Professional Documents
Culture Documents
Osnovi Bakteriologije I Virologije (Izborni Modul Diplomskih Studija) PDF
Osnovi Bakteriologije I Virologije (Izborni Modul Diplomskih Studija) PDF
virologije
Diplomski studij, izborni modul
Virologija
Virus – riječ koja je kroz povijest mijenjala značenje
u rimsko doba: svaka otrovna tvar
u 18. st.: otrov, neugodan miris znoja, iscjedak iz čira
u 19. st.: otrovne tvari povezane sa zarazama
(infekcijama), nevidljivi uzročnici bolesti
u 20. st.: sve običnim mikroskopom nevidljive zarazne
čestice
Otkriće virusa: kraj 19. st., 1892. godine Ivanovski je
proučavajući “mozaičnu bolest duhana” otkrio virus, kasnije
opisan kao TMV (Tobaco Mozaic Virus), 1989. god.
Beijerinck je nezavisno došao do istih rezultata kao
Ivanovski; contagium virum fluidum = tekući zarazni
uzročnik; Beijerinck je smatrao da je to “proteinska molekula
koja se razmnožava”
Tobaco Mozaic Virus
Važnija otkrića u povijesti virologije (Juretić 2002.)
Reprodukcija virusa
Definicija virusa (Frankel – Cornat i sur. 1988.)
“Virusi su zarazni uzročnici (čestice) koji sadrže samo
jedan tip nukleinske kiseline: RNA ili DNA; njihova je
nukleinska kiselina umotana u proteinski omotač
izgrađen od jednog ili nekoliko proteina; kod nekih virusa
oko proteinskog omotača dolazi složeno građena
ovojnica izgrađena iz proteina, lipida i ugljikohidrata.
Virusi su sposobni svoju nukleinsku kiselinu prenositi od
jednog do drugog domaćina; sposobni su nametnuti
stanici domaćina svoju genetičku informaciju, zbog čega
se mogu koristiti enzimatskim ustrojem domaćina za
svoje “razmnožavanje”. Neki virusi mogu svoju
nukleinsku kiselinu ugraditi na više ili manje reverzibilan
način u DNA domaćina te tako postati latentni ili
perzistentni. Neki su od takvih virusa sposobni
transformirati genom stanice domaćina i ometati njezin
kontrolni mehanizam rasta, te uzrokovati tumore.
dalton = masa gotovo jednaka masi atoma vodika
Imunogenost virusa
- Svaka strana bjelančevina ili polisaharid molekularne mase
veće od 1000 daltona (posebno ako je mase veće od 10 000
daltona) unesena u tkivo životinja izaziva imuni odgovor
- Imuni odgovor može biti:
a) stvaranje specifičnih protutjela (humoralna imunost)
b) stvaranje limfatičnih, imunokompetentnih stanica (stanična
imunost)
- tvar (supstanca) koja izaziva imuni odgovor zove se
imunogen
- ako imunogen specifično reagira s protutjelom koje je
stvorio tada se zove antigen
- Bjelančevine koje izgrađuju protutjela pripadaju globulinima
(više globulinskih proteina = imunoglobulin).
Oblik i građa virusnih čestica
- virusi su često okruglog oblika, a zapravo su poliedri
(poliedrične ili izometrične građe)
- virusne čestice mogu biti anizometrične ili produžene,
kratki štapići, dugačke niti
- samo ona virusna čestica koja se može umnožavati, koja
može uzrokovati zarazu zove se virion
- proteinski omotač ili kapsida sastoji se najčešće od
istovrsnih proteinskih molekula
- kod složenih virusa oko kapside nalazi se virusna
ovojnica ili envelope, osim proteina sadrži lipide i
ugljikohidrate
Načini prenošenja virusa
1. Mehaničko prenošenje
- u prirodi nije često; na biljkama nema često rana (ozljeda)
kroz koje bi virus bez posrednika mogao ući u stanicu
- virusi ne mogu samostalno penetrirati (ulaziti) u stanice,
barem koliko je danas poznato, također virusi se ne mogu
vezati na površinu biljne stanice jer na opni nema receptora
za koje bi se mogli vezati
- mehaničkim doticanjem (na pr. uz pomoć vjetra) zdravog i
bolesnog lišća krumpira može se prenijeti X-virus krumpira
(virus mozaika) ili na isti naćin virus mozaika duhana (TMV)
- mehanički kontakt korijena zdrave i zaražene biljke; kontakt
korijena zdrave biljke i zaraženih biljnih ostataka
- često pri agrotehničkim zahvatima: kontaminiranim rukama
ili priborom (noževi, škare) čak i odjećom
2. Cijepljenje
- vrlo lagani načini prenošenja bez obzira je li zaražena
plemka ili podloga, strogo gledajući ovo je antropogeno
širenje jer je za cijepljenje odgovoran čovjek.
3. Zoohorno prenošenje (kukcima)
- najčešći organizmi (vektori) koji prenose viruse su kukci
- 94% (približno) su Arthropoda ili člankonošci
- 6% (približno) su nematode
- oko 99% svih Arthropoda čine insekti
- više od 70% insekata pripadaju redu Homoptera ili
jednokrilaca; tu pripadaju najvažniji vektori virusa
Aphididae (lisne uši)
Lisne uši sišu sok (najčešće iz lišća zaraženih biljaka) i
prenose viruse na tri načina:
1. perzistentno prenošenje:
Virusi koji se prenose perzistentno ili cirkulativno imaju
sljedeća obilježja:
- što stjecanje virusa (sisanje staničnog soka s virusima)
duže traje (na pr. 6-12 sati) mogućnost prenošenja je
veća
- insekt ne može odmah nakon uzimanja virusa “obaviti”
prijenos na zdrave biljke jer postoji latentni period (12
sati i duže)
- nakon latentnog perioda insekt tijekom dužeg vremena
predstavlja izvor zaraze, a pojedini su to za cijelog
života
- perzistentni virus ostaje u insektu u svim stadijima
njegovog razvoja (trensstadijalni prijenos)
2. Neperzistentno prenošenje
Virusi koji se prenose neperzistentno su najčešći
u prirodi i imaju veliko gospodarsko značenje;
karakteristike ovih virusa su:
- Virus ulazi u tijelo insekta za vrijeme hranjenja,
vrijeme “uzimanja” virusa je kratko, od nekoliko
sekundi do nekoliko minuta (faza stjecanja
virusa)
- Virus se na zdravu biljku može prenijeti odmah
(faza inokulacije virusa)
- Insekt za kratko vrijeme (obično tijekom 4 sata)
nakon napuštanja zaražene biljke prestaje biti
nosilac virusa
3. Semiperzistentno prenošenje
Virusi ove skupine se nalaze između perzistentnih i
neperzistentnih virusa.
Oni su neperzistentni jer ne cirkuliraju u svom
vektoru, ali insekt-vektor zadržava sposobnost
prenošenja virusa tijekom 3-4 dana.
Zajedničko semiperzistentnim i perzistentnim
virusima je to što se nalaze u floemu biljke.
Neki virusi iz sve tri grupe mogu biti prenešeni
lisnim ušima samo ako je biljka zaražena drugim, i
to određenim virusom. Taj drugi virus zove se virus
pomagač. Na pr. za aukuba mozaik krumpira vektor
je lisna uš Myzus persicae, virusi pomagači mogu
biti A ili Y virus krumpira, a način prenošenja je
neperzistentan.
Tab. Važniji biljni virusi i način prenošenja
Virus Vektor Prenošenje
Virus žute patuljavosti Rapalosiphum padi i dr. perzistentno
ječma lisne uši
Virus žutog mozaika Polymyxa graminis -
ječma
http://www.dias.kvl.dk/Plantvirology/esy
mptoms/symp-color.html
- nekrotične lokalne lezije: odumrle stanice najčešće
različitog intenziteta smeđe boje, često su okružene
klorotičnom zonom
http://www.dias.kvl.dk/Plantvirology/esymptoms/symp-color.html
b) sistemični, u pravilu na mlađem lišću, a nastaju zbog
opće infekcije kada se virus od mjesta primarne infekcije
(najčešće lišća) proširi na manje više čitavu biljku
http://www.dias.kvl.dk/Plantvirology/esymptoms/symp-color.html
http://www.dias.kvl.dk/Plantvirology/esy
mptoms/symp-color.html
http://www.biologie.uni-hamburg.de/b-
online/e35/symptome.htm
- Sistemični simptomi zbog histopatoloških promjena,
uzrokovani su zbog poremećaja u djeljenju stanica, rastu
stanica, zbog tvorbe novog tkiva, preobrazbe jedne vrste
tkiva u drugu, smrti stanica i dr.
Hiperplazija je uzrok enacija (izrasline na listu) i tumora;
odebljanja (mesnatosti) plojke, naboranost, lepezavost,
nitavost lišća, zastoj u porastu.
Promjene u veličini stanica (hipertrofija, hipoplazija).
Rizomanija
Virus lepezavosti lista vinove loze
http://www.biobio.es/plagas/bacteriasyvirus/ http://ucdnema.ucdavis.edu/imagemap/nemmap/Ent156html/
204NEM/PRGRAPE.htm
rizomania.htm
Virus lepezavosti lista vinove loze Virus uvijenosti lista krumpira
http://ucdnema.ucdavis.edu/imagemap/nemmap/Ent156html/204
NEM/PRGRAPE.htm
2. Unutarnji simptomi (ne vide se bez mikrsokopiranja)
- anatomske promjene vezane su za unutrašnju građu
biljke i često su značajno povezane s histopatološkim
promjenama (hiperplazija, neoplazme).
- virusne stanične inkluzije su nakupine virusnih čestica (u
citoplazmi ili jezgri) koje se razlikuju od ostalih staničnih
struktura. Oblik i sastav virusnih inkluzija jako varira,
neke su vrlo karakteristične pa služe za identifikaciju
virusa.
Virusne infekcije i širenje virusa u biljci
- biljni virusi ne mogu biti adsorbirani na površinu stanice
domaćina
- biljni virusi ulaze u stanice domaćina kroz rane na stjenci
epidermalnog staničja ili kroz ektodezme (sustav pora u
celuloznoj građi stanične stijenke)
- od mjesta infekcije (lokalna infekcija) virusi se dalje šire
putem plazmodezmi ili kroz provodni sustav biljke, kada
se prošire po cjeloj biljci nastaje sistemična ili opća
infekcija
- plazmodezmama se virusi šire od jedne do druge stanice
- provodnim sustavom se šire na veće udaljenosti
- u provodni sustav virusi “ulaze” zajedno s asimilatima
- kada dospije u neki biljni organ virus “izlazi” iz provodnih
elemenata i “ulazi” u parenhim a zatim se dalje širi od
stanice do stanice plazmodezmama
- izlaženje virusa iz provodnih elemenata i ulazak u
meristem omogućuju posebni tzv. virusni transportni
proteini
- brzina širenje virusa je razčičita, na pr. virus mozaika
duhana u nekim biljkama “putuje” do 8 cm na sat
Utjecaj vanjskih čimbenika
1. Krajnja točka razrjeđenja virusa
je najmanje razrjeđenje infekcioznog soka kojim se
može mehanički zaraziti pokusna biljka. Kreće se 10-1-
10-7
- Ovisi o: a) infekcioznosti virusa
b) koncetraciji virusa u soku
c) vrsta tekućine za razrjeđivanje
d)vrsta biljke iz koje je uzet sok
e) vrsta biljke koja se inficira
f) način inokulacije
2. Termalna točka inokulacije virusa
je najniža temperatura na kojoj virus gubi infekcioznost u
soku i to tijekom 10 min.
Termalna točka inaktivacije ovisi o navedenim elementima.
Kreće se od 45-93 C°, najčešće između 55 i 70 C°.
3. Postojanost in vitro
Je najdulje vrijeme u kojem virus u soku na sobnoj
temperaturi još zadržava infekcioznost. Kreće se od 12
do više mjeseci.
Inaktivirati virusne čestice mogu:
a) Fizikalni inaktivatori
- ultrazvučne vibracije
- ionizirajuće zračenje (X, γ,ß zrake, α čestice, protoni,
deutroni)
- neionizirajuće zračenje (UV zrake dužine 254 nm)
b) Fizikalnokemijski inaktivatori
- zagrijavanje
- zamrzavanje, odmrzavanje, isušivanje
- pH
c) Kemijski i biokemijski inaktivatori
- organska otapala
- nitritna kiselina, formaldehid
- oksidirajuća sredstva
- tanini enzimi (proteolitički enzimi)
- antitjela (protutjela)
Ekologija i
epidemiologija
(Juretić, 2002.)
Mjere suzbijanja:
1. uklanjanje izvora zaraze:
- korovne biljke
- zaražene uzgajane biljke
- ostatci prethodnog usjeva
- plodored
- higijenske mjere u zatvorenim prostorima
- uporaba bezvirusnog sjemena i sadnog materijala
2. Suzbijanje vektora
- kemijsko
- fizičko
- biološko
3. Uzgoj otpornih kultivara
Taksonomija/klasifikacija biljnih virusa
lofotrihe
amfitrihe
peritrihe
http://ncse.com/creationism/analysis/molecular-machines
- razmnožavanje bakterija je nespolno, običnom diobom,
od jedne stanice nastaju dvije nove, smatra se da
tijekom 24 sata od jedne stanice nastaje 17 milijuna
novih bakterija
- krajem 40-tih godina 20. stoljeća elektronskim
mikroskopom utvrđeno je spolno razmnožavanje kod
vrste Escherihia coli i Agrobacterium tumefaciens,
spolno razmnožavanje je iznimno rijetko
- veličina fitopatogenih bakterija: 0,5-4,5 x 0,3-0,6 µm
- većina, oko 90%, fitopatogenih bakterija su Gram-
negativne, a samo oko 10% Gram-pozitivne
- fitopatogene bakterije su asporogene
- bakterijska stanica sastoji se od citoplazme i nukleusa
(jezgre) te inkluzija (vjerojatno rezervne tvari kao lipidi i
zrnca škroba) sadržaj stanice okružene je
citoplazmatičnom i zatim čvrstom staničnom opnom
- veliki broj bakterija okružen je sluzastim ovojem ili
kapsulom koji štiti bakterije od nepovoljnih vanjskih
utjecaja, kapsula je značajna i pri serološkim analizama
- enzimi fitopatogenih bakterija su vrlo značajni jer
omogućuju razgradnju organskih tvari (uzimanje hrane)
- ishrana se obavlja apsorpcijom – odnosno osmozom
kroz polupropusnu citoplazmatičnu opnu
Specijalizacija fitopatogenih bakterija
- s obzirom na krug domaćina fitopatogene bakterije dijele
se na: monofagne parazitiraju jednu biljnu vrstu ili vrste
jednog roda, polifagne, parazitiraju veliki (vrlo veliki) broj
biljnih vrsta iz botanički udaljenih porodica i redova.
- monofag most ili polifag most je nastala tijekom evolucije
pojednih bakterija
- jedna polifagna vrsta bakterije koja je morfološki i
biokemijski jedna cjelina i koja parazitira veliki broj biljnih
vrsta (na pr. Pseudomonas syringae ili P. solanacearum
ili Erwinia carotovora) nije jedinstvena u fitopatogenoj
aktivnosti. Očito postoje niže taksonomske jedinice kao:
varijeteti, rase, patotipovi i sl.
- nomenklatura u fitobakteriologiji je složenija i često
neusaglašena u odnosu na mikologiju
- f. sp. (forma specialis) znači nejednaku patogenost koju
bakterija ima prema biljnoj vrsti i podudara se s
“varijetet”, što je česta taksonomsk ajedinica kod
fitopatogenih bakterija
- uvođenjem “patogeni varijetet – patovar, pv.” (Dye i sur
1980.) bakterije s istim ili sličnim morfološkim,
kulturalnim i biokemijskim karkateristikama ali s
različitom patogenosti prema različitim domaćinima
označavaju se kao pv. Najčešće nazivi vrsta
fitopatogenih bakterija svode se na patogeni varijetet.
- fiziološke rase (paototipovi) i sojevi još su nedovoljno
razjašnjeni
- serološke grupe ili serološki tipovi (serotype) označavaju
nejednaku antigenu strukturu
- tipovi bakterijskih kolonija (colony type) označavaju
razlike i u morfološkom pogledu (boja, konzinstencija) uz
razlike u patogenosti
Sistematika (Agrios, 1997.)
Carstvo: Prokarioti, Bakterije
Odjel: Gram-negativne bakterije
Porodica: Enterobacteriaceae
Rod: Erwinia (bakterijska plamenjača jabuka i krušaka,
Stewart-ovo venuće kukuruza, vlažna trulež povrća)
Porodica: Pseudomonadaceae
Rod: Pseudomonas (brojne lisne pjegavsti, paleži, venuće,
vlažna trulež, tumori)
http://ohioline.osu.edu/b895/b895_17.html
Rod: Ralstonia (venuće biljaka porodice Solanaceae)
agroatlas.ru
http://www.rense.com/general82
/scideb.htm
Odjel: Gram-pozitivne bakterije
Rod: Clavibacter (venuće lucerne, krumpira, rajčice)
Rod: Curtobacterium (venuće graha i drugih biljaka)
Rod: Streptomyces (krastavost gomolja krumpira)
2. Vlažnost
- Većina fitopatogenih bakterija razvija se pri visokoj vlazi. Infekcije
gotovo uopće nema bez kapi vode. Bez vlage bakterije brzo
gube vitalnost pa se zbog toga otpornost biljaka povezuje s
niskom RVZ.
3. Zračna strujanja
- raznose bolesne dijelove biljaka na relativno velike udaljenosti
- raznose bakterijski eksudat u kišnim kapima na susjedne
zdrave biljke
- pomažu “ulazak” bakterija kroz puči u biljku (zračne struje
pokreću lišće – lišće se povija - kišne kapi s bakterijskim
eksudatom dolaze do puči – “uvlačenje” bakterija u puč)
- vjetar može sniziti temperaturu zraka i time pospješiti
neke infekcije
- vjetar može ozljediti biljke i time se otvar put za infekcije
4. Svjetlo
- Velika većina bakterija osjetljiva je na direktnu sunčevu
svjetlost. Nešto su malo otpornije one vrste bakterija koje
imaju žute kolonije (karotenoidi) kao npr. Vrste roda
Xanthomonas.
Simptomi bakterioza
1. Pjegavost i nekroza
- pjegavost je najčešći simptom bakterioza, razvija se na
svim nadzemnim dijelovima i tipična je za lokalne
infekcije.
- pjege su u početku svjetlije boje (rjeđe tamnozelene) i
vlažnog izgleda (eksudat), kasnije nastupa nekroza pa
pjege postaju svjetlije ili tamnije smeđe, ponekada su
crvene ili crne
- oblik varira od okruglog do poligonalnog
- ponekada nekrotizirano tkivo “ispada”, a ponekada se
lomi
- na plodovima pjege mogu izgledati kao kraste
Pseudomonas syringae pv. aptata Pseudomonas syringae pv. lachrymans
Erwinia amylovora
3. rak-rane
- obično se javljaju na kori izboja, grana ili stabla
- prvo se vide udubljenja u kori, a zatim se nekrotični
procesi mogu proširiti u drvenasti dio, tkivo puca,
otvaraju se rane i često se pojavljuju kapljice smole
Erwinia amylovora
4. Vlažna trulež
- pektinolitičkim enzimima neke bakterije razlažu središnju
lamelu biljnih stanica zbog čega se gubi kontinuitet
obično u parenhimu
- daljnje razlaganje nastavljaju saprofitne bakterije pa tkivo
postaje poput kaše
http://www.agroatlas.ru/en/content/diseases/Solani/Solani_Erwinia_c
arotovora_subsp_atroseptica/ Erwinia carotovora pv. carotovora
http://www.omafra.gov.on.ca/IPM/english/peppers/disea
ses-and-disorders/bacterial-soft-rot.html
5. Venuće
- Uzrokuju bakterijekoje naseljavaju provodni sustav biljaka,
bakterije mehanički onemogućuju normalno usvajanje i
transport vode kroz biljku. Nastaju tile (tvorevine tipa smole)
koje “začepe” provodni sustav. U nekim slučajevima u
bolesnom tkivu nastaje neka vrsta toksina koji također
uzrokuju venuće.
Agrobacterium tumefaciens
Pseudomonas syringae pv. savastanoi
http://www.inra.fr/hyp3/pathogene/6pssysa.htm http://biomesfourth09.wikispaces.com/Tropical+Rainforest+Facts
Mjere suzbijanja
1. Preventivne mjere
- kontrola pri uvozu biljaka i biljnog matrijala
2. Agrotehničke mjere
- otporni kultivari
- zdravo sjeme i sadni materijal
- plodored (u tlu bakterije žive relativno kratko, ali ima
iznimaka, A. tumefaciens – plodored 3-4 god., X.
campestris – plodored 3-5 god.)
- pravilna gnojidba
- zaoravanje i spaljivanje zaraženih ostataka
- suzbijanje vektora bakterija
- suzbijanje korova
3. Mehaničke mjere
- uništavanje bolesnih biljaka ili bolesnih djelova
- uništavanje jako osjetljivih biljaka kao izvora zaraze
(Crategus (glog) jako osjetljiv na E. amylovora)
4. Fizičke mjere
- dezinfekcija tla vodenom parom
- potapanje sjemena u toplu vodu (X. campestris pv.
campestris 20 min – 50°C, X. campestris pv. carotae 10
min – 54°C)
5. Kemijske mjere
- vrlo ograničene mogućnosti primjene fungicida:
dezinfekcija tla, dezinfekcija sjemena i sadnog materijala