Introduction 

and applications of Biology 
Stem cell technology 

• Stem cells are undifferentiated biological cells that can differentiate into 
specialized cells and can divide (through mitosis) to produce more stem 
cells. 

• They are the raw material from which all of the body’s cell mature. 

• Stem cells give rise to brain cells, nerve cells, heart cells, pancreatic cells, 
etc.  

• Stem‐cell therapy is the use of stem cells to treat or prevent a disease or 
condition. Bone marrow transplant is the most widely used stem‐cell 
therapy, but some therapies derived from umbilical cord blood are also in 
use. 

There are three known accessible sources of autologous adult stem cells in 
humans: 

1. Bone marrow, which requires extraction by harvesting, that is, drilling 
into bone (typically the femur or iliac crest). 

2. Adipose tissue (lipid cells), which requires extraction by liposuction. 

3. Blood, which requires extraction through apheresis, wherein blood is 
drawn from the donor (similar to a blood donation), and passed through a 
machine that extracts the stem cells and returns other portions of the 
blood to the donor. 

How can stem cells treat disease? 

In a stem cell transplant, embryonic stem cells are first specialized into the 
necessary adult cell type. Then, those mature cells replace tissue that is damaged 
by disease or injury. This type of treatment could be used to: 

1. Replace neurons damaged by spinal cord injury, stroke, Alzheimer’s 
disease, Parkinson’s disease or other neurological problems; 
 2. Produce insulin that could treat people with diabetes and heart muscle cells 
that could repair damage after a heart attack; or 

3. Replace virtually any tissue or organ that is injured or diseased. 

Peripheral Blood Stem Cells 

• While most blood stem cells reside in the bone marrow, a small number are 
present in the bloodstream.  

• These peripheral blood stem cells, or PBSCs, can be used just like bone 
marrow stem cells to treat leukemia, other cancers and various blood 
disorders. 

• Since they can be obtained from drawn blood, PBSCs are easier to collect 
than bone marrow stem cells, which must be extracted from within bones.  

• This makes PBSCs a less invasive treatment option than bone marrow stem 
cells. PBSCs are sparse in the bloodstream, however, so collecting enough 
to perform a transplant can pose a challenge. 

Umbilical Cord Blood Stem Cells 

• New‐born infants no longer need their umbilical cords, so they have 
traditionally been discarded as a by‐product of the birth process. 

•  In recent years, however, the stem‐cell–rich blood found in the umbilical 
cord has proven useful in treating the same types of health problems as 
those treated using bone marrow stem cells and PBSCs. 

• Umbilical cord blood stem cell transplants are less prone to rejection than 
either bone marrow or peripheral blood stem cells.  

• This is probably because the cells have not yet developed the features that 
can be recognized and attacked by the recipient's immune system. 

• Also, because umbilical cord blood lacks well‐developed immune cells, 
there is less chance that the transplanted cells will attack the recipient's 
body, a problem called graft versus host disease. 
Genetically Modified Organisms(GMO) 

• A genetically modified organism, or GMO, is an organism that has had its 
DNA altered or modified in some way through genetic engineering.  

• In most cases, GMOs have been altered with DNA from another organism, 
be it a bacterium, plant, virus or animal; these organisms are sometimes 
referred to as "transgenic" organisms. 

• A gene from a spider that helps the arachnid produce silk, for example, 
could be inserted into the DNA of an ordinary goat.That may sound far‐
fetched, but that exact process was used to breed goats that produce silk 
proteins in their goat milk. The milk is then harvested and the silk protein is 
isolated to make a lightweight, ultra‐strong silk with a wide range of 
industrial and medical uses. 

Transgenic Organisms 

• Most transgenic organisms are generated in the laboratory for research 
purposes.  

• For example, “knock‐out” mice are transgenic mice that have a particular 
gene of interest disabled. By studying the effects of the missing gene, 
researchers can better understand the normal function of the gene. 

• Transgenic organisms have also been developed for commercial purposes 

• Perhaps the most famous examples are food crops like soy and corn that 
have been genetically modified for pest and herbicide resistance.  

• These crops are widely known as “GMOs” (genetically modified 
organisms).  

Here are few other examples of transgenic organisms with commercial 
value: 

1. Golden rice: modified rice that produces beta‐carotene, the precursor 
to vitamin A. Vitamin A deficiency is a public health problem for millions 
 of people around the world, particularly in Africa and Southeast Asia. 
Golden rice is still waiting regulatory approval. 

2. Goats that produce important proteins in their milk: goats modified to 
produce FDA‐approved human antithrombin (ATryn), which is used to 
treat a rare blood clotting disorder in humans.  

3. Goats have also been genetically modified to produce spider silk,one of 
the strongest materials known to man, in their milk .Proposed uses for 
this recombinant spider silk range from artificial tendons to bulletproof 
vests. 

4.  Vaccine producing bananas: genetically engineered bananas that 
contain a vaccine. Bananas provide an easy means for delivering a vaccine 
(especially to children) without the need for a medical professional that is 
trained in giving shots. Edible vaccines are still in development. 

5.  Chymosin producing microorganisms: yeast, fungi, or bacteria modified 
to produce the enzyme chymosin, which splits milk to make cheese. 
Traditionally, rennet (found in cow stomachs) is used to clot cheese. But, 
when the demand for firm cheeses surpassed the amount of rennet 
available, recombinant chymosin was developed and is used widely today. 

6.  Blue roses: roses modified with pansy genes to express a blue color. The 
Japanese company Suntory developed the blue rose, which was previously 
unattainable through traditional selective breeding approaches. Before 
Suntory’s success, blue roses were created by dyeing techniques. 

 
Gene therapy 

• Gene therapy is the therapeutic delivery of nucleic acid polymers into a 
patient's cells as a drug to treat disease.  

• The first attempt at modifying human DNA was performed in 1980 
by Martin Cline, but the first successful and approved nuclear gene transfer 
in humans was performed in May 1989. 

•  The first therapeutic use of gene transfer as well as the first direct insertion 
of human DNA into the nuclear genome was performed by French 
Anderson in a trial starting in September 1990. 

• Gene therapy is a way to fix a genetic problem at its source. The polymers 
are either translated into proteins, interfere with target gene expression, or 
possibly correct genetic mutations. 

Gene therapy may be classified into two types: 

Somatic 

• In somatic cell gene therapy (SCGT), the therapeutic genes are transferred 
into any cell other than a gamete, germ cell, gametocyte or 
undifferentiated stem cell.  

• Any such modifications affect the individual patient only, and are not 
inherited by offspring. 

• Somatic gene therapy represents mainstream basic and clinical research, in 
which therapeutic DNA is used to treat disease. 

• Most focus is  on severe genetic disorders, 
including immunodeficiencies, haemophilia, thalassaemia and cystic 
fibrosis. 

• Such single gene disorders are good candidates for somatic cell therapy.  

 
 Germline 

• In germline gene therapy (GGT), germ cells (sperm or eggs) are modified by 
the introduction of functional genes into their genomes.  

• Modifying a germ cell causes all the organism's cells to contain the 
modified gene. 

•  The change is therefore heritable and passed on to later generations.  

Vectors in gene therapy 

• The delivery of DNA into cells can be accomplished by multiple methods. 

The two major classes are: 

• recombinant viruses (sometimes called biological nanoparticles or viral 
vectors) and  

• naked DNA or DNA complexes (non‐viral methods). 

Viral vectors 

• In order to replicate, viruses introduce their genetic material into the host 
cell, tricking the host's cellular machinery into using it as blueprints for viral 
proteins.  

• Scientists exploit this by substituting a virus's genetic material with 
therapeutic DNA. 

• A number of viruses have been used for human gene therapy, 
including retrovirus, adenovirus, lentivirus, herpes 
simplex, vaccinia and adeno‐associated virus. 

• Like the genetic material (DNA or RNA) in viruses, therapeutic DNA can be 
designed to simply serve as a temporary blueprint that is degraded 
naturally or (at least theoretically) to enter the host's genome, becoming a 
permanent part of the host's DNA in infected cells 

   
  
Non‐viral vectors 

• Non‐viral methods present certain advantages over viral methods, such as 
large scale production and low host immunogenicity.  

• However, non‐viral methods initially produced lower levels 
of transfection and gene expression, and thus lower therapeutic efficacy. 
Later technology remedied this deficiency. 

• Methods for non‐viral gene therapy include the injection of naked 
DNA, electroporation, the gene gun, sonoporation, magnetofection, the 
use of oligonucleotides, lipoplexes, dendrimers, and inorganic 
nanoparticles. 
  
Speculative uses 

• Fertility 

• Gene doping 

• Human genetic engineering 
 
 

 
  

Biosensors 

• A biosensor is an analytical device which converts a biological response into 
an electrical signal. 

• The term 'biosensor' is often used to cover sensor devices used in order to 
determine the concentration of substances and other parameters of 
biological interest even where they do not utilise a biological system 
directly. 

A successful biosensor must possess at least some of the following 
beneficial features: 

1. The biocatalyst must be highly specific for the purpose of the analyses, be 
stable under normal storage conditions and, except in the case of 
colorimetric enzyme strips and dipsticks (see later), show good stability 
over a large number of assays (i.e. much greater than 100). 

2. The reaction should be as independent of such physical parameters as 
stirring, pH and temperature as is manageable. This would allow the 
analysis of samples with minimal pre‐treatment. If the reaction involves 
cofactors or coenzymes these should, preferably, also be co‐immobilised 
with the enzyme. 

3. The response should be accurate, precise, reproducible and linear over the 
useful analytical range, without dilution or concentration. It should also be 
free from electrical noise. 

4. If the biosensor is to be used for invasive monitoring in clinical situations, 
the probe must be tiny and biocompatible, having no toxic or antigenic 
effects. If it is to be used in fermenters it should be sterilisable. This is 
preferably performed by autoclaving but no biosensor enzymes can 
presently withstand such drastic wet‐heat treatment. In either case, the 
biosensor should not be prone to fouling or proteolysis. 
5. The complete biosensor should be cheap, small, portable and capable of 
being used by semi‐skilled operators. 

6. There should be a market for the biosensor. There is clearly little purpose 
developing a biosensor if other factors (e.g. government subsidies, the 
continued employment of skilled analysts, or poor customer perception) 
encourage the use of traditional methods and discourage the 
decentralisation of laboratory testing. 

 
Schematic diagram showing the main components of a biosensor. The biocatalyst (a) 
converts the substrate to product. This reaction is determined by the transducer (b) 
which converts it to an electrical signal. The output from the transducer is amplified (c), 
processed (d) and displayed (e). 

‘Generations' of biosensors 

There are three so‐called 'generations' of biosensors;  

• First generation biosensors where the normal product of the reaction 
diffuses to the transducer and causes the electrical response,  

• second generation biosensors which involve specific 'mediators' between 
the reaction and the transducer in order to generate improved response, 
and  

• third generation biosensors where the reaction itself causes the response 
and no product or mediator diffusion is directly involved. 

 
 Applications: 

• Glucose monitoring in diabetes patients 

• Other medical health related targets 

• Environmental applications e.g. the detection of pesticides and river water 
contaminants such as heavy metal ions. 

• Remote sensing of airborne bacteria e.g. in counter‐bioterrorist activities 

• Remote sensing of water quality in coastal waters by describing online 
different aspects of clam ethology (biological rhythms, growth rates, 
spawning or death records) in groups of abandoned bivalves around the 
world 

• Detection of pathogens 

• Determining levels of toxic substances before and after bioremediation 

• Detection and determining of organophosphate 

• Routine analytical measurement of folic acid, biotin, vitamin 
B12 and pantothenic acid as an alternative to microbiological assay 

• Determination of drug residues in food, such as antibiotics and growth 
promoters, particularly meat and honey. 

• Drug discovery and evaluation of biological activity of new compounds. 

• Protein engineering in biosensors 

• Detection of toxic metabolites such as mycotoxins