SESION 7.

METABOLISMO MICROBIANO
Y LAS RUTAS DE BIODEGRADACION
(OXIDATIVA Y REDUCTIVA)
 CONCEPTO DE METABOLISMO

En general el termino metabolismo se refiere al conjunto de reacciones químicas que tiene

lugar en la célula, y tiene tres funciones especificas a saber:

 Obtener energía química del entorno, almacenarla, para utilizar luego en diferentes funciones celulares,

 Convertir los nutrientes exógenos en unidades precursoras de los componentes macromoleculares de la

célula bacteriana,

 Formar y degradar moléculas necesarias para funciones celulares especificas, como por ejemplo, movilidad

y captación de nutrientes.

Konhauser, 2007
Los Organismos dentro de la biósfera intercambian
moléculas y energía

Energy of Useful chemical

sunlight bond energy

Light (via plants)

complex carbon,
glucose, amino acids
Autotrophs:
Phototrophs Heterotrophs
& chemotrophs
CO2, H2O (e.g. some bacteria,
animals, humans)

Chemical oxidations
(via iron & sulfur bacteria) Need 9 amino acids & 15
vitamins from outside
sources
METABOLISMO HETEROTROFICO
Interconversión de materia y energía

Catabolismo Anabolismo
(rompimiento): (sintesis):
Produce Acoplados Requiere
energía energía,
 Reacciones metabólicas
Los contaminantes con mayor solubilidad tendrán mayor
biodisponibilidad y sufrirán diferentes transformaciones
microbianas en procesos metabólicos.

Transformaciones metabólicas:
• Catabolismo - Oxidación / Reducción (Aerobio – Anaerobio
– Aceptor final de electrones)
• Anabolismo – Síntesis
 EXPLICACION DE LOS PRINCIPALES GRUPOS

 Los quimiolitoautótrofos obtienen energía de la oxidación de compuestos inorgánicos y el carbono de la fijación del dióxido de
carbono. Ejemplos: bacterias nitrificantes, bacterias oxidantes del azufre, bacterias oxidantes del hierro (Bacterias generadoras del
DAM) y bacterias oxidantes del hidrógeno (Bacterias degradadoras de compuestos clorados).
 Los fotolitoautótrofos obtienen energía de la luz y el carbono de la fijación del dióxido de carbono, usando compuestos inorgánicos
como equivalentes reductores. Ejemplos: Cyanobacteria (agua como equivalente reductor), Chlorobiaceae, Chromaticaceae (sulfuro
de hidrógeno), Chloroflexus (hidrógeno).
 Los quimiolitoheterótrofos obtienen energía de la oxidación de compuestos inorgánicos, pero no pueden fijar el dióxido de
carbono. Ejemplos: algunos Nitrobacter spp., Wolinella (con hidrógeno como equivalente reductor), algunas bacterias oxidantes del
hidrógeno, también se tienen las sulfatoreductoras.
 Los quimioorganoheterótrofos obtienen energía, carbono y equivalentes reductores para las reacciones biosintéticas de
compuestos orgánicos. Ejemplos: la mayoría de las bacterias, como Escherichia coli, Bacillus spp., Actinobacteria.
 Los fotoorganotrofos obtienen energía de la luz y el carbono y los equivalentes reductores para las reacciones biosintéticas de
compuestos orgánicos. Algunas especies son terminantemente heterótrofas, pero muchas otras pueden también fijar el dióxido de
carbono y son mixótrofas. Ejemplos: Rhodobacter, Rhodopseudomonas, Rhodospirillum, Rhodomicrobium, Rhodocyclus,
Heliobacterium, Chloroflexus (alterna con fotolitoautotrofía con hidrógeno).
A través de que parte de la célula las bacterias liberan energía?

- Eucariotas: mitocondria
- Procariota (Arqueas): membrana citoplasmática
QUE USAN LAS BACTERIAS PARA LOGRAR EL PROCESO METABOLICO ????
file:///C:/Users/user/Downloads/SusanaSavalBohorquez.pdf
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 Metabolismo
microbiano
Muchos compuestos
sintéticos son similares a
los compuestos
naturales por lo que
pueden ser también
degradados por medio
del metabolismo
microbiano
¿Cuál es el reto para el metabolismo microbiano?

Los compuestos Xenobióticos son resistentes o son metabolizados

parcialmente con el resultado de que en su mayoría quedan acumulados
en el ambiente o algunos de sus subproductos.

Los compuestos Xenobióticos son recalcitrantes ya que algunos poseen

incapacidad para inducir la síntesis de las enzimas degradadoras, la
incapacidad del compuesto para entrar a la célula microbiana y la
toxicidad excesiva del compuesto.
Aplicación - Metabolismo
microbiano

Ruta metabólica
para el Tolueno
 Dicloro Difenil Tricloroetano
“DDT”

DDDE
Dicloro Difenil Dicloro etileno
Cuidado con los
compuestos
resultantes y/o
intermedios
 Transformaciones enzimáticas
De acuerdo al tipo de reacción química, las enzimas se
clasifican en 6 grandes grupos:

http://sgpwe.izt.uam.mx/files/users/uami/acym/Reacciones_metabolicas_1.pdf
Karigar and Rao, 2011
 EL COMETABOLISMO
Los microorganismos tiene la habilidad de transformar moléculas orgánicas y generar productos orgánicos.

Se ha encontrado de manera análoga que los microorganismos transforman importantes sustancias químicas sintéticas.

QUE ES EL COMETABOLISMO?

Es la transformación bacteriana de un compuesto orgánico (Sintético…o no) el cual no sirve como fuente de energía.

SUSTRATOS Y REACCIONES

Un número importante de sustancias químicas están sujetas a cometabolismo:

- Ciclohexano… - Pseudomonas
- PCB’s - Acinetobacter
- 3 Trifluorometilbenzoato - Nocardia
- - Bacillus
Clorofenoles
- Methilosinus
- 3,4 dicloroanilina - Alcaligenes
- 1,3,5 Trinitrobenceno - Rodococus
- Micobacterium
Juan Pablo Salazar Giraldo, Geólogo, Ph D.
Curso de Biorremediación de aguas y suelos. Alexander, 1999
 COMETABOLISMO
 El cometabolismo microbiano, es decir, la transformación de un compuesto, llamado cosustrato, es parte fundamental
de la eliminación biológica de compuestos xenobioticos en el ambiente.

 Varios compuestos sintéticos y orgánicos, que son tanto de importancia ambiental como toxicológica son degradados
por cometabolismo.

 El término cometabolismo define la transformación de un compuesto llamado cosustrato, en presencia obligada de un

sustrato durante el crecimiento o por células en reposo en ausencia del sustrato de crecimiento.

 El cometabolismo ocurre cuando una enzima producida por un organismo para catalizar la degradación de su sustrato
de crecimiento para derivar energía y carbono de él también es capaz de degradar compuestos adicionales. La
degradación fortuita de estos compuestos adicionales no favorece el crecimiento de las bacterias, y algunos de estos
compuestos pueden incluso ser tóxicos en determinadas concentraciones para las bacterias.

 El primer informe de este fenómeno fue la degradación del etano por la especie Pseudomonas methanica . Estas
bacterias degradan su sustrato de crecimiento metano con la enzima metano monooxigenasa (MMO) . Se descubrió
que el MMO es capaz también de degradar etano y propano, aunque las bacterias no pudieron utilizar estos
compuestos como fuentes de energía y carbono para crecer.

 El cosustrato o cometabolito no aporta energía, carbono o algún otro nutriente y en consecuencia es incapaz de
soportar la replicación celular.
García-Rivero1y Peralta-Pérez, 2008
 En general las transformaciones cometabólicas ocurren
cuando la enzima de un microorganismo que crece a
partir de un sustrato “A” reconoce al compuesto “B”
como sustrato y lo transforma en un producto.

La transformación es generalmente limitada por que las

siguientes enzimas de la ruta metabólica suelen tener
una especificidad mayor y no reconocen al producto de
https://slideplayer.es/slide/5382603/ “B” como sustrato
 COMETABOLISMO

 Otro ejemplo es Mycobacterium vaccae , que utiliza una enzima alcano monooxigenasa para oxidar el propano.
Accidentalmente, esta enzima también oxida, sin costo adicional para M. vaccae , ciclohexano en ciclohexanol . Por
tanto, el ciclohexano se co-metaboliza en presencia de propano. Esto permite el crecimiento comensal de Pseudomonas
en ciclohexano.

 Se debe aclarar que la presencia del cosustrato no induce la actividad de las enzimas involucradas en su
transformación, ya que se trata de una transformación colateral a la degradación del sustrato el cual sí induce la
actividad enzimática.

 El término Co metabolismo actualmente se ha extendido para incluir diversas reacciones como son hidroxilaciones,
desnitración, desaminación, hidrólisis, y rompimiento de enlaces éter.

 El cometabolismo de xenobióticos en ambientes naturales ocurre a tasas lentas, porque las poblaciones microbianas
son pequeñas y no se incrementan en respuesta a la introducción de esos compuestos en el ambiente.

 En un sistema donde coexisten el sustrato y el cosustrato, la tasa de consumo del cosustrato (cometabolismo) está
ligada a la tasa de consumo del sustrato y tiende a disminuir con el agotamiento del sustrato o con la acumulación de
productos tóxicos.

García-Rivero1y Peralta-Pérez, 2008

 García-Rivero1y Peralta-Pérez, 2008

Sin embargo, las dificultades y los altos costos de mantener los sustratos de crecimiento de los organismos capaces de
cometabolizar los compuestos peligrosos (Co sustratos) y proporcionarles un ambiente aeróbico han llevado a la
aplicación limitada a escala de campo del cometabolismo para la degradación de solventes orgánicos.
 EL COMETABOLISMO
El cometabolismo aunque genera productos orgánicos, el carbono no se convierte en biomasa y puede acumularse.

RAZON??

La enzima inicial lo convierte el sustrato inicial en un primer producto, que luego no puede ser transformado por otra
Enzima del mismo microorganismo para producir metabolitos que puedan ser usados en procesos nmetabólicos.

Por ejemplo:

2,4 D 2,4 diclorofenol 3,5 diclorocatecol (Se puede acumular en el medio…)

En el cometabolismo si las concentraciones son altas se puede generar toxicidad.

Ejemplo: Cometabolismo de Benzoato por Pseudomonas

Benzoato 2-Fluorbenzoato Productos fluorinados tóxicos

Alexander, 1999

Juan Pablo Salazar Giraldo, Geólogo, Ph D.

Curso de Biorremediación de aguas y suelos.
 EL COMETABOLISMO

Aunque en un cultivo los cometabolitos se acumulan, en el ambiente natural (Suelo, agua), no pasa lo mismo…

Por que?

Los cometabolitos pueden ser sustrato o cosustrato de otra cepa bacteriana y luego ser mineralizados.

Ejemplos:

- Paratión se cometabolizado por Pseudomonas S, y produce 4 – Nitrofenol y Di etil fosfato.

El 4 – Nitrofenol es metabolizado por Psedomonas aeruginosa y lo usa como fuente de carbono y energía

- El DDT es cometabolizado a Acido 4 Clorofenil acético por Psedomonas y el cometabolito es usado por Acinetobacter

Alexander, 1999

Juan Pablo Salazar Giraldo, Geólogo, Ph D.

Curso de Biorremediación de aguas y suelos.
LAS RUTAS DE BIODEGRADACION
(OXIDATIVA Y REDUCTIVA)
 LOS TIPOS
DE
RESPIRACIO
N

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 Ambos sirven en los
Procesos de biorremediación

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http://krockne.people.uic.edu/proceeding9.pdf
 CUANDO EL
CONTAMINANTE
ES UTILIZADO
COMO SUSTRATO
PRIMARIO

SE OXIDA…

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 CUANDO EL
CONTAMINANTE
ES UTILIZADO
Gana
COMO SUSTRATO
PRIMARIO

SE REDUCE…

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 Puede ser aerobia
o Anerobia

Normalmente aerobia

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Y QUE ES
LO QUE
OCURRE?
Y QUE ES
LO QUE
OCURRE?
Y QUE ES
LO QUE
OCURRE?

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 RUTA O
TENDENCIA
AEROBIA

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 RUTA O
TENDENCIA
AEROBIA
 RUTA O
TENDENCIA
AEROBIA

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 RUTA O
TENDENCIA
ANAEROBIA

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 RUTA O
TENDENCIA
ANAEROBIA
 RUTA O
TENDENCIA
ANAEROBIA

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 RUTA O
TENDENCIA
ANAEROBIA

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 SIN EMBARGO
HAS COMPUESTOS
XENOBIOTICOS
QUE SE DEGRADAN
POR AMBAS
RUTAS
 POR QUE ES
IMPORTANTE
CONOCER LAS RUTAS
DE DEGRADACION?
 POR QUE ES
IMPORTANTE
CONOCER LAS RUTAS
DE DEGRADACION?
 POR QUE ES
IMPORTANTE
CONOCER LAS RUTAS
DE DEGRADACION?
 Leer el documento:

Degradación microbiana de compuestos Xenobióticos

El cual será utilizado para iniciar la sesión del lunes 5 de

octubre