MATERI KULIAH KIMIA ORGANIK II

SMT IV
BAB I.

3 SKS
STEREO KIMIA

BAB II.

SENYAWA BERGUGUS FUNGSI JAMAK

BAB III. KARBOHIDRAT BAB IV.

BAB V. BAB VI.

ASAM AMINO, PEPTIDA, DAN PROTEIN LEMAK

HIDROKARBON AROMATIK POLISIKLIK

1. Buku Teks Kimia Organik II (Matsjeh, S., et.al., 1996, DIKTI) 2. Fessenden, R.J., and J S Fessenden, 1997, Kimia Erlangga 3. Paul R Young, 2000, Organic Chemistry On Organik, Alih Bahasa A.H Pudjaatmaja, Jilid 1, Edisi ketiga, Jakarta: Kimia Organik II, Kebudayaan Departemen Pendidikan dan

Line,

University Illinois Chicago

and Sons

4. Solomons, 2000, Organic Chemistry, 6th edition, Wiley

SOME ADVICE ON STUDYING FOR ORGANIC CHEMISTRY

STRUCTURE OF KNOWLEDGE IN ORGANIC CHEMISTRY

missing material

Builds like a pyramid balanced on its point.

If something is missing ..

The whole structure collapses !!!

MATERIAL IN THIS COURSE IS CUMULATIVE

STUDY TO UNDERSTAND THE MATERIAL The material keeps building on itself. ANYTHING THAT YOU DO NOT MASTER WILL COME BACK TO HAUNT YOU LATER You literally cannot forget anything in this course. WE WILL BUILD ON EARLIER TOPICS TO DEVELOP NEW ONES

IF YOU DONT UNDERSTAND SOMETHING .. GET HELP AS SOON AS YOU CAN

See me after class, during office hours, or make an appointment. DO AS MANY PROBLEMS AS YOU CAN FIND TIME FOR IN YOUR SCHEDULE Active learning is more effective than passive study. Doing problems really cements your understanding it requires you to apply what you learn. THE END-OF-CHAPTER PROBLEMS ARE THE MOST HELPFUL

6 LANGKAH PENTING UNTUK SUKSES KIMIA ORGANIK

1) berada di kelas; 2) bertanya di kelas (jika menemui kesulitan) 3) Take good notes = buat catatan yang baik persiapan dengan membaca materi sebelum masuk kelas, setelah kuliah: baca lagi, buat Ringkasan dan tulis kembali 4) Kerjakan PR pada waktunya 5) Practice, practice, practice! 6) Pelajari bagaimana ujian dengan baik

STRANGE BUT TRUE

We retain : 90% of what we say as we do a thing 70% of what we say as we talk ACTIVE

50% of what we see and hear

30% of what we see

20% of what we hear

10% of what we read PASSIVE

.. a psychological study

STEREO KIMIA
Studi mengenai molekul-molekul dalam ruang 3 dimensi
Bagaimana atom-atom dalam suatu molekul ditata dalam ruangan satu relatif yang lain
1. ISOMER GEOMETRI Ketegaran (rigidity) dalam molekul dapat mengakibatkan isomer 2. KONFORMASI MOLEKUL bentuk molekul dan bagaimana bentuk ini bisa berubah 3. KIRALITAS MOLEKUL Bagaimana penataan kiri atau kanan atom-atom disekitar atom C dapat mengakibatkan isomer

Pusat stereo;
titik dalam suatu molekul yang menghasilkan stereoisomer

jumlah stereoisomer yang mungkin adalah = 2n , n pusat stereo

Pusat Khiral chirogenic centre =

pusat yang menghasilkan senyawa khiral
Pusat khiral = pusat asimetrik ;

mengikat 4 atom/gugus berbeda

H3CH2C

Br * CH CH C 2 3 H3C H B

* H3C C Br H A

Pusat khiral

A and B = enantiomers (optical isomers)!

Enantiomer adalah khiral!

senyawa khiral tidak berimpit dengan bayangan cerminnya.

Why is chirality important?

Chiral species fits in chiral binding site (matched key and lock)

Chiral species does not fit in binding site (mismatched key and lock)

Loius Pasteur

isomers adalah senyawa berbeda yang memiliki rumus

molekul sama, contoh C4H8:

Stereoisomer Alkena; Isomer Geometri, Ada perbedaan letak gugus-gugus/atom-atom 1. Dilihat prioritas substituen yang terikat langsung ke C ikatan rangkap; Nomor atom tertinggi memperoleh prioritas tertinggi Contoh; H < C < N < O < Cl. (untuk isotop; prioritas sesuai dengan namor massa)

2. Jika atom yang terikat langsung ke ikatan rangkap sama; maka lihat atom berikutnya. Contoh; CH3 < C2H5 < ClCH2 < BrCH2 < CH3O

3.

Jika 2 gugus prioritas tertinggi terletak pada satu sisi = cis Jika 2 gugus prioritas tertinggi terletak pd sisi berlawanan = trans

4. bila ke empat gugus atau atom yang terikat ke atom C ikatan rangkap berbeda; maka dipakai

penamaan E (= entgegen) & Z (=zusammen),

Z equivalent ke cis dan E equivalent ke trans.

Sistem E dan Z

ISOMER GEOMETRI PADA SENYAWA SIKLIK

H
H H H H H H H H OH Di bawah bidang; Gugus terikat pada Ujung-bawah garis vertikal CH3 Di atas bidang; Gugus terikat pada ujung-atas garis vertikal

Contoh:

Konformasi Senyawa Rantai Terbuka

Gugus-gugus yang terikat oleh ikatan

sigma dapat berotasi mengelilingi ikatan,

Dapat memiliki tak terhingga banyak posisi

didalam ruang relatif satu terhadap yang lain

Menggunakan Proyeksi Newman

Hanya ada 1 ikatan C-C, struktur rotasi (rotamer) yang ada: staggered dan eclipsed.
Bond Repulsions in Ethane

Nama Konforme r

Wedge-Hatched Bond Structure

Sawhorse Structure

Newman Projection

Profil Energi Potensial untuk Konformer Etana

Dihedral Angle

Profil Energi Potensial untuk Konformer Butana

Aspek penting dari Stereoisomer Konformasi:

1.Interkonfersi konformasi dalam molekul sederhana terjadi cepat pada temperatur kamar, isolasi konformer murni biasanya tidak mungkin.

2. Konformer spesifik membutuhkan tatanama khusus, seperti staggered, eclipsed, gauche dan anti
3. Konformer spesifik tersusun dari sudut dihedral.

4. konformasi Staggered sekitar ikatan tunggal

C-C lebih stabil (punya energi potensial terendah) dibandingkan konformasi eklips. 5. Konformer Gauche pada butana kurang stabil dari pada konformer anti sekitar 0,9

Kkal/mol. Nilai ini disebabkan rapatnya 2 gugus metil (steric hindrance) pada struktur Gauche
6. Konformer Butana B dan C memiliki struktur bayangan cermin yang tidak identik, sudut

dihedral 2400 & 3000.

Bentuk Senyawa Siklik

600

900

1080

1200

Sudut ikatan menurut BAEYER

Diagram proyeksi
Menggambarkan struktur 3 dimensi ke 2 dimensi :

Proyeksi Fischer Proyeksi Newman

Proyeksi FISCHER

Vertikal; menjauhi pembaca

Horizontal; mendekati pembaca Proyeksi Fischer bisa berotasi dan dimanipulasi Rotasi 900 tidak dibolehkan; karena menghasilkan enantiomer awal.

Rotasi 1800 menghasilkan konfigurasi identik, rotasi

2700 menghasilkan enantiomer

Aturan Penataan ulang proyeksi Fischer : 1. 2. merubah 2 gugus pd proyeksi Fischer; menghasilkan

enantiomer dari senyawa awal

perubahan gugus 2 kali menghasilkan stereokimia awal

Proyeksi Fischer dengan 2 C khiral

Urutan penataan ke 4 gugus di sekitar atom khiral

Tata nama R, S (R = Rektus = ke kanan ; S = Sinister = Kiri)

(R)-alanine

1. Urutkan ke 4 gugus (berdasarkan prioritasnya)

Berdasarkan no atom; dari yg terikat langsung pada C kiral

b. Bila atom yang terikat langsung pada C khiral sama;

maka prioritas ditentukan oleh atom berikutnya c. Ikatan rangkap 2 dianggap mengikat 2 atom yang sama d. Ikatan rangkap 3 dianggap mengikat 3 atom yang sama e. Atom yang mengikat 2 C yang riel punya prioritas lebih tinggi dari pada C dengan ikatan rangkap

2. Isotop dengan massa lebih besar memperoleh

prioritas lebih tinggi

3. Proyeksikan molekul sehingga ggs prioritas terendah berada di belakang 4. Tarik suatu anak panah dari gugus prioritas tertinggi ke terendah Jika searah dengan putaran jarum jam = R Jika berlawanan dengan putaran jarum jam = S

Urutan prioritas: Cl (tertinggi) > C-C > C-H > H.

Sehingga (R)-2-khlorobutana

H3CH2C * Br C H3C H

b H3CH2C

a d H C* Br H3C c

H3CH2C b * dH C Br a (S)-2-bromoH3C c butane

Br * CH CH C 2 3 H3C H

a Br

dH H3Cc

b * C CH2CH3

a Br

dH H3C c (R)-2-bromo-butane

* b C CH2CH3

CH3CH2O * Br C H H3C

b CH3CH2O

a * d H C Br H3Cc
(R)-(1-bromoethyl) ethyl ether

H3C c a b * CH3CH2O C Br Hd
a H C* Br d CH3CH2Ob H3Cc

a OH

H3C

Hd b CH2CH3

C*

HO * C H H3CH2C H3C

HO a b * C Hd H3CH2C H3C c
(R)-2-butanol

a OH c

H3C

C* b H CH2CH3
d

Contoh
Gambarkan struktur dari (S)-1-kloro-2-butanol ! Posisi struktur : ClCH2C*H(OH)CH2CH3 Pusat khiral (C*) pada C2: gugus yang terikat ke C* : HO- , ClCH2-, CH3CH2-, H- . Perioritas : HO- = a, ClCH2- = b, CH3CH2- = c, H- = d a OH a OH 1 2 C* 3 4 1 2 C* 3 4 ClCH2 CH2CH3 C* H c ClCH2 b CH CH 2 3 b c H d d (S)-

Berikan stereostruktur dari (R)-2-iodopentana ! (R)- 2-iodopentana: CH3C*H(I)CH2CH2CH3; Pusat khiral (C*) di C2 Gugus pada C* : I- , CH3-, CH3CH2CH2, H- . Prioritas: I- = a, CH3CH2CH2- = b, CH3- = c, H- = d

a C* c d b

Ia 1 2C* 3 4 5 H3C CH2CH2CH3 c H b d

(R)- 2-iodopentana

2 Pusat Khiral
H3C H3C H *C *C H Br Br
c1 (2R) H3C b H3C d H a Br * C 2 C Br H
H3C Br b C 4 3C* (3S) H C Br 3 c dH a (2R,3S)-2,3-dibromobutane Tetapiapa C senyawa khiral ? H

Senyawa C dua pusat khiral.. Lihat C dan cerminnya D :

is it non-superimposable upon its mirror image? -Bidang cermin atau bidang simetri

1 (2R) H3C
(3S)

H C * 2 *C 3 H Br Br

Br Br

H 2 C* 3 C*

1 CH3 (2S)
(3R)

Br Br

H C * C* H

1 CH3 CH3 D

H3C C 4

CH3 H 4 D

(2R,3S)- or meso-2,3-dibromobutane

C and D identical!

Lanjutan .

Senyawa Meso: setiap pusat khiral dihubungkan dengan gugus yang sama dalam bidang cermin 1 H H 1 H3C Br HO COOH (2R,3S)- or meso-2,3C2 C * * 2 dihydroxybutanedioic acid 3 *C * C3 4 or H3C Br HO COOH meso-tartaric acid 4 H H
(2R,3S)- or meso2,3-dibromobutane m.p. 140 C Bukan senyawa meso!

Br

Br *

1 H3C H3C 4

H C * 2 *C 3 H Br Cl

* H H
(1R,2S)-1,2-dibromocyclobutane

(2R,3S)-2-bromo-3-klorobutana

Diastereoisomer
Compounds C, E and F
(2R) (3S)
1 H3C H3C C 4 H C * 2 *C 3 H Br Br
H 1 1 H H3C Br Br CH3 (2R) C *C 2 2 * 3 3 C* *C (3R) Br CH3 H3C Br H 4 E F 4 H

(2S) (3S)

E,F not superimposable both chiral- enantiomers! Relationship between C and E or C and F: diastereoisomers!

Stereoisomers which are not enantiomers are diastereoisomers or diastereomers.

m.p. 140 C
* C2 * C3 4 HO COOH H HO H 1 COOH
HO HOOC H *C *C H COOH

m.p. 170 C
OH

(2R,3S)- or meso2,3-dihydroxybutanedioic acid or meso-tartaric acid

(2R,3R )2,3-dihydroxybutanedioic acid or (2R,3R)- tartaric acid

Properties of Enantiomers
Identical m.p., b.p., differ in specific rotation:
Solution irradiated with plane polarized light; = 589 nm (sodium D emission line) in polarimeter.

rotation to the right dextrorotatory d- or (+); to the left levorotatory l or (-).

specific rotation []589 = .100/c.l c = conc. g./100mL l = length of sample tube (dm)

Optically active compound: displays optical rotation - pure enantiomer, or mixture of enantiomers containing more than 50% of one enantiomer. Racemic mixture: mixture contains 50% of each enantiomer, = 0. Racemate or racemic compound (rac): crystalline or pure liquid 1:1 mixture of enantiomers

Properties of Enantiomers (cont.)

Examples
* C2 * C3 4 HO COOH H HO H 1 COOH
HO HOOC H *C *C H COOH OH
HOOC HO H *C *C H OH COOH

[]D = 0 m.p. 140 C (2R,3S)- or meso-tartaric acid

[]D = +12.4 m.p. 170 C (2R,3R)- (+)-tartaric acid Racemate []D = 0

[]D = -12.4 m.p. 170 C (2S,3S)-(-)tartaric acid

rac- or (2RS,3RS)tartaric acid or ()- tartaric acid

m.p. 210 C
-crystals consist of 1:1 mixture of enantiomers