ASPECTOS GENERALES DE LOS AMINOCIDOS los aminocidos (AA) son cidos orgnicos con un grupo amino en posicin alfa.

. Los cuatro sustituyentes del carbono alfa en un aminocido son: el grupo carboxilo un grupo amino un tomo de hidrgeno una cadena lateral R, que es caracterstica de cada AA

 En todos los AA proteicos, excepto en la glicina (Gly), el carbono es asimtrico y por lo tanto, son pticamente activos. Existen dos enantimeros (ismeros pticos), uno de la serie D y otro de la serie L. Los AA proteicos son invariablemente de la serie L Constituye una excepcin el AA prolina, con un anillo pirrolidnico, que puede considerarse como un aminocido cuyo N- est sustitudo por su propia cadena lateral

PROPIEDADES DE LOS AMINOCIDOS Los AA son excelentes amortiguadores, gracias a la capacidad de disociacin del grupo carboxilo, del grupo amino y de otros grupos ionizables de sus cadenas laterales (carboxilo, amino, imidazol, fenol, guanidino, etc). Equilibrios de ionizacin de los grupos ionizables de un AA

Valores de pKa de los aminocidos

El comportamiento cido-base de los AA es el que va a determinar las propiedades electrolticas de las protenas, y de ellas dependen, en gran medida, sus propiedades biolgicas. En el modelo de interaccin protena-ligando, la carga elctrica de una y otro juegan un papel fundamental.

Por este motivo, la funcin de las protenas es extraordinariamente sensible al pH: A pH bajo, la mayor parte de los grupos disociables estarn protonados, y por lo tanto habr un gran nmero de cargas positivas en la protena A pH elevado, los grupos disociables no estarn protonados, con lo cual habr mayor nmero de cargas negativas Cambios en el pH se traducen en cambios en el nmero de cargas de la protena, y estos cambios pueden inhibir la interaccin de la protena con un ligando determinado. Por este motivo, muchas protenas (enzimas, sobre todo) slo pueden funcionar en un margen relativamente estrecho de pH.

CLASIFICACIN DE LOS AMINOCIDOS Aunque la mayora de los AA presentes en la Naturaleza se encuentran formando parte de las protenas, hay algunos que pueden desempear otras funciones. Hay, por tanto, dos grupos de AA: Aminocidos proticos Aminocidos no proticos Los AA proteicos se dividen, a su vez, en dos grupos: Aminocidos codificables o universales, que permanecen como tal en las protenas Aminocidos modificados o particulares, que son el resultado de diversas modificaciones qumicas posteriores a la sntesis de protenas

AMINOCIDOS PROTEICOS CODIFICABLES : Alanina (Ala, A) cistena (Cys, C) asprtico (Asp, D) glutmico (Glu, E) fenilalanina (Phe, F) glicina (Gly, G) histidina (His, H) isoleucina (Ile, I) lisina (Lys, K) leucina (Leu, L)

Son 20:

metionina (Met, M) asparragina (Asn, N) prolina (Pro, P) glutamina (Gln, Q) arginina (Arg, R) serina (Ser, S) treonina (Thr, T) valina (Val, V) triptfano (Trp, W) tirosina (Tyr, Y)

De estos 20 AA, la mitad pueden ser sintetizados por el hombre, pero el resto no, y por lo tanto deben ser suministrados en la dieta: son los AA esenciales.

Los AA proteicos se pueden clasificar en funcin de: La naturaleza y propiedades de la cadena lateral R La polaridad de la cadena lateral R

AMINOCIDOS PROTEICOS MODIFICADOS

Los AA incorporados a las protenas, pueden sufrir ciertas transformaciones que dan lugar a los AA modificados o particulares.

Modificaciones ms frecuentes: HIDROXILACIN: Ejemplos tpicos son la 4-hidroxiprolina o la 5-hidroxilisina, que se encuentran en proporcin importante en el colgeno. Estos AA se incorporan a la protena como P o como K, y son posteriormente hidroxilados. CARBOXILACIN: El E, por carboxilacin post-sinttica se convierte en cido carboxiglutmico.
4-hidroxiprolina 5-hidroxilisina g-carboxiglutmico

 ADICIN DE IODO: En la tiroglobulina (una protena del tiroides), la Y sufre diversas reacciones de iodacin y condensacin que originan AA como la monoiodotirosina, diiodotirosina, la triiodotirosina o la liotirosina. FOSFORILACIN: La actividad de muchas protenas se puede modificar mediante reacciones de fosforilacin (catalizadas por las enzimas quinasas) o desfosforilacin (catalizadas por las enzimas fosfatasas). Los residuos que se suelen fosforilar son la serina y la tirosina. GLICOSILACIN: Las glicoprotenas son protenas unidas a cadenas de oligosacrido. stas se unen mediante un enlace O-glicosdico a un residuo de serina o treonina o mediante un enlace N-glicosdico a un residuo de asparagina.

 CONDENSACIN: La cistina es el resultado de la unin de dos C por medio de un puente disulfuro (-S-S-).

AMINOCIDOS NO PROTEICOS Se conocen ms de un centenar, sobre todo en plantas superiores, aunque su funcin no siempre es conocida. Se pueden dividir en tres grupos: 1.- D-AMINOCIDOS: La D-Ala y el D-Glu forman parte del peptidoglicano de la pared celular de las bacterias. La gramicidina S es un pptido con accin antibitica que contiene D-Phe. En ciertos pptidos opioides de anfibios y reptiles tambin aparecen D-aminocidos. 2.- -AMINOCIDOS NO PROTEICOS: La L-ornitina y la L-citrulina son importantes intermediarios en el metabolismo de la eliminacin del nitrgeno y la creatina (un derivado de la G) juega un papel importante como reserva de energa metablica. Tambin pertenecen a este grupo la homoserina y la homocistena 3.- -AMINOCIDOS: En estos AA, el grupo amino sustituye al ltimo carbono (carbono
), no al carbono . La -Alanina forma parte de algunos coenzimas, y el cido aminobutrico es un importante neurotransmisor

PPTIDOS: ASPECTOS GENERALES La unin de dos o ms aminocidos (AA) mediante enlaces amida origina los pptidos. En los pptidos y en las protenas, estos enlaces amida reciben el nombre de enlaces peptdicos y son el resultado de la reaccin del grupo carboxilo de un AA con el grupo amino de otro, con eliminacin de una molcula de agua. Cuando los AA se encuentran formando parte de una cadena polipeptdica se suelen denominar residuos, para diferenciarlos de su forma libre.

Cuando el pptido est formado por menos de 15 AA se trata de un oligopptido (dipptido, tripptido, etc.) Cuando contiene entre 15 y 50 AA se trata de un polipptido y si el nmero de AA es mayor, se habla de protenas. En los seres vivos se pueden encontrar protenas formadas por ms de 1000 AA. Independientemente de la longitud de la cadena polipeptdica, siempre habr un grupo NH2 que no ha reaccionado (el extremo amino) y un grupo COOH que tampoco ha reaccionado (el extremo carboxilo).

FUNCIONES DE LOS PPTIDOS Unos pocos AA que no presentan actividad alguna en forma aislada son capaces de desencadenar respuestas biolgicas tan intensas. Los pptidos se producen generalmente mediante la hidrlisis de protenas precursoras, aunque en hongos y bacterias existen sistemas de sntesis peptdica no ribosmica, en los cuales los AA son activados a travs de una va diferente.
Entre las funciones biolgicas ms importantes que realizan los pptidos podemos destacar las siguientes: agentes vasoactivos hormonas neurotransmisores antibiticos antioxidantes

CLASIFICACIN DE LAS PROTENAS Las protenas son polmeros lineales de -aminocidos con amplia variabilidad estructural y funciones biolgicas muy diversas. La variedad de protenas es elevadsima, y para su clasificacin se suele recurrir a: Criterios fsicos Criterios qumicos Criterios estructurales Criterios funcionales los criterios son muy tiles desde el punto de vista prctico, y nos permiten definir al colgeno como una protena simple, fibrosa y oligomrica, y al citocromo c como una protena conjugada, globular y monomrica.

CRITERIO FSICO
El criterio fsico de solubilidad distingue: albminas: protenas que son solubles en agua o en disoluciones salinas diludas globulinas: requieren concentraciones salinas ms elevadas para permanecer en disolucin prolaminas: solubles en alcohol glutelinas: slo se disuelven en disoluciones cidas o bsicas escleroprotenas: son insolubles en la gran mayora de los disolventes

CRITERIO QUMICO Existen dos grandes grupos de protenas: protenas simples: formadas exclusivamente por -aminocidos, como es el caso de la ubiquitina, una proteasa intracelular formada por 53 AA. protenas conjugadas: que contienen adems de la cadena polipeptdica un componente no aminoacdico llamado grupo prosttico, que puede ser un azcar, un lpido, un cido nucleico o simplemente un in inorgnico. La protena en ausencia de su grupo prosttico no es funcional, y se llama apoprotena. La protena unida a su grupo prosttico es funcional, y se llama holoprotena (holoprotena = apoprotena + grupo prosttico). Son protenas conjugadas la hemoglobina, la mioglobina, los citocromos, etc. En el citocromo c, el grupo prosttico es el grupo hemo

CRITERIO ESTRUCTURAL (DE FORMA ) En cuanto a su forma molecular, podemos distinguir: protenas globulares: la cadena polipeptdica aparece enrollada sobre s misma dando lugar a una estructura ms o menos esfrica y compacta. protenas fibrosas: si hay una dimensin que predomina sobre las dems, se dice que la protena es fibrosa. Las protenas fibrosas, por lo general, tienen funciones estructurales CRITERIO FUNCIONAL Desde un punto de vista funcional se distinguen: protenas monomricas: constan de una sola cadena polipeptdica, como la mioglobina. protenas oligomricas: constan de varias cadenas polipeptdicas. Las distintas cadenas polipeptdicas que componen una protena oligomrica se llaman subunidades, y pueden ser iguales o distintas entre s. Un ejemplo es la hemoglobina, formada por 4 subunidades.

PROPIEDADES DE LAS PROTENAS Desde el punto de vista bioqumico, las propiedades de las protenas son: Precipitacin selectiva Capacidad amortiguadora Propiedades osmticas

PRECIPITACIN SELECTIVA DE LAS PROTENAS El agua es el disolvente biolgico por excelencia. En disolucin acuosa, los residuos hidrofbicos de las protenas se acumulan en el interior de la estructura, mientras que en la superficie aparecen diversos grupos con carga elctrica, en funcin del pH del medio En torno a los grupos cargados, los dipolos del agua se orientan conforme a la carga elctrica de cada grupo, de tal manera que la protena presenta una capa de solvatacin formada por el agua de hidratacin, que es el agua retenida por las cargas elctricas de la superficie de las protenas . Los AA polares sin carga tambin se disponen en la superficie, donde interaccionan con el agua mediante puentes de hidrgeno.

 Cualquier factor que modifique la interaccin de la protena con el disolvente disminuir su estabilidad en disolucin y provocar la precipitacin.
La desaparicin total o parcial de la envoltura acuosa, la neutralizacin de las cargas elctricas de tipo repulsivo o la ruptura de los puentes de hidrgeno facilitar la agregacin intermolecular y provocar la precipitacin.

La precipitacin suele ser consecuencia del fenmeno llamado desnaturalizacin

CAPACIDAD AMORTIGUADORA DE LAS PROTENAS Esta propiedad se debe a la existencia de: Grupos ionizables de las cadenas laterales de los aminocidos Asp, Glu, Lys, Arg, His, Tyr, Cys. Grupos COOH y NH2 terminales . Las protenas poseen un alto poder amortiguador en una amplia zona de pH. Aunque cada AA tiene unos grupos ionizables con unas constantes de ionizacin (pKa) caractersticas, el valor de dichas constantes puede verse ligeramente modificado por el entorno proteico. El grupo imidazol del AA histidina es el principal responsable del poder amortiguador de las protenas a pH fisiolgico, ya que su pKa est prximo a 7. Cuando el pH es bajo, los grupos ionizables estn protonados, y la carga neta de la protena es de signo positivo. Cuando el pH es alto, los grupos ionizables estn desprotonados, y la carga neta es de signo negativo. Entre ambas zonas, habr un pH en el cual la carga neta de la protena es nula. Es el pH isoelctrico o punto isoelctrico, y es caracterstico de cada protena.

pH bajo: carga neta positiva

pI: carga neta nula

pH alto: carga neta negativa

 A valores de pH por debajo del pH isoelctrico la carga neta de la protena es positiva, y a valores de pH por encima del pH isoelctrico, la carga neta de la protena es negativa. La mayora de las protenas intracelulares tienen carga negativa, ya que su pH isoelctrico es menor que el pH fisiolgico (que est proximo a 7). Se llaman protenas cidas a aquellas que tienen un punto isoelctrico bajo (como la pepsina), y protenas bsicas a las que tienen un punto isoelctrico alto (como las histonas).

PROPIEDADES OSMTICAS DE LAS PROTENAS Como todo soluto molecular o inico, las protenas ejercen un efecto osmtico cuando existen barreras que limitan su libre difusin, como puede ser una membrana semipermeable, que permite el paso del agua, pero no de los solutos. Si tenemos dos compartimentos acuosos separados por una membrana semipermeable y uno de ellos contiene protenas, stas tienden a captar agua del compartimento vecino. Este efecto osmtico es proporcional al nmero de partculas dispersas. La presin osmtica se calcula con la frmula de Van't Hoff: = cRT, donde (presin osmtica), c (concentracin), R (constante de gases) y T (temperatura absoluta.

En el caso de las protenas, el efecto osmtico se ve amplificado por otros dos factores. Por un lado, el agua de hidratacin que forma la envoltura acuosa de las protenas

Tambien, las protenas se comportan como polianiones, cuyas cargas estn neutralizadas por iones Na+ o K+. Las membranas biolgicas son permeables a estos iones y a sus contraiones, con lo cual su concentracin a ambos lados de la membrana se equilibra. La existencia de protenas en slo uno de los compartimentos provoca la retencin permanente de iones difusibles en ese lado de la membrana (efecto Donnan), lo que incrementa el efecto osmtico.

Efecto Donnan: Situacin inicial

Efecto Donnan: En el equilibrio

Se denomina presin coloidosmtica o presin onctica al efecto osmtico conjunto de las protenas, que es el resultado de: (1) la presin osmtica (que slo depende del nmero de partculas) (2) la presin provocada por el agua de hidratacin (3) la presin provocada por el exceso de iones debido al efecto Donnan
La mayor parte del agua en el sistema circulatorio est retenida por el efecto osmtico de las protenas del plasma. Cuando por cualquier circunstancia patolgica disminuye la concentracin de protenas en el plasma, el agua puede fluir libremente hacia los tejidos, provocando un edema.

FUNCIONES BIOLGICAS DE LAS PROTENAS As como los polisacridos se reducen a ser sustancias de reserva o molculas estructurales, las protenas asumen funciones muy variadas debido a su gran hetereogeneidad estructural. Podemos destacar las siguientes: funcin enzimtica funcin hormonal funcin de reconocimiento de seales funcin de transporte funcin estructural funcin de defensa funcin de movimiento funcin de reserva transduccin de seales funcin reguladora Muchas protenas ejercen a la vez ms de una de las funciones enumeradas: Las protenas de membrana tienen tanto funcin estructural como enzimtica; la ferritina es una protena que transporta y, a la vez, almacena el hierro; la miosina interviene en la contraccin muscular, pero tambin funciona como un enzima capaz de hidrolizar el ATP, y as se podran poner muchos ejemplos ms.

FUNCIN ENZIMTICA La gran mayora de las reacciones metablicas tienen lugar gracias a la presencia de un catalizador de naturaleza proteica especfico para cada reaccin. Estos biocatalizadores reciben el nombre de enzimas. La gran mayora de las protenas son enzimas. FUNCIN HORMONAL Las hormonas son sustancias producidas por una clula y que una vez secretadas ejercen su accin sobre otras clulas dotadas de un receptor adecuado. Algunas hormonas son de naturaleza proteica, como la insulina y el glucagn (que regulan los niveles de glucosa en sangre) o las hormonas segregadas por la hipfisis como la hormona del crecimiento, o la calcitonina (que regula el metabolismo del calcio). RECONOCIMIENTO DE SEALES QUMICAS La superficie celular alberga un gran nmero de protenas encargadas del reconocimiento de seales qumicas de muy diverso tipo. Existen receptores hormonales, de neurotransmisores, de anticuerpos, de virus, de bacterias, etc. En muchos casos, los ligandos que reconoce el receptor ( hormonas y neurotransmisores) son, a su vez, de naturaleza proteica

FUNCIN DE TRANSPORTE En los seres vivos son esenciales los fenmenos de transporte, bien para llevar una molcula hidrofbica a travs de un medio acuoso (transporte de oxgeno o lpidos a travs de la sangre) o bien para transportar molculas polares a travs de barreras hidrofbicas (transporte a travs de la membrana plasmtica). Los transportadores biolgicos son siempre protenas.

FUNCIN ESTRUCTURAL Las clulas poseen un citoesqueleto de naturaleza proteica que constituye un armazn alrededor del cual se organizan todos sus componentes, y que dirige fenmenos tan importantes como el transporte intracelular o la divisin celular. En los tejidos de sostn (conjuntivo, seo, cartilaginoso) de los vertebrados, las fibras de colgeno forman parte importante de la matriz extracelular y son las encargadas de conferir resistencia mecnica tanto a la traccin como a la compresin.
FUNCIN DE DEFENSA La propiedad fundamental de los mecanismos de defensa es la de discriminar lo propio de lo extrao. En bacterias, una serie de protenas llamadas endonucleasas de restriccin se encargan de identificar y destruir aquellas molculas de DNA que no identifica como propias.

FUNCIN DE MOVIMIENTO Todas las funciones de motilidad de los seres vivos estn relacionadas con las protenas. As, la contraccin del msculo resulta de la interaccin entre dos protenas, la actina y la miosina El movimiento de la clula mediante cilios y flagelos est relacionado con las protenas que forman los microtbulos. FUNCIN DE RESERVA La ovoalbmina de la clara de huevo, la lactoalbmina de la leche, la gliadina del grano de trigo y la hordena de la cebada, constituyen una reserva de aminocidos para el futuro desarrollo del embrin.

TRANSDUCCIN DE SEALES Los fenmenos de transduccin (cambio en la naturaleza fsico-qumica de seales) estn mediados por protenas. As, durante el proceso de la visin, la rodopsina de la retina convierte (o mejor dicho, transduce) un fotn luminoso (una seal fsica) en un impulso nervioso (una seal elctrica), y un receptor hormonal convierte una seal qumica (una hormona) en una serie de modificaciones en el estado funcional de la clula FUNCIN REGULADORA Muchas protenas se unen al DNA y de esta forma controlan la transcripcin gnica. De esta forma el organismo se asegura de que la clula, en todo momento, tenga todas las protenas necesarias para desempear normalmente sus funciones. Las distintas fases del ciclo celular son el resultado de un complejo mecanismo de regulacin desempeado por protenas como la ciclina.

ESTRUCTURA DE LAS PROTENAS A primera vista podra pensarse en las protenas como polmeros lineales de AA unidos entre s por medio de enlaces peptdicos. Sin embargo, la secuencia lineal de AA puede adoptar mltiples conformaciones en el espacio. La estructura primaria viene determinada por la secuencia de AA en la cadena proteica, es decir, el nmero de AA presentes y el orden en que estn enlazados. La conformacin espacial de una protena se analiza en trminos de estructura secundaria y estructura terciaria. La asociacin de varias cadenas polipeptdicas origina un nivel superior de organizacin, la llamada estructura cuaternaria. Por ltimo, la asociacin de protenas con otros tipos de biomolculas para formar asociaciones supramoleculares con carcter permanente da lugar a la estructura quinaria. Por tanto, podemos distinguir cinco niveles de estructuracin en las protenas

Los enlaces que determinan la estructura primaria son covalentes (enlace amida o enlace peptdico), mientras que la mayora de los enlaces que determinan la conformacin (estructuras secundaria y terciaria) y la asociacin (estructura cuaternaria y quinaria) son de tipo no covalente.

ESTRUCTURA PRIMARIA DE LAS PROTENAS La estructura primaria viene determinada por la secuencia de AA en la cadena proteica, es decir, el nmero de AA presentes y el orden en que estn enlazados . Las posibilidades de estructuracin a nivel primario son prcticamente ilimitadas. Como en casi todas las protenas existen 20 AA diferentes, el nmero de estructuras posibles viene dado por las variaciones con repeticin de 20 elementos tomados de n en n, siendo n el nmero de AA que componen la molcula proteica.
El nmero de AA que forman una protena oscila entre 80 y 300. Los enlaces que participan son covalentes: son los enlaces peptdicos. El enlace peptdico es un enlace amida que se forma entre el grupo carboxilo de una AA con el grupo amino de otro, con eliminacin de una molcula de agua. Siempre hay un extremo amino terminal y un extremo carboxilo terminal que permanecen intactos. Por convencin, la secuencia de una protena se lee siempre a partir de su extremo amino Por los enlaces peptdicos entre los distintos AA de la protena se origina una cadena principal o "esqueleto" a partir del cual emergen las cadenas laterales de los AA . Los tomos que componen la cadena principal de la protena son el N del grupo amino (condensado con el AA precedente), el C (a partir del cual emerge la cadena lateral) y el C del grupo carboxilo (que se condensa con el AA siguiente). Por lo tanto, la unidad repetitiva bsica que aparece en la cadena principal de una protena es: (-NH-C -CO-)

ESTRUCTURA SECUNDARIA DE LAS PROTENAS La estructura secundaria es el plegamiento que la cadena polipeptdica adopta gracias a la formacin de puentes de hidrgeno entre los tomos que forman el enlace peptdico. Los puentes de hidrgeno se establecen entre los grupos -CO- y -NH- del enlace peptdico (el primero como aceptor de H, y el segundo como donador de H). De esta forma, la cadena polipeptdica es capaz de adoptar conformaciones de menor energa libre, y por tanto, ms estables
Se pueden distinguir varios tipos de conformaciones que determinan la estructura secundaria de una protena: conformacin al azar hlice alfa hoja beta giros beta conformacin del colgeno estructuras supersecundarias

CONFORMACIN AL AZAR En algunas protenas, o en ciertas regiones de la misma, no existen interacciones de suficiente consideracin como para que se pueda distinguir un nivel de organizacin superior a la estructura primaria. En estos casos se habla de conformacin al azar. HLICE alfa Cuando la cadena principal o esqueleto de un polipptido se pliega en el espacio en forma de helicoide dextrgiro se adopta una conformacin denominada hlice . Esta estructura es peridica y en ella cada enlace peptdico puede establecer dos puentes de hidrgeno. Un puente de hidrgeno se forma entre el grupo -NH- del enlace peptdico del AA en posicin n y el grupo -CO- del enlace peptdico del AA situado en posicin n-4. El otro puente de hidrgeno se forma entre el grupo -CO- del enlace peptdico del AA en posicin n y el grupo -NH- del enlace peptdico del AA situado en posicin n+4.

 Las cadenas laterales de los AA se sitan en la parte externa del helicoide, lo que evita problemas de impedimentos estricos. Los AA alanina, glutamina, leucina y metionina se encuentran frecuentemente formando parte de hlices , mientras que la prolina, glicina, tirosina y serina no. De hecho, la prolina se considera un terminador de la hlice ya que su C no tiene libertad de giro, y al estar integrado en un anillo, interfiere en la formacin de puentes de hidrgeno. Los AA muy polares (Lys, Glu) tambin desestabilizan la hlice porque los enlaces de hidrgeno pierden importancia frente a las interacciones electrostticas de atraccin o repulsin. Por este motivo, la estructura en hlice es la que predomina a valores de pH en los que los grupos ionizables no estn cargados. En caso contrario, adoptan la conformacin al azar.

HOJA beta Cuando la cadena principal de un polipptido se estira al mximo que permiten sus enlaces covalentes adopten una configuracin espacial denominada estructura , que suele representarse como una flecha. En esta estructura las cadenas laterales de los aminocidos se sitan de forma alternante a la derecha y a la izquierda del esqueleto de la cadena polipeptdica. Las estructuras de distintas cadenas polipeptdicas o bien las estructuras de distintas zonas de una misma cadena polipeptdica pueden interaccionar entre s mediante puentes de hidrgeno, dando lugar a estructuras laminares llamadas por su forma hojas plegadas u hojas .

Cuando las estructuras tienen el mismo sentido NC, la hoja resultante es paralela y si las estructuras tienen sentidos opuestos, la hoja plegada resultante es antiparalela. Esta conformacin es tpica de protenas fibrosas como la fibrona de la seda, donde numerosas estructuras antiparalelas dan lugar a varias hojas , pero tambin aparece en protenas globulares como las inmunoglobulinas

GIROS beta Secuencias de la cadena polipeptdica con estructura o a menudo estn conectadas entre s por medio de los llamados giros . Son secuencias cortas, con una conformacin caracterstica que impone un brusco giro de 180o a la cadena principal de un polipptido. AA como Asn, Gly y Pro (que se acomodan mal en estructuras de tipo o ) aparecen con frecuencia en este tipo de estructura. La conformacin de los giros est estabilizada generalmente por medio de un puente de hidrgeno entre los residuos 1 y 4 del giro .

CONFORMACIN DEL COLGENO El colgeno es una importante protena fibrosa, con funcin estructural. Presenta una secuencia tpica compuesta por la repeticin peridica de grupos de tres AA. El primer AA de cada grupo es Gly, y los otros dos son Pro (o hidroxiprolina) y un AA cualquiera: -(G-P-X)-. La frecuencia peridica de la Prolina condiciona el enrollamiento peculiar del colgeno en forma de hlice levgira. La glicina, sin cadena lateral, permite la aproximacin entre distintas hlices, de forma que tres hlices levgiras se asocian para formar un helicoide dextrgiro.

ESTRUCTURAS SUPERSECUNDARIAS En protenas con estructura terciaria globular es frecuente encontrar combinaciones de estructuras al azar, y , con una disposicin caracterstica que se repite en distintos tipos de protenas. Son los llamados motivos estructurales o estructuras supersecundarias.

ESTRUCTURA TERCIARIA DE LAS PROTENAS Es la disposicin tridimensional de todos los tomos que componen la protena.
Es responsable directa de sus propiedades biolgicas, ya que la disposicin espacial de los distintos grupos funcionales determina su interaccin con los diversos ligandos. La estructura terciaria est determinada por la secuencia de AA (estructura primaria). Las protenas de una sola cadena polipeptdica (carecen de estructura cuaternaria), la estructura terciaria es la mxima informacin estructural que se puede obtener. La estructura terciaria es una disposicin precisa y nica en el espacio, y surge a medida que se sintetiza la protena.

Hay dos tipos de estructura terciaria:

Protenas con estructura terciaria de tipo fibroso en las que una de las dimensiones es mucho mayor que las otras dos. Son ejemplos el colgeno, la queratina del cabello o la fibrona de la seda, En este caso, los elementos de estructura secundaria (hlices u hojas ) pueden mantener su ordenamiento sin recurrir a grandes modificaciones, tan slo introduciendo ligeras torsiones longitudinales, como en las hebras de una cuerda.

Protenas con estructura terciaria de tipo globular, ms frecuentes, en las que no existe una dimensin que predomine sobre las dems, y su forma es aproximadamente esfrica. En este tipo de estructuras se suceden regiones con estructuras al azar, hlice , hoja , acodamientos y estructuras supersecundarias. La figura inferior de la derecha corresponde a la mioglobina

Las fuerzas que estabilizan la estructura terciaria de una protena se establecen entre las distintas cadenas laterales de los AA que la componen. Los enlaces propios de la estructura terciaria pueden ser de dos tipos: covalentes y no covalentes Los enlaces covalentes pueden deberse a (1) la formacin de un puente disulfuro entre dos cadenas laterales de Cys, o a (2) la formacin de un enlace amida (-CO-NH-) entre las cadenas laterales de la Lys y un AA dicarboxlico (Glu o Asp). Los enlaces no covalentes pueden ser de cuatro tipos: (1) fuerzas electrostticas entre cadenas laterales ionizadas, con cargas de signo opuesto, (2) puentes de hidrgeno, entre las cadenas laterales de AA polares (3) interacciones hidrofbicas entre cadenas laterales apolares y (4) fuerzas de polaridad debidas a interacciones dipolo-dipolo Como resultado de estas interacciones, en las protenas con estructura terciaria globular: las cadenas laterales con carcter apolar se orientan hacia el interior de la molcula evitando las interacciones con el disolvente, y forman un ncleo compacto con carcter hidrofbico.

 las cadenas laterales de los aminocidos polares se localizan en la superficie de la molcula, interaccionando con el agua y permitiendo que la protena permanezca en disolucin No todas estas interacciones contribuyen por igual al mantenimiento de la estructura terciaria. Obviamente, el enlace que aporta ms estabilidad es el de tipo covalente, y entre los no covalentes, las interacciones ms importantes son las de tipo hidrofbico, ya que exigen una gran proximidad entre los grupo apolares de los AA. Cuando desaparecen estas interacciones la estructura terciaria de una protena se desestabiliza y pierde su estructura tridimensional caracterstica de manera que pierde su funcin y, a menudo precipita. Este fenmeno se conoce con el nombre de desnaturalizacin.

 Existen regiones diferenciadas dentro de la estructura terciaria de las protenas que actan como unidades autnomas de plegamiento y/o desnaturalizacin de las protenas. Estas regiones constituyen un nivel estructural intermedio entre las estructuras secundaria y terciaria reciben el nombre de dominios. Los dominios se pliegan por separado a medida que se sintetiza la cadena polipeptdica. Es la asociacin de los distintos dominios la que origina la estructura terciaria. La prdida total o parcial de los niveles de estructuracin superiores al primario recibe el nombre de desnaturalizacin, que puede ser reversible o irreversible

ESTRUCTURA CUATERNARIA DE LAS PROTENAS

Cuando una protena consta de ms de una cadena polipeptdica, es decir, cuando se trata de una protena oligomrica, decimos que tiene estructura cuaternaria. La estructura cuaternaria debe considerar: (1) el nmero y la naturaleza de las distintas subunidades o monmeros que integran el oligmero y (2) la forma en que se asocian en el espacio para dar lugar al oligmero. Ej. hemoglobina. En protenas con estructura terciaria de tipo fibroso, la estructura cuaternaria resulta de la asociacin de varias hebras para formar una fibra o soga. La miosina o la tropomiosina constan de dos hebras con estructura de hlice enrolladas en una fibra levgira. La -queratina del cabello y el fibringeno de la sangre presentan tres hebras en cada fibra levgira. El colgeno consta de tres hebras helicoidales levgiras que forman una fibra dextrgira. La fibrona de la seda presenta varias hebras con estructura de hoja orientadas de forma antiparalela

Cuando varias protenas con estructura terciaria de tipo globular se asocian para formar una estructura de tipo cuaternario, los monmeros pueden ser:

Exactamente iguales, como en el caso de la fosfoglucoisomerasa o de la hexoquinasa.

Muy parecidos, como en el caso de la lactato deshidrogenasa. Con estructura distinta pero con una misma funcin, como en el caso de la hemoglobina. Estructural y funcionalmente distintos, que una vez asociados forman una unidad funcional,como en el caso de la aspartato transcarbamilasa, un enzima alostrico con seis subunidades con actividad cataltica y seis con actividad reguladora

 La estructura cuaternaria modula la actividad biolgica de la protena y la separacin de las subunidades a menudo conduce a la prdida de funcionalidad. Las fuerzas que mantienen unidas las distintas cadenas polipeptdicas son, en lneas generales, las mismas que estabilizan la estructura terciaria. Las ms abundantes son las interacciones dbiles (hidrofbicas, polares, electrostticas y puentes de hidrgeno) en algunos casos, como en las inmunoglobulinas, la estructura cuaternaria se mantiene mediante puentes disulfuro. El ensamblaje de los monmeros se realiza de forma espontnea, lo que indica que el oligmero presenta un mnimo de energa libre con respecto a los monmeros

ASOCIACIONES SUPRAMOLECULARES En muchos casos, las protenas se agrupan bien entre s, bien con otros grupos de biomolculas para formar estructuras supramoleculares de orden superior y que tienen un carcter permanente. Este nivel de asociacin recibe el nombre de estructura quinaria: Asociaciones entre protenas Asociaciones entre protenas y otras biomolculas ASOCIACIONES ENTRE PROTENAS Las protenas y -tubulina forman unos dmeros que se ensamblan formando filamentos huecos enormemente largos llamados microtbulos, cuya funcin es fundamentalmente estructural, ya que forman parte del citoesqueleto de las clulas (que contribuyen a dar forma a las clulas), del centriolo (que participa en la mitosis), y de los cilios y flagelos (que participan en la motilidad celular). La fibrina es otra protena que forma una asociacin supramolecular. Los monmeros de fibrina se unen mediante enlaces covalentes para formar la malla tridimensional caracterstica del trombo o cogulo sanguneo

ASOCIACIONES ENTRE PROTENAS Y OTRAS BIOMOLCULAS Las protenas se pueden asociar: Con azcares Con lpidos Con cidos nuclicos ASOCIACIONES ENTRE PROTENAS Y AZCARES Cuando las protenas se asocian con azcares pueden originar asociaciones supramoleculares como los proteoglicanos o los peptidoglicanos ASOCIACIONES ENTRE PROTENAS Y LPIDOS Cuando las protenas se asocian con lpidos pueden originar asociaciones supramoleculares como las lipoprotenas del plasma sanguneo y las membranas biolgicas ASOCIACIONES ENTRE PROTENAS Y CIDOS NUCLEICOS Cuando las protenas se asocian con cidos nucleicos pueden originar asociaciones supramoleculares como los ribosomas, nucleosomas o virus

DESNATURALIZACIN DE LAS PROTENAS Cuando la protena no ha sufrido ningn cambio en su interaccin con el disolvente, se dice que presenta una estructura nativa. Se llama desnaturalizacin de las protenas a la prdida de las estructuras de orden superior (secundaria, terciaria y cuaternaria), quedando la cadena polipeptdica reducida a un polmero estadstico sin ninguna estructura tridimensional fija.
Estado nativo Estado desnaturalizado

 Cualquier factor que modifique la interaccin de la protena con el disolvente disminuir su estabilidad en disolucin y provocar la precipitacin.

As, la desaparicin total o parcial de la envoltura acuosa, la neutralizacin de las cargas elctricas de tipo repulsivo o la ruptura de los puentes de hidrgeno facilitar la agregacin intermolecular y provocar la precipitacin.
La precipitacin suele ser consecuencia del fenmeno llamado desnaturalizacin y se dice entonces que la protena se encuentra desnaturalizada En una protena cualquiera, la estructura nativa y la desnaturalizada tan slo tienen en comn la estructura primaria, es decir, la secuencia de AA que la componen. Los dems niveles de organizacin estructural desaparecen en la estructura desnaturalizada.

La desnaturalizacin provoca diversos efectos en la protena:

prdida de las propiedades biolgicas

cambios en las propiedades hidrodinmicas de la protena: aumenta la viscosidad y disminuye el coeficiente de difusin una drstica disminucin de su solubilidad, ya que los residuos hidrofbicos del interior aparecen en la superficie

Una protena desnaturalizada cuenta nicamente con su estructura primaria. Por este motivo, en muchos casos, la desnaturalizacin es reversible ya que es la estructura primaria la que contiene la informacin necesaria y suficiente para adoptar niveles superiores de estructuracin.
El proceso mediante el cual la protena desnaturalizada recupera su estructura nativa se llama renaturalizacin. Esta propiedad es de gran utilidad durante los procesos de aislamiento y purificacin de protenas, ya que no todas la protenas reaccionan de igual forma ante un cambio en el medio donde se encuentra disuelta. En algunos casos, la desnaturalizacin conduce a la prdida total de la solubilidad, con lo que la protena precipita. La formacin de agregados fuertemente hidrofbicos impide su renaturalizacin, y hacen que el proceso sea irreversible

EFECTO DE LA POLARIDAD DEL DISOLVENTE SOBRE LA ESTRUCTURA DE LAS PROTENAS La polaridad del disolvente disminuye cuando se le aaden sustancias menos polares que el agua como el etanol o la acetona. Con ello disminuye el grado de hidratacin de los grupos inicos superficiales de la molcula proteica, provocando la agregacin y precipitacin.

Los disolventes orgnicos interaccionan con el interior hidrofbico de las protenas y desorganizan la estructura terciaria, provocando su desnaturalizacin y precipitacin. La accin de los detergentes es similar a la de los disolventes orgnicos.

EFECTO DE LA FUERZA INICA SOBRE LA ESTRUCTURA DE LAS PROTENAS Un aumento de la fuerza inica del medio (por adicin de sulfato amnico, urea o hidrocloruro de guanidinio, por ejemplo) tambin provoca una disminucin en el grado de hidratacin de los grupos inicos superficiales de la protena, ya que estos solutos (1) compiten por el agua y (2) rompen los puentes de hidrgeno o las interacciones electrostticas, de forma que las molculas proteicas se agregan y precipitan. En muchos casos, la precipitacin provocada por el aumento de la fuerza inica es reversible. Mediante una simple dilisis se puede eliminar el exceso de soluto y recuperar tanto la estructura como la funcin original. A veces es una disminucin en la fuerza inica la que provoca la precipitacin. As, las protenas que se disuelven en medios salinos pueden desnaturalizarse al dializarlas frente a agua destilada, y se renaturalizan cuando se restaura la fuerza inica original.

EFECTO DEL pH SOBRE LA ESTRUCTURA DE LAS PROTENAS Los iones H+ y OH- del agua adems de afectar a la envoltura acuosa de las protenas tambin afectan a la carga elctrica de los grupos cidos y bsicos de las cadenas laterales de los aminocidos.

Esta alteracin de la carga superficial de las protenas elimina las interacciones electrostticas que estabilizan la estructura terciaria y a menudo provoca su precipitacin.
La solubilidad de una protena es mnima en su punto isoelctrico, ya que su carga neta es cero y desaparece cualquier fuerza de repulsin electrosttica que pudiera dificultar la formacin de agregados.

EFECTO DE LA TEMPERATURA SOBRE LA ESTRUCTURA DE LAS PROTENAS

Cuando la temperatura es elevada aumenta la energa cintica de las molculas con lo que se desorganiza la envoltura acuosa de las protenas, y se desnaturalizan.
Un aumento de la temperatura destruye las interacciones dbiles y desorganiza la estructura de la protena, de forma que el interior hidrofbico interacciona con el medio acuoso y se produce la agregacin y precipitacin de la protena desnaturalizada