BIOLOGIA MOLECULAR

FACULTAD DE MEDICINA-UNSA
TOPICOS

VISION GENERAL
CODIGO GENETICO
COMPONENTES NECESARIOS PARA LA TRADUCCION
RECONOCIMIENTO DEL CODON POR EL tRNA
ETAPAS DE LA SISNTESIS DE PROTEINAS
ANTIBIOTICOS Y TRADUCCION
MEDICINA 2018
LUZ CARDENAS HERRERA
1. Visión General
El ADN se copia a sí mismo

El DNA se copia en RNA

El mRNA se copia en proteína

 RIBOSOMAS : es el lugar donde se sintetizan
transporta todas las proteínas
el aminoácido que será
incorporado en la proteína

contiene la información
requerida para dirigir la síntesis de la proteína
5’-AAGGGTACCCAACATTTAGTT-3’
3’-TTCCCATGGGTTGTAAATCAA-5’
DNA

5’-AAGGGUACCCAACAUUUAGUU-3’ RNA

N Lys.Gly.Ser.Gln.His.Leu.Val C Proteína
 Identifica la correspondencia entre una
secuencia de bases nucleotídicas y una
secuencia de aminoácidos

 Cada palabra del Código se compone de tres

bases nucleotídicas llamadas codones o
tripletes.
UUU AAA GGG CCC (codón)
Aa1 aa2 aa3 aa4 (aminoácido)
 Aparecen en el mRNA formados por
A, G, C y U. Se escriben del extremo 5´ al
extremo 3´

 Las 4 bases nucleotídicas se utilizan para

producir los codones de 3 bases. Por
consiguiente las bases se combinan de 64
formas diferentes
Como traducir un codón

61 codifican los 20 aminoácidos comunes

Codones de terminación (¨parada¨ o ¨ finalización de lectura¨ [nonsense])
1. Especificidad (No contiene ambigüedades):
Un codón particular siempre codifica el mismo aminoácido
1. Especificidad (No contiene ambigüedades):
Un codón particular siempre codifica el mismo aminoácido
2.- Es casi universal: todos los seres vivos lo emplean;
con ciertas excepciones, por ejemplo, el de las
mitocondrias que tiene algunas diferencias

 Las mitocondrias y los protozoos ciliados tienen algunos

codones diferentes

UGA en el ADN mitocondrial significa triptófano

3.- Es degenerado ( Redundante):

Un aminoácido puede ser codificado por

más de un codón. Arg es codificado por 6
codones diferentes.

Todos los aminoácidos, excepto Trp y Met, se

codifican por más de un codón
4.- Continuidad (No se solapa ni tiene puntuación)

El código no se sobrepone (non overlapping); se lee

desde un punto de inicio fijo como una secuencia
continua de bases, tomadas de tres en tres sin
ninguna puntuación entre los codones.
 No tiene puntos ni comas

- Las secuencias se leen a partir de un punto de inicio (AUG)

- El codón de iniciación establece el marco de lectura

- El resto de codones se leen a partir del de iniciación

- Los codones sinónimos difieren casi siempre en la última

base (las dos primeras especifican la identidad del
aminoácido)
5.- Contiene codones de iniciación y de
terminación :

- La secuencia AUG codifica el principio de la región

que se va ha traducir y al mismo tiempo sirve para
codificar el aminoácido metionina.

- GUG (en ciertas situaciones).

- Existen tres tripletes que no codifican ningún
aminoácido, son los tripletes “sin sentido”, de
“paro” o “stop”. Estos tripletes marcan el final
de la región a traducir, esto es el final de la
molécula proteica.

También se les conoce como codones de

terminación (UAA, UAG y UGA)
Cambiar una única base nucleotídica
en la cadena del mRNA (una mutación
puntual) pude conducir a :

Mutación silenciosa

Mutación de aminoácido o de
cambio de sentido (missense)

Mutación finalizadora (nonsense)

 Otras Mutaciones
a. Expansión de repeticiones trinucleotídicas
Una secuencia de tres bases que se repite en tándem
aumentara su longitud porque se amplifican
demasiadas copias del triplete.

Si ocurre dentro de la región codificante de un gen , la

proteína contendrá muchas copias adicionales de un
aminoácido.
Trastorno neurodegenerativo,
ocasionado por la amplificación del
codón CAG que conduce a la
inserción de muchas glutaminas
adicionales en la proteína
huntingtina, dando lugar a proteínas
inestables que se acumulan en forma
de agregados proteínicos
Si ocurre dentro de la región no
codificante de un gen , el
resultado podría ser una
disminución de la cantidad de
proteína sintetizada.
Distrofia Miotonica, Sindrome
X Frágil.
b. Mutaciones del sitio de corte y empalme
o ayuste

Alteran la forma en la que los intrones se eliminan de la molécula

de pre-mRNA, por lo que se producen proteínas aberrantes
Si se eliminan o añaden 1 o 2 nucleótidos a la
región codificante de una secuencia mensajera,
se producirá un desfase mutagénico por la
alteración del marco de lectura. Esto daría lugar
a un producto con una secuencia de
aminoácidos radicalmente diferente o un
producto truncado debido a la creación de un
codón de terminación prematuro
ORF
Existen tres posibles formas de leer una secuencia
de ADN dependiendo del punto de inicio. Cada
una de ella se denomina PAUTA DE LECTURA
(Reading Frame)

Secuencia: ACGACGACGACGACGACG
rf+1 ACG ACG ACG ACG ACG ACG
rf+2 CGA CGA CGA CGA CGA CGA CG
rf+3 GAC GAC GAC GAC GAC GAC GAC

Un marco de lectura sin un codón de terminación en 50 o

más codones se denomina marco de lectura abierta (open
reading frame: ORF);y es sólo 1 de las 3 posibles.
c. Mutaciones de cambio de marco de lectura

Si se añaden 3 nucleótidos se agrega un nuevo

aminoácido al péptido
Si se eliminan 3 nucleótidos, se pierde un aminoácido
En ambos casos el marco de lectura no se ve afectado,
La perdida de 3 nucleótidos mantiene el marco de lectura
pero puede dar lugar a enfermedades serias
 Fibrosis quística

Enfermedad hereditaria que afecta principalmente los

aparatos respiratorios y digestivo.
Hay una delección de 3 nucleótidos de la región codificante
de un gen, lo que ocasiona la perdida de la Fen en la posición
508 (∆F508) que impide que la proteína reguladora de la
conductancia transmembrana de la FQ (RCTFQ) se pliegue
correctamente, lo que conduce a la destrucción en el
proteosoma.
La RCTFQ funciona como un canal de cloro en las células
epiteliales y su perdida ocasiona la producción de secreciones
espesas y pegajosas en los pulmones y el páncreas, lo que
conduce a una lesión pulmonar y deficiencias digestivas.
 Aminoácidos que aparecerán en el producto acabado

 RNA de transferencia

 t-RNA – Aminoacil sintetasas

 RNA mensajero a traducir

 Ribosomas funcionales

 Factores proteínicos

 ATP y GTP son la fuente de energía

 Aminoácidos que aparecerán en el producto acabado

Todos los aminoácidos que al final aparecen en la proteína

acabada deben estar presentes en el momento de la síntesis

 RNA de transferencia

Es capaz de llevar un aminoácido específico y

reconocer el codón de dicho aminoácido.
tRNA funciona de molécula adaptadora
 tRNA

– Por cada aminoácido se requiere al menos un tipo de

tRNA especifico. En el hombre existen al menos 50 en
bacterias 30 a 40

• Transportan los aminoácidos activados hasta el

ribosoma

– Cada uno contiene un anticodón (complementario con

un codón del mRNA)
 El grupo hidroxilo en 3´ de la
ribosa de A forma una enlace
éster con el grupo carboxilo del
aminoácido

73 y93 nucleótidos (32 tRNA)

 Asa de la
Asa “D” Pseudouridina
Dihidrouracilo
Ribotimidina(T)
pseudouridina
indica que en la cadena del péptido creciente
hay que insertar el aminoácido cargado en
dicho tRNA
 Aminoacil-tRNA sintetasas

– Activan y unen a los aminoácido a sus correspondientes

tRNA

• Son altamente especificas para un aminoácido dado

• Interpretan el código genético
• Tienen capacidad de corrección de error

– Requieren ATP (2)

 mRNA
Molde con la secuencia organizada en
codones que hace de plantilla

• Los codones son “leídos” por

apareamiento específico con
anticodones de los aminoacil-tRNA

• Debe contener al menos una pauta abierta

de lectura

– En procariotas suelen existir mRNAs

policistrónicos (o poligénicos) que
contienen varias pautas abiertas de
lectura en tandem
Los mRNA de procariotas no tiene la terminación CAP(Cofia (CAP)
7metilguanina) ni poli A.
La secuencia característica de Shine-Dalgarno no esta presente en el mRNA
de eucariotes
Subunidad Ribosomal 30 S

4 a 9 residuos puricos,
que se encuentran
entre 8 y 13pb en el
lado 5’ del codon de
inicio
Señales de inicio de la traducción
 Ribosoma
Son grandes complejos de proteínas
y rRNA

• La subunidad menor se une

al mRNA y determina la
traducción exacta al
garantizar el
emparejamiento correcto de
bases del codón del mRNA y
el anticodon del tRNA
•La subunidad ribosómica mayor cataliza la formación de los enlaces
peptídicos que unen los aas de una proteína.
rRNA
Los rRNA tienen regiones ricas en
estructuras secundarias

Proteínas ribosómicas
Desempeñan funciones
estructurales y enzimáticas en el
ribosoma y en su interacción con
otros componentes del sistema
de traducción
Sitios A, P y E en el ribosoma

Durante la traducción al sitio A (aminoacil) se une el aminoacil-tRNA entrante .

Al sitio P (peptidil) esta ocupado por el peptidil-tRNA, que es el que lleva la cadena de
aminoácidos que se está sintetizando.

Al sitio E (expulsión) está ocupado por un tRNA vacío que está a punto de dejar el ribosoma
para la salida del tRNA
Localización Celular de los ribosomas

Ribosomas libres en el citoplasma

Proteínas propias de la célula

Ribosomas unidos a membranas del retículo

endoplásmico rugoso
Proteínas de exportación forman parte de la membrana
plasmática del RER, Golgi o incorporarse a los lisosomas

Ribosomas unidos a membranas mitocondriales

Proteínas de la mitocondria
 Factores proteínicos

Se requiere factores de iniciación, elongación y terminación.

Algunos tienen actividad catalítica, mientras que otros se

dedican a estabilizar la maquina de la síntesis
 ATP y GTP son la fuente de energía

Para añadir un aminoácido al péptido creciente se necesita romper 4

enlaces muy energéticos:

2 del ATP en la reacción de la aminoacil-tRNA-sintetasa . Uno cuando se

esciende el PPi y otro cuando se hidroliza a Fosforo inorganico
mediante la pirofosfatasa

2 del GTP uno para unir al aminoacil-tRNA al sitio A y otro para la

traslación del ribosoma

Se requiere más moléculas de ATP y GTP para la iniciación en los

eucariotes y una molécula más de GTP para la terminación
 Unión antiparelela entre el codón y el anticodón

Cuando se escriben las secuencias de codones y anticodones

siempre deben presentarse en el sentido 5´---3´
Reconocimiento del codón por el tRNA
 Hipótesis del balanceo
 Hipótesis del balanceo
Inosina

Hipótesis del balanceo

ETAPAS DE LA SINTESIS PROTEICA

Activación de los aminoácidos :

El ribosoma debe ser agrupado al mRNA

Iniciación El tRNA-iniciador debe ser colocado en el sitio P
El ribosoma debe estar posicionado en el
codón AUG

Unión del AA-tRNA entrante el sitio A

Elongación Formación del enlace peptídico
Translocación

Terminación ( Reciclamiento de ribosomas )

Plegamiento y modificaciones Post-traduccionales

RRF, EF-G,IF-3
 ETAPAS DE LA SINTESIS PROTEICA

1.- Activación de los aminoácidos

El grupo carboxilo de cada aminoácido debe ser activado para
facilitar la formación del enlace peptídico

La unión del aminoácido a un tRNA adaptador que asegura la

colocación apropiada del aminoácido en una cadena
polipeptidica en crecimiento
Citosol
ATP
Aminoacil-tRNA sintetasas dependientes de Mg 2+
tRNA aminoacilados se designan como cargados
1. Activación de los aminoácidos
ETAPAS DE LA SINTESIS PROTEICA
2.- Iniciación
El mRNA portador del código del polipéptido que
se ha de sintetizar se une a la subunidad menor y al
aminoacil-tRNA iniciador

La subunidad ribosómica mayor se une a continuación para

formar el complejo de inicio

El aminoacil t-RNA iniciador se aparea con el codón AUG del

mRNA, que señala el principio del polipéptido. Este requiere
de GTP, y de proteínas citosólicas especificas denominadas
factores de iniciación
2. INICIACION

Procariontes

-Subunidad ribosómica 30S

-mRNA que codifica el

polipéptido ha sintetizar

-fMet-tRNAfMet iniciador

-Factores de inicio IF-1, IF-2

e IF-3

-Subunidad ribosómica 50 S

GTP y Mg2+
 Ribosoma

homologo del extremo

5´ del RNA 23 S
de los procariontes
Inicio de la
traducción en
bacterias
 eIF4A

Complejo mayor eIF4F (eIF4A -helicasa)

 Cofia”(cap) 7-metilguanina

2. INICIACION

Eucariontes
RNA helicasa de eIF4A
Subunidad ribosómica 40S
proteina de unión a poli(A)
mRNA que codifica el polipéptido
que se va ha sintetiza
Casquete 7-metilguanosina

Met-tRNAMet iniciador Transloca a lo largo del mRNA

“escaneo”
11 Factores de inicio (eIFn) que helicasas

tienen 26 cadenas polipeptídicas

escaneo
Subunidad ribosomica 60 S

GTP

Mg2+

Sitio de entrada al
Ribosoma interno (IRES)
secuencias de RNA altamente
estructuradas
Factores proteicos requeridos para el inicio de la traducción en las bacterias y
en las células eucarióticas

Bacterias
Factor Función

IF- 1 Evita la unión prematura del tRNA al sitio A

IF- 2 Facilita la unión de fMet-tRNAfMet a la subunidad ribosómica 30S
IF- 3 Se une a la subunidad ribosómica 30S; impide la asociación; prematura de la
subunidad 50S; mejora la especificidad del sitio P hacia fMet-tRNA fMel

Eucariotas
Factor Función

elF2 Facilita la unión del Met-tRNAMet iniciador a la subunidad ribosómica 40S

elF2B, elF3 Primeros factores que se unen a la subunidad 40S; facilitan los pasos
posteriores
elF4A La actividad RNA helicasa elimina la estructura secundaria del mRNA para
permitir la unión de la subunidad 40S; es parte del complejo elF4F
elF4B Se une al mRNA; facilita el barrido del mRNA para localizar el primer AUG
elF4E Se une al casquete en 5' del mRNA; es parte del complejo elFAF
elF4G Se une a elF4E y a la proteína de unión a poli(A) (PAB); es parte del complejo
elF4F
elF5 Promueve la disociación de otros factores de inicio de la subunidad 40S como
preludio de la asociación de la subunidad 6OS para formar el complejo de
inicio 8OS
elF6 Facilita la disociación del ribosoma 8OS inactivo en subunidades 40S y 6OS
 ETAPAS DE LA SINTESIS PROTEICA
3.
3. ELONGACION

- Complejo de Iniciación 70S

- Aminoacil-tRNAs
- Factores de elongación
EF-Tu, EF-Ts y EF-G
- GTP
3.

- Complejo de Iniciación 70S

- Aminoacil-tRNAs
- Factores de elongación
EF-Tu, EF-Ts y EF-G
- GTP
Tres pasos:
1.Unión de un aminoacil-tRNA entrante (A)
2.Formación del enlace peptídico
3.Translocación
1. Unión de un aminoacil-tRNA
entrante
2. Formación del enlace
peptídico Peptidil transferasa
(ribozima rRNA 23S)
3. Translocación

Translocasa
Factores de elongación: eEF eEF  y eEF 2
 ETAPAS DE LA SINTESIS PROTEICA

4.- Terminación

5.- Plegamiento y Modificaciones pos.-traduccionales

 RF1: UAG y UAA
RF2: UGA y UAA

4. Terminación
RF1: UAG y UAA
RF2: UGA y UAA

3. Terminación en eucariotes
Tiene un solo factor de liberación eRF-1
que reconoce los 3 codones de
terminación
eRF-3 es esencial para la viabilidad de
la célula eucarionte

Factor de reciclado ribosómico

5’
Codones de
Terminación

3
UAA ’

UAG

UGA

i
Gl u
L e
n
Fe t
e
MNH 2
TERMINACION
Codones de
Terminación
Subunidad
Ribosomal
Menor A 3’
UA G
5’ UA A
UG

COO
H tRNA
mRNA

Subunidad
Ribosomal
Mayor

Leli
G
Fue
e
Mn
NH

t
2

Proteína
Una mutación en el gen eIF2B5 que codifica para el
eIF2B causa una enfermedad de la materia blanca
evanescente (VWM vanishing white matter)
Las células nerviosas del cerebro desaparecen y son
sustituidas por fluido cerebroespinal
Regulación de la traducción en eucariotes
modificación covalente de eFI-2 (fosforilado es inactivo)
5. Antibióticos y Traducción
 Eucariotes Procariotes

Union del mRNA a la La caperuza en el extremo 5´ Una secuencia especifica

subunidad pequeña del del mRNA se une a los eFI y cadena arriba del AUG
ribosoma a la subunidad ribosomica iniciador se une a su secuencia
40S. ElmRNA se explora en complementaria en el rRNA
busca del primer AUG 16S

Primer aminoácido Metionina Formil-metionina

Factores de iniciación eFI (12 a más) IF (3)

Ribosomas 80S (subunidad 40S y 60S) 70S (subunidad 30S y 50S)

 Inhibidores de la Traducción
ANTIBIOTICO EFECTO ESPECIFICO
Cicloheximida Inhibición de la actividad peptidil transferasa (eucariotes)
Ricina y -Sarcina Inactiva la subunidad 60 S eucarióticos al depurinar una adenosina específica del rRNA 28 S.

Toxina diftérica Inhibe la translocación en eucariotes : EF-2

Cloranfenicol Inhibición de la actividad peptidil transferasa (bacterias)
Lincomicina Inhibición de la actividad peptidil transferasa (bacterias)
Clindamicina Inhibición de la actividad peptidil transferasa (bacterias)
Tetraciclinas Interfiere con la unión del AA-t-RNA en el sitio A
Estreptomicina Se une a la subunidad 30 S y distorciona la lectura
Neomicina Inhibe la translocación en bacterias
Kanamicina Inhibe la translocación en bacterias
Gentamicina Inhibe la translocación en bacterias
Eritromicina Inhibe la translocación en bacterias
Tiostreptona Interfiere con la asociación de IF-2 y EF-G con el Centro de Unión al Facto
Acido Fusídico Evita la liberación de EF-G.GDP desde la subunidad 30 S en bacterias.
Kirromicina Libera EF-Tu. Evita los cambios conformacionales.
Higramicina B Evita la translocación del tRNA desde el sitio A al sitio P en eucariotes y en procariotes.

Puromicina Provoca la terminación prematura de la síntesis proteica tanto en procariotes y eucariotes.

Peptidil
puromicina