Ikrarwati et. al.

: Evaluasi Mutu Fisiologis dan Patologis Benih Padi

EVALUASI MUTU FISIOLOGIS DAN PATOLOGIS BENIH PADI VARIETAS

CIHERANG DAN HIPA 8

Ikrarwati1 dan Amiyarsi Mustika Yukti2

1
Balai Pengkajian Teknologi Pertanian Jakarta
Jl. Raya Ragunan no. 30, Pasar minggu, Jakarta Selatan 12540, Indonesia
2
Balai Besar Pengembangan Pengujian Mutu Benih Tanaman Pangan dan Hortikultura
Jl. Raya Tapos no. 20, Tapos, Depok 16956, Indonesia
Email: ikrar_oktober@yahoo.co.id

ABSTRACT Keywords: seed-borne bacteria, seed-borne

The aims of the research were to determine
the physiological and pathological quality of
rice seed. The experiment was carried out in
March 2012 in Seed Science and Technology
Laboratory, Bogor Agricultural University
and Seed Health Laboratory BBPPMB-TPH.
Physiological quality test conducted using
between paper method, pathological quality
test conducted using blotter test and liquid
assay methods. The results showed rice seed
varieties Ciherang had 95% vigor index, 98%
germination, 20.66% normal sedling etmal-1
speed of germination, 0.15 g normal seedling
dry weight, and seedling growth rate 6.31
mg/normal sedling. The rice seed varieties
HIPA 8 had 49% vigor index, 77.25%
germination, 8.24% normal sedling etmal-1
speed of germination, 0.10 g normal seedling
dry weight, and 6 mg/normal sedling
seedling growth rate. The result of seed
pathological quality test showed Alternaria
sp (6.5%), Fusarium sp. (24%), Drechslera
sp. (4%), Curvularia sp. (22.25%),
Xanthomonas oryzae pv. oryzae (3.32 x 109
cfu g-1) and Erwinia sp. (5.10 x 102cfu g-1)
were found as seed-borne fungi and bacteria
of rice seed varieties Ciherang. Alternaria sp
(32%), Fusarium sp. (31.25%), Penicillium
(1.25%), Curvularia sp. (43.75%),
Cladosporium sp. (0.75%), X. oryzae pv.
oryzae + X. campestris pv. oryzicola (6.63 x
109cfu g-1) and Clavibacter sp. (5.47 x 103cfu
g-1) were found as seed-borne fungi and
bacteria of rice seed varieties HIPA 8.
fungi, seed health, viability, vigor
ABSTRAK
Tujuan dari penelitian ini adalah untuk
menentukan kualitas fisiologis dan patologis
benih padi. Percobaan dilakukan pada bulan
Maret 2012 di Seed Sains dan Teknologi
Laboratorium Teknologi Ilmu Perbenihan,
Institut Pertanian Bogor dan Benih
Laboratorium Kesehatan BBPPMB-TPH. Uji
mutu fisiologis dilakukan dengan
menggunakan metode antara kertas, uji
kualitas patologis dilakukan menggunakan
uji tinta dan metode pengujian cair. Hasil
penelitian menunjukkan varietas benih padi
Ciherang memiliki indeks 95% kekuatan,
98% perkecambahan, 20,66% sedling yang
normal etmal-1 kecepatan perkecambahan,
0,15 g kecambah normal berat kering, dan
tingkat pertumbuhan bibit 6.31 mg / sedling
normal. Varietas benih padi HIPA 8 memiliki
indeks 49% kekuatan, 77,25%
perkecambahan, 8.24% sedling yang normal
etmal-1 kecepatan perkecambahan, 0,10 g
berat kering bibit normal, dan 6 mg / laju
pertumbuhan sedling kecambah normal.
Hasil pengujian benih berkualitas patologis
menunjukkan Alternaria sp (6,5%), Fusarium
sp. (24%), Drechslera sp. (4%), Curvularia
sp. (22,25%), Xanthomonas oryzae pv.
oryzae (3.32 x 109 cfu-g 1) dan Erwinia sp.
(5.10 x 102cfu g-1) ditemukan sebagai biji-
ditanggung jamur dan bakteri varietas benih
padi Ciherang. Alternaria sp (32%),
Fusarium sp. (31,25%), Penicillium (1,25%),
Curvularia sp. (43,75%), Cladosporium sp.
(0,75%), X. oryzae pv. oryzae + X.

Buletin Pertanian Perkotaan Volume 4 Nomor 1, 2014 | 27

 Ikrarwati et. al.: Evaluasi Mutu Fisiologis dan Patologis Benih Padi
campestris pv. oryzicola (6.63 x 109cfu g-1)
dan Clavibacter sp. (5.47 x 103cfu g-1)
ditemukan sebagai biji-ditanggung jamur dan
bakteri dari benih padi varietas HIPA 8.
Kata kunci: bakteri terbawa benih, jamur
terbawa benih, kesehatan benih, viabilitas,
vigor
PENDAHULUAN
B enih merupakan salah satu input
dasar dalam kegiatan produksi
tanaman, tidak terkecuali dalam
usaha tani padi. Penggunaan benih bermutu
tinggi merupakan prasyarat penting untuk
menghasilkan produksi tanaman yang
menguntungkan secara ekonomis. Dengan
menggunakan benih bermutu diharapkan
dapat meningkatkan produksi persatuan luas,
mendapatkan keseragaman pertanaman dan
produk yang dihasilkan, serta dapat
mengurangi serangan hama dan penyakit.
Sebaliknya, penggunaan benih bermutu
rendah akan menghasilkan persentase
pemunculan bibit yang rendah, bibit yang
kurang toleran terhadap cekaman abiotik,
sensitif terhadap penyakit tanaman dan dapat
menjadi sumber inokulum bagi penyakit
terbawa benih (Ilyas 2012; Balai Besar
PPMBTPH 2004). Dengan demikian,
penggunaan benih bermutu rendah disertai
dengan adanya penyakit yang terbawa benih
merupakan salah satu faktor yang menjadi
penyebab rendahnya produktivitas
pertanaman padi.
Pengujian terhadap mutu benih
sangat penting untuk memberikan informasi
mengenai kualitas benih yang pada akhirnya
akan menentukan keberhasilan pertanaman di
lapang. Kriteria mutu benih meliputi empat
aspek, yaitu mutu genetis yang menjabarkan
Buletin Pertanian Perkotaan Volume 4 Nomor 1, 2014 | 28
sifat unggul yang diwariskan oleh tanaman
induk dan dicirikan dengan tingkat
kemurnian; mutu fisik yang meliputi struktur
morfologis, ukuran, berat dan penampakan
benih; mutu fisiologis; serta mutu patologis
yang menunjukkan kesehatan benih (Ilyas
2012).
Pengujian mutu fisiologis penting
untuk dilakukan karena dapat menduga sifat
benih yang berdampak pada pertumbuhan
tanaman. Mutu fisiologis meliputi viabilitas
benih yaitu kemampuan benih untuk
berkecambah dan menghasilkan kecambah
normal (Copeland dan McDonald 2001),
serta vigor benih yaitu kemampuan benih
untuk tumbuh normal dalam keadaan lapang
suboptimum (Sadjad et al. 1999).
Selain mutu fisiologis benih,
pengujian terhadap mutu patologis atau
kesehatan benih juga memiliki arti yang
sangat penting. Mutu patologis benih yang
rendah ditandai dengan adanya patogen yang
terbawa oleh benih. Patogen terbawa benih
dapat merugikan pada hampir semua tahap
pertumbuhan. Dampak yang dapat
diakibatkan oleh patogen terbawa benih
antara lain adalah benih mengalami
penurunan vigor dan viabilitas, peningkatan
kematian bibit atau tanaman muda,
penurunan hasil, peningkatan perkembangan
penyakit di lapangan, munculnya peluang
terjadinya ledakan penyakit di daerah baru,
serta toksik yang dihasilkan patogen terbawa
benih akan menyebabkan perubahan
komponen biokimia dari benih tersebut
(Agarwal dan Sinclair 1996).
Berdasarkan hal tersebut maka sangat
penting untuk mengetahui mutu benih yang
akan digunakan sehingga evaluasi terhadap
mutu fisiologis dan patologis benih harus
dilakukan. Percobaan ini bertujuan
 Ikrarwati et. al.: Evaluasi Mutu Fisiologis dan Patologis Benih Padi
mengetahui mutu fisiologis dan patologis
awal dari benih yang akan digunakan pada
percobaan tahap selanjutnya.
BAHAN DAN METODE
Penelitian dilaksanakan di Balai
Besar Pengembangan Pengujian Mutu Benih
Tanaman Pangan dan Hortikultura (Balai
Besar PPMB-TPH) Cimanggis.
Bahan yang digunakan dalam
penelitian ini adalah benih padi sawah
inbrida varietas Ciherang produksi SHS dan
padi hibrida varietas HIPA 8 produksi BB
PADI Sukamandi. Benih telah disimpan
selama satu bulan pada kondisi suhu ruang
27 – 31 °C dan RH 70 – 78%. Pengujian
dilakukan terhadap mutu fisiologis dan mutu
patologis benih padi.
Pengujian Mutu Fisiologis Benih Padi
Pengujian dilakukan dengan metode
between paper (ISTA 2010). Benih ditabur
di antara dua lapis kertas merang yang telah
dilembabkan kemudian digulung dengan
dilapisi plastik dan dikecambahkan di
ecogerminator IPB tipe 72-1. Benih yang
digunakan berjumlah 400 butir benih
(delapan ulangan, setiap ulangan terdiri dari
50 butir) untuk pengujian daya berkecambah
dan indeks vigor, 400 butir benih untuk
pengujian kecepatan tumbuh benih, dan 200
butir benih (delapan ulangan, setiap ulangan
terdiri dari 25 butir) untuk pengujian berat
kering kecambah normal. Parameter
pengamatan meliputi: (1) Indeks vigor benih
yaitu persentase kecambah normal pada
pengamatan pertama (hari ke-5) setelah
tanam; (2) Daya berkecambah benih, yaitu
persentase kecambah normal pada
pengamatan pertama (hari ke-5) dan
Buletin Pertanian Perkotaan Volume 4 Nomor 1, 2014 | 29
pengamatan kedua (hari ke-7) setelah tanam;
(3) Kecepatan tumbuh, dihitung berdasar
nilai pertambahan perkecambahan
(persentase kecambah normal) setiap hari
pada kurun waktu perkecambahan dalam
kondisi optimum; (4) Bobot kering kecambah
normal, diperoleh dengan mengeringkan
kecambah yang tumbuh normal hingga hari
ke-7 yang telah dibuang karyopsisnya pada
oven dengan suhu 60 °C selama 3 x 24 jam,
kemudian ditimbang bobot keringnya; (5)
Laju pertumbuhan kecambah, merupakan
berat kering kecambah normal dibagi dengan
jumlah kecambah normal; (6) Kadar air
benih, merupakan persentase selisih berat
basah dengan berat kering dibagi berat basah
benih Benih sebanyak 5 g di-grinder,
ditimbang berat basahnya, kemudian di oven
suhu 130-133 0C selama 2 jam dan ditimbang
berat keringnya.
Pengujian Mutu Patologis Benih Padi
Deteksi dan identifikasi cendawan
terbawa benih dilakukan dengan metode
blotter test (ISTA 2010). Benih didisinfeksi
permukaan dengan natrium hipoklorit 1%
dan dicuci dengan air steril. Benih padi
sebanyak 400 butir (empat ulangan, setiap
ulangan terdiri dari dua petridish @ 50 butir
benih) ditanam diatas cawan petri yang sudah
dilapisi dengan tiga lembar kertas saring
lembab. Benih yang telah ditanam diinkubasi
pada suhu 20-25°C selama 24 jam kemudian
dipindahkan ke medicool pada suhu -20 °C
selama 24 jam dan kembali diinkubasi pada
inkubator dengan suhu 20-25°C dengan
penyinaran (NUV) selama 12 jam gelap dan
12 jam terang. Identifikasi dilakukan setelah
7 hari inkubasi. Pengamatan dan identifikasi
dilakukan dengan mikroskop terhadap semua
 Ikrarwati et. al.: Evaluasi Mutu Fisiologis dan Patologis Benih Padi

jenis cendawan terbawa benih dan persen
infeksi dari tiap cendawan yang terdeteksi.
Jumlah benih terinfeksi
Persen Infeksi= x 100%
Jumlah benih yang ditabur
Ekstraksi dan isolasi bakteri dilakukan
dengan metode penghancuran (liquid assay)
(Balai Besar PPMB-TPH 2007). Benih
sebanyak 400 butir dihancurkan dengan
menggunakan mortar dan pestle. Benih yang
akan dihancurkan telah ditimbang beratnya
dan disterilkan dengan alkohol 70%,
dilanjutkan dengan natrium hipoklorit 1%
selama 1 menit kemudian dibilas dengan air
steril sebanyak tiga kali. Pada saat
penggerusan ditambahkan air steril dan
dicukupkan volumenya sampai 50 ml. Hasil
penggerusan diinkubasi selama 2 jam.
Selanjutnya suspensi bakteri diambil dengan
menggunakan pipet steril sebanyak 1 ml dan
dimasukkan ke dalam tabung reaksi yang
telah berisi 9 ml air steril, sehingga diperoleh
suspensi dengan pengenceran 10-1 kemudian
dikocok hingga homogen. Cara pengenceran
ini diulang secara bertingkat hinga diperoleh
pengenceran 10-2, 10-3, 10-4, 10-5, 10-6.
Masing-masing pengenceran diambil 100µl
kemudian disebar pada media nutrient agar
(NA) dan diinkubasi pada suhu 28-30 °C
selama 1-7 hari. Koloni bakteri yang
diperoleh dimurnikan pada media NA atau
King’s B kemudian diinkubasi pada suhu 28-
30°C selama 2-3 hari. Deteksi dan
identifikasi bakteri patogen terbawa benih
dilakukan berdasarkan ciri morfologis
(bentuk, warna, dan kejernihan) dan karakter
biokimia isolat bakteri yang dimurnikan.
Karakter biokimia diamati berdasar uji
reaksi gram, fluorescence, hidrolisis pati,
arginin, oksidase, dan uji katalase
(Mortensen 1989). Pengamatan terhadap
jumlah koloni bakteri terbawa benih
dilakukan dengan metode plate counting
(ISTA 2010), dengan asumsi bahwa satu
koloni berasal dari satu sel bakteri sehingga
satuan yang digunakan adalah colony
forming unit per gram benih.
Y = (X.n.10.v) / berat 400 butir benih
Y : jumlah koloni bakteri per gram benih
(cfu.g-1)
X : jumlah rata-rata koloni per petri pada
suatu tingkat pengenceran
n : tingkat pengenceran
10 : menunjukkan per ml karena yang
ditabur per petri adalah 0.1 ml
v : volume larutan total yang digunakan
untuk mengekstrasi bakteri dari benih
(ml)
HASIL DAN PEMBAHASAN
Mutu Fisiologis Benih Padi Varietas
Ciherang dan HIPA 8
Mutu fisiologis benih padi Ciherang
dan HIPA 8 ditunjukkan pada Tabel 1. Daya
berkecambah dan kadar air benih merupakan

Tabel 1. Hasil uji mutu fisiologis benih padi varietas Ciherang dan HIPA 8.
Varietas
Tolok ukur
Ciherang HIPA 8
Indeks vigor (%) 95.00 49.00
Daya berkecambah (%) 98.00 77.25
Kecepatan tumbuh (% KN etmal-1) 20.66 8.24
Bobot kering kecambah normal (g) 0.15 0.1
Laju pertumbuhan kecambah (mg KN-1) 6.31 6.00
Kadar air (%) 9.70 10.04

Buletin Pertanian Perkotaan Volume 4 Nomor 1, 2014 | 30

 Ikrarwati et. al.: Evaluasi Mutu Fisiologis dan Patologis Benih Padi
komponen yang termasuk dalam persyaratan
sertifikasi benih. Pengujian daya berkecam-
bah merupakan tolok ukur bagi kemampuan
benih untuk tumbuh normal pada kondisi
optimum dan kadar air benih merupakan
salah satu faktor yang penting dalam
pengujian benih karena menentukan
kemampuan benih untuk mempertahankan
viabilitasnya selama penyimpanan. Benih
varietas Ciherang yang digunakan pada
penelitian ini memiliki nilai daya berkecam-
bah 98 % dan kadar air 9.7%, sedangkan
benih HIPA 8 memiliki nilai daya berkecam-
bah 77.25% dan kadar air 10.04%. Hal
tersebut menunjukkan bahwa benih varietas
Ciherang memenuhi persyaratan sertifikasi
sedangkan varietas HIPA 8 yang digunakan
pada penelitian ini tidak memenuhi
persyaratan sertifikasi untuk benih padi yang
mensyaratkan nilai daya berkecambah
minimal 80% dan kadar air maksimal 13%
berdasarkan standar kelulusan sertifikasi
benih tanaman pangan (Dirjen TP 2009).
Benih varietas Ciherang memiliki
indeks vigor, kecepatan tumbuh, bobot
kering kecambah normal, dan laju
pertumbuhan kecambah yang lebih tinggi
dibanding varietas HIPA 8. Hasil ini
menginformasikan bahwa varietas Ciherang
pada percobaan ini memiliki mutu fisiologis
yang lebih baik dibanding HIPA 8. Menurut
Sadjad et al. (1999), indeks vigor dan
kecepatan tumbuh merupakan tolok ukur
vigor kekuatan tumbuh benih. Nilai indeks
vigor dan kecepatan tumbuh yang tinggi
mencerminkan benih dengan vigor tinggi.
Benih Ciherang memiliki nilai indeks vigor
95% dan HIPA 8 memiliki indeks vigor 49%.
Hal tersebut berarti dalam kondisi
lingkungan suboptimum, benih varietas
Ciherang masih dapat menghasilkan 95%
Buletin Pertanian Perkotaan Volume 4 Nomor 1, 2014 | 31
kecambah normal, sedangkan HIPA 8 hanya
49%. Selain itu, benih Ciherang memiliki
nilai kecepatan tumbuh 20.66% KN etmal-1
dan benih HIPA 8 memiliki nilai kecepatan
tumbuh 8.24% KN etmal-1. Itu berarti dalam
24 jam benih varietas Ciherang menghasilkan
20.66 kecambah normal sedangkan HIPA 8
hanya 8.24 kecambah normal.
Benih varietas Ciherang memiliki
bobot kering kecambah normal sebesar 0.15
g dan laju pertumbuhan kecambah 6.31 mg
KN-1, sedangkan benih HIPA 8 memiliki
bobot kering kecambah normal 0.1 g dan laju
pertumbuhan kecambah 6 mg KN-1. Bobot
kering kecambah normal menggambarkan
viabilitas potensial benih yang ditanam pada
kondisi optimum. Copeland dan McDonald
(2001) menyatakan benih dengan viabilitas
tinggi memiliki kemampuan untuk
mensintesis material baru secara efisien dan
dengan cepat mentransfer material tersebut
untuk pertumbuhan kecambah sehingga
mengakibatkan peningkatan akumulasi bobot
kering kecambah.
Mutu Patologis Benih Padi Varietas
Ciherang dan HIPA 8
Evaluasi mutu patologis benih padi
menunjukkan bahwa benih padi varietas
Ciherang terinfeksi oleh 4 jenis cendawan
yaitu Alternaria sp., Fusarium sp.,
Drechslera sp. dan Curvularia sp.,
sedangkan pada varietas HIPA teridentifikasi
5 jenis cendawan yaitu Alternaria sp.,
Fusarium sp., Curvularia sp., Penicillium sp.
dan Cladosporium sp. (Gambar 1).
Cendawan diketahui sebagai kelompok
terbesar patogen terbawa benih (Agarwal dan
Sinclair 1996). Cendawan yang dilaporkan
menginfeksi benih padi yaitu Curvularia sp.,
Nigrospora oryzae, Fusarium moniliforme,
 Ikrarwati et. al.: Evaluasi Mutu Fisiologis dan Patologis Benih Padi

A B C

D E F
Gambar 1. Spora cendawan yang terdeteksi pada benih padi dengan mikroskop compound (A) Fusarium
sp., (B) Curvularia sp., (C) Alternaria sp., (D) Drechslera sp.; dan terdeteksi dengan
mikroskop stereo (E) Penicillium sp, (F) Cladosporium sp.

Rhizoctonia solani, Alternaria padwickii,
Aspergillus flavus, Aspergillus niger,
Bipolaris oryzae, Chepalosporium oryzae,
Sarocladium oryzae, Drechslera oryzae
(Islam et al. 2000; Pham et al. 2001; Nurdin
2003; Thobunluepop 2009; Yukti 2009;
Fiana 2010).
Deteksi dan identifikasi cendawan
dilakukan pada benih dengan teknik
sterilisasi permukaan dan tanpa sterilisasi
untuk mengetahui lokasi cendawan terbawa
benih. Agarwal dan Sinclair (1996)
menyatakan bahwa patogen terbawa benih
dapat berupa infeksi atau infestasi. Infeksi
ditandai dengan keberadaan patogen di dalam
jaringan benih yaitu pada kulit benih,
endosperm dan embrio, sedangkan infestasi
ditandai dengan keberadaan patogen pada
permukaan benih atau terbawa bebas
bersama benih. Sterilisasi permukaan
dilakukan untuk menghilangkan patogen
yang terinfestasi pada permukaan benih.
Tabel 2 menunjukkan bahwa
cendawan terbawa benih terdeteksi pada
benih dengan sterilisasi ataupun tanpa
sterilisasi permukaan. Hal itu berarti lokasi
cendawan terbawa benih berada pada
permukaan (infestasi) dan di dalam benih
(infeksi). Pengujian pada benih Ciherang
menunjukkan hasil persentase infeksi total
cendawan, infeksi Fusarium sp. dan infeksi
Curvularia sp. berbeda nyata antara
perlakuan sterilisasi permukaan dan tanpa
sterilisai permukaan, sedangkan persentase
infeksi Alternaria sp. dan infeksi Drechslera
sp. tidak berbeda nyata. Dengan demikian
diketahui bahwa keberadaan Fusarium sp.
dan Curvularia sp. pada benih Ciherang
adalah sebagai bentuk infeksi dan infestasi,
sedangkan Alternaria sp. dan Drechslera sp.
sebagai bentuk infeksi.
Pengujian pada benih HIPA 8
menunjukkan hanya persentase infeksi
Penicillium sp. dan Cladosporium sp. yang
menunjukkan tidak berbeda nyata antara
perlakuan dengan sterilisasi ataupun tanpa
sterilisasi permukaan. Hal tersebut
menandakan Penicillium sp dan
Cladosporium sp. terdeteksi sebagai bentuk
patogen yang menginfeksi benih HIPA 8,

Buletin Pertanian Perkotaan Volume 4 Nomor 1, 2014 | 32

 Ikrarwati et. al.: Evaluasi Mutu Fisiologis dan Patologis Benih Padi

Tabel 2. Persentase infeksi cendawan pada benih padi Ciherang dan HIPA 8
Sterilisasi Tanpa sterilisasi
Tolok ukur
permukaan permukaan
------------------ Ciherang ------------------
Benih terinfeksi total cendawan (%) 24.00 b 49.00 a
Benih terinfeksi Alternaria sp. (%) 5.50 a 6.50 a
Benih terinfeksi Fusarium sp. (%) 14.25 b 24.00 a
Benih terinfeksi Drechslera sp. (%) 2.50 a 4.00 a
Benih terinfeksi Curvularia sp. (%) 3.25 b 22.25 a
-------------------- HIPA 8 --------------------
Benih terinfeksi total cendawan (%) 53.50 b 70.25 a
Benih terinfeksi Alternaria sp. (%) 23.50 b 32.00 a
Benih terinfeksi Fusarium sp. (%) 23.50 b 31.25 a
Benih terinfeksi Penicillium sp. (%) 1.00 a 1.25 a
Benih terinfeksi Curvularia sp. (%) 17.50 b 43.75 a
Benih terinfeksi Cladosporium sp. (%) 0.50 a 0.75 a
Keterangan: Angka-angka pada baris yang sama yang diikuti oleh huruf yang sama menunjukkan tidak
berbeda nyata pada uji t (t-test) taraf 5%.

sedangkan keberadaan Alternaria sp., meskipun tanpa adanya hubungan aktif

Fusarium sp., Curvularia sp. sebagai bentuk
infeksi dan infestasi. Meskipun tidak
menginfeksi benih, infestasi patogen tetap
harus diperhatikan. Agarwal dan Sinclair
(1996) menyatakan infestasi merupakan hal
penting pada penularan patogen benih
antara patogen dan benih.
Berdasarkan hasil pengujian
morfologi dan biokimia terhadap bakteri
terbawa benih padi pada Tabel 3, terdeteksi 2
bakteri terbawa benih Ciherang yaitu
Xanthomonas oryzae pv. oryzae dan Erwinia

Tabel 3. Hasil identifikasi koloni bakteri pada benih padi Ciherang dan HIPA 8
Pengujian Ciherang HIPA 8
Koloni 1 Koloni 2 Koloni 1 Koloni 2 Koloni 3
Morfologi Cembung, Licin, timbul, Licin, Cembung, Agak
bulat kecil tepi tak cembung, bulat kecil cembung, tak
beraturan bulat beraturan
Warna Kuning, Putih Kuning, Kuning tua Putih keruh
kuning tua kuning
pucat
Gram Negatif Negatif Negatif Negatif Positif
Arginin/anaerob Negatif Positif Negatif Negatif Negatif
Fluoresen Negatif Negatif Negatif Negatif Negatif
Oksidase Negatif Negatif Negatif Negatif Negatif
Katalase - Positif - - Positif
Hidrolisa Pati Negatif - Positif Negatif -
Hasil identifikasi Xoo Erwinia sp. Xco Xoo Clavibacter sp.
Keterangan: Xoo = Xanthomonas oryzae pv. oryzae; Xco = Xanthomonas campestris pv. oryzicola

Buletin Pertanian Perkotaan Volume 4 Nomor 1, 2014 | 33

 Ikrarwati et. al.: Evaluasi Mutu Fisiologis dan Patologis Benih Padi
sp. dan 3 bakteri terbawa benih HIPA 8 yaitu
Xanthomonas oryzae pv. oryzae,
Xanthomonas campestris pv. oryzicola dan
Clavibacter sp. Keempat bakteri ini diketahui
sebagai bakteri tular benih, tetapi tidak
semuanya menjadi patogen penyebab
penyakit tanaman padi.
Jumlah koloni bakteri terbawa benih
ditunjukkan pada Tabel 4. Berdasar hasil
deteksi diketahui terdapat 3.32 x 109 cfu g-1
Xanthomonas oryzae pv oryzae dan 5.10 x
102 cfu g-1 Erwinia sp. pada benih varietas
Ciherang sedangkan pada benih varietas
HIPA 8 terdapat 6.63 x 109 cfu g-1
Xanthomonas oryzae pv. oryzae +
Xanthomonas campestris pv. Oryzicola dan
5.47 x 103 cfu g-1 Clavibacter sp.
Penghitungan jumlah koloni bakteri
Xanthomonas oryzae pv. oryzae dan
Xanthomonas campestris pv. oryzicola pada
benih HIPA 8 tidak dipisahkan karena sulit
membedakan morfologi kedua bakteri
tersebut secara cepat sehingga dikhawatirkan
dapat menyebabkan kesalahan dalam
pengamatan.
Gambar 2 menunjukkan morfologi
koloni bakteri Xanthomonas oryzae pv.
oryzae dan Erwinia sp. yang terdeteksi pada
padi Ciherang serta Xanthomonas campestris
pv. oryzicola dan Clavibacter sp. yang
terdeteksi pada benih HIPA 8.
Tabel 4. Jumlah koloni bakteri terbawa benih padi Ciherang dan HIPA 8
Jenis bakteri pada benih
Ciherang
Xanthomonas oryzae pv. Oryzae
Erwinia sp.
HIPA 8
Xanthomonas oryzae pv. oryzae
campestris pv. Oryzicola
Clavibacter sp.
Buletin Pertanian Perkotaan Volume 4 Nomor 1, 2014 | 34
Xanthomonas oryzae pv. oryzae
merupakan penyebab hawar daun bakteri
pada tanaman padi. Penyakit ini dilaporkan
pertama kali pada tahun 1884 di Jepang. Di
Indonesia, penyakit ini pertama kali
dilaporkan oleh Reitsma dan Schure pada
tahun 1950 dengan nama ‘kresek’ dan
organisme penyebab penyakit ini dinamakan
Xanthomonas kresek Schure (Ou 1972).
Hawar daun bakteri merupakan salah satu
penyakit yang dapat ditularkan melalui
patogen terbawa benih (Agarwal dan Sinclair
1996). Penyakit ini dapat menurunkan
produksi padi sampai 50% (Vikal et al.
2007), dan sebelum diterapkannya
penggunaan varietas resisten dan karantina
yang ketat, kerusakan karena hawar daun
bakteri mencapai 20-30% (Liu et al. 2006),
sedangkan di Indonesia penurunan hasil
dapat mencapai 60% (BB PADI 2010). Ilyas
(2012) melaporkan keberadaan patogen Xoo
pada benih padi varietas IR64, Ciherang, dan
Situ Bagendit dengan tingkat kontaminasi
berturut-turut 70%, 50%, dan 40%. Pada
tahun 2006, seluas 519.200 ha tanaman padi
diserang organisme penganggu tanaman dan
seluas 74.243 ha terserang hawar daun
bakteri (Direktorat Perlindungan Tanaman
Pangan 2007).
Penyakit yang disebabkan bakteri
Erwinia sp. jarang dilaporkan pada tanaman
Jumlah bakteri (cfu g-1)
3.32 x 109
5.10 x 102
+ Xanthomonas
6.63 x 109
5.47 x 103
 Ikrarwati et. al.: Evaluasi Mutu Fisiologis dan Patologis Benih Padi

(a) (b) (c) (d)

Gambar 2. Koloni bakteri Xanthomonas oryzae pv. oryzae (a) dan Erwinia sp. (b) pada benih Ciherang;
Clavibacter sp. (c) dan Xanthomonas campestris pv. oryzicola (d) pada benih HIPA 8

padi. Ou (1972) melaporkan bahwa pada terdeteksi Xanthomonas campestris pv.

tahun 1965 Masao Goto menemukan
penyakit bacterial sheat rot di Indonesia dan
membandingkannya dengan isolat
Pseudomonas oryzicola pada padi dari
jepang dan isolat Erwinia carotovora pada
Carica papaya (pepaya) dari Filipina.
Diperoleh hasil bahwa isolat P. oryzicola dan
isolat dari Indonesia bersifat patogen
terhadap padi sedangkan isolat Erwinia
carotovora tidak. Bagaimanapun, isolat dari
Indonesia lebih mirip dengan E. carotovora
dibanding P. oryzicola. Goto (1979) juga
melaporkan penyakit bacterial foot rot pada
padi yang ditemukan di Jepang pada 1977.
Strain bakteri penyebab penyakit tersebut
memiliki karakter fenotip yang mirip dengan
Erwinia chrysanthemi pada jagung. Agarwal
dan Sinclair (1996) melaporkan Erwinia
herbicola sebagai patogen terbawa benih
yang menjadi penyebab penyakit Palea
browning
Xanthomonas campestris pv. oryzicola
adalah bakteri terbawa benih penyebab
penyakit bacterial leaf streak yang
merupakan salah satu penyakit penting dan
banyak ditemukan pada tanaman padi (Swing
et al. 1990; Syam et al. 2007). Balai Besar
PPMB-TPH (2006) melaporkan pada 42
sampel dari 59 sampel benih yang diuji,
oryzicola.
Laporan Clavibacter sp. sebagai
bakteri patogen terbawa benih yang menjadi
penyebab penyakit pada tanaman padi belum
ditemukan. Tanaman inang yang paling dekat
dengan padi dan terserang Clavibacter sp.
adalah gandum. Agarwal dan Sinclair (1996)
melaporkan Clavibacter tritici menyebabkan
penyakit yellow ear dan Clavibacter
michiganensis subsp. tesselarius sebagi
penyebab bacterial mosaic pada gandum.
KESIMPULAN
Benih varietas Ciherang pada
penelitian ini memiliki mutu fisiologis yang
tinggi dan memenuhi persyaratan sertifikasi
benih, sedangkan benih varietas HIPA 8
memiliki mutu fisiologis yang rendah dan
tidak memenuhi persyaratan sertifikasi pada
komponen daya berkecambah yang hanya
mencapai 77.25%. Pengujian terhadap mutu
patologis benih menunjukkan bahwa benih
varietas Ciherang terinfeksi bakteri
Xanthomonas oryzae pv. oryzae dan Erwinia
sp. dan benih HIPA 8 terinfeksi bakteri
Xanthomonas oryzae pv. oryzae,
Xanthomonas campestris pv. oryzicola dan
Clavibacter sp. Cendawan terbawa benih

Buletin Pertanian Perkotaan Volume 4 Nomor 1, 2014 | 35

 Ikrarwati et. al.: Evaluasi Mutu Fisiologis dan Patologis Benih Padi
yang terdeteksi dan teridentifikasi pada benih
padi varietas Ciherang adalah Alternaria sp.,
Fusarium sp., Drechslera sp. dan Curvularia
sp., sedangkan pada varietas HIPA
teridentifikasi 5 jenis cendawan yaitu
Alternaria sp., Fusarium sp., Curvularia sp.,
Penicillium sp. dan Cladosporium sp.
Penggunaan benih untuk pertanaman
di lapang sebaiknya menggunakan benih
dengan mutu fisiologis yang tinggi karena
menunjukkan vigor atau ketahanannya
terhadap kondisi lingkungan yang kurang
optimal. Mutu patologis benih sebaiknya
menjadi komponen persyaratan untuk
sertifikasi benih, patogen yang terdeteksi
dicantumkan pada label sertifikasi. Dengan
demikian benih dengan patogen tertentu tidak
ditanam pada lokasi yang tidak memiliki
riwayat adanya serangan penyakit yang
disebabkan oleh patogen tertentu tersebut.
DAFTAR PUSTAKA
Agarwal VK, Sinclair JB. 1996. Principles of
Seed Pathology. New York (US):
Lewis Publishers.
[Balai Besar PPMB-TPH] Balai Besar
Pengembangan Mutu Benih
Tanaman Pangan dan Hortikultura.
2004. Pengujian Mutu Benih
Tanaman Pangan dan Hortikultura.
Direktorat Jenderal Bina Produksi
Tanaman Pangan. Depok.
[Balai Besar PPMB-TPH] Balai Besar
Pengembangan Mutu Benih
Tanaman Pangan dan Hortikultura.
2006. Laporan Tahunan Pengujian
Laboratorium Bakteri. Depok (ID):
Balai Besar Pengembangan
Pengujian Mutu Benih Tanaman
Pangan dan Hortikultura.
[Balai Besar PPMB-TPH] Balai Besar
Pengembangan Mutu Benih
Buletin Pertanian Perkotaan Volume 4 Nomor 1, 2014 | 36
Tanaman Pangan dan Hortikultura.
2007. Deteksi Bakteri Patogen
Benih. Direktorat Jenderal Tanaman
Pangan. Depok.
[BB PADI] Balai Besar Penelitian Tanaman
Padi. 2010. Penyakit Hawar Daun
Daun Bakteri (BLB).
http://bbpadi.litbang.deptan.go.id/ind
ex.php/in/component/content/
article/204--penyakit-hawar-daun-
bakteri.html
Copeland LO, McDonald MB. 2001.
Principles of Seed Science and
Technology. Kluwer Academic Pr.
Massachusetts (USA).
Direktorat Perlindungan Tanaman Pangan.
2007. Informasi Perkembangan
Serangan OPT Padi Tahun 2006,
Tahun 2005, dan rerata 5 Tahun.
Subang.
[Dirjen TP] Direktorat Jenderal Tanaman
Pangan. 2009. Persyaratan dan
Tatacara Sertifikasi Benih Bina
Tanaman Pangan. Jakarta.
Fiana Y. 2010. Efektifitas matriconditioning
plus pestisida nabati dalam
pengendalian patogen seedborne
dominan dan peningkatan mutu
benih padi. Tesis. Institut Pertanian
Bogor. Bogor.
Goto M. 1979. Bacterial foot rot of rice
caused by a strain of Erwinia
chrysanthemi. Phytopathology 69:
213-216.
Ilyas S. 2012. Ilmu dan Teknologi Benih:
Teori dan Hasil-hasil Penelitian.
Bogor (ID): IPB Pr.
Islam MSh, Jahan QSA, Bunarith K,
Viangkum S, Merca SD. 2000.
Evaluation of seed health of some
rice varieties under different
conditions. Bot. Bull. Acad. Sin.
41:293-297.
[ISTA] International Seed Testing
Association. 2010. International
Rules for Seed Testing. Zurich.
Switzerland.
 Ikrarwati et. al.: Evaluasi Mutu Fisiologis dan Patologis Benih Padi

Liu NDO, Ronald PC, and Bogdanovie AJ. Kersters K. 1990. Reclassification of
2006. Xanthomonas oryzae the Causal Agents of Bacterial Blight
pathovars: model patogen of a model (Xanthomonas campestris pv.
crop. Molecular Plant Pathology oryzae) and Bacterial Leaf Streak
7:303-324. (Xanthomonas campestris pv.
oryzicola) of Rice as Pathovars of
Nurdin M. 2003. Inventarisasi beberapa
Xanthomonas oryzae (ex Ishiyama
mikroorganisme terbawa benih padi
1922) sp. nov., nom. rev.
yang berasal dari Talang Padang
International Journal Of Systematic
kabupaten Tanggamus, Lampung. J.
Bacteriology 40 (3 ): 309-311.
Hama dan Penyakit Tumbuhan
Tropika 3(2): 47-50. Syam M, Suparyono, Hermanto, Wuryandari
DS. 2003. Masalah Lapang Hama
Ou SH. 1972. Rice Diseases. England (GB):
Penyakit Hara Pada Padi. Bogor
Commonwealth Mycological
(ID): Pusat Penelitian dan
Institute
Pengembangan Tanaman Pangan.
Pham VD, Le CL, Nguyen D C, Huynh VN,
Vikal Y, Das A, Patra B, Goel RK, Sidhu JS,
Nguyen DT. 2001. Survey on
Singh K. 2007. Identification of
seedborne fungi and its effects on
news sources of bacterial blight
grain quality of common rice
resitence in wild oryza species. Plant
cultivars in the Mekong Delta.
Genetic Resources 5: 108-112.
Omonrice 9:107-113.
Yukti AM. 2009. Efektivitas
Sadjad S, Murniati E, Ilyas S, 1999.
matriconditioning plus agens hayati
Parameter Pengujian Vigor Benih
dalam pengendalian patogen terbawa
dari Komparatif ke Simulatif. Jakarta
benih, peningkatan vigor dan hasil
(ID): Grasindo.
padi. Tesis. Institut Pertanian Bogor.
Swings J, Van Den Mooter M, Vauterin L, Bogor.
Hoste B, Gillis M, Mew Tw,

Buletin Pertanian Perkotaan Volume 4 Nomor 1, 2014 | 37