Microbiota from Litopenaeus vannamei: digestive

tract microbial community of Pacific white shrimp

(Litopenaeus vannamei)
Abstract
Bacteria capable of producing different extracellular enzymes of potential relevance in
digestive processes were isolated from the stomach, hepatopancreas and intestine of
Pacific white shrimp Litopenaeus vannamei. A total of 64 strains with proteolytic
activity were isolated and grouped into 16 clusters based on morphological
characteristics: 4 groups were isolated from the intestine; 5 from the hepatopancreas;
and 7 from the stomach. Molecular methods (16S rRNA gene amplification and
sequencing) and phenotypic criteria (Gram stain, catalase and oxidase tests, cell and
colony morphology) were used to identify strains, which corresponded
to Pseudoalteromonas and Vibrio genera. These genera are reported to form part of the
digestive tract microbial community in shrimp. Both genera were isolated from all three
tested tissues. One member of each morphologic group was selected for analysis of the
presence of amylases, lipases/esterases and chitinases. Most of the strains had all the
tested enzymes, indicating that the L. vannamei digestive tract microbiotic flora
includes groups which have the potential to contribute to the degradation of dietary
components.
Keywords: Shrimp, Microbiota, Digestion, Enzymatic activity, 16S

Draft Genome Sequence of Bacillus

licheniformis CG-B52, a Highly Virulent Bacterium
of Pacific White Shrimp (Litopenaeus vannamei),
Isolated from a Colombian Caribbean Aquaculture
Outbreak
Abstract
Bacillus licheniformis strain CG-B52 was isolated as the etiological agent producing a
self-limited outbreak of high mortalities in commercial Litopenaeus vannamei culture
ponds on the Colombian Caribbean coast in 2005. Here, we report its draft genome and
three novel extrachromosomal elements that it harbors.

Enhancing Ecoefficiency in Shrimp Farming

through Interconnected Ponds
Abstract
The future development of shrimp farming needs to improve its ecoefficiency. The
purpose of this study was to evaluate water quality, flows, and nitrogen balance and
production parameters on a farm with interconnected pond design to improve the
efficiency of the semi-intensive culture of Litopenaeus vannamei ponds. The study was
conducted in 21 commercial culture ponds during 180 days at densities of 30–35 ind
m−2 and daily water exchange <2%. Our study provides evidence that by interconnecting
ponds nutrient recycling is favored by promoting the growth of primary producers of the
pond as chlorophyll a. Based on the mass balance and flow of nutrients this culture
system reduces the flow of solid, particulate organic matter, and nitrogen compounds to
the environment and significantly increases the efficiency of water (5 to 6.5 m3
kg−1 cycle−1), when compared with traditional culture systems. With this culture system
it is possible to recover up to 34% of the total nitrogen entering the system, with
production in excess of 4,000 kg ha−1 shrimp. We believe that the production system
with interconnected ponds is a technically feasible model to improve ecoefficiency
production of shrimp farming.

Microbiota de Litopenaeus vannamei: comunidad microbiana del tracto

digestivo de camarones blancos del Pacífico (Litopenaeus vannamei)
Resumen
Las bacterias capaces de producir diferentes enzimas extracelulares de
relevancia potencial en los procesos digestivos se aislaron del estómago, el
hepatopáncreas y el intestino del camarón blanco del Pacífico Litopenaeus
vannamei. Se aislaron un total de 64 cepas con actividad proteolítica y se
agruparon en 16 grupos según las características morfológicas: se aislaron 4
grupos del intestino; 5 del hepatopáncreas; y 7 del estómago. Se utilizaron
métodos moleculares (amplificación y secuenciación del gen 16S rRNA) y
criterios fenotípicos (tinción de Gram, pruebas de catalasa y oxidasa,
morfología de células y colonias) para identificar cepas, que correspondían a
los géneros Pseudoalteromonas y Vibrio. Se informa que estos géneros forman
parte de la comunidad microbiana del tracto digestivo en camarones. Ambos
géneros fueron aislados de los tres tejidos probados. Se seleccionó un
miembro de cada grupo morfológico para el análisis de la presencia de
amilasas, lipasas / esterasas y quitinasas. La mayoría de las cepas tenían
todas las enzimas probadas, lo que indica que la flora microbiótica del tracto
digestivo de L. vannamei incluye grupos que tienen el potencial de contribuir a
la degradación de los componentes de la dieta.
Palabras clave: camarones, microbiota, digestión, actividad enzimática, 16S

Proyecto de secuencia del genoma de Bacillus licheniformis CG-B52, una

bacteria altamente virulenta del camarón blanco del Pacífico (Litopenaeus
vannamei), aislada de un brote de acuicultura en el Caribe colombiano
Resumen
La cepa de Bacillus licheniformis CG-B52 se aisló como el agente etiológico
que produce un brote autolimitado de altas mortalidades en estanques
comerciales de cultivo de Litopenaeus vannamei en la costa caribe colombiana
en 2005. Aquí, presentamos su borrador del genoma y tres nuevos elementos
extracromosómicos que alberga .

Mejora de la ecoeficiencia en el cultivo de camarones a través de estanques

interconectados

Resumen
El desarrollo futuro de la camaronicultura necesita mejorar su ecoeficiencia. El
propósito de este estudio fue evaluar la calidad del agua, los flujos y el
equilibrio de nitrógeno y los parámetros de producción en una granja con
diseño de estanques interconectados para mejorar la eficiencia del cultivo
semiintensivo de los estanques Litopenaeus vannamei. El estudio se realizó en
21 estanques de cultivo comerciales durante 180 días a densidades de 30–35
ind m − 2 e intercambio diario de agua <2%. Nuestro estudio proporciona
evidencia de que al interconectar los estanques, el reciclaje de nutrientes se ve
favorecido al promover el crecimiento de los productores primarios del
estanque como clorofila a. Basado en el balance de masa y el flujo de
nutrientes, este sistema de cultivo reduce el flujo de sólidos, partículas
orgánicas y compuestos de nitrógeno al medio ambiente y aumenta
significativamente la eficiencia del agua (5 a 6.5 m3 kg − 1 ciclo − 1), en
comparación con sistemas culturales tradicionales. Con este sistema de cultivo
es posible recuperar hasta el 34% del nitrógeno total que ingresa al sistema,
con una producción de más de 4.000 kg ha − 1 de camarones. Creemos que el
sistema de producción con estanques interconectados es un modelo
técnicamente factible para mejorar la producción ecoeficiente de la
camaronicultura.