Pseudo : Laza Nathan Rendue le : 19 nov.

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Commentaire :

Chap.2 activ.5 : Comprendre comment est régulée l'expression

des gènes
Créé le : 16 nov. 2023
Date limite : Pas de date limite

Version numérique disponible sur :

https://www.quiziniere.com/diffusions/D5O35E/copie/7PO

Chapitre 2, activité 5 :
Comprendre comment est régulée l'expression des
gènes
Partie 1 : Maturation de l'ARN chez les Eucaryotes

1ère partie :
Maturation de l'ARN
chez les Eucaryotes
Le nombre de protéines produites par un être humain est estimé à plusieurs centaines
de milliers, voire plusieurs milliards. Pourtant le génome humain ne comporte que 20
000 à 25 000 gènes, ce qui remet en question le concept: un gène/une protéine.
Dans cette première partie, on cherche à expliquer cette différence entre le nombre
de gènes et le nombre de protéines produites.

Lisez attentivement les documents 1, 2 et 3 et réalisez les tâches demandées sur

Geniegen2 (doc.3) puis répondez aux questionnaires.

Document 1

Doc.1: Comparaison de la longueur du gène Calc-1, de l'ARN pré-messager issu de la

transcription de ce gène et des deux ARNm permettant respectivement de coder la
synthèse de la calcitonine et du CGRP

Dans les cellules de la thyroïde, le gène Calc-1 (appelé aussi Calca) gouverne la
synthèse d'une protéine, la calcitonine, qui est une hormone1 intervenant dans la
régulation de la quantité de calcium dans le sang.
Dans de nombreux neurones du système nerveux, ce même gène commande la
synthèse d'une autre protéine permettant la communication entre neurones: le
neurotransmetteur CGRP.

1
Hormone = molécule produite par des cellules dites endocrines, transportée par le sang, et agissant à distance sur des cellules
cibles dont elle modifie le fonctionnement : c’est donc un messager chimique (définition vue en classe de seconde dans la partie
Procréation).

Chez les eucaryotes, il existe des différences entre l'ARN messager (ARNm) utilisé dans
le cytoplasme pour la traduction (synthèse des protéines) et l'ARN initial, issu
directement de la transcription de l'ADN, que l'on appelle ARN pré-messager
(ARNpm)
Le tableau ci-dessous indique la longueur des séquences correspondantes, dans le cas
du gène Calc-1.

Image modifiée d'après le manuel de 1ère EDS SVT, éd. Bordas, 2019

Document 2

Doc.2: L'organisation de l'ARN pré-messager

transcrit à partir du gène Calc-1

Comme tous les gènes d'eucaryotes, le gène Calc-1 est morcelé: il est formé de
séquences codantes appelées exons, entrecoupées de séquences non codantes,
appelées introns (voir schéma doc.2).
Après la transcription, les introns, présents dans l'ARNpm, sont éliminés lors d'une
étape appelée épissage : les ARNm sont donc exclusivement constitués d'exons.

Document 3 (manipulation pratique avec Geniegen2)

Doc.3: Manipulation pratique avec le logiciel Geniegen2

1) Ouvrez dans une autre fenêtre le logiciel Geniegen 2 : dans MCNL ou en suivant le lien suivant:
https://cosphilog.fr/geniegen2/

2) Dans la banque de séquences, ouvrez le fichier " Epissage alternatif, cas du gène CALCA ".

3) Alignez les 3 séquences d'ARN du fichier pour pouvoir ensuite les comparer. En vous aidant des informations du document 2,
repérez les introns 1 à 5.

Questionnaires de la 1ère partie

Répondez aux questionnaires n°1 à 3 :

19 - Complétez le texte à trous suivant :

Les ARNm ont une séquence de nucléotides plus courte que le gène ou l'ARN pré-messager (ARNpm), car ils sont
courte, petite

dépourvus des intronns .

introns

Dans l'ARNpm du gène Calc-1 (ou Calca), il y a cinq introns :

- l'intron 1 s'étend du nucléotide n° au nucléotide n° ;

65 1084

- l'intron 2 s'étend du nucléotide n° au nucléotide n° ;

1183 2213

- l'intron 3 s'étend du nucléotide n° au nucléotide n° ;

2353 3289

- l'intron 4 s'étend du nucléotide n° au nucléotide n° ;

3787 4432

- l'intron 5 s'étend du nucléotide n° au nucléotide n° .

4616 5187
Coef. 1

starstar_outlinestar_outlinestar_outlinestar_outline 8%

20 - Répondez aux deux QCM suivants :

Après avoir aligné les 3 séquences d'ARN étudiées sur Geniegen2, on peut en déduire
que :
L'ARNm codant la protéine CGRP (neurotransmetteur) est constitué de l'association des exons n°...

Réponse élève Réponse attendue

1 check

Juste
2 check

3 check

Faux
4 clear

5 check

6 check

Coef. 1
 star_outlinestar_outlinestar_outlinestar_outlinestar_outline 0%

L'ARNm codant la protéine calcitonine (hormone) est constitué de l'association des exons n°...

Réponse élève Réponse attendue

Juste
1 check

2 check

Juste
3 check

4 check

5 clear

6 clear

Coef. 1

starstarstar_halfstar_outlinestar_outline 50%

1 - Bilan de la 1ère partie (texte à trous)

Complétez le texte à trous suivant, pour faire le bilan de la 1ère partie de cette
activité :

Le produit de la transcription, appelé ARNpm , subit ensuite une maturation qui se passe en plusieurs étapes.
arnpré-messager,
arn pré-messager,
arn pre-messager,
arnpm, arn pm

Tout d'abord, les introns sont éliminés, lors d'une étape appelée épissage .
introns épissage,
epissage

Mais après cette étape, il peut aussi y avoir élimination de certains exons , au cours d'une étape appelée épissage
exons

alternatif. Les séquences restantes, qui sont exclusivement des exons , sont soudées entre elles, ce qui forme l'ARN
exons

messager .
messager, m,

L'épissage alternatif permet donc aux cellules de créer éventuellement plusieurs protéines à partir d'un même ARN
arnmessagers, arn
messagers,
arnme, arn me,
pré-messager. C'est donc ce mécanisme qui permet à des cellules différentes comme les cellules
arn messager, de la thyroïde ou certains
arnmessager

neurones, de synthétiser des protéines différentes comme la calcitonine ou le CGRP, à partir du même gène
protéines gène

Calc-1 (ou Calca). #lineBreak##lineBreak# L'épissage alternatif permet donc d'expliquer comment l'organisme humain est

capable de produire des centaines de milliers voire des milliards de protéines , à partir de seulement 20000 à 25000
protéines
 .
gènes
gènes
Coef. 1

starstarstarstarstar 91%

Partie 2 : Lumière et expression des gènes

2e partie :
Lumière et expression des gènes
Toutes les cellules de l'organisme portent le même ADN donc les mêmes gènes.
Pourtant, toutes les cellules de l'organisme ne produisent pas les mêmes protéines,
puisqu'elles ne réalisent pas toutes les mêmes tâches. Cela signifie que dans une
cellule donnée, seuls certains gènes sont exprimés, c'est-à-dire transcrits puis traduits.
Dans cette 2e partie, on cherche à comprendre comment l'expression d'un gène peut
être régulée .
On comprend qu'il y a deux niveaux de régulation possibles: avant la transcription, ou
après la transcription mais avant la traduction.

Consigne: Lisez attentivement le document ci-dessous, puis cochez la ou les bonnes

réponses de chaque QCM.

Manuel de SVT de 1ère S, éd. Nathan, 2011

2 - 1er QCM de la partie 2

On observe que la quantité d'ARNm du gène témoin...

Réponse élève Réponse attendue

Juste
...est équivalente à la lumière et à l'obscurité check

...augmente significativement lors du passage de l'obscurité à la lumière clear

 ...diminue significativement lors du passage de la l'obscurité à la lumière. clear

Coef. 1

starstarstarstarstar 100%

3 - 2e QCM de la partie 2

On observe que la quantité d'ARNm du gène Héma-1...

Réponse élève Réponse attendue

...est équivalente à la lumière et à l'obscurité clear

Juste
...augmente significativement lors du passage de l'obscurité à la lumière check

...diminue significativement lors du passage de la l'obscurité à la lumière. clear

Coef. 1

starstarstarstarstar 100%

4 - 3e QCM de la partie 2

Interprétez les résultats de cette étude :

Réponse élève Réponse attendue

La lumière n'a pas d'impact sur l'expression du gène Hema-15 clear

La lumière inhibe (=freine) l'expression du gène Hema-1 clear

Juste
La lumière stimule l'expression du gène Hema-1 check

Juste
La lumière est un facteur de régulation indirect de la production de chlorophylle check

Coef. 1

starstarstarstarstar 100%

Partie 3: Hormones et expression des gènes

3e partie :
Hormones et expression des gènes
Consigne: Lisez et observez attentivement les documents 1 et 2 ci-dessous, puis
cochez la ou les bonnes réponses pour chaque QCM.
 Manuel de 1ère EDS SVT, éd. Belin, 2019

6 - 1er QCM de la partie 3

Lorsque la dose d’œstrogènes reçue par les cellules de l'utérus des souris témoins
augmente...
Réponse élève Réponse attendue

...on n'observe aucun effet sur la quantité d'ARNm des gènes 1 et 2 clear

Juste
...on observe une augmentation de la quantité d'ARNm du gène 1 check

...on observe une augmentation de la quantité d'ARNm du gène 2 clear

...on observe une diminution de la quantité d'ARNm du gène 1 clear

...on observe une diminution de la quantité d'ARNm du gène 2 check

Coef. 1

starstarstar_halfstar_outlinestar_outline 50%

7 - 2e QCM de la partie 3

Interprétez les résultats de cette étude:

Réponse élève Réponse attendue

Les œstrogènes n'ont aucun effet sur l'expression des gènes 1 et 2 clear

Les œstrogènes stimulent l'expression des gènes 1 et 2 clear

Faux
Les œstrogènes activent l'expression du gène 1 dans toutes les cellules de souris clear

Les œstrogènes inhibent (freinent) l'expression du gène 2 dans les cellules utérines de souris check

Juste
Les œstrogènes stimulent l'expression du gène 1 dans les cellules utérines de souris check

Coef. 1
 starstar_outlinestar_outlinestar_outlinestar_outline 17%

8 - 3e QCM de la partie 3

Les œstrogènes ont une action régulatrice sur l'expression de certains gènes. Cette
régulation a lieu...
Réponse élève Réponse attendue

après la traduction (= régulation post-traductionnelle) check

avant la transcription (= régulation pré-transcriptionnelle) clear

Faux
après la transcription mais avant la traduction (= régulation post-transcriptionnelle) clear

Coef. 1

star_outlinestar_outlinestar_outlinestar_outlinestar_outline 0%

9 - Phrase à trou

Consigne: Trouvez le mot manquant à la fin de la phrase suivante:

Les résultats obtenus avec les souris transgéniques prouvent que les oestrogènes agissent par fixation sur un récepteur
récepteur

spécifique.
Coef. 1

starstarstarstarstar 100%

Partie 4 : Facteurs de transcription et expression des gènes

4e partie :
Facteurs de transcription
et expression des gènes
Consigne: Lisez attentivement les documents du manuel aux pages 98-99, puis cochez
la ou les bonnes réponses de chaque QCM.

11 - 1er QCM de la partie 4

L'épinoche marine et l'épinoche lacustre:

Réponse élève Réponse attendue

Juste
ont des phénotypes différents check

Faux
portent des gènes PITX1 différents clear
 portent le même gène PITX1 mais celui-ci ne s'exprime pas dans les cellules ventrales de l'embryon d'épinoche
check
lacustre.

Coef. 1

star_outlinestar_outlinestar_outlinestar_outlinestar_outline 0%

12 - 2e QCM de la partie 4

Dans l'expérience de transgénèse réalisée :

Réponse élève Réponse attendue

on injecte le gène PITX1 d'épinoche marine à une épinoche lacustre adulte clear

Faux
on injecte le gène PITX1 d'épinoche marine dans une cellule-oeuf d'épinoche lacustre clear

on injecte l'ARNm de PIX1, extrait d'une épinoche marine dans une cellule-oeuf d'épinoche lacustre clear

on injecte une séquence régulatrice du gène PITX1 d'épinoche marine dans une cellule-oeuf d'épinoche
lacustre check

l'épinoche transgénique obtenue présente le phénotype "lacustre" clear

Juste
l'épinoche transgénique obtenue présente le phénotype "marin" check

Coef. 1

starstarstar_outlinestar_outlinestar_outline 25%

13 - Bilan de la partie 4 (texte à trous)

A partir des informations de l'ensemble des documents des pages 98-99, complétez
ce texte à trous (un mot par trou) afin d'expliquer l'absence de nageoires pelviennes
épineuses chez l'épinoche lacustre.

L'alignement des séquences codantes du gène PITX1 d'épinoche lacustre et d'épinoche marine révèle que ces deux gènes

sont similaires .
identiques,
semblables,
similaires, les
mêmes

La séquence PEL de l'épinoche lacustre, située juste en amont du gène PITX1, porte en revanche une mutation . Or
mutation

cette séquence a été identifiée comme une séquence régulatrice du gène PITX1.
régulatrice,
regulatrice

La fixation de facteur de transcription sur cette séquence PEL est nécessaire au déclenchement de la
facteurs de transcription

transcription du gène PITX1. #lineBreak##lineBreak# Le résultat de la transgénèse montre qu'une épinoche lacustre

génétiquement modifiée grâce à une micro injection d'épinoche marine présente des nageoires
séquence pel, regulatrice, marine
régulatrice
pelviennes épineuses développées, tout comme l'épinoche .
lacustre
marine

On en conclut que la différence de phénotype entre ces deux poissons n'est pas liée à une altération du gène PITX1
mutation

mais à une différence de régulation interne qui modifie l' expression de ce gène.
régulation expression
Coef. 1

starstarstarstarstar_outline 62%

Pour terminer (synthèse des 4 parties de l'activité)...

Rédigez une courte synthèse de toute l'activité 5, expliquant comment l'expression

d'un gène peut être régulée, avant ou après transcription.

Coef. 1

star_outlinestar_outlinestar_outlinestar_outlinestar_outline 0%