Metodología: ligando

Metodología: Blanco, tarjet, proteasa SARS CoV-2

Blanco
Receptor
Tarjet
Optimización geométrica
Mecánica Molecular
Método variacional: Hartree Fock
DFT
Teoría Funcional
de Densidad

Medio etanolico y al vacío

Métodos cuánticos:
Ab initio y semiempírico
Se utilizó un diseño de bloques al azar con cuatro tratamientos
dos al vacío (la estructura del eucaliptol sin solventes), y dos en
etanol (la estructura del eucaliptol con el solvente etanol)
aplicando en ambos medios la teoría DFT y el método HF
respectivamente. Cada tratamiento se realizó por triplicado.
Mediciones
energéticas
geométricas
Longitudes de enlaces, ángulos, ángulos diedros
Funciones Fukui
y descriptores moleculares.
Descarga del
PDB
Protein data bank
Descarga del archivo
6LU7
Preparación
de la proteína
Dinámica
Molecular
CASTp
Sitio activo