Aprendiendo el ciclo de la urea en 10 minutos

Este tutorial te mostrar el ciclo de la urea. Quiz el ciclo ms importante para el metabolismo del nitrgeno y lo puedes lograr en 10 min. Sigue las instrucciones y convncete con el examen al final de la presentacin . Otro punto importante de este tutorial es que aprendindote las estructuras puedes aprender ms fcilmente las rutas metablicas.

Como en la mayora de las rutas metablicas el ciclo de la urea puede ser mejor comprendido si comenzamos al revs. Comencemos escribiendo el ltimo compuesto del ciclo la (click 1). Conforme estudias la estructura de la arginina trata de imaginarte todos los intermediarios en el ciclo para poder construir una molcula. A lo mejor con un poco de color lo puedas ver. La arginina es la fuente inmediata de urea. Click 1 para que veas a la urea. Ahora, puedes ver la urea en la arginina (click 1). El oxgeno es obtenido del agua cuando otra molcula de urea es hidrolizada por la enzima arginasa.

O C

COO H3N-C-H
+

Ornitina
Despus de que la urea es eliminada por hidrlisis, lo que queda es la ornitina (click 1). La Ornitina reacciona con el carbamoil-PO4 para formar citrulina (click 1). Ya que conoces como los tres compuestos caben en la molcula de arginina. La vamos a volver a armar . (click 1 para continuar).

H2N

NH2

CH2 CH2 CH2

+

Urea

NH NH2

Citrulina

O HN=C

El armado de la Arginina comienza con la ornitina (click 1). Primero debes de hacer carbamoil-PO4 que se condensa con la ornitina (click 1). Como puedes ver el carbamoil-PO4 se forma de NH4+ y CO2 usando 2ATPs como fuente de energa y la enzima carbamoil-PO4 sintetasa I . NH4+ + CO2 + 2ATP

O C H2N
+ 2ADP + Pi

OPO3=
+

COO-

El Carbamoil-PO4 reacciona con la ornitina para formar citrulina (click 1). Se libera fosfato en esta reaccin (click 1). Una vez que la citrulina se ha formado, lo nico que tienes que hacer para formar arginina es cambiar el oxgeno de la citrulina con un grupo nitro (click 1).

COO+

H3N-C-H CH2 CH2 CH2 NH O=C NH2

H3N-C-H CH2 CH2 CH2 + NH

3

+ Pi

Ornitina

Citrulina

En el segundo paso de la ruta el oxgeno de la citrulina es cambiadopor un grupo NH3 del aspartato. (click 1). Se debe de formar un complejo para que el cambio sea suave (click 1). Para formar el complejo se requiere de ATP, pero no hay transferencia de ningn grupo fosfato (click 1). +

COO
+

COO

H3N-C-H CH2 CH2 CH2

COO
ATP AMP + PPi

H3N-C-H CH2 CH2

H3N-C-H

CH2 COO

COO CH2 H-C-N=C

CH2

NH
O=C NH2

NH
NH2

COO

Ahora puedes ver que la arginina est en el producto. La molcula formada se llama argininosuccinato. Pero dnde est el succinato? Click 1 para ver.

Ya hemos hecho urea pero todava queda un poco ms de trabajo. Las rutas metablicas son cclicas y por lo tanto requerimos regresar al punto de partida. Cuando cortamos el succinato del argininosuccinato, un par de electrones se fueron con el grupo NH3 y nos quedamos con un succinato oxidado, mejor conocido como fumarato (click 1). Suena familiar? Debera , porque es parte del ciclo de Krebs y estamos en la mitocondria. Nuestro objetivo es convertir el fumarato en aspartato (click 1). Para lograrlo debemos hacer oxalacetato (click 1). Para hacer oxalacetato necesitamos L-malato (click 1). Listo! Ahora lo nico que necesitamos es que las enzimas y cofactores conecten todos los intermediarios.

COO

COO

COO C=O CH2

HC CH

H2O

HO-C-H CH2

NAD+ NADH

Glutamato -Kg

COO

H3N-C-H CH2 COO Aspartato

COO
Fumarato

COO L-Malato

COO
Oxaloacetato

Revisa tu reloj! Haz aprendido el ciclo de la urea en menos de 10 minutos. Haz Click 1 y ve que tal te va en un pequeo examen.

Revisa lo que haz aprendido. Da clik en la respuesta una vez que hayas contestad 1. Nombra 5 -amino acidos requeridos en el ciclo de la urea Existen 3 tradicionales: arginina, aspartato y glutamato y otros 2 no tradicionales: ornitina y citrulina. Siendo los tradicionales aquellos que estn en las protenas. 2. Cul es la funcin del glutamato en el ciclo? El Glutamato es necesario para regenerar aspartato de oxalacetato. 3. Cuntos ATPs son necesarios para hacer una molcula de urea? Se requieren tres. Dos para hecer carbamoil-PO4 y uno para aportar energa para la condensacin del aspartato con la citrulina.

4. Porqu el ciclo de la urea se conoce como un biciclo?

Porque ocurren dos ciclos. Uno convierte la ornitina en arginina y regresa de arginina a ornitina. Y el segundo convierte el fumarato a partir de argininosuccinato y lo regresa a aspartato.