CHAPITRE 3

ASSIMILATION DE L’AZOTE ET DU SOUFRE

 Rôles et importance de l’azote
Propor%ons d’azote dans les différents composés azotés chez les
plantes

F r a c t i o n Concentration (µg/
Composés
d’azote (%) g MS)
Protéines 85 10 000 à 40 000
Acides nucléiques 5 1000 à 3000
Autres substances organiques
solubles <5 1000 à 3000
Nitrate <1 10 à 5000
Ammonium <0,1 1 à 40
Concentra%ons en azote dans différents organes de la plante

Concentration Intervalle
Organes
en azote (% MS) Optimum
Feuilles 1à6 >3
Tiges 1à4 >2
Racines 1à3 >1
Fruits 1à6 >3
Graines 1à7 >2
Nutri5on azotée
Formes de l’azote minéral
NO3- : Nitrates
NO2- : Nitrites
NH4+ : Ammonium
N2 : moléculaire
 Formes de l’azote minéral
Les Nitrates (NO3-)

• Assimilables par les plantes

• En raison de sa charge négative, Le nitrate n’est

retenu que faiblement au niveau du sol (lixiviation).

• Stocké au niveau des vacuoles.

 Formes de l’azote minéral

L’ammonium (NH4+ )

• Les ions ammonium se fixent aux argiles

• L’ammonium devient toxique au delà de ~ 65

mg d’ammonium par Kg de sol

• L’ammonium est rapidement oxydé en nitrates

(nitrification).
 Formes de l’azote minéral

Les nitrites (NO2-)

• Les nitrites sont très toxiques au delà de 150

ppm

• Ils sont très rapidement oxydés en nitrates.

 Formes de l’azote minéral

L’azote moléculaire (N2)

• Le plus abondant (~ 70% de l’atmosphère

terrestre)

• N’est pas assimilable par les plantes sauf en cas

de symbiose avec des bactéries du genre
Rhizobium (légumineuses).
 Cycle géochimique de l’azote
• Les inter-relations entres les différentes formes d’azote minérales et avec les
formes organiques constituent le cycle géochimiques de l’azote
 Cycle géochimique de l’azote

L’azote moléculaire (N2)

• Fixé biologiquement par les bactéries du sol

nitrifiantes et amonifiantes (Actinomycetes, Nitrosomonas,
Nitrobacter, Azotobacter) (90%)

• Transformations photochimiques dans

l’atmosphère par réaction avec l’eau ) (10%).
 Cycle géochimique de l’azote
Fixa5on libre/Fixa5on symbio5que

v Fixation libre d’azote réalisée par des bactéries aérobies

(Azotobacter sp., Beijrinkia sp.) ou anaérobies (Clostridium sp.), des
algues bleues (Cyanophycées) (10 et 30 Kg/Ha/an).

v Fixation symbiotique : légumineuses-Rhizobium

Certaines espèces d’autres familles avec un actinomycète du genre
Frankia.
 Cycle géochimique de l’azote

Fixation biologique Transformation de l’azote atmosphérique en azote

organique assimilable par les plantes
- Assurée par des bactéries fixatrices d’azote
Rhizobium (symbiose avec légumineuses)
Azotobacter (bactéries du sol non-symbiotiques)
 Cycle géochimique de l’azote

l’azote organique
§ Minéralisation : dégradation de la matière organique du sol
pour aboutir à des formes simples dont la forme ultime est l’ion
nitrate.

La minéralisation primaire : elle est directe et quantitativement

importante. Elle conduit directement à la formation de composés
minéraux simples (CO2, H2O, NH4+, …) à partir des résidus
organiques récents.

La minéralisation secondaire : elle est indirecte et passe par la voie

humique qui implique dans un premier temps l’élaboration transitoire
d’une nouvelle matière organique : les composés humiques.
 Cycle géochimique de l’azote

l’azote organique
La minéralisation primaire
§ Deux étapes (l’ammonification et la nitrification)
§ La nitrification est réalisée en deux étapes : la nitritation et la nitratation

Nitritation : l’ ammonium est transformé en nitrite (Nitrosomonas).

Nitratation : nitrite est transformé en nitrate (Nitrobacter).
 Cycle géochimique de l’azote
l’azote organique
La Nitrification : Décomposition de la matière organique en
ammonium et en nitrate
- Assurée par les bactéries ammonifiantes et nitrifiantes
bactéries ammonifiantes bactéries nitrifiantes
(Actinomycetes) (Nitrosomonas) (Nitrobacter)

Ammonification Nitritation Nitratation

résidus organiques → NH4 + → NO2 → NO3-
(Protein, aa, etc) Ammonium Nitrite Nitrate
 Cycle géochimique de l’azote

Les pertes
L’azote dans le sol peut être perdu pour regagner
l’atmosphère ou les aquifères (lacs d’eau, eaux souterraines) :

ü Dénitrification : réactions inverses de la nitrification

(Intense en condition d’anaérobiose)

ü Volatilisation de l’ammoniac : maximale dans les

sols calcaires (pH alcalin) par temps chaud et humide.

ü Lixiviation et entraînement dans les eaux

 Cycle géochimique de l’azote

Les pertes
La dénitrification : Transformation du nitrate en azote moléculaire.
Deux étapes :
• Le nitrate est transformé en nitrites.
• La réduction des nitrites en azote gazeux (N2O puis
N2) (Pseudomonas et Agrobactérium).

En conditions d’anaérobiose pertes importantes (3kg.N ha-1.jour-1 !!

solution = labour).
 Cycle géochimique de l’azote

Les pertes
La volatilisation de l’ammoniac : C’est un processus physicochimique
résultant de l’évolution suivante :

NH4+ (fixé) NH4+(solution) NH3(solution) NH3(gazeux)

La volatilisation de l’ammoniac est maximale dans les sols calcaires (pH

alcalin) par temps chaud et humide.

Les pertes par les eaux : les nitrates, nitrites ne sont pas fixés par les sols
et sont entrainés par les eaux de surface et aussi vers la nappe
phréatique par lixiviation
 Absorp5on des nitrates
Devenir du nitrate dans la cellule

(1) Réduction,

(2) Efflux vers

l’apoplasme,

(3) Stockage,

(4) Efflux symplasmique

de cellule à cellule
vers le xylème.
Absorp5on de l’ammonium
 Assimila5on de l’azote minéral

NO3- NO2- NH4+ Acides aminés

nitrate nitrite ammonium

Nécessite d’importantes quantités d’énergie

Formation de composés intermédiaires toxiques

Les plantes transforment immédiatement la majorité du nitrate

absorbé en composés organiques azotés.

La première étape consiste en la réduction au niveau du

cytoplasme du nitrate en nitrite, par la nitrate reductase.
Assimila5on de l’ammonium au niveau cellulaire
Evolu&on de la biosynthèse et de l’ac&vité de la nitrate réductase chez les plantules
d’orge après induc&on par le nitrate
La nitrate réductase

- NR
NO3 NO2- NH4+ acides aminés
La nitrate réductase
La nitrate réductase des plantes supérieures est composée de deux
sous unités identiques.
Chaque sous unité contient 3 groupes prosthétiques :
• FAD—flavine adenine dinucleotide
• Hème
• Molybdène—ptérine
 Régula%on de l’ac%vité NR

La Nitrate réductase est la principale enzyme végétale contenant le

Molybdène.
Le niveau des nitrates, l’intensité lumineuse, et la concentration en
sucres influencent l’activité de la nitrate réductase.
§ Ces facteurs stimulent une phosphatase, qui dephosphoryle
plusieurs résidus serine de la nitrate reductase activant ainsi la nitrate
réductase.
§ Ces réactions de dephosphorylation/phosphorylation permettent un
controle plus rapide de l’activité de la NR.
 La nitrite réductase (NiR)

- NiR
NO3- NO2 NH4+ acides aminés
 La nitrite réductase (NiR)

Le Nitrite (NO2-) est hautement réactif.

Le nitrite est rapidement transporté du cytoplasme vers les
plastes/ chloroplates où il est réduit en ammonium par la
nitrite réductase.
La NiR consiste en un seul polypeptide contenant du Fer, et du soufre et un heme
L’Hème permet le transfert d’électrons
 Assimila5on de l’ammonium
Les cellules végétales évitent la toxicité de l’ammonium par son rapide
transfert à des acides alpha cétoniques pour former des acides aminés

Ceci fait intervenir deux types d’enzymes

Glutamine synthetase – Combine l’ammonium au glutamate pour
former la glutamine

Glutamate synthase – Ac5vée par des concentra5ons élevées en

glutamine
Transfert le groupe amine de la glutamine
sur un l’acide alpha céto glutarique et
forme deux glutamates
Voie GS-GOGAT d’assimila&on de l’ammonium
Voie GS-GOGAT d’assimila&on de l’ammonium
 Transamination

Ø Une fois la glutamine et le glutamate formés, le

groupement amine peut être transféré sur des acides
alpha cétoniques pour former d’autres acides aminés.

Ø Les enzymes catalysant ces réactions sont dites :

aminotransferases
 Aspartate aminotransférase

Ø Le groupe amine du glutamate est transféré sur

l’oxaloacétate pour former l’aspartate
Ø L’Aspartate est l’acide aminée qui sert de navette pour
les agents réducteurs de la mitochondrie et du chloroplaste
vers le cytoplasme
Assimila5on du nitrate au niveau cellulaire
 Assimila5on du Soufre
Absorp5on et Assimila5on du soufre
 Le soufre dans le sol
Ø Le soufre provient ini%alement de la roche mère, (gypse)
Ø Forme minérale:
§ Ions solubles dans la solu%on du sol
§ Précipite sous forme de sulfate de calcium
Ø Forme organique :
§ Acides aminés soufrés libres (faible frac%on)
§ Soufre lié aux lipides ou à des glucides
§ Soufre lié aux frac%ons minérales et humiques du sol (plus
de 50%).
 Le soufre dans la plante

• Cysteine, methionine, proteines, peptides (e.g. glutathione)

• Fer-soufre groupements: 2Fe:2S, 3Fe:3S, 3Fe:4S, 4Fe:4S,

• Polysacharides sulfatés (agar agar), sulfolipides des thylacoïdes

• Cofacteurs: acide pantothenique in CoA

• Métabolites secondaires (glucosinolates)

 Absorp5on du soufre

Ø Absorp5on et transport du soufre sous forme de sulfate

(SO-4).

Ø Transport ac5f secondaire 1 SO42- / 3H+

 Assimilation du soufre
• 2 à 5 % seulement du soufre absorbé seraient réduits (le reste s’accumule
dans la vacuole),

• Chez les plantes supérieures et les algues, la réduction des sulfates est
localisée essentiellement dans le stroma des chloroplastes.

• Réduction en faible quantité, dans les racines .

• La réduction s’opère sur le sulfate activé et non pas sur des ions sulfates.
Assimilation dans les
Cellules du
feuilles
Mesophylle
(cysteine, glutathione)
Storage

Transport
xylémique
jusqu’aux feuilles

assimilation en
cysteine dans les
racines Storage Cellules
Racinaires

Absorption
Transport actif
secondaire
 Ac5va5on du sulfate

Ø L’ion sulfate (SO42-) est très stable donc peu réactif.

Ø Avant sa réduction son activation est nécessaire.
Ø L’activation consiste en une réaction entre le sulfate et l’ATP pour former
l’Adenosine-5′-PhosphoSulfate (l’APS)

Ø L’enzyme ATP sulfurylase qui catalyse cette réaction présente deux forme
une cytoplasmique minoritaire et une chloroplastique majoritaire
Assimila5on des sulfates
 Réduc5on ou sulfata5on de l’APS

Cytoplasme

L’APS, est rapidement

réduit ou sulfaté.

La Réduction est la
voie majoritaire

Chloroplaste
 Réduc5on de l’APS (I)

La reduction de l’APS se fait en plusieurs étapes

Elle a lieu exclusivement dans les chloroplastes

En premier, Une APS réductase transfert deux éléctrons du

glutathion réduit (GSH) pour former des sulfites (SO32-) et du
glutathion oxydé (GSSG) :

APS réductase
 Réduc5on de l’APS (II)

La sulfite réductase transfert six eléctrons des ferredoxines (Fdred) pour

produire des sulfures (S2-):
 Réduc5on de l’APS (III)

Le sulfure réagit avec l’O-acetylserine (OAS) Pour former la cysteine et

l’acetate. Cette réaction est catalysée par une O-acetylserine thiol-
lyase.

L’O-acetylserine se forme lors de la réaction catalysée une

acetyltransferase entre la serine et l’acétyl-CoA
 Sulfata5on de l’APS

La sulfatation de APS, est localisée dans le cytoplasme

Une APS kinase catalyse la reaction de l’APS avec l’

ATP pour former le 3’-
phosphoadénosine-5’phosphosulfate (PAPS)
 Sulfata5on de l’APS

• PAPS, en présence de la PAPS- sulfotransférase forme des

esters sulfuriques (composés phénoliques, stéroïdes, polyholosides :

agar-agar, ...),

• PAPS, en se déphosphorylant par une nucléotidase fournit

l’APS,

• PAPS = réserve qui fournit l’APS en cas de besoin.

Nutri%on minérale des plantes Chapitre III

CADI AYYAD UNIVERSITY

Faculté des Sciences Semlalia
Hafidi abdella5f : a.hafidi@ucam.ac.ma
Rela%ons nutri%on azotée et soufrée
 Interac5ons nutri5on soufrée et oligoéléments

Antagonisme avec Molybdène et du Bore

Synergie avec phosphore et potassium