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Principios de Ingeniería

Metabólica

Unidad 1. Generalidades y Energética

• Conceptos generales
• Presión osmótica y efecto de polimerización
• Membranas biológicas
• Recordatorio de termodinámica
Conceptos Generales

El metabolismo es la suma de una serie interconectada de


secuencias de reacciones donde forman parte los metabolitos.
Cada secuencia es regulada para proveer a la célula lo que ella
necesita en un momento dado de forma a gastar energía solo
cuando sea necesario.
Se le llama ruta metabólica (pathways) al conjunto de reacciones
catalizadas por enzimas que se organizan funcionalmente en muchas
secuencias de reacciones consecutivas. En estas el producto de una
reacción se convierte en el reaccionante de la siguiente

 Algunas de estas rutas metabólicas degradan nutrientes orgánicos en


moléculas más simple para extraer energía. Estas rutas degradadoras y
generadoras de energía libre se denominan rutas catabólicas.

 Otras rutas inician en moléculas simples convirtiéndolas paulatinamente en


moléculas más grandes y complejas. Estas rutas sintetizadoras y que
necesariamente consumen energía libre se denominan rutas anabólicas.
Las rutas anabólicas y catabólicas se
acoplan. En este acoplamiento el ATP
(adenosín trifosfato) es la principal
molécula de conexión.

El ATP no es la única molécula que


se emplea como “almacén” de energía
Las rutas metabólicas que actúan en los principales constituyentes
de la célula: proteínas, lípidos, azucares y ácidos nucleicos son
conservadas entre organismos.

A pesar de la gran diversidad de procesos que contribuyen a


mantener el orden biológico, la mayoría de ellos se pueden
clasificar en:
1.Síntesis de biomoléculas
2.Transporte a través de las membranas
3.Movimiento celular
4.Eliminación de residuos
Los sistemas biológicos tienen elaborados mecanismos de control
buscando no solo el balance sino también la economía. Existen
cientos de intermediarios en las rutas metabólicas y muchos de ellos
son a su vez reaccionantes en varias otras rutas. De esta forma el
metabolismo es mejor representado como una red de reacciones e
interacciones.
Dentro de los mecanismos de regulación más comunes está el
llamado: mecanismos de retroalimentación

Retroalimentación negativa o
Retroalimentación positiva
Retroalimentación inhibitoria
Presión osmótica. Efecto de la polimerización

Ósmosis: Paso selectivo de moléculas del disolvente a través de una


membrana porosa desde una disolución más diluida a una más
concentrada.

Presión osmóica: Presión necesaria para detener la ósmosis.

Membrana selectiva: Deja pasar las


moléculas del disolvente pero no las del
soluto
La presión osmótica no depende de la masa sino del número de
partículas disueltas

- Una misma masa de una sustancia, genera una menor presión si


esta está en forma polimérica
- Es posible almacenar grandes cantidades de sustancia en forma
polimérica (ej. glucógeno) con una presión osmótica mucho más
baja que si se almacena en forma monomérica (ej. glucosa)
Membranas Biológicas
1. La cantidad relativa de proteínas y lípidos varía de acuerdo al
tipo de membrana
2. La composición proteica de las membranas varía mucho más
que la composición lipídica reflejando funcionalidades
específicas
Características comunes

1.Son impermeables a la
mayoría de solutos cargados o
polares
2.Dada su composición y
características estructurales se
usa el modelo de mosaico fluido
para representar las membranas
celulares
Modelo del mosaico fluido para la estructura de la membrana

1. Los fosfolípidos forman una bicapa en la cual las regiones no polares de la


molécula de lípido de ambas capaz se encuentran hacia el núcleo de la bicapa
y las regiones polares interactuando con las fases acuosas de ambos lados de
la membrana.
2. Las proteínas están embebidas en la bicapa ayudadas por las interacciones
hidrofóbicas entre los lípidos de la membrana y los dominios hidrofóbicos de
las proteínas. Algunas proteínas tiene regiones en un solo lado mientras que
otra tienen regiones expuestas a ambos lados de la membrana.
3. La orientación de las proteínas en la bicapa es asimétrica: los dominios
expuestos en un lado de la bicapa son diferentes a los del otro lado reflejando
una asimetría funcional.
4. Los lípidos individuales y unidades de proteínas en la membrana forman un
mosaico fluido cuyo patrón cambia constantemente.
5. El mosaico de la membrana es fluido porque la mayoría de las interacciones
entre sus componentes son no covalentes dejando que los lípidos individuales
y las proteínas puedan moverse libremente lateralmente en el plano de la
membrana.
Hay una distribución asimétrica de los fosfolípidos entre la
monocapa externa e interna (ej. Membrana plasmática de los
eritrocitos)
En dependencia de las condiciones y naturaleza de los lípidos,
hay tres tipos de agregados de lípidos que pueden formarse
cuando lípidos anfipáticos se mezclan en agua:

1.Micelas: son estructuras esféricas que pueden contener desde unas pocas
docenas hasta centenas de lípidos anfipáticos. Estos agregados se
organizan de forma tal que las regiones hidrofóbicas quedan al interior.
EN el interior el agua es excluida y las cabezas polares de los lípidos
quedan hacia el exterior del agregado.
2.Bicapas: dos monocapas de lípidos forman una capa bidimensional. Las
bicapas se tienden a formar más cuando las áreas de las cabezas y las
cadenas de los lípidos son similares como es el caso de los
glicerofosfolípidos y esfingolípidos. Las regiones hidrofóbicas de ambas
capaz, excluyendo al agua, interactúan entre ellas. Las bicapas son
inestables y de forma expontaneas tienden a formas otro tipo de agregado.
3.Liposoma: Las bicapas siendo inestables se pliegan sobre ellas mismas
formando vesículas o liposomas. Estas formas de las bicapas proveen la
mayor estabilidad y son capaces de almacenar agua en su interior creando
un compartimento separado.
Las proteínas de membrana se
pueden clasificar en dos tipos:

1.Proteínas integrales: Están íntimamente


asociadas con la membrana y pueden ser
removidas solo por agentes que interfieren
con las interacciones hidrofóbicas
(detergentes, solventes orgánicos, etc.)
2.Proteínas periféricas: se unen a la
membrana por interacciones electrostáticas y
puentes de hidrógeno con dominios
hidrofílicos de proteínas integrales y/o
cabezas polares de lípidos de membrana.
Pueden ser liberadas por ejemplo por
cambios de PH.
Recordatorio de Termodinámica

1ra Ley de la Termodinámica


En cualquier cambio físico o químico, la cantidad total de energía
en el universo permanece constante, la energía puede cambiar de
forma o transportada de una región a otra, pero no puede ser creada
o destruida.

2da Ley de la Termodinámica


En todos los procesos naturales la entropía del universo se
incrementa

UNIVERSO = SISTEMA + ALREDEDORES


Sistema abierto
Intercambia materia y energía con los alrededores

Sistema aislado
No intercambia materia ni energía con los alrededores

Sistema cerrado
Se intercambia energía pero no se intercambia materia con los
alrededores

Los sistemas biológicos son sistemas abiertos y nunca están en


equilibrio con sus alrededores. Su interacción con los alrededores es
la razón por la cual aparece “orden” en estos sistemas. Esto no viola
la segunda Ley de la Termodinámica.
La segunda Ley de la Termodinámica establece que la entropía del
UNIVERSO crece pero esto no quiere decir que la entropía del SISTEMA
tenga que crecer también.

En el proceso de organización de un sistema biológico se incrementa el


desorden en los alrededores. Esto es, los organismos vivos preservan su
orden interno, tomando energía libre de los alrededores y devolviendo
entropía y calor.

Las células son sistemas isotérmicos (e isobáricos), por lo que el calor en sí no


es de gran utilidad como fuente energética para la célula. En su lugar, la
Energía Libre de Gibbs, constituye el principal recurso energético para la
célula, convirtiéndola en ATP.
Entalpía, entropía y energía libre

Energía libre de Gibbs (G)


Representa la cantidad de energía con capacidad de realizar trabajo en una
reacción a temperatura y presión constante. Cuando la reacción procede de
forma a perder energía la variación total es negativa y la reacción es exergónica,
caso contrario endergónica

Entalpía (H)
Es la cantidad de calor contenida (Energía interna) en el sistema reaccionante.
Este representa la cantidad y tipos de enlaces químicos en los reaccionantes y
productos. Cuando en la reacción química se libera energía se dice que es
exotérmica, caso contrario endotérmica.

Entropía
Es una representación cuantitativa de la aleatoriedad o desorden de un sistema.

En las condiciones biológicas (Presión y Temperatura constante


La variación de energía libre ∆G es una magnitud diferente de la
variación de energía libre estándar ∆G’ᵒ. La última es de hecho
constante en las condiciones estándares (bioquímica). La relación
entre estas dos magnitudes es:

Las concentraciones de reaccionantes y productos no se refieren en


este caso a las del equilibrio sino a las concentraciones actuales de
la reacción (en el equilibrio obviamente ∆G=0)
Las reacciones redox también contribuyen a la energía libre:
Acoplamiento de reacciones
La variación de energía libre estándar ∆G’ᵒ, es aditiva:

Esta propiedad es la razón por la cual reacciones metabólicas endergónicas


pueden de todas formas ocurrir en acoplamiento con reacciones altamente
exergónicas
• Reacciones catabólicas son exergónicas (liberan
energía libre)

• Reacciones anabólicas son endergónicas


(consumen energía libre)

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