Operator's Manual

Quantitative PCR Detection System Archimed X4 & Archimed X6
医用荧光定量 PCR 仪
User Manual
用户手册（Archimed X4 和 Archimed X6 适用）
Version 1.0
鲲鹏（徐州）科学仪器有限公司
Archimed X4 和 Archimed X6 医用荧光定量 PCR 仪
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鲲鹏（徐州）科学仪器有限公司努力确保本手册付印时内容正确无误，但本公司仍有权随时对本手
册内容进行修改，无需提前通知。手册内容以变更后的内容为准。
用户手册版本号：V1.0
用户手册修订时间：2020 年 7 月
适用仪器型号：Archimed X4 和 Archimed X6
软件版本号：V1.0.0
仪器生产日期：见产品铭牌
产品使用期限：5年
生产许可证号：
产品注册证编号/产品技术要求编号：
Archimed X4 和 Archimed X6 用户手册 V1.0 1

前言
欢迎使用鲲鹏（徐州）科学仪器有限公司出品的医用荧光定量PCR仪Archimed X4 和 Archimed
X6。请仔细阅读本说明书，以便您能正确使用。在仔细阅读完毕后，请妥善保管，以便需要时查
询。
产品信息：
产品名称：医用荧光定量 PCR 仪
产品型号：Archimed X4 和 Archimed X6
软件名称：Archimed Analyzer
软件发布版本号：V1.0.0
产品规格：产品尺寸：长 250 mm，宽 520 mm，高 370 mm
产品重量：25 Kg
企业信息：
生产企业：鲲鹏（徐州）科学仪器有限公司
地址：徐州高新技术产业开发区第三工业园珠江东路 10 号一期 6 栋厂房二层
邮编：221100
联系电话：0516-83316609
售后服务单位：鲲鹏（徐州）科学仪器有限公司
服务电话：010-59724295；400-860-5168 转 4483

预期用途声明：
本产品是基于荧光聚合酶链式反应原理，与配套的检测试剂共同使用，对特定基因进行合成放大。利用
反应管内的荧光信号到达设定阈值时所经历的循环数与该基因模板的起始拷贝数的对数存在线性关系
的特点，通过荧光检测系统对荧光信号进行测定，对来源于人体样本中的靶核酸进行定性或定量检测，
包括感染性疾病、遗传性疾病、肿瘤诊疗、心血管疾病和药物基因组等临床核酸检测项目。
特别声明：
首次安装、使用本仪器之前，请仔细阅读本手册中的说明，充分考虑误操作或非推荐功能可能的发生范
围，特别注意可能发生的后果。
禁忌症：
本产品为体外诊断类仪器，无使用禁忌症。
使用者要求：
本产品必须由学习过本用户手册，且接受过鲲鹏（徐州）科学仪器有限公司或鲲鹏（徐州）科学仪器有
限公司代理商培训的检验专业人员、医生或实验室专业人士进行操作。

目录
第 1 章安全与注意事项 .................................................................................................................................... 9
1.1 安全符号及标记 .......................................................................................................................... 9
1.2 通用仪器安全及注意事项 ........................................................................................................ 10
1.3 人身安全及注意事项 ................................................................................................................ 11
1.4 电气安全及注意事项 ................................................................................................................ 11
1.5 环境安全及注意事项 ................................................................................................................ 12
1.6 生物安全及注意事项 ................................................................................................................ 12
1.7 电磁兼容性(EMC)标准............................................................................................................. 12
第 2 章产品概述 .............................................................................................................................................. 14
2.1 适用范围 .................................................................................................................................... 14
2.1.1 预期用途 ............................................................................................................................ 14
2.1.2 产品预期使用环境 ............................................................................................................ 14
2.2 应用领域 .................................................................................................................................... 14
2.3 基本原理 .................................................................................................................................... 15
2.4 主要功能 .................................................................................................................................... 15
2.5 产品组成 .................................................................................................................................... 15
2.6 产品结构 .................................................................................................................................... 16
2.7 仪器参数及特性 ........................................................................................................................ 18
2.7.1 仪器常规参数 .................................................................................................................... 18
2.7.2 仪器技术参数 .................................................................................................................... 18
2.7.3 软件特性 ............................................................................................................................ 19

2.7.4 试剂特性 ............................................................................................................................ 20
2.7.5 耗材规格 ............................................................................................................................ 20
第 3 章仪器安装与运输 .................................................................................................................................. 21
3.1 运输和贮存 ................................................................................................................................ 21
3.2 拆箱 ............................................................................................................................................ 21
3.3 装箱清单 .................................................................................................................................... 21
3.4 安装要求 .................................................................................................................................... 22
3.4.1 仪器工作环境要求 ............................................................................................................ 22
3.4.2 电脑配置要求 .................................................................................................................... 22
3.5 仪器安装 .................................................................................................................................... 23
3.5.1 设备外观 ............................................................................................................................ 23
3.5.2 解除仪器运输锁 ................................................................................................................ 24
3.5.3 仪器安装 ............................................................................................................................ 25
3.6 仪器软件安装 ............................................................................................................................ 26
3.6.1 USB-串口驱动安装 .......................................................................................................... 26
3.6.2 Archimed Analyzer 软件安装 ...................................................................................... 27
3.7 开机前预准备 ............................................................................................................................ 29
3.7.1 仪器自检 ............................................................................................................................ 29
3.7.2 实验准备 ............................................................................................................................ 29
3.7.3 仪器启动 ............................................................................................................................ 30
3.7.4 软件启动 ............................................................................................................................ 31
3.8 系统质量控制 ............................................................................................................................ 32
第 4 章建立和运行实验的一般操作 .............................................................................................................. 33

4.1 软件启动 .................................................................................................................................... 33
4.2 创建实验 .................................................................................................................................... 33
4.3 实验属性 .................................................................................................................................... 34
4.4 运行条件 .................................................................................................................................... 36
4.5 孔板设置 .................................................................................................................................... 38
4.6 运行实验 .................................................................................................................................... 41
4.7 保存实验 .................................................................................................................................... 42
第 5 章实验分析及数据导出的一般操作 ...................................................................................................... 44
5.1 实验分析主界面 ........................................................................................................................ 44
5.2 实验分析一般流程 .................................................................................................................... 45
5.3 查看结果 .................................................................................................................................... 45
5.4 数据导出 .................................................................................................................................... 57
5.5 实验报告 .................................................................................................................................... 59
第 6 章软件分析应用 ...................................................................................................................................... 61
6.1 绝对定量（标准曲线）实验 .................................................................................................... 61
6.1.1 创建实验 ............................................................................................................................ 62
6.1.2 设置实验属性 .................................................................................................................... 62
6.1.3 设置运行条件 .................................................................................................................... 64
6.1.4 设置孔板 ............................................................................................................................ 65
6.1.5 运行实验 ............................................................................................................................ 68
6.1.6 查看及分析结果 ................................................................................................................ 68
6.1.7 导出实验结果 .................................................................................................................... 70
6.2 熔解曲线实验 ............................................................................................................................ 72

6.2.1 创建实验 ............................................................................................................................ 72
6.2.2 设置实验属性 .................................................................................................................... 72
6.2.3 设置运行条件 .................................................................................................................... 74
6.2.4 设置孔板 ............................................................................................................................ 76
6.2.5 运行实验 ............................................................................................................................ 78
6.2.6 查看及分析结果 ................................................................................................................ 78
6.2.7 导出实验结果 .................................................................................................................... 80
6.3 相对定量（△△CT）实验 .......................................................................................................... 82
6.3.1 创建实验 ............................................................................................................................ 82
6.3.2 设置实验属性 .................................................................................................................... 82
6.3.3 设置运行条件 .................................................................................................................... 84
6.3.4 设置孔板 ............................................................................................................................ 85
6.3.5 运行实验 ............................................................................................................................ 86
6.3.6 查看及分析结果 ................................................................................................................ 87
6.3.7 导出实验结果 .................................................................................................................... 89
6.4 基因分型（Genotyping）实验.............................................................................................. 91
6.4.1 创建实验 ............................................................................................................................ 91
6.4.2 设置实验属性 .................................................................................................................... 92
6.4.3 设置运行条件 .................................................................................................................... 93
6.4.4 设置孔板 ............................................................................................................................ 94
6.4.5 实验运行 ............................................................................................................................ 95
6.4.6 查看及分析结果 ................................................................................................................ 95
6.4.7 导出实验结果 .................................................................................................................... 97

第 7 章仪器保养与维护 .................................................................................................................................. 99
7.1 仪器清洁 .................................................................................................................................... 99
7.1.1 清洁仪器外壳 .................................................................................................................... 99
7.1.2 清洁样品仓和反应孔 ........................................................................................................ 99
7.2 仪器维护 .................................................................................................................................. 100
7.2.1 保持空气流通 .................................................................................................................. 100
7.2.2 保持供电稳定 .................................................................................................................. 100
7.2.3 保持仪器清洁 .................................................................................................................. 100
7.2.4 废物处理 .......................................................................................................................... 100
7.2.5 更换保险丝 ...................................................................................................................... 100
7.2.6 过热保护 .......................................................................................................................... 101
第 8 章常见故障处理 .................................................................................................................................... 102

第1章安全与注意事项
1.1 安全符号及标记
产品包装上使用的安全标记
符号含义描述
易碎物品运输包装内为易碎品，因此搬运时应小心轻放。
向上产品运输包装此方向向上。
怕雨仪器运输包装不能被雨淋。
禁止堆高标明本仪器的输包装在储运过程中禁止堆高超过 4 层。
IVD 仪器本仪器为 IVD 仪器。
温度极限标明运输包装储运过程中温度极限。
湿度极限标明运输包装储运过程中湿度极限。
大气极限标明运输包装储运过程中大气压极限。
可回收标明本产品的包装材料为可回收材料。
仪器上使用的安全标记
符号含义描述
警告标明若不按规定的程序或指示操作，可能导致物理伤害或损坏仪器
标明仪器的某个区域易被生物试剂或样本污染，受到污染后请用户
生物危害
及时对该区域进行消毒处理。
标明仪器的某个表面可能存在高温，提醒操作人员注意，操作时小
注意高温
心烫伤。
CE 标志表示仪器符合欧盟相关指令的要求
IVD 仪器本仪器为 IVD 仪器。
序列号标明仪器的生产序列号

用户出于自愿使用本产品，本产品的操作、维护、修理以及运输都必须严格遵守下面列出的安全注意事
项。本产品在设计上对生物污染防护、电气安全防护及机械运动防护进行了充分考虑，任何不遵守安全
注意事项或本手册中的其它提示信息所进行的操作，均有可能引起防护失效，也可能会破坏设计和制造
的安全标准以及仪器的预期使用范围。
由于使用者未阅读本手册或未按照本手册上的内容进行操作而引起的任何损失，鲲鹏（徐州）科学仪器
有限公司不承担任何责任！
注意：使用仪器前请仔细通读本手册，错误的理解或操作可能会导致仪器损坏、实验室的危害、操作人
员的伤害以及较低的仪器使用效率。
提示：请注意所有标记有“注意”、“提示”、“禁止”的描述，以及手册中和仪器上使用的安全符号
和标记。
1.2 通用仪器安全及注意事项
注意：操作人员在没有经过我公司授权的情况下，不得擅自拆卸仪器，更换元器件或对仪器进行调试。
如有以上需要，必须经我公司认可后，由专业人员完成。
注意：请避免碰撞、损坏仪器，小心存放。
注意：如遇到以下情况，用户应立即将仪器的电源插头从电源插座上拔掉，并与供应商联系或请我公司
的专业维修人员进行处理：
– 仪器经受雨淋或水浸；
– 仪器工作时出现不正常的声音或气味；
– 仪器受到碰撞或外壳受损；
– 仪器功能发生明显变化。
禁止：禁止在仪器运行过程中搬运或挪动仪器。
注意：本仪器上的开口均为通风而设，为了避免温度过高，请勿在仪器运行过程阻塞或覆盖这些通风口，
或使用防尘罩及其他任何物质覆盖在仪器表面上。
注意：如需安装或运输本仪器，请与我公司联系请求专业人员或专业指导，否则对仪器造成的损伤，我
公司概不承担任何责任。

注意：仪器安装完成后，应按照技术人员要求，妥善保留运输锁。
注意：仪器运行过程中，请勿强行打开样本仓，否则将会破坏仪器的生物安全、电磁辐射等防护措施。
注意：请勿将与本仪器不配套的耗材（8联管/试管/96孔板等）强行置于样本模块内。
注意：不按照制造商规定的方法使用本仪器，则可能会损害本仪器所提供的防护。
1.3 人身安全及注意事项
注意：仪器的实际重量较重，移动或抬起仪器需要采用适当的工具、方法或与他人配合完成请避免在没
有其他人配合的情况下独自一人移动仪器。若以不当方式抬起本仪器，则可能导致身体损伤、疼
痛或仪器损坏。
禁止：手湿切勿碰触电源插头、电源线或开关。
表面高温：仪器运行过程中，样本仓样本模块可能存在高温，实验过程中及实验刚结束后，请勿立即用
手或任何身体部位直接触碰样本模块，以免发生烫伤。请待样本模块温度降至待机温度后再
打开样本仓，取出样本。
1.4 电气安全及注意事项
禁止：本仪器存在对人体造成危害的电压，任何时候，在拆开仪器外壳之前，请切断仪器电源。禁止在
连接电源线的情况下更换元件。
注意：本仪器的外壳应通过电源地线妥善接地，仪器内部或外部接地通路的任何损坏都有可能造成危险。
注意：若发现漏电现象，请立即切断电源并停止使用。
注意：移动仪器之前，请先切断仪器电源。
提示：通常情况下，请使用本仪器随机附带的电源线。如果原厂电源线破裂、磨损或断开，应尽快采用
等同电源线进行替换。
注意：为了避免触电危险，本仪器的电源线必须可靠接地。本仪器的电源线是标准的三项插头电源线，
请将电源插头插入适当的三线接地插座中 (插座连接的外网电源必须可靠接地)，以保证仪器的
使用安全。
注意：仪器所处电网环境必须接有地线。
注意：请仔细检查电源连接是否牢固，电源线插拔时一定要手持插头，请勿硬拉电源线。插头插入电源
时应确保插头完全插入插座。
注意：请将电源插头、电源线远离加热器等高温物体。使用本仪器时请不要在电源线上放置任何物品，
不要将电源线置于人员经常走动的地方。

注意：本仪器的保险丝型号为250V/5A，安放在仪器后部的电源插座处备用盒内。使用不适当的保险
丝可能会损坏仪器的线路系统并引起火灾。在打开仪器电源开关之前，请检查并确保已正确安装
保险丝。
注意：为在长时间内免遭火灾危险，更换保险丝时请使用本仪器指明使用的正确类型和额定值的保险丝。
更换保险丝时请先切断电源，拔出电源线，并用一字螺丝刀撬开保险盒，将旧的保险丝替换成等
同的新保险丝即可。
1.5 环境安全及注意事项
注意：本仪器仅适用于室内使用，室内应通风良好，无腐蚀性气体。
禁止：电火花可能会引发爆炸危险，禁止在存在或者可能存在易燃易爆气体的环境中使用本仪器。
提示：本仪器的工作环境温度应在10℃~30℃之间，相对湿度应在20%~85%。
提示：本仪器的工作环境气压应为正常大气压 (海拔高度低于2000米)。
1.6 生物安全及注意事项
生物危害：本仪器的样本对象为核酸，实际操作过程中，请视其等同于具有潜在性生物危害的生物样本。
进行样本的处理及操作时，应当采取普遍适用的安全防护措施，穿戴合适的保护眼罩、衣服
和手套。
生物危害：用户请遵守当地或本国所有适用的相关法规，完成对废弃样本及污染材料的处理。
生物危害：本仪器应被视为具有生物污染危险的废弃物进行处理。在重新使用、回收再用或处置之前，
需对仪器进行净化 (包括清洗、消毒和/或杀菌)。应根据当地或本国适用的有关法规处理本
仪器。
生物危害：任何操作过程中，如有液体样本溢出，应迅速取用适当的消毒剂进行消毒，以避免污染物散
播至实验室人员或污染仪器。
1.7 电磁兼容性(EMC)标准
本章节为电磁兼容性的提示，本仪器应根据本章节的电磁兼容性信息进行安装和使用。
本仪器电磁兼容分类为A类、I组。
a) 本仪器符合GB/T 18268.1-2010 和GB/T 18268.26-2010 规定的发射和抗扰度要求。
b) 本仪器按GB 4824-2013 中的A类仪器设计和检测。
c) 便携式和移动式射频通信仪器可能会影响本仪器的使用，在正常使用本仪器时，建议远离便携式和

移动式射频通信仪器或使其处在关闭状态。
d) 必须使用本公司提供的电源线，电源线长度不超过1.5m；
注意：除本公司提供的附件外，使用其它的厂家附件可能导致本仪器发射的增加或抗扰度的降低。
e) 建议在本仪器使用之前评估电磁环境。
f) 禁止在强辐射源（如非屏蔽的射频源）旁使用本仪器，否则可能会干扰仪器正常工作。
注意：制造商有责任向顾客或用户提供仪器的电磁兼容信息。
注意：用户有责任确保仪器的电磁兼容环境，使仪器能正常工作。

第2章产品概述
2.1 适用范围
2.1.1 预期用途
Archimed X4和Archimed X6医用荧光定量PCR仪用于运行实时荧光PCR实验（Real-time PCR）并对
实验数据进行分析；仪器是在实验室内操作，配合相应试剂，对取自患者体内的人体样本（如血液、口
腔拭子、鼻咽拭子、体液等）或其它分析物中的目标核酸进行快速、准确的定量、定性检测，或者进行
熔解曲线、基因型分析等研究，包括感染性疾病、遗传性疾病、肿瘤诊疗、心血管疾病和药物基因组等
临床核酸检测项目。
2.1.2 产品预期使用环境
可在医疗机构、实验室使用，并满足产品运行环境的要求。
1、临床疾病的体外诊断；2、一般实验室的研究使用。其用户是医院检验科或一般实验室的专业技术
人员，需要经过PCR实验室技术和仪器、软件操作的专门培训，具备熟练的相关操作技能。
2.2 应用领域
– 病原体的临床检测
– 遗传筛查
– 肿瘤诊疗
– 心血管疾病诊疗
– 药物基因组
– 基础科学研究
– 公共卫生安全疫情监控
– 食品卫生检疫
– 海关进出口检疫
– 动植物转基因及病原体检测

2.3 基本原理
PCR原理类似于DNA的天然复制过程，其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变
性--退火--延伸三个基本反应步骤构成。重复循环变性--退火--延伸三过程，1～2小时就能将待测目标
基因扩增放大几百万倍，因此具有极高的检测灵敏度。
实时荧光PCR的工作原理是在PCR反应系统中加入一个荧光标记探针，利用反应管内的荧光信号到达设
定阈值时所经历的循环数与该基因模板的起始拷贝数的对数存在线性关系的特点，通过荧光检测系统对
对试管内荧光值的实时监测，对来源于人体样本中的靶核酸进行定性或定量检测。相比普通PCR检测，
实时荧光PCR检测除了能定量检测以外，还具有更高的特异性与灵敏度。
2.4 主要功能
Archimed X4和Archimed X6医用荧光定量PCR仪是专门用于实时荧光PCR检测的仪器，集PCR扩增、
荧光检测、数据分析于一身，可以在PCR扩增的同时，实时监测每个试管内荧光量的增长过程，在扩增
结束后，软件自动处理实验数据，对样本进行定量/定性、熔解曲线或基因分型分析，显示并打印样本
的的起始浓度等实验结果。
2.5 产品组成
本产品主要由电子控制系统、电源模块、温控系统、检测系统、外壳部件及软件组成。
Archimed X4和Archime X6
电子控制系统电源模块温控系统外壳部件检测系统软件
热盖热循环模块光路模块光学扫描模块

2.6 产品结构
整机结构示意图
1.样本模块 2.样本仓 3.进风口 4.出仓按钮
5.电源指示灯 6.运输锁孔 7.状态指示灯 8.通风口
9.电源开关 10.电源线插座 11.USB 接口 12.保险丝
电子控制系统示意图

热盖示意图
温控模块示意图
光路模块示意图
光学扫描模式示意图

2.7 仪器参数及特性
2.7.1 仪器常规参数
尺寸：350 mm(L) × 520 mm (W) × 370 mm (H)；

仪器规格
重量：25 kg
尺寸：720 mm(L) × 550 mm (W) × 580 mm (H)；

包装规格
重量：36 kg
电源电压：AC 220 V（电源电压波动不超出±10%）

；
电源规格电源频率：50 Hz；
额定功率：600 W
通讯规格 USB 端口
温度：10℃ ~ 30℃；
湿度：20% ~ 85% RH 无冷凝；

使用环境
大气压力：85.0 kPa ~ 106.0 kPa；
海拔：2000m 以下
温度：-20℃ ~ 55℃，仪器包装在运输包装箱内；
储运环境
湿度：低于 93% RH
运行噪音仪器运行时最大噪声不超过 70 分贝。
2.7.2 仪器技术参数
热学参数
热循环方式 Peltier半导体
控温模式模块控温
最大升降温速率 3.6 ℃/s
温度准确性 ± 0.2 °C
温度均一性 ± 0.2 ℃
光学参数
激发光源免维护单色LED
检测装置高灵敏MPPC（硅光电倍增管）
荧光通道数 4通道（Archimed X4）或6通道（Archimed X6）

通道1 FAM/SYBR Green等
通道2 VIC/JOE/HEX/TET等
通道3 ROX/Texas Red等

适用荧光染料
通道4 NED/TAMRA/Cy3等
通道5 Cy5等
通道6 FAM/SYBR Green等
检测参数
样本容量 96孔
样本容积 10-50 μl
荧光强度检测重复性 CV ≤3%
荧光强度检测精密度 CV ≤5%
样本检测重复性 CV ≤ 3%
荧光强度检测线性 5个浓度梯度范围内，线性回归系数│r│≥ 0.999
样本线性相关性 5个浓度梯度范围内，线性回归系数│r│≥ 0.980
备注：Archimed X4和Archimed X6两款型号除荧光通道配置不同外，其他技术指标均相同，二者荧
光通道的配置差异请见下表：
通道编号适用荧光染料 Archimed X4 Archimed X6
通道 1 FAM/SYBR Green 等 √ √
通道 2 VIC/JOE/HEX/TET 等 √ √
通道 3 ROX/Texas Red 等 √ √
通道 4 NED/TAMRA/Cy3 等 N/A √
通道 5 Cy5 等 √ √
通道 6 FAM/SYBR Green 等 √ √
2.7.3 软件特性
– 软件界面：向导式界面，直观的样本布局和程序设定，更便于操作编辑。
– 软件功能：具备绝对定量、相对定量、基因分型等分析功能，适应多种实验要求。
– 语言支持：中文或英文。
– 数据传输：仪器与主控计算机之间可实现数据传输；仪器在处于计算机控制下的实验过程中，可以

向所连接的主控计算机实时传输实验数据。
– 数据存储：仪器可存储 ≥ 1000 个实验设置文件/实验数据文件。
– 超长程序设置：每个阶段可包括小于100个步骤，且大循环数小于10。
2.7.4 试剂特性
– PCR试剂：开放试剂平台，所有定量、定性PCR试剂均适用。
– 荧光染料：适用于FAM/SYBR Green, VIC/HEX/TET/JOE, ROX/Texas Red, NED/TAMRA/Cy3，
Cy5等荧光染料。
– 本仪器若用于临床疾病的体外诊断，则使用的试剂必须具备国家药监局颁发的产品注册证、生产许
可证及产品合格证，并在产品有效期内使用，才能保证检测的准确性。
2.7.5 耗材规格
– 0.1 ml 透明/白色 PCR 薄壁单管，平顶透明光学试管盖。
– 0.1 ml 透明/白色 PCR 薄壁8联管，平顶透明光学试管盖。
– 0.1 ml 透明/白色 PCR 薄壁96孔板，无裙边或半裙边。
注意：Archimed™ X4/X6 兼容低位（Low profile）0.1mL PCR 平顶透明管盖反应管/8 联管，无裙边或半裙边 96 孔
PCR 反应板，请勿使用 0.2mL PCR 反应管及凸盖。若样品管较少，请在两侧使用 8 联管空管支撑，或使用空的单管在
四角支撑，以防止板槽受力不均。

第3章仪器安装与运输
3.1 运输和贮存
产品运输按订货合同的要求进行，在运输中必须使用原始包装，以免损坏仪器。
产品在包装运输状态下，应贮存于环境温度为-20℃～55℃、相对湿度小于85%，且空气中不能含有腐
蚀性气体的环境中。
3.2 拆箱
产品的外包装为纸板箱，内部填充避震泡沫。请操作人员收到设备后，不要着急打开设备包装，需仔细
检查包装外观有无损坏。拆箱后先检查您收到的物品是否有缺失和损坏。若产品在运输过程中发生明显
损坏，请不要使用并及时联系销售商！
3.3 装箱清单
序号名称型号数量单位
1 医用荧光定量 PCR 仪 Archimed X4 或 Archimed X6 1 台
2 仪器电源线 1 根
3 仪器数据线 1 根
4 保险丝 2 个
5 L 形内六角扳手 1 个
6 产品装箱单 1 份
7 出厂合格证明 1 份
8 售后服务承诺书 1 份
9 快速使用指南 1 份
10 仪器安装快速指南 1 份
11 U 盘（包含软件及电子版用户手册） 1 根
12 主机防尘罩 1 个

3.4 安装要求
3.4.1 仪器工作环境要求
– 放置地点：Archimed X4和Archimed X6主机必须放在稳固、水平的工作台面上，避免阳光直射，
避免靠近加热设备；仪器在环境温度10～30℃，相对湿度<85%的室内使用；
– 周边环境：不要将Archimed X4和Archimed X6主机安装在强电磁干扰或有高感应系数的仪器旁
边，例如：电冰箱、高速离心机、振荡器等；
– 放置空间：Archimed X4和Archimed X6主机的放置位置必须离周围物体或墙壁至少要有15cm，
以便仪器的散热和通风，以及方便用户开启和关闭仪器电源；
注意：主机在运行时禁止覆盖任何东西
– 电源要求：Archimed X4和Archimed X6供电电源要求：220VAC，50/60Hz，电压波动＜10%；
– 电源插座：为了防止电击危害，Archimed X4和Archimed X6主机必须接在符合安规标准的三芯
接地插座上，电压为～220V（50Hz），零地电压≤5V。如果条件允许，尽可能把仪器连接在专用
的电源插座上。
警告：不正确的接地可能导致人员触电或者仪器损坏。确认输入电压符合仪器要求，并已安装了合乎规格的保险丝。
– 使用培训：Archimed X4和Archimed X6的用户必须经过制造商或经销商的专业技术人员培训后，
才能安装及使用本仪器。
3.4.2 电脑配置要求
安装Archimed X4和Archimed X6荧光定量PCR仪配套软件的电脑必须达到以下配置：
处理器：Intel 或 AMD 双核CPU，2.8GHz；
内存：8 GB；
硬盘：500 GB；
网卡：10M/100M 自适应网卡；
显示器分辨率：1440×900 或更高；
操作系统：Windows 10 或以上，并安装Office Word/Excel 2007或以上版本；
注意：本仪器的主控计算机并非为在线使用而设计，连接网络会有感染病毒及成为黑客攻击目标的风险。鲲鹏（徐州）

科学仪器有限公司对用户连接到网络所导致的任何损害不负责任。
注意：不建议在主控计算机中安装其他软件。否则会有与本仪器软件模块发生冲突的潜在风险，还可能影响结果的可靠
性。
注意：鲲鹏（徐州）科学仪器有限公司不提供杀毒软件。因此，若有必要，请采取预防措施确保本仪器主控计算机上没
有病毒。
3.5 仪器安装
以下内容为方便用户快速完成Archimed X4和Archimed X6荧光定量PCR仪的安装，请务必根据以下
内容进行操作，如您在装机操作中有任何疑问，请拨打服务热线。
3.5.1 设备外观

◼ 状态灯
设备顶板上有电源状态灯POW和系统状态灯STU，状态灯含义入下表所示：
名称状态含义
POW 蓝色常亮系统正常上电
绿色慢闪系统正在自检；进、出仓
绿色快闪系统正在工作
STU 绿色常亮系统空闲状态
黄色系统警告，可以继续工作
红色系统故障，停止工作
◼ 开闭仓控制
通过仪器顶板的进出仓按键对样品盘的进出仓进行控制。在样品盘进仓状态下，按压进出仓按键，样
品盘出仓；反之，样品盘进仓。放置或取出样品管需要在仪器空闲状态进行，在系统工作和自检过程中，
请勿按动开盖按键，以免影响实验进程与结果。
◼ 设备开关
设备采用船型开关，“I”端按下为接通，“O”端按下为断开。
◼ 数据接口
设备背板的接口为USB接口，用于电脑和设备之间的通信。
◼ 进风口
设备前面板的下部缝隙为设备的一组进风口，设备工作工程中应避免有物体阻塞该进风口。特别注意该
缝隙仅为进风口，设备搬运过程中严禁作为抠手使用！
3.5.2 解除仪器运输锁
为避免运输过程中仪器的重要部件损坏，特增加运输锁功能。在仪器断电状态下，找到仪器顶部锁定孔，
取下软胶塞。将随机配备的M4内六角扳手对准孔内螺栓，稍用力向下按压至底部并逆时针旋转90度后，
松开扳手，运输锁在仪器内部弹簧作用下弹出（如下图所示）。

仪器上电，仪器内部电机自动执行复位动作，STU灯状态从慢闪烁变为常绿，解锁成功。
3.5.3 仪器安装
插入数据线和电源线连接（如图A所示），数据线连接电脑。接通电源后，按压仪器后端的电源开关，
仪器开机，电源指示灯（POW）常亮，系统开始自检。待系统自检结束，若仪器正常状态灯（STU）
为绿色常亮（如图B所示）。按压进出仓按键，取出样品载台中的支撑板（如图C所示）。装机步骤完
成。
B C

3.6 仪器软件安装
3.6.1 USB-串口驱动安装
在使用 Archimed X4和Archimed X6荧光定量PCR仪和Archimed Analyzer分析软件之前，您需要在
系统中预先安装驱动程序。您可以在随机赠送的U盘中找到USB-串口驱动软件。请参考以下步骤完成
安装过程：
a) 双击安装图标
b) 出现解压文件界面后点击“Extract”提取文件；
c) 弹出安装界面后点击“下一步”安装 USB-串口驱动程序；
d) 点击“完成”完成程序安装；

3.6.2 Archimed Analyzer 软件安装
在使用 Archimed X4和Archimed X6荧光定量PCR仪之前，您需要在电脑中安装Archimed Analyzer
分析软件。您可以在随机赠送的U盘中找到安装软件。请参考以下步骤完成安装过程：
a) 双击安装图标
b) 在弹出的安装界面点“下一步”开始安装
c) 软件的默认安装路径为 C:\Program Files (x86)\QPCR。您可以根据自己的需求改变安装路径，

并点击“下一步”继续安装过程：

d) 在确认安装信息无误后，点击“开始”开始安装软件：
e) 安装完成后点击“退出”结束安装过程：

3.7 开机前预准备
3.7.1 仪器自检
本仪器带有自检功能，使用前用户应运行仪器进行自检，确保仪器在实验时能够正常工作。
a) 打开仪器背面电源开关，开启仪器。
b) 开机后，仪器自动进入自检状态，自动检查包括仪器版本、电气是否处于正常工作状态、供电是否
正常及初始化电机位置等项。
c) 自检通过后，仪器前端显示灯常亮（如下图所示），仪器将进入待命状态。
注意：仪器通电之前请确保：
仪器运输锁已解除；
主控计算机等外接仪器已正确连接；
仪器电源已正确连接。
注意：仪器无法通过自检或无法正常工作时，请再次开机进行自检，若仪器仍无法通过自检，请及时联系经销商或我公
司，切勿拍打或晃动仪器。
3.7.2 实验准备
PCR和RT-PCR的良好实验室规范：
✓ 准备 PCR 或 RT-PCR 扩增样品时：
✓ 准备干净的手套实验服（以前在处理扩增产物或样品制备过程中没有穿过）
✓ 每当你怀疑手套被污染时，建议更换手套
✓ 为以下目的设置单独的区域和专用设备及用品:
– 样品制备和反应设置
– 产物的扩增和分析
✓ 不要将扩增产物带入反应设置区

✓ 小心打开和盖上所有样品管，避免溅起或喷洒样品
✓ 尽可能多地保持反应和组分的上限
✓ 使用正向洗液或抗气溶胶屏障移液管头
✓ 定期用 10%漂白剂清洗实验台
✓ 使用校准过的移液器和抗气溶胶枪头
✓ 按照制造商关于主混合物和待检混合物的建议制备反应混合物
✓ 在计算中包括过量体积，以便为试剂转移过程中发生的损失提供过量体积
✓ 用 TE 缓冲液或水稀释样品和任何标准品
✓ 稀释样品和标准品时要小心，稀释过程中的错误或不准确直接影响数据的准确性
✓ 将稀释液和化验混合液置于冰箱中避光，直到准备好使用为止。过度曝光可能会影响荧光探针或染
✓ 使用前:
– 通过旋转瓶子彻底混合主混合物。
– 通过涡旋振荡重新悬浮化验混合物，然后短暂离心。
– 将任何冷冻样品放在冰上解冻。解冻后，用涡旋法重新悬浮样品，然后将试管短暂离心。
配置PCR反应的指南注意事项：
✓ 确认各管液体在管底，无气泡。否则再次离心孔板
✓ 确保板或管正确密封
✓ 将反应板或反应管保持在 4°C 的避光环境中，直到准备好将其装入仪器
✓ 保持板底部干净，板底部的液体和其他污染物会污染样品，并导致异常高
的背景信号
✓ 如有必要，可使用永久性记号笔或钢笔在试管和板的侧面进行记号，不要使用荧光笔
3.7.3 仪器启动
a) 启动电脑显示器、主机；
b) 打开仪器背板的电源开关，电源状态灯 POW 为蓝色，常亮；
c) 等待系统自检，自检过程中状态灯 STU 为绿色闪烁状态，自检通过后为绿色常亮；

3.7.4 软件启动
a) 启动电脑显示器、主机；
b) 双击桌面软件图标，启动软件；
c) 软件启动中界面；
d) 用户登录；
软件启动后，将自动弹出“系统登录”对话框（如下图左）
。点击“系统登录”对话框右上角“注
册”按钮，将自动弹出“用户注册”对话框（如下图右）
，可编辑用户名和密码，完成新用户注
册。点击“用户名”下拉列表，可选择不同账户进行软件登录。
e) 软件启动后界面；

3.8 系统质量控制
为了保证Archimed X4和Archimed X6的检测准确性，除了日常的维护保养外，用户还应做到以下几
点：
每次定量检测必须做标准品及阴阳性对照，以监测实验质量及仪器性能；
定期购买权威部门的质控品，来验证试剂及仪器的性能。

第4章建立和运行实验的一般操作
本章节内容将详细介绍如何利用 Archimed Analyzer 软件进行实验的建立及运行。
4.1 软件启动
双击桌面图标，启动应用软件
软件启动后自动跳转到创建实验的界面：
4.2 创建实验
“创建实验”界面用于创建一个全新的实验运行或调用之前保存的运行模板建立一个新的实验，这是建
立实验运行的第一步。
4.2.1 新的实验
a) 点击启动界面右下方“创建”按钮，或者通过菜单栏选择“创建”
，可以创建全新的实验流程；
b) 点击菜单栏的“从模板创建”，可以通过之前已保存的实验运行模板创建新实验。
4.2.2 打开已有实验

点击启动界面右下方“打开”按钮，或者通过菜单栏选择“打开”，即可打开之前已保存的实验文件，
文件类型如下：
a) .qps 文件，为完整原始数据文件，包含运行条件、反应板设置和实验结果；
b) .qpt 文件，为实验运行模板文件，包含运行条件及反应板设置信息。
4.3 实验属性
“实验属性”界面用于根据实际实验情况进行实验相关属性的定义，包括实验的命名、反应管类型的对
应选择、所要进行的实验类型的定义、PCR 试剂类型的选择等。实验属性设置完成后，软件将根据相
应信息关联至后续的实验设置步骤。
4.3.1 实验名称
实验名称默认为当前的时间，可根据需要进行更改，不支持特殊字符。
4.3.2 仪器型号
仪器型号为 Archimed X4 或 Archimed X6。
4.3.3 反应管类型
Archimed X4 和 Archimed X6 兼容市场中常见的荧光定量反应管类型，包括 0.1ml 的 PCR 单管、8
联管及 96 孔板，可根据实际使用的反应管材质对应选择白管或透明管（含磨砂管），软件会根据选择
的反应管类型进行后续实验的设置关联。相对于透明管而言，白管能够更有效地减少光信号的损失及串
扰，因此我们建议用户使用白色材质的反应管，以获取更佳的实验数据。

4.3.4 实验类型
根据实验的实际目的，选择所对应的实验类型，软件将根据选择的实验类型关联后续的实验设置，实验
类型请参见下表所述：
实验类型概述
基于标准曲线的绝对定量是适合需要测定目标基因实际浓度或拷贝数的研究人员采用的
实时荧光定量 PCR 分析方法。要进行绝对定量，需对已知浓度的目标模板溶液进行几
绝对定量次连续稀释，采用实时荧光定量 PCR 扩增，利用获得的数据生成标准曲线，标准曲线
以各靶点浓度及相应的 Ct 值绘制。然后将未知样本的 Ct 值与此标准曲线进行比较，
确定其拷贝数。
相对定量适用于大多数基因表达研究，可分析校准 (正常)样本和一个或多个实验样本中
目的基因表达水平的上调或下调。采用该技术无需精确测定拷贝数，而是关注与校准样
本相比的倍数变化。ΔΔCt法是一种非常普遍的相对定量分析方法，它比较了包括校准品
相对定量（△△CT）
(如未处理或野生型样本) 和标准品 (如看家基因表达) 在内的实验样本的结果。采用该
方法，可根据检测样本和校准样本中的标准品 (正常) 基因的Ct比较同样两个样本中的
目的基因的Ct。其得出的ΔΔCt值可用于测定表达的倍数差异。
熔解曲线实验用于测定 SYBR™Green 染料 PCR 反应扩增产物的熔解温度(Tm)，不同碱
熔解曲线基组成或长度的基因序列具有不同的 Tm，因此可以根据 Tm 值确定不同的反应产物，包
括非特异性产物。
在基因变异研究中，为了获得大量特征的标记物，必须对大量个体进行基因分型。不同
层次的个体基因组上存在差异的原因包括：单核苷酸多态性（SNP）和 DNA 共价修饰。
其中，造成个体差异的基因序列变异 90%以上属于单核苷酸多态性（single nucleotide
polymorphism, SNP）
，SNP 主要是指由基因组核苷酸水平上的变异引起的 DNA 序列
基因分型
多态性，其中最少一种等位基因在群体中的频率不小于 1%，包括单碱基的转换、颠换
以及单碱基的插入和缺失等；此外还包括 DNA 的共价键修饰方式的改变，例如 DNA 甲
基化。最常用的基本方法是利用酶裂解水解探针对于已知突变的检测进行的终点法基因
分型。

4.3.5 试剂类型
仪器兼容市面中绝大多数荧光定量 PCR 试剂，可根据具体实验设计，选择探针法（TaqMan 试剂）或
染料法（SYBR Green 试剂）以开展后续实验。探针法及染料法的概述比较请参见下表：
方法优点缺点适用范围
适用性广
适合科研中对各种目的基因定量分析，
灵敏引物要求高
SYBR Green 方法基因表达量的研究，转基因动植物的研
方便易出现非特异性带
究
便宜
特异性高价格高病原体检测，疾病耐药基因研究，药物

TaqMan 方法
重复性好只适合特定目标疗效考核，遗传疾病的诊断
4.4 运行条件
“运行条件”界面用于设置定量 PCR 反应运行的具体参数，包括反应体积、反应阶段、反应步骤、反
应温度、反应时间及循环次数等，可根据具体实验需求及相应反应试剂要求进行上述参数的设置。
4.4.1 反应体积
默认 20µL，支持 1-50µL，可手动点击输入更改；
4.4.2 热盖温度
热盖温度，默认 100 度，不可更改；

4.4.3 基本设置
a) 时间、温度、升温速度（熔解曲线模式）的设定可以通过在数值区输入数值或点
击进行，其中温度的设置还可通过点击拖拽温度曲线中的进行温度更改
注意：时间设置最小值不能小于 00:01 秒，进行实际更改时请避免
b) 点亮相机图标开启数据采集
c) 相机开启默认为延伸结束后进行采集
d) 如需增加或减少 PCR 某阶段中的反应步骤，可将鼠标移至该步骤区域，点击“+”或“-”，左侧
及右侧“+”分别代表在此步骤前或后增加一个步骤，中间“-”代表去掉此步骤
e) 如需增加或减少 PCR 反应阶段，如“保温”、“PCR 反应”等，可将鼠标移至反应阶段区域，点
击“+”或“-”，左侧及右侧“+”分别代表在此阶段前或后增加一个阶段，中间“-” 代表去掉
此阶段
f) 循环次数，可通过在数值区输入数值或点击进行更改
g) 熔曲阶段相机图标上的下拉列表数值表示荧光信号采集温度间隔，数值越小所采集的数据点越多。

4.5 孔板设置
“孔板设置”界面用于设置反应孔的属性，包括对每个反应孔分配样本、检测项目、反应孔任务等属性，
便于实验信息的记录、直观查看及后续结果的分析。
注意：孔板设置可以在反应运行前、运行中、或运行后设置，运行中或运行后进行孔板设置可以节省时间。
4.5.1 高级设置
◼ 在孔板设置的高级设置窗口中定义和分配孔属性：
a) 点击可以添加样本和检测项目；

b) 点击右侧的可以去掉样本和检测项目；
c) 在（孔板视图）中根据实际反应管放置的相应孔位选择反应孔
d) 将样本（目的基因来源）和检测项目（目的基因）分配到选定孔位中，点击各自的字段文本框，
可命名实际测试的样本和目的基因。对于已输入的名称软件会进行记录，并可从各自的下拉列
表中选择之前定义的样本和检测项目。
e) 当您在高级设置窗格中输入一个新的样本或检测项目时，软件会自动为 Reporter 填充默认值
(FAM)和淬灭基团(NFQ-MGB)，并分配任务(未知)，需根据实际使用的染料或探针进行相应
更改。设置完成后，在相应样本及检测项目前进行勾选，即可将设置的属性分配到之前选定的
相应孔位中。
◼ 在孔板设置选项卡的高级设置窗口中分配任务：
a) 在（孔板视图）中选择反应孔。
b) 在检测项目中，选择检测项目的复选框，然后从下拉列表中选择任务。

反应类型任务
未知（待测样本）
阴性对照
标准品
纯合等位基因 1/1
杂合等位基因 1/2
上述设置完成后，在相应样本及检测项目前进行勾选，即可将设置的属性分配到之前选定的相应孔
位中。
4.5.2 快速设置
“快速设置”是用于对样本及检测项目进行快速简易设置的功能模块，选定待设置的孔位后，可点击样
本及检测项目后的文本框手动输入命名。若在高级设置中已进行设置，则可通过下拉菜单选择高级设置
中定义的选项，对相应孔位进行属性分配。
4.5.3 反应孔清除
若需要对已设置的反应孔进行清除，则选中要清除的反应孔，单击鼠标右键选择清除。若需要清除多个
孔位，则用鼠标拖选这些孔位后，单击鼠标右键选择清除。

4.6 运行实验
4.6.1 从桌面软件运行实验
a) 按仪器顶部的进出仓按钮；
b) 弹出仪器温控模块；
c) 将反应管或板加载到温控模块上；
注意：（仅适用于 96 孔 0.1 毫升模块）当抽屉关闭时，加热盖将施加适当的压力以将管带牢固地安置在模块中。
d) 按进出仓按钮关闭仪器温控模块；
e) 在桌面软件的“运行”选项卡中，单击“开始运行”
。
f) 运行完成后，按进出仓按钮，从温控模块中取出反应管或板，然后关闭仓门。
注意：人身伤害危险。在仪器操作过程中，温控模块温度可达 100°C，在处理前让它冷却至室温。
4.6.2 运行实验程序
a) 点击“开始运行”后出现保存对话框，选择数据保存位置和名称；
b) 保存后仪器开始运行程序，运行界面左上角将显示实时热盖温度和反应板温度；

c) 等热盖温度达到 100°C 时，运行界面左上角将显示实时热盖温度、反应板温度和反应处于的循环
数，右上角将显示预计剩余时间，扩增图谱栏将实时显示整个反应流程的原始数据图谱，在最初
的反应循环阶段，原始数据图谱基本为背景或基线，当扩增反应进入指数增长阶段后，曲线将会
上升。
4.7 保存实验
点击菜单栏“文件”选项，可以选择保存或者另存为，对原始实验数据进行保存。实验流程的每一步操
作都可以在界面右上角选择保存实验。运行前保存的实验文件扩展名为 qpt（实验运行模板）。运行完
成后保存的实验文件扩展名为.qps（原始数据文件）
，包含所有的原始运行数据及分析结果。

发布分析数据的选项说明：
目的操作
将图谱保存为图像文件点击按钮
打印一个图谱
点击按钮
将图谱复制到剪贴板点击按钮
导出实验结果数据点击导出按钮
数据类型描述文件格式或应用程式
• .txt
实验结果以做进一步分析 Archimed X4 和 Archimed X6 格式
• .xls

第5章实验分析及数据导出的一般操作
本章节内容将详细介绍如何利用 Archimed Analyzer 软件进行实验结果的查看、分析及导出操作。
5.1 实验分析主界面
5.1.1 工具栏按钮
按钮按钮名称功能
放大展开反应板或曲线窗口显示
缩小收缩反应板或曲线窗口显示
还原反应板还原反应板
反应板在反应板中查看结果
列表在列表中查看结果
发送到打印机打印当前软件窗口图像文件
复制复制当前软件窗口图像文件
保存为 jpeg 图像保存当前软件窗口图像文件
图谱特性图谱特性设置
隐藏图谱图例隐藏图谱图例
显示图谱图例显示图谱图例
显示曲线设置显示和更改曲线设置

5.1.2 其它工具
工具工具名称功能
分析单击分析可在反应板或分析设置更改后分析数据
操作可选择样本和检测项目
保存当前打开文件可另存为.qps 文件
查看在反应板或列表中查看当前文件实验结果
分类查看在列表中查看当前文件实验结果
展开/收缩展开/收缩反应板或图像窗口显示
5.2 实验分析一般流程
查看曲线或图谱
评估实验结果图
（可选）检查异常值，必要时忽略孔
（可选）更改分析设置
运行完成后，Archimed X4 和 Archimed X6 桌面软件将使用默认分析设置自动分析数据，结果分析界
面中显示扩增图谱。
注意：遗漏孔或更改分析设置后，需再次单击“ ”以获取新的实验结果。
5.3 查看结果
5.3.1 查看扩增曲线
a) 单击扩增曲线，软件将在图谱界面中显示扩增曲线图谱。

b) 查看扩增曲线，评估扩增曲线整体形状，一个典型的扩增曲线有四个不同的部分:①基线②指数期
③线性期④平台期。
c) 单击” “，打开图谱特性设置界面，可以分别在“一般”、
“X 轴”及“Y 轴”设置界面中对扩
增图谱的相关标题、文字、字体、颜色、刻度范围等属性进行个性化设置，如下图所示。设置完
成后点击保存，软件会自动将新设置的属性显示在扩增图谱中。
d) 单击“ ”，打开曲线设置界面，可以对图谱类型、曲线颜色及阈值进行个性化设置。

e) 点击图谱类型下拉列表，可以根据需要选择曲线图 X/Y 轴的显示模式，软件默认的显示模式为“△
Rn Vs 循环数”
，该模式也是查看扩增图谱的常用模式。
图谱类型描述用途
Rn Vs 循环数 Rn 是将染料的荧光信号归一化后的值识别和检查异常扩增
△Rn Vs 循环数 △Rn 是对 Rn-1 后得到的值识别和检查异常扩增
CT Vs 反应孔 CT 为荧光在扩增图中达到阈值的 PCR 循环数识别异常值
f) 点击图谱类型下拉列表，可以根据需要选择扩增曲线的显示类型，包括线性图谱和对数图谱，软
件默认显示图谱类型为线性图谱。
5.3.2 设置颜色
可根据需要选择不同的颜色区分项目，以便于对不同类别的扩增曲线进行观测。
描述用途
检测项目软件将以不同颜色表征所检测不同目标基因扩增曲线区分不同目标基因的扩增曲线
样本软件将以不同颜色表征所检测的不同样本的扩增曲线区分不同样本的扩增曲线
反应孔软件将以不同颜色表征每一个反应孔的扩增曲线区分每个反应孔的扩增曲线
标记软件将以不同颜色表征不同荧光标记的扩增曲线区分不同荧光标记的扩增曲线
以选择“反应孔”为例，下图显示了软件通过不同颜色表示不同反应孔的扩增曲线。

5.3.3 设置检测项目
可勾选锁定前面的方框，锁定检测项目，也可点击锁定后的下拉菜单，选择检测项目，如下图当前软件
检测项目为β-actin 基因。
5.3.4 设置阈值
每次实验结束后，软件默认以最大二阶导算法给出 CT 值，由于最大二阶导算法并不存在阈值线的概念，
因此在扩增曲线图谱中不显示阈值线；若想在扩增曲线中显示阈值线，则可去掉自动阈值勾选，软件将
自动切换为以差值法算法给出阈值线并计算 CT 值，如需手动更改阈值，可通过手动输入数值或在扩增
图谱中上下拖动阈值线进行更改，每次拖动阈值线后，软件将自动根据新设置的阈值进行 CT 值等相关
结果的计算分析。
注意：每次阈值设置更改后，需再次单击“ ”以获取新的实验结果。

5.3.5 基线设置
软件会在反应的最初几个循环中 (一般为第 3 至 15 个循环)自动设置基线。如需手动设置，去掉自动
阈值勾选，去掉自动阈值勾选，可直接在曲线上拖拽基线（绿色三角号）并在可取范围(1 至 15 个循
环)内进行更改。建议当 Ct 值出现过早时，要保证基线的设置要在曲线的平直区域内；基线设置范围
过宽时，如在第 10 个循环中即可检测出荧光，结果可能会造成曲线下降和 Ct 延迟，此时可尝试提
前几个循环设置基线，使曲线和 Ct 回到准确的位置上。
注意：每次基线设置更改后，需再次单击“ ”以获取新的实验结果。
5.3.6 以反应板形式查看结果
单击“ ”，软件将以反应板形式展示实验结果
在反应板中，将鼠标移动到某一孔位，即可显示此孔的检测项目、任务、荧光染料和样本名称信息，如
上图显示的是 A3 孔的信息。

如需单独查看某反应孔扩增曲线，则点选相应孔位，以查看相应孔位曲线，上图在左侧反应板中点选
F6 孔，右侧曲线区将只显示此孔扩增曲线。
根据需要，可点击放大“ ”
、缩小“ ”以及还原“ ”图标，以更改反应板显示布局。
反应孔图例：
反应类型任务
未知（待测样本）
阴性对照
标准品
杂合等位基因 1/2
5.3.7 以列表形式查看结果
单击“ ”软件将以列表形式展示实验结果
列表中会显示实验基本信息，反应孔、样本名称、项目名称、检测类型、荧光染料、CT、CT 平均值和
CT SD 等实验信息，可参照下表中的描述对孔板进行分组或排序：
分类描述注释
检查每个重复组的 CT 或数量值，以评估 CT
重复按重复分组，例如：阴性对照、标准品和样本
值的精度
一个标志表明软件在标记的孔中发现了一个潜
标志分组为标记孔和未标记孔
在的错误。
按 CT 值分组：
• 低（CT<24） CT 值<8 表示反应中模板可能过多；
CT 值 • 中等（CT 值从 24-30） CT 值>35 表示反应中靶量较低，CT 值>35 的
• 高（CT>30）结果，有更高的标准差。
• 无 CT 值

5.3.8 查看原始数据图谱
原始数据图谱反映了整个 QPCR 反应过程中荧光信号的实时变化，图谱中横坐标为扩增循环数，纵坐
标为原始荧光数值。
单击原始数据图谱，软件将在图谱界面中显示原始数据图谱。
在原始数据图谱中的其它分析操作方法与上述扩增曲线一致，具体请参见上述扩增曲线部分相应段落。

5.3.9 查看标准曲线
在相对定量前验证扩增效率或者做绝对定量实验时，需要设置标准曲线实验。
a) 单击标准曲线
b) 查看标准曲线
c) 标准曲线 X 轴下方会显示，实验的检测基因、斜率、Y 轴截距、R2、扩增效率%、误差信息，其
中斜率在-3.2~-3.5，R>0.99 或 R2>0.98，扩增效率在 90%~110%，扩增结果就认为是可靠的。
d) 单击“ ”，可以进行曲线设置。
e) 检测项目同上，图谱颜色默认状态下，红色标记标准品，蓝色和绿色标记未知样品。

f) 在标准曲线中的其它分析操作方法与上述扩增曲线一致，具体请参见上述扩增曲线部分相应段落。
5.3.10 查看熔解曲线
a) 单击熔解曲线，软件将在图谱界面中显示熔解曲线图谱。
b) 查看熔解曲线
c) 熔解曲线通常用于鉴定 PCR 反应是否特异，产物是否单一，如果出现双峰或者多峰，可以认为
PCR 产物为非单一产物。
d) 单击“ ”，可以设置图谱特性。在图谱特性窗口，可以设置熔解曲线的一般、X 轴、Y 轴信息。
e) 单击“ ”，可以更改曲线设置。
f) 设置图谱类型

上图为衍生图谱，衍生图谱是用荧光信号改变的负的一次导数与温度作图。在扩增产物的熔解温
度上有一特征峰（Tm，DNA 双链解链 50％的温度）

，因为它们在不同的温度熔解，所以用这个
特征峰就可以将特异产物与其它非特异性产物和引物二聚体区分开。
上图为原始图谱，原始图谱是反映荧光信号随温度变化的曲线。
g) 设置颜色

在熔解曲线中颜色设置方法与上述扩增曲线一致，具体请参见上述扩增曲线部分相应段落。
h) 熔解曲线阶段
上图阶段 3 说明熔解曲线阶段处于整个反应的第三个阶段。
i) 设置检测项目
在熔解曲线中检测项目设置方法与上述扩增曲线一致，具体请参见上述扩增曲线部分相应段落。
5.3.11 查看基因表达图谱
a) 单击基因表达
b) 选中表格中的所有样本信息
c) 查看基因表达图谱

d) 在基因表达图谱中的其它分析操作方法与上述扩增曲线一致，具体请参见上述扩增曲线部分相应
段落。
5.3.12 查看基因分型图谱
a) 单击等位基因鉴别图谱
b) 查看等位基因鉴别图谱
c) 等位基因鉴别图谱下方会显示不同样本的颜色，以及每种颜色代表的等位基因类型，在等位基因
鉴别图谱中的其它分析操作方法与上述扩增曲线一致，具体请参见上述扩增曲线部分相应段落。

5.4 数据导出
5.4.1 导出界面工具
工具工具名称功能
导出导出数据
保存当前文件另存为.qps 文件
5.4.2 数据导出
a) 文件名称：系统默认以实验当前的时间而命名，也可以自己命名，支持中文，但不支持特殊字符。
b) 内容：包括孔板设置、扩增数据、多组分数据、结果、熔解曲线结果、试剂信息。可以根据数据
分析需求，勾选导出内容，如果是染料法定量还会在内容中显示熔解曲线阶段，上图就是染料法。
c) 选项：系统默认以上信息合并为一个文件，按此选项导出的各项内容会显示在一个 Excel 表的不
同 sheet 中，也可以选择把以上信息拆分为多个文件，按此选项导出的各项内容会分别显示在不
同的 Excel 中，且每个 Excel 会以导出内容命名。
d) 文件类型：选择 QPCR 和.xsl。
e) 存储路径：系统默认的是桌面，可以单击存储路径后面的“ ” 选择左侧的桌面，会
弹出打开对话框再单击右下角的打开，文件即保存到桌面，也可以选择其它路径，此时打开对话
框会关闭。

f) 单击导出：结果会显示在一个打开的 Excel 中，表格中包含孔板设置、扩增数据、结果、原始数
据、熔解曲线原始数据、熔解曲线结果等 sheet。
g) 用于数据分析的 CT 值信息会在结果表格中展示

5.5 实验报告
5.5.1 创建实验报告
实验运行完成后，通过软件界面左侧“实验报告”选项卡，可创建实验报告模板。点击“实验报告”按
钮，软件主界面将显示实验运行设置及检测结果相关信息（如下图）。左侧孔板视图界面将自动关联实
验设置信息，右上侧检测结果界面自动关联实验结果信息，用户可在右下侧“编辑患者信息”视图框中
输入实验对应的患者相关信息。
5.5.2 打印或保存实验报告
实验报告创建完成后，点击软件界面右上角“打印”按钮，可进行实验报告的打印或保存。点击“打印”
按钮后，将自动弹出“打印预览”视图框（如下图）
，在上一步创建实验报告时编辑输入的信息将显示
在检测报告中。

在“打印预览”视图框中点击左上角保存按钮，将自动弹出保存对话框，用户通过选择保存路径，可将
实验报告保存为 PDF 文档（如下图左）。点击左上角打印按钮，将自动弹出打印选项对话框，可将实验
报告直接进行打印（如下图右）
。

第6章软件分析应用
6.1 绝对定量（标准曲线）实验
绝对定量是适合需要测定靶点实际拷贝数的研究人员采用的实时荧光定量 PCR 分析方法。要进行绝对
定量，需对已知浓度的目标模板溶液进行几次连续稀释，采用实时荧光定量 PCR 扩增，利用获得的数
据生成标准曲线，标准曲线以各靶点浓度及相应的 Ct 值绘制。然后将未知样本的 Ct 值与此标准曲
线进行比较，确定其浓度或拷贝数。
应用标准曲线方法进行绝对定量，需具备已知浓度或数量的模板标准品，这表示在生成曲线前，应准确
定量模板。定量的准确度与标准曲线的质量直接相关。用于生成标准曲线的模板及定量该模板采用的方
法是实验的基础。连续稀释时的加样准确度极为重要，目标模板和连续稀释的实际样本的 RT 和 PCR
效率至关重要。
尽管您可能需要均匀的纯模板进行初始拷贝数测定和标准曲线生成，但最好使用与实验样本尽可能类似
的目标模板。由于诸如核酸提取和逆转录等步骤可影响反应的动态范围，所以应采用与实验样本尽可能
相同的处理步骤。
在标准曲线实验中：
– 软件使用来自标准稀释系列的数据生成标准曲线。
– 软件利用标准曲线来计算未知样本的量。
反应类型：
– 在标准曲线实验中可以分析多种样本，但每种样本需要自己的标准曲线。
– 下表中列出了标准曲线实验中涉及的样本设置类型：
设置类型示例说明
标准包含已知数量的目标样本
未知待测样本
无模板对照(NTC) 水或缓冲液替代模板，NTC 孔中不应出现靶区扩增
定量实验的精确度随着重复反应次数的增加而提高，设置适合实验的复孔数（通常应包含至少 3 个重
复）
。为了精确的检测，设置标准稀释梯度在较宽的标准量范围内至少有 5 个稀释点，如果标准量有限，
目标丰度低，或已知目标落在给定范围内，则标准量的宽窄范围可以适当调整。

利用 Archimed X4 和 Archimed X6 荧光定量 PCR 仪完成一个绝对定量（标准曲线）实验共分 7 个步
骤，如下图所示操作流程图：
创建实验设置实验属性设置运行条件设置孔板

• 创建新的绝对定量实验文 • 设置实验基本信息 • 进行绝对定量运行条件的 • 设置标准曲线，并反应孔
件设置进行属性及分布设置
导出实验结果查看及分析结果运行实验

• 将图谱及实验数据导出保 • 查看绝对定量图谱实验结 • 开始绝对定量实验运行
存以进行后续分析果并进行分析
6.1.1 创建实验
6.1.2 设置实验属性
a) 点击页面左侧的实验属性选项，进入实验属性设置界面：
b) 实验名称：系统默认以实验当前的时间而命名，也可以自己命名，不支持中特殊字符，这里以系
统默认名称命名；

c) 仪器型号：选择 Archimed X4 或 Archimed X6 系统为例；
d) 反应管类型：选择透明管或白管；
e) 实验类型：选择绝对定量；
f) 实验试剂：根据实际使用的试剂类型进行选择，这里以选择 TaqMan 试剂为例。

6.1.3 设置运行条件
a) 实验属性设置完成后，点击页面左侧的运行条件或者右下角的下一步，进入运行条件设置界面：
b) 反应体积设置：建议在 5-25µL，实际实验可在 1-30 间选择一个值，反应体系后面显示热盖温度
为 100°C；
c) 反应阶段设置：根据实际使用的试剂说明书设置反应阶段及步骤，如需增加或减少 PCR 反应阶
段，如“保温”、
“PCR 反应”等，可将鼠标移至反应阶段区域，点击“+”或“-”
，左侧及右侧
“+”分别代表在此阶段前或后增加一个阶段，中间“-” 代表去掉此阶段；如需增加或减少 PCR
某阶段中的反应步骤，可将鼠标移至该步骤区域，点击“+”或“-”，左侧及右侧“+”分别代
表在此步骤前或后增加一个步骤，中间“-”代表去掉此步骤；

d) 反应温度设置：时间、温度、升温速度（熔解曲线模式）的设定可以通过在数值
区输入数值或点击进行，其中温度的设置还可通过点击拖拽温度曲线中的进行温度更改，
拖动时温度以 1°C 为单位发生改变；
e) 信号采集的相机图标：在每个反应步骤的时间框下面都有一个信号采集的相机图标，相机图标有
两种状态，当为深蓝色时，代表处于信号采集开启状态，当为浅蓝色时，代表处于信号采
集关闭状态，软件默认在每个循环扩增完成后进行信号采集；
f) 运行条件模板保存：设置好的运行条件，可以点击界面左上角的保存按钮后的下拉菜单，单击另
存为，即会弹出保存对话框。选择保存对话框左侧桌面图标，点击右下角保存按钮，运行条件模
板即保存为实验文件模板（*.qpt）文件，也可以选择其它保存路径，下次做相同运行条件的实验
可以直接调用模板，节省实验设置时间。
6.1.4 设置孔板
运行条件设置完成后，点击页面左侧孔板设置或者右下角的下一步，进入孔板设置界面。
a) 在孔板视图任意区域单击鼠标右键选择定义和设置标准品；

b) 在标准品设置界面（如下图）进行标准曲线实验孔板设置；
c) 根据实际实验设计，从反应模式下拉列表中选择单重反应或多重反应。单重反应指每一个反应孔
中只有一个待测基因，多重反应指每一个反应孔中有两个或者更多的待测基因；
d) 选择检测项目，若已在“孔板设置-高级设置”中对检测项目进行了相应设置，则此下拉列表中
将会显示对应项；
e) 对标准曲线进行定义，可根据具体实验需求及情况，对标准曲线的参数进行设定；
– 标准品浓度稀释梯度: 建议至少 5 个梯度；
– 标准品各稀释浓度复孔数: 建议 3 个/梯度；
– 起始数量：输入标准品的最高或最低数量值，不含单位（单位包含 copies、 copies/µL 或
ng/µL)和系列稀释倍数（如 2×103 需输入 2000）；
– 如果起始数量是最大值，则选择 1:10 至 1:2 的序列系数；
– 如果起始数量是最小值，则选择 2×至 10×的序列系数。

f) 选择并布置标准孔；
– 根据需要选择按行进行标准品的孔位排布；
– 可根据需要让软件自动选择反应孔或操作者自选反应孔，进行标准品的孔位排布；
– 标准品孔位分布设置完成后，软件将根据上述设置排布标准品孔位，并显示相应孔位排布及
孔位数量，如下图：
g) 点击“应用”按钮，软件自动将上述设置应用于孔板视图界面中，并自动将上述孔位定义为标准
品属性（如下图），至此标准品孔板设置操作完成。
h) 在（反应板视图）中根据实际反应管放置的相应孔位选择反应孔；
i) 在“高级设置”选项卡中，对样本及检测项目进行相应属性设置，并勾选分配至对应孔位中，待
测样品孔位将显示相应设置属性（如下图）
。

6.1.5 运行实验
a) 运行条件或孔板设置完成后，点击页面左侧实验运行或右下角的下一步，进入仪器运行界面。
b) 将反应管装入仪器；
c) 点击，系统会弹出数据保存对话框，选择保存路径，点击保存按钮，把文件保
存到所选的路径下，文件格式为.qps，同时仪器左上角会显示当前盖板、反应板温度，等热盖温
度达到 100°C，界面右上角会显示当前实验剩余时间。
6.1.6 查看及分析结果
运行完成后，Archimed 桌面软件将使用默认分析设置自动分析数据，结果分析界面中显示扩增图谱。
注意：遗漏孔或更改分析设置后，需再次单击以获取新的实验结果。
a) 查看扩增曲线；
一个典型的扩增曲线有四个不同的部分:①基线②指数期③线性期④平台期。
b) 单击分析，选择标准曲线；

c) 查看标准曲线；
d) 标准曲线 X 轴下方会显示，实验的检测基因、斜率、Y 轴截距、R2、扩增效率%，错误信息，其
中斜率在-3.2~-3.5，R>0.99 或 R2>0.98，扩增效率在 90%~105%,扩增结果就认为是可靠的；
e) 单击，软件将以反应板形式展示实验结果，在反应板中，将鼠标移动到某一孔位，即可显示此
孔的检测项目、任务、荧光染料和样本名称信息；
f) 单击，软件将以列表形式展示实验结果，列表中会显示实验基本信息，反应孔、样本名称、项
目名称、检测类型、荧光染料、CT、CT 平均值、CT SD、数量等实验信息，点击查看，可勾选
或去除需要在列表中显示的项目类型。

6.1.7 导出实验结果
查看结果步骤完成后，点击页面左侧数据导出或右下角的下一步，进入数据导出界面。
a) 文件名称：系统默认以实验当前的时间而命名，也可以自己命名，不支持特殊字符；
分析需求，勾选导出内容；
同的 Excel 中，且每个 Excel 会以导出内容命名；
d) 文件类型：文件导出格式包含.txt 和.xls，通常选择.xls 将数据结果导出至 excel 表中；

e) 存储路径：系统默认的是桌面，可以单击，选其它路径保存；
f) 单击导出：结果会显示在一个打开的 Excel 中，表格中包含孔板设置、扩增数据、多组分数据、
结果等 sheet；
g) 用于数据分析的 Ct 值、数量（浓度）
、标准曲线相关参数等信息会在结果表格中展示。

6.2 熔解曲线实验
利用 Archimed 荧光定量 PCR 仪完成一个核酸熔解曲线实验共分 7 个步骤，如下图所示操作流程图：

• 创建新的熔解曲线实验文 • 设置实验基本信息 • 进行溶解曲线运行条件的 • 对反应孔进行属性及分布
件并设置实验属性设置设置

• 将图谱及实验数据导出保 • 查看熔解曲线图谱及Tm • 开始熔解曲线实验运行
存以进行后续分析值等实验结果并进行分析
6.2.1 创建实验

b) 实验名称：系统默认以实验当前的时间而命名，也可以自己命名，但目前不支持中文和特殊字符，
这里以系统默认名称命名；
c) 仪器型号：根据实际使用机型进行选择，这里以选择 Archimed-X6 系统为例；
d) 反应管类型：根据实际使用的反应管类型进行选择，这里以选择白管为例；
e) 实验类型：选择熔解曲线；

f) 熔曲模式：选择核酸熔曲；
g) 实验试剂：选择 SYBR Green（注：熔解曲线实验仅适用于染料法实验，故此处只有“SYBR Green
试剂”选项）。
a) 实验属性设置完成后，点击页面左侧的运行条件或右下角的下一步，进入运行条件设置界面。
b) 反应体积设置：建议在 5-25µL，实际实验可在 1-30 间选择一个值，反应体系后面显示热盖温度
为 100°C；

c) 反应阶段设置：根据实际使用的试剂说明书设置反应阶段及步骤，我们这里设置一个阶段，里面
有三个步骤；
d) 如需增加或减少熔解曲线实验反应阶段，可将鼠标移至反应阶段区域，点击“+”或“-”，左侧
及右侧“+”分别代表在此阶段前或后增加一个阶段，中间“-” 代表去掉此阶段；如需增加或
减少反应阶段中的反应步骤，可将鼠标移至该步骤区域，点击“+”或“-”，左侧及右侧“+”
分别代表在此步骤前或后增加一个步骤，中间“-”代表去掉此步骤；
e) 反应温度设置：时间、温度、升温速度（熔解曲线模式）的设定可以通过在数值
区输入数值或点击进行，其中温度的设置还可通过点击拖拽温度曲线中的进行温度更改，
拖动时温度以 1°C 为单位发生改变；
f) 信号采集的相机图标：在每个反应步骤的时间框下面都有一个信号采集的相机图标，相机图标有
g) 熔曲类型：根据是否包含扩增，可以分为单独熔曲或扩增+熔曲。对已经得到 QPCR 产物，以此
PCR 产物进行熔曲实验只做单独熔曲，可直接参照上面步骤设置反应，对于扩增+熔曲的实验，
需要在运行条件设置界面右上角的包含处，勾选扩增，之后会在熔解曲线阶段前，增加两个阶段，
保温和 PCR 反应，根据实际所用的试剂说明书按上面方法设置时间、温度，反应循环数，可以
手动输入设置，也可以通过后面的上下箭头对循环数进行增减，以及信号采集状态设置，设置完
整的扩增+熔曲实验，如下图所示；

h) 运行条件模板保存：设置好的运行条件，可以点击界面左上角的保存按钮后的下拉菜单，单击另
6.2.4 设置孔板
a) 运行条件设置完成后，点击页面左侧孔板设置或右下角的下一步，进入孔板设置界面。
b) 在（反应板视图）中根据实际反应管放置的相应孔位选择反应孔；
c) 点击高级设置，可以设置样本和检测项目。
d) 这里我们以检测样本 A 和样本 B 的β-actin 基因，每个样品做 3 次重复为例来说明，设置方法如
下：
e) 点击“ ”，样本栏下有两个样本，鼠标左键单击样本 1 和样本 2 分别命名为样本 A 和

样本 B；
f) 单击检测项目，命名为β-actin，报告基团选择 SYBR Green，淬灭基团选择 None，任务选择；
g) 定义反应孔的样本和检测项目，在左侧反应板，鼠标左键拖动选择 A1-A3，右侧勾选样本 A 和β
-actin，再用鼠标拖动选择 B1-B3，右侧勾选样本 B 和β-actin，设置好的反应板如下：

6.2.5 运行实验
a) 单击下一步或者左侧的运行，进入运行界面，由于此时电脑未连接仪器，界面左上角会显示未连
接。
b) 若电脑连接仪器，点击 ” ” ，系统会弹出对话框，点击桌面图标，也可以
设置其它保存路径，点击保存按钮，把文件保存到所选的路径下，文件格式为.qps，同时仪器左
上角会显示当前盖板、反应板温度，界面右上角会显示当前实验剩余时间。
a) 单击熔解曲线，软件将在图谱界面中显示熔解曲线图谱；
b) 查看熔解曲线；

c) 熔解曲线通常用于鉴定 PCR 反应是否特异，产物是否单一，如果出现双峰或者多峰，可以认为
PCR 产物为非单一产物。
d) 单击，软件将以反应板形式展示实验结果，在反应板中，将鼠标移动到某一孔位，即可显示此

e) 单击，软件将以列表形式展示实验结果，列表中会显示实验基本信息，反应孔、样本名称、项
目名称、检测类型、荧光染料、CT、CT 平均值、CT SD、数量、Tm 等实验信息，点击查看，可
勾选或去除需要在列表中显示的项目类型。
查看结果步骤完成后，点击页面左侧数据导出或右下角的下一步，进入数据导出界面。
a) 文件名称：系统默认以实验当前的时间而命名，也可以自己命名，支持中文，但不支持特殊字符；
分析需求，勾选导出内容，如果是染料法定量还会在内容中显示熔解曲线阶段，上图就是染料法；
d) 文件类型：文件导出格式包含.txt 和.xls，通常选择.xls 将数据结果导出至 excel 表中；

e) 存储路径：系统默认的是桌面，可以单击，选其它路径保存；
f) 单击导出：结果会显示在一个打开的 Excel 中，表格中包含孔板设置、扩增数据、多组分数据、
结果等 sheet；
g) 用于数据分析的 Tm 信息会在结果表格中展示。

6.3 相对定量（△△CT）实验
相对定量适用于大多数基因表达研究，可分析校准（正常）样本和一个或多个实验样本中目的基因表达
水平的上调或下调。采用该技术无需精确测定拷贝数，而是关注与校准样本相比的倍数变化。ΔΔCt 法
是一种非常普遍的相对定量分析方法，该方法能够用于比较包括校准品 (如未处理或野生型样本) 和标
准品 (如看家基因表达) 在内的实验样本的结果。采用该方法，可根据检测样本和校准样本中的标准品
(正常) 基因的 Ct 比较同样两个样本中的目的基因的 Ct，

其得出的 ΔΔCt 值可用于测定表达的倍数差异。
相对定量实验常用来:
✓ 比较基因在不同组织中的表达水平。
✓ 比较处理过的样品和未处理过的样品中基因的表达水平样本。
✓ 比较不同遗传背景下感兴趣基因的表达水平。
✓ 分析特定处理下基因表达随时间的变化条件。
利用 Archimed X4 和 Archimed X6 荧光定量 PCR 仪完成一个相对定量实验共分 7 个步骤，如下图所
示操作流程图：

• 创建新的相对定量实验文 • 设置实验基本信息 • 进行相对定量运行条件的 • 对反应孔进行属性及分布
件设置设置

• 将图谱及实验数据导出保 • 查看相对定量图谱实验结 • 开始相对定量实验运行
存以进行后续分析果并进行分析
6.3.1 创建实验

b) 实验名称：系统默认以实验当前的时间而命名，也可以自己命名，不支持特殊字符，这里以系统
默认名称命名；
c) 仪器型号：选择 Archimed X4 和 Archimed X6 系统；
d) 反应管类型：以选择白管为例；

e) 实验类型：选择相对定量；
f) 实验试剂：根据实际使用的试剂类型进行选择，这里以选择 TaqMan 试剂为例；
a) 实验属性设置完成后，点击页面左侧的运行条件或者右下角的下一步，进入运行条件设置界面；
b) 反应体积设置：建议在 5-25µL，实际实验可在 1-30 间选择一个值；

c) 反应阶段设置：根据实际使用的试剂说明书设置反应阶段及步骤，如需增加或减少 PCR 反应阶
，左侧及右侧
d) 反应温度设置：时间、温度的设定可以通过在数值区输入数值或点击进行，其中
温度的设置还可通过点击拖拽温度曲线中的进行温度更改，拖动时温度以 1°C 为单位发生改
变；
e) 注意：时间设置最小值不能小于 00:01 秒，进行实际更改时请避免
g) 运行条件模板保存：设置好的运行条件，可以点击界面左上角的保存按钮后的下拉菜单，单击另
6.3.4 设置孔板

a) 在（反应板视图）中根据实际反应管放置的相应孔位选择反应孔；
b) 在“高级设置”选项卡中，对样本及检测项目进行相应属性设置，并勾选分配至对应孔位中，待
测样品孔位将显示相应设置属性（如下图）；
c) 在“快速设置”选项卡中，对参照样本及管家基因进行定义。
6.3.5 运行实验
a) 运行条件或孔板设置完成后，点击页面左侧实验运行或右下角的下一步，进入仪器运行界面。
b) 将反应管装入仪器；
c) 点击，系统会弹出数据保存对话框，选择保存路径，点击保存按钮，把文件保

一个典型的扩增曲线有四个不同的部分:①基线②指数期③线性期④平台期
b) 单击分析，选择基因表达；
c) 查看基因表达分析结果；

d) 对照为参考（校准品）样品和测试样品中的内源性质控基因（内源性控制是一个在所有样本中平
等表达的基因）
，软件将对照样品的表达级别设置为 1，可直接计算出其他样品的相对比例。
e) 单击，软件将以反应板形式展示实验结果，在反应板中，将鼠标移动到某一孔位，即可显示此
目名称、检测类型、荧光染料、CT、CT 平均值、CT SD、△Ct、△△Ct 等实验信息，点击查看，
可勾选或去除需要在列表中显示的项目类型；

a) 查看结果步骤完成后，点击页面左侧数据导出或右下角的下一步，进入数据导出界面。
b) 文件名称：系统默认以实验当前的时间而命名，也可以自己命名，不支持特殊字符；
c) 内容：包括孔板设置、扩增数据、多组分数据、结果、试剂信息。可以根据数据分析需求，勾选
导出内容；
d) 选项：系统默认以上信息合并为一个文件，按此选项导出的各项内容会显示在一个 Excel 表的不
e) 文件类型：文件导出格式包含.txt 和.xls，通常选择.xls 将数据结果导出至 excel 表中
f) 存储路径：系统默认的是桌面，可以单击，选其它路径保存；

g) 单击导出：结果会显示在一个打开的 Excel 中，表格中包含孔板设置、扩增数据、多组分数据、
结果等 sheet；
h) 用于数据分析的 Ct 值、数量（浓度）相关参数等信息会在结果表格中展示。

6.4 基因分型（Genotyping）实验
在基因变异研究中，为了获得大量特征的标记物，必须对大量个体进行基因分型。不同层次的个体基因
组上存在差异的原因包括：单核苷酸多态性（SNP）和 DNA 共价修饰。其中，造成个体差异的基因序
列变异 90%以上属于单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism, SNP）

，SNP 主要是指由基
因组核苷酸水平上的变异引起的 DNA 序列多态性，其中最少一种等位基因在群体中的频率不小于 1%，
包括单碱基的转换、颠换以及单碱基的插入和缺失等；此外还包括 DNA 的共价键修饰方式的改变，例
如 DNA 甲基化。
实时荧光定量 PCR 能提供不同的方法，进行基因分型分析。对于已知突变的检测，最常用的基本方法
是利用酶裂解水解探针进行的终点法基因分型，更高级的方法是利用杂交探针进行的熔解曲线法基因分
型；对于未知或新突变的检测，通常利用饱和 DNA 结合染料通过高分辨率熔解曲线的方法进行基因分
型。本章我们将介绍利用 TaqMan 探针终点法进行已知突变位点等位基因分析的方法。该方法可以很
容易的改进和应用到其他各种 SNP 的检测。
基因分型常见应用:
✓ 遗传疾病基因鉴定；
✓ 肿瘤易感基因和热点突变的鉴定；
✓ 病原体基因突变和耐药的鉴定；
✓ 动植物取证、育种研究。
利用 Archimed X4 和 Archimed X6 完成一个基因分型实验共分 7 个步骤，如下图所示操作流程图：

• 创建新的基因分型实验 • 设置实验基本信息 • 进行运行条件的设置 • 对反应孔进行属性及分
文件布设置

• 将图谱及实验数据导出 • 查看实验结果并进行分 • 开始实验运行
保存以进行后续分析析
6.4.1 创建实验

b) 实验名称：系统默认以实验当前的时间而命名，也可以自己命名，不支持特殊字符，这里以系统
默认名称命名；
c) 仪器型号：选择 Archimed X4 和 Archimed X6 系统；
d) 反应管类型：以选择白管为例；

e) 实验类型：选择基因分型；
f) 实验试剂：选择 TaqMan 试剂。
a) 实验属性设置完成后，点击页面左侧的运行条件或者右下角的下一步，进入运行条件设置界面：
b) 反应体积设置：建议在 5-25µL，实际实验可在 1-30 间选择一个值；
c) 勾选 PCR 前读取，记录每个孔的背景荧光，在 PCR 读取过程中，前读取荧光从读取后的荧光中
减去确保结果准确。如果没有预读数据，则不执行扣除背景；

d) 反应阶段设置：根据实际使用的试剂说明书设置反应阶段及步骤，如需增加或减少 PCR 反应阶
，左侧及右侧
e) 反应温度设置：时间、温度的设定可以通过在数值区输入数值或点击进行，其中
温度的设置还可通过点击拖拽温度曲线中的进行温度更改，拖动时温度以 1°C 为单位发生改
变；
g) 运行条件模板保存：设置好的运行条件，可以点击界面左上角的保存按钮后的下拉菜单，单击另
6.4.4 设置孔板

a) 在（反应板视图）中根据实际反应管放置的相应孔位选择反应孔；
b) 在“高级设置”选项卡中，对样本及 SNPs 进行相应属性设置，并勾选分配至对应孔位中，待测
样品孔位将显示相应设置属性（如下图）
。设置纯合等位基因样本和 NTA。
6.4.5 实验运行
运行条件或孔板设置完成后，点击页面左侧实验运行或右下角的下一步，进入仪器运行界面。
a) 将反应板装入仪器；
b) 点击，系统会弹出数据保存对话框，选择保存路径，点击保存按钮，把文件保
运行完成后，Archimed Ananlyzer 软件将使用默认分析设置自动分析数据，结果分析界面中显示扩增
图谱。
一个典型的扩增曲线有四个不同的部分:①基线②指数期③线性期④平台期。

b) 单击分析，选择等位基因鉴别图；
c) 查看等位基因鉴别图；
d) 等位基因鉴别图左下方会显示，代表纯合等位基因、杂合基因等位基因、NTA 以及未确定样本的
颜色；
e) 单击，能显示样本在反应板中孔位设置；

目名称、检测类型、荧光染料、识别、等位基因等实验信息，点击查看，可勾选或去除需要在列
表中显示的项目类型。
a) 查看结果步骤完成后，点击页面左侧数据导出或右下角的下一步，进入数据导出界面。
b) 文件名称：系统默认以实验当前的时间而命名，也可以自己命名，不支持特殊字符；

c) 内容：包括孔板设置、扩增数据、多组分数据、结果、试剂信息。可以根据数据分析需求，勾选
导出内容；
d) 选项：系统默认以上信息合并为一个文件，按此选项导出的各项内容会显示在一个 Excel 表的不
e) 文件类型：文件导出格式包含.txt 和.xls，通常选择.xls 将数据结果导出至 Excel 表中；
f) 存储路径：系统默认的是桌面，可以单击，选其它路径保存；
g) 单击导出：结果会显示在一个打开的 Excel 中，表格中包含孔板设置、扩增数据、多组分数据、
结果等 sheet；
h) 用于数据分析的等位基因相关参数等信息会在结果表格中展示。

第7章仪器保养与维护
本仪器在常规使用的情况下，不需要大量的维护。如果长时间使用本仪器，则需要定期（如每隔一月）
对仪器进行清洁和少量维护，以确保仪器的正常运转。清洁仪器前，请仔细阅读本章节，正确的对仪器
进行维护及清洁保养，有助于延长仪器的使用寿命。
7.1 仪器清洁
禁止：切勿在通电时或仪器运行过程中对仪器进行清洁或维护。
禁止：切勿将水或其他溶液倒入样本仓、样本模块或任仪器部件内部。仪器通电时，液体流入可能会导致电击！
注意：乙醇为易燃易挥发性液体。暴露接触会刺激眼睛、皮肤和呼吸道，并可能导致中枢神经系统机能减退和肝脏损伤。
使用乙醇清洁时，请穿戴合适的保护眼罩、衣服和手套。
表面高温：仪器运行过程中，样本模块可能存在高温。在对仪器进行清洁或维护之前，应等待样本模块温度降至室温，
以免发生烫伤。
生物危害：请视所有样本为潜在性生物危害的样本进行处理及操作，如果液体样本溢出或飞溅，请立即取用适当的消毒
剂进行消毒，以避免污染物散播污染仪器或对实验室人员造成伤害。
生物危害：切勿在未采取任何安全防护措施的情况下，对任何有潜在性生物危害的样本进行处理及操作。
7.1.1 清洁仪器外壳
a) 关闭仪器，并拔掉电源线。
b) 请使用潮湿的软布清洁仪器外壳，必要时请使用温和的清洁剂清洁仪器。
注意：请勿将清洁剂直接喷在在仪器上，这可能会引起电子仪器的故障。
注意：请避免使用强酸碱、75%以上的浓酒精、有机溶剂或烈性去污剂对仪器进行清洁，会破坏仪器表面涂层。
7.1.2 清洁样品仓和反应孔
a) 请关闭仪器，打开样品仓。
b) 请使用潮湿的软布清洁样品仓，必要时请使用温和清洁剂清洁样品仓。
c) 请定期清理反应孔，以确保耗材试管与反应孔接触充分、导热良好。
d) 清洁时请使用蘸取温和清洁剂的棉签清洁反应孔。
注意：请待样品仓和反应孔完全干燥后再关闭热盖。加热表面存留有清洁剂的反应模块将有可能损坏仪器。

注意：不要将清洁剂直接喷在仪器上，这可能会引起电子仪器的故障。
7.2 仪器维护
7.2.1 保持空气流通
本仪器需要空气流通的情况下使用，以确保目标温度的准确性。因此请定期检查本仪器的放置区域以确
保空气流通，并且无其他物品干扰仪器周围的空气流动。
7.2.2 保持供电稳定
本仪器的正常运行需要稳定的电力供应，因此请定期检查本仪器的电源，以确保电源电压与仪器所要求
的电压一致（允许±10%的偏差）
。并确保电源插座的额定负载不小于仪器的要求。
7.2.3 保持仪器清洁
样品仓、反应模块、光学元件的污染可能会干扰热循环和数据收集。请参照以下指示尽量避免本仪器的
污染：
– 将反应耗材放入反应孔前，请确保耗材外壁清洁、无污垢。
– 请定期清洁反应模块和内盖，以防止污垢，生物性危害物或荧光性溶剂的积聚。
– 运行反应前请确认密封。
注意：切勿将开盖或盖子破损的反应耗材放入反应孔中，试剂可能会漏出并覆盖在热盖、样品仓和反应孔的表面。
注意：切勿运行含有挥发性试剂的 PCR 反应，可能会导致在热盖、样品仓和反应孔的污染。
注意：长时间不使用本仪器时，请拔掉仪器电源插头并用软布或防尘袋覆盖仪器，以防止灰尘进入。
7.2.4 废物处理
每次实验结束后，试管内有大量扩增产物，应按相关规定尽快处理，以免污染实验室及仪器。注意：将
试管从反应模块中取出后不要打开试管，否则其中高浓度核酸将污染实验室。
7.2.5 更换保险丝
当电路发生故障或异常时，伴随着电流不断升高，并且升高的电流有可能损坏电路中的某些重要器件或
贵重器件，也有可能烧毁电路甚至造成火灾。若电路中正确地安置了保险丝，那么，保险丝就会在电流
异常升高到一定的高度和热度的时候，自身熔断切断电流，从而起到保护电路安全运行的作用。

Archimed X4 和 Archimed X6 装有 1 个 5A 保险丝，用以保护仪器。当保险丝发生损坏后，用户可按
如下方法更换保险丝：切断主机电源，并拔掉电源线；用一字螺丝刀逆时针拧开保险丝盒盖子，查看内
部的保险丝管，如果中间断开（两个或者其中一个）
，说明已坏，需要更换新的保险丝管（保险丝型号
为 Φ5×20mm – 5A、250V）
；将换好的保险丝管座装入插座下方，更换完成。
注意：更换保险丝前必须关闭电源并拔掉电源线。
7.2.6 过热保护
仪器的加热系统设有过热保护装置，当加热系统发生故障，温度值超过允许范围的上限时，保护装置会
自动断开，并不可恢复；此时，加热系统无法继续正常升降温。加热系统发生上述故障后，用户应停止
使用仪器，及时联系生产商进行维修。

第8章常见故障处理
a) 故障现象：打开电源但是仪器没有反应，电源指示灯不亮。
故障原因分析：仪器电源线未插紧。
故障处理办法：请把仪器后部电源拨到关闭一端，将电源线重新插入插座后再开机。
电源线未插紧电源线插紧
b) 故障现象：点击“开始运行”后，软件弹出对话框“没有可用的仪器”
。
故障原因分析：仪器数据线未插紧。
故障处理办法：请把仪器后部的数据线重新插入插座后再重启软件。
数据线未插紧数据线插紧

c) 故障现象：PCR 扩增阶段可听到仪器内部有扫描电机转动声，但软件“原始数据图谱”界面没有荧
光信号。
故障原因分析：
“孔板设置”界面上“样本”和“检测项目”两栏未填写完全，二者都填入后才有荧
光信号显示。Archimed™在用户未填写“样本”或“检测项目”时，将采集 96 孔所有通道的荧光信
号并保存在实验文件内部，只是不显示在实验界面上，待用户把“孔板设置”信息完善后可以显示。
故障处理办法：返回至“孔板设置”界面，将“样本”和“检测项目”两栏的信息填写完全。
d) 故障现象：软件弹出对话框“内存不足，请关闭一些实验”。
故障原因分析：发生此现象，是由于用户打开的实验文件过多，软件运行内存不足。
故障处理办法：用户按照弹窗提示，关闭一些暂时不用的实验文件后，此现象即可消失。建议用户
同时打开实验文件数目不超过 6 个。

e) 故障现象：模块降温速度明显变慢。
故障原因分析：仪器通风口被堵塞。
故障处理办法：清除通风孔（包括进风口和出风口）处的堵塞物。
f) 故障现象：未放入耗材的情况下执行扫描操作（空扫描）
，个别孔位的本底信号值很大。
故障原因分析：对应的反应孔位有污染。
故障处理办法：清除污染，操作方法请参照（系统保养一章）5.3 月保养。

g) 故障现象：试剂蒸发，严重者实验结束后查看反应管中已无试剂残留。
故障原因分析：反应管密封不严，反应管盖或覆膜不合适、不正确。
故障处理办法：选用密封性能好的适用耗材。
注意：若用户不能自行判断和排除以上故障，可直接与我公司联系。
注意：如果出现下列情况，应立即切断电源，并与供应商或我公司联系，我公司将指派合格的维修人员进行处理：
有液体流进仪器内部；
仪器经雨淋或水浇；
仪器有任何不正常的声音或气味出现；
仪器跌落导致外壳受损；
仪器功能发生明显变化；

鲲鹏（徐州）科学仪器有限公司
生产许可证编号：
医疗器械注册证书/产品技术要求编号：
注册人：鲲鹏（徐州）科学仪器有限公司
住所：徐州高新技术产业开发区第三工业园珠江东路 10 号一期 6 栋厂房二层
生产企业名称：鲲鹏（徐州）科学仪器有限公司
生产地址：徐州高新技术产业开发区第三工业园珠江东路 10 号一期 6 栋厂房二层
联系方式：0516-83537686
邮编：221100
网址：www.rocgene.com
售后服务单位：鲲鹏（徐州）科学仪器有限公司
服务热线：400-860-5168 转 4483
编制日期：2020 年 7 月

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Quantitative PCR Detection System Archimed X4 & Archimed X6

Archimed X4 和 Archimed X6 用户手册 V1.0 1

产品规格：产品尺寸：长 250 mm，宽 520 mm，高 370 mm

地址：徐州高新技术产业开发区第三工业园珠江东路 10 号一期 6 栋厂房二层

Archimed X4 和 Archimed X6 用户手册 V1.0 2

Archimed X4 和 Archimed X6 用户手册 V1.0 3

1.1 安全符号及标记 .......................................................................................................................... 9

1.2 通用仪器安全及注意事项 ........................................................................................................ 10

1.3 人身安全及注意事项 ................................................................................................................ 11

1.4 电气安全及注意事项 ................................................................................................................ 11

1.5 环境安全及注意事项 ................................................................................................................ 12

1.6 生物安全及注意事项 ................................................................................................................ 12

2.1 适用范围 .................................................................................................................................... 14

2.1.1 预期用途 ............................................................................................................................ 14

2.1.2 产品预期使用环境 ............................................................................................................ 14

2.2 应用领域 .................................................................................................................................... 14

2.3 基本原理 .................................................................................................................................... 15

2.4 主要功能 .................................................................................................................................... 15

2.5 产品组成 .................................................................................................................................... 15

2.6 产品结构 .................................................................................................................................... 16

2.7 仪器参数及特性 ........................................................................................................................ 18

2.7.1 仪器常规参数 .................................................................................................................... 18

2.7.2 仪器技术参数 .................................................................................................................... 18

2.7.3 软件特性 ............................................................................................................................ 19

Archimed X4 和 Archimed X6 用户手册 V1.0 4

2.7.4 试剂特性 ............................................................................................................................ 20

2.7.5 耗材规格 ............................................................................................................................ 20

3.1 运输和贮存 ................................................................................................................................ 21

3.3 装箱清单 .................................................................................................................................... 21

3.4 安装要求 .................................................................................................................................... 22

3.4.1 仪器工作环境要求 ............................................................................................................ 22

3.4.2 电脑配置要求 .................................................................................................................... 22

3.5 仪器安装 .................................................................................................................................... 23

3.5.1 设备外观 ............................................................................................................................ 23

3.5.2 解除仪器运输锁 ................................................................................................................ 24

3.5.3 仪器安装 ............................................................................................................................ 25

3.6 仪器软件安装 ............................................................................................................................ 26

3.6.1 USB-串口驱动安装 .......................................................................................................... 26

3.6.2 Archimed Analyzer 软件安装 ...................................................................................... 27

3.7 开机前预准备 ............................................................................................................................ 29

3.7.1 仪器自检 ............................................................................................................................ 29

3.7.2 实验准备 ............................................................................................................................ 29

3.7.3 仪器启动 ............................................................................................................................ 30

3.7.4 软件启动 ............................................................................................................................ 31

3.8 系统质量控制 ............................................................................................................................ 32

Archimed X4 和 Archimed X6 用户手册 V1.0 5

4.1 软件启动 .................................................................................................................................... 33

4.2 创建实验 .................................................................................................................................... 33

4.3 实验属性 .................................................................................................................................... 34

4.4 运行条件 .................................................................................................................................... 36

4.5 孔板设置 .................................................................................................................................... 38

4.6 运行实验 .................................................................................................................................... 41

4.7 保存实验 .................................................................................................................................... 42

5.1 实验分析主界面 ........................................................................................................................ 44

5.2 实验分析一般流程 .................................................................................................................... 45

5.3 查看结果 .................................................................................................................................... 45

5.4 数据导出 .................................................................................................................................... 57

5.5 实验报告 .................................................................................................................................... 59

6.1 绝对定量（标准曲线）实验 .................................................................................................... 61

6.1.1 创建实验 ............................................................................................................................ 62

6.1.2 设置实验属性 .................................................................................................................... 62

6.1.3 设置运行条件 .................................................................................................................... 64

6.1.4 设置孔板 ............................................................................................................................ 65

6.1.5 运行实验 ............................................................................................................................ 68

Operator's Manual

Operator's Manual

第 8 章常见故障处理 .................................................................................................................................... 102

IVD 仪器本仪器为 IVD 仪器。

IVD 仪器本仪器为 IVD 仪器。

电子控制系统电源模块温控系统外壳部件检测系统软件

热盖热循环模块光路模块光学扫描模块

电源规格电源频率：50 Hz；

运行噪音仪器运行时最大噪声不超过 70 分贝。