Professional Documents
Culture Documents
Referensi Inggris 6
Referensi Inggris 6
Komunikasi Tumbuhan II
Mengulas artikel
https://doi.org/10.1016/j.xplc.2023.100610
ABSTRAK
Pengukuran parameter lingkungan yang tepat sangat penting untuk kebugaran dan kelangsungan hidup tanaman,
serta untuk menentukan waktu transisi perkembangan, termasuk peralihan dari pertumbuhan vegetatif ke
pertumbuhan reproduktif. Parameter penting yang mempengaruhi waktu pembungaan meliputi panjang hari
(fotoperiode) dan suhu. Jalur respons mereka paling baik dijelaskan dalam Arabidopsis, yang saat ini menawarkan
kerangka kerja konseptual terperinci dan berfungsi sebagai pembanding untuk spesies lain. Padi, fokus dari tinjauan
ini, juga memiliki jalur pembungaan fotoperiodik, tetapi 150 juta tahun evolusi yang berbeda di lingkungan yang
sangat berbeda telah mendiversifikasi arsitektur molekulernya. Jalur persepsi suhu sekitar sangat terkait dengan
jalur penyinaran dan pada dasarnya menyatu pada gen yang sama untuk mengubah waktu pembungaan. Saat
mengamati topologi jaringan, terbukti bahwa jaringan pembungaan padi dipusatkan pada AWAL KEPALA TANGGAL
1, pengatur transkripsi khusus beras. Di sini, kami merangkum fitur paling penting dari jaringan pembungaan
fotoperiodik padi, dengan penekanan pada keunikannya, dan mendiskusikan hubungannya dengan hormonal,
persepsi suhu, dan jalur stres.
Kata kunci: padi, penyinaran, suhu, pembungaan, stress, florigen
Vicentini G., Biancucci M., Mineri L., Chirivÿ` D., Giaume F., Miao Y., Kyozuka J., Brambilla V., Betti C., dan Fornara
F. (2023). Pengendalian lingkungan waktu pembungaan padi. Plant Comm.4, 100610.
CIRI-CIRI KHAS BERAS regulator transkripsional (Yano et al., 2000). Hd1 menunjukkan kesamaan
FOTOPERIODIK BUNGA urutan tinggi dengan CONSTANS (CO), promotor pembungaan pusat jalur
fotoperiodik Arabidopsis. Fitur ini menunjukkan adanya jaringan pembungaan
JALAN bersama secara evolusioner yang umum untuk monokotil dan dikotil. Dalam
Waktu berbunga adalah sifat adaptif utama yang memungkinkan tanaman Arabidopsis, transkripsi CO dikendalikan oleh jam sirkadian melalui
menyinkronkan reproduksi dengan kondisi lingkungan yang paling GIGANTEA (GI), dan CO diperlukan untuk mengaktifkan transkripsi
menguntungkan. Perubahan musiman panjang hari (fotoperiode) mengikuti FLOWERING LOCUS T (FT), yang mengkodekan protein florigenik seluler
kurva sinusoidal yang amplitudonya bervariasi dengan garis lintang, tetapi (Andre´s dan Coupland, 2012). Pengaturan jaringan serupa juga ditunjukkan
pada lokasi tertentu, tidak berubah dari satu tahun ke tahun lainnya. Dengan pada beras, di mana OsGI mempromosikan ekspresi Hd1 , yang pada
demikian, variasi penyinaran menawarkan parameter yang sangat stabil gilirannya mempromosikan transkripsi homolog FT Hd3a dalam kondisi
dan terukur untuk menjangkarkan reproduksi tumbuhan pada waktu tertentu fotoperiodik induktif (Hayama et al., 2003). Homologi yang kuat antara gen
dalam setahun, dan spesies tumbuhan dapat dikategorikan menurut rejim dan pengaturan serupa dalam jaringan pengatur gen (GRN) selanjutnya
riodik penyinaran yang diperlukan untuk mendorong pembungaan. Tanaman mendukung gagasan arsitektur yang dilestarikan.
hari pendek (SD) berbunga ketika panjang hari jatuh di bawah ambang kritis,
tanaman hari panjang (LD) berbunga ketika panjang hari melebihi ambang
kritis, dan tanaman hari netral tidak menggunakan isyarat fotoperiodik untuk Namun, karena lebih banyak gen yang dikloning, menjadi jelas tidak hanya
reproduksi waktu. bahwa pengatur khusus beras ada tetapi juga bahwa gen yang homolog
dengan pengatur pembungaan Arabidopsis diatur secara berbeda dalam
Padi merupakan tanaman SD fakultatif yang berbunga lebih cepat jika jaringan pembungaan. Oleh karena itu, kami ingin
terkena panjang hari lebih pendek dari 13,5 jam; ia juga dapat berbunga
dalam kondisi LD, meskipun membutuhkan waktu lebih lama (Itoh et al.,
Diterbitkan oleh Kantor Editorial Plant Communications Shanghai
2010). Pemetaan genetik memungkinkan isolasi beberapa gen waktu bekerja sama dengan Cell Press, cetakan dari Elsevier Inc., atas nama CSPB dan
pembungaan, dimulai dengan HEADING DATE 1 (Hd1) yang termasuk dalam keluarga
CEMPS,CCT dari
CAS.
Akhirnya, ciri khas padi adalah evolusi sistem florigen ganda yang
penting untuk pembungaan di bawah fotoperiode apa pun (Komiya et
al., 2008, 2009). Induksi Florigen tidak hanya bergantung pada SD, dan
ekspresi RFT1 juga dapat dipromosikan di bawah LD (Komiya et al.,
2009). Fleksibilitas dalam ekspresi florigen ini memungkinkan beras
Gambar 2. Pola akumulasi diurnal pengatur pembungaan utama menggunakan Hd3a dan RFT1 di lingkungan yang berbeda
di bawah LD (kotak di sebelah kiri) dan SD (kotak di sebelah kanan)
menunjukkan posisi sentral Ghd7 dalam model kebetulan dan garis lintang (Wang et al., 2021a). Contoh utama dari fleksibilitas
eksternal pembungaan padi. tersebut adalah relaksasi ketergantungan sepanjang hari yang terjadi
Puncak transkripsi GI melacak senja di bawah LD dan SD. Protein GI berinteraksi dengan pada garis lintang yang lebih tinggi dan ditingkatkan oleh seleksi buatan,
Ghd7 dan berkontribusi pada degradasinya dengan cara yang bergantung pada proteasome yang memungkinkan perluasan spesies dan area budidayanya
26S. Transkripsi Ghd7 peka terhadap lampu merah, dengan gerbang inducibility (naungan ( Takahashi et al., 2009; Goretti et al., 2017). . Dengan demikian, induksi
merah) yang terjadi pada pagi hari di bawah LDs. Gerbang bergeser ke malam di bawah SD, fotoperiodik florigen sangat penting untuk pembungaan SD dan LD,
dan meskipun beberapa publikasi telah melaporkan pengurangan transkripsi di bawah SD,
dan, berbeda dengan Arabidopsis, tidak ada jalur waktu pembungaan
konsensus yang lebih besar menunjukkan puncak transkripsi di pagi hari, tidak berbeda dari
bebas florigen lain yang telah dijelaskan dalam beras hingga saat ini.
yang terdeteksi di bawah LD. Terlepas dari transkripsi, protein Ghd7 tidak terakumulasi di
bawah SD atau mutan phyB, tetapi menunjukkan penurunan akumulasi GI di atas ekspresi.
Dengan demikian, lapisan pengatur yang bergantung pada cahaya dan fotoperiode
menentukan kelimpahan Ghd7. Ekspresi Ehd1 terjaga keamanannya di pagi hari dengan
ASPEK PASCA-TERJEMAHAN DARI
sinyal cahaya biru (naungan biru). OsGI dapat menginduksi transkripsi Ehd1 di bawah SD KONTROL WAKTU BERBUNGA
ketika tidak dimusuhi oleh protein Ghd7. Profil diurnal transkripsi Ehd1 juga ditentukan oleh
Hd1 dan PRR37, yang mempromosikan ekspresinya di bawah SD dan menekannya di bawah Pembentukan kompleks tingkat tinggi Studi
LD. terbaru telah menjelaskan tingkat koordinasi yang lebih tinggi di antara
komponen jalur fotoperiode, bergantung pada kombinasi interaksi
protein-protein, pembentukan kompleks tingkat tinggi, dan modifikasi
Terakhir, Hd3a dan RFT1 ditranskripsi di bawah SD dengan kombinasi induksi yang dimediasi
pasca-translasi. Level ini menyetel output jaringan dengan berinteraksi
Hd1 dan Ehd1. Di bawah LDs, ekspresi florigen ditekan oleh Hd1, dan induksi oleh Ehd1
dengan kuantitas cahaya dan sinyal kualitas dari lingkungan.
terbatas. Akhirnya, RFT1 lolos dari represi di bawah LD dan ditranskripsi untuk
mempromosikan pembungaan.
Garis padat dan putus-putus masing-masing menunjukkan pola akumulasi protein dan
mRNA. Simbol jam menunjukkan bahwa gen tersebut berada di bawah Dari perspektif ini, protein Hd1 paling banyak dipelajari, karena efeknya
kontrol jam sirkadian. yang kuat pada pembungaan dan karena
Ehd1
Ehd1
Hd3a/ RFT1 Hd3a/ RFT1 SEBUAH KOTAK
INTI
D
Hd3a/ RFT1
Hd3a/ RFT1
INTI
Vakuola
BERBUNGA
akumulasi menentukan waktu ekspresi FT . Kelimpahan pada setiap titik waktu yang diuji dan dalam penyinaran apa pun. Namun,
siklus protein beras HD1, dengan akumulasi puncak terjadi degradasi fagik otomatis dari Hd1 tampaknya lebih efektif dalam
sebagian besar pada siang hari, dan bersifat antifasik relatif terhadap akumulasi gelap. Data ini menunjukkan bahwa akumulasi harian dari Hd1
mRNA (Yang et al., 2015). Pola ini bukan akibat dari protein tidak dibentuk oleh mekanisme degradasi atau perubahan
stabilitas meningkat selama fase cahaya tetapi mungkin hasil dari dalam panjang hari.
siklus mRNA Hd1 (Gambar 2) (Ishikawa et al., 2011). Itu
stabilitas diferensial tidak tergantung cahaya juga dikuatkan Selain pergantian protein, fosforilasi adalah hal lain
oleh pola akumulasi serupa yang diamati di bawah SD dan langkah penting dalam kontrol pasca-translasi regulasi Hd1
LDs (Yang et al., 2015; Hu et al., 2022). aktivitas. HEADING DATE REPRESSOR 1 (HDR1) adalah sebuah transkripsi
faktor yang menunda pembungaan dengan meningkatkan transkripsi Hd1
Hd1 ditargetkan untuk degradasi pada HEADING DATE dan mengurangi Ehd1 dan florigen (Sun et al., 2016).
FAKTOR TERKAIT 1, ligase ubiquitin E3 jari-RING, via Pada tingkat pasca-translasi, HDR1 dapat berikatan dengan kinase
proteasome 26S dan oleh komponen autophagy OsK4, yang memfosforilasi Hd1. Ketiga protein ini membentuk a
jalur, termasuk OsATG5, -7, dan -8 (Yang et al., 2015; Hu kompleks in vivo, menunjukkan bahwa Hd1, mungkin dalam bentuk yang terlapisi
et al., 2022). Tidak ada efek waktu hari yang jelas pada protein HD1 fosfornya, mungkin terlibat dalam lingkaran positif pengaturan diri
akumulasi dalam mutan haf1 atau osatg5 , karena kadar Hd1 lebih tinggi yang melibatkan HDR1 dan OsK4 (Gambar 3). Selain itu, baik itu
PEBP dengan pengaruh yang sangat kuat pada pembungaan dapat dibagi Florigen bergerak melalui plasmodesmata untuk mencapai bagian tanaman
menjadi dua kelas fungsional utama, FT-LIKE dan TFL1-LIKE. Dalam yang jauh. FT dimuat ke dalam floem oleh FT INTERACTING PROTEIN 1
Arabidopsis, FT dan TFL1, anggota pendiri dari setiap kelas, berbagi identitas (FTIP1) (Liu et al., 2012). Telah dibuktikan bahwa beras FTIP1 (OsFTIP1),
asam amino lebih dari 98% tetapi memiliki fungsi antagonis. FT homolog terdekat dari Arabidopsis FTIP1, diperlukan untuk mempromosikan
mempromosikan pembungaan dengan memediasi sinyal fotoperiode dan pembungaan padi di bawah LD melalui modulasi spesifik transportasi RFT1
suhu, sedangkan TFL1 menekan pembungaan (Wickland dan Hanzawa, dari sel pendamping ke elemen saringan. OsFTIP1 berinteraksi dengan
2015; Susila et al., 2021). RFT1, dan pada mutan osf tip1 , RFT1 terakumulasi ke tingkat tinggi dalam
sel pengiring tetapi menurun dalam elemen ayakan, menunjukkan bahwa
OsFTIP1 mempromosikan ekspor RFT1 dari sel pengiring ke elemen ayakan
Ada 13 gen padi dalam keluarga gen mirip FT (Chardon dan Damerval, dalam floem (Song et al., 2017). Meskipun mekanisme ini terbatas pada
2005). Hd3a dan RFT1 adalah paralog yang dipisahkan hanya 11,5 kb yang transpor RFT1 di bawah LD, mekanisme paralel menentukan transpor Hd3a
muncul dari peristiwa duplikasi lokal yang terjadi setelah divergensi monokotil di bawah SD. OsFTIP9 mengkodekan homolog OsFTIP1, dan produk
dari dikotil (Komiya et al., 2008). Mereka berbagi tingkat identitas yang tinggi, proteinnya berinteraksi dengan Hd3a untuk memediasi pemuatannya ke
tetapi pola ekspresi mereka telah menyimpang, menghasilkan sebagian dalam elemen ayakan (Zhang et al., 2022). Konsisten dengan fungsi ini,
fungsi yang berbeda. Kedua gen ditranskripsi sebagai respons terhadap SD, mutan osftip9 berbunga terlambat di bawah SD tetapi tidak pada LD. Dengan
dan protein serumpunnya dapat berpindah ke meristem dan memicu demikian, dimer OsFTIP1-RFT1 dan OsFTIP9-Hd3a saling mencerminkan
pembungaan (Tamaki et al., 2007; Komiya et al., 2009). Jadi, dalam kondisi fungsi masing-masing di bawah LD dan SD (Gambar 3). Apakah dimerisasi
induktif, mereka redundan dan mengkompensasi fungsi satu sama lain. juga dapat dilakukan dengan menukar interaksi antara dimer masih harus
Hanya mutan tunggal Hd3a yang menunjukkan sedikit penundaan ditentukan. Meskipun demikian, interaksi kedua dimer diperkuat oleh
pembungaan. Namun, tanaman RNAi ganda Hd3a – RFT1 tidak pernah OsTPR075, protein berulang tetratrikopeptida yang aktif di bawah SD dan LD
berbunga di bawah SD, menunjukkan bahwa, berbeda dengan Arabidopsis, (Zhang et al., 2022). Saat bermutasi, ini mengurangi jumlah Hd3a dan RFT1
peralihan ke pengembangan perbungaan sepenuhnya bergantung pada yang mencapai puncak, yang menyebabkan pembungaan terlambat di bawah
florigen dalam beras (Komiya et al., 2008; Tamaki et al., 2015). Dalam kondisi penyinaran apa pun.
LD, ekspresi RFT1, tetapi bukan Hd3a, diinduksi pada daun. Ini cukup untuk
memicu pembungaan, meskipun lebih lambat dari SD, dan menunjukkan
bagaimana perilaku fotoperiodik fakultatif padi selalu dimediasi oleh florigen.
Sampai saat ini belum ada jalur induksi pembungaan yang bebas florigen Mekanisme transportasi seperti itu mungkin memerlukan perdagangan
yang dijelaskan. endosom yang dimediasi oleh protein SNARE dalam membran intraseluler.
Dalam Arabidopsis, SYNTAXIN OF PLANTS121 (SYP121) mengkode
protein SNARE yang berinteraksi dengan QUIRKY (QKY). Kompleks SYP121-
Homolog terdekat dari Hd3a dan RFT1, FT LIKE 1 (FT-L1), memiliki aktivitas QKY mengatur transpor FT endosom dalam vesikel yang diarahkan ke
florigenik dan dapat menginduksi pembentukan bunga pada bibit yang membran plasma sel pendamping.
ditanam secara in vitro ketika diekspresikan secara berlebihan (Izawa et al., Ekspor FT dari sel pendamping ke elemen saringan terganggu pada mutan
2002). Ekspresi FT-L1 secara langsung diinduksi oleh Hd3a dan RFT1 hilangnya fungsi SYP121 atau QKY , menunda pembungaan di bawah LD
(Giaume et al., 2023). Transkrip dan proteinnya dapat dideteksi pada semua (Liu et al., 2019a). Perdagangan endosom juga dapat terlibat dalam
tahap perkembangan perbungaan di jaringan yang sama, menunjukkan pengangkutan florigen dalam beras, karena OsFTIP1 dan OsFTIP9
aktivitas otonom sel meristematik (Furutani et al., 2006; Zong et al., 2022; terlokalisasi dalam retikulum endoplasma (Song et al., 2017; Zhang et al.,
Giaume et al., 2023). Mutasi kehilangan fungsi menunda pembungaan dan 2022). Namun, homolog SYP121 dan QKY pada beras belum dipelajari.
meningkatkan keterlambatan mutan tunggal hd3a dan rft1 . Menariknya,
mutan mengembangkan malai dengan jumlah cabang sekunder yang lebih
banyak, menunjukkan determinasi yang berkurang, dan efek ini secara Regulasi pemuatan florigen ke dalam aliran floem kemungkinan tunduk pada
genetik dapat dipisahkan dari kontrol bunga. beberapa lapisan kontrol. Fosfatidilinositol
Meristem adalah penerima utama sinyal pembungaan, di mana terjadi integrasi Pengamatan ini menunjukkan bahwa OsMADS14, -15, -18, dan -34 mungkin
beberapa input lingkungan. Komitmen untuk nasib pembungaan tidak dapat bukan faktor pertama yang bertanggung jawab untuk konversi meristem vegetatif
diubah untuk sebagian besar spesies dan harus diatur waktunya dan dilaksanakan menjadi meristem perbungaan, dan target lain, yang diaktifkan sebelumnya atau
dengan tepat, terutama dalam semusim yang siklus hidupnya berakhir setelah secara paralel, kemungkinan besar ada.
satu episode pembungaan. Ambang batas sinyal induktif yang tepat harus dicapai
sebelum saklar reproduktif terjadi. FRC berbagi arsitektur heterotrimerik yang sama dengan FAC
tetapi menggabungkan elemen yang menekan transisi bunga. Terutama, RCN
dapat menggantikan Hd3a dan RFT1, mengikat ke 14-3-3 dan menunda transisi
Masih belum jelas bagaimana protein florigenik berpindah dari jaringan konduktif, (Kaneko-Suzuki et al., 2018). Selain itu, bZIP dengan fungsi represi bunga, seperti
yaitu floem atau protofloem dewasa, ke dalam sel meristematik di puncak dan Hd3a BINDING FACTORS 1 dan 2, dapat membentuk FRC meskipun aktivitasnya
bagaimana mereka bergerak di dalamnya. Namun, penelitian pada padi, sebagian besar terjadi di daun dan perannya yang tepat di SAM perlu didefinisikan
Arabidopsis, dan beberapa spesies model dan non-model lainnya menunjukkan lebih menyeluruh (Brambilla et al., 2017 ) .
mode aksi umum untuk florigen. Inti dari aktivitas mereka adalah kompleks
aktivasi / penekan florigen (FAC / FRC) (Taoka et al., 2011; Park et al., 2014; Li et
al., 2015; Tylewicz et al., 2015; Abe et al., 2019; Collani et al., 2019; Sun et al., Fosforilasi motif C-terminal SAP/TAP dari bZIP yang membentuk FAC/FRC
2020; Cerise et al., 2021; Liu et al., 2021). FAC adalah heterohexamer yang diperlukan untuk interaksinya dengan protein 14-3-3, dan mutasi di wilayah ini
berkumpul di sekitar dimer dari 14-3-3 protein, yang membentuk struktur berbentuk mengurangi fungsionalitas kompleks. Sebaliknya, mutasi yang meniru fosforilasi
W. Saat memasuki sel meristematik, Hd3a dan RFT1 mengikat dimer 14-3-3 di konstitutif memberikan aktivitas promosi pembungaan yang lebih kuat pada
sitoplasma (Taoka et al., 2011; Zhao et al., 2015). Kompleks florigen/14-3-3 protein FD (Taoka et al., 2011; Collani et al., 2019). Pada beras, beberapa protein
memasuki nukleus, di mana ia berikatan dengan faktor transkripsi dari keluarga kinase yang mempengaruhi sifat fungsional dan interaksi OsFD telah diisolasi.
bZIP yang memberikan sifat pengikatan DNA ke kompleks. Dua molekul florigen Calcineurin B-like-interacting protein kinase 3 (OsCIPK3) berinteraksi dengan dan
bertumpu pada daerah terminal-C dari masing-masing protein 14-3-3, dan dua memfosforilasi OsFD1 (Peng et al., 2021). Menariknya, mutan oscipk3 menunjukkan
sudut di dasar W membentuk kantong tempat bagian terminal-C dari bZIP berikatan. fenotipe pembungaan yang terlambat dan mengakumulasi OsFD1 yang kurang
terfosforilasi hanya di bawah LDs, sedangkan tanaman yang tumbuh dalam
kondisi SD memiliki fenotipe tipe liar. Dengan demikian, OsCIPK3 secara khusus
memengaruhi perakitan kompleks RFT1/14-3-3/OsFD1 di bawah LD, menunjukkan
bahwa kinase lain yang tidak diketahui beroperasi di bawah SD. Protein kinase
yang bergantung pada kalsium OsCDPK41 dan OsCDPK49 berinteraksi
Struktur FAC pertama kali ditunjukkan mengandung OsFD1
faktor transkripsi, tetapi kemudian ditunjukkan bahwa beberapa
OsMADS
Pemilihan gen waktu pembungaan selama padi
domestikasi dan pemuliaan
Waktu pembungaan merupakan sifat bunga terapan utama karena
mempengaruhi dua aspek utama budidaya padi: pemanjangan ke atas
C
lintang dan adaptasi terhadap lingkungan setempat. Peraturan LD
jalur menunda pembungaan (Gambar 1), dan mutasi pada LD utama
represor mempercepat siklus panen, memungkinkan beras menjadi
dibudidayakan pada garis lintang dengan musim tanam yang lebih pendek (Shrestha
et al., 2014). Mutasi di Hd1, Ghd7, Ghd8, dan PRR37 adalah
tersebar luas di plasma nutfah Asia dan Eropa dan memiliki
berperan penting dalam membawa beras hingga 55N di Cina dan 45N
di Eropa (Gao et al., 2014; Go´mez-Ariza et al., 2015; Goretti
et al., 2017). Sebagian besar varietas Eropa berbagi tingkat tinggi
kesamaan genetik dengan varietas dari Cina utara, dan mutan
alel gen represor LD sebagian besar dimiliki oleh keduanya
Gambar 4. Menyeimbangkan sinyal selama peralihan meristematik ke plasma nutfah (Cai et al., 2013). Kemungkinan ekspansi ke
pertumbuhan reproduksi. Cina utara mengikuti domestikasi dan mendahului penyebaran
Meristem di atas mewakili tahap perkiraan di mana tanaman ke Eropa Mediterania. Jadi, kumpulan umum
peristiwa molekuler yang diwakili di bawah ini terjadi. alel berbunga-waktu berada di bawah seleksi terus menerus oleh
(A) Keseimbangan antara SPL dan miR156/529 menentukan percabangan peternak di berbagai wilayah dunia (Zhao et al., 2011).
pola dan fitur vegetatif dari perbungaan. Di antara mereka, alel mutan hd1 sangat melimpah,
(B) Florigen yang diangkut dari daun membentuk FAC yang menginduksi
mungkin karena mereka juga memberikan keuntungan adaptif di
transkripsi gen kotak MADS dan mengubah nasib perkembangan
budidaya di bawah SD. Di daerah tropis, Hd1 fungsional
meristem. DHD4 bersaing dengan OsFD1 untuk mengikat Gf14 di bawah LD.
mempromosikan pembungaan, memperpendek siklus sejauh itu
(C) Sakelar reproduksi dimusuhi oleh FRC, dan RCN yang diangkut dari daun
bersaing dengan florigen untuk mengikat Gf14s.
varietas tidak memanfaatkan seluruh musim tanam,
menyebabkan penalti hasil yang parah (Kim et al., 2018). Pengecualian
untuk aturan umum ini melibatkan varietas yang mengandung HD1 fungsional
Hyper-ramifikasi (Nakagawa et al., 2002; Kaneko-Suzuki et al., tetapi RFT1 non-fungsional , yang hanya ditemukan pada plasma nutfah indica
2018). Fenotipe ini adalah kebalikan dari yang diproduksi yang dibudidayakan di garis lintang yang lebih rendah (Ogiso-Tanaka et al., 2013).
oleh mutasi florigen atau ekspresi berlebih (Tamaki et al.,
2015; Giaume et al., 2023). Jadi, meskipun kontrol berkembang Meskipun efek utama dari mutasi tunggal pada pembungaan, kehilangan
pengembangan menuju diferensiasi spikelet, yang efek langsungnya fungsi alel represor LD jarang ditemukan sendirian, dan pada varietas modern,
adalah pengurangan percabangan, RCN memusuhi lintasan ini, kombinasi dari beberapa alel mutan adalah umum.
dan keseimbangan yang dihasilkan membentuk arsitektur perbungaan. Fitur ini bisa menjadi konsekuensi dari sejarah perkembangbiakan masing-masing
Modulasi buatan dari dua kekuatan yang berlawanan, dengan cara varietas, yang telah dipilih memiliki waktu berbunga yang
genetika, mungkin menarik untuk peningkatan hasil jika hiper ramifikasi, panjang siklus sangat cocok dengan panjang tanam lokal
peningkatan jumlah spikelet, dan kesuburan floret bisa musim. Efek aditif atau epistatik bergantung pada interaksi molekuler yang
berasosiasi pada varietas yang sama. dijelaskan di atas dan berkontribusi pada adaptasi siklus yang baik
panjang (Gambar 2), misalnya, piramida ghd7 dan prr37 menghasilkan
Di antara RCN, setidaknya RCN4 adalah target langsung hilir akselerasi terkuat di bawah LD karena menghilangkan kompleks
OsMADS34/PAP2 dan paralognya OsMADS5 (Zhu et al., 2022). yang secara independen menekan ekspresi florigen, memungkinkan akses
Mutan rcn4 tunggal kemungkinan besar tidak menunjukkan percabangan yang diubah ke garis lintang tertinggi.
Dalam DE, level ABA meningkat dan menginduksi ekspresi bZIP23, yang
bertindak sebagai regulator positif dari respons DE. bZIP23 memberi umpan balik
pada regulasi gen waktu berbunga, menginduksi transkripsi OsTOC1, Ehd1,
Hd3a, dan RFT1 dan mengurangi transkripsi Ghd7 (Du et al., 2018). Analisis
genetik menunjukkan bahwa mutasi pada PRR37, GI, dan EARLY FLOWERING
3 (ELF3) menunda pembungaan di bawah defisit air ringan dibandingkan dengan
kontrol tipe liar, menghasilkan respons DE yang terganggu, dan ini terjadi secara
terpisah dari ABA. Ekspresi Ehd1, Hd3a, dan RFT1 cor berhubungan dengan
waktu pembungaan mutan. Dengan demikian, komponen jalur fotoperiode
terintegrasi dengan respons DE secara kompleks, hanya sebagian bergantung
B pada ABA (Weng et al., 2014; Du et al., 2018) (Gambar 5). Hilir florigen, faktor
transkripsi OsMADS18 telah diidentifikasi sebagai sangat terinduksi selama
kekeringan sebagai integrator tambahan DE, konsisten dengan peran pembungaan
OsGI
gen kotak-MADS pada akhir kaskade fotoperiodik ( Fornara et al., 2004; Kobayashi
RCN1
OsELF3 OsPRR37 et al., 2012; Groen et al., 2020).
Ehd1
OsbZIP23 OsWRKY104
RFT1 Hd3a
Ghd7
BERBUNGA
Keterlambatan pembungaan yang disebabkan oleh kekeringan parah juga
bergantung pada ABA tetapi berlangsung melalui mekanisme molekuler yang berbeda.
Gambar 5. Jaringan pengatur gen yang mengendalikan pembungaan di bawah Tingkat ABA yang tinggi menginduksi ekspresi faktor transkripsi OsABF1 bZIP,
tekanan kekeringan. penekan pembungaan (Zhang et al., 2016). Mengurangi ekspresinya oleh RNAi
(A) Sawah yang mengalami kekeringan parah selama musim panas 2022 di Italia utara. juga mempercepat pembungaan di bawah tekanan kekeringan dan menginduksi
Kekeringan melanda beberapa negara pada tahun 2022. Ehd1. Aktivitas OsABF1 bergantung pada OsWRKY104 yang membuat modul
( B ) Jaringan molekuler yang mengendalikan ekspresi Ehd1 sebagai respons terhadap represif bunga yang bergantung pada ABA. Stres kekeringan dan ABA juga
tekanan kekeringan ringan dan parah. Panah dan panah berujung datar masing-masing menginduksi ekspresi RCN1, dengan rcn1 melemahkan keterlambatan
menunjukkan aktivasi transkripsi dan represi. Gen yang ditunjukkan dengan warna ungu
pembungaan yang disebabkan oleh stres (Wang et al., 2020a). Masih harus
bertindak sebagai penghambat pembungaan, dan gen yang berwarna hijau bertindak sebagai
ditentukan apakah dan bagaimana mekanisme yang bergantung pada OsABF1-
promotor. Panah hijau menunjukkan peningkatan biosintesis.
dan RCN1 terintegrasi dan di jaringan mana. Mengingat bahwa RCN dapat
membentuk kompleks penekan bunga dengan bZIP, kemungkinan yang menarik
menunjukkan keterlambatan pembungaan (Wang et al., 2013). Pengamatan ini
adalah bahwa OsABF1 dan RCN1 berinteraksi untuk menunda pembungaan
melambangkan kesulitan dalam mempelajari ketergantungan pembungaan pada
ketika tanaman mengalami kekeringan parah (Gambar 5).
jalur hormonal, mengingat keterkaitannya yang banyak dan kompleks.
Meskipun transisi ke pembungaan sebagian besar ditentukan oleh interaksi Budidaya padi di delta sungai terancam oleh salinisasi tanah, yang terjadi ketika
antara penyinaran dan komposisi alelik pada lokus waktu pembungaan, parameter peristiwa alam mengembalikan air laut ke sawah.
lingkungan lainnya, termasuk cekaman abiotik, dapat memodifikasi transisi Serangkaian mekanisme perlindungan yang dijelaskan dengan baik diaktifkan
tersebut. Semua stres eksternal akhirnya menyatu pada regulasi transkripsional sebagai respons terhadap peningkatan salinitas. Namun, hubungan antara stres
Ehd1, Hd3a, dan RFT1, yang dengan demikian bertindak sebagai integrator dari garam dan kontrol waktu pembungaan baru mulai dieksplorasi dan menunjukkan
banyak sinyal. bahwa komponen jam sirkadian adalah integrator preferensial dari jalur ini.
Stres kekeringan Evening complex (EC) adalah fitur sentral dari jam sirkadian yang disusun oleh
Sebagian besar budidaya padi bergantung pada air hujan dan karena itu LUX ARRHYTHMO, ELF3, dan ELF4 dan berikatan dengan DNA untuk menekan
bergantung pada fluktuasi ketersediaan air. ekspresi gen (Silva et al., 2020). Genom beras mengkodekan dua ortolog dari
Bahkan ketika padi ditanam di sawah, peristiwa cuaca ekstrem yang terkait ELF3 dan tiga dari ELF4. Mutan tunggal oself4a , oself3-1, dan oslux sangat
dengan perubahan iklim dapat mengganggu pasokan air, menimbulkan tekanan sensitif terhadap stres garam, menunjukkan penurunan tingkat kelangsungan
kekeringan (Gambar 5). hidup ketika tumbuh pada konsentrasi NaCl yang tinggi (Wang et al., 2021d).
Selain itu, di bawah SD, mutan oself4a berbunga terlambat, sedangkan mutan
Waktu untuk berbunga dapat merespons kekeringan dengan dua cara yang oslux tunggal dan ganda oself3-1 oself3-2 tidak pernah berbunga (Wang et al.,
berlawanan, baik menurun, respons yang dikenal sebagai pelarian kekeringan 2021d; Andrade et al., 2022). Pengamatan ini menunjuk ke EC sebagai integrator
(DE), atau meningkat. Efek akhir tergantung pada tingkat keparahan kekeringan. sinyal pembungaan dan stres garam. Target langsung EC mencakup beberapa
Defisit air yang ringan memicu DE, dan pembungaan yang lebih awal PRR serta OsGI. OsELF4a, OsLUX, dan OsELF3-1 dapat mengikat promotor
memungkinkan tanaman untuk menyelesaikan siklus hidupnya sebelum stres OsGI untuk menekan ekspresinya. Mutasi pada OsGI meningkatkan tingkat
menjadi terlalu parah (Weng et al., 2014; Du et al., 2018; Groen et al., 2020). kelangsungan hidup beras pada garam atau
Sebaliknya, kekeringan parah mengancam kelangsungan hidup tanaman, dan
penundaan pembungaan mencegah masuknya tanaman ke dalam tanah
Andrade, L., Lu, Y., Cordeiro, A., Costa, JMF, Wigge, PA, Saibo, NJM, dan Collani, S., Neumann, M., Yant, L., dan Schmid, M. (2019). FT memodulasi
Jaeger, KE (2022). Kompleks malam mengintegrasikan sinyal penyinaran pengikatan DNA selebar genom dari faktor transkripsi bZIP FD. Fisik
untuk mengontrol pembungaan pada beras. Proses Natl. Acad. Sains. Tumbuhan. (Cuci. DC) 180:367–380.
AS 119, e2122582119.
Dai, C., dan Xue, H.-W. (2010). Padi berbunga awal1, CKI, memfosforilasi protein
Andre´s, F., dan Coupland, G. (2012). Dasar genetik dari respons pembungaan DELLA SLR1 untuk mengatur pensinyalan giberelin secara negatif. EMBO
terhadap isyarat musiman. Nat. Pendeta Genet. 13:627–639. J.29:1916–1927.
Andre's, F., Galbraith, DW, Talo'n, M., dan Domingo, C. (2009). Ding, C., Anda, J., Chen, L., Wang, S., dan Ding, Y. (2014). Pupuk nitrogen
Analisis SENSITIVITAS FOTOPERIODE5 menyoroti peran fitokrom dalam meningkatkan jumlah bulir per malai dengan meningkatkan sintesis sitokinin
pembungaan fotoperiodik pada beras. Fisik Tumbuhan. pada beras. Perwakilan Sel Tumbuhan 33:363–371.
(Cuci. DC) 151:681–690.
Doi, K., Izawa, T., Fuse, T., Yamanouchi, U., Kubo, T., Shimatani, Z., Yano, M.,
Ashikari , M. , Sakakibara , H. , Lin , S. , Yamamoto , T. , Takashi , T. , Nishimura , dan Yoshimura, A. (2004). Ehd1, regulator respons tipe-B dalam beras,
A. , Angels , ER , Qian , Q. , Kitano , H. , dan Matsuoka , M. ( 2008 ).2005). memberikan promosi pembungaan hari pendek dan mengontrol ekspresi gen
Sitokinin oksidase mengatur produksi gabah. Sains 309:741–745. seperti FT secara independen dari Hd1. Gen Dev. 18:926–936.
Ballerini, ES, dan Kramer, EM (2011). Mengingat evolusi: evaluasi ulang Du, Y., Liu, L., Li, M., Fang, S., Shen, X., Chu, J., dan Zhang, Z. (2017a).
konservasi dalam regulasi CO-FT dan perannya dalam regulasi fotoperiodik UNBRANCHED3 mengatur percabangan dengan memodulasi biosintesis
waktu berbunga. Depan. Tanaman Sci. 2:81. sitokinin dan pensinyalan pada jagung dan beras. Phytol Baru. 214:721–733.
Bla'zquez, MA, dan Weigel, D. (2000). Integrasi sinyal induktif bunga di Du, A., Tian, W., Wei, M., Yan, W., He, H., Zhou, D., Huang, X., Li, S., dan
Arabidopsis. Alam 404:889–892. Ouyang, X. (2017b). Modul DTH8-hd1 memediasi regulasi pembungaan padi
yang bergantung pada panjang hari. Mol. Tanam 10:948–961.
Brambilla, V., Martignago, D., Goretti, D., Cerise, M., Somssich, M., de Rosa, M.,
Galbiati, F., Shrestha, R., Lazzaro, F., Simon, R. , dan Fornara, F. (2017). Du, H., Huang, F., Wu, N., Li, X., Hu, H., dan Xiong, L. (2018). Regulasi integratif
Kompleks faktor transkripsi antagonis memodulasi transisi bunga dalam kekeringan melalui jalur yang bergantung pada ABA dan independen pada
beras. Sel Tumbuhan 29:2801–2816. beras. Mol. Tanam 11:584–597.
€
Cai, X., Fan, J., Jiang, Z., Basso, B., Sala, F., Spada, A., Grassi, F., dan Lu , B.- Eriksson, S., Bohlenius, H., Moritz, T., dan Nilsson, O. (2006). GA4
R. (2013). Teka-teki asal dan evolusi padi Italia: menentukan divergensi adalah giberelin aktif dalam regulasi transkripsi daun dan inisiasi bunga
genetik dan afinitas plasma nutfah padi dari Italia dan Asia. PLoS Satu 8, arabidopsis. Sel Tumbuhan 18:2172–2181.
e80351.
Fornara , F. , Parenicova ÿ , L. , Falasca , G. , Pelucchi , N. , Masiero , S. ,
Cai, M., Chen, S., Wu, M., Zheng, T., Zhou, L., Li, C., Zhang, H., Wang, J., Xu, Ciannamea , S. , Lopez-Dee , Z. , Altamura , MM , Colombo , L. , dan Kater ,
X., Chai, J. , et al. (2019). Pos 7 awal berinteraksi dengan DTH8, dan MM (2004). Karakterisasi fungsional OsMADS18, anggota subfamili AP1/
mengatur waktu pembungaan pada padi. Perwakilan Sel Tumbuhan 38:521–532. SQUA dari gen kotak MADS. Fisik Tumbuhan . (Cuci. DC) 135:2207–2219.
Cai, M., Zhu, S., Wu, M., Zheng, X., Wang, J., Zhou, L., Zheng, T., Cui, S., Zhou,
S., Li, C. , et al. (2021). DHD4, faktor transkripsi keluarga seperti CONSTANS , Fujino, K., Wu, J., Sekiguchi, H., Ito, T., Izawa, T., dan Matsumoto, T.
menunda tanggal tajuk dengan memengaruhi pembentukan kompleks FAC (2010). Berbagai peristiwa introgresi seputar gen waktu pembungaan Hd1
dalam beras. Mol. Tanam 14:330–343. pada padi budidaya, Oryza sativa L. Mol. Genet. Genom. 284:137–146.
Cerise, M., Giaume, F., Galli, M., Khahani, B., Lucas, J., Podico, F., Tavakol, E.,
Parcy, F., Gallavotti, A., Brambilla, V., dan Fornara, F. Furutani, I., Sukegawa, S., dan Kyozuka, J. (2006). Analisis luas genom ekspresi
(2021). OsFD4 mempromosikan transisi bunga beras melalui pembentukan gen spasial dan temporal dalam pengembangan malai padi. Tanaman J.
kompleks aktivasi florigen di meristem apikal pucuk. Phytol Baru . 229:429– 46:503–511.
443.
Galbiati, F., Chiozzotto, R., Locatelli, F., Spada, A., Genga, A., dan Fornara, F.
Chardon, F., dan Damerval, C. (2005). Analisis filogenomik dari (2016). Hd3a, RFT1 dan Ehd1 mengintegrasikan sinyal stres fotoperiodik dan
Keluarga gen PEBP dalam sereal. J.Mol. Evol. 61:579–590. kekeringan untuk menunda transisi bunga pada beras. Lingkungan Sel
Tumbuhan . 39:1982–1993. –1993.
Chen, M., MacGregor, DR, Dave, A., Florance, H., Moore, K., Paszkiewicz, K.,
Smirnoff, N., Graham, IA, dan Penfield, S. Galva˜o, VC, dan Schmid, M. (2014). Pengaturan pembungaan oleh sinyal
(2014). Riwayat suhu ibu mengaktifkan Flowering Locus T dalam buah- endogen. Dalam Kemajuan dalam Penelitian Botani - Genetika Molekuler dari
buahan untuk mengontrol dormansi progeni menurut waktu dalam setahun. Proses Transisi Bunga dan Perkembangan Bunga, hlm. 63–102.
Natl. Acad. Tahu AS 111:18787–18792. -18792.
Chen, Q., Payyavula, RS, Chen, L., Zhang, J., Zhang, C., dan Turgeon, R. Gangappa, SN, dan Botto, JF (2014). Keluarga faktor transkripsi tanaman BBX.
(2018a). FLOWERING LOCUS T mRNA disintesis dalam sel pendamping Tren Tumbuhan Sci. 19:460–470.
khusus di pembuluh daun tembakau Arabidopsis dan Maryland Mammoth .
Gao, X., Liang, W., Yin, C., Ji, S., Wang, H., Su, X., Guo, C., Kong, H., Xue, H.,
Proses Natl. Acad. Sains. AS 115:2830–2835.
dan Zhang, D. (2010). Gen mirip SEPARATA OsMADS34 diperlukan untuk
Chen, JY, Zhang, HW, Zhang, HL, Ying, JZ, Ma, LY, dan Zhuang, JY (2018b). perbungaan padi dan pengembangan spikelet. Fisik Tumbuhan. (Cuci. DC)
Variasi alami pada qHd1 mempengaruhi percepatan tanggal tajuk pada suhu 153:728–740.
tinggi dengan pleiotropisme untuk sifat hasil padi. Pabrik Biol BMC. 18:112.
Gao, H., Jin, M., Zheng, X.-M., Chen, J., Yuan, D., Xin, Y., Wang, M., Huang, D.,
Zhang, Z., Zhou, K., et al. (2014). Hari ke pos 7, lokus kuantitatif utama yang
Cho, LH, Yoon, J., Pasriga, R., and An, G. (2016). Homodimerisasi Ehd1 menentukan sensitivitas fotoperiode dan adaptasi regional pada beras. Proses
diperlukan untuk menginduksi pembungaan pada beras. Fisik Tumbuhan. Natl. Acad. Sains. AS 111:16337– 16342.
(Cuci. DC) 170:2159–2171.
(2020). Efek dinamis dari interaksi gen yang mendasari plastisitas fenotipik
waktu berbunga padi dan adaptasi global Genom Res. 30:673–683. Kim, SR, Torollo, G., Yoon, MR, Kwak, J., Lee, CK, Prahalada, GD, Choi, IR,
Yeo, US, Jeong, OY, Jena, KK, dan Lee, JS
Hayama, R., Yokoi, S., Tamaki, S., Yano, M., dan Shimamoto, K. (2018). Alel kehilangan fungsi pos tanggal 1 (Hd1) dikaitkan dengan adaptasi
(2003). Adaptasi jalur kontrol fotoperiodik menghasilkan pembungaan hari tanaman padi japonica beriklim sedang ke daerah tropis. Depan. Tanaman Sci.
pendek pada padi. Alam 422:719–722. 9.
Hori, K., Ogiso-Tanaka, E., Matsubara, K., Yamanouchi, U., Ebana, K., dan Kobayashi, K., Maekawa, M., Miyao, A., Hirochika, H., dan Kyozuka, J.
Yano, M. (2013). Hd16, gen kasein kinase I, terlibat dalam kontrol waktu (2010). PANICLE PHYTOMETRA2 (PAP2), yang mengkode protein MADS-box
pembungaan padi dengan memodulasi respons panjang hari. subfamili SEPARATA , secara positif mengontrol identitas meristem spikelet
Tanam J. 76:36–46. dalam beras. Fisiol Sel Tumbuhan. 51:47–57.
Hoshikawa, K. (1989). Tanaman Padi yang Tumbuh (Tokyo, Jepang: Kobayashi, K., Yasuno, N., Sato, Y., Yoda, M., Yamazaki, R., Kimizu, M.,
Nobunkyo). Yoshida, H., Nagamura, Y., dan Kyozuka, J. (2012).
Identitas meristem perbungaan pada padi ditentukan oleh tumpang tindih fungsi
Hu, L., Chen, W., Yang, W., Li, X., Zhang, C., Zhang, X., Zheng, L., Zhu, X., Yin, J.,
tiga gen kotak MADS mirip AP1/FUL dan PAP2, gen kotak SEPARATA MADS.
Qin, P., et al. (2021). OsSPL9 mengatur jumlah gabah dan hasil gabah pada
Sel Tumbuhan 24:1848–1859.
beras. Depan. Tanaman Sci. 12:682018.
Hu, Z., Yang, Z., Zhang, Y., Zhang, A., Lu, Q., Fang, Y., dan Lu, C. Komiya, R., Ikegami, A., Tamaki, S., Yokoi, S., dan Shimamoto, K.
(2022). Autophagy menargetkan Hd1 untuk degradasi vacuolar untuk mengatur (2008). Hd3a dan RFT1 sangat penting untuk pembungaan pada padi.
pembungaan padi. Mol. Tanam 15:1137–1156. Pengembangan 135:767–774.
Huang, X., Kurata, N., Wei, X., Wang, Z.-X., Wang, A., Zhao, Q., Zhao, Y., Liu, K., Komiya, R., Yokoi, S., dan Shimamoto, K. (2009). Jaringan gen untuk pembungaan
Lu, H., Li, W., et al. (2012). Peta variasi genom padi mengungkap asal usul padi hari panjang mengaktifkan RFT1 yang mengkodekan sinyal pembungaan seluler
yang dibudidayakan. Alam 490:497–501. dalam beras Pengembangan 136:3443–3450.
Ishikawa, R., Aoki, M., Kurotani, KI, Yokoi, S., Shinomura, T., Takano, M., dan Koo, B.-H., Yoo, S.-C., Park, J.-W., Kwon, C.-T., Lee, B.-D., An, G., Zhang, Z., Li,
Shimamoto, K. (2011). Phytochrome B mengatur ekspresi tanggal 1 (Hd1) yang J., Li, Z., dan Paek, N.-C. (2013). Variasi alami dalam OsPRR37 mengatur
dimediasi oleh beras florigen Hd3a dan panjang hari kritis dalam beras. Mol. tanggal tajuk dan berkontribusi pada penanaman padi di berbagai garis lintang.
Genet. Genom. 285:461–470. Mol. Tanam 6:1877–1888.
Itoh, H., Nonoue, Y., Yano, M., dan Izawa, T. (2010). Sepasang pengatur Kumimoto , RW , Adam , L. , Hymus , GJ , Repetti , PP , Reuber , TL , Marion ,
bunga menetapkan panjang hari kritis untuk ekspresi florigen Hd3a dalam beras. CM , Hempel , FD , dan Ratcliffe , OJ (2008). Subunit faktor Y nuklir NF-YB2
Nat. Genet. 42:635–638. dan NF-YB3 memainkan peran tambahan dalam
Kwon, CT, Koo, BH, Kim, D., Yoo, SC, dan Paek, NC (2015).
Miura , K. , Ikeda , M. , Matsubara , A. , Song , X.-J. , Ito , M. , Asano , K. , Matsuoka ,
Casein kinases I dan 2a phosphorylate oryza sativa pseudo response regulator
M. , Kitano , H. , dan Ashikari , M. (2010 ). ). OsSPL14 mendorong percabangan
37 (OsPRR37) pada pembungaan fotoperiodik pada beras.
Mol. Sel 38:81–88. malai dan produktivitas bulir padi yang lebih tinggi. Nat.
Genet. 42:545–549.
Li, C., Lin, H., dan Dubcovsky, J. (2015). Kombinasi faktorial interaksi protein
Nagai, K., Mori, Y., Ishikawa, S., Furuta, T., Gamuyao, R., Niimi, Y., Hobo, T., Fukuda,
menghasilkan multiplisitas kompleks aktivasi florigen dalam gandum dan jelai.
M., Kojima, M., Takebayashi, Y., dkk (2020).
Tanam J. 84:70–82.
Regulasi antagonis dari respon asam giberelat selama pertumbuhan batang
Li, S., Yue, W., Wang, M., Qiu, W., Zhou, L., dan Shou, H. (2016). padi. Alam 584:109–114.
Mutasi OsGIGANTEA mengarah pada peningkatan toleransi terhadap
Nagalla, AD, Nishide, N., Hibara, KI, dan Izawa, T. (2021). Suhu sekitar yang
stres osmotik yang dihasilkan polietilen glikol dalam beras. Depan. Tanaman
tinggi menghambat represi pembungaan yang dimediasi ghd7 pada beras.
Sci. 7:465.
Fisiol Sel Tumbuhan. 62:1745–1759.
Liang, L., Zhang, Z., Cheng, N., Liu, H., Song, S., Hu, Y., Zhou, X., Zhang, J., Nakagawa, M., Shimamoto, K., dan Kyozuka, J. (2002). Ekspresi RCN1 dan
and Xing, Y. (2021). Penekan transkripsional OsPRR73 menghubungkan jam RCN2 yang berlebihan , homolog Terminal Flower 1/Centroradialis beras,
sirkadian dan jalur fotoperiode untuk mengontrol penanggalan tajuk pada menyebabkan penundaan transisi fase dan perubahan morfologi malai pada
beras. Lingkungan Sel Tumbuhan. 44:842–855. beras. Tanaman J. 29:743–750.
€
Liu, L., Liu, C., Hou, X., Xi, W., Shen, L., Tao, Z., Wang, Y., dan Yu, H. Nakamura, Y., Andre's, F., Kanehara, K., Liu, YC, Dormann, P., dan Coupland,
(2012). FTIP1 adalah regulator penting yang diperlukan untuk transportasi florigen. G. (2014). Arabidopsis florigen FT berikatan dengan fosfolipid berosilasi
PLoS Biol. 10:e1001313. diurnal yang mempercepat pembungaan. Nat. Komunal. 5:3553.
Liu, C., Teo, ZWN, Bi, Y., Song, S., Xi, W., Yang, X., Yin, Z., and Yu, H.
(2013). Jalur genetik yang dilestarikan menentukan arsitektur perbungaan Nakamura, Y., Lin, YC, Watanabe, S., Liu, Y.chi, Katsuyama, K., Kanehara, K.,
pada arabidopsis dan beras Dev. Sel 24:612–622. dan Inaba, K. (2019). Struktur Kristal Resolusi Tinggi LOKUS BUNGA
Arabidopsis T Menyinari Situs Pengikatan Fosfolipidnya saat Berbunga. iSains
Liu, L., Li, C., Teo, ZWN, Zhang, B., dan Yu, H. (2019a). Kompleks MCTP
21.
SNARE mengatur transportasi florigen di arabidopsis. Sel Tumbuhan 31:2475–
2490. Navarro , C. , Abelenda , JA , Cruz-Oro ÿ , E. , Cue ÿ llar , CA , Tamaki , S. , Silva ,
J. , Shimamoto , K. , and Prat , S. (2011). Pengendalian pembungaan dan
Liu, X., Li, Z., Hou, Y., Wang, Y., Wang, H., Tong, X., Ao, H., and Zhang, J.
pembentukan organ penyimpanan pada kentang dengan FLOWERING LOCUS T.
(2019b). Analisis interaksiomik protein dari SAPK dan bZIP yang diinduksi
Alam 478:119–122.
ABA mengungkapkan peran kunci SAPK10 dalam pembungaan padi. Int.
J.Mol. Sains. 20, 1427. Nemoto, Y., Nonoue, Y., Yano, M., dan Izawa, T. (2016). Hd1, ortolog CONSTANS
dalam beras, berfungsi sebagai penekan Ehd1 melalui interaksi dengan
Liu, H., Huang, X., Ma, B., Zhang, T., Sang, N., Zhuo, L., and Zhu, J.
protein Ghd7 domain CCT spesifik monokotil. Tanam J. 86:221–233.
(2021). Diversifikasi komponen dan fungsional kompleks aktivasi florigen
dalam kapas. Fisiol Sel Tumbuhan. 62:1542–1555.
Ogiso-Tanaka, E., Matsubara, K., Yamamoto, Si, Nonoue, Y., Wu, J., Fujisawa,
Luan, W., Chen, H., Fu, Y., Si, H., Peng, W., Song, S., Liu, W., Hu, G., Sun, Z., Xie, H., Ishikubo, H., Tanaka, T., Ando, T., Matsumoto, T. , dan Yano, M. (2013).
D. , dan Sun, C. (2009). Pengaruh persilangan antara penyinaran dan temperatur Variasi alami LOKUS BUNGA BERAS T 1 berkontribusi terhadap divergensi
pada tanggal tajuk pada beras.
waktu pembungaan pada padi. PLoS Satu 8, e75959.
PLoS Satu 4, e5891.
Osugi, A., Itoh, H., Ikeda-Kawakatsu, K., Takano, M., dan Izawa, T.
Luccioni, L., Krzymuski, M., Sa' nchez-Lamas, M., Karayekov, E., Cerda' n, PD, (2011). Pembedahan molekuler tentang peran fitokrom dalam pembungaan
dan Casal, JJ (2019). CONSTANS menunda pembungaan Arabidopsis pada fotoperiodik pada beras. Fisik Tumbuhan. (Cuci. DC) 157:1128–1137.
hari-hari yang pendek. Tanaman J. 97:923–932.
Lv, X., Zeng, X., Hu, H., Chen, L., Zhang, F., Liu, R., Liu, Y., Zhou, X., Wang, C., Park, SJ, Kim, SL, Lee, S., Je, BI, Piao, HL, Park, SH, Kim, CM, Ryu, CH, Park,
Wu, Z. , et al. (2021). Wawasan struktural ke dalam pengikatan multivalen SH, Xuan, YH, dkk. (2008). Rice Indeterminate 1 (OsId1) diperlukan untuk
dari promotor LOCUS T FLOWERING Arabidopsis oleh kompleks faktor ekspresi Ehd1 (Early heading date 1) terlepas dari penyinaran. Tanaman
transkripsi master CO-NF-Y. Sel Tumbuhan 33:1182–1195. J.56:1018–1029.
Park, SY, Fung, P., Nishimura, N., Jensen, DR, Fujii, H., Zhao, Y., Lumba, S.,
Ma, Y., Szostkiewicz, I., Korte, A., Moes, D., Yang, Y., Christmann, A., dan Grill, Santiago, J., Rodrigues, A., Chow, TFF, dkk. (2009).
E. (2009). Regulator aktivitas fosfatase PP2C berfungsi sebagai sensor asam Asam absisat menghambat protein fosfatase tipe 2C melalui keluarga PYR/
absisat. Sains 324:1064–1068. PYL dari protein START. Sains 324:1068–1071.
Qu, L., Chu, YJ, Lin, WH, and Xue, HW (2021). Sekretori fosfolipase D
Sun, X., Zhang, Z., Wu, J., Cui, X., Feng, D., Wang, K., Xu, M., Zhou, L., Han, X.,
menghidrolisis fosfatidilkolin untuk menekan waktu penyajian nasi. PLoS
Gu, X. , dan Lu, T. (2016). Regulator oryza sativa HDR1 berasosiasi dengan
Genet. 17:e1009905.
kinase OsK4 untuk mengontrol pembungaan fotoperiodik.
Reeves, PH, dan Coupland, G. (2001). Analisis kontrol waktu pembungaan pada PLoS Genet. 12:e1005927.
arabidopsis dengan perbandingan mutan ganda dan tripel. Fisik Tumbuhan .
Sun, H., Wang, C., Chen, X., Liu, H., Huang, Y., Li, S., Dong, Z., Zhao, X., Tian,
(Cuci. DC) 126:1085–1091.
F., dan Jin, W. (2020). dlf1 mempromosikan transisi bunga dengan
Ren, Y., Tian, X., Li, S., Mei, E., He, M., Tang, J., Xu, M., Li, X., Wang, Z., Li, C. , mengaktifkan ZmMADS4 dan ZmMADS67 secara langsung di puncak pucuk
dan Bu, Q. (2020). Subunit mediator Oryza sativa OsMED25 berinteraksi jagung . Phytol Baru. 228:1386–1400.
dengan OsBZR1 untuk mengatur pensinyalan brassinosteroid dan arsitektur
tanaman dalam beras J.Integr. Tanaman Biol. 62:793–811. Sun, K., Huang, M., Zong, W., Xiao, D., Lei, C., Luo, Y., Song, Y., Li, S., Hao, Y.,
Luo, W. , et al. (2022). Hd1, Ghd7, dan DTH8 secara sinergis menentukan
Ruelens, P., De Maagd, RA, Proost, S., Theißen, G., Geuten, K., dan Kaufmann, tanggal tajuk padi dan sifat agronomi terkait hasil. J.
K. (2013). LOKUS C BERBUNGA dalam monokotil dan asal tandem dari gen Genet. Genomik 49:437–447.
kotak MADS khusus angiospermae. Nat.
Umum. 4:2280. Susila, H., Juric, S., Liu, L., Gawarecka, K., Chung, KS, Jin, S., Kim, SJ, Nasim,
Z., Youn, G., Suh, MC, dkk. (2021). Penyerapan Florigen dalam membran sel
Sakamoto, T., Kobayashi, M., Itoh, H., Tagiri, A., Kayano, T., Tanaka, H., Iwahori,
memodulasi pembungaan yang responsif terhadap suhu. Sains 373:1137–
S., dan Matsuoka, M. (2001). Ekspresi gen giberelin 2-oksidase di sekitar
1142.
pucuk berkaitan dengan transisi fase pada padi. Fisik Tumbuhan. (Cuci. DC)
125:1508–1516. Takahashi, Y., Shomura, A., Sasaki, T., dan Yano, M. (2001). Hd6, lokus sifat
kuantitatif beras yang terlibat dalam sensitivitas penyinaran periode,
Sakamoto, T., Morinaka, Y., Ishiyama, K., Kobayashi, M., Itoh, H., Kayano, T.,
mengkodekan subunit protein kinase CK2. Proses Natl. Acad. Sains. AS
Iwahori, S., Matsuoka, M., dan Tanaka, H. (2003). 98:7922–7927.
Manipulasi genetik metabolisme giberelin pada beras transgenik.
Nat. Bioteknologi. 21:909–913. Takahashi, Y., Teshima, KM, Yokoi, S., Innan, H., dan Shimamoto, K.
(2009). Variasi dalam protein Hd1, promotor Hd3a, dan tingkat ekspresi Ehd1
Sarid-Krebs, L., Panigrahi, KCS, Fornara, F., Takahashi, Y., Hayama, R., Jang,
berkontribusi terhadap keragaman waktu pembungaan pada padi yang
S., Tilmes, V., Valverde, F., dan Coupland, G. dibudidayakan. Proses Natl. Acad. Sains. AS 106:4555–4560.
(2015). Fosforilasi CONSTANS dan degradasinya yang bergantung pada
COP1 selama pembungaan fotoperiodik Arabidopsis. Tanam J. 84:451–463. Tamaki, S., Matsuo, S., Wong, HL, Yokoi, S., dan Shimamoto, K.
(2007). Protein hd3a adalah sinyal pembungaan seluler dalam beras. Sains
316:1033–1036.
Shen, C., Liu, H., Guan, Z., Yan, J., Zheng, T., Yan, W., Wu, C., Zhang, Q., Yin,
P., dan Xing, Y. (2020). Wawasan struktural tentang pengenalan DNA oleh Tamaki, S., Tsuji, H., Matsumoto, A., Fujita, A., Shimatani, Z., Terada, R.,
kompleks CCT / NF-YB / YC dalam pembungaan fotoperiodik tanaman. Sel Sakamoto, T., Kurata, T., dan Shimamoto, K. (2015). Protein seperti FT
Tumbuhan 32:3469–3484. menginduksi pembungkaman transposon di apeks pucuk selama induksi
bunga pada beras. Proses Natl. Acad. Sains. AS 112:E901–E910.
Shrestha, R., Go' mez-Ariza, J., Brambilla, V., dan Fornara, F. (2014).
Kontrol molekuler pembungaan musiman pada beras, arabidopsis, dan sereal Taoka , Ki , Ohki , I. , Tsuji , H. , Furuita , K. , Hayashi , K. , Yanase , T. ,
sedang. Ann. Bot. 114:1445–1458. Yamaguchi , M. , Nakashima , C. , Purwestri , YA , Tamaki , S. , dkk . . . .
(2011). Protein 14-3-3 bertindak sebagai reseptor intraseluler untuk beras
Silva , CS , Nayak , A , Lai , X , Hutin , S , Hugouvieux , V , Jung , JH , Lopez-
Hd3a florigen. Alam 476:332–335.
Glassman , I , Franco-Zorrilla , JM , Panigrahi , KCS , Nanao , MH , dkk .
(2020). Mekanisme molekuler aktivitas kompleks malam di arabidopsis. Proses Thirumurugan, T., Ito, Y., Kubo, T., Serizawa, A., dan Kurata, N. (2008).
Natl. Acad. Sains. AS 117:6901–6909. Identifikasi, karakterisasi dan interaksi gen famili HAP pada padi. Mol. Genet.
Genom. 279:279–289.
€ €
Simon, S., Ruhl, M., de Montaigu, A., Wotzel , S., dan Coupland, G. Thomas, B., dan Vince-Prue, D. (1997). Fotoperiodisme pada Tumbuhan
(2015). Evolusi regulasi dan fungsi CONSTANS setelah gen (Pers Akademik).
Wu, C., You, C., Li, C., Long, T., Chen, G., Byrne, ME, dan Zhang, Q.
Trusov, Y., dan Botella, JR (2006). Pembungkaman gen ACC synthase AACCS2 (2008). RID1, yang mengkodekan faktor transkripsi jari seng tipe Cys2/His2 ,
menyebabkan tertundanya pembungaan pada nanas [Ananas comosus (L.) bertindak sebagai saklar utama dari perkembangan vegetatif ke bunga pada beras.
Mengambil.]. J.Exp. Bot. 57:3953–3960. Proses Natl. Acad. Sains. AS 105:12915–12920.
Tsuji, H., Nakamura, H., Taoka, Ki, dan Shimamoto, K. (2013). Wu, W., Zheng, X.-M., Lu, G., Zhong, Z., Gao, H., Chen, L., Wu, C., Wang, H.-J.,
Diversifikasi fungsional faktor transkripsi FD dalam beras, komponen kompleks
Wang, Q. , Zhou, K., dkk. (2013). Asosiasi polimorfisme nukleotida fungsional di
aktivasi florigen. Fisiol Sel Tumbuhan. 54:385–397.
DTH2 dengan ekspansi budidaya padi ke utara di Asia. Proses Natl. Acad. Sains.
AS 110:2775–2780.
Tylewicz, S., Tsuji, H., Miskolczi, P., Petterle, A., Azeez, A., Jonsson, K., Shimamoto,
K., dan Bhalerao, RP (2015). Peran ganda komponen kompleks aktivasi florigen
Wu, C., Cui, K., Wang, W., Li, Q., Fahad, S., Hu, Q., Huang, J., Nie, L.,
pohon FD dalam kontrol pertumbuhan fotoperiodik dan jalur respons adaptif.
Mohapatra, PK, and Peng, S. ( 2017). Transportasi dan degradasi sitokinin
Proses Natl. Acad. Sains. AS 112:3140–3145.
yang diinduksi panas dikaitkan dengan penurunan ekspresi sitokinin malai
dan lebih sedikit bulir per malai dalam beras. Depan.
Valverde, F., Mouradov, A., Soppe, W., Ravenscroft, D., Samach, A., dan Coupland, Tanaman Sci. 8:371.
G. (2004). Regulasi fotoreseptor protein CONSTANS dalam pembungaan
Wuriyanghan, H., Zhang, B., Cao, W.-H., Ma, B., Lei, G., Liu, Y.-F., Wei, W., Wu, H.-
fotoperiodik. Sains 303:1003–1006.
J., Chen , L.-J., Chen, H.-W., dkk. (2009). Reseptor etilen ETR2 menunda transisi
Wang, Q., Zhang, W., Yin, Z., dan Wen, C.-K. (2013). Beras CONSTITUTIVE TRIPLE- bunga dan memengaruhi akumulasi pati dalam beras. Sel Tumbuhan 21:1473–
RESPONSE2 terlibat dalam pensinyalan reseptor etilen dan pengaturan berbagai 1494.
aspek pertumbuhan dan perkembangan beras. J.Exp. Bot. 64:4863–4875.
Xia, K., Wang, R., Ou, X., Fang, Z., Tian, C., Duan, J., Wang, Y., dan Zhang, M.
(2012). Downregulasi OsTIR1 dan OsAFB2 melalui overekspresi OsmiR393
Wang, L., Sun, S., Jin, J., Fu, D., Yang, X., Weng, X., Xu, C., Li, X., Xiao, J., dan
menyebabkan lebih banyak anakan, pembungaan awal dan kurang toleransi
Zhang, Q. (2015). Regulasi terkoordinasi percabangan vegetatif dan reproduktif
terhadap garam dan kekeringan pada beras. PLoS Satu 7, e30039.
pada padi. Proses Natl. Acad. Sains. AS 112:15504–15509.
Xue, W., Xing, Y., Weng, X., Zhao, Y., Tang, W., Wang, L., Zhou, H., Yu, S., Xu,
C., Li, X. , dan Zhang, Q. (2008). Variasi alami dalam Ghd7 merupakan
Wang, Y., Lu, Y., Guo, Z., Ding, Y., dan Ding, C. (2020a). RICE CENTRORADIALIS 1,
pengatur penting tanggal tajuk dan potensi hasil padi. Nat.
Gen mirip TFL1, Menanggapi Stres Kekeringan dan Mengatur Transisi Pembungaan
Genet. 40:761–767.
Padi. Nasi 13.
Wang, H., Jiao, X., Kong, X., Liu, Y., Chen, X., Fang, R., dan Yan, Y. (2020b). Histone Yaish, MW, El-kereamy, A., Zhu, T., Beatty, PH, Good, AG, Bi, Y.- M., dan Rothstein,
deacetylase HDA703 berinteraksi dengan OsBZR1 untuk mengatur pensinyalan SJ (2010). Faktor transkripsi seperti APETALA-2 OsAP2-39 mengontrol interaksi
brassinosteroid beras, pertumbuhan dan tanggal heading melalui represi ekspresi kunci antara asam absisat dan giberelin dalam beras. PLoS Genet. 6, e1001098.
Ghd7. Tanaman J. 104:447–459.
Wang, X., Zhou, P., Huang, R., Zhang, J., dan Ouyang, X. (2021a). Model pengenalan Yang, Y., Fu, D., Zhu, C., He, Y., Zhang, H., Liu, T., Li, X., and Wu, C.
panjang hari berbunga fotoperiodik. Depan. Tanaman Sci. 12:778515. (2015). RING-finger ubiquitin ligase HAF1 memediasi degradasi pos tanggal 1
selama pembungaan fotoperiodik pada beras. Sel Tumbuhan 27:2455–2468.
Wang, T., Guo, J., Peng, Y., Lyu, X., Liu, B., Sun, S., dan Wang, X. (2021b). Faktor
gerak yang diinduksi cahaya dari pucuk mengatur nodulasi akar kedelai yang dipicu Yang, J., Yuan, Z., Meng, Q., Huang, G., Pe'rin, C., Biro, C., Meunier, A.-C.,
oleh rhizobium. Sains 374:65–71. Ingouff, M., Bennett, MJ, Liang , W., dan Zhang, D. (2017).
Wang, L., Ming, L., Liao, K., Xia, C., Sun, S., Chang, Y., Wang, H., Fu, D., Xu, C., Regulasi dinamis dari respons auksin selama pengembangan padi
Wang, Z. , et al. (2021c). Penekanan bract yang diatur oleh modul miR156/529- diungkapkan oleh penanda biosensor hormon yang baru dibuat. Depan.
Tanaman Sci. 8:256.
SPLs-NL1-PLA1 diperlukan untuk transisi dari percabangan vegetatif ke reproduktif
pada padi. Mol. Tanam 14:1168–1184. Yano , M. , Katayose , Y. , Ashikari , M. , Yamanouchi , U. , Suami , L. , Fuse , T. ,
Wang, X., He, Y., Wei, H., dan Wang, L. (2021d). Modul pengaturan jam diperlukan Baba , T. , Yamamoto , K. , Umehara , Y. , Nagamura , Y. , dan Sasaki, T. (2000).
untuk toleransi garam dan kontrol tanggal tajuk pada beras. Lingkungan Sel Hd1, lokus sifat kuantitatif sensitivitas penyinaran utama dalam beras, terkait erat
Tumbuhan. 44:3283–3301. dengan gen waktu berbunga Arabidopsis CONSTANS. Sel Tumbuhan 12:2473–
2484.
Wei, X., Xu, J., Guo, H., Jiang, L., Chen, S., Yu, C., Zhou, Z., Hu, P., Zhai, H., dan
Wan, J. (2010). DTH8 menekan pembungaan pada padi, mempengaruhi tinggi Ye, T., Li, Y., Zhang, J., Hou, W., Zhou, W., Lu, J., Xing, Y., dan Li, X.
tanaman dan potensi hasil secara bersamaan. Fisik Tumbuhan . (Cuci. DC) (2019). Pemupukan nitrogen, fosfor, dan kalium berpengaruh terhadap waktu
153:1747–1758. pembungaan padi (Oryza sativa L.). Gumpal. Ekol. Konservasi. 20, e00753.
Weng, X., Wang, L., Wang, J., Hu, Y., Du, H., Xu, C., Xing, Y., Li, X., Xiao, J., dan Yin, C., Gan, L., Ng, D., Zhou, X., dan Xia, K. (2007). Asam indole-3-asetat yang
Zhang, Q. (2014). Jumlah Butir, Tinggi Tanaman, dan Tanggal Tajuk7 adalah pusat diturunkan dari malai menurunkan kadar giberelin A1 di ruas paling atas,
pengatur pertumbuhan, perkembangan, dan respons stres. Fisik Tumbuhan. (Cuci. menyebabkan penutupan malai pada beras mandul jantan Zhenshan 97A. J.Exp.
DC) 164:735–747. Bot. 58:2441–2449.
Wickland, DP, dan Hanzawa, Y. (2015). Keluarga gen FLOWERING LOCUS T/
Yoshikawa , T. , Ito , M. , Sumikura , T. , Nakayama , A. , Nishimura , T. , Kitano , H. ,
TERMINAL FLOWER1: evolusi fungsional dan mekanisme molekuler. Mol. Tanam
Yamaguchi , I. , Koshiba , T. , Hibara , K.-I. , Nagato , Y., dan Itoh, J. (2014). Gen
8:983–997.
rice FISH BONE mengkode triptofan aminotransferase, yang memengaruhi proses
Wolbang, CM, dan Ross, JJ (2001). Auksin mempromosikan giberelin terkait auksin pleiotropik . Tanaman J. 78:927–936.
biosintesis pada tanaman tembakau yang dipenggal. Tanaman 214:153–157.
Zhang, L., Zhang, F., Zhou, X., Poh, TX, Xie, L., Shen, J., Yang, L., Song, S., Yu, Zong, W., Ren, D., Huang, M., Sun, K., Feng, J., Zhao, J., Xiao, D., Xie, W., Liu,
H., and Chen, Y. ( 2022). Protein berulang tetratricopeptide OsTPR075 S., Zhang, H. , et al. (2021). Sensitivitas penyinaran yang kuat dikendalikan
mempromosikan tajuk dengan mengatur transportasi florigen dalam beras. oleh kerja sama dan persaingan antara Hd1, Ghd7 dan DTH8 dalam tajuk
Sel Tumbuhan 34:3632–3646. beras. Phytol Baru. 229:1635–1649.
Zhao , K. , Tung , C.-W. , Eizenga , GC , Wright , MH , Ali , ML , Price , AH , Zong, J., Wang, L., Zhu, L., Bian, L., Zhang, B., Chen, X., Huang, G., Zhang, X.,
Norton , GJ , Islam , MR , Reynolds , A. , Mezey , J. , dkk. Fan, J., Cao, L., et al. (2022). Atlas transkriptomik sel tunggal beras
(2011). Pemetaan asosiasi genome mengungkapkan arsitektur genetik yang mendefinisikan lintasan perkembangan floret beras dan meristem perbungaan.
kaya dari sifat-sifat kompleks di Oryza sativa Nat. Komunal. 2:467. Phytol Baru. 234:494–512.