Organizao e propriedades

do material gentico

Dogma Central

DNA: modelo para a transcrio,

RNAm liberado, DNA volta
sua conformao original.

RNAm: molde para a traduo,

auxiliado pelos RNAt e RNAr.

Quantidade de RNAm produzida

controlada por fatores
regulatrios que interagem com
o DNA.

cidos Nuclicos

Papel fundamental no armazenamento e transmisso

da informao gentica.

DNA e RNA.

DNA

Composto por 2 cadeias de nucleotdeos.

Esqueleto acar-fosfato: desoxirribose.

Estrutura primria de todas as protenas codificada

pelo alfabeto de 4 letras: A, C, G e T.

Estrutura Primria do DNA

cido desoxirribonuclico: polmero composto por

desoxirribonucleotdeos
Acar: desoxirribose
Base nitrogenada
Purina: adenina e guanina
Pirimidina: citosina e timina
Grupamento Fosfato

Estrutura Primria do DNA

Fosfato

Estrutura Primria do DNA

Ligao do
Fosfato

C5
Ligao da Base
Nitrogenada
C4

C1
C3

C2

Estrutura Primria do DNA

Ligao fosfodister

Grupos fosfato ligam a unidade de desoxirribose por meio da substituio do

grupo OH, no carbono 3 ou 5 da mesma.
NUCLEOTDEO: BASE + ACAR + FOSFATO.

Estrutura Primria do DNA

Estrutura Primria do DNA

Todos os nucleotdeos tm a
mesma orientao relativa =
direo.

Extremidade 5 (5 linha) = C5 =
grupo fosfato.

Extremidade 3 = C3 = grupo
OH.

Conveno: representao de
uma seqncia de DNA:
5 ACGTACGT 3

Dupla Hlice do DNA

1953: Watson e Crick, modelo de estrutura 3D.

DNA uma dupla hlice, a qual gira ao redor de um

eixo central.

Desoxirriboses: posio externa em relao s bases

nitrogenadas (formando um corrimo da escada
circular), expostas ao meio aquoso.

Dupla Hlice do DNA

Ligaes fosfodister nas duas

fitas: direes opostas
Direo 5 3
Direo 3 5

C5

C3 C2

C1

C4

C4

C1

C3 C2

C5

ANTIPARALELAS

Dupla Hlice do DNA

Anis aromticos das bases

nitrogenadas:
Hidrofbicos permanecem
orientados para o interior da
hlice.

Dupla Hlice do DNA

Bases Nitrogenadas:
Presena de grupos
ceto (C=O) e amino
(NH2), permitindo a
formao de pontes
de hidrognio entre as
bases.

Dupla Hlice do DNA

Dupla Hlice do DNA

Dupla Hlice do DNA

Pares AT e CG tm o mesmo tamanho e dimenses

semelhantes ocupam o mesmo espao e, portanto,
no existe restrio quanto seqncia de
nucleotdeos ao longo do DNA.

Significado fisiolgico:
Cadeias so complementares.
Garantia de replicao precisa das cadeias,
assegurando a transmisso da informao.

Dupla Hlice do DNA

As ligaes glicosdicas (ligao entre as

desoxirriboses e as bases nitrogenadas) no esto
diretamente opostas na dupla hlice:

Cavidades desiguais na estrutura da hlice:

Cavidade maior
Cavidade menor

Dupla Hlice do DNA

Cavidade maior: as
bases esto mais
expostas ao meio,
permitindo, por
exemplo, que molculas
que interagem com
seqncias especficas
de base, reconheam o
alvo sem romper a
estrutura da dupla
hlice.

Dupla Hlice do DNA

Vrias foras atuam em conjunto para estabilizar a estrutura de

dupla hlice do DNA.

Manuteno da integridade permitindo flexibilidade

conformacional.

Estabilizao do pareamento de bases: anis de purina e

pirimidina so forados para o interior da dupla hlice. Este
empilhamento permite o estabelecimento de outras ligaes
que, embora mais fracas, so tambm aditivas.

A cadeia acar-fosfato carregada negativamente e interage

com ctions em soluo, neutralizando a repulso entre as
mesmas.

Desnaturao e Renaturao do
DNA

Fenmenos fundamentais para os processos de

replicao, transcrio e recombinao.

Desnaturao: rompimento das pontes de

hidrognio, entre as cadeias complementares, as
fitas so separadas.

Renaturao: processo inverso.

Ambos podem ser desencadeados in vitro.

Desnaturao e Renaturao do
DNA

Desnaturao:
Aumento da temperatura
Presena de cidos ou alclis
Agentes desnaturantes: formamida e DMSO.

Ocorre a formao de grupos carregados no

interior da dupla-hlice e rompimento das pontes
de hidrognio entre as bases complementares.

Desnaturao e Renaturao do
DNA

Desnaturao:
Pode ser acompanhada no espectrofotmetro
medindo-se a absorbncia da luz UV.

Bases nitrogenadas: responsveis pela maior parte

da absoro. A absoro mxima a 260nm,
quando as duas fitas esto completamente
separadas.
Fitas

completamente separadas: absoro

maior do que quando a dupla hlice est intacta.

Desnaturao e Renaturao do
DNA

A temperatura na qual
metade das bases, em
uma dupla fita, esto
desnaturadas
(separadas) a
chamada Tm
(temperatura de
melting).

Desnaturao e Renaturao do
DNA

O pareamento entre as
bases no apresenta a
mesma estabilidade:
GC = 3 pontes de H
AT = 2 pontes de H
Rompimento de GC
temperatura mais alta, pH
mais elevado ou
concentraes de agentes
desnaturantes maiores.

Tipos de DNA

DNA: pode assumir diferentes conformaes,

dependendo da sua composio de bases e do meio
onde se encontra.

Condies fisioolgicas: tipo B, tipo A e tipo Z.

As regras de pareamento permanecem e as

alteraes de conformao no alteram a informao
contida na seqncia de bases.

Entretanto, o que muda a interao DNA-protenas.

DNA tipo B

Forma de dupla hlice

clssica descrita por
Watson e Crick.

a forma mais
abundante encontrada
na clulas, na presena
de elevada umidade e
em solues de baixa
fora inica.

DNA tipo B

A dupla hlice gira para

a direita, a distncia
entre um nucleotdeo e
outro de 0,36nm, a
cada 10.4 pares de
base, a dupla hlice
realiza uma volta
completa (3,6nm).

DNA tipo A

Desidratao com
etanol : a molcula
encurta-se e engrossa,
originando o DNA tipo A.

A cavidade menor tornase mais larga e rasa e a

cavidade maior torna-se
menor e mais profunda.

Hbridos de DNA-RNA e
RNA-RNA.

DNA tipo Z

Pequenas molculas de DNA

compostas de Gs e Cs (purinas e
pirimidinas) adotam uma
configurao na qual a dupla
hlice gira para a esquerda.

As bases parecem zig-zaguear

Pode estar presente nas clulas

mas sua funo desconhecida.

Formas do DNA

Dupla hlice
Forma circular: extremidades ligadas formando
uma molcula circular.
E. coli o cromossomo circular e ainda podem
existir molculas de DNA extra-cromossomais,
os plasmdeos.
Mitocndrias, cloroplastos e alguns vrus.

Formas do DNA

Conformao 3D: supertorcida, superenrolada ou superhlice.

Enrolamento da dupla hlice sobre mesma, os mtodos

comuns de isolamento de DNA geralmente alteram sua
estrutura tridimensional e, inicialmente, acreditava-se que o
superenrolamento s acontecia em pequenas molculas.

Grau de superenrolamento: caracterstica importante em

processos como replicao, recombinao e expresso
gnica.

Formas do DNA

Microscopia eletrnica
do DNA viral de SV40:
Quando o DNA circular
do vrus isolado e
separado das protenas
associadas, o mesmo
assume a configurao
supertorcida.

Formas do DNA

Se a forma supertorcida clivada em

uma fita apenas (nick), as fitas podem
se reorientar, levando perda da
supertoro.

A topoisomerase 1 catalisa esta reao

e repara as pontas clivadas.

Todos as supertores no DNA isolado

de SV40 podem ser removidas desta
maneira.

Estrutura do RNA
cido

ribonuclico: polmero composto por

ribonucleotdeos
Acar:

ribose
Base nitrogenada
Purina: adenina e guanina
Pirimidina: citosina e uracila
Grupamento Fosfato

Estrutura do RNA
Ligao do
Fosfato

C5
Ligao da Base
Nitrogenada
C4

C1
C3

C2

Estrutura do RNA

Estrutura do RNA

Estrutura do RNA

Apresentaes

A maioria dos RNAs celulares so simples fita

(hlice hbrida: DNA-RNA e RNA-RNA).

O pareamento C-G e A-U pode, dentro da mesma

fita, formando estruturas secundrias que so
importantes na funo dos RNAs e no
reconhecimento de complexos protena-RNA.

Estrutura do RNA

Estrutura secundria
mais simples formada
pelo pareamento das
bases complementares,
espaadas por 5-10nt.

Estrutura do RNA

Estrutura secundria
mais simples formada
pelo pareamento das
bases complementares,
espaadas por 10 a
centenas de nt.

Estrutura do RNA

Os RNAs so classificados de acordo com sua

localizao e funo dentro da clula.

RNAm: carrega a informao gentica, transcrita a

partir do DNA, sob a forma de seqncias de 3 nt,
codons, cada um dos quais especifica um aa
particular representa a 1-5% do RNA total da clula.

Estrutura do RNA

RNAr: representa cerca de 75% do RNA total da clula.

Est associado com uma srie de protenas para formar os
ribossomos (compostos de uma subunidade maior e uma
subunidade menor) estruturas complexas, que, fisicamente,
se movem ao longo da molcula de RNAm, e catalisam a
montagem dos aa em cadeias de polipeptdeos.

Estrutura do RNA

Os RNAs so classificados de
acordo com sua localizao e
funo dentro da clula.

RNAt: chave para decifrar os

codons no RNAm. Cada aa
tem seu prprio RNAt, o RNAt
se liga ao aa e o carrega para
a cadeia de polipeptdeos em
crescimento. O RNAt/aa so
escolhidos a cada passo da
sntese pois cada RNAt
contm um anti-codon
complementar aos codons do
RNAm.

Estrutura do RNA

Os RNAt adotam uma arquitetura bem definida, a qual

crucial para a sntese de protenas. Os RNAr tambm
adotam este tipo de conformao. O RNAm pode
apresentar estrutura secundria e terciria,
especialmente nas extremidades da molcula.

RNA semelhantes s protenas pois apresentam

domnios estruturados conectados por cadeias flexveis.

Estrutura do RNA

Existem ainda nas clulas eucariotas:

hnRNA RNAs heterogneos nucleares

precursores dos RNAm presentes no ncleo.

snRNA RNAs pequenos nucleares ligados a

protenas (snRNP) desempenhm funes
importantes na sntese dos RNAm funcionais.

RNAs pequenos, localizados no ncleo e

citoplasma, com funes catalticas ou estruturais
(ribozimas) ex. splicing do RNAm.

Estrutura do RNA