B.

cereus has evolved a panoply of pathogenic attributes, including adhesins and toxins, that make it able
to enter and survive within the human host and, under certain circumstances, to breach barriers and cause
pathologic processes in various anatomical compartments. These are discussed in a dedicated chapter, but
it is important, here, to emphasize that the major hurdle, when B. cereus is isolated in clinical materials, is
the need to overcome its nagging stigmata as a mere harmless contaminant, which is unfortunately still in
vogue despite a globally ongoing evidence of diseases other than those (probably the most famous ones,
together with ocular infections) involving the enteric tract.

Actually, outside the notoriety of B. cereus as an agent of food poisoning, acknowledgment of the
multitude of other severe infections it may cause, such as fulminant bacteremia and devastating central
nervous system involvement, is lacking. Both clinicians and clinical microbiologists must therefore
seriously consider B. cereus isolates from clinical specimens before aprioristically dismissing them as
accidentally contaminating organisms, especially when an underlying immunosuppression is present.

B. cereus, finally, by virtue of its exotoxin armamentarium, may be considered to be centrally situated
between B. anthracis and, though an anaerobe, C. perfringens, thus representing a formidable link
between these two sporulating bacterial species. In fact, B. cereus can both acquire and carry B.anthracis
genes that are responsible for an anthrax-like pneumonia and, through its exoenzyme profile, overlap with
C. perfringens pathogenicity in the event of gas gangrene-like skin syndromes.

The debate surrounding classification of B. cereus group strains is not exclusively of academic and
taxonomic interest, therefore; conversely, it does relate to issues concerning public health. In fact, for
instance, B. cereus isolates that carry B. anthracis virulence determinants have caused cases of serious
anthrax-like disease. Again, while B. cereus is a well-known agent of food poisoning, B. thuringiensis
plays a role as a biological insecticide for crop protection, as mentioned above. Nevertheless, genes
encoding the cytotoxins causing the diarrheal syndrome and other B. cereus infections are usually
chromosomally encoded, and are present in all species of the B. cereus group, though silent in
B.anthracis. Especially, B. thuringiensis and B. cereus share similar distributions and expression of genes
encoding extracellular pathogenic factors, and the former has caused human infections similar to those
caused by the second. Unfortunately, food poisoning caused by B. thuringiensis is probably
underreported, given that methods for identification of B. cereus group strains cannot discriminate
between B. cereus and B. thuringiensis.

It has been suggested that B. cereus, B. thuringiensis, and B. anthracis be considered one species only,
based on genetic evidence, but there is no consensus on this matter thus far. Such an ambiguous
taxonomy of the B. cereus group then reflects the difficulties encountered with species classification
within bacterial systematics, especially today, in the so-called genomic era. It is also clear that
phylogenetic analyses within the B. cereus group are furthermore complicated by extensive horizontal
transfer of mobile genetic elements between strains. Nevertheless, whereas the genome investigation
suggests that the B. cereus group be considered as one species, a good argument supporting current
nomen-clature is the principle that “medical organisms with defined clinical symptoms may continue to
bear names that may not necessarily agree with their genomic relatedness so as to avoid unnecessary
confusion among microbiologists and nonmicrobiologists,” as stated by rule 56a(5) in the Bacteriological
Code.
About the B. cereus phenotype, it is interesting to note, finally, that intermediate types between B. cereus
and B. weihenstephanensis may sometimes be observed that are interpreted as a “snapshot” of ongoing
thermal adaptation inside the B. cereus group.

Phenotype may in fact not always reflect genotype; accordingly, and historically, B. cereus, B.
thuringiensis, B. anthracis, and B. mycoides were described based on phenotype about one century ago,
much earlier than the discovery of DNA as carrying heritable information. At that time, particularly,
classification of bacteria was usually made on the basis of their morphological and physiological features,
habitats, and pathogenicity for mammals or insects. Later, the large extent of synteny among their
genomes and other genotypical similarities led scientists to suggest that the mentioned four species indeed
represented a single taxon.

In addition to the importance of Bacillus species as human pathogens as well as for agricultural purposes
(related to their biocontrol properties, which are discussed in a separate chapter), numerous strains that
have important economic relevance are used as probiotics, preventing enteric disorders. Among such
strains, B. cereus va r. toyoi (strain BCT 7112T) has been used since 1975; in that year, in fact, it was
officially approved by the Japanese Ministry of Agriculture and Forestry as the commercial product
TOYOCERIN Spores of strain BCT-7112T have found application in animal nutrition, particularly for
poultry, swine, cattle, and rabbits, along with aquaculture for over 30 years, in several countries
throughout the world. In the European Community, TOYO CERIN was first authorized by the European
Commission in 1994 for use in swine, thus becoming the first bacterium authorized as a feed additive in
the European Union; later, it was authorized for poultry, cattle, and rabbits, too. Original identification
studies assigned strain BCT-7112T to the species B. cereus; however, several phenotypic features can
indeed differentiate it from the main phenotype of this species, so it was labeled as a variant and named
B. cereus va r. toyoi. Following investigations based on DNA–DNA hybridization have documented that
this organism might not be B. cereus after all, but actually represents a different species of the group, that
is, B. toyonensis.
B. cereus a développé une panoplie d’attributs pathogènes, y compris des adhésines et des toxines, qui lui
permettent d’entrer et de survivre dans l’hôte humain et, dans certaines circonstances, de franchir les
barrières et de provoquer des processus pathologiques dans divers compartiments anatomiques. Ceux-ci
sont discutés dans un chapitre dédié, mais il est important, ici, de souligner que le principal obstacle,
lorsque B. cereus est isolé dans les matériaux cliniques, est la nécessité de surmonter ses stigmates
persistants comme un simple contaminant inoffensif, qui est malheureusement encore en vogue malgré
une évidence globalement continue de maladies autres que celles (probablement les plus célèbres, ainsi
que des infections oculaires) impliquant le tractus entérique.

B. cereus a développé une panoplie d’attributs pathogènes, y compris des adhésines et des toxines, qui lui
permettent d’entrer et de survivre dans l’hôte humain et, dans certaines circonstances, de franchir les
barrières et de provoquer des processus pathologiques dans divers compartiments anatomiques. Ceux-ci
sont discutés dans un chapitre dédié, mais il est important, ici, de souligner que le principal obstacle,
lorsque B. cereus est isolé dans les matériaux cliniques, est la nécessité de surmonter ses stigmates
persistants comme un simple contaminant inoffensif, qui est malheureusement encore en vogue malgré
une évidence globalement continue de maladies autres que celles (probablement les plus célèbres, ainsi
que des infections oculaires) impliquant le tractus entérique.

B. cereus, enfin, en vertu de son exotoxine armamentarium, peut être considéré comme étant situé au
centre entre B. anthracis et, bien qu’anaérobie, C. perfringens, représentant ainsi un lien formidable entre
ces deux espèces bactériennes sporulantes. En fait, B. cereus peut à la fois acquérir et transporter les
gènes de B. anthracis responsables d’une pneumonie semblable à celle de l’anthrax et, grâce à son profil
exoenzymatique, chevaucher la pathogénicité de C. perfringens en cas de syndromes cutanés semblables à
des gangrènes gazeux..

Le débat entourant la classification des souches du groupe B. cereus n’est donc pas exclusivement
d’intérêt académique et taxonomique; à l’inverse, il porte sur des questions de santé publique. En fait, par
exemple, les isolats de B. cereus porteurs des déterminants de la virulence de B. anthracis ont causé des
cas graves de maladie semblable à l’anthrax. Encore une fois, alors que B. cereus est un agent bien connu
de l’intoxication alimentaire, B. thuringiensis joue un rôle comme insecticide biologique pour la
protection des cultures, comme mentionné ci-dessus. Néanmoins, les gènes codant les cytotoxines causant
le syndrome diarrhéique et d’autres infections à B. cereus sont généralement codés chromosomiquement,
et sont présents dans toutes les espèces du groupe B. cereus, bien que silencieux dans B.anthracis. En
particulier, B. thuringiensis et B. cereus partagent des distributions et une expression similaires de gènes
codant des facteurs pathogènes extracellulaires, et le premier a causé des infections humaines similaires à
celles causées par le second. Malheureusement, l’intoxication alimentaire causée par B. thuringiensis est
probablement sous-déclarée, étant donné que les méthodes d’identification des souches du groupe B.
cereus ne peuvent pas faire de discrimination
entre B. cereus et B. thuringiensis.
On a suggéré que le B. cereus, le B. thuringiensis et le B. anthracis soient considérés comme une seule
espèce, d’après les données génétiques, mais il n’y a pas de consensus à ce sujet jusqu’à maintenant. Une
telle taxonomie ambiguë du groupe B. cereus reflète alors les difficultés rencontrées avec la classification
des espèces au sein de la systématique bactérienne, en particulier aujourd’hui, à l’ère dite génomique. Il
est également clair que les analyses phylogénétiques au sein du groupe B. cereus sont en outre
compliquées par un transfert horizontal important d’éléments génétiques mobiles entre les souches.
Néanmoins, alors que l’étude du génome suggère que le groupe B. cereus soit considéré comme une seule
espèce, un bon argument à l’appui du nomen-clature actuel est le principe selon lequel « les organismes
médicaux présentant des symptômes cliniques définis peuvent continuer de porter des noms qui ne
correspondent pas nécessairement à leur lien génomique afin d’éviter toute confusion inutile entre les
microbiologistes et les non microbiologistes », comme le stipule la règle 56a(5) du Code bactériologique.

À propos du phénotype B. cereus, il est intéressant de noter, enfin, que des types intermédiaires entre B.
cereus et B. weihenstephanensis peuvent parfois être observés qui sont interprétés comme un
« instantané » de l’adaptation thermique continue à l’intérieur du groupe B. cereus.

En plus de l’importance des espèces de Bacillus en tant que pathogènes humains ainsi qu’à des fins
agricoles (liées à leurs propriétés de lutte biologique, qui sont discutées dans un chapitre séparé), de
nombreuses souches qui
ont une pertinence économique importante sont utilisés comme probiotiques, la prévention des troubles
entériques. Parmi ces souches, B. cereus va r. toyoi (souche BCT 7112T) est utilisé depuis 1975; en fait, il
a été officiellement approuvé par le ministère japonais de l’Agriculture et des Forêts comme produit
commercial TOYOCERIN Spores de la souche BCT-Depuis plus de 30 ans, 7112T a trouvé des
applications dans l’alimentation animale, en particulier pour la volaille, les porcs, les bovins et les lapins,
ainsi que dans l’aquaculture, dans plusieurs pays du monde. Dans la Communauté européenne, TOYO
CERIN a été autorisé pour la première fois par la Commission européenne en 1994 pour l’utilisation chez
les porcins, devenant ainsi la première bactérie autorisée en tant qu’additif pour l’alimentation animale
dans l’Union européenne; elle a ensuite été autorisée également pour la volaille, les bovins et les lapins.
Des études d’identification originales ont assigné la souche BCT-7112T à l’espèce B. cereus; cependant,
plusieurs caractéristiques phénotypiques peuvent effectivement la différencier du phénotype principal de
cette espèce, de sorte qu’elle a été étiquetée comme une variante et nommée B. cereus va r. toyoi. À la
suite d’enquêtes fondées sur l’hybridation ADN-ADN, on a établi que cet organisme pourrait ne pas être
B. cereus après tout, mais représenter en fait une espèce différente du groupe, c’est-à-dire B. toyonensis.