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Tema 3 - Enzimas
Tema 3 - Enzimas
Índice
En base a estas observaciones, Michaelis y Menten desarrollaron una ecuación, que se estableció
para el estado estacionario. Para desarrollar su modelo, hicieron varias suposiciones:
En una reacción enzimática una enzima se combina con el sustrato para formar un complejo
enzima–sustrato que disminuye la energía de activación y que supondrá la descomposición del
sustrato para generar el producto de la reacción y quedar el enzima libre. Cada una de estas
reacciones está determinada por una constante.
Como la velocidad de una reacción enzimática se mide como velocidad inicial, la cantidad de
producto es prácticamente despreciable en ese instante. Por tanto, se supuso que no se puede
formar complejo enzima-sustrato a expensas del producto (k-2 es despreciable).
La deducción de la ecuación se hizo para el estado estacionario, es decir, para una concentración del
complejo enzima-sustrato constate, por lo que la velocidad de formación del complejo sería igual a
su velocidad de descomposición. Esto implica:
Con todas estas suposiciones, se realizó la ecuación de Michaelis–Menten, que indica lo siguiente:
Cuanto menor sea el valor de Km, mayor afinidad de la enzima por el sustrato, y, por tanto, a mayor
valor de Km, menor será la afinidad. Esto también se puede ver gráficamente, ya que las pendientes
determinarán la posición de la Km: cuanto mayor sea la pendiente, mayor afinidad y menor la Km.
[S] <<<<<< Km
La enzima se ha saturado y por más sustrato que se añada, la enzima no puede unirse a él (cinética de orden cero,
independiente de la cantidad de sustrato).
[S] = Km
En el otro caso, tenemos una recta que nos permite calcular con mayor facilidad las intersecciones
con los ejes y con ello la Vmáx y la Km, disminuyendo así el error.
Cada enzima tiene un valor de Km característico para cada sustrato, desde valores muy altos (poca
afinidad) a muy bajos (mucha afinidad), que indican la cantidad de sustrato que se necesita para
llegar a la mitad de la Vmáx.
Además, cada enzima va a presentar un valor de Vmáx característico, que depende de varios
factores. Uno de ellos es la concentración de enzima y otro es la constante catalítica, llamada
también número de recambio o actividad molecular, que es el número de moléculas que cataliza una
enzima o centro activo por unidad de tiempo, cuando el enzima está saturado por el sustrato. Sus
.
unidades son s –1
En ella la enzima se puede unir con un inhibidor de manera reversible (de manera no covalente).
*ap=aparente.
EJEMPLO DE INHIBICIÓN COMPETITIVA
En este caso no importa cuánto sustrato en exceso haya porque siempre va a haber una parte del
enzima atrapado en la formación enzima-sustrato-inhibidor que no es productivo y por eso no se
alcanzará la Vmáx.
Sin embargo, la Km disminuye cuando se añade el inhibidor y se forma el complejo
enzima-sustrato-inhibidor, ya que la afinidad del enzima por el sustrato aumenta.
Si hacemos x=0, como la Vmáx disminuye la ordenada en el origen aumentará y la recta cortará el
eje Y más arriba. Sin embargo, si hacemos y=0, entonces el valor de km será más negativo y cortará
el eje x más a la izquierda.
No competitiva. En ella, el inhibidor tampoco es análogo del sustrato y no se une al centro activo de
la enzima, pero puede unirse a la enzima libre para dar un complejo enzima–inhibidor o puede
unirse al complejo enzima–sustrato para dar un complejo enzima–sustrato–inhibidor.
Si las dos constantes de disociación son iguales, se habla de una inhibición no competitiva pura, si
son diferentes hablamos de una mixta.
En el caso de
la pura, la
Vmáx va
a disminuir, ya que da igual
cuanto sustrato haya, siempre
que se forme el complejo enzima-sustrato va a haber parte del enzima que va a estar secuestrada
formando el complejo enzima-sustrato-inhibidor. Sin embargo, la Km se mantiene constante porque
el inhibidor tiene la misma tendencia a unirse al complejo enzima-sustrato que el sustrato al
complejo enzima-inhibidor (las cte de afinidad son iguales). Por otro lado, en la inhibición mixta la
Km puede aumentar o disminuir.
TABLA RESUMEN
6.2-. Inhibición irreversible
Los inhibidores irreversibles, una vez que se unen al enzima, no pueden separarse, ya que se
produce una unión covalente, quedando el enzima inactivo de manera indefinida. Esto ocurre
debido a una serie de modificaciones químicas de los grupos catalíticos.
Para distinguirlo de los reversibles, se somete el complejo a diálisis y se comprueba si se separa o no.
Un ejemplo interesante es el del cianuro que se une y fija al grupo Hemo impidiendo que la
hemoglobina capte el oxígeno.
Homotrópicos: En este caso, el sitio de unión del modulador y el sitio activo son el mismo y la
molécula que actúa como modulador puede ser el propio sustrato o una molécula idéntica a él.
Debemos saber que las uniones de las moléculas de sustrato a cada subunidad no son
independientes, ya que cuando se produce la unión a la primera subunidad, aumenta la afinidad de
las otras subunidades por los sustratos, además de la velocidad de unión (cooperatividad positiva). El
sustrato se comporta como un efector alostérico homotrópico positivo, lo que explica que su
cinética sea sigmoidea.
Heterotrópicos: En este caso, el sitio de unión del modulador y el sitio activo son diferentes y la
molécula que actúa como modulador es diferente al sustrato. El enzima se va a encontrar en un
equilibrio entre dos conformaciones, la tensa y la relajada, de manera que si se une un regulador
alostérico negativo, que estabiliza a la conformación tensa, se producirá una disminución de la
afinidad por el sustrato. Sin embargo, si se une un regulador alostérico positivo, que estabiliza a la
conformación relajada aumentará la afinidad por el sustrato. Retroalimentación
TABLA RESUMEN
Las fosforilaciones y desfosforilaciones son el tipo de regulación covalente más frecuente. Uno de los
ejemplos mejor conocidos de fosforilación-desfosforilación corresponde al de la enzima glucógeno
fosforilasa, involucrada en la degradación del glucógeno para la formación de glucosa-6-fosfato y al
de la enzima glucógeno-sintetasa, que actúa en la síntesis de glucógeno.
El glucagón nos indica que la glucosa en sangre es baja y ante eso, el hígado va a reaccionar
haciendo que se active la fosforilasa quinasa, que fosforilará a la glucógeno-fosforilasa y se
convertirá en fosforilasa a. Como hay poca glucosa se favorecerá su conformación relajada (activa)
para generar glucosa a partir de glucógeno. Sin embargo, cuando ya tenemos suficiente glucosa, se
favorecerá su conformación tensa (inactiva).
Por otro lado, cuando tenemos un exceso de glucosa en sangre, la proteína fosfatasa 1 (PP1)
producirá la desfosforilación de la glucógeno-fosforilasa y esta se convertirá en fosforilasa b, que
es menos activa. Como hay mucha glucosa se favorecerá su conformación tensa (inactiva). Sin
embargo, cuando el nivel de glucosa esté más equilibrado se favorecerá su conformación relajada
(activa).
A nivel muscular, lo que ocurre es muy parecido. La proteína fosfatasa 1 es la que produce la
desfosforilación de la glucógeno-fosforilasa y la fosforilasa quinasa es la que mediará su
fosforilación (pero se activa por epinefrina o adrenalina).
La adrenalina nos indica que el músculo necesita energía (ATP), que se consigue con la
degradación de glucosa. Ante esto, se va a activar la fosforilasa quinasa, que fosforilará a la
glucógeno-fosforilasa y se convertirá en fosforilasa a. Como hay poco ATP se favorecerá su
conformación relajada (activa) para generar glucosa a partir de glucógeno. Sin embargo, cuando ya
tenemos suficiente glucosa, se favorecerá su conformación tensa (inactiva).
Por otro lado, cuando tenemos un exceso de ATP, la proteína fosfatasa 1 producirá la
desfosforilación de la glucógeno-fosforilasa y esta se convertirá en fosforilasa b, que es menos
activa. Como hay mucho ATP se favorecerá su conformación tensa (inactiva). Sin embargo, cuando
el nivel de ATP esté más equilibrado se favorecerá su conformación relajada (activa).
*TODO LO QUE APARECE EN NEGRITA PODEMOS VERLO CON MÁS PROFUNDIDAD EN EL TEMA DEL
METABOLISMO DE GLÚCIDOS.
9.3-. Regulación por activación proteolítica irreversible
Algunas enzimas no se sintetizan como tales, sino como proteínas precursoras sin actividad
enzimática. Estas proteínas se denominan proenzimas o zimógenos y para activarse, estos sufren un
ataque proteolítico que origina la liberación de uno o varios péptidos. Una vez eliminados, el resto
de la molécula proteica adopta la conformación y las propiedades del enzima activo.
Además, las unidades M de la LDH5 favorecen la conversión de piruvato en lactato, lo que supone
una reacción anaeróbica (obtención de energía sin oxígeno) y por eso se da en el músculo. Sin
embargo, las unidades H de la LDH1 favorecen la conversión de lactato en piruvato, qué es una
reacción aeróbica y por eso se da en el corazón.