>WP_147663673.

1 PAS domain-containing sensor histidine kinase [Candidatus

Prometheoarchaeum syntrophicum]
MGMKFTFQSRPLKLQIKLSCIIIVIFTSIIPFIYISLLTLFLKLDNENINNPLINEYLKNFLIFQLISIL
IIGFGLYSIIHSSNKIANNQEKMNKQYNSDLKVINAKLQSVFKTSNEGFWESNNEDITIDVNPKMCEILG
RTREEIIGRDSHELLTPDGKDKISFQHEEYRKKGLSSSYELSFVSSSSKIVNCIVNAAPIFDEFGEKIGT
FAMMTDITYLKEAEEKLKKQIEKLDCLFEISRILSKPNITIPKLLHDSLPLILQTSQNPKKTFVSIAYDE
FEYKSENFKETDLRISILDRINGKKLEIIVYCENEHIISEEEISLIKEIEERIRNEILRREIEHDNYILA
NIVENSNDAIISLNIDGSIISWNKGAENVFGYKEKEIKGKNYSLLGPENLTIDQTLIFNEVKNSEHTNHI
ETKGLSKEGNILDISVTTSLIKNQKGEITGISIIARDFTEVFKNQKLYQEQILKSSQFKSDFMSSMSHEL
RTPLNSIIGFSDVLLEKYYGELNDQQEIYLNNVKSSAGHLLNLINDILDISKIEAGKVELNIQKISIHKV
LKQTEITLRPEFEKKNLKFEMVGLNSEQVVPVDLIRFKEILYNLLSNAIKYTKKGSVKLEVIEEEDLWKF
NVIDTGIGIKEEHFDLIFNEFERIQSEYVSSVEGTGLGLSLTKRLVELHGGNISFTSKWEEGSIFTFTLP
KK

>QEE16389.1 sensory histidine kinase AtoS [Candidatus Prometheoarchaeum

syntrophicum]
MNKHFTIFAVVLTMLTLNFGLIEVAESVSDQTETLKYGVDPGWPPGEFVEDGKVKGFDVDLVQLIGDYMD
CEVEYYPMDWNDVLESVKNGSLDILCATDTPERREFFDFSKPILNLSNRIFVNEKVVGISNVNDLANHTV
AVVKEYATHVYLEENVQDVHIVVVENVEEGLEMLVNGEVFALFDEMHIVSYYIQEHNYENLKVIGDELVF
GPFCIAVKKGNSSLLEKINSEIDNIFEAGEYDRIYEKWFGTSFTSGPFSWETIIVISIIVCVLASGLGIV
SLWNRTLKKRVNEKTIELKMAQNELLQSQKMEAIGQFAGGIAHDFNNVLTVILGLSNLTIDSLRDENEEI
NRNELIKNLEDVLRAGDRAAKLTKDVLTFSRKQVFQSQIVNLNKLLKNNKDMLARVLGENISFNLKLDQE
NKSIEIDPNQMSLVILNMAINSRDAMPNGGDFTIETSRTYLSKGLKGFNLKPGNYIKISLRDTGIGMDET
HKQHLFEPFFTTKEKGKGTGLGLSIAFGIIKQYHGEIKVESKLGTGTVFHIYLPEIDVIDPQDDEIILKK
QETLNGKETILLVEDEEMVRKFAFRVLNSHGYNCLEAKSPKEAIKISQEYHEKIDLLLSDVIMPDFSGLE
LKKKIEKRHPDMIILFISGYDANIISNNGELEVGINLLKKPFSSIELLERIHLLLN

>QEE16756.1 sensory histidine kinase AtoS [Candidatus Prometheoarchaeum

syntrophicum]
MDFEIDKKEKKKIRFQRVFDRLPIPIAISDQNDQNLYVNPKFTEILGYTVNDIPNTESWMNLAYPDPKYQ
EIIKAKLPEITSAITQPRINEIKCKDGQVISLLLQDISIDDNEFITILEDVTEKLKTEELLIKSQQRFRK
IVEYFPYPIVVTTPRNDVVYVNPAFTKSLGFTIEDIPNAKTWYLKAYPNPEYRNSIIEESQVPNHPKTTP
IERHITCKNGDFKDLILKNITIGDEDITIFQDISAQRKAEIKFQEIIENSRDMILLLNEKGIIQMINPAV
TAIMGYSEDDIINHSPLEFVLPEFQSLILSLAPDGKKKIQETTLQEIDAKKLNGEIVTLEFFTRNIIRNG
KFIGMLSICRDISNRKKINEAQFQQQKIESIGLLAGGLAHDFNNILVSIIGNINLFQMDEDTLTTEQQDM
LMDLEKAAMRARDLTNQLLTFSKGGTPIKKPESIEQVIRDSANFILRGSKSKCTFYFESNLPPVEIDVGQ
INQVLNNLLINASQAMPHGGIIDISVFREKIDNKSSIPLIPGCYIKLIIEDKGVGIPKSIQHKIFEPYFT
TKSAGTGLGLSTSYSILKKHKGLITFSSKPGEGTIFYIYLPTTQKNVLIKPDPKKEICLSRCRVFVLDDD
KNIHKFLIRAFSHLGLEMVSCYNGDHILEDFQAAEKSGKKIDIVFMDLTIPGGIGGKDAVKILRKKYPDL
KIIVFSGYSNDPVIANFKDYGFDDFLEKPFSIEQLKAILSKWIKN

>WP_147664519.1 PAS domain-containing hybrid sensor histidine kinase/response

regulator [Candidatus Prometheoarchaeum syntrophicum]
MSSFINIKNLNYLLMDISSLNWNIEIFTHFFSFLLFTITSIILYFQNRKFKHKIISFLMIAWIFFGFYCL
SAGIAYLILDHILFRISFIYLLITAVFFTLSLDLYIDYFYDAKKMIVLGVIIGGTILSLFNPSSVLDRFL
PSGHGTFLTSGFLDFWMIILSIFTCFLFFYYCLQIFLKTPAELKKITMWTLIGGIIFGIISPIIYAFKLL
QTFPGSMMIGFSVGALITGITFTRDNRIIETLIKNSNDAKVRLRKSLEEKLELSQGRFQELVETMDEGIY
EYDLSGNCTYSNEAHYKVLGYHVNEPSYHKYQNMFNLKELKDLKKVVKKNQKGVLIRNAKIHLKNKDGKQ
IPFLVNITPKYDASKKNLIGFIAISRDISNLEEIEKRLKEKNKQLLKIQKMESIGNLAGGIAHDFNNLLQ
AVFGHLDLILLEFENNNDKDKEILDSLFKIKSAAEHGAEITHQLLTLSKIHNVEFSSININDEILEIYSI
LKHSIPKMVEINLELSEDMDPIYGNSTSIQQVIMNLVLNARDALQDGGKISIKTDEVILDDLFCEMFANL
TPGKYISITITDTGIGMSQEVLEHLFEPYYSTKPHGKGTGLGLSIVYNIIQQHNGSIQCYSEVDRGTRFK
IFLPVNEKAESPIAKTKEEELIYSKAHETILVIDDNEEILEYTIKILKKFGYNVLIANSCKNIHEILKRN
KRIDLFIVDYIMPHTGGIKCIRNIREKLDYNTKYILSSGMGSEKLNEECEINKIDTFLPKPYTMGDLLLI
IQSVLEN

>WP_147664078.1 PAS domain-containing hybrid sensor histidine kinase/response

regulator [Candidatus Prometheoarchaeum syntrophicum]
MLKQSTQDIQNRKKKEHLKSLDDALVYISQLEKQLKFSKIFYSNPIITALTKLKDGLFIDVNEAFVKSLE
YTRSEAIGQTSTSLNIYSEESREKFKNRLIRDGKVSNLEMMFRTKSRQKLIALVSAEIIEIESEEYIISS
LIDITDQRTAEKKLRESEEKYKNLVEFSTDFIFSEDLHGEFIYINPTFNKTLGYSNEELLHKDISHLIHP
EDLEGLIKAKLPLLEGKEIRNVEYRFKAKNGSYRNFSTNASPLFDSEGNIQEIYGVGRDITELKKLEFEK
YQSQKLDSVGILAGGLAHDFNNILVGILGNVNLIQHSEENFSSEIGEMLEDISEATKKATALTRQLLTFS
KGGEPIKKAQDIEKIIEFSMKLVMPGSKSICKFLPHDKVPPVNVDAGQIEQVINNILLNADQAMEHGGII
TIALSQIQFKELDRKVMLKPGQYIKISISDQGIGIPPQVQKKIFSPYFSTKPNGNGLGLATVYSIIKKHN
GKISFTSTVDVGTTFDIFLPVSQQAVEHDKKEIDIVLTKRGKILVLEDDSTVIKLLKKMFHILNQKADFV
TDGYNILQLYEQALQNNDPYDIVIMDLTIPGGMGGKDTIEALVKIDPDVTAIVSSGYSTDPVMANFSEYN
FKGVLEKPFTINEVKKILLRWL

>WP_147662496.1 PAS domain-containing hybrid sensor histidine kinase/response

regulator [Candidatus Prometheoarchaeum syntrophicum]
MMDLNQEKTLFFQKILNNLPEPAFAVDSNCKIIEWNKAMEEFSGIKAELIIGKTSSEYNIPFYQKSQPLL
IENYIKSKNFSNSIYSKEEILTLIDGQEVNVLSKVSLIFDDSNKLIGGVQTFQNISEHVIAEKMLAEDLL
KYSVLFNNSYDGIILHDLNGNILEINKKALNLFQFNQKDFKNVKLSQLFPEREKKHLEDFLKDFHTEKFN
YDEFYLMKSNKIEFIGEIYADLIILEKQEIGQLIIRDITEKKHIEENLAAEKEMLAVTLAGIVDGVITLD
ADANIILINKVAENILEMDYDEVFGKKIFNITTLYKDKSRDPYELYEVKNMLGKRANPPISLSVLKMKDG
REKIIEHDIAPIHNKAGELSGNIIVFRDITDKQKKEAEEFKNQKIESIGLLAGGIAHDFNNILTAVLGNT
ALLKMDLDQNSEKFTILNELESAIHRASKLTHQLLTFSKGGSPIKKFMFIGDVIKESANFALHGTKNEIE
FNFAPGLWPVHIDEGQISQVINNLVINAVQATNINSKIIIQANNYLMEPENNMMLTPGNYVKISFQDFGN
GILEENQEKIFDPYFTTKETGSGLGLSVCYSILTRHSGKIKVTSKIGEGSTFTFYLPAHPEIVLKMEDKS
DLPDIISNLNSRILILEDEKPIRVLLEKFLRKKNFYVESAADGEEILIKYQDALDKGQEFDILILDLTIK
GGMGGEETFQKLLEINPNVKAIVASGYSTKKILSDYKQYGFAGMLSKPFKMSDLLKEIERLLENND

>QEE16740.1 aerobic respiration control sensor protein ArcB [Candidatus

Prometheoarchaeum syntrophicum]
MGMKFTFQSRPLKLQIKLSCIIIVIFTSIIPFIYISLLTLFLKLDNENINNPLINEYLKNFLIFQLISIL
IIGFGLYSIIHSSNKIANNQEKMNKQYNSDLKVINAKLQSVFKTSNEGFWESNNEDITIDVNPKMCEILG
RTREEIIGRDSHELLTPDGKDKISFQHEEYRKKGLSSSYELSFVSSSSKIVNCIVNAAPIFDEFGEKIGT
FAMMTDITYLKEAEEKLKKQIEKLDCLFEISRILSKPNITIPKLLHDSLPLILQTSQNPKKTFVSIAYDE
FEYKSENFKETDLRISILDRINGKKLEIIVYCENEHIISEEEISLIKEIEERIRNEILRREIEHDNYILA
NIVENSNDAIISLNIDGSIISWNKGAENVFGYKEKEIKGKNYSLLGPENLTIDQTLIFNEVKNSEHTNHI
ETKGLSKEGNILDISVTTSLIKNQKGEITGISIIARDFTEVFKNQKLYQEQILKSSQFKSDFMSSMSHEL
RTPLNSIIGFSDVLLEKYYGELNDQQEIYLNNVKSSAGHLLNLINDILDISKIEAGKVELNIQKISIHKV
LKQTEITLRPEFEKKNLKFEMVGLNSEQVVPVDLIRFKEILYNLLSNAIKYTKKGSVKLEVIEEEDLWKF
NVIDTGIGIKEEHFDLIFNEFERIQSEYVSSVEGTGLGLSLTKRLVELHGGNISFTSKWEEGSIFTFTLP
KK

>QEE16628.1 aerobic respiration control sensor protein ArcB [Candidatus

Prometheoarchaeum syntrophicum]
MTPKSDDKKKVRHTYFIVFLSGILVWILDATIAFYFFNLGENFWDLMILKIPPYNLFMRLLIVALFHILG
YKIIRQIRTYDRTFNNIFQTIPDSLFLFSKDGTALEFNGNKKNSQFYQRSVLGKKLSEIFPKRISDTITA
NIEAILKFKKPLIFNYNAEDEENKRKYYEVRSLYYSEEKFAVLIRDISEQKEYEKKLEESSKKYSNLVDN
LTDIVGVIDKKGKIIYGNSQMYTSLGYKPEELKGQNFFALYLDPKAIYSLTRKIKGVPGVVLSFDCELKH
KSGHYIPFSGKVVGIEWGKEIEYIGILRDETEKKKSENLSKEFNKKMEESLKKYTNLVNNLTDIIGAVDP
KGKINYCNPQVYTLLGYKPEELLGQKFFKLLANPKALLSVGKKIIGVPGVVLSYDCQLKHKSGHYIPFSG
KVVGIESGDQIEYIGILRDETEKKKSEDMMRKFNVKLEKEVDLKTLELQQEIRERKIIENKLRTSENKQK
DQINQLNCLFGISHLLSTPDISIRETLQNVLNLIPPTFKFPNLINVKITFNGIEYKLNNILDTTWKISRK
EFVNDKILLIEIFYQDNLPFLKEEENLIKKIGELLKIGLLRREIENEKENLLKMVENSDDAFINMDLDGT
MIYWNKGAEQTFGYTAKEVLYRKNLDLVPPDRYEERKFIFDRIKKGEKVKHFETKRLRKDGKELDISVTY
SPFINYEDKIIGVFSIARDFTEKFEQQKKFQDHIIKASEFKSEFMSSMSHELRTPLNSIIGFSDILKEKF
YGDLNEKQENYIENVRSSAQHLLELINDILDISKIEAGKITLRFVDVNLKELLNQIGTTIRPEYEKKNLT
FEIIGLEEGKMIKCDPKRFKEIIFNLLSNAIKYTISGGITLEIFETRNHWEFSVIDTGIGIEEKDFKFIF
QDFKRLKNEHTATVEGTGLGLSLTKRLIELHNGNISFKSKWKEGSTFTITLPKFSQTMGIENY

>QEE16621.1 aerobic respiration control sensor protein ArcB [Candidatus

Prometheoarchaeum syntrophicum]
MIGNDRKYLNIIDAIVLQLDRKGKILYINVKGNKILGYRENEILGKNWFKTCIPHSKREEMERVFNKVIN
GEKEVDYFENAVQTKKGLEKIIRWHNSNVYNKKGNIEGVLSLGTDITRQRKIEKLTFIQGQTNFLISNAK
NEMGMFQEFCEEIIQFKNYQFCWIGLVQYDEEKSIKPVALAGYNIFDNSKYDGKKLKFTWSESVKDQSPS
GTAIRTRKNYIINDLSAEKKFKNWKTVFDGSGFLSSISIPIIIENIVIGVLGIYSGNKNTFDEDDVELIS
KMVNNLSLGIAKMRYYKIQKKNEKNLRNSLKKFTTIFQAIPDLFLLLSKKGDVLEFHGDKNLLHVPLDNL
LGKDLFIGFPNKISKLIEEKSLEVFKTKKPQVVEFPLKQQNEIIEIFEARLFFYDENKIAVFVRNITESK
SRENKLKETEFRLRNLNLDLDQKVELRTRELENSKNQLNIILNTLNYPVFVISEDYEILFHNRSSSKIYD
GILDGKICYKILRGREQPCDDMCPLRNKSLSQNIKSLKFEDKLFLSKFDEERDFEISSTKIENFNGKPAL
LEIFEDITDRKKKEKQILESELMLQVRIKGLKCLYGISSLLVVPDITIKELLYGVLPLIRSSWQYPEITM
VKIIYGENQAQTTSFKESEWKLTISDKINDIPLKIEVVYEINKEFLDEEKRLLKEILTRIKLGIISIEYK
LETKRLASIVGTSSDSIVSMDKEGMIKSWNKGAERIYGYALEEVLEKSISMLIPPDRMEEIPNLIEKVVQ
GESYKLFETKRLRKDGKVLSVNVTISPILDLKGDIVGISSISRDVTESLEQQKQYQDQLIKSSQFKSDFM
ASMSHELRTPLNSIIGFTDILIEKFYGDVNEKQDHYLNNVRTSAEHLLNLINDILDISKIEAGKVELKYR
DFDLLNLVSQIEIEVKPLYKKKGLNFELVGFEKGTIINADPIRFKEILLNLLSNAIKYTEKGGIKLDFME
DEKNWKFKIIDTGIGIAPEDFGIIFQEFKRVESDYVESIEGTGLGLMLTKKLIELHGGHITFTSVLGEGS
SFSFTLPKKLI

>QEE16613.1 aerobic respiration control sensor protein ArcB [Candidatus

Prometheoarchaeum syntrophicum]
MNIRNILNKNRTKQFFFLFLIYILITLVSFSNFSFKPSSSESIHLKVGAYENSPKIFTNEQGEIDGFFPS
ILGHIADKEGWELEYIHGNWSESLALLKANQIDILPDVGFSYDRQMEYDFNNESAITGWGIAYTHDESDI
YSMQDLKNKKIGVMKDDINYIGPLGIKIISDQNRLNCTFVEYDSLEDVLTSLNLKIVDVGIVNEFFGNLN
AYKFDVKKTSIAFNPIDFKFAFPKNASLNSFLIEKIDNWLKTSKSDLDSIYYQEAEIYLSDQESSIPSWI
FPSFLILIGLAAFLTISAMTLRYQVKIRTKSLHDLNQELSTESIQKKNQLANIVENSNDGIISAELDGTI
RSWNKSAEVIFGFSSEEIIGKKLDLIIPSNRFNEVKYIIDKIKQGEPVNHFETKLMRNDGKLLDISITAS
PLKNLKGKINGFSAIGRDFTETIERQKLYQDQILKASKFKSDFMASMSHELRTPLNSIIGFTDVILERIS
GEINEEQDKYLTHVKTSAMLLLDLINDILDITKIESGKMELNIEEVNLSQIISQVDTMIKPIYMKKSLIF
EVQEIDKEKVIRVDRLRFKEILFNLLSNAVKYTKEGKIMIKFSEEEEFWKFDVIDTGIGIKKENFDILFK
DFRRIASKYVVATEGTGLGLSLSKRLVEFHGGTISFTSTFGKGSKFTFTIPKQL

>WP_147661239.1 PAS domain-containing protein [Candidatus Prometheoarchaeum

syntrophicum]
MKSDILNFESFINHSPIIIFIWNPVPNEPVLYVSENISQFGYSQEDFLNHKTVYSDIVHPEDLPKIRSES
QHHVKNQTKSFLQKYRIITKSGEIRWIFDHTWDELDKFGNTLYYYGFILDITDQIEIEQALRESEERFKI
AAQNVSDVIYEYDVVEHKFIWFGELQFLLKISNEQIPETFEELSKFIHVDDSERIKKKIQMLIEDKNQIH
GFLKCRIIPSDEKERLWQGSLEIIRNDAGKALKVIGVLNDITEKYATEQALRESEERFRIVASKSSDIIF
EYNYVKEEVNMFGDIVGFFGVSQDEIPIPPSNSYDFIFEEDRDRVRDATNKFLASKESRLDLDYRIVRKD
GSVRFCHDTTTVIRDPETGKHLKVIGALSDITEKHIIEQALRESEERFRIVAENGSDLIYEFTSGGKKIA
WFGDVENFYGLKSDEIPKNFDEVISRLHPSDQRKITKQIEDLSASTKERMVLEYRIIKKDREVRNIRDVM
RVIRNKSGKPIKVIGALSDITEKNKFEQILQQSESRFRMVAENTSDLIYEYDYNDKNVKTFGGLESLLGI
SEKELNKSPKKFYDFIHDEDRLIIEKEMVKFLASKEDKKDFTYRLVRKDGDIIYCRDNTKLIRDSHGLPQ
KAISAISDITQKYRYEEALKVSKERFRTVAQNVSDIIFEYDVKKHSVYWFGDIAEHLKIGDDEIPKRMTA
FMKFIHPDDIERIKSEVIITRESRKNADYDFRIIRKDGKIRHWHNSVEFFRDASGKLIKVIGALSDLTHQ
KNIEAELEIRQRMDYIGNFAGGIAHDFNNILAVILGNVSLLQMDADHLSEEHNLIINDISTASERAKSII
KQLQEFSSQDIRKEKAEIFDLSVIVDEVINFMKNTTNRLIQKENSIPKNRYFIKGNPVEFNQVLLNLGIN
SIHAIEEKKNGATTLDFIKIDISFPEGEQKNTHIVVNFMDSGRGIPEKNLKQMFIPFFTTKTGSGASKIK
GRGLGLSMVYHIITNKFDGSINIESRVDHGTVFYITLPLIDQH

>WP_147663689.1 PAS domain S-box protein [Candidatus Prometheoarchaeum

syntrophicum]
MDFEIDKKEKKKIRFQRVFDRLPIPIAISDQNDQNLYVNPKFTEILGYTVNDIPNTESWMNLAYPDPKYQ
EIIKAKLPEITSAITQPRINEIKCKDGQVISLLLQDISIDDNEFITILEDVTEKLKTEELLIKSQQRFRK
IVEYFPYPIVVTTPRNDVVYVNPAFTKSLGFTIEDIPNAKTWYLKAYPNPEYRNSIIEESQVPNHPKTTP
IERHITCKNGDFKDLILKNITIGDEDITIFQDISAQRKAEIKFQEIIENSRDMILLLNEKGIIQMINPAV
TAIMGYSEDDIINHSPLEFVLPEFQSLILSLAPDGKKKIQETTLQEIDAKKLNGEIVTLEFFTRNIIRNG
KFIGMLSICRDISNRKKINEAQFQQQKIESIGLLAGGLAHDFNNILVSIIGNINLFQMDEDTLTTEQQDM
LMDLEKAAMRARDLTNQLLTFSKGGTPIKKPESIEQVIRDSANFILRGSKSKCTFYFESNLPPVEIDVGQ
INQVLNNLLINASQAMPHGGIIDISVFREKIDNKSSIPLIPGCYIKLIIEDKGVGIPKSIQHKIFEPYFT
TKSAGTGLGLSTSYSILKKHKGLITFSSKPGEGTIFYIYLPTTQKNVLIKPDPKKEICLSRCRVFVLDDD
KNIHKFLIRAFSHLGLEMVSCYNGDHILEDFQAAEKSGKKIDIVFMDLTIPGGIGGKDAVKILRKKYPDL
KIIVFSGYSNDPVIANFKDYGFDDFLEKPFSIEQLKAILSKWIKN