Professional Documents
Culture Documents
Els microorganismes tenen una gran importància, tot seguit esmentarem diferents
funcions que realitzen:
Microorganismes
Microorganismes cel·lulars
Procariotes
Bacteria
Archea
1
Eucariotes
Eukarya
Algues
Protozoous
Fongs
Fongs mucosos
Quin dels tipus cel·lulars, procariota o eucariota, té més intercanvi amb el medi?
Moltes es mouen . Per últim les cèl·lules microbianes actuals són molt evolucionades, i
per tant estan adaptades a molts ambients.
Min, òptim,
max.
2
La quantitat mínima que necessita una cèl·lula per estar viva.
Arbre filogenètic
Realitzar proves de creixement (pH, Tª, etc.) fer tincions per identificar estructures,
determinar propietats (com presència o absència d’enzims, etc.) proves bioquímiques.
Fent això podem conèixer i diferenciar microorganismes. Cap d’aquestes proves ens
donarà la línia evolutiva dels microorganismes. Cap d’aquestes proves ens donarà la
línia evolutiva dels microorganismes, pe això al 1970 es va decidir fer un estudi del
genoma. El que es feia era agafar gens. Es va decidir utilitzar el rRNA, més
concretament el gen 16s, veient
que d’aquesta manera les
podíem comparar i ens donava
un arbre filogenètic.
3
Pasteur va demostrar que la generació espontània no existia. L’experiment de Pasteur
consistia en introduir un brou en un recipient, el va esterilitzar però no va tancar el
recipient hermèticament. Es microorganismes van contaminar el coll, però el brou,
sempre que el recipient es mantegues recte verticalment.
Robert Koch assegurava que moltes malalties eren produïdes per microbis. Es va
dedicar a estudiar els seus pacients. Va descobrir els bacils de cocs, també el causant de
l’àntrax.
4
Només l’1% de la varietat microbiana es pot cultivar en placa i segons el medi se’ns
envà cap a el 0%. Projectes metagenómics, es agafar to el nivell cel·lular d’un ambient i
seqüenciar, per permetre saber gens, RNA.
5
6
Tema 2. El món dels procariotes
Grandària i morfologia
Parameci 200μm de longitud, schichia coli 1,5μm de llargada, virus 60nm d’amplada.
Nanobacteris, diferents autors diuen que són cèl·lules bacterianes, altres que no són
cèl·lules, el que es cert es que són les més petites < 0,05- 0,2μm.
7
El significat de la relació Superfície/volum
Com més gran és la relació superfície volum més material intervé el microorganisme
amb el medi.
El microscopi és una eina bàsica en microbiologia que ens permet observar els
microorganismes gràcies a la seva capacitat per augmentar la grandària
Observació:
8
Preparacions in vivo (o fresques)
Simple portaobjectes/cobreobjectes
En gota pendent
Tincions
Colorants de tipus bàsic (càrrega positiva): s'uneixen a les parts cel·lulars amb càrrega
negativa. Són útils per tenyir cèl·lules microbianes. Per procariotes.
Colorants de tipus àcid (càrrega negativa): s'uneixen a les parts cel·lulars amb càrrega
positiva. Són útils per tenyir teixits infectats amb microorganismes.
Per fixar la mostra al portaobjectes ho podem fer amb calor, però s’ha d’anar amb molt
de compte de cremar la mostra.
Observem la mostra directament amb objectiu de 100, 1000 augments sempre que
mirem procariotes. Si el microorganisme és molt làbil es pot fixar químicament, afegint
una gota de fixador com glutaraldehid, àcid òsmic, formaldehid, etc.
9
Tincions
Tincions simples. S'usa un únic colorant bàsic. Exemple. Tinció amb blau de
metilé.
Tincions diferencials. S'usen per distingir entre tipus diferents de
microorganismes. Consta de tinció primària i tinció de contrast. Exemple. Tinció
de Gram: Distingir grampositius (blau) de gramnegatius (vermell).
Exemple. Tinció de Ziehl-Nieelsen (àcid alcohol resistent). Distingir
Mycobacterium (vermell) de la resta de bacteris (blau).
Tincions Específiques. Revelen estructures particulars d'una cèl·lula. Exemple.
Tinció d'endospores (tinció de Wirtz-Conklin).
Exemple. Tinció de càpsules.
Tinció de Gram
Pas 1 i 2. Utilitzem tinció primària amb cristall violeta + mordent (solució de iode). En
una mostra quan es tenyeix i queda blava es Gram + i vermella Gram -. Això ho fa pel
contigut de la paret.
10
Aquest procés distingeix streptococs, diplococs, bacils i cèl.lules de llevats.
Diferència els bacteris del gènere microbacterium e la resta. Ho fa perquè els bacteris
d’aquest gènere tenen a les seves voltes amb àcids micólics. Aquesta tinció té un ús
molt important en diagnòstic. Aquests bacteris són de creixement molt lent, poden trigar
fins a 30 dies en créixer. Pas 1 i 2: Tinció primària amb fucsina bàsica. Escalfar a la
flama per permetre la penetració del colorant dins la cèl.lula.
Es basa en la presència d'un compost químic (àcid dipicolínic) propi de les endòspores
bacterianes (gèneres Bacillus i Clostridium fonamentalment).
Pas 1. Tinció amb verd de malaquita. Escalfar a la flama per permetre la penetració del
colorant dins l’endòspora.
Pas 3. Tinció amb safranina aquosa (color vermellós) per tenyir les cèl·lules vegetatives.
Tinció de càpsules
Observació clara i amb detall de les cèl·lules sense tenyir. Les cèl·lules apareixen
rodejades d'un anell lluminós. Aplicacions:
Observació clara i amb detall de les cèl·lules sense tenyir. Les cèl·lules s'observen com
una imatge brillant contra un fons fosc. És la que té major poder de resolució.
Aplicacions:
11
Observació d'estructures externes de la cèl·lula com flagels.
Observació del moviment.
Recomptes.
Microscòpia de fluorescència
Microscopi confocal
S’utilitza per estudiar les poblacions en els seus ambients. Els bacteris que colonitzen es
fixen i alguns comencen a segregar substàncies que acaben formant biopel·liucles (un
entramat de fils i xarxes). En els medis no naturals també ho fan, cetéters, molts
objectes que es fan servir en cirurgia, etc.. Eliminar els bacteris de biopelicules és molt
complicat, perquè els protegeixen dels antibiòtics. A les canonades, també podem
observar biopel·liclues.
Es tracta d’un microscopi computeritzat que acobla una font de làser. Dona imatges
digitalitzades en tres dimensions. Software pel processament de les imatges:
Escombratge (SEM)
Transmissió (TEM)
12
Observació de virus.
Observació d'estructures cel·lulars (ultraestructura).
Un organismes quan esta a les acaballes, encara que li donem nutrients no l’afavorirà. El
que s’haurà de fer serà deixar-lo en condicions penoses un temps i després
progressivament canviar-lo.
Macronutrients
13
El ferro per la majoria de microorganismes és un macronutrient, però per altres es tracta
d’un micronutrient, o element traça.
14
El ferro pot ser un factor limitant del creixement. Normalment aquest està calat, i per
tant molt poc esta biodisponible, no permeten als microorganismes que en infecten
créixer i desenvolupar-se. Els microorganismes aquests s’adaptaran i realitzaran
mecanismes per captar el ferro d’altres llocs.
Disposen de receptors de quelants de ferro, molècules que capten ferro de les mostres
molècules, tot i està en molt baixa concentració.
Líquids.
Sòlids (porten un agent solidificant i permeten aïllar colònies, fem servir agar –
agar, abans es feia servir gelatina però els organismes degradaven i es feia
líquid).
Semisòlids (també afegim agar-agar però en baixa concentració).
Els sòlids en plaques de petri. A partir de 45ºC el agar –agar es liqua. Els termòfils i
hipertermòfils no es poden cultivar.
Medi definit mínim, conté la concentració mínima que cal per l’organisme. Existeix per
tant un medi mínim per a cada bacteri. El temps que triga a dividir-se E.coli es d’una
hora en condicions mínimes. Per agafar els components necessaris, l’han de fer per ells
mateixos. Això es refereix a la capacitat biosintètica als microorganismes. Scoroclum
no pot créixer perquè no pot sintetitzar.
15
En un medi ric tos dos bacteris creixen molt bé, E. Coli al tenir tot el necessari només
triga 20min.
En medi ric les cèl·lules creixen grans i en més nombre. En canvi a medi mínim n’hi ha
poques i són més primes.
Medis diferencials
Exemple. Medi agar sang creixen molts patògens i molt ràpid. La sang es tracta d’un
medi complex. Els organismes patògens són capaços de produir hemòlisi, permetent-nos
diferenciar hemolítics i no hemolítics. Dins els hemolítics podem diferenciar en α i β
hemolítics.
Medis selectius
Són medis amb compostos inhibidors del creixement d’un o més grups. (Exemple.
Azida sòdica, Tel·lurit, Cristall violeta.), o Medis amb antibiòtics inhibidors del
creixement de certs grups microbians (Exemple. Antibacterians i antifúngics).
Exemple. EMB (Erosin Mehylene Blue) Coliforms bacteris gram – que fermenten la
lactosa i formen part de la família enterobacterizae (són entero patògens o bacteris que
viuen al tracte intestinal). Amb indicadors de bacteris, busquem els patògens. Per
detectar coliforms de l’aigua es va dissenyar un medi selectiu diferencial (EMB). El
blau de metilè li dona el caràcter de selectiu. La lactosa i la eosina són els dos caràcters
diferencials.
Medis d’enriquiment
16
Condicions ambientals del cultiu
Aerobiosi
Anaerobiosi, gerres d’anaerobiosi amb un generador de gas.
Hi ha bacteris que no poden créixer en aquests llocs, i per això hi ha unes bobines en
condicions anaeròbiques on es manipulen els microorganismes.
Tècnica asèptica
Aïllament de procariotes
17
D’un cultiu mixt agafem la cèl·lula que volem i l’aïllem. Aquesta prolifera i després
podem agafar qualsevol de les obtingudes i aïllar-lo, tenint així un cultiu pur.
Sembra en estria
En la de profunditat afegim normalment 1ml de mostra, s’estén per tot el medi de dalt a
baix.
Per separar cèl·lules cal fe dilucions, si la dilució la fem 1010 vegades tindrem 1010
colònies (càlcul de concertació de cèl·lules viables). El càlcul de concertació
18
microscòpic dona cèl·lules, el càlcul per sembra dona unitats formadores de colònies.
Examen microscòpic
Característiques culturals
Sistemes miniaturitzats
Són unes tires on es poden realitzar totes les proves que normalment realitzen al
laboratori, estalviant així un temps considerable.
Sistemes automàtics
Unes targetes on podem veure un seguit de proves. Aquesta targeta es pot connectar a
l’ordinador, que llegirà els resultats.
Tècniques d’identificació
20
Tècniques moleculars, utilitzem el DNA.
o Hibridació, una sonda específica (un fragment de DNA 100 – 1500pb,
específica d’un gen), mira si està present al microorganisme. Les
cèl·lules es trenquen per obtenir el DNA, el desnaturalitzem quedant
cadena senzilla al igual que la sonda, i aleshores mirem si s’engaxen. La
sonda esta marcada per després poder observar-la. Els diferents gradients
depenen de la quantitat de DNA, no és que siguin diferents.
o PCR, Ens servirà per distingir microorganismes. Quan fem un gel veiem
control + el valor a esperar i la els resultats negatius són els que ens
indicaran la intensitat amb la que està present el microorganisme.
21
Mètodes de manteniment i conservació
Agar conservació 4ºC, microorganismes en estat latent, però no es pot tenir durant
molt de temps. S’utilitza quan es treballa amb ell sovint.
Congelació amb nitrogen líquid, utilitzem també crioprotectors i podem observar més
temps que l’anterior (- 196ºC).
Liofilització, extreure l’aigua. Quan el vulguem tornar a fer servir només caldrà posar-
ho en un medi. Això es fa a temperatura ambient.
Col·leccions microbianes
Són llibreries on es guarden les soques microbianes, es pot fer ús d’elles sempre que es
desitgi. Molts països tenen la seva pròpia CECT és l’espanyola, ATCC l’americana,
també existeix una llibreria mundial la WDCM.
REGULACIÓ I SEGURETAT
Real Decreto 664/1997 del 12 de maig “Protección de los trabajadores contra los riesgos
relacionados con la exposición a agentes biológicos durante el trabajo.
Real Decreto 178/2004 del 30 de enero por el que se aprueba el reglamento general para
el desarrollo y ejecución de la Ley 9/2003 de 25 de abril por la que se establece el el
regimen jurídico de la utilización confinada, liberación voluntaria y comercialización de
organismos modificados genéticamente. (BOE no. 27 del s 31 de gener de 2004).
22
Tema 5. La cèl·lula procariota
Presenten membrana cel·lular, paret cel·lular i apèndixs, en canvi, no presenten
membrana nuclear. Però presenten una regió on hi ha el genoma i aquest és el nucli.
Trobem ribosomes escampats pel citoplasma, normalment units al mRNA, també tenen
els cossos d’inclusió que són substàncies de reserva.
La membrana cel·lular
És una doble bicapa lipídica amb fosfolípids i proteïnes integrals de membrana, també
hi trobem proteïnes perifèriques importants per la vida de les cèl·lules.
Del 5 al 25% del contingut lipídic de la membrana són esterols. Però tot i així
l’estructura general de la membrana plasmàtica és com la dels eucariotes.
23
Els que presenten tetraèter de diglicerol només poden formar una monocapa. Si
presenten diéter de glicerol presenten una bicapa lipídica. Per tant, no tots els Archea
presenten bicapes lipídiques, alguns poder formar monocapa, però no a la membrana
cèl·lula. Molts hipertermofils (temperatura òptima molt elevada) tenen monocapa així
s’aconsegueix una menor fluïdesa.
Hi trobem proteïnes sensores, per tant, està interaccionant contínuament amb l’ambient
[O2], [glucosa], intensitat de llum, etc..
24
Transport simple: Una única permeasa permet l’entrada i sortida d’un compost i
l’energia l’obté del gradient de membrana.
Exemple de transport simple en E. Coli.
La permeasa és de síntesi constitutiva (sintetitzada contínuament a la
cèl·lula) però algunes són indivisibles.
25
Transport tipus ABC (de tres components). Consta d’una proteïna
transmembranal i una de periplasmàtica. Llavors hi ha la proteïna 3 que és una
ATPasa, per tant, aquest transport depèn de l’hidròlisi d’ATP.
La proteïna periplasmàtica transporta la substància fins a la permeasa (proteïna
transmembrana), aquesta interacció provoca que l’ATPasa hidrolitzi l’ATP,
llavors es produeix un canvi de conformació i entra la molècula.
Tipus I: Un exemple són els transportadors ABC però que expulsen molècules.
Tenen dues proteïnes addicionals normalment que col·laboren en el procés.
Tipus II: Proteïnes que quan es sintetitzen tenen el pèptid líder, aquest serveix de
senyal per la cèl·lula per la seva expulsió. Aquesta seqüència és reconeguda per
la SRP i la proteïna 7B impedeix que la proteïna es plegui. Llavors és conduïda
cap a la proteïna transmembranal (Sec YEG) i la seva Sec A empeny la proteïna
amb consum d’ATP per la Sec YEG, així és alliberada a l’exterior i allà pren la
seva estructura natural (Sistema Sec YEG).
Tipus III: Mecanisme que trobem a patògens. Els diferents patògens que el
presenten injecten a les cèl·lules que infecten factors de violència. Sintetitzen
unes molècules que la base està unida a la cèl·lula i l’altre part per fora la
membrana de la cèl·lula hoste i injecta el factor de virulència. L’estructura
d’injecció s’anomena agulla per la seva forma.
Tipus IV: Sistemes de conjugació dels bacteris gram -. Secreten DNA proteïnes.
Alguns secreten factors de virulència.
Tipus V: Sistemes de transport Tat Secreció de proteïnes plegades.
Tots presenten paret excepte els Mycoplasmas perquè són paràsits intercel·lulars i viuen
a dins d’altres cèl·lules,
Els bacteris gram + (tenen la paret gram positiva que es tenyeix blava). L’espai
periplasmàtic és molt petit seguit d’una regió molt densa. La composició química de la
paret hi predomina el pèptid glicà (90% o més).
En els bacteris gram – (tenen la paret gram negativa que els tenyeix de color vermell).
L’espai periplasmàtic és molt més gran i dins d’aquest hi trobem una capa densa però
prima i després una altre capa densa més gruixuda.
26
A la primera capa (prima) hi ha peptidglicà i la gruixuda té una estructura de bicapa
lipídica per això se l’anomena membrana externa, però no té les propietats de la
membrana plasmàtica.
El peptidglicà agafa rigidesa amb un enllaç extra l’últim aminosacàrid d’una cadena de
tetrapèpeptid i el penúltim aminoàcid d’una altre cadena de tetrapèptid continu.
27