Zavod za kliničku mikrobiologiju - Odjel za bakteriologiju i bolničke infekcije

Uzimanje uzoraka
Uzorci iz primarno sterilnih materijala

Na uputnici obavezno navesti slijedeće:

- podatci o pacijentu (ime i prezime, godina rođenja, odjel)
- dijagnoza
- da li pacijent uzima antimikrobnu terapiju, ako da koju
- vrsta uzorka (kod hemokultura označiti broj seta)
- vrsta pretrage
- datum i vrijeme uzimanja uzorka
- ime nadležnog liječnika

UZORAK Posuda Uzimanje materijala Transport Pohranjivanje Očekivani patogeni

(odmah po (samo ako (kultivacija ne uključuje M.
uzimanju) transport nije tuberculosis)
moguć odmah)
Krv- Bujoni za Prije venepunkcije kožu dezinficirati ST + 37 C Bilo koja vrsta bakterija i gljiva
2-3 seta u 24 hemokulture 70% alkoholom i poslije to mjesto
(istovremeno uzeti set - više ne palpirati Pozitivni rezultati se javljaju telefonom
sata Uzeti 2 do 3 uzorka u razmacima od (preliminarni i definitivni)
bočica za AE i AN uzgoj
smatraju se jednim 1/2h s različitih mjesta, prije
uzorkom) odrasli očekivanog maksimuma temperature Nalaz se izdaje za 5 dana ukoliko prije
– 10 ml po bočici U akutnoj sepsi uzeti 2 seta s nije bio pozitivan
djeca- 1-5 ml po bočici različitih mjesta unutar 10 min (prije
početka antimikrobne terapije) Telefonski dogovoriti dulju inkubaciju
Kod sumnje na Kod sumnje na kateter sepsu uzeti kod sumnje na brucelozu, tularemiju i
intracelularne patogene uzorak krvi iz periferije i cvk – gljivičnu infekciju (i naznačiti na
(bartonela) od laboratorija svakako naznačiti vrijeme uzimanja uputnici)
zatražiti Isolator bočice i u uzorka
njima dostaviti krv
Kateteri Sterilna posuda s Dezinficirati kožu prije vađenja ST +4 C Bilo koja vrsta bakterija i gljiva
(NE urinarni navojem (70% alkohol) (po mogućnosti

1
kateter) vrh urinarnog katetera ne slati na ne dulje od 2 Pozitivni rezultati se javljaju telefonom
analizu sata) (preliminarni i definitivni)
vrh i.v. katetera ne slati u bujonu!
Mali broj bakterija u kvantitativnom i
semikvantitativnom uzgoju ukazuje na
vjerojatnu kontaminaciju, ali ne
isključuje patogenu ulogu u slučaju
kliničkih znakova kateter sepse
Tjelesne Sterilna epruveta s Dezinficirati kožu prije aspiriranja ST ST / 24 sata Bilo koja vrsta bakterija i gljiva
tekućine navojem (70% alkohol)
(zglobna, pleuralna, BRIS nije adekvatan uzorak, već * nasađena bočica Amnionska tekućina i tekućina dobivena
amnionska, ascites, SAMO aspirat za hemokulturu na kuldocentezom trebaju se slati u
Iznimno, ako uzorka ima Poslati što je moguće više materijala anaerobnom transportnom mediju
žuć, itd) malo, može se nasaditi u + 37 C
bočicu za hemokulturu* Pozitivni rezultati se javljaju telefonom
(preliminarni i definitivni)

Telefonski dogovoriti dulju inkubaciju

kod sumnje na gljive (i naznačiti na
uputnici)
Likvor Sterilna epruveta s Dezinficirati kožu prije aspiriranja ST ST Bilo koja vrsta bakterija i gljiva
navojem (min.1 ml, za (70% alkohol).
acidorezistentne uzročnike Uzeti po 1-2 ml u tri epruvete (za *Nasađene hranjive Pozitivni rezultati se javljaju telefonom
mikrobiologiju, citologiju i
Zbog (preliminarni i definitivni)
5 ml) podloge na +37 C
biokemiju – epruvetu za hitnosti
mikrobiologiju nikad ne puniti prvu, pretrage Za bakteriologiju Nalaz se izdaje za 5 dana ukoliko prije
ako samo 1 epruveta prvo ju odnjeti likvor se ne stavljati u nije bio pozitivan
na mikrobiologiju) predaje iz hladnjak !
Telefonski dogovoriti dulju inkubaciju
Ako je moguće odmah pri uzimanju
ruke u ruku! kod sumnje na gljive (i naznačiti na
nekoliko kapi likvora direktno uputnici)
nasaditi i u epruvetu s kosim agarom
te epruvetu s hranjivim bujonom koji Rutinska obrada ne uključuje tuš
se dobiju u laboratoriju* preparat i preparat po Ziehl-Neelsenu
(po potrebi naznačiti na uputnici)
Bioptati Sterilna posuda s Dezinficirati kožu prije biopsije ST ST / 24 sata Bilo koja vrsta bakterija i gljiva
navojem (dodati par (70% alkohol)
dodatni materijal Pozitivni rezultati se javljaju telefonom
kapi sterilne fiziološke (preliminarni i definitivni)

2
 otopine da tkivo bude
vlažno)
Aspirat (bris) a) Aspirat poslati u
duboke rane, sterilnoj epruveti. Ako je
uzorka malo ili se ne može
apscesa
odmah otpremiti u
laboratorij nasaditi u
bočicu za anaerobnu
hemokulturu
b) Bris je loš uzorak, ali
ako se uzima pohraniti ga
u anaerobni transportni
medij
Kožne Bris u sterilnoj
promjene, epruveti
površinske rane
(celulitis, opekline) U slučaju duljeg transporta
pohraniti u Amies
transportni medij
Dezinficirati kožu prije aspiriranja ST
(70% alkohol).
Aspirirati duboko u otvorenu ranu,
najbolje s dna ili stijenke apscesa ili
incidirati komad tkiva
Tkivo ili tekućina bolji su uzorak od
brisa
U slučaju male količine aspiriranog
materijala navući u špricu malu
količinu sterilne fiziološke otopine i
proštrcati u sterilnu epruvetu ili
bočicu za hemokulturu*
Prije uzimanja brisa područje izaprati ST
sterilnom fiziološkom otopinom
Obrisati rub prema zdravom tkivu,
odstraniti kruste
za moguće buduće
analize sačuvati na Telefonski dogovoriti dulju inkubaciju
-70 C kod sumnje na gljive (i naznačiti na
uputnici)
ST / 24 Bilo koja vrsta bakterija i gljiva
*aspirat u bočici za Pozitivni rezultati se javljaju telefonom
(preliminarni i definitivni)
hemokulturu na
+37 C
Telefonski dogovoriti dulju inkubaciju
kod sumnje na gljive (i naznačiti na
uputnici)
ST / 24 sata S.aureus, BHS-A i gljive se izdaju ako
su prisutni u bilo kojoj količini (u tom
slučaju preliminarni i definitivni nalaz se
javljaju telefonom)
Ostale bakterije se izdaju samo ako
predstavljaju dominantnu floru ili zbog
rezistencije zahtjevaju kontaknu
izolaciju pacijenta

Saprofitne bakterije kože se ne izdaju

Krv na Krv u epruveti bez Prije venepunkcije kožu dezinficirati ST Test se radi iz Aspergillus antigen (galaktoman)
Aspergillus antikoagulansa 70% alkoholom i poslije to mjesto svježe krvi –
više ne palpirati ukoliko uzorak nije
antigen moguće poslati
(galaktoman) odmah odvojiti
serum i pohraniti
na -200C
ST = sobna temperatura

3
Uzorci iz dišnog sustava

Na uputnici obavezno navesti slijedeće:

- podatci o pacijentu (ime i prezime, godina rođenja, odjel)
- dijagnoza
- da li pacijent uzima antimikrobnu terapiju, ako da koju
- vrsta uzorka
- vrsta pretrage
- datum i vrijeme uzimanja uzorka
- ime nadležnog liječnika

UZORAK Posuda Uzimanje materijala Transport Pohranjivanje Očekivani patogeni

(odmah po (samo ako (kultivacija ne uključuje M.
uzimanju) transport nije tuberculosis)
moguć odmah)
Aspirat ili bris Sterilna posuda Uzorak uzeti samo ako uho ST ST / 24 sata Bilo koja vrsta bakterija i gljiva
srednjeg uha s navojem ili curi ili je učinjena
Ako uzorak nije Telefonski dogovoriti dulju inkubaciju
bris u sterilnoj timpanocenteza kod sumnje na gljive (naznačiti na
epruveti moguće poslati odmah
treba ga slati u Amies uputnici)
transportnom mediju
Bris vanjskog uha Bris u sterilnoj Prije uzimanja brisa odstraniti ST 24 sata na +4 C Bilo koja vrsta bakterija i gljiva
epruveti kruste fiziološkom otopinom; OSIM:
Saprofitne bakterije kože se ne izdaju
bris rotirati u vanjskom
kanalu
Bris spojnice oka Bris u sterilnoj Prvim sterilnim štapićem ST ST / 24 sata Bilo koja vrsta bakterija i gljiva
epruveti odstraniti sluz, a drugim uzeti OSIM:
Ako uzorak nije Saprofitne bakterije kože se ne izdaju
obrisak pazeći da se ne Pretraga ne uključuje Ch. trachomatis
dotakne kožni dio vjeđe moguće poslati odmah
treba ga slati u Amies (vidi: Laboratorij za molekularnu i
transportnom mediju citološku dijagnostiku)

Bris ždrijela Bris u sterilnoj Sterilnim štapićem treba ST ST / 24 sata BHS-A

4
 epruveti obrisati tonzile (lukove
ždrijela) te stražnju stijenku za N.gonorhoae unutar Ako se traži neki drugi uzročnik treba
za N.gonorrhoae u farinksa, pazeći pritom da se 12 sati naznačiti na uputnici
Amies ugljeni ne dotakne jezik ili bukalna
transportni medij* Ako uzorak nije
sluznica moguće poslati odmah
treba ga slati u Amies
transportnom mediju
Bris / aspirat Bris u sterilnoj Tankim sterilnim štapićem ST ST / 24 sata S.pneumoniae, H.influenzae,
nazofarinksa epruveti lagano ući u nazofarinks M.catarrhalis, BHS-A
prateći smjer nosnog hodnika, Ako uzorak nije
lagano rotirati štapić moguće poslati odmah Ako se traže neki drugi uzročnici
treba ga slati u Amies (N.meningitidis) treba naznačiti na
transportnom mediju uputnici

Bris nazofarinksa nije kvalitetan uzorak

(nedovoljno specifičan i nedovoljno
osjetljiv) za otkrivanje uzročnika upale
srednjeg uha ili sinusa
Bris / aspirat Bris u sterilnoj Tankim sterilnim štapićem ST ST / 24 sata Bordetella pertusis
nazofarinksa na epruveti lagano ući u nazofarinks
Bordetella pertusis prateći smjer nosnog hodnika, Što hitnije Ako uzorak nije Pozitivni rezultati se javljaju telefonom
lagano rotirati štapić dostaviti u moguće poslati odmah
laboratorij treba ga slati u Nalaz se izdaje za 7 dana ukoliko prije
transportnom mediju nije bio pozitivan
Bris nosa na Bris u sterilnoj Sterilni štapić navlažiti u ST ST / 24 sata Staphylococcus aureus
Staphylococcus epruveti sterilnoj fiziološkoj otopini, 5 MRSA
aureus ili MRSA puta čvrsto rotirati štapić
brišući unutarnji kožni nabor Na uputnici naznačiti da li se traži
detekcija stafilokoknog kliconoštva ili se
prvo jedne, a potom istim radi o rani unutar nosnog hodnika
štapićem i druge nosnice (do
1-2 cm dubine)
Sputum: Sterilna posuda a) Prije davanja sputuma ST a) +40C / 24 sata S.pneumoniae, H.influenzae,
a)ekspektorirani s navojem pacijent treba izaprati ekspektorirani M.catarrhalis, BHS-A, S.aureus
b)inducirani (grgljati) usta vodom te

5
 pokušati proizvesti „duboki“ b) ST / 24 sata Telefonski dogovoriti dulju inkubaciju
iskašljaj inducirani kod sumnje na gljive osim Candida spp.
(naznačiti na uputnici)

b) iskašljavanje se inducira Ako se traže neki drugi uzročnici

inhalacijom 3-10% sterilne (P.aeruginosa kod cistične fibroze) treba
fiziološke otopine naznačiti na uputnici

Rutinska obrada ne uključuje tuš

preparat i preparat po Ziehl-Neelsenu
(po potrebi naznačiti na uputnici)

Kvalitetnim uzorkom se smatra onaj

iskašljaj u kojem ima puno (>25 u
vidnom polju) polimorfonukleara i
malo (<10 u vidnom polju) epitelnih
stanica. Velik broj epitelnih stanica
ukazuje da se radi o ispljuvku, a ne
iskašljaju
Bronhoalveolarna Sterilna posuda BAL se uzima tijekom ST +40C / 24 sata Bilo koja vrsta bakterija i gljiva
lavaža (BAL) s navojem od bronhoskopije
Fiziološka flora gornjeg dišnog sustava
Endotrahealni 15 ml Endotrahealni aspirat se se ne izdaje
aspirat uzima preko sterilnog
katetera Mali broj bakterija u kvantitativnom
uzgoju ukazuje na vjerojatnu
kontaminaciju – interpretacija ovisi i o
vrsti nađene bakterije

Telefonski dogovoriti dulju inkubaciju

kod sumnje na gljive osim Candida spp.
(naznačiti na uputnici)

Rutinska obrada ne uključuje tuš

preparat i preparat po Ziehl-Neelsenu
(po potrebi naznačiti na uputnici)
ST = sobna temperatura

6
Uzorci iz probavnog sustava

Na uputnici obavezno navesti slijedeće:

- podatci o pacijentu (ime i prezime, godina rođenja, odjel)
- dijagnoza
- da li pacijent uzima antimikrobnu terapiju, ako da koju
- vrsta uzorka
- vrsta pretrage
- datum i vrijeme uzimanja uzorka
- ime nadležnog liječnika

UZORAK Posuda Uzimanje materijala Transport Pohranjivanje Očekivani patogeni

(odmah po (samo ako
uzimanju) transport nije
moguć odmah)
Stolica Čista, nepropusna Dovoljno je žličicom čepa ST +40C / 24 sata Rutinska obrada uključuje
posuda zagrabiti oko 1-2 g proljevaste salmonele, šigele, jersiniju i
stolice ili grumen veličine U transportnom kampilobakter, E.coli O157,O124
lješnjaka u slučaju formirane mediju +4C / 48h ako se traže drugi uzročnici
stolice naznačiti na uputnici

Bris rektuma Bris u sterilnoj Uzeti bris do dubine od 2,5cm ST ST / 24h Shigellla spp, Salmonella spp.
(Bris ili uzorak epruveti od analnog sfinktera ( feces
iz pelene manje mora biti vidljiv na brisu zbog
osjetljivi od detekcije dijarealnih patogena)
stolice)
Stolica na Alkalna peptonska voda za Dovoljno je žličicom čepa +40C U alkalnoj Vibrio cholerae
Vibrio cholerae Vibrio cholerae zagrabiti oko 1-2 g proljevaste peptonskoj vodi

7
 Podlogu zatražiti u stolice ili grumen veličine do 6 h
mikrobiološkom lješnjaka u slučaju formirane (prethodno
laboratoriju
stolice. Uzorak uzeti u ranoj ohladiti medij
fazi bolesti. 1-2 h)
Stolica na Čista, nepropusna Dovoljno je žličicom čepa ST +4 C / ≤24 sata Rotavirus
rotavirus i posuda zagrabiti oko 1-2 g proljevaste ≥24h -200C Adenovirusi
adenoviruse stolice ili grumen veličine
lješnjaka u slučaju formirane
stolice.
Bioptat želuca Sterilna posuda s Uzorak se uzima tijekom ≤1h ST +4 C / ≤24 sata H. pylori
na H. pylori navojem + transportni gastroskopije . Preporuča se u transportnom
medij (brucela bujon s uzorak uzeti s više mjesta kako mediju
20% glicerola, Stuart bi vjerojatnost izolacija bila što
transportni medij ili veća
Portagerm pylori)
C. difficile Čista, nepropusna Dovoljno je žličicom čepa ≤1h ST 1-24 +40C Toksikogeni soj C. difficile
dokaz toksina A suha posuda >5 ml zagrabiti oko 1-2 g proljevaste >24 -200C
iB stolice ili grumen veličine (oprez- brz U dječjoj dobi česta je kolonizacija
lješnjaka u slučaju formirane gubitak toksikogenim sojevima
stolice. Testiranje formirane ili aktivnosti
tvrde stolice nije preporučljivo citotoksina
(pacijent bi trebao imati ≥5
tekućih ili mekih stolica na
dan). 1-2 uzorka mogu biti
potreba za detekciju niskih
razina toksina
ST = sobna temperatura

8
Uzorci iz urogenitalnog sustava

Na uputnici obavezno navesti slijedeće:

- podatci o pacijentu (ime i prezime, godina rođenja, odjel)
- dijagnoza
- da li pacijent uzima antimikrobnu terapiju, ako da koju
- vrsta uzorka
- vrsta pretrage
- datum i vrijeme uzimanja uzorka
- ime nadležnog liječnika

UZORAK Posuda Uzimanje materijala Transport Pohranjivanje Očekivani patogeni

(odmah (samo ako (kultivacija ne uključuje M.
po transport nije tuberculosis)
uzimanju) moguć
odmah)
Urin Sterilna posuda s Spolovilo oprati sapunom i ST +40C / 24 sata E.coli i S.saprophyticus (u
navojem vodom ili u ambulantnim mlađih žena) izdaju se ako su
uvjetima sterilnom +4 C ako se prisutni u čistoj kulturi u
fiziološkom otopinom očekuje da količini ≥10³ cfu/ml.
(jednim potezom tupfera u će od
uzimanja do
smjeru od naprijed prema nasađivanja
Ostale bakterije se izdaju ako
otraga). Prvi mlaz ispustiti, a uzorka proći su prisutne u čistoj kulturi u
srednji uhvatiti u sterilnu > 2h količini ≥104 cfu/ml
posudu.
U interpretaciji nalaza potrebno
je uzeti u obzir biokemijski
nalaz urina i kliničku sliku.

Kod trajnog urinarnog katetera

uzorak ne uzimati bez kliničkih

9

Bris cerviksa, vagine Bris u sterilnoj Bris cerviksa se uzima pri
epruveti ginekološkom pregledu
spekulima – prvim brisom
odstraniti sekret te drugim
brisom uzeti uzorak iz
endocervikalnog kanala
simptoma upale - na uputnici
naznačiti da se radi o kateter
urinu
ST ST / 24 sata Staphlococcus aureus, BHS-A,
BHS-B, Candida albicans
Detekcija Gardnerella
vaginalis se zasniva na
preparatu po Gramu

Navedene bakterije se u
genitalnom traktu nalaze i
normalno kao dio fiziološke ili
kolonizirajuće flore, ali kad se
nađu kao dominantan izolat
mogu biti povezani s određenim
kliničkim simptomima

Kod djece su u brisu vagine /

vulve mogući i respiratorni
patogeni

Detekciju Neisseria
gonorrhoeae, Listeria
monocytognes, Actinomyces
spp. (anaerobi) treba posebno
naznačiti na uputnici
Bris cerviksa, vagine na Bris u sterilnoj ST ST / 24 sata Ciljana pretraga na BHS/B je
BHS/B epruveti indicirana u trudnica pred porod
(35.tj. trudnoće)
Bris cerviksa, vagine, Amies ugljeni ST ST / 24h N.gonorrhoae
uretre na N.gonorrhoae transportni medij
Za PCR dijagnostiku vidi: Laboratorij

10
 za molekularnu i citološku
dijagnostiku

Eksprimat prostate, Sterilna posuda s Eksprimat prostete se dobiva ST ST / 24 h Bilo koja vrsta bakterija i gljiva
ejakulat navojem masažom prostate kroz
rektum. Ne preporuča se u Eksprimat prostate se izdaje
tijeku akutnog prostatitisa. kvantitativno. Za interpretaciju nalaza
je uputno uspoerditi porast bakterija iz
eksprimata s porastom bakterija iz
prvog, drugog i treceg (nakon
eksprimata) mlaza urina – 10x veći
broj bakterija u 1. i 2. mlazu urina
negoli u eksprimatu prostate i 3.
mlazu ukazuje da bakterije potječu iz
mjehura ili uretre, a ne prostate
Bris cerviksa, uretre, Specijalne Bris uretre (tanki sterilni bris ST ST / 24 h Mycoplasma hominis i
ejakulat, eksprimat transportne podloge staviti 2-4 cm u lumen uretre, Ureaplasma urealyticum mogu
prostate, urin na koje se dobiju u rotirati ga) ili bris cerviksa predstavljati saprofitnu floru.
Mycoplasma hominis i laboratoriju uroniti u transportnu podlogu Nalaz ovih bakterija u kolicini
Ureaplasma i dobro protresti te potom ≥104 cfu/ml govori u prilog
urealyticum bris odbaciti a podlogu infekciji te se izdaje s
dostaviti u laboratorij antibiogramom

ST = na sobnoj temperaturi

Uzorci za molekularnu dijagnostiku

11
Na uputnici obavezno navesti slijedeće:
- podatci o pacijentu (ime i prezime, godina rođenja, odjel)
- dijagnoza
- da li pacijent uzima antimikrobnu terapiju, ako da koju
- vrsta uzorka
- vrsta pretrage
- datum i vrijeme uzimanja uzorka
- ime nadležnog liječnika

UZORAK Posuda Uzimanje materijala Transport Pohranjivanje Metoda pretrage

Puna krv Epruveta s Prije venepunkcije / ST Punu krv / Real time PCR, LightCycler
Likvor antikoagulansom lumbalne punkcije kožu likvor zalediti (Roche)
na (EDTA) dezinficirati 70% alkoholom Uzorak na -200C
- N.meningitidis Uzeti ≥ 1ml likvora dostaviti u
laboratorij
- S.pneumoniae Uzeti ≥ 2ml krvi što hitnije
- L.monocytogene
s U slučaju
- S.aureus duljeg
- Staphylococcus transporta
uzorak
spp / S.aureus zalediti i
- Meticilin poslati
rezistentni zaleđen
stafilokok
(MRSA / MRSE)
Soj za identifikaciju Čista kultura ST ST
bakterija u dubokom Dulje
agaru pohranjivanje
na -200C
ST = na sobnoj temperaturi

12