STEREOCHEMISTRY

O D-glyceraldehyde D-glicerinaldehid
C
H
H C* OH

CH 2OH
O L-glyceraldehyde L-glicerinaldehid
C
H
HO C* H

CH 2OH
COOH R-lactic acid R-tejsav

HO C* CH3

H
COOH S-lactic acid S-tejsav

H3C C* OH

H
COOH meso-tartaric acid mezo-borkősav

H C* OH

H C* OH

COOH
 O D-erythrose D-eritróz
C
H
H C* OH

H C* OH

CH2OH

O L-treose L-treóz
C
H
H C* OH

HO C* H

CH2OH
 SATURATED HYDROCARBONS

H structure of methane a metán szerkezete

H
C
H H
H structure of eclipsed etán zárt
ethane konformációja
H C

C H H
H H
H H structure of etán nyitott
staggered ethane konformációja
H C

C
H
H H
propane propán
CH3 CH2 CH3

n-butane n-bután
H3C CH2 CH2 CH3

H3C CH CH3 isobutane izobután

2-methylpropane 2-metil-propán
CH3
methyl group metilcsoport
CH3

ethyl group etil csoport

CH3 CH2

propyl group propilcsoport

H3C CH2 CH2
 H3C CH CH3 isopropyl group izopropilcsoport

SR equation for the chlorination metán klórozásának

CH4 + Cl2 → CH3Cl, CH2Cl2, CHCl3, CCl4 + HCl of methane egyenlete
CH2 CH2 cyclobutane ciklobután

CH2 CH2
CH2 cyclopentane ciklopentán
H 2C CH2

H 2C CH2
chair and boat ciklohexán szék és
conformation of kád konformációja
cyclohexane

cis-1,2-dimethyl- cisz-1,2-dimetil-
cyclopentane ciklopentán
CH3 CH3

trans-1,2-dimethyl- transz-1,2-dimetil-
cyclopentane ciklopentán
CH3

CH3
 UNSATURATED HYDROCARBONS

cis-2-butene cisz-2-butén
H3C CH3
C C
H H
trans-2-butene transz-2-butén
H3C H
C C
H CH3

1,3-butadiene 1,3-butadién
H2C CH CH CH2

H H addition of hydrogen etén hidrogén-klorid

H H chloride to ethene addiciója
C C HCl H C C H
H H H Cl AE
H3C CH3 H 3C CH CH2 CH3
addition of hydrogen 2-butén hidrogén-
chloride to 2-butene klorid addiciója
C C HCl
H H Cl AE
H H addition of water to etén vízaddiciója
H H ethene
C C H2O H C C H
H H H OH AE
 H H addition of etén bróm addiciója
H H bromine to
Br2 H C C H ethene
C C
H
H Br Br AE
H3C CH3 addition of 2-butén hidrogén
H 3C CH2 CH2 CH3 hydrogen to 2- addiciója
C C H2 butene
H H AR
H CH2 CH3 H 3C CH CH2 CH3 addition of 1-buténe hidrogén-klorid
hydrogenchloride addiciója
C C HCl
to 1-butene
Cl
H H AE
CH3 isoprene izoprén
(2-methyl-1,3- (2-metil-1,3-butadién)
H2C C CH CH2 butadiene)
H 3C CH3 -ionone ring -jonon gyűrű

CH3
2-butyne 2-butin
H3C C C CH3

ethyne etin
(acetylene) (acetilén)
HC CH
 AROMATIC COMPOUNDS

benzene benzol

naphthalene naftalin

anthracene antracén

phenantrene fenantrén

CH 3 toluene toluol
(methylbenzene) (metil-benzol)
CH3 orto-xylene orto-xilol
(1,2-dimethyl- (1,2-dimethil-benzol)
CH3 benzene)

CH 3 meta-xylene meta-xilol
(1,3-dimethyl- (1,3-dimetil-benzol)
benzene)

CH3

para-xylene para-xilol
CH 3 (1,4-dimethyl- (1,4-dimetil-benzol)
benzene)

CH 3

phenyl group fenilcsoport

 benzyl group benzilcsoport
CH2

pyrrole pirrol

N
H
N imidazole imidazol

N
H
pyridine piridin

N
4 pyrimidine pirimidin

3 N 5

2 6
N
1
 4 indole indol
3
5
8
2
7 1
6
N
7
H
6 7 purine purin
1N
N
5
8
4 9
2
N N
3
H
4 5 pteridine pteridin
N
3N 6
10

9
2 7
N N
1 8
4 furan furán
3

5 2
O
1
4 tiophene tiofén
3

5 2
S
1
4 thiazole tiazol
N3

5 2
S
1
 4 oxazole oxazol
N3

5 2
O
1
Br bromination of benzol brómozása
FeBr3 benzene
Br2 HBr

SE
SO3H sulfonation of benzol
benzene szulfonálása
H2SO4 H 2O

SE
CH3 alkylation benzol alkilezése
(methylation) of (metilezése)
CH3Cl HCl benzene

SE
CH3 CH3 CH3 nitration of toluol nitrálása
toluene
NO 2
H2SO4
HNO 3 H2O

NO2 SE
 NO2 nitrobenzene nitro-benzol

NO2 NO2 nitration of nitro-benzol

nitrobenzene nitrálása

H2SO4
HNO 3 H 2O

NO 2 SE
 ORGANIC HALOGEN COMPOUNDS

Cl trichloromethane triklór-metán
(chloroform) (kloroform)
Cl C Cl

H
Cl tetrachloromethane tetraklór-metán
(carbon (széntetraklorid)
Cl C Cl tetrachloride)

Cl

H H reaction of methyl metil-klorid

- chloride with reakciója hidroxid-
H
C Cl OH- H
C OH Cl
hydroxide ions ionnal
H H SN
 ALCOHOLS AND PHENOLS

general structures alkohol, enol és

OH for alcohols, enols fenol általános
and phenols szerkezete

C C
R CH2 OH OH
general structure primer, szekunder,
R for primary, tercier alkohol
secondary and általános képlete
R R C OH tertiary alcohols

R CH2 OH R CH OH R

isomers of propyl propil-alkohol

H3C CH CH3 alcohol: izomerjei
1-propanol 1-propanol
H3 C CH2 CH2 OH OH 2-propanol 2-propanol

CH2 OH benzyl alcohol benzil-alkohol

 phenol fenol
OH

OH isomers of cresol a krezol izomerjei

OH
OH

CH3

CH3 CH3

orto-cresol meta-cresol para-cresol

2-hydroxy-toluene 3-hydroxy-toluene 4-hydroxy-toluene

OH isomers of dihidroxi-benzol
dihydroxybenzene izomerjei
OH OH

OH

OH OH
ortho-dihydroxy benzene meta-dihydroxy benzene para-dihydroxy benzene
1,2-dihydroxybenzene 1,3-dihydroxybenzene 1,4-dihydroxybenzene
catechol resorcinol hydroquinone
 isomers of trihidroxi-benzol
OH trihydroxy izomerjei
benzene
OH OH OH

OH

OH OH HO OH
1,2,3-trihydroxy benzene 1,2,4-trihydroxy benzene 1,3,5-trihydroxy benzene
pyrogallol hydroxy-hydroquinone phoroglucinol
hydrogen bonded hidrogénkötés
R CH2 O alcohol and alkohol és
water molecules vizmolekulák
H között

O
H
H

hydrogen bonded hidrogénkötés két

R R alcohol alkohol molekula
molecules között
CH2 CH2

O H O H
 H H hydrogen bonded phenol hidrogénkötés két
O O molecules fenol molekula
között

methanol metanol
H3 C OH methylalcohol metil-alkohol

ethanol etanol
CH3 CH2 OH ethylalcohol etil-alkohol

O O biological oxidation of az etanol biológiai

ethanol oxidációja
CH3 CH2 OH H3C C H3C C
H OH
ethanol acetaldehyde acetic acid
O O biological oxidation of a metanol biológiai
methanol oxidációja
CH3 OH H C H C
H OH
methanol formaldehyde formic acid
oxidation O O oxidation of primary primer alkohol
oxidation alcohol oxidációja
R CH2 OH R C R C
H OH
primary alcohol aldehyde acid

OH O oxidation of secondary szekunder alkohol

ox alcohol oxidációja
R H2C CH CH2 R R H2C C CH2 R
secondary alcohol ketone
 H2C CH2 ethylene glycol etilén-glikol
1,2-ethanediol 1,2-etándiol
OH OH
H2C CH CH2 glycerol glicerol
1,2,3-propantriol 1,2,3-propántriol
OH OH OH
CH2 O NO 2 structure of glycerol a trinitro-glicerol
trinitrate szerkezete
CH O NO 2

CH2 O NO 2
 ETHERS

diethyl ether dietil-éter

H3C CH2 O CH2 CH3

methyl propyl ether metil-propil-éter

CH3 O CH2 CH2 CH3

tetrahydrofuran tetrahidrofurán
O

1,4-dioxane 1,4-dioxán
O

O
 ORGANIC SULFUR COMPOUNDS

ethanethiol etántiol
H3 C CH2 SH tioetanol

dimethyl sulfide dimetil-szulfid

CH3 S CH3

O dimethyl sulfoxide dimetil-szulfoxid

CH3 S CH3
O general structure for szulfonsav általános képlete
sulfonic acid
R S OH

O general structure for szulfinsav általános képlete

sulfinic acid
R S OH
O general structure for szulfon általános képlete
sulfone
R S R'

oxidation reaction for the mild metántiol enyhe oxidációja

oxidation of methanethiol
2 CH3 SH CH3 S S CH3
reduction

H2C CH2 2-mercaptoethanol 2-merkapto-etanol

SH OH
 oxidation General reaction for the Diszulfid
formation of disulfide képződése
Cys SH + HS Cys Cys S S Cys from cysteinyl residues fehérjék cisztein
reduction in proteins. oldalláncaiból

protein residues protein residues

 OXO COMPOUNDS: ALDEHYDES, KETONES AND QUINONES

H formaldehyde formaldehid
methanal metanal
C O
H
H acetaldehyde acetaldehid
ethanal etanal
H 3C C
O

H3C C CH3 acetone aceton

propanone propanon
O
H benzaldehyde benzaldehid

C
O

H hydrogen bonded aldehyde and hidrogénkötés egy aldehid és

water molecule egy vízmolekula között
R C
O
H
H
O

H addition of water to an aldehyde aldehid vízaddiciója

H
R C H2O R C OH
O OH AN
 first step reaction of an aldehyde with an aldehid reakciója alkohollal 2
H alcohol in two steps lépésben
H
R C R' OH R C OH
O O
R' AN
aldehyde alcohol hemiacetal

second step
H H
R'
R C OH R' OH R C O H2O

O O
R' R' condensation
hemiacetal alcohol acetal
R addition of HCN to a ketone keton HCN addiciója
R
C O HCN R C OH
R
CN AN
 formation of a Schiff bázis
R1 R1 Schiff base képződése
R1
C O H N R3 R2 C N R3 C N R3
-H2O R2
R2
H OH H
aldehyde/ketone amine intermediate Schiff base
oxidation O O oxidation and aldehid oxidációja
oxidation reduction of an és redukciója
R CH2 OH R C R C aldehyde
reduction H OH
primary alcohol aldehyde carboxylic acid
R1 reduction of a ketone keton redukciója
R1 reduction
C O CH OH
R2
R2
ketone secondary alcohol
H keto-enol tautomerization oxo-enol tautomerizáció
O
C C C C
OH
enol form oxo/keto form
aldol addition aldol addició
H (aldol dimerization)
CH3 C H CH3 C H CH3 CH CH2 C
O
O O OH AN

H chloral hydrate klorál-hidrát

Cl 3C C OH

OH
 O 1,4-naphthoquinone 1,4-naftokinon

O
oxidation of hydroquinone hidrokinon oxidációja
OH O

oxidation

reduction

OH O
1,4-hydroquinone 1,4-benzoquinone
 AMINES

general structure az aminok

R of amines általános
szerkezete
R NH R N R R N R

R NH2 R R R
primary amine secondary amine tertiary amine quaternary ammoniumion
aniline anilin
NH2

tetramethyl tetrametil-
CH3 ammonium ammónium-
hydroxide hidroxid
H 3C N CH3 OH -

CH3

hydrogen bonded hidrogénkötés

amines aminok között

H N H N
 hydrogen bonded amine and water hidrogénkötés egy amin és
R H egy vízmolekula között

N H O
R
R

chemical equation to illustrate of aminok bázikus jellege vizes

R the basicity of amines in aqueous közegben
R H solution
N + OH-
N H O
R H
R R
R

comparison of the basicity az „aminok” bázis-

NH2 of „amines” erősségének
összehasonlítása
< NH3 < H 3C N CH3 < H3C NH2 < H 3C NH

CH3 CH3

aniline ammonia trimethylamine methylamine dimethylamine

aromatic < ammonia < tertiary < primary < secondary
amine amine amine amine
chemical equation primer amin
H OH for the reaction of a reakciója
O AN primary amine with aldehiddel
R2 R1 N C R2 R1 N C R2 an aldehyde
R1 NH2 +
- H2O
H H
H
Schiff base
 chemical primer amine
O H OH H O equation for the acetilezése
AN acylation of a
H 3C N C CH3 H 3C N C CH3 primary amine
H3C NH2 + Cl C CH3
- HCl
Cl

chemical equation for the diazóniumsó

+ formation of a diazonium keletkezése
AN
NH2 + HNO2 + HCl N N Cl- salt from aniline anilinből
- 2 H2O

- 2 H2O + - N2 reaction of a primary amine primer amin

R NH2 + HNO2 + H+ R N N R+ with nitrous acid reakciója
salétromos-savval
reaction of a secondary szekunder amin
R R amine with nitrous acid reakciója
AN salétromossavval
NH + HNO2 N N O
- H2O
R R
reaction of a tertiary amine with tercier amin reakciója
NO REACTION nitrous acid salétromos-savval
ethanolamine etanolamin
HO CH2 CH2 NH2 (2-amino-1-ethanol) (2-amino-1-etanol)

choline kolin
CH3 (trimethyl-[-hydroxyethyl]- (trimetil-[2-hidroxi-
ammonium hydroxyde) etil]-ammónium-
HO CH2 CH2 N+ CH3 OH- hidroxid)

CH3
 COO- NH3+ formation of histamine hisztamin keletkezése

+
H3N C H CH2

CH2 decarboxylation CH2

NH NH
N N

histidine histamine
formation of acetylcholine by the reaction of choline and acetyl-CoA acetil-kolin
O képződése
kolinból
CoA S C CH3 CoA SH O CH3
CH3

HO CH2 CH2 N+ CH3 H3C C O CH2 CH2 N+ CH3

CH3 CH3

chemical equation for the formation of serotonin szerotonin képződése

COO- COO - NH3 +

+ +
H3N C H H3N C H CH2

CH2 hydroxylation CH2 decarboxylation CH2

HO HO

N N N
H H H
 epinephrine adrenalin
H (adrenaline) (epinefrin)

HO C CH2 NH CH3

OH
HO
 HETEROAROMATIC COMPOUNDS

cytosine citozin
NH2 (4-amino-2-hydroxypyrimidine) (4-amino-2-hidroxi-pirimidin)

O N
H

uracil uracil
O (2,4-dihydroxypyrimidine) (2,4-dihidroxi-pirimidin)

HN

O N
H

O thymine timin
(2,4-dihydroxy-5-methylpyrimidine) (2,4-dihidroxi-5-metil-pirimidin)
CH3
HN

O N
H
 keto-enol tautomers of uracil uracil keto-enol
O OH OH tautomerizációja

HN N N

O N O N HO N
H H
adenine adenin
NH2 (6-aminopurine) (6-amino-purin)

N
N

N N
H
guanine guanin
O (2-amino-6-hydroxypurine) (2-amino-6-hidroxi-purin)

N
HN

H2N N N
H
nicotinic acid nikotinsav
COOH (niacin) (piridin-3-karbonsav)

N
 porphin ring porfin-gyűrű

NH N

N HN

nicotinamide nikotinsavamid
O (piridin-3-karboxamid)

C
NH2

N
 H O O NAD+/NADH conversion with NAD+/NADH átalakulás
H H
simplified formulas egyszerűsített
C C szerkezetekkel
NH2 NH2
+ H+ + 2e-

N+ N

R R

NAD+ NADH
O barbituric acid barbitursav
(2,4,6-trihydroxypyrimidine) (2,4,6-trihidroxi-pirimidin)

HN

O N O
H

OH uric acid húgysav

N
N
OH
HO N N
H
 OH O folic acid fólsav
(memorize only (csak a három
N CH2 NH C NH CH CH2 CH2 COOH the names of the fő alkotórész
N three main nevének
COOH structural parts) megjegyzése
szükséges)
H2N N N

2-amino-4-hydroxy-6-methylpteridine p-aminobenzoic acid glutamic acid

sulfanilamide szulfanilamid
(p-aminobenzene sulfonamide) (p-amino-benzol-szulfonamid)
H2N SO2 NH2
 CARBOXYLIC ACIDS

general structure of a carboxylic acid karbonsavak általános

O szerkezete
R C
O H

hybridization of the carbon atom: sp2

ionization of acetic acid in aquenous ecetsav ionizációja vizes
O O solution oldatban

+ H2O H 3C C + H3O+
H3C C
O H O-

structure of hydrogen bonded hidrogén kötés

O H O
carboxylic acids karbonsavmolekulák között
R C C R
O H O

formic acid is stronger acid than a hangyasav erősebb sav, mint

O O acetic acid because of the +I az ecetsav az alkilcsoport +I
< effect of alkyl group effektusa miatt
H3C C H C
OH OH
acetic acid formic acid
trichloroacetic acid is stronger a triklór-ecetsav erősebb sav,
O O acid because of the -I effect of the mint az ecetsav a halogének -I
halogens effektusa miatt
H 3C C < Cl3C C
OH OH
acetic acid trichloroacetic acid
oxalic acid is stronger acid az oxálsav erősebb sav, mint a
O COOH because of the -I effect of hangyasav a karboxilcsoport -I
H C < carboxyl group effektusa miatt
OH COOH
formic acid oxalic acid
 structure of formyl and acetyl formil- és acetilcsoport
O O groups szerkezete

H C H3C C
formyl group acetyl group

structure and names of the a monokarbonsavak homológ

O O homologous series of sorának első hat tagja (szerkezet
O monocarboxylic acids up to 6 és név)
H 3C C CH3 CH2 C carbons
H C OH
OH OH
formic acid acetic acid propionic acid
methanoic acid etanoic acid propanoic acid

O O
H3C CH2 CH2 C H3C CH2 CH2 CH2 C
OH OH
butyric acid valeric acid
(butanoic acid) (pentanoic acid)

O
H3C CH2 CH2 CH2 CH2 C
OH
hexanoic acid
decarboxylation of carboxylic karbonsav dekarboxileződése
O decarboxylation
acid
R CH2 C R CH3 + CO2
OH

reaction of acetic acid with ecetsav reakciója nátrium

O O sodium hydroxide hidroxiddal
H3C C + NaOH H3C C + H2O
- +
OH O Na
  oxidation of monocarboxylic acids (monokarbonsavak -oxidációja)
O O
O
R CH CH2 C R C CH2 C
R CH2 CH2 C
OH OH
OH OH O
-hydroxyacid -keto acid
decarboxylation of - -keto-karbonsavak
O keto acids dekarboxilezése
decarboxylation R C CH3
R C CH2 C + CO2
OH O
O

-keto acid ketone

benzoic acid benzoesav
COOH

COO - -OOC H formation of fumarate fumarát keletkezése

from succinate szukcinátból
-2H C
CH2

CH2 C
H COO -
COO -
succinate fumarate
 formation of succinic anhydride borostyánkősavanhidrid
O O from succinic acid képződése

CH2 C OH CH2 C
O + H2O
CH2 C OH CH2 C

O O

HOOC H H COOH cis/trans isomers of butenedioic a buténdisav cis és trans

acid izomerjei
C C

C C
H COOH H COOH

fumaric acid maleic acid

trans cis
formation of phthalic anhydride ftálsavanhidrid keletkezése
O O
OH C O
C OH

C -H2O C
O O

+H2O
phthalic acid phthalic anhydride
COOH oxalic acid oxálsav

COOH
 COOH malonic acid malonsav

CH 2

COOH
COOH succinic acid borostyánkősav

CH 2

CH 2

COOH
glutaric acid glutársav
COOH

CH 2

CH 2

CH 2

COOH

adipic acid adipinsav

HOOC CH2 CH2 CH2 CH2 COOH

palmitic acid palmitinsav

CH3 (CH2)14 COOH
stearic acid sztearinsav
CH3 (CH2)16 COOH

oleic acid olajsav

CH3 CH2 CH2 CH2 CH CH CH2 CH2 CH2 COOH
CH2 CH2 CH2 CH2 CH2 CH2 CH2 CH2
 alkyl sulfhate alkil-szulfát
O OH
CH2 CH2 CH2 S
R CH2 CH2 O O

O alkyl benzene sulfonate alkil-benzol-szulfonát

CH2
O -Na+
R CH2 S

invert soap invert szappan

CH2 CH2 CH2 CH2 (quaterner ammonium salt) (kvaterner ammóniumsó)
R1 CH2 CH2 R3
N+
CH2 X-
CH2 CH2 CH2
R2 CH2 CH2 R4

dehydration of -hydroxy acid -hidroxi-karbonsav

O O vizeliminációja

R CH CH2 C R CH CH C

OH OH
OH
-hydroxy acid ,-unsaturated acid

H2C CH2 H2C CH2 lakton képződése -hidroxi-

formation of lactone from gamma-hydroxy vajsavból
OH H2C O butyric acid
H 2C OH -H2O C
C
O
O
-hydroxybutyric acid -butyrolactone
 formation of lactone from delta-hydroxy lakton képződése valeriánsavból
H2 H2 acid
C C
H2C CH2 H2C CH2
OH
H2C OH -H2O H2C O
C C

O O
-hydroxy acid -lactone
oxidation of alpha-hydroxy acid -hidroxi-karbonsav oxidációja
COOH COOH
oxidation
CH OH C O

R R
-hydroxy acid oxoacid
salicylic acid szalicilsav
COOH

OH

COOH aspirin aszpirin

(acetylsalicylic acid) (acetil-szalicilsav)
O C CH3

O
 L-malic acid L-almasav
COOH

HO C H

CH 2

COOH

isomers of tartaric acid a borkősav izomerei

COOH COOH COOH

HO C H H C OH H C OH

H C OH H C OH HO C H

COOH COOH COOH

D-tartaric acid meso-tartaric acid L-tartaric acid

citric acid citromsav
H2C COOH

HO C COOH

CH2 COOH

H2C COOH cis-aconitate cisz-akonitát

C COOH

HC COOH
 keto-enol tautomerization of pyruvic piroszölősav keto-enol tautomerizációja
COOH COOH acid

C O C OH

CH3 CH2
keto form enol form
conversion of pyruvate to etanol képződése piruvátból
COO - H+ CO2 H H
ethanol
(fermentation)
reduction
C O C O H C OH

CH3 CH3 CH3

pyruvate acetaldehyde ethanol

conversion of pyruvate to lactate piruvát/laktát átalakulás
- - (in the presence of NAD+/NADH) NAD+/NADH jelenlétében
COO COO

C O + NADH + H+ HO C H + NAD+

CH3 CH3
pyruvate L-lactate
formation of aceyl CoA from acetil-CoA keletkezése
COO- S CoA pyruvate piruvátból NAD+ és CoA
(in the presence of NAD+ and jelenlétében
C O + NAD+ + CoA-SH C O + NADH + CO2 CoA)

CH3 CH3
 structure of ketone bodies ketontestek
COO - COO - acetoacetát, aceton, -hidroxi-butirát
CH3
CH2 CH2
C O
C O HO C H
CH3
CH3 CH3
acetoacetate acetone -hydroxy-butyrate
formation of citrate in citrát keletkezése
H2C COO - the TCA cycle a trikarbonsav-
H3C C O ciklusban
O C COO-
+ + H2O HO C COO - + CoA-SH + H+
H2C COO- S CoA
H2C COO-
oxaloacetate acetyl-CoA citrate
formation of isocitrate in izocitrát keletkezése a
H2O H2O the TCA cycle trikarbonsav-ciklusban

H2C COO- HC COO- HO HC COO-

HO C COO- C COO- HC COO-

H2C COO- H2C COO- H2C COO-

citrate cis-aconitate isocitrate
formation of - -
H 2C COO- H 2C COO- H 2C COO- ketoglutarate in the ketoglutarát
H+ CO2
TCA cycle keletkezése a
HC COO- oxidation HC COO- H 2C trikarbonsav-
ciklusban
HO CH COO- O C COO- O C COO-
isocitrate oxalosuccinate -ketoglutarate
(intermediate)
 COO - COO - formation of fumarate in the TCA cycle fumarát keletkezése a trikarbonsav-ciklusban

CH2 oxidation C H

CH2 H C

COO - COO -
succinate fumarate
formation of L-malate in the TCA cycle L-malát keletkezése a trikarbonsav-ciklusban
- -
COO H2O COO

C H HO C H

H C CH2

COO - COO -
fumarate L-malate
formation of oxaloacetate in the TCA cycle oxálacetát keletkezése a trikarbonsav-
COO - COO - ciklusban

HO C H oxidation C O

CH2 CH2

COO - COO -
L-malate oxaloacetate
O general formula of a soap szappan általános képlete
R CH2 CH2 C Na+ or K+
CH2 CH2 CH2 O
formation of an ester észter képződése
O O

R C + R' OH R C + H2O

OH O R'
 O reaction of ethanol with acetic acid etanol reakciója ecetsavval
O
H3C C + C2H5 OH H3C C + H2O

OH O C2H5
acetic acid ethanol ethyl acetate
saponification of an ester észter elszappanosítása
O O
R C + NaOH R C + R' OH
O R' O-Na+

general structure of a triglyceride triglicerid általános szerkezete

O

O H2C O C R1

R2 C O HC

H2C O C R3

general structure of a thioester tioészter általános szerkezete

O
R C
S R'

phosphoenolpyruvate (PEP) foszfo-enol-piruvát (PEP)

COO - O

C O P O-

CH 2 O-
 NH2 urea karbamid
(urea)
O C
NH2
guanidine guanidin
NH2
HN C
NH2

guanidino group guanidinocsoport

NH2
HN C
NH
 AMINO ACIDS, PEPTIDES, PROTEINS

COO - structure of -amino acid in zwitter ionic form -amino-karbonsav ikerionos szerkezete

+
H3N C* H

L-alanine, Ala L-alanin, Ala

COO -

+
H 3N C H

CH3

L-valine, Val L-valin, Val

-
COO

+
H3N C H

CH
H 3C CH3

L-leucine, Leu L-leucin, Leu

COO -

+
H 3N C H

CH2

CH
H 3C CH3
 COO - L-isoleucine, Ile L-izoleucin, Ile

+
H3N C H

H C CH3

CH2

CH3

L-proline, Pro L-prolin, Pro

-
COO
H
C
+
H2N CH2

H 2C CH2

L-methionine, Met L-metionin, Met

COO -

+
H 3N C H

CH2

CH2

CH3
 COO - L-phenylalanine, Phe L-fenilalanin, Phe

+
H 3N C H

CH2

L-tryptophan, Trp L-triptofán, Trp

COO -

+
H 3N C H

CH2

C
CH

NH

glycine, Gly glicin, Gly

COO -

+
H3N C H

H
 COO - L-serine, Ser L-szerin, Ser

+
H 3N C H

CH2

OH

L-threonine, Thr L-treonin, Thr

COO -

+
H 3N C H

H C OH

CH3

L-cysteine, Cys L-cisztein, Cys

-
COO

+
H3N C H

CH2

SH
 COO - L-tyrosine, Tyr L-tirozin, Tyr

+
H 3N C H

CH2

OH

L-asparagine, Asn L-aszparagin, Asn

COO -

+
H3N C H

CH2

C
H 2N O
 COO - L-glutamine, Gln L-glutamin, Gln

+
H 3N C H

CH2

CH2

C
H 2N O

L-aspartate, Asp L-aszpartát, Asp

-
COO

+
H3N C H

CH2

COO -

L-glutamate, Glu L-glutamát, Glu

COO -

+
H 3N C H

CH2

CH2

COO -
 COO - L-lysine, Lys L-lizin, Lys

+
H 3N C H

CH2

CH2

CH2

CH2

NH3+

L-arginine, Arg L-arginin, Arg

COO -

+
H 3N C H

CH2

CH2

CH2

NH

C NH2+

NH2
 COO - L-histidine, His L-hisztidin, His

+
H 3N C H

CH2

C NH

HC CH
N
H+

formation of a peptide peptidkötés

H H H O H bond between two kialakulása két
amino acids aminosav között
+
H3N C COO- + +
H3N C COO- +
H3N C C N C COO-

R1 R2 R1 H R2

resonance a peptidkötés rezonancia

structures of a határszerkezeti formái
peptide bond
C H C H
C N C N+
O C C
O

structure of alanyl- az alanil-glicin dipeptid szerkezete

H O H glycine dipeptide

+
H3N C C N C COO -

CH3 H H
 structure of glycyl- a glicil-alanin dipeptid szerkezete
H O H alanine dipeptide

+
H3N C C N C COO -

H H CH3

constituting amino a glutation szerkezetét felépítő

COOH COOH COOH acids of aminosavak, és a vegyület
glutathione and redoxireakciója
HC NH 2 HC NH 2 HC NH 2 oxido-reduction
reaction of
glutathione
CH2 Glu CH2 CH2

CH2 CH2 CH2

C O -2 H C O C O
2
NH NH NH
+2 H
HC CH 2 SH HC CH 2 S S CH 2 CH

C O Cys C O C O

NH NH NH
Gly
CH2 CH2 CH2

COOH COOH COOH

reduced glutathione oxidized form of glutathione

 types of interactions between a fehérjék
residues in tertiary structures harmadlagos
CH2 of proteins szerkezetét
CH2 CH stabilizáló
kölcsönhatások
H2C CH3
C
-
O O CH3

NH3+
CH3
CH2 O CH2
H3C CH2
H
S CH2 CH
O O-
S C CH2

CH2 CH2 CH2

disulfide bridge hydrogen bonding electrostatic forces London forces

 CARBOHYDRATES

H O open chain structure of D-ribose D-ribóz nyílt láncú szerkezete

C

H C OH D-configuration

H C OH

H C OH

H 2C OH
CH2OH open chain structure of D-fructose D-fruktóz nyílt láncú szerkezete

C O

HO C H D-configuration

H C OH

H C OH

CH2OH
 H O open chain structure of D-galactose D-galaktóz nyílt láncú szerkezete
C

H C OH

HO C H D-configuration

HO C H

H C OH

CH 2OH
open chain structure of D-glucose D-glükóz nyílt láncú szerkezete
H O
C

H C OH

HO C H D-configuration

H C OH

H C OH

CH 2OH
 H O mutarotation of D-glükóz
D-glucose mutarotációja
CH2OH C CH2OH

O HC OH O OH

HO CH
OH OH

OH OH HC OH OH
H C OH
OH OH
CH2OH
-D-glucopyranose open chain form -D-glucopyranose
mutarotation of D-glükóz
H2C OH H2C OH H2C OH D-glucose mutarotációja
O OH O
HO HO H HO
HO HO HO OH
OH OH OH
OH O
-D-glucopyranose open chain form -D-glucopyranose
formation of furanose furanóz szerkezet kialakulása
H O structure D-ribózból
C
CH2OH
HC OH O OH

HC OH

HC OH

H 2C OH OH OH
open chain form -D-ribofuranose
 
CH2OH CH2OH structure of -D- -D-fruktofuranóz és -D-
O OH O CH2OH fructofuranose and -D- fruktofuranóz szerkezete Haworth-
fructofuranose according to féle ábrázolással
Haworth
HO HO

CH2OH OH

OH OH
-D-fructofuranose -D-fructofuranose
structure of -D- -D-glükopiranóz és -D-
CH2OH CH2OH glucopyranose and -D- glükopiranóz szerkezete Haworth-
glucopyranose according to féle ábrázolással
O O Haworth
OH

OH OH

OH OH OH

OH OH
-D-glucopyranose -D-glucopyranose
CH2OH COOH COOH oxidation of D-glucose D-glükóz oxidációja

O OH HC OH HC OH
oxidation oxidation
HO CH HO CH
OH
OH HC OH HC OH

HC OH HC OH
OH
CH2OH COOH
-D-glucose D-gluconic acid D-glucaric acid
 COOH -D-glucuronic acid -D-glükuronsav

OH
OH OH

OH
O -D-glucose-6-phosphate -D-glükóz-6-foszfát

CH2 O P O-

O-
O

OH

OH OH

OH

-D-glucose-1-phosphate -D-glükóz-1-foszfát
CH2OH

O
OH

OH O P O-

OH O-
 2-deoxy--D-ribofuranose 2-dezoxi--D-ribofuranóz
CH2OH
O OH

OH

formation of a glycoside glikozid keletkezése

CH2OH CH2OH

O OH O O CH3

OH + CH3OH OH + H2O

OH OH

OH OH

-D-glucosamine -D-glükózamin
CH2OH

O OH

OH

OH

NH2
 CH2OH -D-galactosamine -D-galaktózamin

OH O OH

OH

NH2

O fructose 6-phosphate fruktóz-6-foszfát

-
O P O CH2
O CH2OH
O-
HO

OH

OH

O fructose-1,6-bisphosphate fruktóz-1,6-biszfoszfát
O
-
O P O CH2
O CH2 O P O-
O-
HO O-

OH

OH
 dihydroxyacetone-phosphate dihidroxi-aceton-foszfát
O

CH2 O P O-

C O O-

CH2 OH

glyceraldehyde 3-phosphate gliceraldehid-3-foszfát

H O
C

H C OH O

CH2 O P O-

O-
 O O stage one of glycolysis a glikolízis első szakasza
CH 2 O P O- -
CH2OH O P O CH2
O - O CH 2OH
O ADP O O-
ATP
HO
OH OH OH
OH OH OH OH
OH
OH OH
fructose-6-phosphate
glucose glucose-6-phosphate
ATP

O
ADP
CH2 O P O- O
O
-
C O O- O P O CH2
O CH 2 O P O-
CH2 OH O-
O-
dihydroxyacetone-phosphate HO

OH
H O
OH
C
fructose-1,6-bisphosphate
CH OH O

CH2 O P O-

glyceraldehyde-3-phosphate O-
 Stage two of glycolysis (A glikolízis második szakasza)
H O
C O
Pi + NAD+ H+ + NADH ADP ATP COO-
C O P COO-
CH OH O
CH OH CH O P
-
CH OH
CH2 O P O
CH2 O P CH2 OH
-
CH2 O P
O
glyceraldehyde-3-phosphate 1,3-bisphospho-glycerate 3-phospho-glycerate 2-phospho-glycerate

-H2O

ATP ADP COO-

COO-
C O P
C O
CH2
CH3
phospho-enolpyruvate
pyruvate
 sucrose szacharóz
CH2OH (saccharose) nemredukáló diszacharid
nonreducing disaccharide
O
HOH2C O

OH OH
OH O CH2OH

OH OH

maltose maltóz
CH2OH CH2OH reducing disaccharide redukáló diszacharid

O O
OH

OH OH
OH O

OH OH
 CH2OH CH2OH cellobiose cellobióz
reducing disaccharide redukáló diszacharid
O O
OH

O
OH OH
OH

OH OH

lactose laktóz
CH2OH CH2OH reducing disaccharide redukáló diszacharid

O O
OH OH

O
OH OH

OH OH
 LIPIDS

L--phosphatidic acid L--foszfatidsav

O

O CH2 O C R1

R2 C O CH O

CH2 O P OH

OH

O general structure of glycerophospholipids a foszfogliceridek általános

szerkezete
O CH2 O C R1

R2 C O CH O

CH2 O P O alcohol

O-

cephalin kefalin
O (phophatidylethanolamine) (foszfatidil-etanol-amin)

O CH2 O C R1

R2 C O CH O

CH2 O P O CH2 CH2 NH3+

O-
 lecithin lecitin
O (phosphatidylcholine) (foszfatidil-kolin)

O CH2 O C R1

R2 C O CH O CH3

CH2 O P O CH2 CH2 N+ CH3

O- CH3

O phosphatidylserine foszfatidil-szerin

O CH2 O C R1

R2 C O CH O

CH2 O P O CH2 CH NH 3+

O- COO -
 phosphatidylinositol foszfatidil-inozitol
O

O CH2 O C R1

R2 C O CH O OH OH

CH2 O P O

O-
OH
OH

OH

OH H sphingosine szfingozin

CH C C (CH2)12 CH3

NH2 CH H

CH2 OH
 OH H structure of sphingomyelin a szfingomielin szerkezete

O CH C C (CH2)12 CH3
H
CH3 (CH2) 16 C N CH H O CH3

CH2 O P O CH2 CH2 N+ CH3

O- CH3
the steroid skeleton with a szteránváz szerkezete: az
numbering of carbon atoms atomok számozása és a
and designating of rings gyűrűk betűjele

cholesterol koleszterin
H3C CH2 CH2

CH3 CH CH2 CH
CH3
H3C
CH3

HO
 H3C CH2 CH2 vitamin D3 D3-vitamin

CH3 CH CH2 CH
CH3
H3C
CH2

HO

H3C CH2 COO- cholate kolát

OH (cholic acid)
CH3 CH CH2

CH3

HO OH
H
O estrone ösztron
CH3

HO
 H3C progesterone progeszteron
O
CH3 C

CH3

testosterone tesztoszteron
CH3 OH

CH3

O
 NUCLEOTIDES

adenine adenin
NH2

N
N

N N
H
O guanine guanin

N
HN

H2N N N
H
O uracil uracil

HN

O N
H
O thymine timin

CH3
HN

O N
H
 NH2 cytosine citozin

O N
H
adenosine adenozin
NH 2

N
N

N
N

HOH2C O

OH OH
 NH 2 2’-deoxyadenosine 2’-dezoxiadenozin

N
N

N N

HOH2C O

OH

adenosine 5’- adenozin-5’-monofoszfát

NH 2 monophosphate (AMP)
(AMP)

N
N

O- N N

-
O P O H2C O

OH OH
 NH 2 adenosine 3’,5’-cyclic adenozin-3’,5’-foszfát
monophosphate ciklikus AMP (cAMP)
(cAMP)
N
N

N N

O H2C O

O P O OH

O-

structure of adenosine 5’-triphosphate adenozin-5’- trifoszfát szerkezete

NH2

N
N
O- O- O-
N N
-
O P O P O P O H2C O

O O O

OH OH
 O NAD+ NAD+
(oxidized form) (oxidált forma)
C
NH2

O N+

-
O P O H2C O

OH OH
O
NH2

N
N

N N

-
O P O H2C O

OH OH
 O
structure of flavin mononucleotide a flavin-mononukleotid
H2C CH CH CH CH2 O P O - (FMN) (FMN) szerkezete
(details of flavin don’t need to be (a flavin képletét nem
memorized) szükséges megjegyezni)
OH OH OH O-

H3C N N O

NH
H3C N

O
 NH2

N
N

O O N N

H2C CH CH CH CH2 O P O P O H2C O

OH OH OH O- O-

H3C N N O

OH OH
NH
H3C N

structure of flavin adenine dinucleotide (FAD)

(details of flavin don’t need to be memorized)

a flavin-adenin-dinukleotid (FAD) szerkezete

(a flavin képletét nem szükséges megjegyezni)
 hydrogen bonded structure of adenine and H-kötés adenin és timin bázisok között
CH3 thymine base pairs

O
H
H
N
N N
H DNA
N
N
O

N N
DNA

hydrogen bonded structure of guanine and H-kötés guanin és citozin bázisok között
H cytosine base pairs

N
H
O
N N
H DNA
N
N
O
H
N N N
DNA
H
 NH2

N
N
O-
-
N N
O P O CH2 O
O
O

HN

O OH
O N
-O P O CH2 O
O
O
N
NH

O OH N N NH2
-O P O CH2 O
NH2
O

HN

O OH
O N
-O P O CH2 O

O OH
-O P O-

covalent backbone of RNA

 NH2

N
N
O-
-O
N N
P O CH2 O
O
O
CH3
HN

O
O N
-O P O CH2 O
O
O
N
NH

O N N NH2
-
O P O CH2 O
NH2
O

HN

O
O N
-O P O CH2 O

O
-O P O-

covalent backbone of DNA