Curso: Engenharia Biotecnológica

  
    Disciplina: Bioinformática
     Campus Assis
    Docente: Drª Juliana de Oliveira
  Nome do aluno:   RA:
   Maria Clara Poli da Silva    221244646

RELATÓRIO SEMANAL DE BIOINFORMÁTICA

FAMÍLIA BLAST

1. INTRODUÇÃO
A família BLAST (Basic Local Alignment Tool) é uma ferramenta usada
para comparar sequências de nucleotídeos e proteínas aos bancos de dados,
também pode ser usada para conhecer as relações funcionais e evolutivas das
sequências e identificar os membros de famílias de genes.
Possui três etapas básicas que servem para agilizar o alinhamento local:
criação de uma lista com palavras curtas com uma pontuação acima do valor
limite quando são alinhadas com uma sequência de pesquisa, busca no banco de
dados para conseguir a ocorrência dessas palavras e os alinhamentos com
pontuação mais alta de uma sequência, ou pares de sequência, são combinados
em um alinhamento local.
O programa é dividido entre NUCLEOTIDE BLAST e PROTEIN
BLAST, onde o primeiro consulta um banco de dados de nucleotídeos usando
uma sequência de nucleotídeos (tem os algoritmos BLASTN, MEGABLAST,
DISCONTIGUOUS MEGABLAST, cada um tem uma função em específico) e
o segundo que usa um banco de dados de proteínas usando uma sequência de
proteína (tem os algoritmos QUICK BLASTP, BLASTP, PSI-BLAST, PHI-
BLAST e DELTA-BLAST, cada um com uma função específica).
Dentro do programa também existe o BLASTX, usa um banco de dados
de proteína usando uma sequência de nucleotídeos traduzida, TBLASTN, usa
um banco de dados de sequências de nucleotídeos traduzidas usando uma
sequência de proteína, e o TBLASTX, usa um banco de dados de sequências de
nucleotídeos traduzidas usando uma sequência de nucleotídeos traduzida.
 2. MATERIAIS E MÉTODOS
Os matérias utilizados para a pesquisa das sequências foram:
Um computador;
Acesso à internet;
Acesso ao website do BLAST (https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi);

As sequências usadas foram: a sequência de nucleotídeo NM_174381 e a

sequência de proteína NP_776806.1. Foi usado o NUCLEOTIDE BLAST para fazer o
alinhamento da sequência NM_174381, algoritmo blastn, o PROTEIN BLAST para o
alinhamento da sequência NP_776806.1, algoritmo blastp, e o BLASTX para alinhar
as duas sequências.

3. RESULTADOS

Ao digitar a sequência NM_174381, após clicar no ícone do NUCLEOTIDE

BLAST, e em seguida clicar em BLAST no final da página apareceu os seguintes
resultados:
Ao clicar em Grafic Summary :

Em Alignments:
 E em Taxonomy:

Ao digitar a sequência NP_776806.1, após clicar no ícone do PROTEIN

BLAST, e em seguida clicar em BLAST no final da página apareceu os seguintes
resultados:
Ao clicar em Grafic Summary :

Em Alignments:

E em Taxonomy:
 Ao digitar a sequência de nucleotídeo NM_174381 na primeira tabela e a
sequência de proteína NP_776806.1 na segunda tabela, após clicar no ícone do
BLASTX, e em seguida clicar em BLAST no final da página apareceu os seguintes
resultados:
Ao clicar em Grafic Summary :

Em Alignments:

E em Dot Plot:
 :
4. CONCLUSÃO
Em síntese, o BLAST é uma ferramenta que ajuda alinhar quaisquer
sequências, tanto de nucleotídeos quanto de proteínas, presente nos bancos
dados oferecidos. Além de ser de fácil acesso, não é complicado de usar e as
informações estão organizadas, facilitando o entendimento geral.
5. REFERÊNCIAS
https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
https://drive.google.com/file/d/
1ur_9bzXMZCURRUOq_avP1BZelKVWYMmW/view