Professional Documents
Culture Documents
Scientific Writing
Scientific Writing
3
4
1. Một ấn phẩm báo cáo về kết quả của một dự án nghiên
cứu hoặc các quan sát khoa học về hoặc về một chủ đề
2. Báo cáo nghiên cứu được thực hiện bởi nhiều lĩnh vực
bao gồm công nghiệp, giáo dục
3. Có thể phổ biến trong nội bộ hoặc công khai (xuất bản,
thường không có sẵn từ các nhà bán sách hoặc thông qua
các kênh xuất bản thương mại tiêu chuẩn.
4. Phát hành bởi các tổ chức chính phủ, phi chính phủ và
quốc tế
5
1. Khóa luận tốt nghiệp đại học, luận văn cao học, luận án
tiến sĩ
2. Báo cáo tóm tắt nghiên cứu khoa học (hội nghị KH)
3. Báo cáo kết quả đề tài nghiên cứu khoa học
4. Theo mẫu / quy định của cơ quan quản lý – nhà tài trợ
6
8
9
1
• Chia sẻ kiến thức: Xây dựng hệ thống kiến thức nhân loại
• Cơ hội để hiểu hơn kinh nghiệm của mình. Ví dụ:
- Phân tích số liệu
- Bình duyệt
• Phát triển nghề nghiệp
1
• Scientific paper, paper, journal articles
• Nội dung khoa học
• Xuất bản trên trên tạp san khoa học
1
https://naturemicrobiologycommunity.nature.com/posts/43103-dear-editor 1
Journal Editor Reviewers
Author submits screens manuscript and provide
manuscript sends to comments on
peer reviewers manuscript
1, 2, 3
Author addresses
Copy editing reviewer
comments
Author addresses
Copy Editor’s Layout Proof reading
comments
Publish
1
• Bài báo nguyên gốc (original papers)
• Bài báo nghiên cứu ngắn (short communications)
• Báo cáo trường hợp/loạt trường hợp (Case/case series reports)
• Bài tổng quan (Reviews)
• Bài xã luận (Editorials)
• Thư tòa soạn (Letters to the editor)
• Báo cáo tóm tăt (Abstracts)
1
• Dữ liệu của nghiên cứu chưa công bố trước đây
• Nghiên cứu đề ra ý tưởng mới hay cách diễn giải mới
• Nghiên cứu đề ra phương pháp mới để tiếp cận chủ đề cũ
• Quy trình bình duyệt chặt chẽ
1
1
• Short paper / short letter
• Số lượng từ ít, tùy vào tạp chí (~ 1000 từ)
• Nội dung tập trung vào 1 vấn đề hẹp hay phát hiện nhỏ
• Vẫn theo quy trình bình duyệt như original paper
1
1
• Nội dung xoay quanh 1 hay 1 số trường hợp đặt biệt
• Vẫn theo quy trình bình duyệt như original paper nhưng
nhẹ hơn
2
• Perspective paper
• Có thể là những tác giả uy tín được mời
• Tập trung vào chủ đề hẹp và đề ra hướng nghiên cứu cho
chuyên ngành
• Không hay có bình duyệt nhưng không chặt chẽ
2
• Bài bình luận một nội dung khoa học nào đó
• Không qua bình duyệt mà chỉ góp ý từ ban biên tập
2
• Phản hồi / phê bình cho bài báo được đăng trên tạp chí
• ~ 500 words, tùy từng tạp chí
2
• Bản tóm lượt (abstract) ~ 250 words
• Bài báo ngắn (proceeding paper)
• Không hay bình duyệt không chặt chẽ
2
2
2
• Tờ báo xuất bản định kỳ
• Mang thông tin khoa học đến đến giới khoa học
• Danh mục của index medicus:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC197854/pdf/mlab00192-0054.pdf
2
• I : Introduction
• M : Methods
• R : Results
• A : and
• D : Discussion
2
• Cơ sở nghiên cứu được tiến hành
• Lý do người đọc phải quan tâm đến nghiên cứu
1. Vấn đề chung là gì? Tình hình hiện nay ra sao?
2. Vấn đề cụ thể là gì ? Tình hình hiện nay ra sao và khoảng trống
trong y văn?
3. Công trình này đóng góp gì?
2
• Chi tiết phương pháp của nghiên cứu
• Cân đối giữa súc tích và đầy đủ
• Súc tích: kỹ thuật với chi tiết
• Đầy đủ: đọc và hiểu rõ phương pháp
3
• Ngắn gọn
• Đi thẳng vào phần mà Introduction đã dẫn nhập
• Phát hiện kết quả gì và trả lời câu hỏi đã nêu trong giới thiệu?
• Kết quả chính / phụ
• Trình bày bằng biểu đồ / bảng số liệu
3
Trình bày số liệu thống kê
Thống kê
Statistics
giống như
are like
bikini
bikinis. What.
Những gì để
they reveal is
lộ ra là gợi
suggestive
cảm, những , Prof. Aaron Levenstein
but what they
gì che giấu là
conceal
điều quan is
vital
trọng
32
• Không có cấu trúc cố định
• Giải thích số liệu phần kết quả và phát hiện chính là gì?
• Ý nghĩa của phát hiện này và bàn luận ý nghĩa này
• Ưu / khuyết của nghiên cứu
• So sánh với các nghiên cứu khác
• Cuối phần bàn luận là kết luận
3
3
1. Results
2. Methods
3. Discussion
4. Introduction
5. Abstract
3
• Nhận góp ý đồng nghiệp nội bộ trước khi gửi đăng
• Bình duyệt chung
• Bình duyệt chuyên môn
3
• Xác định tạp chí
- Chọn tạp chí với độc giả mà bạn muốn chia sẻ thông tin
- Theo các hướng dẫn của tạp chí dành cho tác giả
- https://jane.biosemantics.org/
• STROBE checklist (Báo cáo các nghiên cứu quan sát)
3
jane.biosemantics.org/
4
• Ít từ nhất và mô tả đầy đủ nội dung / mục đích bài báo
• Tiêu đề tốt:
1. Dự đoán nội dung của bài nghiên cứu
2. Gây hứng thú cho người đọc
3. Phản ánh phương pháp nghiên cứu
4. Chứa các từ khóa để giúp tìm kiếm bài báo
https://www.enago.com/academy/write-irresistible-research-paper-title/ 4
4
• Theo quy định của tạp chí
• Thông tin cần thiết để đọc giả quyết định đọc toàn văn
• Không có y đức
https://libguides.usc.edu/writingguide/abstract 4
• Sử dụng kiểu văn đơn giản và súc tích
- Tránh từ phức tạp
- Sử dụng câu ngắn
• Sử dụng các headings hay subheadings
- Phương pháp
- Kết quả
4
• Đoạn văn thường 3-7 câu
• Câu giới thiệu
• Các câu tiếp theo
• Câu kết của đoạn văn trước thường liên kết và bắt đầu ở
đoạn văn tiếp theo
4
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3040376/pdf/BLT.10.077982.pdf 4
• Độc giả là quốc gia / quốc tế
• Sử dụng ngôn ngữ phổ thông / quốc tế
• Trường hợp không có từ tương đương thì phải giải thích
từ địa phương khi dùng
- Phân cấp hành chính ở Malaysia: Country – states – district
(district ~ province)
- Aimag ở Mogolia tương đương với cấp tỉnh
4
• Biểu đồ, hình, bản đồ
• Thông tin trực quan và theo cách dễ hiểu hơn
• Thể hiện mô hình, xu hướng và so sánh dữ liệu
• Hình ảnh phải có tiêu đề và nhãn rõ ràng, được đánh số và
tham chiếu trong văn bản
4
• Công cụ hữu ích để trình bày dữ liệu và kết quả phân tích một
cách rõ ràng, có tổ chức và dễ hiểu
• Thay cho danh sách nhiều con số trong văn bản người đọc
sẽ khó theo dõi
• Thông tin trình bày rõ ràng: Tiêu đề bảng, hàng, cột, đơn vị
• Hai hay 3 bảng tốt hơn bảng nhiều số liệu
5
• Tiêu đề của bảng: rõ ràng, ngắn gọn, miêu tả được số liệu gì,
ở đâu, khi nào, thông thường phải đánh số cho bảng
• Ghi chú hàng và cột: rõ ràng, ngắn gọn, đơn vị đo lường (năm,
tỷ lệ mắc/100.000 dân, tiền)
• Giải thích những chữ viết tắt, mã hóa, biểu tượng ở cuối bảng
• Ghi chú nguồn số liệu ở cuối bảng
5
• 3 - 4 số: Chữ
• Trên 4 số: Bảng số liệu
5
53
54
• Chỉ ra mô hình hoặc xu hướng của bệnh theo thời gian.
• Thông thường sử dụng đồ thị hình dây để biểu thị dãy số
liệu dài và so sánh một số dãy
350
300 305.79
250
200
Mắc/100.000
150 142.13
95.86 81.65
100
54.98
46.99 61.59
50 68.45
32.55 39.6
0
1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006
200
100
0
Tuần 1 Tuần 2 Tuần 3 Tuần 4
• Dùng để so sánh số liệu với những biến số riêng rẽ
• Đồ thị hình cột đơn: được sử dụng để biểu thị số liệu từ
bảng 1 biến số 3
2.67
2.5
Mắcc/100.000 dân
1.5
1.28
1.2
0.97
1
0.5
2500
Miền Nam
1500
1000
500
0
1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 Năm
40000
35000
30000
25000
20000
15000
10000
5000
0
1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006
Miền Nam
72.0%
Chú thích:
1 BN
Bản đồ phân bậc
Tay chân miệng - 2011
Tỷ lệ tử vong / 1.000.000
http://www.biomedcentral.c
om/1471-2334/14/341
Xin trân trọng cảm ơn
65
Tips for tables
• Indicate when data are missing from the table either
by adding a row or column with the number of
missing values or explaining in a footnote to the table
• Include row and or column totals to help the reader
understand the table
• Check and recheck all numbers in tables
• Proof-read carefully for transcription errors
• Arithmetic errors may cast doubt on your results so
– Carefully check all arithmetic in table
– Check that rows and columns add up correctly
– Check that percentages correctly calculated
Typical tables
• Some typical tables in epidemiological analysis include:
– Description of study population (e.g. frequency distribution of key
variables)
– Cross tabulations
– Results of multivariate analysis
Exercise 1: How can this table be improved?
Reason %
Reason %
% Column adds up to more than 100%. Correct error or indicate why colum
does not sum to 100%
Include the total number of cases in the title
Exercise 3: How can this table be improved?
Table 2: Demographic characteristics of study population
Variable N
Age <1 40
1-5 40
5-15 100
15+ 100
Sex Male 150
Female 149
Economic status of family Hi 30
Middle 80
Low 100
Exercise 3: Suggestions for improvement?
Table 2: Demographic characteristics of study population
Include total number of cases in title
Variable N
Age <1 40
1-5 40
5-15 100
15+ 100
Sex Male 150
Female 149
Economic status of family Hi 30
Middle 80
Low 100
Insert rows with missing values
Graphs, charts, figures and maps
Good design of graphs, figures, charts and maps*
• Show data clearly
• Induce reader to think about what the graphic is about rather than
how it is designed
• Avoid distorting the data
• If possible, show several levels of detail – this makes the graph
more interesting
• Keep unnecessary lines and information to a minimum
– Grids should be muted or suppressed so they do not compete with data
– Erase extraneous information and lines
Antenatal clinic patients had lower infection levels than in pregnant women in the
immediate surrounding area in a study of 12 sub-communities in Zimbabwe 1998-
2000.
The authors suggested that reason was that women from nearby rural areas also used
the clinic and these women had much lower levels of HIV infection
Gregson S, Terceira N et al. Study of bias in antenatal clinic HIV 1 surveillance data in a high
contraceptive prevalence population in sub-Saharan Africa. AIDS 2002, Vol 16 No 4
Class discussion
• In your studies was selection bias possible or likely?
• How might this affect your results?
Confounding
• Co-occurrence of several different factors
– At a wedding diner in the UK, contaminated liver parfait was served
on the same plate as salad, so that those who ate liver were also
more likely to eat salad
– Over time, the amount of alcohol consumed rose in similar pattern to
increase in priests. But this does not imply that there was a direct
relationship between alcohol consumption and number of priests.
Both were related to population growth
Class discussion
• In your studies are there possible or likely confounding factors?
• How might they affect your results?
Information bias
• Typical systematic measurement errors in a variable used for
analysis
– Recall bias
– Poor calibration of weighing scale
– Contamination in laboratory
– Interviewer influences responses in a survey
Class discussion
• In your studies is information bias possible or likely for any of
your variables?
• What steps have you taken to reduce information bias?
• How may possible or likely information bias errors affect your
results?
Coherence with known facts and previous findings
• How do your study results fit in with known facts and findings
from other studies?
• Are there known facts that help to explain your results?
• Do previous studies have evidence to support or to refute your
results?
Further issues and new hypotheses
Two study sites were chosen. One site was Baganuur District, a district of Ulaanbaatar,
the capital of Mongolia, located 130 km east of the city centre with a population of 25
875. The other study site was Selenghe Province, located 300 km north of Ulaanbaatar
at the border to the Russian Federation with a population of 21 460. Age distribution
nationwide and at the two study sites were compatible. Each site has one hospital and
four family group practices (outpatient clinics), and all the residents receive free
medical care.
Nukiwa N et. al. Evaluating influenza disease burden during the 2008-2009 and 2009-2010 influenza seasons in Mongolia. Western Pacific Surveillance and Response Journal, 2011(1). doi:10.5365/wpsar.2010.1.1.004
Methods: Example
Study participants
All the patients with ILI who visited these health care facilities as
well as patients who were hospitalized with a diagnosis of SARI
were enrolled in this study.
Nukiwa N et. al. Evaluating influenza disease burden during the 2008-2009 and 2009-2010 influenza seasons in Mongolia. Western Pacific Surveillance and Response
Journal, 2011(1). doi:10.5365/wpsar.2010.1.1.004
Methods: Example
Data
doi:10.5365/wpsar.2010.1.1.004
Methods: Example
Data
The proportion of ICU/SCU admissions among hospitalized patients with pandemic A(H1N1) 2009 infection was
calculated. Univariate association of various factors were evaluated using descriptive statistical techniques. The
association between ICU/SCU admission and patient characteristics (age, sex, indigenous status, underlying medical
conditions and whether antiviral treatment was received) was evaluated using univariate logistic regression
followed by multivariate forward stepwise logistic regression test.
To assess the predictive value of various factors, the area under the receiver-operating characteristic (ROC) curves
was calculated. The ROC curve evaluates the ability of the full logistic regression model to discriminate patients
admitted to ICU/SCU from those with no ICU/SCU admission. The SPSS package (Version 12) was used for all
analyses.
Phung H et al. Surveillance of hospitalizations with pandemic A(H1N1) 2009 influenza infection in Queensland, Australia. Western Pacific Surveillance and Response Journal.
2011, 2(2). doi: 10.5365/wpsar.2010.1.1.013
Methods: Example
Ethics
1:
The study was conducted primarily as part of a national public health programme, with
supplemental data obtained from a community seroprevalence study which had been approved by
the National Environment Agency Bioethics Review Committee (IRB 005.2) in 2007.
Ler et al. Epidemiological characteristics of the 2005 and 2007 dengue epidemics in Singapore - similarities and distinctions. Western Pacific Surveillance and Response Journal. 2011, 2(2).doi:
10.5365/wpsar.2010.1.1.011
2:
Ethical clearance was not required for this analysis. This analysis was conducted as a clinical audit
(during a public health emergency event), required under the Health Services Act (1991).
Phung H et al. Surveillance of hospitalizations with pandemic A(H1N1) 2009 influenza infection in Queensland, Australia. Western Pacific Surveillance and Response Journal. 2011, 2(2). doi:
10.5365/wpsar.2010.1.1.013
Methods: Exercise
Manuscript outline
For your study identify the follow:
• Study design
• Study site
– Brief description of location
• Study participants
– Describe how study participants were identified
• Data
– Source
– Case definition
– Variables
– Data cleaning - missing/incomplete data
• Analysis
– Computer programs
– Statistics used
• Ethics
– Provide details of ethics approval if required
– If ethics approval was not required, provide a statement why
Discussion
Interpretation of results
Discussion
• Interpretation of your results
• Relate results to literature
– How do your results compare to other studies?
• Opportunity to highlight the strengths of your study, e.g.
– E.g. new findings, first study in Mongolia
• 4-6 paragraphs
• Include references
Discussion
Outline
• Main finding
– Describe main finding
– Relate to literature
– Should be closely linked to your objectives
• Minor findings
– Describe minor findings
– Relate to literature
• Limitations
– Describe limitations
– Explain the possible affect of these limitations on your results
• Conclusion
– Restate your major finding/message
– Link to public health implications
– Future directions
Discussion
1. Major finding
• Main finding
– Describe main finding
– Relate to literature
– Should be closely linked to your objectives
• Minor findings
– Describe minor findings
– Relate to literature
• Limitations
– Describe limitations
– Explain the possible affect of these limitations on your results
• Conclusion
– Restate your major finding/message
– Link to public health implications
– Future directions
Discussion: Example
1. Major finding
Pregnancy has been associated with increased hospitalization and severity of illness
due to pandemic A(H1N1) 2009 infection. In our study, 7% of hospitalized patients with
confirmed pandemic A(H1N1) 2009 infection were pregnant compared to the 1%
prevalence of pregnancy in the general population. Although a slightly higher
proportion of pregnant patients were admitted to ICU or SCU, this did not reach
statistical significance.
Phung H et al. Surveillance of hospitalizations with pandemic A(H1N1) 2009 influenza infection in Queensland, Australia. Western Pacific Surveillance and Response Journal.
• LIMITATION: Because we defined the influenza epidemic periods from limited laboratory results and
defined a cut-off point at 20% of influenza-positive proportion,
– EFFECT: we might have shortened the influenza epidemic periods and in turn underestimated the ILI cases.
• CREDIBILITY STATEMENT: In spite of these limitations, the proportion of specimens positive for
influenza in our study were 17% in Baganuur and 18% in Selenghe, which is compatible with other
studies showing 10%–19%.
Discussion:
4. Concluding paragraph
• Main finding
– Describe main finding
– Relate to literature
– Should be closely linked to your objectives
• Minor findings
– Describe minor findings
– Relate to literature
• Limitations
– Describe limitations
– Explain the possible affect of these limitations on your results
• Conclusion
– Restate your major finding/message
– Future directions
– Public health implications
Discussion:
4. Concluding paragraph
Phung H et al. Surveillance of hospitalizations with pandemic A(H1N1) 2009 influenza infection in Queensland, Australia. Western
Pacific Surveillance and Response Journal. 2011, 2(2). doi: 10.5365/wpsar.2010.1.1.013
Discussion: Exercise
4. Concluding paragraph
We observed the highest incidence of ILI among children, especially children under
five years of age; the highest proportion of SARI was also observed in this age group.
Other infections such as respiratory syncytial virus and rhinovirus can also cause ILI in
this age group, so it is necessary to examine other pathogens with influenza-negative
samples for more clear disease burden estimation. We believe our findings can lead to
awareness among parents who have young children with high potential to be affected
with influenza infection. This awareness will encourage individuals in Mongolia to
adopt non-pharmaceutical interventions (e.g. hand hygiene) during the influenza
epidemic period. However, to reveal a more accurate disease burden of influenza in
Mongolia and to develop intervention strategies such as a vaccination programme,
further studies in urban areas and with more severe patients are necessary to observe
the severity of influenza infection.
Nukiwa N et. al. Evaluating influenza disease burden during the 2008-2009 and 2009-2010 influenza seasons in Mongolia. Western Pacific Surveillance and
Response Journal, 2011(1). doi:10.5365/wpsar.2010.1.1.004
Discussion: Exercise
4. Concluding paragraph
FUTURE DIRECTIONS:
• Other infections such as respiratory syncytial virus and rhinovirus can also cause ILI in this age
group, so it is necessary to examine other pathogens with influenza-negative samples for
more clear disease burden estimation.
FUTURE DIRECTIONS:
• However, to reveal a more accurate disease burden of influenza in Mongolia and to develop
intervention strategies such as a vaccination programme, further studies in urban areas and
with more severe patients are necessary to observe the severity of influenza infection.
Discussion: Exercise
Manuscript outline
• For your study identify the following:
• Main finding
– Describe main finding
– Relate to literature
– Should be closely linked to your study objective
• Minor findings
– Describe minor findings
– Relate to literature
• Limitations
– Describe limitations
– Explain the possible affect of these limitations on your results
• Conclusion
– Restate your major finding/message
– Future directions
– Public health implications
Discussion: Group discussion
Manuscript outline
2. Specific context
– Brief description of disease in the context of your study (e.g. Mongolia)
3. Gap in knowledge
– Briefly describe the gap in knowledge
– Why was it necessary to undertake the study
On the other hand, much less is known about the burden of influenza in
developing countries. Monitoring the incidence and clinical characteristics
of influenza and hospitalization due to influenza is critical in understanding
the influenza disease burden in the population and guiding prevention and
control strategies.
Nukiwa N et. al. Evaluating influenza disease burden during the 2008-2009 and 2009-2010 influenza seasons in Mongolia. Western Pacific Surveillance and Response Journal, 2011(1).
doi:10.5365/wpsar.2010.1.1.004
Introduction: Example
4. Objective
1. General situation
– Brief description of disease
– Brief description of relevant epidemiological characteristics of disease
2. Specific context
– Brief description of disease in the context of your study (e.g. Mongolia)
3. Gap in knowledge
– Briefly describe the gap in knowledge
– Why was it necessary to undertake the study
Outbreak of hand, foot and mouth disease caused by Coxsackie A16 virus
in a childcare centre in Croatia, February to March 2011
Ljubin-Sternak S, Slavic-Vrzic V, Vilibić-Čavlek T, Aleraj B, Gjenero-Margan I. Outbreak of hand, foot and mouth disease caused by Coxsackie A16 virus in a childcare centre in
Croatia, February to March 2011 . Euro Surveill. 2011;16(21):pii=19875. Available online: http://www.eurosurveillance.org/ViewArticle.aspx?ArticleId=19875
Ng LC. Challenges in dengue surveillance and control. Western Pacific Surveillance and Response Journal. 2011, 2(2). doi:10.5365/wpsar.2011.2.2.001
Title page
• Include a title page with your manuscript with the following:
– Title
– Authors and affiliations
– Contact information of corresponding author
– Funding for the study
– Running title
– Word counts (for abstract and for text)
– Number of figures and tables
– Conflicts of interest
http://www.icmje.org/manuscript_1prepare.html
Proof reading
• Proof read your manuscript before submission
• Fix typographical and grammatical errors
• Figures and tables
– Ensure all numbers are correct
– Ensure the table/figure number matches the in text citation
• References
– Ensure in text citation matches the bibliography
Peer review
• Peer reviewers will:
– Highlight errors
– Suggest changes to the manuscript
• E.g. additional analyses required
• E.g. additional discussion points required
• Document your responses to each reviewer comment
– Provide the detail of what changes you have made to the manuscript
– If you disagree with the reviewer and do not make a change, provide justification
Peer review: Example
Reviewer comment:
– In the discussion you mention that there is a difference in the rate of
infection in urban and rural areas. Statistical tests should be carried
out to determine if the difference is significant.
Author reply:
– Statistical tests were carried out as indicated in paragraph 4 of the
methods and table 1 of the results.
Advice for successful publication
• Read articles from your target journal
– Is your manuscript similar in format?
– Does your manuscript on a similar topic?
• Ensure your manuscript is within the scope of the journal your are
submitting to
152
1