Kuliah II 20 Maret 2013

Klasifikasi Virus

Influenza
 Klasifikasi virus berdasarkan Family

Asam nukleat Family Symetry Envelope

dsDNA I. Poxviridae Complex -

dsDNA II. Iridoviridae Icosahedral -
dsDNA III. Herpesviridae Icosahedral +
dsDNA IV. Adenoviridae Icosahesral -
dsDNA V. Papovaviridae Icosahedral -
ssDNA VI.Parvoviridae Icosahedral -
ssRNA I. Picornaviridae Icosahedral -
ssRNA II.Caliciviridae Icosahedral -
ssRNA III.Togaviridae Icosahedral +
ssRNA IV.Bunyaviridae (Uncertain) +
dsRNA V. Reoviridae Icosahedral -
dsRNA VI. Orthomyxoviridae Helical +
dsRNA VII.Paramyxoviridae Helical +
dsRNA VIII.Rhabdoviridae Helical +
ssRNA IX. Retroviridae Icosahedral +
ssRNA X. Arenaviridae Uncertain +
ssRNA XI. Coronaviridae Helical +
Miscelaneous
 Klasifikasi berdasarkan jaringan yang di infeksi
Group Bagian yang di infeksi (Penyakit)
Pneumotropic Respiratory system ( influenza, respiratory
syncytial disease, adenovirus disease, rhinovirus
infection)
Dermotropic Skin and subcutaneous tissues
(chickenpox, herpes simplex, measles, mumps,
smallpox, rubella)
Viscerotropic Blood and visceral organs (Yellow fever,
dengue fever, infectious mononucleosis,
cytomegalovirus disease, viral fevers, Marburg
disease, viral gastroenteritis, hepatitis A, hepatitis B,
AIDS)
Neurotropic Central nervous system (Rabies,
lymphocytic choriomeningitis, polio, slow virus disease,
arboviral encephalitis)
Approximate size (nm) Important disease
250 Smallpox, cowpox
200 Animal viruses
200 Herpes simplex, chickenpox,
infectious mononucleosis,
75 respiratory infections, tumor in
animal
50
Benign tumors (warts), Tumor in
animal
20
Animal viruses
27
Polio, coxsackievirus disease
Hepatitis A
40
Animal viruses
50
Arboviral equine encephalitis,
100 rubella, yellow fever, dengue
fever
180 Influenza, hepatitis B
150 Rabies
AIDS, NANB hepatitis
 Perbandingan ukuran virus dengan m.o lain
Approximate size (nm)
2800 Sel nukleus
2000 E. Coli
250 Small pox
240 Tobacco mosaic
150 Rabies
100 Influenza
95 Bacteriophage
70 Common cold
27 Polio
20 parvovirus
 Influenza
Name of Date Death subtype
pandemic involved
Asiatic 1889-90 1 million possibly H2N2
(Russian) Flu
Spanish flu 1918-20 40 million H1N1
Asian flu 1957-58 1 to 1.5 million H2N2

Hongkong flu 1968-69 0.75 to 1 H3N2

million
 Struktur virus influenza

Ortomiksoviradae merupakan determinan utama dari mobilitas

dan mortilitas yang di sebabkan oleh penyakit pernapasan

Semua ortomuksovirus yang di kenal adalah virus influenza

Amplop yang terdiri dari dari Haemagglutinin dan Neuraminidase

(H dan N) menentukan varian dari virus influenza
 Partikel virus influenza mengandung tujuh protein
struktural yang berbeda.

Tiga protein besar (PB1, PB2, dan PA) terikat pada RNA
virus dan merupakan penyebab dari transkripsi dan
replikasi dari RNA
Influenza
Influenza, biasa di sebut flu.

Penyakit infeksi pada burung dan mamalia

Disebabkan oleh virus RNA (Fam. Ortomyxoviridae)

Pada manusia, gejala yang timbul adalah: demam, sakit

tenggorokan, sakit pada otot, sakit kepala, batuk, and
weakness and fatigue .

Pada kasus yang serius, influenza dapat menyebabkan

pneumonia , yang mana akan fatal pada anak2 atau orang
tua.

Kadang2 agak mirip common cold , influenza is a much more

severe disease and is caused by a different type of virus.

Although nausea and vomiting can be produced, especially

in children,these symptoms are more characteristic of the
unrelated gastroenteritis , which is sometimes called
"stomach flu" or "24-hour flu".
 Mekanisme Terjadinya Pandemi
Ada 6 fase:
tidak terdapat subtype virus influenza baru yang
terdeteksi pada manusia. Virus tsb terdapat pada hewan
tetapi beresiko kecil untuk menginfeksi manusia
Tidak terdeteksi subtype virus tsb pada manusia, tetapi
beresiko besar untuk menginfeksi manusia
Terjadi infeksi pada manusia oleh subtype virus baru,
tetapi tidak terjadi penularan antar manusia, atau
jarang sekali terjadi penularan pada kontak terdekat
sekalipun
Terjadi penularan antar manusia pada kelompok
kecil(small cluster), tetapi hanya terlokalisir pada daerah
yang terbatas. Hal ini mengesankan virus belum mampu
beradaptasi pada tubuh manusia
Continue..

Terjadi penularan antar manusia pada

kelompok yang lebih besar (larger cluster),
tetapi masih pada daerah tertentu. Hal ini
mengesankan virus sudah beradaptasi lebih
baik pada tubuh manusia, tetapi belum dapat
menyebar secara mudah
Terjadi peningkatan penularan yang menetap
pada populasi manusia secara umum.
 Perkembangan H dan N:
1889-1890: H2N2 (A2?)
1900 : H3N2 (A3)
1918-1919: HswN1
1929: HswN1
1931: HswN1
1933: H0N1 (A0) England
1947: H0N1, H1N1 (A1) Australia
1950: H1N1 (A1 variant)
1957: H2N2 (A2) Singapore Asian flu)
1967: H3N2 (AHK) Hongkong
1976: HswN1, H3N2, New Jersey
 1977: H1N1 (A1 variant ) China
1979-1981: H3N2 Bangkok, H1N1
1983-1985: H1N1 Chile, H3N2 Philippines
 Avian Flu
Avian flu
also "bird flu", "avian influenza", "bird influenza",
means "flu from viruses adapted to birds", but is
sometimes mistakenly used to refer to both other
flu subsets (such as H5N1 flu) or the viruses that
cause them (such as H5N1).

All known avian flu viruses belong to the species

of virus called Influenza A virus. All subtypes (but
not all strains of all subtypes) of Influenza A virus
are adapted to birds, which is why for many
purposes avian flu virus is the Influenza A virus
(note that the "A" does not stand for "avian").
 Secara genetik dapat dibedakan
antara virus flu manusia dan virus flu
avian, mencakup :
PB2: RNA polymerase: Amino acid (or residue)
position 627 in the PB2 protein encoded by the
PB2 RNA gene.
Until H5N1, all known avian influenza viruses
had a Glu at position 627, while all human
influenza viruses had a lysine.
 HA: (hemagglutinin): Avian influenza HA
bind alpha 2-3 sialic acid receptors while
human influenza HA bind alpha 2-6 sialic
acid receptors. Swine influenza viruses
have the ability to bind both types of sialic
acid receptors.
 H5N1

Sejak tahun 2006, H5N1 umum digunakan untuk

avian flu, merujuk pada virus influenza A.
Baru baru ini, strain ini di transmisikan melalui
kontak dengan burung yang telah terinfeksi oleh
virus ini, dan pada beberapa kasus, dapat
dipindahkan dari satu manusia ke manusia lain.
Sebenarnya, H5N1 sekarang bukan pandemic dan
tidak dapat menyebabkan pandemic
Hanya jika bentuk H5N1 bermutasi dan dapat
dipindahkan dari satu manusia ke manusia lain
dan menyebabkan pandemic.
Penyebaran H5N1
 Penyebaran avian flu di dunia

Countries with poultry or wild birds killed by H5N1.

Countries with human cases of H5N1.

 Cumulate Human Cases of and Deaths from H5N1 As of March
8, 2007

Notes:
Source WHO Confirmed Human Cases of H5N1
"[T]he incidence of human cases peaked, in each of the three years in which cases have occurred, during the period roughly corresponding
winter and spring in the northern hemisphere. If this pattern continues, an upsurge in cases could be anticipated starting in late 2006 or ea
Avian influenza epidemiology of human H5N1 cases reported to WHO
The regression curve for deaths is y=a+ekx, and is shown extended through the end of April, 2007.
Kasus kasus yang terjadi
2003
Mulai muncul lagi Januari 2003, sejak outbreak terakhir flu
hongkong tahun 1997. tiga orang dalam 1 keluarga
terinfeksi setelah mengunjungi kota Fujian dan 2 dari
padanya meninggal (China).
Pertengahan 2003 terjadi outbreak penyakit unggas yang
disebabkan oleh H5N1 (asia).
Des 2003, hewan di kebun binatang Thai mati setelah
memakan daging ayam yang terinfeksi.
Pada akhir tahun ini juga di deteksi virus ini di Korea
 2004
Jan 2004, H5N1 ditemukan di Vietnam dan
Thailand dan dalam beberapa minggu
menyebar ke 10 bagian negara asia lain
termasuk Indonesia, Korea selatan, jepang
dan china.
Oktober 2004 peneliti menetapkan H5N1
lebih berbahaya dibandingkan dari temuan
sebelumnya yang diduga hanya
menyerang ayam, itik, babi dan hewan
unggas lain nya.
2005
 2005
Pada jan 2005 an outbreak influenza avian menginfeksi 33
dari 64 kota dan propinsi di Vietnam. 1,2 juta unggas
dibunuh.

Lebih dari 140 juta burung dipercayai mati atau

dibunuholeh karena outbreak ini.

Pada April 2005 there begins an unprecedented die-off of

over 6,000 migratory birds at Danau Qinghai di Cina over
three months.

Strain H5N1 menyebar melalui migrasi burung, lebih pada

tidak kurang dari 10 bulan.

In August 2005 H5N1 menyebar ke Kazakhstan, Mongolia

and Russia.
 2005

On September 29, 2005, David Nabarro, the newly

appointed Senior United Nations System Coordinator for
Avian and Human Influenza, warned the world that an
outbreak of avian influenza could kill 5 to 150 million
people. David Nabarro later stated that as the virus had
spread to migratory birds, an outbreak could start in Africa
or the Middle East.

Later in 2005 H5N1 spread to Turkey, Romania, Croatia and

Kuwait.
 2006
Jan-feb 2006, H5N1 menyebar ke Africa and
Europe melalui burung liar

Penyebaran H5N1 yang patogen pada burung

liar , pada burung di kebun binatang dan pada
tempat2 lain, contohnya pada penjualan hewan
(pet animals) terus meningkat.

Tanpa menggunaan vaksin maka akan

menyebabkan terbunuhnya jumlah hewan di
peternakan dan di kebun binatang makin
meningkat, sementara kebutuhan terhadap
vaksin juga meningkat.

SARS
Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS)

Kapan dan dimana pertama kalinya SARS

dilaporkan ?
A : On 26 February 2003, a man was
admitted to hospital in Hanoi with high
fever, dry cough, myalgia (muscle
soreness) and mild sore throat. Over the
next four days he developed increasing
breathing difficulties, severe
thrombocytopenia (low platelet count) and
signs of adult respiratory distress
syndrome requiring ventilator support.
 Bagaimana symptoms SARS ?

Demam tinggi (> 38 Celsius)

Batuk kering
Susah bernafas
Changes in chest X-rays indicative of
pneumonia also occur.
SARS may be associated with other
symptoms, including headache, muscular
stiffness, loss of appetite, malaise,
confusion, rash and diarrhoea.
 Continue..
Bagaimana menangani pasien SARS?
Pasien harus ditempatkan di ruang isolasi.
Strict respiratory and mucusol barrier
nursing is recommended.
It is very important that suspected cases
are separated from other patients and
placed in their own hospital room.
Health care workers and visitors should
wear efficient filter masks, goggles,
aprons, head covers, and gloves when in
close contact with the patient.
Hospital Infection Control Guidance
 Seberapa cepat SARS menyebar ?

A : SARS appears to be less

infectious than influenza. The
incubation period is short, estimated
to range from 2-7 days, with 3-5
days being more common. However,
the speed of international travel
creates a risk that cases can rapidly
spread around the world.