Professional Documents
Culture Documents
A Genetikáról (2004, 26 Oldal)
A Genetikáról (2004, 26 Oldal)
1. Mendeli elemzés
Mindezek alapján Mendel első törvénye fogalmazható meg. Eszerint egy gén pár két tagja
elválik egymástól, szegregál az ivarsejtek, gaméták képződése során, így az ivarsejtek fele a
gén pár egyikét, fele a másikát hordozza. Megtermékenyítéskor e párok tagjai újra egyesülnek
és a fenotípust együttesen alakítják ki.
A meiozis két sejtosztódást, meiozis I-et és meoiozis II-őt jelent. A meiocytában már
lejátszódik a még részleges DNS megkettőződése, s bár ebben az esetben is pro- meta- ana- és
telofázisok váltakoznak, a mitózishoz viszonyítva komplikáltabb eseménysor játszódik le
(2.3.a és 2.3.b ábrák). Ezek közül kiemelkedik az összetett és időigényes profázis I, amit még
további egységekre szokás osztani. Ezek a leptotén, zygotén, pachytén, diplotén és a
diakinezis.
A leptotén szakaszban a kromoszómák vékony szálakként válnak láthatóvá, melyek
chromomerákat tartalmaznak, egy gyöngyfűzérhez hasonlóan.
A zygoténben a kromoszóma készlet, komplement homológ tagjai párokat, szinapszisokat
alkotnak. A homológ kromoszómák nukleotid sorrendjének nagyfokú hasonlósága
nyilvánvalóan meghatározó szerepet játszik egy összezáródó zipzár szerkezetéhez hasonló
struktúra létrejöttében. Végső állapotában az ún. synaptonemális komplex keletkezik, amit a
homológ kromoszómák határolnak kétoldalt.
A pachytenben válik teljessé a szinapszisok képződése, melyek jellegzetes alakja alapján az
egyes párok megkülönböztethetőek.
A diplotenben kereszt alakú képződmények, chiasmák jönnek létre a nem-leány kromatidák
között. Minden kromoszóma pár legalább egy chiasmát tartalmaz. Ennek eredményeképp a
nem-leány kromatidák, azaz az apai és anyai kromatidák precíz törése és újraegyesülése
játszódik le, vagy más szóval rekombináció történik. Ennek jelentőségére a későbbiek során
többször kitérünk.
A diakinezisben további kromoszóma kondenzáció játszódik le, mintegy előkészítve és
megkönnyítve a meiotikus osztódáshoz szükséges mozgást, vándorlást.
A metafázis I-ben a sejtmag membrán és a sejtmagvacska lebomlanak, s a homológ párok
egyenlítői síkban helyezkednek el, de centromerjük – mint mitózisban – még nem osztódik.
Anafázis I-ben, a mitózishoz hasonlóan, a kromoszómák mozgása kezdődik meg a sejt
ellenkező pólusai felé.
Telofázis I-ben zárul a folyamat két sejtmag képződésével. A két sejtmag genetikailag nem
egyenértékű, mivel vagy az apai, vagy az anyai leány kromatidákat tartalmazzák, szemben a
mitózis során keletkező két sejtmaggal, melyek apai és anyai nem leány kromoszómákat
tartalmaznak.
A profázis II-ben a kromoszómák erőteljesen kondenzálódnak.
Metafázis II-ben egyenlítői síkban rendeződnek és részben elválnak a kromoszóma párok
egymástól.
Anafázis II-ben a centromerek egymástól elválnak, és a sejt pólusai felé mozdulnak el a
kromoszómák.
Telofázis II-ben négy sejtmag képződik (tetrád), melyek mindegyike nagy valószínűséggel
genetikailag eltérő tulajdonságú, azaz apai és anyai kromoszómák véletlenszerű keverékét
hordozzák, melyek között rekombináns kromoszómák is találhatóak, azaz egyetlen
kromoszóma mind apai, mind anyai eredetű. A meiozis ilyen mechanizmusa egy fajon belül
tehát a sokszínűséget biztosítja az utódok között. A mitózis és a meiozis lépéseinek sematikus
ábrázolását tartalmazza a 2.4. ábra.
Eukariótákban a genetikai nem meghatározás egyik lehetséges módja eltérő alakú, heteromorf
kromoszómákhoz (X, Y) kötődik. E két kromoszóma eltérő mérete és információtartalma
számos eljárással jól megkülönböztethető (2.5. ábra). Ebből adódóan az X/Y nemi
kromoszómákat hordozók (ember esetében férfiak) X kromoszómás génjeik csupán egy
példányban vannak jelen, azaz ezen gének tekintetében haploidok, hemizigóták. Emiatt
Mendel első törvénye, a bélyegek kialakításáért felelős gének szétválása nem érvényesülhet,
így az öröklésmenet a mendelitől eltérő, és látszólagos anomáliát mutat. Nem véletlen tehát,
hogy a kromoszóma elmélet genetikai, citológiai igazolása is nemi kromoszómákhoz
kapcsolódik, ami egy azóta is igen hatékony modell szervezet, a Drosophila alkalmazásához
kötődik.
Morgan fehér szemű hímeket keresztezett piros szemű nőstényekkel. Az utódok mind piros
szeműek voltak, azaz a piros szemszín domináns a fehérrel szemben. Az utódok aránya eltérő
volt, ha ebből a keresztezésből származó nőstényeket piros vagy fehér szemű hímekkel
keresztezte, illetve amikor fehér szemű nőstényeket piros szemű hímekkel keresztezett. Ezek
az eredmények az alábbiak szerint magyarázhatóak.
A Drosophila normális piros szemszínét kialakító gén mutációja fehér szemszínt eredményez.
A gént az X kromoszóma hordozza; nőstények X/X, hímek X/Y kromoszóma szerelvénnyel
rendelkeznek. Így a hímek X kromoszómájukat kizárólag anyjuktól, az Y-t kizárólag apjuktól
öröklik. Nőstények ezzel szemben egy-egy apai és anyai X kromoszómát hordoznak.
Mindezek figyelembevételével a nemhez kötődő öröklésmenet anomáliái
megmagyarázhatóak, mint azt a 2.6. ábra mutatja néhány kombinációban.
Habár a gén párok/allél párok Mendel által leírt viselkedése, azaz szétválásuk és szabad
kombinációjuk törvényei jól követhető a genetika egyszerű, ám hatékony eszközeinek
használatakor. Ezeket az eseményeket akkor észleljük, amikor egy-egy tulajdonság
kialakításáért egy gén pár felelős, azaz két alléllel rendelkezik az adott szervezet. Mindehhez
társul a dominancia viszonyok egyértelmű érvényesülése, a domináns/recesszív heterozigóta
domináns fenotípusa. Ezzel szemben, amikor a dominancia viszonyok nem egyértelműen
nyilvánulnak meg, vagy egy tulajdonság kialakításáért kettőnél több allél felelős, vagy egy
tulajdonságot egynél több gén alakít ki, vagy legalább két gén összehangolt kölcsönhatása
következtében figyelhetünk meg egy fenotípust, akkor a nemhez kötött öröklésmenet
látszólagos anomáliájához hasonló helyzettel szembesülünk. Ilyenkor az észlelt jelenségek
interpretálása további elemeket igényel, ugyanakkor az öröklődés szabályai nem sérülnek,
azok univerzalitása továbbra is érvényes. A homozigóta fenotípusokhoz viszonyítva a
heterozigóta fenotípus alapján vonjuk le következtetéseinket.
Nem teljes, inkomplett dominanciát például a fehér és piros virágú csodatölcsér
keresztezésekor figyelhetünk meg; az F1 generációban rózsaszín szirmú virágokat kapunk,
átmenetet a két fenotípus között. A rószaszínű virágok beltenyészete, önbeporzása ¼ rész
fehér, ¼ rész piros, 1/2 rész rózsaszín utódot eredményez, így érvényesül az 1:2:1 hasadás
(3.1. ábra).
A B gén a pigment színét határozza meg. B fekete, b barna színt eredményez. B A-val
kombinálódva agouti, míg aa homozigótákban fekete színt ad. Az A a B b X A a B b (agouti)
keresztezés az alábbi arányokat adja:
9 A – B – (agouti)
3 A – bb (fahéj)
3 a a B – (fekete)
1 a a b b (barna), így tehát ezen gének vonatkozásában a mendeli arányoktól eltérést nem
tapasztaltunk.
A C gén C allélje a szín kialakításáért felelős gén kifejeződését megengedi, míg a c allél
megakadályozza. Más szóval a c/c homozigóta „felette álló”, episztatikus más szín génekkel
szemben. Emiatt a c/c homozigóta egyedben pigment termelés nincs, így albino. Az
albinizmus az állatvilágban széles körben megfigyelt jelenség, s az emberre is vonatkozik
(3.8. ábra). A C gén hőmérséklet-érzékeny allélje a ch (Himalaya), amely a test hidegnek
jobban kitett tájékain teszi lehetővé melanin felhalmozódását, ami a napfény fokozott
abszorpcióját eredményezi (3.9., 3.10. ábrák). Episztatikus gének esetében azonnal felmerül a
gyanú, hogy alkalmasak a mendeli arányok megváltoztatására. Végezzük el az alábbi
keresztezést:
9 B – C – (fekete)
3 b b C - (barna)
3 B – c c (albino)
1 b b c c (albino), azaz öröklésmenetünk 9:3:4 fenotípusos arányban szegregál; az ilyen
pedigrét recesszív episztázisnak nevezzük. A labradori terelőkutya esetében is – a c c
homozigótizmushoz hasonlóan – az e e homozigótizmus mind a B B mind a b b esetében a
pigment lerakódást gátolja, ami a fekete:barna:arany szőr színek 9:3:4 arányú öröklésmenetét
eredményezi (3.11. ábra).
Egy adott genotípus kifejeződése sok esetben nem autonóm, más gének termékeinek
kölcsönhatása képes befolyásolni megnyilvánulását. A fent említett módosító és episztatikus
gének példa erre az állításra, emellett még szokás a környezetet, mint módosító tényezőt
említeni. A penetrancia ebben a kontextusban egy populáción belül százalékos arányban
határozza meg azt, hogy a népesség hanyad részében érvényesül az adott genotípusra jellemző
fenotípus. Az expresszivitás egy egyedre vonatkozó jellegzetesség, ami egy adott
genotípusnak az egyén szintjén megfigyelhető fenotípusos kifejeződés mértékét jelenti (3.14.
ábra).
Mint korábban már láttuk, számos esetben tapasztalható eltérés a klasszikus mendeli 1:2:1,
9:3:3:1 arányoktól. Ennek okaiként említettük a nemhez kötött öröklődést, gén
kölcsönhatásokat, többszörös allélizmust, gén duplikációt, stb. Érdemes még felidézni, hogy a
9:3:3:1 hasadás akkor érvényesül, ha a vizsgált gének eltérő kromoszómákon helyezkednek
el. Ellenkező esetben fennálló viszonyokat taglalja e fejezet.
Közel száz éve a szagos bükköny tanulmányozása során érdekes jelenséget jegyeztek fel,
amikor a virág színét és a pollen alakját befolyásoló gének öröklésmenetét tanulmányozták,
ugyanis az elvárt arányoktól teljesen eltérő eredményeket kaptak (4.1. táblázat). A Drosophila
szem színét és a szárny méretét kialakító gének esetében (4.1. ábra) a rendelkezésre álló
információk alapján megmagyarázhatatlan jelenséggel szembesültek a kísérletezők:
A Drosophila szem színt és a szárny méretét meghatározó géneket összesen 2735 utódot
eredményező kísérletben tanulmányozták fenti példánkban. Definíciónk szerint, ha a két gén
egy térkép egységnyi távolságra helyezkedne el, mintegy 27 rekombináns utódot kapnánk.
Ezzel szemben 303 a rekombinánsok száma, így a térkép távolság közöttük 303/2735=0.11,
azaz 11 térkép egység, 11 cM, míg a rekombinációs gyakoriság 11% (4.8. ábra).
Az eddigiek során kettős heterozigóta, dihibrid, két pontos keresztezésekről esett szó. Legyen
három gén sorrendje A B C. Mint fenn láttuk, sorrendjük meghatározásához három két pontos
keresztezés szükséges. Ez egyetlen hárompontos keresztezéssel helyettesíthető:
X2 rész értékeit minden egyes kategóriára kiszámoljuk. A kísérletileg megfigyelt (M) és a null
hipotézis szerint várt (V) adatok felhasználásával: X2=(M-V)2/V adatoknak az összes
kategóriára vonatkozó összegével.
Meghatározzuk a szabadsági fokok számát, ami az összes kategória száma –1 (egy két pontos
keresztezés esetében 4-1).
A géneket ért mutációk a kromoszómának csekély részét érintik, így közvetlen kimutatásuk a
citogenetika eszközeivel nem lehetséges. A kromoszóma szerelvény mikroszkópos
tanulmányozása bizonyos esetekben észrevehető változásokra vet fényt; ilyenkor a változás a
kromoszóma előbbinél lényegesen nagyobb részére terjed ki. Ugyanakkor a közvetlenül nem
észrevehető kromoszóma szerkezeti változás, a gén mutációkhoz hasonlóan, genetikai
eszközökkel kimutatható.
A kromoszómák megkülönböztetésére morfológiájuk nyújt lehetőséget. A kromoszómák
mérete általában eltérő egy-egy szervezetben. A kromoszóma centromer helyzete alapján
lehet telocentrikus (a centromer végállású), akrocentrikus (nem közép- vagy végállású),
valamint metacentrikus (középen elhelyezkedő). A sejtmagvacska (nucleolus) a riboszomális
RNS-t tartalmaz, melynek lokusza, a kódoló gének helye a nucleolaris organizátor régió, ami
citogenetikailag felismerhető a határoló befűződésről. Legalább egy kromoszóma hordozza. A
Feulgen festék DNS-hez kötődik, és erőteljesen festi a génműködésből többé-kevésbé kizárt
kromoszóma szakaszokat, a heteroeukromatint, míg a kevésbé kompakt, működő rész, az
eukromatin halványabban festődik. A heterokromatin lehet konstitutív, például a centromer
környékén, vagy fakultatív. Ugyanakkor ezek az alaktani bélyegek segítséget nyújthatnak a
kromoszóma szerkezeti változások, a deléció, a duplikáció, az inverzió és a transzlokáció
megítélésében.
Egy kromoszóma szakasz elvesztése a deléció, vagy deficiencia. Keletkezésükhöz két helyen
beálló kromoszóma törés szükséges, akár interstíciális, akár terminális delécióról van szó (1.
ábra). Ez utóbbi esetében is még működőképes kromoszómát csak akkor kapunk, ha a végén
elhelyezkedő szerkezeti elem, a telomer nem sérül. Génen belüli, citológiailag ki nem
mutatható deléció csupán egy gént érint. A deléciók általában jellemző tulajdonsága, szemben
a pontmutációkkal, hogy nem revertálnak, akár egy vagy több gént érintenek. Homozigóta
állapotban gyakran letálisak. Több gént érintő deléciók homozigóta állapotban letálisak, míg a
normál homológgal együtt életképességet biztosíthatnak. Meiozis során jellegzetes
megjelenésük a deléciós hurok (2. ábra). A deléció területére eső recesszív gének
megnyilvánulása a pszeudo-dominancia. A deléció közelében elhelyezkedő gének esetében a
rekombinációs gyakoriság lecsökken. Deléciók alkalmasak genetikai térképezésre pszeudo-
dominanciára alapozva (3. ábra). Az 5. humán kromoszóma rövid (p) karjának terminális
deléciója a macskasírás (cri du chat) szindrómát okozza, csecsemőkorban halálos (4. ábra).
Bizonyos daganatok esetében is kimutathatók deléciós kromoszómák (5. ábra).
Inverzió akkor keletkezik, ha egy kromoszómán egyszerre két törés keletkezik, a közbülső
fragment 180 fokkal elfordul, majd a három fragment újra egyesül. Paracentrikus az inverzió,
ha a centromer e területen kívül esik, s a kromoszóma kar arányok nem változnak.
Pericentrikus inverzióban a centromer is érintett, emiatt a kromoszóma kar arányok is
megváltoznak. Inverzióban a genetikai anyag, a DNS mennyisége nem változik, emiatt
általában életképes a hordozó egyed. Heterozigóta állapotban citológiai megjelenése az
inverziós hurok (9. ábra). Ezen belüli rekombináció dicentrikus híd és acentrikus fragment
(elvész) keletkezéséhez vezet, majd mormál, inverziós és deléciós kromoszómák keletkeznek
paracentrikis inverzió esetén (10 ábra). Pericentrikus inverzió esetén meiozisban normál,
inverziós, valamint duplikációt és deléciót egyaránt hordozó kromoszómák keletkeznek (11.
ábra). Míg az inverziós kromoszómára erőteljes szelekciós nyomás nem nehezedik, addig
rekombinációs termékei hátrányosak, viselőik általában elpusztulnak (12. ábra). E
tulajdonságuk alapján az inverziós kromoszómákat balanszereknek nevezzük, mivel
alkalmasak a rekombináció nélküli állapot fenntartására, így kiegyensúlyozott letális mutációt
hordozó kromoszóma változatlan, rekombináció nélküli fenntartására, szelekciójára és
elkülönítésére.
Aneuploidia a vad típushoz hasonlítva egy, legfeljebb néhány kromoszóma elvesztését vagy
nyerését jelenti. Az aneuploid nomenklatura ennek megfelelően egy diploid szervezet
esetében 2n-1, egy kromoszóma hiányában beálló monoszómiát, 2n+1 egy kromoszóma
többlet miatti triszómiát, valamint 2n-2, egy kromoszóma pár hiányából adódó nulliszómiát
különbözteti meg. A nulliszómia ismereteink szerint csupán búzában tolerált kondíció, ahol a
négy homeológ képes kompenzálni egy homológ kromoszóma pár hiányát (7.9. ábra).
Az aneuploidia okát elsősorban a hibás meiozis során fellépő non-diszjunkcióban kereshstjük.
A jelenség mind az első, mind a második meiotikus osztódáskor felléphet (7.10. ábra).
Mindkét esetben n+1 és n-1 gaméták keletkeznek.
Erre humán példa a 44 +1X monoszómiás kromoszóma komplement, a Turner szindróma. Az
érintettek steril nők, jellegzetes fenotípusos megjelenéssel (7.11. ábra). Az X monoszómia
életképessége tette lehetővé néhány X kromoszómához kapcsolódó genetikai betegség
(vérzékenység, vörös-zöld színtévesztés) génjének erre a kromoszómára való térképezését.
Fellépésének gyakorisága 1 5000 élve született leánygyermek között.
A 2n+1 triszómia egyik példája a 44, XXY komplement, ami a Klinefelter szindrómát okozza.
Az érintettek szellemileg retardált, steril férfiak, fellépési gyakorisága 1 1000 élve született
fiúgyermek között. A fenotípust a 7.12. ábra mutatja.
Máig nem zárult le a vita az erőteljes testalkatú XYY triszómiát hordozó férfiak erőszakra,
bűncselekmények elkövetésére való hajlamukkal kapcsolatban. Érdekes módon az érintettek
mormális X vagy Y spermiumokat képeznek, és soha XY-t vagy YY-t, fertilisek.
A leggyakoribb humán triszómiás kondíció a Down szindróma, 44, XX (vagy XY), +21
aneuploidia, ami az élveszületések 0.15 %-át érinti, nemtől függetlenül. Az érintettek
szellemileg súlyosan visszamaradottak (IQ=20-50), jellegzetes külső megjelenéssel (7.13.
ábra). Érdekes módon az anyai életkor előrehaladtával a Down szindróma fellépésének
gyakorisága szoros összefüggést mutat, erőteljesen emelkedik (7.14. ábra). Citogenetikai,
illetve nem-invazív biokémiai szűréssel a betegség kimutatható.
További triszómiás humán kondíciók a 13-as kromoszóma triszómiája (Patau szindróma),
valamint a 18-as triszómia (Edwards szindróma). Mindkét esetben az érintettek a születést
követő néhány héten-hónapon belül elhaláloznak.
A későbbiek során számos Hfr törzset állítottak elő, amelyek donorként való alkalmazása
során megállapították, hogy ezek a konjugáció során kezdeményezett gén transzfer
kezdőpontjában és irányában különbözhetnek egymástól, azaz a kromoszóma más és más
pontján iniciálódik az átvitel 12. ábra). A nagyszámú Hfr törzs tanulmányozása alapján
megállapítható, hogy az E. coli kromoszóma kör alakú, amire nézve Cairns autoradiográfiás
kísérlete közvetlen bizonyítékot szolgáltatott. (Cairns radioaktív timidinnel jelölte in vivo a
kromoszómát, majd a sejtek óvatos lízisét követően a készítményre fényérzékeny filmet
helyezve detektálta a sugárzást).
A konjugáció pontos mechanizmusának megértéséhez szükséges az F faktor természetének
megállapítása. F+ sejtekből viszonylag egyszerű biokémiai módszerekkel egy kis méretű
extrakromoszómális elem, plazmid állítható elő, ami a bakteriális kromoszómához hasonlóan
szintén kör alakú képződmény. A Hfr sejt képződése során egyszeri átkereszteződést
követően a plazmid beépül a kromoszómába, és recipiens sejt jelenlétében képes a
kromoszóma átvitel megindítására (Campbell-modell, 13. ábra). A kromoszómába való
beépülés tulajdonságával rendelkező plazmidokat szokás még episzómáknak is nevezni. A
kromoszómába való beépülés több helyen, mindkét irányban lehetséges. Ennek
szükségességét a késői gének átvitelének esetleges volta indokolja, tekintettel az átvitelkor
fellépő transzfer gradiensre. Ellenkező esetben ugyanis a beépülési helytől távoli gének
gyakorlatilag ki lennének zárva a rekombinációból. A gén átvitel mechanizmusának lényeges
eleme az, hogy a donor sejtből származó genetikai információ egyes szálú DNS-ként kerül a
recipiens sejtbe, ahol a kiegészítő szál szintézisével kettős szálúvá válik, s alkalmas
rekombináció létrehozására.
A Hfr törzsek további tulajdonságai között meg kell említeni a mindkét irányban történő
beépülés következményeit. Emiatt a gén átvitel iránya is az óramutató járásával megegyező
vagy azzal ellenkező irányú lehet (12. ábra), ugyanakkor a kapott térképek egyenértékűek. A
gén átvitel az F faktor belsejében iniciálódik, azaz egy adott Hfr törzs esetében minden
esetben ugyanarról a pontról indul (12. ábra). Az F + állapottal összehasonlítva voltaképp
ugyanaz a mechanizmus figyelhető meg, csupán a Hfr törzs F faktora mintegy „mellékesen” a
teljes kromoszómát hordozza, óriási in vivo rekombináns plazmidként. Az F faktor ez utóbbi
tulajdonsága tette lehetővé az igen nagy méretű (~100 kilobázispár, kbp) idegen DNS
befogadására alkalmas klónozó vektorok kifejlesztését. Az ily módon nyert in vitro
rekombináns klónokat nagyfokú stabilitásuk, sejtenként egy kópiaszámuk következtében
bakteriális mesterséges kromoszómaként (bacterial artificial chromosome, BAC) emlegetjük.
A kromoszómába épült F faktor vagy az eredeti állapot visszaállításával, vagy nem precíz
kivágódás során a beépülési hely melletti DNS darab magával ragadásával hagyhatja azt el.
Ez utóbbi esetben keletkező plazmid az F’ faktor. Az F’ faktor nem integrálódott állapotában
is természetesen lejátszódik gén átvitel, ez azonban kizárólag az általa hordozottakra
korlátozódik. Az F’ faktor közvetítésével létrejött gén átviteli folyamatot szexdukcióként is
szokás emlegetni. Így tehát egy meglehetősen rugalmas rendszer áll elő, melyben az összes
irányban játszódhatnak le az átalakulások (14., 19. ábrák):
Eukariótákban a rekombinációs események (általában) két teljes genom között játszódnak le.
Ezzel szemben prokariótákban csupán részleges, korlátozott diploid állapotról, merozigóta
képződéséről beszélhetünk, ahol nem képződik reciprok rekombináns. Mindemellett kettő,
vagy ennél több, de páros számú átkereszteződés szükséges ahhoz, hogy életképes
rekombinánst kapjunk. Egy, vagy páratlan számú átkereszteződés lineáris szerkezetet
eredményez, ami nem életképes (15. ábra).
Két igen közeli gén sorrendjének eldöntésére szolgáló eljárás a reciprok keresztezés.
Végezzük el a Hfr a+ b+ c x a b c+ és az F- a b c+ x a+ b+ c keresztezéseket annak eldöntése
érdekében, hogy a gének sorrendje a b c vagy a c b, és szelektáljunk csupán a vad típusú, + +
+ rekombináns kategóriára. Amennyiben a gének sorrendje a b c, a reciprok elrendezésű
keresztezések külön-külön nagyjából azonos számú rekombinánst eredményeznek (18. ábra).
Amennyiben a sorrend a c b, a fenti elrendezések egyike négyszeres átkereszteződés révén
szolgáltat vad típusú rekombinánst, ami igen kis gyakoriságú a másik konfigurációhoz
viszonyítva (18. ábra).
A DNS közvetítette transzformáció során a donor sejt DNS-ét juttatjuk a recipiens sejtbe. A
donor DNS páros számú átkereszteződés során beépülhet a gazda sejt genomjába, a 20. ábrán
bemutatottak szerint. Függetlenül a DNS bejuttatásának mechanizmusától, a rekombináció
hely specifikusan játszódik le a befogadó sejtben. Bár korlátozott mértékben, a transzformáció
is alkalmas – többek között – genetikai térképezésre, némiképp az általános transzdukcióra
emlékeztető mechanizmus szerint.
9. Bakteriofágok
A rekombinációs gyakoriságot az
hányados fejezi ki. Ez az érték ugyanakkor nem az összes eseményt reprezentálja, hiszen pl. a
szülői fágok egymás közötti rekombinációjának, vagy kettős rekombinációnak a termékei
nem mutathatók ki, nem mérhetőek. Függetlenül attól, hogy az átkereszteződés azonos vagy
eltérő fág genomok között játszódik le, ez általában diploid állapotban lezajló eseménysort
takar, szemben a bakteriális konjugáció esetében megfigyelt részleges diploidiával.
Általános transzdukció során az alábbi események játszódnak le: Fág fertőzést követően a
gazda sejt kromoszómája véletlenszerűen feldarabolódik. Bizonyos fágok, köztük a P1, a P22
képes arra, hogy a fág fejbe a saját genomjához hasonló méretű, de a gazda sejtjéből származó
DNS-t csomagoljon be. A fág ezt a DNS-t injektálja a gazda sejtbe, ahol páros számú
átkereszteződések során rekombináns keletkezhet (9. ábra). Mivel ez a mechanizmus csupán a
hordozott, idegen DNS méretére, s nem pl. információ tartalmára szelektív, így a kromoszóma
bármely helyéről származó darab juthat a fág fejbe. Elsősorban közeli gének átvitelére
alkalmas, így nagy felbontású genetikai térkép készíthető segítségével. A P1 fág
alkalmazásával elvégezhetjük a leu thr azi génekre vonatkozó általános transzdukciós
kísérletet, és alkalmazzuk a szelektált – nem szelektált markerek „trükkjét”. A
kotranszdukciós értékek alapján a gének sorrendje és távolsága meghatározható az alábbiak
szerint. Minél nagyobb két marker együttes transzdukciójának (kotranszdukciójának)
valószínűsége, annál közelebb helyezkednek el egymáshoz viszonyítva. Ugyanakkor, a
mechanizmusból adódóan, a fág genom (ez utóbbi 1-2 %-a az E. coli genomnak) méretét
meghaladó távolságban elhelyezkedő gének a kotranszdukcióból ki vannak zárva (10. ábra).
Annak eldöntésére, hogy két gén a kotranszdukció során kapcsolt, vagy független események
során figyelhetjük meg jelenlétüket a rekombinánsok között, egy egyszerű számítás
alkalmazható. Végezzük el A B gének általános transzdukcióját - - gazdában, ahol három féle
rekombinánst kaphatunk: ++, +-, -+ kategóriákat. Legyen P a ++ rekombináns kategória
keletkezésének valószínűsége (0<P<1). Legyen a +- és -+ rekombináns kategóriák
fellépésének valószínűsége egyenlő, (1-P)/2. E két független esemény egyidejű
bekövetkezésének valószínűségét a két esemény bekövetkezte valószínűségének szorzata adja
meg. Ha a szorzat kisebb mint P, A B kapcsolt, ha nagyobb, nem kapcsolt. Az előbbiek
szerint a
P=[(1-P)/2]2
egyenlet megoldása adja azt az értéket, ahol ez a dilemma nem eldönthető.
A fentiek során láttuk, hogy a virulens fágok csoportjába tartozóak fertőzhető gazdán tiszta
tarfoltot képeznek, a sejteket maradéktalanul elpusztítják. A tarfolt zavarossága ugyanakkor a
fertőzést túlélő baktérium sejtek jelenlétére utal. Az ilyen sejtek a továbbiakban ugyanazzal a
fággal nem fertőzhetőek, „immunissá” válnak. A fág fertőzésre ellenálló, rezisztens sejtekből
spontán módon kicsi, külső behatásra, pl. UV fénnyel történő megvilágítás eredményeképp
lényegesen nagyobb gyakorisággal fertőzőképes részecskék, ép fágok szabadulnak ki.
Ezekkel végrehajtott fertőzést követően újfent zavaros tarfolt képződését tapasztalhatjuk,
amelyekből rezisztens sejtek izolálhatóak (11. ábra). Ezeket a sejteket lizogénnek nevezzük, s
ennek a kiváltására alkalmas fágok a mérsékeltek, a temperáltak körébe tartozóak. Az ilyen
viselkedés mögött meghúzódó események tisztázása az E. coli fágjának alaposabb
tanulmányozásával valósult meg.
Egy Hfr x F-() konjugáció során a lizogén recipiensben a gén átvitel során ismert események
játszódtak le, azaz a megfelelő markerekkel ellátott recipiens sejtek körében rekombinánsok
jelentek meg. Ugyanakkor a Hfr () x F- keresztezés során a recipiens sejtek lizáltak, bennük
fágok keletkeztek. A kísérleti eredmények alapján kimondhatjuk, hogy a lizogénia
állapotában a sejt valószínűleg tartalmazza a fág genomját, s ennek következtében
citoplazmájában olyan fehérjék jelennek meg, amelyek ezt az állapotot stabilizálják. Emiatt a
lizogén recipiens továbbra is lizogén marad. Fordított esetben a genom nem lizogén
környezetbe kerül a konjugáció során, s ez a miliő a fág gének aktiválódásának kedvez a
fékentartó mechanizmus hiányában. A lizogénia illetve a lítikus ciklus közötti választás
összefüggésbe hozható a fág genom eltérő státusával. A. Campbell feltételezte, hogy a fág
esete sok tekintetben emlékeztet az F faktor viselkedésére, azaz a cirkuláris fág genom
beépülhet, integrálódhat a gazda sejt kromoszómájába, és profág képződik (12. ábra). A
beépülés helyének meghatározása érdekében a Hfr() x F-(), valamint a Hfr x F-
keresztezések összehasonlítása nyújtott értékes információt. Megfigyelhető ugyanis, hogy a
gal és bio operonok egymáshoz viszonyítva később jelentkeznek a lizogén exkonjugánsokban,
mint a nem lizogének esetében. E két operon között található egy rövid, mind a fágban,
mind a baktérium kromoszómájában fellelhető nukleotid sorrend, a kapcsolódó (attachment,
att) régió, mely mentén a rekombináció lezajlik. A beépülés következtében az E.coli
kromoszóma mérete kb. 1%-al, a gal és bio operonok egymáshoz viszonyított felbukkanása
kb. egy perccel megnő.
Speciális transzdukció a már többször említett fág alkalmazásával hajtható végre. A profág
hibás kivágódása során kis gyakorisággal defektív fág részecskék keletkeznek (13. ábra),
mivel a folyamat során fág gének maradnak a kromoszómán, ugyanakkor a beépülési helytől
jobbra vagy balra elhelyezkedő gal és bio lokuszok egyike a fág DNS-sel eltávoznak. Az
ilymódon keletkezett fág részecskék defektívek, önmagukban nem képesek a befogadó sejt
kromoszómájába beépülni. Ép fág genom jelenléte ugyanakkor biztosítja a beépüléshez
szükséges fehérjék szintézisét, és mindkét genom beépülését (14. ábra). Az ebből a lizátumból
előállított fágok fele ép, fele defektív lesz, s ez a fág keverék már igen nagy gyakorisággal
képes transzdukcióra (high frequency of transducing, hft lysate). Ez az állapot ugyanakkor
lehetővé tesz a domináns, vad típusú gént (gal vagy bio) hordozó fág genommal történő
komplementációt.
1963-ban az E.coli genetikai térképe mintegy száz gén helyét mutatta meg (15. ábra), míg
1990-ben ez a szám több, mint 1400 volt (16. ábra). Ezt követően készült el az E.coli genom
nukleotid sorrendjének meghatározása. A genom mintegy 4x106 nukleotid hosszúságú,
mintegy 4000 gént tartalmaz, s a legpontosabban elkészíthető térképet reprezentálja (17.
ábra).
Spontán mutációk kialakulása sok esetben a DNS replikáció hibáira vezethető vissza. Az így
keletkezett hibákat egy javító rendszer, az ún. posztreplikációs javítás, repair, korrigálja. E
rendszer elemeinek mutációja, ugyanakkor, az így keletkezett hibákat meghagyja. Ilyen
tulajdonságúk eszerint az ún. mutátor gének.
A spontán mutáció ritka esemény, ezért olyan szervezetek esetében, ahol megengedett,
mutációkat indukálunk. Egy gén funkciójának megértését mutáns alléljainak tanulmányozása
nagymértékben segíti elő. E célból legelőször Röntgen sugárforrást használtak, de más
ionizáló sugárzás UV, radioaktív) is használható; e fizikai ágensek gyakran kromoszóma
töréseket indukálnak. Az UV fény ciklobután szerkezetű timidin diméreket indukál; javításuk
mutáció miatti elmaradása UV fény (napfény) érzékenységet eredményez, ami a xeroderma
pigmentosum betegségben nyilvánul meg.
Alkiláló szerek (metil- vagy etil metán szulfonát, N-metil-N-nitrosoguanidin) a guanin 6-os O
atomját és a timin 4-es O atomját alkilálják, éterkötést kialakítva. Az O-6-metilguanidin a
timinnel, az O-4-metil-timidin a guaninnel képez bázispárt, ami GC<->AT tranzíciót okoz
(missense mutáció). Interkalálódó ágensek (proflavin, akridin oranzs) a kettős spirál
bázispárjai közé ékelődnek, és egy nukleotid beépülését vagy delécióját okozzák (frameshift
mutáció). Ez az eszköztár mutánsok előállításának hatékony lehetőségét biztosítja
laboratóriumi modell szervezetekben.
A fenti biokémiai adatok megerősítést nyertek a későbbi genetikai elemzés során, ami szintén
koordinált gén kifejeződésre utaló jelenséget indikált, valamint a poláris mutációk
fellépésének magyarázatául szolgált. Eszerint a lac operon három gént (Z, Y, A, 1. ábra)
tartalmaz, és pl. egy nonsense (stop) mutáció a mögötte elhelyezkedő gén termékének
megjelenését drasztikusan lecsökkentheti. Ugyanakkor alkalmas nonsense szuppresszor ezt a
hibát – legalábbis részlegesen - képes kijavítani. Az itt megfigyelt jelenségek vezettek a
prokariota gének policisztronos természetének felismeréséhez. A lac operon további genetikai
elemei egyikeként az I gént azonosították (1. ábra). Mutáns alléljeinek viselkedése meglepő
volt: Nem az enzim aktivitását, hanem szintézisét, termelését érintették, így kézenfekvőnek
tűnt feltételezni az I gén represszor fehérje termékenek a lac gének átírásában gátló szerepét.
Ennek igazolására I- Z- F- tulajdonságú recipiens sejtekbe vad típusú Hfr donor tulajdonságú
sejtek segítségével juttatták be a fenti gének vad típusú alléljeit. Ebben a kísérleti
elrendezésben az említett génekre nézve diploid állapot áll be merozigóta, részleges diploid
formában. A donor gén termékek megjelenése a konjugációt követő néhány percben
kimutatható volt (3. ábra). A képződött konjugáns sejtek egyik feléhez induktort adagoltak,
míg a másikat e nélkül hagyták. Megfigyelhető, hogy az induktor jelenléte vagy hiánya eleinte
a képződött aktív fehérje szintézisét nem befolyásolja, később azonban induktor hiányában a
szintézis leáll, jelenlétében erőteljesen folytatódik. A megfigyelések magyarázata az alábbi:
Az I- Z- F- sejtekben a vad típusú Z+ allél megjelenése az aktív fehérje szintézisével párosul
mindaddig, míg az I gén termékének citoplazmás koncentrációja egy küszöb értéket
meghaladva – induktor hiányában - a lac operon átírását meggátolja. Induktor jelenlétében
természetesen a szintézis fennmarad. Ilyen típusú komplementációs teszt elvégzésének
egyszerűbb, ugyanakkor megbízhatóbb lehetőségét kínálta az I gént hordozó F’ faktor
alkalmazása. Ebben az esetben ugyanis a részleges diploid állapot állandósul a plazmid
jelenléte következtében. A +/- diploid állapotú sejtek a fentiekben leírtak szerint viselkedtek,
azaz a + tulajdonság domináns a – felett, azaz az ép represszor ektopikus kifejeződése
elégséges az indukálhatóság fenntartásához (4. ábra). A represszor hipotézis további
alátámasztásához nyújtott adalékot az IS mutáció viselkedése: Induktortól függetlenül a lac
operon átírása nem történt meg. Továbbá, az IS mutáns mind az I+, mind az I- allélek
vonatkozásában dominánsnak bizonyult (4. ábra). Mindezen kísérletek arra engedtek
következtetni, hogy az I gén terméke kettős természetű: Átírást gátló hatása DNS-hez történő
kötésre, induktorral történő kölcsönhatása pedig a kis molekulákkal, pl. laktózzal való
komplex képzésére utal (5. ábra).
E.coli sejtek erőteljes preferenciát mutatnak glükóz hasznosítása szempontjából. Így glükóz és
laktóz jelenlétében kizárólag az előbbit fogyasztják, holott az induktorként viselkedő laktóz
jelenléte hasznosítását mindenképp indokolná. Ennek oka a represszor által közvetített
szabályozásra rétegződő újabb, pozitív természetű kontrol folyamat, a katabolit represszió. E
folyamat kulcsszereplői a katabolit aktivátor protein (CAP), valamint a ciklikus AMP
(cAMP). Glükóz jelenléte alacsony cAMP szinttel társul, emiatt a CAP nem képes a lac
operon promoteréhez kapcsolódni, ezáltal alacsony sebességű átírás figyelhető meg. A cAMP
koncentráció emelkedése glükóz fogytán lehetővé teszi a CAP-cAMP komplex kialakítását,
kapcsolódását a promoterhez, s az ott elhelyezkedő DNS meggörbítését. Mindezek együttesen
a lokusz nagy sebességű átírását eredményezik (9-11 ábrák). Represszor közreműködése az
átírás gátlásában a negatív, míg a CAP átírást serkentő viselkedése a pozitív szabályozásra
példa, megállapodás szerint (12. ábra).
Az arabinóz operon működése hasonló elveken nyugszik, s mind a pozitív, mind a negatív
szabályozás elemei fellelhetők benne. Az operon három gént kódol (araB, araA, araD),
további genetikai elemei az araC gén, valamint az I és O cisz elemek. Arabinóz jelenlétében a
C fehérje-arabinóz, valamint a CAP-cAMP komplexek mindegyike szükséges a hatékony
átíráshoz. Arabinóz hiányában a C fehérje egyidejűleg képes kapcsolódni az O és I
elemekhez, ezáltal hatékonyan gátolja meg a lokuszon történő átírást (18-20 ábra).
A DNS ellenőrző pontjain ható fehérjék DNS-t kötő szerkezeti elemeik alapján oszthatók fel.
A már megismert helix-turn-helix motívummal rendelkező transzkripciós faktorok csaladjába
tartoznak pl. az egyedfejlődés szabályozásában kitüntetett szereppel bíró homeotikus fehérjék
DNS kötő tulajdonságú peptidje, a homeo „doboz” (box), amely egyúttal a célzott
szekvenciák felismerésére is szolgál (20. ábra). A cink ujj (zinc finger) fehérjék – nevükből
adódóan – cink iont tartalmaznak koordinatív kötésben (20. ábra), és pl. szteroid
receptorokban fordulnak elő nagy számban. A leucin zipzár (leucine zipper) homo- és
heterodimer képzésére hajlamos a szabályosan ismétlődő leucin aminosavmaradékok mentén,
és alkotja pl. a c-jun, c-fos proto-onkogén család tagjait. A helix – hurok (loop) – helix
szerkezetű fehérjék szintén dimer képzésére alkalmas polipeptidek, szintén proto-onkogén
tulajdonságúak, mint pl. a c-myc gén terméke.