Mục tiêu:

HỆ THỐNG HỌC ĐVCXS 1. Giới thiệu một số công cụ sử dụng trong định loại và nghiên

cứu hệ thống học bằng di truyền phân tử;

Bài 4. ĐỊNH LOẠI ĐVCXS 2. Làm quen với một số bước cơ bản trong thao tác định loại và

bằng Di truyền phân tử nghiên cứu hệ thống học bằng di truyền phân tử;

Một số công cụ sử dụng

Sử dụng công cụ BLAST để:
trong nghiên cứu di truyền
phân tử • So sánh trình tự cần kiểm tra với cơ sở dữ liệu online

• BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) (online) • MEGA 7, X • So sánh hai trình tự cần kiểm tra
(Molecular evolutionary genetics analysis(soft ware) • BOLD

systems - Barcode of Life Data System (online) • ABDG -

Automatic Barcode Gap Discovery (online) • Một số phần mềm

khác:

– PAUP

– MrBayes

Sử dụng phần mềm Bioedit

Sử dụng công cụ BOLS SYSTEM để:
• Gióng hàng các trình tự cần phân tích

• Kiểm tra vị trí phân loại của trình tự cần tra cứu • Xây

dựng cây quan hệ di truyền giữa trình tự cần kiểm tra

Sử dụng phần mềm MEGA để:
với các trình tự có sẵn trong cơ sở dữ liệu
• Xây dựng cây quan hệ di truyền
• Dowload dữ liệu (các trình tự sử dụng trong phân tích
• Xác định khoảng cách di truyền
mã vạch di truyền)
1