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  • UE2 FC1 Trafic Intracell 5

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    UE2 FC1 Trafic intracell 5 (1)

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    Lille 2018-2019 UE2 — Cellules et Tissus Fiche de cours n°1 Partie 5 Trafic intracellulaire des macromolécules et des glycoprotéines ° Nation tambée 1 foiz au concours 8B Notion tombée? fois auconcours OGG _ Notion tombée3 fois ou plus au concours TE Nouveauté ou programme cette année lle 2018-2019 + VARNM est traduitet a protiine soxt du risosome par von extrémté N-terminale * Siellela posside, la sequence d‘atressage au RE est reconnue par a SRP = LaSRP change de conformation et se ie ézalement au ribosome : 6 lle avéte Ia traduetion en empéchont Fentrée de nouveaunARN de tvansferts Par fandodemaine du récoptcur SRP = (© Reconnat la SRF dans s3 conformation lige au peptide signal et au ribosome © Provoque un changement de conformation quilibére la SRP et le ribosome Dirige fa protéine en cours de synthése vers le RE: © Parce quill est reconnu parla SRP Constitue le signal d'initiation ae transfert ou signal einitiation de translacation (SIT) ‘0 Parce quil se fite sur un acide‘émin spéciique 3 Vintérieur du translocoa et permet & la protéine de sfintégrer dedans Le transiocon est inacif larsqu’ll ne participe paz’ la transtocation d'une protéine ‘© Ferméparune hélice alphe Li liaison du ribosome au translocen active ce dernier : ‘© Changement de conformation qui déplace Théfice alpha : ~ Le centre du translocon s’ouwre et se remplit d'eau orifice du translocon s'aligne en porfaite eontinuité avec le tunnel du riboserne : © La protéine est transloquée a travers Henvironnement aqueux du centre du translacon © line peut y avoir aucune fuite de molécules, en particulier de calcium, dis lumen du RE jusqu’au eytosol Des cycles de Fixation et d'hydrolyse du GTP provoquent les changements de conformation des protéines impliquées dans le systémne de translocation : ~ Permit par Fesistence de GTP transféraces, ou protéines GEF, et de GTPases Le mécanisme général de translocation ca-traductionnelie ne nécessite pas d’énergie sous forme hydrolyse de FAT BOO © Vallongement de la protéine par sa traduction suffit aa faire passer i travers le translocon = Lemdcanisme de translocation co-traductionnel crée 2 populations de ribosomes © Des ribosomes libres dans le cytosol © Des ribosomes is & la membrane du RE qui constituent fe néticulum endoplasmique granulire : ~ Forment des polyribasomes le temps nécessaire 4 Is translocation totale a peatéine ~ Sontlibérés une fois que les protéines sont complétement translaquées et renflouent le pool ‘commun de sous-unités ribosomeales dans le evtosol [= ces deuxpopuntions de rivsemes: ‘0 Dérivent d'un pool commun de sous-unités ribasomales ‘© Sont structurellement et fonctionnellement parfuitement identiques : = Ne different que par le type de protéine quis synthétisent a-un moment donne Lille 2o1e-2019 * Le peptide signal se fie & Fimtérieur du transiocen en formant une boucle © Bxtréimité N-terminale du «Ste cytasalique * La traduction reprend et la protéine'sallonge dans con exodemaine * Parla signal peptidase (Quand lo protéine a été synthétisée sue une longueur d’enviran 150 acides aminés : © Clivage eo-traductionnel et co-translecationnel * Le translocon change de conformation et Yeuvre latéralement : © Le peptide signal diffuse latévalerent ~ Vo ttre rapidement dégradé en acides aminés par des protéases membranaires © La protéine continue tre traduite et est ibérée dansie lumen * Aprés libération de la protsing, le transioeon ehange de sonfarmation et est inactive * Laprotéine arquiére sa topologie par rapport aux membranes du systéme endomembranaire dane eRe: © Reste luminale dans tout le systtme endomembransire © Sora séerétée si elle est adressée:3lamembrane plasmique ks 2018-2019 J Barents Cterminateeytezotique | * Extrémité Cterminalsiuminaig’” |» Bardrité Cierminate cyosoligue = Extrémité N-terminale luminale | * Extrémité Neterminale cytosolique | * Extrémité N-terminale luminale + sitcvable O + Sit nondlvabie + sit non divable Lille 2018-2019 Séquence ¢initiation de la traduction en N-terminal la protdine s'inskre dans le teanslacon sus forme dune boucle avec lextrémité N-terminale du ote eytesolique : © Lapratéinesallonge dans san exadomaine Une séquence de 25-20 acide amings hydrophebes anparait dans Ia sequence 5 + Joue le ble de signal d’arrét de transfert, ou SAT, ou signal dart de translocation et erréte la ‘translocation ‘© Aun moment donné, le translocon contient le signal ‘initiation de transfert et le signal @arrét de transfert ‘© La protdine continue # étretraduite dans endodomaine,jusqu'’ son extrémité C-terminate 1s signal peptidase clive le peptide signal : ‘© bere 'extrémité N-terminale dela protéine dans le lumen du réticulum endoplasmique * Le transiocon souvee latéralemeat : © Lepentide signal diffuse latérolementet est dégradé © La proteine diffuse latéralement dans le plan de la membrane ‘Acquise dans te RE Reste transmembrenaice dans tout le systéme endomembranaire avec © N-terminal luminal © Cterminal cytosolique Sielle est adresséed la membrane plasmique : © Vextrémité N-torminale sera-extracellulaire © Vextréminé C-terminale restera cytosolique lle 2018-2019 Extrémité N-terminale de la protéine constituée d’acides aminés plutét hydrophiles iznal d'adressoge au RE, ou SIT, en position interne-& ‘© Constitué d'une vingtaine d’acides aminds plutét hydrophobes © Reconnu parla SRP ‘0 Non clivable : pas de séquence de reconnaissance parla signal peptidase Le renzdintégration de la pratéine dans le translocan dépend de la charge des acides aminés proches dd signal s'initistion de transfert: © kes acides amines précédant le SIT sont chargés positivement pour une protéine de type 1! ~ La protdine sintdgre dans la transioeon sous Ia Forme dune boucle avec le N-terminal du cote eytosotique © (Les acices amings qui suivent le SIT sont chargis négativerent pour une protéine de type It La protdine continue & étre traduite: ¢ Lerestede laprotéine senfile dans le lumen duRE Le translocon s/ouvre latéralement et la pratéine diffuse latéralement dans le plan de ts membrane ‘Acquise dans le RE Reste transmemibranaire dans tout lesystéme endomembranaire avee + © Cterminal luminal ‘6 Neteemsinal eytosoique Siclle est adressée@ la membrane plasmique ¢ Lemrémité Cterminale sera extracellulaire © Lextrémité N-terminale resters eytozelique 2 Lille 2018-2019 Extrémité N-terminale de la protéine constituée d'acides aminés plutit hydrophites ‘Signal d'adressage au RE, ou SIT, en position interne : © Reconnupar la SRP © Non clivable Le sens d'intégration de Ia protdine dans le transiocon éépend de la charge des acides aminés proches ‘du signal d’initistion de transfert = 9 Les atides amings précédant le SIT sont chorgés ngativement pour une protéine de type Il © Lesacides arninés qui suivent le SIT cont chargés positivemant pour une pretdine de type Il: = La partie N-terminale se pasitionne dans fe lumen ~ La protéine finit d'étre traduite dans Fendodamaine = les acides aminds chargés pasitivement restent dans le cytosol (eagle du + dans le cytosol) Acquise dans le RE [este transmembranaire dans tout le systémme endemembransire avec ‘© N-terminal luminal ‘© Gterminal eytosotique Sielle est adressée Is membrane plasmique © Vextrémité n-terminale sera extracelluiaire © Lextrémité C-terminale restera eytosolique a lle 2018-2019 + La chatne pahpeptidique traverse la membrane autant de fois que l'on retrouve une séquence hydrophobe-d’une vingtaine d’acides arsings: © La 1 séquence, du cété N-terminal, joue le réle de SIT, © La séquence suivante joue le rdle de SAT ' Limégration de a protéine dans le transtovon dépend de la charge des aeides aminés qui précédent Dat de fa sequence en acides amin, ele meme cléduite data sequence de FARN © Choque acide aminé 2 un index hydrophobic { ‘ou d'hycrophilie en fonction de sa chaine latérale E i + Permet de déterminer les sequences i transmembranaires potentielles * Protéine transmembranaire pohtopique = © 7 séquences transmembranaires, — © StT interme, non clivable, © ST précéde d'une séquence chargé négativement = uweno0 = Extrémite N-terminale luminale » 3boucles cytosoliques = 3 bouclestuminales = Extrémité C-terminale eytosolique > Protéine elycosyiée © Poste des groupements osidiques du c6té luminal Lule 2018-2019 Paretnie génétique. on intervertit le signal einitiation de transfert et le signal d’arrat de transfert lune protéine transmembranaire La pretéine est toujours intégrée dans le bon sens dans la membrane Le caractire o’hydrophobicité des signaux d’adressage est plus important que Is séquence en. acides amings pour lintégration a la membrane Plus de 50% des protéines eucaryotes sont des glyeoprotéines : © La Nglycosylation est spécifique des eucaryotes : = Ble n’existe pas chez les procaryotes Uniquement du cété du feuillet €, exoplasmnique ou luminal, de la membrane du RE © Une pratiinte est forcement giyeosyige dans son exodomaine GOO En mime temps que le treduction = co-traduetionnelle En mime temps que la translocation’ ‘Aider au repliement de la protéine Participer au processus de transport et @adressage des plycoprotéines Ader & la protection physique de ta celile + 5 La partie glucidique des protéines adresses’ la membrane plasmique est expasée bla surface: de la cellule et forme le manteau cellulaire ou cell-coat Participe au precescus de reconnaissance cellulaire, par exemple ‘© Les groupes sanguins 10 lle 2018-2018 Enayme transmembranaire ‘A proximité du translocon Site actif porté par son exeomaine Transfére en bioc le précurseur oligosaccharidique sur une asparagine della chaine polypeptidique en croissance = © Au niveau di signal de glycosylation : + Séquence Asn-X-Ser/Thr :résidu Asparagine suivi de n’importe quel acide aminé x, suv lune sérine ou d'une threonine ‘Commun & toutes les N-glycopratines Riche en mannoses Plus de mannsses que d'sutressuerae Trianteané : © Uneseur compost de 2 N-acétylgluensamines et3 mannose: puis3 antennes : ~ Une 1 constituée de 2 mannases et de 5 lucases = autres antennes plus petites compasées de 2 mannoses Fabriqué et ié3 un lside membranaire appelééolicho : «2 Poly sopréncideintermaiaire de ls synthise du cholestrol ‘© Li par des lsisons phosphates : ~ Uoligosaccharyltransférase utilise Ménergie de ces liaisons pour transfrer oligosaccharide de base sur Fasparaghne it Lille 2018-2019 ANNALES CLASSEES CORRIGEES [Notion non traltée dans ce chapitre et corrigée sur la base du cours de l'année précédente} = item modifié pour correspondre ou programme du concours de cette année 2018 3. Parmiles propositions suivantes relatives au réticulum endoplasmique (RE), laquelle (lesquelles) est (sont) exacte(s) ? A. B. Cc. D. E, [Les ponts disulfure se forment spontanément dans la lumiére du RE] 4, Parmiles propositions suivantes relatives 4 la séquence Aspa La premiere étape de adressage au RE des protéines séorétées est la reconnaissance de leur peptide signal par un récepteur situé sur la membrane de cet organite Sion traduit in vitro, en absence de microsomes, un ARNm codant une protéine normalement sécrétée, on obtient une protéine d’unc taille supérieure & celle de la protéine sécrétée par la cellule vivante ‘Le mécanisme général de translocation des protéines dans le RE nécessite de I’énergie d’hydrolyse de PATP Le peptide signal des protéines séeréiées est situé a leur extrémité COOH-terminale gine-X-Sérine/Thréonine, laquelle (lesquelles) est (sont) exacte(s) ? A. Cc. D. B Cette séquence peut étre N-glycosylée si elle se trouve dans I’endodomaine d'une protéine transmembranaire de type I B. Cette séquence peut étre N-glycosylée si elle se trouve du cdté NH2-terminal d’une protéine transmembranaire de type I Cette séquence peut étre N-glycosylée si elle fait partie d’une protéine extrinseque interagissant avec une protéine anerée par GPI (glycosylphosphatitylinositol) Cette séquence peut aire N-glycosylée si elle se trouve du c6té COOH-terminal d’une protéine ‘ransmembranaire de type TI Cette séquence peut étre N-glycosylée si elle fait partie d'une protéine extrinsdque interagissant avec l’extrémité NHs-terminale dune protéine transmembranaire de type IIL 16. 2017 ‘Parmi les propositions suivantes relatives au réticulum endoplasmique, Inquelle (lesquelles) est (sont) cexacte(s) ? A B. c D. B [L'ultrastructure du réticulum endoplastnique est maintenue tout au long du cycle cellulaire) Le réseau de réticulum endoplasmique s’étend dans le cytoplasme grace aux microtubules et aux protéines motrices de type « kinésine » qui leur sont associes Le réticulum endoplasmique est le site de synthése de lipides destinés aux mitochondies ‘Le mécanisme général de translocation des protéines & travers la membrane du réticulum endoplasmique ne nécessite pas I’énergie d’hydrolyse de "ATP La N-glycosylation débute lorsque Ja protéine a été complétement transloquée dans Je réticulam endoplasmique 3 lite 2018-2019 18. Parmi les propositions suivantes relatives & une protéine de la membrane plasmique dont la topologie est -dessous, laquelle (lesquelles) est (sont) exacte(s) ? A. C'est une protéine polytopique B. L’adressage de cette protéine & la membrane plasmique a été possible aprés son insertion dans le membrane du réticulum endoplasmique puis son trafic vésiculaire via le systéme endomembranaire C. Son extrémité Nt peut étre glycosylée D. [Les boucles extracellulaires peuvent étre reliées par des ponts disulfures] E, [Les boucles intracellulaires peuvent étre relies par des ponts disulfures] 2016 16. Parmi les propositions suivantes relatives au Réticulum Endoplasmique (RE), laquelle (lesquelles) est (sont) exacte(s) ? ‘A. Une cellule en culture in vitro peut adapter le volume de son RE en fonction de la composition en nnutriments du milieu de culture B. Le réseau de RE s‘étend dans le cytoplasme grace aux filaments d’actine et aux protéines motrices de type « dynéine » qui leur sont associées C. Le feuillet E de la membrane du RE lisse est le site de synthase des phospholipides membrenaires D, Le mécanisme général de translocation des protéines & travers la membrane du RE nécessite énergie d'hydrolyse de PATP E, [Sion transfére par génie génétique la séquence d’adressage au noyau a une protéine normalement sécrétée, elle ne sera plus sécrétée] 2014 15. 16. Parmi les propositions sulvantes relatives au Réticulum Endoplasmique (RE), laquelle (lesquelles) est (sont) exacte(s) ? A. Si on traduit in vitro, en absence de microsomes, I'ARN messager codant une protéine normalement sécrétée, la protéine obtenue a une vingtaine d’acides aminés de moins que la protéine normalement sécrétée B. Lapremitre étape de l'adressage au RE des protéines sécrétées est la reconnaissance de leur peptide signal par la particule de reconnaissance du signal (SRP) transmembranaire C. [Si on transfére par génie génétique la séquence d'adressage au noyau a une protéine normalement sécrétée, elle ne sera plus sécrétée] D. Lemécanisme général de translocation des protéines & travers la membrane du RE est co-traductionnel E. Le mécanisme général de translocation des protéines & travers la membrane du RE nécessite énergie hydrolyse de VATP Parmi les propositions suivantes quel(s) est (sont) le (les) substrats de la signal peptidase, laquelle (lesquelles) est (sont) exacte(s) ? A. Les précurseurs protéiques de toutes les protéines polytopiques B. [Les précurseurs protéiques des hydrolases acides) C. Les précurseurs protéiques des protéines de Type | D. [Le précurseur protéique de la calréticuline] E, [Précurseur protéique de la clathrine] 14 ee te Lulle 2018-2019 2011 ‘2. Parml les propositions sulvantes relatives au peptide signal d’adressage au Reticulum Endoplasmique (ou Signal d'tnitiation de Transfert), quelle(s) est (sont) la (les) réponse(s) exacte(s) ? A. II peut tre clivé par la SRP (Particule de Reconnaissance du Signal) B. lest présent dans les protéines transmembranaires de type I! C. [(Cest une séquence protéique glycosylée organisée en hélice alpha) D. llest absent des enzymes lysosomales matures] E, Cest une séquence généralement localisée & Vextrémité N-terminale du précurseur des protéines sécrétées 10. On s‘intéresse a une glycoprotéine de la membrane plasmique dont la topologie est schématisée ci- dessous. Parmi les propositions suivantes, quelle(s) est (sont) la (les) réponse(s) exacte(s) ? Miliou extraceliuiaire : Mb Plasmique Milieu intraceltulaire ‘A. Cest une protéine polytopique B. Son précurseur avait certainement un Signal d'initation de Transfert qui a été clivé C. Vadressage de cette protéine & la membrane plasmique n’a été possible qu’aprés son insertion dans la membrane du Réticulum Endoplasmique, suivie de son trafic vésiculaire via le systeme endomembranaire D. Son extrémité N-terminale peut étre glycosylée E, [Les deux boucles extracellulaires sont hydrophiles et peuvent étre relies par des ponts disulfure] 15 2018-2019 REPONSES "adessage au RE des protines serédes est la reconnaissance de leur peptide ur st sur la membrane de cet organite iro, en absence de microsomes, ur ARNm codent une protine nonpaleraet jet une potting ide signal des protsinessborédes et stu & Jur extrémité COOT-terminale pons dsulfure se formentspontanément maine d'une protine trouve du c6té NHe-orminal d'une prostine otsine exrinséqve ineragissant ‘COOH-terminal d'une prossine arte d'une protine exrinsdque interagissont A: FAUKC: Cate séquonce peut ere N-gyconde sake se trowe dos xodontaine une proigine transmembransire de Typo] S:RAl o:vRat Esra ite rore-2019 ES FAUK: La n-glycosystion dbute sore ques roi est en cours detralocatin dense tine de a membrane plasmique dont Ie tepologe et aces)? A. Cest une ptnepoytopique 1 Ladremage deste prt dunce a:vRA C:FAUX: Son extrdit Nt ne pat as tre eycosyie b:vRAl ESFAUK: Les bovcer eres ne Beye as re reles par _L(s}apere (sosaodgs (sy) (aos) 5 ()ayenb 'squeans surysodo1d 56 eg snosOp

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