GENETIKA

MIKROORGANISME

Oleh :

Dr. dr. Hj. Efrida Warganegara, M.Kes., Sp.MK

 GENETIKA
Genetika dipelajari utk mengetahui dan mempelajari :

Pewarisan ciri dan keragaman

Perubahan fenotipe dan genotipe
Pembuatan peta gen
Aplikasi genetik
 GENETIKA
Pengetahuan tentang Genetika berkembang sejak ditemukannya TEORI MENDEL (1900) HEREDITAS

HEREDITAS adalah suatu bentuk tetap yg di-turunkan dari 1 generasi ke generasi berikutnya (terkadang terdapat variasi)

Yang bertanggungjawab terhadap Hereditas (Pewarisan ciri & keragaman) adalah gen-gen yang terdapat berderetan di dalam khromosom
 GENETIKA
STRUKTUR & FUNGSI GEN

FUNGSI GEN
GEN merupakan suatu segmen asam nukleat (polimer / urutan asam
nukleat, DNA) yg mengkode protein (produk fungsional) dan RNA

RNA t.d. : tRNA (transfer RNA) -> translasi

rRNA (ribosomal RNA) -> translasi
mRNA (messenger RNA) -> hasil transkripsi

Ukuran Gen : Prokariot -> 1000 pb

Eukariot -> 10.000 pb
 GENETIKA
STRUKTUR GEN

Gen Prokariot -> kontinyu

Gen Struktural
DNA
transkripsi
mRNA
Translasi

Protein
 GENETIKA
* Gen Eukariot -> - Intron (tidak memspesifikasi protein)
- Ekson (yang menspesifikasi protein )

Gen Struktural

I1 E1 I2 E2 I3 E3 I4 E4 DNA

transkripsi
RNA primer
Prosesing
E1 E2 E3 E4 mRNA fungsional
Translasi Protein
 GENETIKA
ASAM NUKLEAT

Asam Nukleat merupakan makromolekul yg

merupakan Polimer lurus dari Monomer, dimana
monomer merupakan susunan nukleotida-nukleotida

NUKLEOTIDA : Merupakan ikatan dr 3 komponen

yaitu, 1. Komponen gula
2. Komponen Fosfat
3. Komponen Basa organik
 GENETIKA
Komponen Nukleotida
1. Gula

1.Deoksiribosa = D.N.A 2. Ribosa = R.N.A

0 0

5 OH 5 OH
OH CH2 OH CH2
1 1
4 4 H H
H H
3 2 3 2
OH H OH OH
 GENETIKA
Komponen Nukleotida (lanjutan)

2. Fosfat
0
Berikatan dengan
O P 0 Gula pada Atom
C ke 5 dan pada
O gugus OH- dr
nukleotida yg
lain
 GENETIKA
Komponen Nukleotida (lanjutan)

3.Basa organik

1. Purin : 2. Pirimidin :
Adenin (A) Citosin (C)
Guanin (G) Timin (T)
Urasil (U)

DNA : A G C T - UNTAI GANDA

RNA : A G C U - UNTAI TUNGGAL
 GENETIKA
Susunan molekul Asam Nukleat
1. Back bone : molekul Gula & PO4
2. Molekul Basa : terikat pada Gula
3. Terdapat polaritas 5 ke 3
Ujung 5 memp. gugus PO4
Ujung 3 memp. gugus OH bebas
 GENETIKA
Cara Terbentuknya Untai Ganda dari molekul
DNA :

1. Back bone di luar untai Gula dan Fosfat

2. Basa di dalam untai
Basa Purin Basa Pirimidin
A T
G C
 GENETIKA
Cara Terbentuknya Untai Ganda dari molekul DNA : (lanjutan)
3. Dua untai tunggal yang anti pararel arah 5 ke
3 berlawanan
5 3
3 5
5 3
A G C T T A G C C T A G

T C G A A T C G G A T C
3 5
 GENETIKA
REPLIKASI

Proses Sintesis
DNA baru dengan
menggunakan
DNA lama
sebagai templat
(cetakan)
 GENETIKA
REPLIKASI
Replikasi membutuhkan :
* Basa-basa : - d ATP - d GTP
- d CTP - d TTP
* Primer
* Templat DNA
* DNA polimerase (bekerja bila ada 3 OH
bebas) dan DNA ligase
 GENETIKA
BACTERIAL CHROMOSOME REPLICATION
 GENETIKA
Proses Replikasi :
1. Denaturasi lokal ( pemisahan dari 2
untai pada ORI = Origin of
Replication )
2. Polimerisasi DNA (penambahan basa)
3. Arah 5 ke 3
4. Penambahan basa dikatalisis oleh DNA
polimerase
 GENETIKA
Proses Replikasi : (lanjutan)

5. Untai yg baru dihasilkan disebut Leading

dan Lagging Strand (fragmen OKAZAKI).
6. Tahap akhir dilakukan penyambungan celah
diantara basa-basa dengan enzim DNA ligase
7. Proses Replikasi bersifat SEMI-
KONSERVATIF (1 untai induk, 1 untai baru dibentuk)
 GENETIKA
Transkripsi
Proses sintesis mRNA
dengan menggunakan
DNA sebagai templat
(cetakan)
RNA t.d. 3 macam :
1. mRNA : berfungsi mem-
bawa informasi genetik dr
DNA, templat pd proses
sintesis protein
2. tRNA : berperan men-
transfer AA pd sintesis
protein
3. rRNA : komponen struktur
dr Ribosom
 GENETIKA
Transkripsi
Membutuhkan :
* DNA sebagai templat (untai sense, pengkode protein)
* Enzim RNA polimerase (t.d. FAKTOR SIGMA, yg mengenali daerah
promotor pd DNA sbg inisiasi transkripsi; CORE ENZIM ( , , dan )
* Promotor : Tempat pd DNA utk inisiasi
+ urutan - 10 pb (pribnow box TATAAT) &
+ urutan -35 pb (TTGACA)
* Terminasi transkripsi yi : terbentuk stem-loop structure yg dikuti UUUU,
atau urutan kaya GC diikuti kaya AT
* Memp. Protein regulator (aktivator, represor & terminator) -> bekerja pd
RNA polimerase
 GENETIKA
Proses Transkripsi :
- Eukariot : transkripsi di nukleus
translasi di sitoplasma
Prokariot : transkripsi & translasi di sitoplasma
- Faktor sigma akan mengenali promotor pd DNA,
lalu Core Enzim mulai mensisntesis mRNA,
biasanya dimulai pada basa Purin ( A atau G)
- Proses sintesis selesai bila sampai urutan
terminator
 GENETIKA
TRANSLASI
Membutuhkan :
* mRNA pembawa pesan yg dikodenya
* Ribosom : memp. 2 situs tempat pengikat
tRNA (situs A dan P)
Ribosom t.d. 2 sub unit (30S dan 50S)
* tRNA membawa asam amino yang sesuai
dengan kode yang dibawa mRNA
* Enzim peptidil transferase
 GENETIKA
PROSES TRANSLASI
menggunakan informasi urutan basa nitrogen dr mRNA
utk menyusun urutan AA suatu protein (segmen 3 basa
pd mRNA : CODON)
1. Inisiasi -> kompleks inisiasi t.d. ribosom unit 30S,
mRNA (codon AUG), tRNA (membawa AA Met.) dan
baru bergab. Ribosom unit 50S
2. Elongasi -> Ribosom terus bergerak pd mRNA, tRNA
datang membawa AA yg sesuai, terjadi ikatan peptida
diantara AA, tRNA yg kosong dilepas, demikian
seterusnya sp pada kodon terminasi
 GENETIKA
PROSES TRANSLASI (lanjutan)
3. Terminasi -> bila sampai pada kodon
terminasi (UAG) terjadi pelepasan
ribosom, tRNA dan mRNA ->
Asam-asam amino sesuai dgn informasi
yg dibawa mRNA dihasilkan, akhirnya
membentuk protein yg fungsional
4. Protein ini merupakan enzim yang
berfungsi dalam metabolisme dan
Reproduksi
GENETIKA
 GENETIKA
KODE GENETIK
* Merupakan hubungan antara urutan basa nitrogen DNA, codon
mRNA dan asam amino
* Terdapat 64 codon tapi hanya mengkode 20 asam amino (1 asam
amino dpt dikode oleh bbp codon) -> disebut DEGENERACY OF
CODE
* 61 merupakan SENSE CODON (mengkode AA)
3 merupakan : NONSENSE CODON (mengakhiri translasi) ->
TERMINATOR CODON (UAA, UAG, UGA)
* INISIATOR CODON -> adalah UGA mengkode N-formil
methionin -> memulai sintesis protein
 GENETIKA
VARIASI GENETIK
Terjadi krn : 1. Mutasi
2. Transfer genetik

1. MUTASI
suatu perubahan dlm kharakteristik khusus dr
m.o. akibat perubahan urutan basa dari
material yg diturunkan

* Sel yg membawa perubahan disebut MUTAN

* Induksi dr mutasi disebut MUTAGENESIS
* Zat yg terlibat dlm proses ini adalah
 GENETIKA
Mekanisme Mutasi :
1. Spontaneous mutation :
- alamiah
- kesalahan replikasi
2. Induksi oleh mutagen :
- Chemical mutagens : acridin,
5 - bromouracil, HNO3
- Physical mutagens : radiasi
U.V., X--ray
 GENETIKA
PENGARUH MUTASI PADA KODE GENETIK
bergantung pada mutasinya.

Macam..macam Mutasi :
A. Point Mutasi
B. Frameshift Mutasi

A. POINT MUTASI Hanya 1 atau beberapa

nukleotida termutasi dengan cara Substitusi
 GENETIKA
Akibat Point Mutasi :
1. Silent Mutasi tak ada efek ok tak
ada perubahan asam amino
2. Missence Mutasi terjadi perubahan
shg AA yg dihasilkan berbeda, kurang
berfungsi
3. Nonsense Mutasi - terbentuk urutan
terminasi, terjadi terminasi prematur dr
sintesis protein, protein tak lengkap
 GENETIKA
B. FRAMESHIFT MUTASI ->
Bila terjadi Delesi atau Insersi satu
basa menyebabkan reading frameakan
bergeser satu basa, sehingga daerah
sesudah mutasi akan membentuk AA yg
baru dan biasanya menghasilkan
polipeptida yang tak berfungsi
* Mutasi dapat menyebabkan perubahan
fenotip didalam sel
 GENETIKA
2. TRANSFER DNA
Terjadi transfer gen dari donor DNA ke
resepien DNA -> Pertukaran yang terjadi
disebut REKOMBINASI (hanya pada urutan
yang homolog)
Mekanisme Transfer DNA :
1. Transformasi DNA bebas
2. Transduksi bantuan faga
3. Konjugasi kontak antar sel
GENETIKA
1. Transformasi
GENETIKA
2. Transduksi
GENETIKA
3. Konjugasi
 GENETIKA
PLASMID

* adalah elemen genetik , DNA untai ganda,

sirkuler, superkoil, otonom,
* Ukuran 1 1000 kb, dalam sel tdpt sekitar
100 plasmid, mengandung 1 100 gen
* Dapat dipindah secara konjugasi atau dapat
berintegrasi ke dalam khromosom
 GENETIKA
Plasmid ada 2 macam :
A. Konjugatif ada gen utk
pilus -> konjugasi
B. Non-konjugatif tak ada gen
pembentuk pilus shg transfer
gen hanya mel. transformasi
atau transduksi
 GENETIKA
Kharakteristik yg dihubungkan dgn plasmid :
1. R Plasmid -> resistensi thdp Antibiotik
2. Resisten logam berat
3. Determinan virulensi penentu virulensi
shg dapat menyebabkan infeksi,
mungkin mengkode produksi toksin
4. Pembentukan Colisin dan Bacteriocin -
antibakteri
5. Aktifitas metabolik merubah
kemampuan fermentasi
 GENETIKA
GENETIC ENGINERING (REKAYASA GENETIKA)
dan DNA REKOMBINAN
* DNA Rekombinan -> berhubungan dengan
pembentukan molekul DNA dari sumber yang
berbeda
* Teknologi DNA Rekombinan disebut Rekayasa
Genetika (Genetic Enginering)
* Perkembangan DNA Rekombinan terjadi ok
ditemukannya enzim Restriksi
 GENETIKA
PROSES DNA REKOMBINAN
Dasarnya :
1. Mengambil gen yg diminati secara spesifik dr
donor -> menggabungkannya dgn DNA (vektor)
yg mampu bereplikasi dan dapat dimasukkan ke
dalam sel dan diberi tanda agar keberadaannya
dpt dik -> pBR322, bakteriofaga dan kosmid
2. Menyediakan lingkungan shg gen tsb dapat
bereproduksi dlm jumlah besar -> Kloning
 GENETIKA
* Metoda memperbanyak DNA
secara invivo -> Kloning gen
konvensional
* Metoda memperbanyak DNA
secara invitro -> Polimerase
Chain Reaction (PCR)
 GENETIKA
PCR (Polymerase Chain reaction)
Bahan :
- Templat untai ganda (+ DNA target)
- Enzym DNA polimerase
- Nukleosida trifosfat
- Sepasang primer oligonukleotida
( disintesis dengan alat DNA
synthesizer ) berfungsi menyediakan
gugus OH- bebas pada karbon 3
 GENETIKA
Tahapan PCR
1. Denaturasi ( 90 - 950 C )
2. Annealing ( pemanjangan primer ) (
37 - 600 C )
3. Polimerisasi ( 25 - 30 x ) ( 72 0 C )
setiap siklus terjadi amplifikasi 2x, yang baru
menjadi template, setelah siklus 30 x didapat
106 - 109 x jumlah DNA target awal
 GENETIKA

Aplikasi genetik
1.In Vivo Tecnology
Produksi industri -> Protein, Penisillin,
Lisin, Glutamic dll
Perkembangan strain -> Generation,
Selection, Genetic Exchange,
Productie Primary metabolites
 GENETIKA
2. In Vitro

- Gene Libraries Genom, Screening,

Kontruksi gen
- Expresi vektor
- Liverekombinant vaccine - Hepatitis B
vaccin
 GENETIKA
Diagnostik :
1. PCR : Salmonella, TBC, Chlamydia
dll mem butuhkan primer
2. Gene probes
3. Finger printing gen
4. Human genetik diseases
5. Gen therapy