Professional Documents
Culture Documents
Page 2
SASARAN BELAJAR
Mampu mengenali perbedaan jenis sel yang ada di kehidupan ini Mampu membedakan organel-organel yang terdapat di dalam sel Mampu menjelaskan fungsi dari masing-masing organel yang terdapat di dalam sel Mampu membedakan antara sel prokariotik dan eukariotik
Page 3
SEL
Sel sebagai unit struktural Sel sebagai unit fungsional Sel-sel penyusun tubuh makhluk hidup melakukan suatu fungsi atau kegiatan proses hidup Fungsi : respirasi, ekskresi, transportasi, sintesis, reproduksi, sekresi dan respon (tanggapan) terhadap rangsang Sel sebagai unit hereditas Menurunkan sifat genetis dari satu generasi ke generasi berikutnya
Page 5
Mikroskop
Penemuan dan awal pengamatan terhadap sel mengalami perkembangan adanya mikroskop di abad 17 Pada mikroskop cahaya dapat memungkinkan untuk melihat spesimen melalui beberapa tumpukan lensa Lensa-lensa menggunakan cahaya yang ada sehingga memungkinkan gambar dapat dilihat oleh mata atau melalui layar video
Page 6
Sel memiliki ukuran yang sangat kecil, antara 10 100 m Mata telanjang manusia hanya dapat melihat obyek kecil berukuran sekitar 0.2 mm (200 m) Jenis Mikroskop : mikroskop cahaya : digunakan untuk melihat sel sampai dengan pembesaran 2000 kali mikroskop elektron : digunakan untuk melihat sel sampai dengan pembesaran 500.000 kali
Page 7
MIKROSKOP
Page 8
MIKROSKOP
Page 9
MIKROSKOP ELEKTRON
SEM (Scanning Electron Microscope) : untuk melihat permukaan obyek, seperti permukaan bakteri atau permukaan mata serangga TEM (Transmission Electron Microscope) : untuk melihat benda irisan ultra mikro, sehingga isi sel terlihat sangat rinci, seperti irisan melintang mitokondria dengan krista yang jelas, atau kloroplas dengan struktur stroma dan grana yang jelas
Page 10
Page 11
Kisaran Ukuran Sel Sebagian besar sel berdiameter antara 1 sampai 100 m sehingga hanya bisa dilihat dengan menggunakan mikroskop. Perhatikan bahwa skala yang dipakai berupa logaritma untuk mengakomodasi kisaran ukuran yang ditunjukkan. Skala dimulai di bagian atas dengan 10 meter dan menurun, setap pengukuran di sisi kiri menunjukkan pengecilan ukuran sepuluh kali
Page 12
Teknik pengamatan spesimen mengalami perkembangan pada abad 20, menjadi semakin kontras dan dapat melihat komponenkomponen sel yang utama dan dapat diberi nama
Page 13
Sementara mikroskop cahaya dapat digunakan untuk melihat sel-sel individual, sedangkan yang lainnya tidak dapat digunakan untuk melihat bagian dalam tubuh, terutama organel-organel Untuk memperjelas struktur-struktur yang lebih kecil dapat digunakan mikroskop elektron (EM), dimana dengan bantuan elektron melalui spesimen atau melalui permukaannya Karena pembesaran ada hubungan dengan penggunaan panjang gelombang, mikroskop elektron dengan panjang gelombang yang lebih pendek lebih baik penglihatannya Secara teoritis, resolusi dari EM modern dapat mencapai 0.1 nanometer (nm), tetapi secara penggunaannya terbatas hanya sampai 2 nm
Page 14
Transmission electron microscopes (TEMs) are digunakan terutama untuk mempelajari bagian dalam sel secara ultra struktur A TEM tujuannya menggunakan elektron menembus potongan tipis dari spesimen Gambar sangat fokus dan bagus dengan adanya elektromagnet Untuk meningkatkan daya kontrasnya, potongan tipis spesimen yang telah diwarnai dengan atomatom dan logam berat etals.
Page 15
Mikroskop elektron digunakan untuk melihat organel, tetapi organel hanya dapat dilihat pada sel-sel yang sudah mati dan kemungkinan memperlihatkan beberapa artefak Mikroskop cahaya tidak memiliki resolusi yang tinggi, tetapi dapat digunakan untuk mempelajari sel-sel yang hidup Mikroskop adalah peralatan utama yang digunakan dalam sitologi, yaitu ilmu yang mempelajari struktur sel Sitologi ada hubungannya dengan ilmu biochemistry, yaitu ilmu yang mempelajari tentang molekul dan proses kimia dalam metabolisme, pengembangan ke dalam biologi sel modern
Page 16
FRAKSIONASI SEL
Sel yang dikacaukan disentrifugasi pada berbagai kecepatan dan jangka waktu yang berbeda untuk mengisolasi komponen-komponen yang ukurannya berbeda. Proses ini dimulai dengan homogenisasi, pengacauan jaringan dan selnya dengan bantuan peralatan seperti blender dapur atau peralatan ultrasuara. Homogenat, campuran organel-organel yang mirip sup, sedikit membran, dan molekul-molekul dari sel yang rusak, kemudian difraksionasi dengan serangkaian pemutaran dalam suatu alat sentrifuge. Setelah masing-masing tahap sentrifugasi, bagian yang tidak membentuk pelet, atau supernatan, dituang dan disentrifugasi lagi, dengan kecepatan yang lebih tinggi. Dengan menentukan fraksi-fraksi sel mana yang berkaitan dengan proses metabolisme tertentu, fungsinya dapat dikaitkan dengan organel-organel tertentu
Page 17
Prosesnya disebut ultracentrifuge, yaitu suatu alat yang dapat memutar hingga 130,000 revolutions per menit dan memiliki daya gravitasi lebih dari 1 juta kali (1,000,000 g). Proses fraksinasi dimulai dengan homogenisasi, secara perlahan masuk ke dalam sel
Page 18
Fraksionasi sel menyediakan jumlah komponen sel yang khusus Hal ini dimungkinkan untuk melihat fungsi-fungsi organel yang akan diisolasi, terutama berdasarkan reaksinya atau proses katalisis oleh proteinnya Sebagai contoh, fraksi satu sel banyak terdapat di dalam enzim yang berfungsi di dalam proses respirasi seluler Electron microscopy memperlihatkan kembali hasil fraksi banyak terdapat di dalam organel yang disebut dengan mitokondria Sitologi dan biokimia ada hubungannya dengan struktur selular dan fungsinya
Page 19
Sel prokariotik dan sel eukariotik dapat dibedakan atas ukuran dan kompleksitas 2. Membran internal (dalam) mengatur fungsi dari sel eukariotik
1.
Page 20
Sel prokariotik dan sel eukariotik dapat dibedakan atas ukuran dan kompleksitas
Semua sel dikelilingi oleh membran plasma Substansi semicair di dalam membran disebut cytosol, mengandung organel-organel Semua sel mengandung kromosom yang juga memiliki gen-gen dalam bentuk DNA. Semua sel juga memiliki ribosom, merupakan organel yang kecil yang dapat membuat protein dengan menggunakan instruksi di dalam gen
Page 21
Perbedaan yang utama antara sel prokariotik dan sel eukariotik adalah lokasi dari kromosom Pada sel eukariotik, kromosom terdapat di dalam membran yang menutupi organel disebut nucleus. Pada sel prokariotik, DNA dikonsentrasikan dalam nucleoid tanpa membran yang memisahkannya dari sisa sel yang lainnya
Page 22
SEL PROKARIOTIK
Adalah sel tanpa membran inti Berukuran 1 10 m Memiliki materi genetik berupa DNA yang tidak dibungkus membran inti yang berbentuk sirkuler NUKLEOID Di luar nukleoid terdapat DNA sirkuler lain dengan ukuran yang lebih kecil PLASMID Sebagian besar mempunyai dinding sel Aktivitas sel terjadi pada membran plasma dan di dalam sitoplasma Contoh : sel bakteri dan Cyanobakteri
Page 23
Page 24
SEL PROKARIOTIK Prokariota merupakan bakteri, termasuk sianobakteri (a) Melukiskan bakteri berbentuk batang. Karena tidak mempunyai organel terbungkus membran seperti pada eukariota, prokariota jauh lebih sederhana strukturnya. Area tempat DNA disebut daerah nukleoid, dan tidak ada membran yang memisahkan DNA dari bagian sel lainnya. Prokariota memiliki banyak ribosom, yang merupakan tempat sintesis protein. Batas sel ialah membran plasma. Di luar membran plasma ini terdapat dinding sel yang cukup kaku yang seringkali berupa kapsul luar, yang biasanya mirip jeli. Sebagian bakteri memiliki flagela (organel pergerakan), vili (struktur pelekatan), atau keduanya yang menonjol dari permukaannya. Page 25 (b) Mikrograf elektron ini menunjukkan irisan tipis bakteri Bacillus coagulans
Page 26
ORGANISME PROKARIOTIK
Umumnya adalah bakteri yang hidupnya tergantung pada ketersediaan makanan di lingkungan sekitranya Gen-gen (DNA) bakteri hanya diekspresikan untuk menyesuaikan diri dengan lingkungannya Untuk adaptasi yang cepat, bakteri mampu mencetak protein enzim (biokatalisator) dalam waktu < 20 menit dengan mengubah substrat kimia yang tersedia
Page 27
Page 28
SEL EUKARIOTIK
Sel yang memiliki membran inti terjadi pemisahan antara inti sel dengan sitoplasma Berukuran 10 100 m Materi genetik (DNA) berada di dalam inti sel yang dibungkus oleh membran inti Mempunyai sejumlah organel yang masing-masing memiliki fungsi spesifik Contoh : sel ragi (khamir), sel protozoa (Amoeba), sel tumbuhan dan sel hewan
Page 29
Page 30
Dalam sel eukariotik, kromosom terdapat dengan selaput membran nuklear Daerah antara nukleus dan membran plasma adalah sitoplasma Semua bahan yang terdapat di dalam membran plasma sel prokariota adalah sitoplasma Di dalam sitoplasma sel eukariotik terdapat berbagai jenis membran yang mengelilingi organel-organel berdasarkan bentuk dan fungsi yang khusus Membran yang mengelilingi organel tidak dijumpai pada sel prokariotik
Page 31
Page 32
1.
Dalam sembarang satuan panjang, sel kecil ini berukuran 1 pada setiap sisi. Kita kemudian dapat menghitung luas permukaan sel (dalam satuan persegi), volume (dalam satuan kubik), dan rasio luas permukaan terhadap volume Begitu ukuran sel naik ke 5 satuan panjang untuk tiap sisi, rasio luas permukaan terhadap volume akan berkurang jika dibandingkan dengan sel yang lebih kecil. Laju pertukaran kimiawi dengan lingkungan ekstraseluler mungkin saja tidak cukup untuk memelihara sel karena sebagian besar sitoplasmanya relatif jauh dari membran luar Dengan membagi sel besar menjadi banyak sel yang lebih kecil, kita mendapatkan rasio luas permukaan terhadap volume yang dapat memenuhi kebutuhan setiap sel untuk memperoleh nutrien dan mengeluarkan produk limbah
2.
3.
Page 33
Page 34
Membran plasma berfungsi sebagai barrier yang selektif yang mengijinkan alur oksigen, nutrisi dan sisa untuk semua volume sel
Page 35
Gambar. 7.6
MEMBRAN PLASMA
1. Pada mikrograf elektron dengan pembesaran yang cukup, membran plasma tampak sebagai sepasang pita gelap yang dipisahkan oleh pita terang. Yang ditunjukkan disini ialah membran sel darah merah (TEM) Membran plasma dan berbagai macam membran internal sel terdiri atas lapisan ganda fosfolipid dengan protein yang mempunyai berbagai fungsi dilekatkan pada atau ditanamkan didalamnya. Fungsi spesifik membran plasma dan berbagai tipe membran di dalam sel bergantung pada jenis fosfolipid dan protein yang ada. Membran plasma juga memiliki karbohidrat yang melekat pada permukaan luarnya
2.
3.
Page 36
Page 37
Page 38
FOSFOLIPID BILAYER
Page 39
FOSFOLIPID BILAYER
Page 40
Page 41
Page 42
Page 43
Page 45
Inti sel mengandung bahan-bahan genetis pada sel eukariota 2. Ribosom membentuk sel-sel protein
1.
Page 46
Page 48
(a) Di dalam nukleus terdapat kromatin, yang terdiri atas DNA dan protein. Apabila sebuah sel bersiap membelah, tiaptiap kromosom menjadi terlihat karena kromatin memadat. Nukleolus berfungsi dalam sintesis ribosom. Selubung nukleus, yang terdiri atas dua membran yang dipisahkan oleh ruang sempit, mempunyai beberapa pori (b) Banyak pori nukleus pada selubung nukleus terlihat jelas dalam mikrograf elektron, yang dipersiapkan dengan metode yang disebut patah beku (TEM) (c) Selubung nukleus (d) Mikrograf elektron dari permukaan luar selubung mengungkapkan bahwa setiap pori dibatasi oleh cincin partikel protein (TEM) (e) Lamina nukleus mirip jaring melapisi permukaan bagianbagian dalam selubung dan memperkuat bentuk nukleus Page 49 (TEM)
Di dalam nukleus, DNA dan protein terorganisasi ke dalam bahan fibrous, yang disebut kromatin Pada sel yang normal akan muncul sebagai massa difusi Bagaimanapun pada saat sel terpisah melalui proses pembelahan, serabut kromatin terlihat seperti bentuk atau struktur yang terpisah disebut kromosom Masing-masing sel eukariotik memiliki jumlah kromosom yang karakteristik Sel manusia pada umumnya memiliki 46 kromosom, tetapi sel kelamin (sel telur dan sperma) hanya memiliki 23 kromosom
Page 50
Page 51
SITOSKELETON
Fungsi : Sebagai rangka sel yang memberi dan men jaga bentuk sel Sebagai pengatur gerakan sel, misalnya pada Amoeba Sebagai pengatur gerakan kromosom ke arah kutub pada saat membelah secara mitosis maupun meiosis
Page 53
SITOSKELETON
Page 54
SITOSKELETON
Sitoskeleton membuat sel mempunyai bentuk, merupakan tempat tertambatnya beberapa organel dan mengarahkan gerakan yang lain, dan mungkin membuat seluruh sel dapat bertukar bentuk atau bergerak. Sitoskeleton bahkan mungkin mempunyai pengatur yang penting, dengan secara mekanis menghantarkan sinyal dari permukaan sel ke bagian dalamnya. Dalam mikrograf elektron ini, yang dipersiapkan dengan metode yang dikenal sebagai pengetsaan dalam, tampak mikrotubula dan mikrofilamen. Komponen ketiga sitoskeleton, filamen intermediet, tidak terlihat disini (TEM).
Page 55
Page 56
RIBOSOM
Merupakan butiran kecil nukleoprotein yang tersebar di dalam sitoplasma Bahan penyusun ribosom : protein RNA ribosomal (rRNA) tersebar bebas di dalam sitoplasma Ada juga yang melekat pada retikulum endoplasma Fungsi : Melangsungkan sintesis protein Ribosom bebas mensintesis protein yang nantinya terletak di dalam sitoplasma Ribosom yang melekat untuk sintesis protein yang hasil peptidanya masuk ke lumen RE
Page 57
Gambar. 7.10
Page 58
RIBOSOM
Baik ribosom bebas maupun ribosom terikat melimpah jumlahnya dalam mikrograf elektron bagian sel pankreas ini (TEM). Pankreas merupakan kelenjar yang terspesialisasi untuk mensekresi protein. Pankreas ini mensekresi hormon, termasuk protein insulin, ke dalam aliran darah, dan mensekresi enzim pencernaan, yang juga protein, ke dalam usus halus. Ribosom terikat, ribosom yang terlihat dilekatkan pada retikulum endoplasmik (RE), menghasilkan protein sekretoris. Ribosom bebas terutama membuat protein yang akan tetap terlarut dalam sitosol. Ribosom terikat dan bebas itu identik dan dapat saling berganti peran
Page 59
Page 60
SISTEM ENDOMEMBRAN
Page 61
RETIKULUM ENDOPLASMIK RE merupakan sistem membran dari tubula dan kantong pipih saling terhubung yang disebut sisternae, yang juga bersambung dengan selubung nukleus. Membran RE menyelubungi ruangan yang disebut ruang sisternae. RE kasar, yang pada permukaan luarnya terdapat tonjolan ribosom, dapat dibedakan dari RE halus dalam mikrograf elektron (TEM)
Page 63
BADAN GOLGI
Merupakan kantong pipih yang bertumpuk, terikat membran, yang tersusun dari ukuran besar sehingga ukuran kecil Fungsi : Memproses protein dan molekul lain yang akan dibawa keluar sel atau ke membran sel Glikosilasi (penambahan oligosakarida) pada protein Terdapat pada sel-sel : Sel kelenjar pencernaan laktase, sukrase dan peptidase Sel kelenjar pankreas lipase dan tripsin Kelenjar air ludah amilase Kelenjar air mata protein (antibodi)
Page 64
GLIKOSILASI
Merupakan salah satu modifikasi protein setelah sintesisnya selesai Penting untuk penanda protein-protein ekstraseluler Contoh glikoprotein dapat dikenali dengan baik karena adanya protein pengenal glikoprotein LEKTIN yang berasal dari biji kacang-kacangan
Page 65
APARATUS GOLGI
Page 66
APARATUS GOLGI
Aparatus Golgi terdiri atas tumpukan kantong pipih, atau sisternae, tidak seperti sisternae RE yang terhubung secara fisik. Aparatus ini menerima dan mengirimkan vesikula transpor serta produk yang dikandungnya. Materi yang diterima dari RE dimodifikasi dan disimpan dalam aparatus Golgi dan akhirnya dikirim ke permukaan sel atau tujuan yang lain. Perhatikan vesikula yang bergabung dan meninggalkan sisternaenya. Satu tumpukan memiliki polaritas struktural dan fungsional, dengan muka cis yang menerima vesikula dan muka trans yang mengirim vesikula Page 67 (TEM)
LISOSOM
Merupakan vesikel membran berkantong yang mengandung enzim hidrolitik yang bersifat asam Terbentuk dari pertunasan vesikel yang mengandung badan Golgi Fungsi : Untuk mencerna secara intraseluler dan merusak sel-sel asing Terdapat enzim-enzim yang berfungsi untuk menghidrolisis materi seluler asing : DNA, RNA, protein dan lipid
Page 68
ENZIM DI LISOSOM
nuklease berfungsi menghidrolisis DNA dan RNA protease berfungsi menghidrolisis protein lipase berfungsi menghidrolisis lipid fosfatase berfungsi menghidrolisis oligonukleotida enzim lain berfungsi menghidrolisis karbohidrat polisakarida dan oligosakarida
Page 69
Dalam sel darah putih tikus ini, lisosom sangat gelap karena pewarnaan spesifik yang bereaksi dengan salah satu produk pencernaan di dalam lisosom. Jenis sel darah putih ini menelan bakteri dan virus sekaligus menghancurkannya dalam lisosom (TEM) Page 70
Page 71
Page 73
1. Mitokondria 2. Peroksisom
Page 74
MITOKONDRIA
Organel bermembran rangkap yang sangat penting untuk metabolisme energi dalam sel Menghasilkan energi tinggi (ATP) Terdiri dari : Membran luar berfungsi sebagai pembatas antara bagian dalam mitokondria dengan sitoplasma Membran dalam yang berlekuk-lekuk krista berfungsi untuk melangsungkan rantai respirasi menghasilkan ATP Matriks mitokondria berfungsi untuk oksidasi asam lemak dan katabolisme asetil koenzim mengandung DNA mitokondria yang menyediakan gen-gen untuk diekspresikan menjadi protein membran dalam rantai respirasi
Page 75
MITOKONDRIA, TEMPAT RESPIRASI SELULER Dua membran mitokondria terlihat jelas dalam mikrograf (TEM) Krista yang berlekuk-lekuk merupakan membran dalam. Gambar potongan ini memperlihatkan dua ruang yang dipisahkan oleh membran : ruang intermembran dan matriks mitokondria
Page 76
PEROKSISOM
Berbentuk seperti lisosom Berisi enzim oksidatif dan katalase Enzim oksidatif mentransfer hidrogen dari berbagai substrat ke oksigen menghasilkan produk sampingan berupa hidrogen peroksida (H2O2) racun H2O2 enzim katalase H2O + O2
Page 77
Peroksisom berbentuk agak bulat dan sering memiliki inti butiran atau kristal yang mungkin saja merupakan kumpulan banyak enzim. Peroksisom ini berada dalam sel daun. Perhatikan kedekatannya dengan dua kloroplas dan satu mitokondrion. Organel-organel ini bekerjasama dengan peroksisom dalam fungsi metabolisme tertentu (TEM)
Page 78
SENTRIOL
Merupakan sepasang struktur seperti silinder yang memiliki lubang di tengah Terdiri dari protein mikrotubulus Anggota pasangan sentriol biasanya terletak pada posisi menyudut ke arah kanan satu sama lain Mempunyai mikrotubulus yang membentuk suatu struktur protein seperti jala yang tampak berlekatan dengan kromosom selama pembelahan sel (mitosis) benang spindel Berperan untuk mengatur polaritas (kutub) pembelahan sel dan mengatur pemisahan kromosom selama pembelahan sel
Page 79
Sel hewan memiliki sepasang sentriol dalam sentrosom, daerah di dekat nuklus tempat mikrotubula sel berawal. Sentriol, masingmasing kira-kira berdiameter 250 nm (0.25 mikron), disusun saling tegak lurus, dan masing-masing terdiri atas sembilan set, masingmasing sel terdiri atas 3 mikrotubula (TEM)
Page 80
Flagela biasanya berombak-ombak, gerakannya yang mirip ular menggerakkan sel dalam arah yang sama dengan sumbu flagela. Perjalanan sel sperma merupakan contoh pergerakan flagela (SEM)
Page 81
Suatu permukaan yang penuh dengan silia yang bergetar menutupi Paramecium, protista yang motil (SEM). Silia bergetar pada laju sekitar 40 60 kibasan per detik. Silia memiliki gerak maju mundur, kibasan aktif dan kibasan balik yang bergantiganti. Ini akan menggerakkan sel, atau menggerakkan cairan di atas permukaan sel diam, dalam arah yang tegak lurus terhadap sumbu silianya
Page 82
Page 83
ULTRASTRUKTUR FLAGELA ATAU SILIA EUKARIOTIK (a)Dalam mikrograf elektron penampang memanjang silia ini, mikrotubula dapat dilihat membentang sepanjang strukturnya (TEM) (b)Penampang melintang silia menunjukkan susunan mikrotubula (TEM) (c)Tubuh basal yang menambatkan silia atau flagela ke sel memiliki cincin yang terdiri atas sembilan triplet mikrotubula (tubuh basal secara struktural identik dengan sentriol). Ke sembilan doublet silia membentang ke tubuh basal, tempat setiap doublet bergabung dengan mikrotubula lain untuk membentuk cincin yang terdiri atas sembilan triplet silia berakhir di atas tubuh basal (TEM)
Page 84
PERAN STRUKTURAL MIKROFILAMEN Luas permukaan sel usus halus penyerap nutrien ini diperluas oleh mikrovilinya yang banyak, yaitu perluasan seluler yang diperkuat oleh berkas mikrofilamen. Filamen aktin ini ditambatkan ke jalinan filamen intermediet
Page 85