Bacteriologie médicale ocites: a LUE eis e Le cours @ 30 QROC et cas cliniques corriges. fm MASSON( Introduction Cet ouvrage déctt le 1dle des bactéries en pathologie médicale. Il est destiné principalement aux étudiants en médecine et aux médecins, mais aussi & tous les personnels de santé concemés par les infections bactériennes. ll ne s'agit pas d'un traité visant & lexhaustivité, ni d'un ouvrage de techniques destiné au biologiste. Les considérations d’ordre technique (notamment celles concemant les méthodes d'identification bactérienne) ont &é réduites au minimum. ouvrage a pour but de permettre des cliniciens de comprendre le rdle des bactéries dans les infections humaines et de dialoguer avec le microbiologiste. La pattie théorique de Fouvrage comporte trois sections — la premiére section contient des informations générales sur les bactéries, la réponse de fhéte 3 linfection, et les antibiotiques. = La seconde section passe en revue les principales bactéries rencontrées en pathologie humaine : leur mode de transmission, les maladies qu’elles provoquent, les armes qu’elles utiisent, Les moyens de diagnostic et les bases du traitement seront également décrts. (Une description détaillée des maladies et de la thérapeutique est & rechercher dans des ouvrages de maladies infectieuses.) — La troisiéme section contient des informations complémentaires. La partie pratique permet au lecteur de s‘entrainer et de valider ses connaissances grace & des exercices cortiges. Je remercie les professeurs C. Petronne et J-L. Vildé pour la relecture des exercices pratiques. Les connaissances et les techniques dans le domaine de la bactériologie médicale ont beau- coup progressé ces demnitres années. Le lecteur souhaitant des compléments ¢’information trouvera des réérences diarticles-revues en fin de chapitre et des références de traités récents en fin doouvroge.Meti-R ( Abréviations adénosine monophosphate cyclique complexe majeur d’histocompatibilité concentration minimale inhibitrice Direction départementale des affaires saniteires et sociales Enzyme-linked Immunosorbent Assay interféron immunoglobuline interleukine traveineux liquide céphalo-rachidien résistant 8 la méticilline (et & ensemble des Belactamines) Natural Killer protéine de liaison a la pénicilline Polymerase Chain Reaction T helper, lymphocyte T auniliaire op__——_____coumiseress (Bactériologie médicale (Bactériologie générale } Structure bactérienne e Cytoplasme (6). Membrane eytoplasmique (6).Paroi (6). Capsule (8). Appendi- es (8). Spores (8. D Croissance bactétienne a ennnenn enn Culture des bactéries (11). Cinétique de la croissance bactérienne (11). Besoins nnutritfs (12). Penetration des elements nuts (13). Conditions physico-chimi- ques de la culture (13). Métabolisme énergétique (14). Milieux de culture en bactériologie médicale (14). Classification (17). Identification (18). D Variations génétiques chez les bactéries nn ‘Mutations (21). Transposition (21). Transfert de matériel génétique (22). D Facteurs de pathogénicité Adhésines (28). Invasion des cellules non phagocytates (28). Résistance & la phagocytose (29). Persistance dans les phagocytes (23). Tosines protéiques (29), Lipopolyzaccharide ou endotoxine (51). Echappemert au aystéme immu nitaite (32). Captation du fer (53. D Mécanismes de défense contre les bactéries Barrigres anatorniques (35). Resistance naturelle (36). Immunité acquise (39), Relations entre résistance naturelle et immunitS acquise (43). Principe des vac- nations (43). D Epidémiologie des infections bactériennes Epidémiologie des infections communautaites (45). Epidémiologie des infec- tions nosocomiales (46). Marqueur épidémiologiques (47). ow n W 2 27 35 45(CONNASSANCES » Action des antibiotiques sur les bactéries _.. Concentration minimale inhibitrice (CMI) (51). Bactéiiostase et bactercidie (53). Associations d‘antibiotiques (53), Corrélation entre études in vitro et résul- tatsin vivo (54). Principales familles d’antibiotiques et leur mode d'action ....... ‘Antibiotiques agissant sur la synthése du peptidogiycane (55). Antibiotiques in- hibant la synthese protéique (60). Antibiotiques agissant sur les acides nucle ‘ques (62), Antibiotiques agissant sur les membranes (63). D Mécanismes de résistance aux antibiotiques Inactivation de lantibiotique (65). Modification de la cible (67). Diminution de la perméabilite (68), Excrétion de Fantbiotique pat un mécanisme d’eflux (63). Evolution de la résistance aux antibiotiques (63). D Regles dlutilisation des antibiotiques Indication du traitement antibiotique (71). Choix de lantibiotique (71). indica- tion dos associations diantibiotiques (72). Posologie et voie dad (72), Durée du traitement (73). Gestes complémentaires (73). Suivi du uaite- ment (73). D Diagnostic biologique des infections bactériennes. Mise en évidence de l'agent infectious (75). Mie en évidence de la réponse im- munitaire (77). Bactéries d'intérét m« Cocei & Gram positif. D Staphylococcus ... ‘Staphylococcus aureus (83), Autres staphylocoques (86). Streptococcus et Enterococcus... seem Streptococcus pyagenes (ou streptocoque du groupe A) (87). Streptococcus agalactiae (ou streptecoque du groupe 8) (91). Autres streptoceques (92). En- terocaceus (93). Streptococcus pneumoniae .. (95). Powvoir pathogene (95). Facteurs de pathoge- biologique (97). Bases du traitement (97). D Neisseria .... [Neisseria meningitidis (101). Neisserie gonorrhoeae (103). Autes coed & Gram nnegatif (108). ey n 5 83 87 101Taste oes manbnes Cocci & Gram postif. - 109 D Corynebacterium . on Corynebacterium iphteriae (111), Autres coynebactéries (114). Listeria monocytogenes nena Habitat (115). Transmission (115). Pouvoir pathogéne (115). Facteurs de patho- ‘enicite (116). Diagnostic biologique (117). Bases du tatement (117). D Autres bacilles 8 Gram positif ... = Ensipeloirxrhusiopthae (119) Rhodococas equ (119). Nocardia (119). Bacillus (120). Tropheryma whippelii (120). Bacilles a Gram négatif. D Entérobactéries .. D Escherichia coli .. Habitat (127). Pouvoir pathogene (127). Facteurs de pathogenicité (128). D salmonella Habitat 33). Transmission (133) Pouvo pathogene (154, Fateursde patho- ‘génicité (155). Diagnostic biologique (136). Sérologie (136). Bases du traite- ment (136). Habitat (139). Transmission (139). Pouvoir pathogéne (139). Facteurs de patho- genicite (140). Diagnostic biologique (141). Bases du traitement (141). Yersinia peas (143), Yersinia enterocalica (144). Yersinia pseudotuberculss (146). D Bacilles a Gram négatif de environnement ...... Pseudomonas aeruginosa (147). Autres bacilles a Gram négatt (148). Haemophilus Haemophilus influenzae (151). Autres Haemophilus (153). D Bordetella Bordetella pertussis (155). Auttes Bordetella (157). D Bacilles & Gram négatif d'origine animale Brucella (159). Pasteurella (161). Francisella tularensis (162). Streptobacillus ‘monolfiormis (162).‘CONNASSANCES, 3 Legionella ... 165 Habitet (165). Transmission (165). Pouvoir pathogéne (165).Facieurs de patho: “ énicité (66). Diagnostic biologique (166). Bases du traitement (167). 3 D Bacilles a Gram négatif divers 168 - Groupe HACEK (168). Grcnerela vaginels (168). Colymmarobocterium gra i 2 ‘rulomatis (169). Burkholderia pseudomaslei (170). x Bactéries incurvées & Gram négi e = m { Dvibrio Vibrio chelerae (173), Autves vbrio (175). > Campylobacter. Habitat (177). Transmission (177), Pouvoit pathogene (177). Facteurs de patho- {encité (178). Diagnostic biologique (176). Bases du traitement (178) 13 7 k 3 D Helicobacter Habitat (181). Transmission (181). Pouvoir pathogene (181). Facteurs de patho- genicité (182). Diagnostic biologique (182). Bases du traitement (182). Mycobactéries. D Mycobacterium tuberculosis et autres mycobactéries 187 ‘Mycobacterium tuberculosis (187). Autres mycobactéries du complexe Tubercu- - losis (192). Mycobacterium leprae (192). Mycobacterias atypiques (163). D Clostridium ... 199 4 Habitat (199), Clostridium tetani (199). Clostridium botulinum (201). Clostri- dium pertringens (202). Clostridium difficile (204). Bactéries anaérobies strictes . \ D Anaérobies de la flore endogene Pouvoir pathogine (207). Diagnostic biologique (208). Bases du taitement 208), a Spirochates. yee ee 208) q an 185 205 207 2 D Treponema .. Trepanema palicium subsp. Palidum (211). Aukees téponémes (214). DLeptospira 23 4 Habitat (215) Trensmisson (215). Pout pathogéne (215). Diagnostic bico- | 2 sique (216). Bases du traitement (216).TABLE DES MATERES D Borrelia et Spire ONG Borrelia burgdorferi (219). Autres Borrelia (220). Spirillum minus (220). 23 i : : 22s ; CChlamytia trachomatis (226). Chlamyia psiteci (227). Chlamydia preumno- niige (228). 5 D My COpLAS IID enemies Bi ng i ‘Mycoplasma pneumoniae (223), Mycoplasmes gertaux (230). D Rickettsia, Coxiella et Ehrlichia - Rickettsia prowazokii (233). Autres rckettsioses (234). Coxiolla burneti (235). Enrichia (256). 233 D Bartonella ..... Bartonella henselae (237). Autres Bartonella (238). ‘Annexes Principales bactéries en cause dans différents syndromes cliniques.... Recommandations concemant la prise en charge infections bactériennes.... = 207 D Pour en savoir plus..... (Bactériologie médicale