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ST 15 BM 2023 U2
ST 15 BM 2023 U2
SP-15
a) En las secuencias de los plásmidos
seleccionados: detectar resistencia a antibióticos
(Investigación formativa).
Incompatibilidad (Inc)
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Incompatibilidad (Inc)
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Incompatibilidad
• Se basa en los sistemas de:
• Replicación
• Partición ó segregación (más frecuente en sistemas
de partición Tipo I y Tipo II)
• Incompatibilidad se presenta cuando los plásmidos
frecuentemente presentan similitud de genes y
elementos estructurales del sistema de replicación ó
segregación
• Plásmidos con diferente sistema de replicación o
segregación pueden ser coresidentes y segregarse
después de la duplicación de la bacteria huésped.
• Incompatibilidad de plásmidos es un factor limitante en
la transferencia horizontal de plásmidos
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Plásmidos coresidentes de Aeromonas sp. ASNIH2
Plásmido RefSeq Replicación bp
Desplazamiento de cadena 13512
“primase"
pAER-ba17 NZ_CP026407.1
"replicative helicase"
"Replication protein (RepC)
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Aeromonas sp. ASNIH2
Plásmido Replicación bp
Theta clase C 8238
pAER-c633 "DNA primase"
"Replicase“-"PriCT_1“
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Sistema de partición Tipo I en ambos plásmidos
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Incompatibilidad dependiente de ParA
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Incompatibilidad dependiente del centrómero
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Rango de hospederos
• Características que determinan el rango de hospederos:
• Número de orígenes de replicación
• Tipos de orígenes de replicación
• dso (sólo en sus huéspedes)
• sso
• ssoU, ssoT ( en diferentes huéspedes)
• ssoA, ssoW (sólo en sus huéspedes)
• Estructura del orígen de replicación:
• iterones
• Dna boxes
• IHF
• Número de genes codificadores de Rep
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Rango de hospederos
• Características adicionales en el genoma del plásmido
• Genes codificadores de proteínas auxiliares para el
inicio de la replicación
• primasa,
• helicasa,
• Topoisomerasas
• Relaxasa replicativa
• Presencia de sistema conjugativo
• Pocos sitios de restricción para endonucleasas de
restricción de la bacteria
• Sistemas de protección “anti-restricción”
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Plásmidos de amplio rango de hospederos (BHR)
• pJD4 (7.4 kb) de Neisseria gonorrhoeae
• Se replica en E. coli, Salmonella enterica, Haemophilus
influenzae
• Tres orígenes de replicación → ori1, ori2, ori3
• Dos genes repB y repA → proteínas iniciadoras de la
replicación
• RepB → ori2
• RepA → ori3 y ori1
• pMV158
• Dos orígenes de replicación: ssoA y ssoU
• ssoA → S. agalactiae
• ssoU → bacterias Gram+ ( Bacillus subtilis, Staphylococcus
aureus y Lactococcus lactis)
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Plásmidos de amplio rango de hospederos (BHR)
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Plásmidos de amplio rango de hospederos (BHR)
• RSF1010
• Tiene genes auxiliares a repC para el inicio de la
replicación
• repA que codifica la helicasa
• repB que codifica la primasa
• Se replica en:
• E. coli, P. aeruginosa, Samonella typhimurium,
Agrobacterium
• Mycobacterium smegmatis, S. lividans,
• S. cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe,
Kluyveromyces lactis, Hansenula polymorpha,
• Cyanobacteria
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Reducido rango de hospederos
• Plásmido F (99.5 kb)
• Contiene tres replicones básicos: RepFIC, RepFIA y
RepFIB.
• Replicon básico funcional RepFIA
• tiene dos orígenes (oriV y oriS) y un sólo gen repE
• Replicación desde oriV es bidireccional
• Replicación desde oriS es unidireccional
• R6K
• 3 orígenes de replicación ( alfa, beta y gamma)
• alfa y gamma reconocen a la proteína
transactivadora de la replicación (pir)
• Se replica sólamente en bacterias que tengan el gen pir
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Importancia de los plásmidos BHR
• En el ambiente para degradación de:
• metales (cobre, plata, cromo, mercurio, arsénico),
• compuestos xenobióticos (organosforados,herbicidas,
hidrocarburos),
• compuestos de amonio cuaternario
• anilinas………..
• En salud humana o animal responsable de resistencia a
antibióticos (kanamicina, ampicilina, estreptomicina…)
• En la tecnología del DNA recombinante para construcción de
diversos tipos de plásmidos vectores
• pB10, pKJK10,plásmidos altamente “promiscuos” pueden
transferirse, replicarse y mantenerse en casi todas las
especies de las proteobacteria (Alpha, Beta y Gamma)
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Ventaja selectiva a la bacteria huésped
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Ventaja selectiva a la bacteria huésped
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• Replicación círculo rodante
• Movilizable
• Bacteria hospedera Streptococcus agalactiae resistente a tetraciclina
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Ventaja selectiva a la bacteria huésped
Plásmido bp Resistencia Bacteria
Sphingobium
pPDL2 37317 Parathion
fuliginis
naphthalene/biphenyl,
Sphingomonas
pNL1 184457 xylene,
aromaticivorans
p-cresol
Sphingomonas
pISP1 172140 cyclohexane
sp. MM-1
Mercury "merE"-D-A-F-P-T-R" Pseudomonas
pUM505 123322
Chromate "chrB" "chrA-chrC" aeruginosa
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Plásmidos crípticos
• Por lo general se replican por los mecanismos theta o RC
• Independientemente del tamaño del plásmido, los plásmidos
crípticos contienen genes para único beneficio del plásmido
• Pueden codificar sólo uno o dos genes implicados en la
replicación:
• pKST21 (1460 bp) →rep A y repB
• También pueden incluir además del gen codificador de la
proteína de replicación a:
• Genes relacionados a movilización, partición (estabilidad)
• Genes con funciones adicionales que no se expresan
fenotípicamente en su bacteria huésped
• Genes con funciones desconocidas (proteínas
hipotéticas) sin evidencia experimental
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Plásmidos crípticos co-residentes de Escherichia coli strain MNCRE44
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