研究動機

水是多年來所關注的課題，科學家對於水的型態變化在過去有深入的研究，像
是發現水在液態時不再是過去認知的單一形式，可分為 HDL 及 LDL 兩種。所
謂的 HDL 指的是分子周圍水密度分佈較多，反之，LDL 為分子周圍水密度分佈
較低。除此之外，溫度也是影響 HDL 及 LDL 的因素。近年來學者透過實驗的
方式對 3-氰基-7-氮雜吲哚（3-cyano-7-azaindole, 3CAI）進行周圍水的探測，分
析溫度與激發態質子轉移（ESPT）速率的關係，發現動力學常數的自然對數與
絕對溫度倒數的關係並非 Arrhenius 行為而是 convex-Arrhenius，其中 40℃為此
關係的轉折點，如圖 1(3)。且溫度達 40℃時 LDL 的型態變少，進而證實溫度是
HDL 及 LDL 存在比例的依據。既然溫度會造成水型態改變，而質子轉移過程中
環境水的行為是非常重要的，那麼透過分析

我們實驗室先前為探討蛋白質周圍的水，利用分子動力模擬對環境水分子與雙
氮雜吲哚之間的動態行為進行研究，發現基態及激發態質子轉移的預測路徑中，
N(1)上的氫轉移至 N(6)及 N(7)，兩者之間的基態結構能量差為 2 kcal/mol。由此
得知不同位置的氮造成周圍水排列的不同進而使質子轉移過程能量上的改變。
除此之外，最近研究利用發現激發態內分子電荷轉移（ESICT）過程中發現極
性溶劑與非極性溶劑下所造成的速率也會不同。既然分子會因周圍溶劑性質的
不同而改變，

研究問題
此研究問題主要想透過分子動力模擬及網格非均勻溶劑化理論來分析溫度對水
型態的改變進而造成質子轉移過程的前後狀態自由能的變化，再將此理論基礎
對於新的探針分子進行內分子電荷轉移的探討，以加強周圍水型態的重要性。
我們先利用 3CAI 及其他色胺酸分子進行 GIST 分析了解不同溫度及距離對周圍
水密度的影響。再透過熱力學因子，加強溫度與水型態的連結，作為驗證過去
實驗結果的依據。除此之外，也希望藉由探討新的探針分子是如何對激發態內
分子電荷轉移過程中的反應造成電荷移轉，透過此分析也能更加證實分子周圍
水的重要性，對於後續研究水環境下的分子或不同溶劑下的狀態提供方向及研
究基礎。

文獻回顧
最近的研究發現，分子周圍溶劑相的性質會影響反應速率快慢，