MATERI KULIAH KIMIA ORGANIK II

SMT IV 3 SKS

BAB I. STEREO KIMIA

BAB II. SENYAWA BERGUGUS FUNGSI JAMAK
BAB III. KARBOHIDRAT
BAB IV. ASAM AMINO, PEPTIDA, DAN
PROTEIN
BAB V. LEMAK
BAB VI. HIDROKARBON AROMATIK
POLISIKLIK
1. Buku Teks Kimia Organik II (Matsjeh, S.,
et.al., 1996, Kimia Organik II,
Departemen Pendidikan dan Kebudayaan
DIKTI)
2. Fessenden, R.J., and J S Fessenden, 1997,
Kimia Organik, Alih Bahasa A.H
Pudjaatmaja, Jilid 1, Edisi ketiga, Jakarta:
Erlangga
3. Paul R Young, 2000, Organic Chemistry On
Line, University Illinois Chicago
4. Solomons, 2000, Organic Chemistry, 6th
edition, Wiley and Sons
SOME ADVICE ON STUDYING
FOR ORGANIC CHEMISTRY
STRUCTURE OF KNOWLEDGE IN ORGANIC CHEMISTRY

missing
material

Builds like a
pyramid balanced
on its point.
If something is missing …..

The whole structure

collapses !!!
MATERIAL IN THIS COURSE IS CUMULATIVE

STUDY TO UNDERSTAND THE MATERIAL

The material keeps building on itself.

ANYTHING THAT YOU DO NOT MASTER WILL

COME BACK TO HAUNT YOU LATER

You literally cannot forget anything in this course.

WE WILL BUILD ON EARLIER TOPICS TO

DEVELOP NEW ONES
IF YOU DON’T UNDERSTAND SOMETHING
….. GET HELP AS SOON AS YOU CAN

See me after class, during office hours, or make

an appointment.

DO AS MANY PROBLEMS AS YOU CAN FIND

TIME FOR IN YOUR SCHEDULE

Active learning is more effective than passive study.

Doing problems really cements your understanding
it requires you to apply what you learn.

THE END-OF-CHAPTER PROBLEMS ARE THE

MOST HELPFUL
6 LANGKAH PENTING UNTUK SUKSES
KIMIA ORGANIK

1) berada di kelas;
2) bertanya di kelas (jika menemui kesulitan)
3) Take good notes = buat catatan yang baik
persiapan dengan membaca materi sebelum
masuk kelas, setelah kuliah: baca lagi,
buat Ringkasan dan tulis kembali
4) Kerjakan PR pada waktunya
5) Practice, practice, practice!
6) Pelajari bagaimana ujian dengan baik
 STRANGE BUT TRUE
We retain : 90% of what we say
ACTIVE
as we do a thing

70% of what we say as we talk

50% of what we see and hear

30% of what we see

20% of what we hear

10% of what we read PASSIVE

….. a psychological study

STEREO KIMIA
Studi mengenai molekul-molekul dalam ruang 3 dimensi
Bagaimana atom-atom dalam suatu molekul ditata dalam
ruangan satu relatif yang lain

1. ISOMER GEOMETRI
Ketegaran (rigidity) dalam molekul dapat mengakibatkan
isomer
2. KONFORMASI MOLEKUL
bentuk molekul dan bagaimana bentuk ini bisa berubah
3. KIRALITAS MOLEKUL
Bagaimana penataan kiri atau kanan atom-atom disekitar
atom C dapat mengakibatkan isomer
 Pusat stereo;
titik dalam suatu molekul yang menghasilkan
stereoisomer

jumlah stereoisomer yang mungkin adalah = 2n ,

n pusat stereo
 Pusat Khiral – ‘chirogenic centre’ =
‘pusat yang menghasilkan senyawa khiral

• Pusat khiral = pusat asimetrik ;

mengikat 4 atom/gugus berbeda

Br
H3CH2C
* C* CH CH
H3C C Br H3C 2 3

H A H B

Pusat khiral A and B = enantiomers (‘optical isomers’)! –

• Enantiomer adalah khiral! –

• senyawa khiral tidak berimpit dengan bayangan
cerminnya.
Why is chirality important?
Chiral species fits in chiral binding
site (matched key and lock)
Chiral species does not fit in
binding site (mismatched key
and lock)
Loius Pasteur
isomers adalah senyawa berbeda yang memiliki rumus
molekul sama, contoh C4H8:
 Stereoisomer Alkena; Isomer Geometri,

Ada perbedaan letak gugus-gugus/atom-atom

1. Dilihat prioritas substituen yang terikat langsung

ke C ikatan rangkap;
Nomor atom tertinggi memperoleh prioritas tertinggi
Contoh; H– < C– < N– < O– < Cl–.
(untuk isotop; prioritas sesuai dengan namor massa)

2. Jika atom yang terikat langsung ke ikatan rangkap

sama; maka lihat atom berikutnya.
Contoh;
CH3– < C2H5– < ClCH2– < BrCH2 < CH3O–
3. Jika 2 gugus prioritas tertinggi terletak pada satu
sisi = cis

Jika 2 gugus prioritas tertinggi terletak pd sisi

berlawanan = trans

4. bila ke empat gugus atau atom yang terikat ke

atom C ikatan rangkap berbeda; maka dipakai
penamaan E (= entgegen) & Z (=zusammen),

 Z equivalent ke cis dan E equivalent ke trans.

Sistem E dan Z
ISOMER GEOMETRI PADA SENYAWA
SIKLIK
Di atas bidang;
H H Gugus terikat pada
ujung-atas garis vertikal
H CH3
H H
H H
H H

H OH
Di bawah bidang;
Gugus terikat pada
Ujung-bawah garis vertikal
Contoh:
Konformasi Senyawa
Rantai Terbuka
 Gugus-gugus yang terikat oleh ikatan
sigma dapat berotasi mengelilingi ikatan,
 Dapat memiliki tak terhingga banyak posisi
didalam ruang relatif satu terhadap yang
lain
 Menggunakan Proyeksi Newman
 Hanya ada 1 ikatan C-C, struktur rotasi (rotamer) yang ada:
staggered dan eclipsed.

Sawhorse Newman Bond Repulsions

Nama Wedge-Hatched in Ethane
Konforme r Bond Structure Structure Projection
Profil Energi Potensial untuk Konformer Etana

Dihedral Angle
Profil Energi Potensial untuk Konformer Butana
 Aspek penting dari
Stereoisomer Konformasi:
1.Interkonfersi konformasi dalam molekul
sederhana terjadi cepat pada temperatur
kamar, isolasi konformer murni biasanya tidak
mungkin.

2. Konformer spesifik membutuhkan tatanama

khusus, seperti staggered, eclipsed, gauche
dan anti

3. Konformer spesifik tersusun dari sudut

dihedral.
4. konformasi Staggered sekitar ikatan tunggal
C-C lebih stabil (punya energi potensial
terendah) dibandingkan konformasi eklips.

5. Konformer Gauche pada butana kurang

stabil dari pada konformer anti sekitar 0,9
Kkal/mol. Nilai ini disebabkan rapatnya 2
gugus metil (steric hindrance) pada struktur
Gauche

6. Konformer Butana B dan C memiliki struktur

bayangan cermin yang tidak identik, sudut
dihedral 2400 & 3000.
 Bentuk Senyawa Siklik

600 900 1080 1200

Sudut ikatan menurut BAEYER

Diagram proyeksi
Menggambarkan struktur 3 dimensi
ke 2 dimensi :

 Proyeksi Fischer
 Proyeksi Newman
 Proyeksi FISCHER

 Vertikal; menjauhi pembaca

 Horizontal; mendekati pembaca
 Proyeksi Fischer bisa berotasi dan dimanipulasi
 Rotasi 900 tidak dibolehkan; karena menghasilkan
enantiomer awal.
 Rotasi 1800 menghasilkan konfigurasi identik, rotasi
2700 menghasilkan enantiomer
Aturan Penataan ulang proyeksi Fischer :
1. merubah 2 gugus pd proyeksi Fischer; menghasilkan
enantiomer dari senyawa awal
2. perubahan gugus 2 kali menghasilkan stereokimia awal
Proyeksi Fischer dengan 2 C khiral
Urutan penataan ke 4 gugus di sekitar atom khiral
Tata nama R, S
(R = Rektus = ke kanan ; S = Sinister = Kiri)

(R)-alanine
1. Urutkan ke 4 gugus (berdasarkan prioritasnya)
Berdasarkan no atom; dari yg terikat langsung
pada C kiral
b. Bila atom yang terikat langsung pada C khiral sama;
maka prioritas ditentukan oleh atom berikutnya
c. Ikatan rangkap 2 dianggap mengikat 2 atom
yang sama
d. Ikatan rangkap 3 dianggap mengikat 3 atom
yang sama
e. Atom yang mengikat 2 C yang riel punya prioritas
lebih tinggi dari pada C dengan ikatan rangkap
2. Isotop dengan massa lebih besar memperoleh
prioritas lebih tinggi
3. Proyeksikan molekul sehingga ggs prioritas
terendah berada di belakang
4. Tarik suatu anak panah dari gugus prioritas
tertinggi ke terendah
Jika searah dengan putaran jarum jam = R
Jika berlawanan dengan putaran jarum jam = S
Urutan prioritas: Cl (tertinggi) > C-C > C-H > H.

Sehingga
(R)-2-khlorobutana
 b
H3CH2C H3CH2C H3CH2C b
* Br a *
C *
d H C Br
H3C dH C Br
(S)-2-bromo- a
H H3C c butane H3C c

a
Br Br a Br
*
b * b
C* CH CH C CH2CH3 C CH2CH3
H3C 2 3 dH dH
H H3C c H3C
c
(R)-2-bromo-butane
CH3CH2O b H3C c
CH3CH2O
a b * a
* Br *
H C d H C Br CH3CH2O C Br
H3C H3C c Hd
H3Cc
a
(R)-(1-bromoethyl) H C* Br
ethyl ether d
CH3CH2Ob
 a OH

c C*
H3C Hd
b CH2CH3

a OH
HO HO a
* b * C*
b
H3CH2C C H H3CH2C C Hd c
H3C H CH2CH3
H3C H3C c d
(R)-2-butanol
Contoh
• Gambarkan struktur dari (S)-1-kloro-2-butanol !

Posisi struktur : ClCH2C*H(OH)CH2CH3

Pusat khiral (C*) pada C2:
gugus yang terikat ke C* : HO- , ClCH2-, CH3CH2-, H- .
Perioritas : HO- = a, ClCH2- = b, CH3CH2- = c, H- = d
a OH
a OH
1 2 C* 3 4
C* 1 2 C* 3 4 ClCH2 CH2CH3
ClCH2 CH CH b H c
b d c H 2 3
d
(S)-
Berikan stereostruktur dari (R)-2-iodopentana !

(R)- 2-iodopentana: CH3C*H(I)CH2CH2CH3;

Pusat khiral (C*) di C2 
Gugus pada C* : I- , CH3-, CH3CH2CH2, H- .
Prioritas: I- = a, CH3CH2CH2- = b, CH3- = c, H- = d

a Ia
1 2C* 3 4 5
C* H3C CH2CH2CH3
c b c H b
d d
(R)- 2-iodopentana
 2 Pusat Khiral
d
H c1 H a H
H3C Br H3C Br
(2R) H3C *C Br
*C 2
b C
*C b C 4 3C *
H3C (3S) H C Br
Br H3C Br 3
C H H c dH a
(2R,3S)-2,3-dibromobutane
Senyawa C – dua pusat khiral….. Tetapi…apa C senyawa khiral ?
… is it non-superimposable upon its mirror image?
Lihat C dan cerminnya D : -Bidang cermin atau
bidang simetri

1 H H 1
(2R) H3C Br Br CH3 (2S) H 1
C 2 C*
Br CH3
* 2 C
3 C* *
(3S) *C 3 (3R)
H3C Br Br CH3 C*
H 4 D Br CH3
C 4 H H D
(2R,3S)- or meso-2,3-dibromobutane C and D identical!
 Lanjutan ….
Senyawa Meso: setiap pusat khiral dihubungkan dengan
gugus yang sama dalam bidang cermin
1 H H 1
H3C Br HO COOH
C2 C (2R,3S)- or meso-2,3-
* * 2 dihydroxybutanedioic acid
*C 3 * C3 4 or
H3C Br HO COOH meso-tartaric acid
4 H H
m.p. 140 °C
(2R,3S)- or meso-
2,3-dibromobutane
Bukan senyawa meso!
Br
Br 1 H
* H3C Br
C
* * 2
H *C 3
H
H3C Cl
(1R,2S)-1,2-dibromo- 4 H
cyclobutane (2R,3S)-2-bromo-3-klorobutana
 Diastereoisomer
Compounds C, E and F
1 H 1 H H 1
H3C Br H3C Br Br CH3
(2R) C (2R) *C 2 (2S)
* 2 2C *
(3S) *C 3 (3R) *C 3 3C*
H3C Br Br CH3 H3C Br
(3S)
C 4 H E H 4 4 H F

• E,F not superimposable – both chiral- enantiomers!

• Relationship between C and E or C and F: diastereoisomers!
• Stereoisomers which are not enantiomers are diastereoisomers or
diastereomers.
H 1 H
HO COOH HO COOH
m.p. 140 °C * C2 *C m.p. 170 °C
* C3 4 *C
HO COOH HOOC OH
H H
(2R,3S)- or meso- (2R,3R )-
2,3-dihydroxybutanedioic acid 2,3-dihydroxybutanedioic acid
or or
meso-tartaric acid (2R,3R)- tartaric acid
 Properties of Enantiomers
Identical m.p., b.p., differ in specific rotation:
Solution irradiated with plane polarized light;  = 589 nm (sodium ‘D’
emission line) in polarimeter.

rotation °  ‘to the right’ – ‘dextrorotatory’ d- or (+);

‘to the left’ – ‘levorotatory’ l or (-).

specific rotation []589 = .100/c.l

c = conc. g./100mL
l = length of sample tube (dm)

• Optically active compound: displays optical rotation

- pure enantiomer, or mixture of enantiomers containing more
than 50% of one enantiomer.
• Racemic mixture: mixture contains 50% of each enantiomer,  = 0°.
• Racemate or racemic ‘compound’ (rac): crystalline or pure liquid 1:1
mixture of enantiomers
 Properties of Enantiomers (cont.)
Examples
H 1 H
HO COOH H
HO COOH HOOC OH
* C2 *C *C
* C3 4 *C
HO COOH HOOC OH *C
H HO COOH
H H

[]D = 0° []D = +12.4° []D = -12.4°

m.p. 140 °C m.p. 170 °C m.p. 170 °C
(2R,3S)- or meso- (2R,3R)- (+)-tartaric (2S,3S)-(-)-
-tartaric acid acid tartaric acid

Racemate
rac- or (2RS,3RS)- []D = 0°
tartaric acid
m.p. 210 °C
or
(±)- tartaric acid -crystals consist of 1:1
mixture of enantiomers