See discussions, stats, and author profiles for this publication at: https://www.researchgate.

net/publication/314255928

Difference Between Codon and Anticodon

Article · March 2017

CITATIONS READS
0 524

1 author:

Lakna Panawala
Difference Between, Sydney, Australia
247 PUBLICATIONS   3 CITATIONS   

SEE PROFILE

Some of the authors of this publication are also working on these related projects:

Embryology View project

Biochemistry View project

All content following this page was uploaded by Lakna Panawala on 07 March 2017.

The user has requested enhancement of the downloaded file.

3/7/2017 Difference Between Codon and Anticodon | Definition, Features, Comparison

EXPLORE  Type here to search...  

Home » Science » Biology » Cell Biology » Difference Between Codon and Anticodon

Difference Between Codon and Anticodon
March 6, 2017 • by Lakna • 7 min read

Main Difference – Codon vs
Anticodon
Codon  and  anticodon  are  nucleotide  triplets  which  specify  a
particular  amino  acid  in  a  polypeptide.  A  specific  rule  set
exists  for  the  storage  of  genetic  information  as  a  nucleotide
$35 Plasmid Seq + Assembly
sequence  either  on  DNA  or  mRNA  molecules  in  order  to
synthesise proteins. That specific rule set is referred to as the
Assembly Consensus Q30 =
99%+, High Quality, High genetic code. Codon is a group of three nucleotides, especially
Throughput, Volume Discounts on the mRNA. Anticodon is present on tRNA molecules. The
seqwell.com/products/plasmid main difference between codon and anticodon is that codon is
the  language  which  represents  an  amino  acid  on  mRNA  molecules  whereas  anticodon  is  the  complement
nucleotide sequence of the codon on tRNA molecules.

This article examines,

1. What is Codon 
     – Definition, Features  
2. What is Anticodon 
     – Definition, Features  
3. What is the difference between Codon and Anticodon

EXPLORE 

http://pediaa.com/difference­between­codon­and­anticodon/ 1/10
3/7/2017 Difference Between Codon and Anticodon | Definition, Features, Comparison

What is a Codon
A codon is a sequence of three nucleotides which specifies one amino acid in the polypeptide chain. Every gene that
encodes  a  specific  protein  consists  of  a  sequence  of  nucleotides,  which  represent  the  amino  acid  sequence  of  that
particular protein. Genes utilize a universal language, the genetic code, in order to store the amino acid sequences of
proteins. Genetic code consists of nucleotide triplets which are called codons. For example, the codon TCT represents
the amino acid serine. Sixty one codons can be identified in order to specify the twenty essential amino acids required
by the translation.

Reading Frame
A  particular  nucleotide  sequence  in  a  single­stranded  DNA  molecule  consists  of  three  reading  frames  in  5′  to  3′
direction  of  the  strand.  Considering  the  nucleotide  sequence  in  figure  1,  first  reading  frame  starts  from  the  first
nucleotide, A. The first reading frame is shown in blue colour. It contains the codons, AGG TGA CAC CGC AAG
CCT TAT ATT AGC. The second reading frame starts from the second nucleotide, G which is shown in red colour. It
contains  the  codons  GGT  GAC  ACC  GCA  AGC  CTT  ATA  TTA.  The  third  reading  frame  starts  from  the  third
EXPLORE 
nucleotide, G which is shown in green colour. It contains the codons GTG ACA CCG CAA GCC TTA TAT TAG.

http://pediaa.com/difference­between­codon­and­anticodon/ 2/10
3/7/2017 Difference Between Codon and Anticodon | Definition, Features, Comparison

Figure 1: Reading Frames

Since DNA is a double­stranded molecule, six reading frames can be found in the two strands. But, only one reading
frame is potential to be translated. That reading frame is referred to as the open reading frame. A codon can only be
identified with an open reading frame.

Start/Stop Codon
The open reading frame is defined basically by the presence of a start codon encoded by the mRNA. The universal
start  codon  is  AUG  which  codes  for  the  amino  acid,  methionine  in  eukaryotes.  In  prokaryotes,  AUG  encodes  for
formylmethionine.  Eukaryotic  open  reading  frames  are  interrupted  by  the  presence  of  introns  in  the  middle  of  the
frame. Translation stops at the stop codon in the open reading frame. Three universal stop codons are found on the
mRNA: UAG, UGA and UAA. A codon series on an mRNA piece is shown in figure 2.

Figure 2: Codon series on mRNA 

Effect of Mutations
Errors occur in the replication process which introduces changes into the nucleotide chain. These changes are called
EXPLORE 
mutations. Mutations may change the amino acid sequence of the polypeptide chain. Two types of point mutations are
missense  mutations  and  nonsense  mutations.  Missense  mutations  alter  the  properties  of  the  polypeptide  chain  by

http://pediaa.com/difference­between­codon­and­anticodon/ 3/10
3/7/2017 Difference Between Codon and Anticodon | Definition, Features, Comparison

changing the amino acid residue and they may cause diseases like sickle­cell anaemia. Nonsense mutations change the
nucleotide sequence of the stop codon and may cause thalassemia. 

Degeneracy
The redundancy that occurs in the genetic code is referred to as the degeneracy. For example, the codons, UUU and
UUC both specify the amino acid phenylalanine. The RNA codon table is shown in figure 3.

Figure 3: RNA codon tabl

Codon Usage Bias
The frequency which a particular codon occurs in a genome is referred to as the codon usage bias. For example, the
frequency of the occurrence of the codon, UUU is 17.6% in the human genome.

Variations
Some  variations  can  be  found  with  the  standard  genetic  code  when  considering  the  human  mitochondrial  genome.
Some  Mycolasma  species  also  specify  the  codon  UGA  as  tryptophan  rather  than  the  stop  codon.  Some  Candida
species specify the codon, UCG as serine.

What is Anticodon EXPLORE 

The three nucleotide sequence on the tRNA, which is complementary to the codon sequence on the mRNA is referred
to as the anticodon. During translation, anticodon is complementary base paired with the codon via hydrogen bonding.
http://pediaa.com/difference­between­codon­and­anticodon/ 4/10
3/7/2017 Difference Between Codon and Anticodon | Definition, Features, Comparison

Therefore,  each  codon  contains  a  matching  anticodon  on

distinct tRNA molecules. The complementary base pairing
I'm in control with my
of anticodon with its codon is shown in figure 4.

Figure 4: Complementary Base pairings

Wobble Base Pairing
The ability of a single anticodon to base pair with more than one codon on the mRNA is referred to as wobble base
pairing.  The  wobble  base  pairing  occurs  due  to  the  loss  of  the  first  nucleotide  on  the  tRNA  molecule.  Inosine  is
present  in  the  first  nucleotide  position  on  the  tRNA  anticodon.  Inosine  can  form  hydrogen  bonds  with  different
nucleotides. Due to the presence of wobble base pairing, an amino acid is specified by the third position of the codon.
For example, glycine is specified by GGU, GGC, GGA and GGG.  

Transfer of RNA
Sixty one distinct types of tRNA can be found in order to specify the twenty essential amino acids. Due to wobble
base pairing, the number of distinct tRNA is reduced in many cells. The minimum number of distinct tRNAs required
by the translation is thirty one. The structure of a tRNA molecule is shown in figure 5. The anticodon is shown in grey
colour. The acceptor stem, which is shown in yellow colour contains a CCA tail at the 3′ end of the molecule. The
specified amino acid is covalently bound to the CCA tails’ 3′ hydroxyl group. The amino acid­bound tRNA is called
aminoacyl­tRNA.
EXPLORE 

http://pediaa.com/difference­between­codon­and­anticodon/ 5/10
3/7/2017 Difference Between Codon and Anticodon | Definition, Features, Comparison

Figure 5: Transfer of RNA

Difference Between Codon and Anticodon
Location
Codon: Codon is located on the mRNA molecule.

Anticodon: Anticodon is located in the tRNA molecule.

Complementary Nature
Codon: Codon is complementary to the nucleotide triplet in the DNA.

Anticodon: Anticodon is complementary to the codon.

Continuity
Codon: Codon is sequentially present on the mRNA.

EXPLORE 
Anticodon: Anticodon is individually present on tRNAs.

http://pediaa.com/difference­between­codon­and­anticodon/ 6/10
3/7/2017 Difference Between Codon and Anticodon | Definition, Features, Comparison

Function
Codon: Codon determines the position of the amino acid.

Anticodon: Anticodon brings the specified amino acid by the codon.

Conclusion
Codon and anticodon are both involved in the positioning of amino acids in the correct order in order to synthesise a
functional  protein  during  translation.  Both  of  them  are  nucleotide  triplets.  Sixty  one  distinct  codons  can  be  found
specifying the twenty essential amino acids required for the synthesis of a polypeptide chain. Thus, sixty one distinct
tRNAs are required in order to complementary base pair with the sixty one codons. But, due to the presence of wobble
base pairing, the number of tRNAs required is reduced to thirty one. The anticodon complementary base pairs with the
codon  are  considered  as  a  universal  feature.  Therefore,  the  key  difference  between  codon  and  anticodon  is  their
complementary nature.

Reference: 
“Genetic code”. Wikipedia, the free encyclopedia, 2017. Accessed 03 March 2017 
“Transfer RNA”. Wikipedia, the free encyclopedia, 2017. Accessed 03 March 2017

Image Courtesy: 
“Reading Frame” By Hornung Ákos – Own work (CC BY­SA 3.0) via Commons Wikimedia 
“RNA­codon”  By  The  original  uploader  was  Sverdrup  at  English  Wikipedia  –  Transferred  from  en.wikipedia  to
Commons., Public Domain) via Commons Wikimedia 
“06 chart pu” By NIH –  (Public Domain) via Commons Wikimedia 
“Ribosome” By pluma – Own work (CC BY­SA 3.0) via Commons Wikimedia 
“TRNA­Phe yeast 1ehz” By Yikrazuul – Own work (CC BY­SA 3.0) via Commons Wikimedia

Start Download
- PDF Now
Convert Any File to a PDF.
Get the Free From Doc to
Pdf App!
fromdoctopdf.com EXPLORE 

http://pediaa.com/difference­between­codon­and­anticodon/ 7/10
3/7/2017 Difference Between Codon and Anticodon | Definition, Features, Comparison

About the Author: Lakna
Lakna, a graduate in Molecular Biology & Biochemistry, is a Molecular Biologist and has a
broad and keen interest in the discovery of nature related things

View all posts

 You May Also Like These

DNA/RNA Di៛�erence Between Download Di៛�erence Between

synthesizer Cytoplasm and... Prokaryotic and...
Ad ka-lab.de pediaa.com Ad Wallpapers pediaa.com

Start Download - Di៛�erence Between Di៛�erence Between Di៛�erence Between

PDF Now Test Cross and... Plant and Animal... DNA and Genes |...
Ad fromdoctopdf.com pediaa.com pediaa.com pediaa.com

Leave a Comment

Name * Email * Website

Comment

EXPLORE 

http://pediaa.com/difference­between­codon­and­anticodon/ 8/10
3/7/2017 Difference Between Codon and Anticodon | Definition, Features, Comparison

Post Comment

You May Like

Difference Between
Chromatin and
Chromosome

Difference Between
Codon and Anticodon

Difference Between
Chloroplast and
Mitochondria

Difference Between
Lysosome and
Ribosome

Difference Between
Bacterial Cell and
Animal Cell

Copyright © 2017 Pediaa.Com. Contact About Us

http://pediaa.com/difference­between­codon­and­anticodon/ 9/10
 View publication stats

3/7/2017 Difference Between Codon and Anticodon | Definition, Features, Comparison

http://pediaa.com/difference­between­codon­and­anticodon/ 10/10