TOPAS 4.2 中文教程2013830103816 PDF

BRUKER AXS GMBH
DIFFRAC TOPAS 4.2

中文教程
德国布鲁克 AXS 有限公司北京代表处

DIFFRAC TOPAS 4.2 中文教程
目录
1.总览------------------------------------------------------1
2.一般谱线拟合方法------------------------------------3
2.1单峰拟合及全谱拟合-------------------------------------3
2.1.1单峰拟合----------------------------------------------------------3
2.1.2利用限制条件进行线形分析----------------------------------8
2.1.3全谱拟合---------------------------------------------------------13
2.2指标化------------------------------------------------------16
2.2.1LSI指标化-------------------------------------------------------16
2.2.2 LP搜索----------------------------------------------------------25
2.3全谱分解---------------------------------------------------36
2.3.1Pawley法---------------------------------------------------------36
2.3.2Le Bail法---------------------------------------------------------42
2.4 Rietveld 结构精修---------------------------------------45
2.5Rietveld定量分析-----------------------------------------49
I
2.5.1CPD-2定量分析（择优取向）------------------------------49
2.5.2CPD-3定量分析（非晶相定量）---------------------------58
2.5.3OPC定量分析（水泥定量）---------------------------------63
3.杂项----------------------------------------------------66
3.1计算结晶度------------------------------------------------66
4. 刚体编辑器（晶体结构3D图）------------------72
4.1创建刚体图------------------------------------------------73
4.2利用已知晶体结构数据创建刚体图------------------77
4.3扭曲---------------------------------------------------------79
II
1.总览
DIFFRACplus TOPAS：TOtal Pattern Analysis Solutions
Bruker公司衍射图谱线形拟合及结构分析软件，无缝集成目前所有线形
分析方法，可实现所有相关应用。
用户界面：
GUI （窗口式用户界面模式）和 Launch 模式（直接命令模式）
GUI Launch
1
窗口式界面模式（GUI）用户界面
2
2.一般谱线拟合方法
2.1单峰拟合及全谱拟合
2.1.1单峰拟合
2.1.1.1 Split-PVII函数单峰拟合
1.打开TOPAS
2. 利用“Import Data File(s)”调入数据：CeO2.raw，文件默认位置为：C:\TOPAS4-
2\TUTORIAL\CEO2。
3.放大（按住左键选择放大区域）第一个衍射峰，27.5-29.5°。
4.手动插入峰位：打开“Peak Details”对话框，选择split-PVII 函数(SPVII)，点击左键，
在目标位置插入一个峰。
说明：蓝色“弹力球”随衍射图谱移动，点击左键会在弹力球停靠的位置插入峰。蓝色实
线代表峰位。按F9可删除距离鼠标最近的插入峰。
3
5.在主参数窗口，查看“Emission Profile（光源信息）”。右键“Load Emission Profile”
载入预先定义好的光源信息文件CUKA2_ANALYT.LAM。文件默认位置为：C:\TOPAS4-
2\LAM。
4
6. 在参数窗口，可改变插入峰的初始值及修正命令--Code（修正--Refine还是固定--Fix）。
展开“Peaks Phase”(点它前面的加号)，其中“Peak SPVII”选项，则会显示所有参数的
数值及修正命令。
7. 如要计算误差，点击菜单栏“Fit>Calculate Errors”。
8. 在拟合窗口，点击“Run”键开始拟合。
在数据窗口，随参数变化的计算图谱以红色线显示。灰色曲线为测试图谱和计算图谱之间
的差值。拟合结束时会弹出对话框，询问拟合是否收敛？如拟合图谱和测试图谱相匹配，
则点击“Yes”，修正参数会替代初始值。
5
9. 在参数窗口可查看参数修正结果。
10.保存结果，存成.PRO文件。
说明：TOPAS文件（.PRO文件）包含测量数据、修正模型、修正参数及所有用户自
定义设置。重新载入pro文件，可修改修正模型或是修正参数继续拟合。同时也可把此文
件作为模版，替换类似数据进行计算（后面会介绍）。
2.1.1.2 利用基本参数法（FPA）进行单峰拟合
1. 打开TOPAS
2. 调入数据：LaB6.raw，文件默认位置为：C:\TOPAS4-2\TUTORIAL\MISC。
3. 选择FP（基本仪器参数法）作为峰形函数，并在目标位置手动插入峰。
4. 载入光源文件：CUKA5.LAM。
5. 使用基本参数法，需设置仪器参数。查看“Instrument”选项，根据如下配置设置仪器
参数：
6
6. 运行“Run”，开始拟合。
7
2.1.2利用约束条件进行线形分析
本节包括3部分：
I．无约束条件的线形分析
II．有约束条件的线形分析
III．基本参数法进行线形分析
I：无约束条件的线形分析
1.打开TOPAS。
2.调入数据：Quartz.raw，文件默认位置为：C:\TOPAS4-2\TUTORIAL\MISC。
3. 选择SPVII作为峰形函数，并在目标位置手动插入峰，第一、三、四峰。
石英的“五指峰”：实际为三个衍射峰，其余为Ka2峰。其中第二个峰的Ka2和第三
个峰的Ka1重叠。从图谱可知，三个衍射峰中中间的峰最强。根据Ka2的峰强，可判断第
一个峰比最后一个峰强。
4.载入光源文件：CUKA2_ANALYT.LAM。
5.拟合数据。如图所示，拟合结果与测试曲线符合很好，且Rwp=2.1%也说明拟合结果很
好。
8
6. 貌似拟合结果很好。但是，在参数窗口检查修正参数（半高宽、积分面积等）结果时发
现：第三个峰的峰面积比第二个峰大50%，但是从图谱可知第二个峰面积最大。所以拟合
结果是不合理的。
7.为更直观的观察，显示所有单个拟合峰。具体操作可参照下表：
9
拟合结果不合理的主要原因在于：后两个峰的严重重叠导致分峰时强度不准确。这种
情况下，如果不用约束条件很难得到合理的单峰强度。
II. 有约束条件的线形分析
利用线形分析合理拟合石英的五指峰，需要设定一些约束条件，比如相同的半高宽及
对称性等参数。在TOPAS中可通过设定相同的变量名来实现。
8. 在参数窗口中查看“Peaks SPVII”项，选择“CODE”界面。把三个峰的左右半高宽
（FWHM left\right）及左右指数（M left\right）4独立参数，并分别赋予相同的变量和初始
值。比如fwhm1=fwhm2=0.05，m1=m2=1。
10
9. 运行拟合。Rwp大约为4%，与无约束条件上相比略高，但拟合结果更加合理（特别是
积分强度—面积）。
III．基本参数法进行线形分析
10. 查看“Peaks Phase”选项，选择“Value”界面。改变峰形函数（Peak Type）为FP。
12. 使用基本参数法，设置仪器参数：
11
13. 运行拟合。Rwp大约为3.8%，虽然仍高于无约束条件结果，但拟合结果更加合理。
12
2.1.3全谱线形拟合
1. 打开TOPAS
2. 调入数据：Y2O3.raw，文件默认位置为：C:\TOPAS4-2\TUTORIAL\MISC。
3. 选择FP作为峰形函数。
4. 进行寻峰（Peak Search ）操作。在“Peak Search Dialog”对话框中设定“Peak
Width=0.14”和“Noise Threshold=2”。
6. 查看“Background”选项，使用“Chebychev Polynomial”，级数（order）“5”。
13
7. 使用如下设备参数：
8. 设定各向同性晶粒尺寸参数。查看“Peaks Phase”选项，选择“CODE”界面，把所有
晶粒尺寸（Cry Size L）设为同一变量“csl”。
14
9. 运行拟合。
15
2.2指标化
2.2.1 LSI指标化
LSI : Iterative method of least squares 最小二乘迭代法。
2.2.1.1 Ex2指标化
典型的LSI指标化包括以下三个步骤：
I.寻峰和峰形拟合
II. 指标化
III. Pawley或LeBail精修
I.寻峰和峰形拟合
1. 打开TOPAS，调入数据Ex2.xdd，主要文件类型选择xdd。文件默认位置：C:\TOPAS4-
2\TUTORIAL\LSI。注：文件夹内有pro文件，可打开参考。
16
2. 设置光源信息：λ=1.4011Å。删除光源文件：选中目标，按键盘上的“Delete”键。
3. 查看“Background”选项，使用“Chebychev Polynomial”，级数（order）“2”使用
“1/x Bkg”。
4. 设备选项选择“Simple Axial Model ”，同时“Code”改为“Refine”。
17
5. 采用FP函数对前24个衍射峰进行峰形拟合。手动插入前24个峰，运行拟合。
18
II．指标化
6. 创建指标化项：右键“Peak Phase 0”，选择“Create indexing Range”。
7．选中“Indexing”项。取消“Ex2.xdd”，通过点击其前面的蓝色小方框。选择可能的
Bravais 格子，本例全选。
说明：尽可能的减少所选的 Bravais 格子。
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8. 在拟合窗口点击“Run”运行。
9. 指标化的结果以列表形式显示在“Solutions”界面。此例的正确解为：Trigonal R3，
a=81.301Å，c=73.052Å，Vol=418173Å3。
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选中结果列表中的解，计算峰位会实时的显示在数据窗口。同时，如选中数据
“Ex2.xdd”则原始数据、拟合结果及指标化结果均会显示在数据窗口。
III. Pawley或LeBail精修
10. 在“Solutions”界面，选择想修正的解。点击右键“Copy all/selection”复制指标化结
果。
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11. 选择“Ex2.xdd”，取消“Indexing”项。右键“Ex2.xdd”，点击“Add hkl Phase”插
入 hkl_I 项。
12.查看“Corrections”项，选中“Zero error”且“Code”改为“Refine”。
选择“Miscellaneous”选项，按如下设置：
22
13. 查看“Peak Phase” ，选中“use”，取消对号，如下图。
14. 查看 hkl_Phase，选中“LeBail”。
23
15. 展开“hkl_Phase”，右键“Indexing Details”点击“Paste Indexing details”。
16. 运行拟合。
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2.2.2 LP 搜索
例子文件位置：C:\TOPAS4-2\TUTORIAL\PbSO4;
结果（pro 文件）位置：C:\TOPAS4-2\TUTORIAL\LP-SEARCH。
LP 搜索教程例子，R 为最大和最小晶胞参数的比值。
2.2.2.1 通用指南
LP 搜索是一种全谱分解方法，因此作为选项出现在 hkl phase 模型的 Phase Details 列
表中：LP Search。
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LP 指标化就是利用给定的初始空间群，从初值逐步寻找正确的晶胞参数。通常空间
群设定为相应晶系最低对称性的空间群。比如，三斜晶系为“1”号空间群、单斜为“3”
号空间群、而正交为“16”号空间群等等。
由于 LP 指标化方法晶胞参数和晶胞体积变化较大，所以必须限制其变化范围。上限
尽可能的小以避免计算过程中找到 2 倍或是 3 倍的晶胞参数。一般第一个衍射峰的 d 值被
认为是晶胞参数的上限。
2.2.2.2 LP 搜索指标化方法
1. 打开 TOPAS，调入 PbSO4.raw ，目标位置：C:\TOPAS4-2\TUTORIAL\PbSO4。
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以下部分为峰形及背底确定过程：
2. 光源选项，调入 Ka5。
3. 查看背底选项，选择 Chebychev 多项式 5 级和 1/x。
27
4. 按照下图输入仪器参数：
5. 查看 Corrections 选项，选中 LP factor 输入 26.4，如下图：
6. 查看 Miscellaneous 选项，Finish X 设置为 51.6（设定计算范围）。
7. 放大 10-51.6 度，点击 peak search，寻峰。
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如有没寻到的峰，需手动插入。注：21 度处和 44.5 附件均为两个峰。
两
个
峰
8. 查看 Peaks Phase 选项，峰形 TYPE 均选择：FP
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9. 点击上图中“Codes”按钮，Cry Size L 项的“Refine”均改为“cry”
10．点击拟合，得到 Cry size L 为 280.9。
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11. 查看 Background，把 Refine 改为 Fix。
以下部分为 LP search 部分：
12. 删除 Peaks Phase，并右键数据 PbSO4.raw，选择 Add hkl Phase。
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13. 查看 hkl_Phase,按下图输入参数。
选中 LP Search：进行 LP 搜索指标化；选择空间群：四方晶系的第一个空间群：P222
（16 号）。给定晶胞参数的初始值以及变化范围，这里 3-15。晶胞参数 code 为 Refine。
输入上述得到的 cry size L 值：280.9；code 为 fix。选中 Cell Volume，并设定 min 和 max
值：100 和 400 。
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14. 在拟合窗口，打开 Refinement Options，选中“Continue After Convergence”，OK。
15. 点击拟合，观察拟合窗口 Rwp 的变化，当 Rwp<9%时，认为找到了正确的晶胞参数。
此时，点击停止，选 Yes。软件会自动显示 Rwp 最小时的晶胞参数值。
注：此时在工作区计算图谱和实验图谱可能匹配的不是很好，因为红色计算图谱显示
的为最好一轮的计算结果，它不一定是最佳值。而最佳值已显示在晶胞参数栏了。
以下部分为精修晶胞参数
16. 取消 Continue After Convergence 选项，OK。
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17. 取消 LP Search 项，点击拟合（也可以把背底、Zero error（零点）、Cry size L（晶粒
尺寸）都放开，一起修正）。
18. 查看 Miscellaneous 选项，放开修正范围，比如 Finish X 设为 90 度。再拟合。查看结
果是否满足整个图谱。
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2.3全谱分解
2.3.1Pawley法
以ALVO4为例：
1. 打开 TOPAS，调入 AlVO4.raw ，目标位置：C:\TOPAS4-2\TUTORIAL\AlVO4
2. 光源文件：Ka1.lam
3. 背底选择多项式 4 级。
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4. “Instrument”选项，如下图：
5. Corrections 选项，如下图:
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6. 选择“Miscellaneous”选项，做如下修改：
7. 插入 hkl_Phase：右键数据“AlVO4 .raw”，点击“Add hkl Phase”:
8. 选择 hkl_Phase 项，按照下表选择并输入参数：
38
点击“Peak Tye”，在 peak Tye 后面的框中选择“PV_TCHZ”函数：
39
9. 运行拟合。
10. 改变修正范围，取消 Finish，Miscellaneous 选项：
11. 运行拟合。
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41
2.3.2Le Bail法
以PbSO4为例：
1. 打开 TOPAS，调入 PbSO4.raw，目标位置：C:\TOPAS4-2\TUTORIAL\PbSO4。
2. 光源文件：CuKa5.lam；背底选择 Chebychev 多项式 4 级和 1/x 函数。仪器参数如下图：
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3. Corrections 选项：
4. 插入 hkl_Phase：右键数据“PbSO4 .raw”，点击“Add hkl Phase”,并按如下图输入参数：
43
5. 运行拟合。
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2.4 Rietveld 结构精修
以PbSO4为例：
1.打开 TOPAS，调入数据 PObSO4.raw。
2. 光源文件：CuKa5.lam；背底选择 Chebychev 多项式 4 级和 1/x 函数。仪器参数如下图：
3. Corrections 选项：
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4. 输入结构信息。TOPAS 支持三种方式输入结构信息：
a. 手动添加结构信息，Add Structure；
b. 调入 TOPAS STR 文件；
c. 调入 CIF 通用结构文件。
此处，手动添加结构信息。
插入一个新的结构。右键 PbSO4.raw，选择 Add Structure，并命名为 PbSO4。
5. 选择“PbSO4”选项，按下图选择和输入结构参数：
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6. 展开（点击加号）PbSO4 结构选项，选择“Sites”，点击左下角“Add Site at bottom”
插入 5 个原子位置，并按下图输入参数：
注：特殊位置，0、1、1/2、1/3、2/3、1/4、3/4、1/6、5/6、1/8、3/8、5/8、7/8 等。其中
1/3、2/3、1/6、5/6 等位置，要在 Codes 中以“=1/3”的方式表示。
7. 转到“Codes”选项，按下图该表坐标修正命令:
47
特殊位置不用修正，且如特殊位置为 1/3、2/3、1/6、5/6 等位置，要在 Codes 中以
“=1/3”的方式表示。
8. 运行拟合，可保存结果。
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2.5Rietveld定量分析
2.5.1CPD-2定量分析（择优取向）
CPD-2样品含有“Corundum、Fluorite 、Zincite和 Brucite”四种物相。
1. 打开TOAPS，调入数据CPD-2.raw，目标位置：C:\TOPAS4-\Tutorial\qparr。
2. 调入光源文件CuKa5.lam。
3. 背底模型：选择4级多项式和1/x函数。
4. Insturment项如下图：
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5. Corrections项：
注：“Absorption”选项描述由样品吸收（透明效应）引起的线形畸变。透明效应为
BB几何的固有特征。吸收参数给出了样品有效平均吸收系数。此参数为BB几何的基本参
数。但是，只有当仪器和所有物相的微观特性被正确描述时，它才有物理意义。否则，它
只能作为一种函数来描述峰形不对称性。
6. 调入结构文件。
TOPAS软件支持的结构文件分两种：
• “str” 文件： TOPAS专用结构文件。可到“Structure_Database”文件夹（Bruker
提供）中寻找，其内有各种矿物的结构文件（几百种），如石英：Quartz、
Tridymite；方镁石：Periclase等等。
• “cif”格式的文件：通用结构文件。可通过“FindIt”软件（ICSD收费软件，需
购买）获得。或是到一些免费网站下载，如www.crystallogtaphy.net。
具体查找结构文件方法，请参看“EVA定性及TOPAS定量分析步骤”。
50
先以STR文件为例：
右键“CPD-2”，选择Load STR(s):
载入相应的物相结构文件，默认位置：C:\TOPAS4\TUTORIAL\QPARR。
7. 运行拟合。
51
发现拟合结果很差，Rwp大概在30%左右。特别是Brucite的18.6度的（001）衍射峰差别很
大，原因为择优取向。
8. 修正择优取向。选择Brucite结构项，并展开（点加号）。点击“Preferred Orientation”，
点中“Use”，把上边得到的(0 0 1) 填入“Direction1”，“Fix”改成“Refine”。
9. 再运行拟合。
52
10. 右上角给出了个物相的质量百分比。下表为TOPAS计算结果和XRF测量结果对比。
11. 保存结果。
下面我们调入另外一种结构文件：Cif文件
12. 1-5步相同，调入结构文件时选择“Load CIF(s)”。四种物相Cif结构文件默认位置
C:\TOPAS4-\Tutorial\qparr。
13. 检查各物相的cif结构文件，需做如下修改：
① 晶胞参数，“Codes”改为“Refine”。晶胞参数 a 、b、 c、 alpha、 beta、 gamma 都
改成“refine”，双击“fix”即可改好，如 Zincite（ZnO）的结构文件只有 a 和 c，改这两个
即可。
②原子坐标: “Sites”修改。检查原子坐标 x、y、z 是否有 1/3、2/3、1/6 等不能整除的特殊
位置，要在“Codes” 中以“=1/3”的方式表示。如下图所示：
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③原子散射因子：“Atom”修改。在下拉菜单中找到和实际元素化学价匹配的选项。比
如Zn为+2价。如下拉列表中没有，则用原子代替。
54
14. 运行拟合：Run。
15. 修择优。
16.查看结果，发现定量结果准确度有一定下降。如认为2%的误差可以接受，则保存结果。
原因：由于背底、Instruments及微结构模型均相同，所以只能是调入结构的不同导致。虽
然我们已修改了cif文件，但其结构信息仍不完全。具体为“温度因子，Beq.”信息不准确。
55
根据下表修改“Beq”：
17. 再运行拟合。
56
18. 保存结果。
注：当Cif文件修改好后，右键点击“Save Structure in STR format”，可保存成Str格式以
便以后使用。
57
2.5.2 CPD-3定量分析（非晶相定量）
含有非晶态的样品，定量分析需外加一定量的已知标样。
CPD-3样品含有四个物相：
非晶相（Glass）、 Corundum（Al2O3）、Fluorite（CaF）、Zincite（ZnO）。
其中，Corundum为外加标样，含量为30.79%。
1. 打开TOAPS，调入数据CPD-3.raw，目标位置：C:\TOPAS4-\Tutorial\qparr。
2. 调入光源文件CuKa5.lam。
3. 背底模型：选择5级多项式和1/x函数。
4. Insturment项如下图：
58
5. Corrections项：
6. “Miscellaneous”选项：
从24°开始计算，绕开非晶漫散包。
7. 右键CPD-3.raw，载入结构文件。
59
8. 展开“Structures/ hkl Phases”选项，点击“Quantitative”项。定义Corundum为内标相，
并在“wt% of Spiked”中输入其已知含量。
9. 运行拟合，查看定量结果。
Wt% Rietveld：各晶态物相的相对百分含量，不含非晶态；
Wt% in Spiked sample：所有物相的绝对百分含量；
Wt% in Original sample：实际样品中各物相的绝对百分含量，不包括外加内标相
（corundum）。
60
10. 如果想把图谱拟合的更好，则可以用Peak Phase来描述非晶包。 “Miscellaneous”项
中去掉24°开始。
在非晶漫散包出插入一个峰（Peak Phase），函数选择FV。
61
11. 运行拟合。
62
2.5.3 OPC定量分析（水泥定量）
使用模版（pro 文件）进行快速定量分析。OPC 样品为 NIST RM8486、RM8487、
RM8488 水泥标样。
本节中 pro 文件 OPC.pro 已经建立。三个样品的定性分析如下：
1. 打开 TOPAS，调入 OPC.pro 文件，目标文件位置：C:\TOPAS4\TUTORIAL\QA。
默认数据 D8-8486。
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2. 在参数窗口，选择 Structures/ hkl Phases 选项。根据定性分析结果（上表），选择物相。
3. 运行拟合，查看结果。
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4. 使用 OPC 模板，分析其它两个数据。重新调入 OPC.pro。
5. 替换数据。右键 D8-8486.raw，点击“Replace Scan Data”，选择 D8-8487.raw 或 D8-
8488.raw。
6. 重复步骤 2-3 。
65
3.杂项
3.1计算结晶度
谱线拟合计算聚合物结晶度
1. 打开TOPAS，调入数据m2a.raw，默认位置：C:\TOPAS4-2\TUTORIAL\DOC。
2. 光源：默认。背底选择多项式1级和1/x函数。
3. Corrections选项，去掉“LP factor”后的“√”，即不使用。
66
4. 首先，用一个Peak Phase描述非晶漫散峰。插入一个SPV函数在非晶峰的最高处。
把“Peaks Phase ”重新命名为“Amorphous”：
67
5. 运行拟合。
6. 其次，再用一个Peaks Phase来描述晶态相。右键m2a.raw，点击“Add Peaks Phase”：
68
重新命名为“Crystalline”：
在每个衍射峰的位置手动插入一个SPV函数。建议方法：分步拟合。先拟合较强的衍射峰。
69
7. 运行拟合。
8. 再增加弱衍射峰，最终拟合。
70
9. 点击“Miscellaneous”选项，选择“Degree of crystallinity”：
选择非晶相，在“Phases”中，把“Crystalline”后面的“对号”去掉。点击“Calculate
Degree of crystallinity”。
71
4. 刚体编辑器
作用：可 3D 结构图和设置结构限制命令。
CeO2 结构
C5H5
72
刚体编辑器表示原子有两种方式或是命令：“Point_for_site”和“Z_matrix”。两者
可以单独使用，亦可同时使用。
4.1. 刚体结构图的创建
4.1.1 分数坐标或卡迪尔坐标系（直角坐标系）
以 ZrO6 八面体为例：
1. 打开 TOPAS
2. 点击菜单栏中的“Tools>New Rigid-body editor Window。
3．在刚体编辑器的编程界面，输入如下命令：
prm r 2 (定义一个参数r，值为2，括号内的内容不用输入)
rigid （建立刚体模型命令）
point_for_site Zr （在0，0，0位置放置一个Zr原子）
point_for_site O1 ux = r; （在2，0，0位置放置第一个O原子）
point_for_site O2 ux = -r; （在-2，0，0位置放置第二个O原子）
point_for_site O3 uy = r; （在，2，0位置放置第三个O原子）
point_for_site O4 uy = -r; （在0，-2，0位置放置第四个O原子）
point_for_site O5 uz = r; （在0，0，2位置放置第五个O原子）
point_for_site O6 uz = -r; （在 0，0，-2 位置放置第六个 O 原子）
73
点击“update Alt-F1”。
74
4.1.2 Z-matrix 表示
还是已 ZrO6 八面体为例子:
1.在刚体编辑器的编程界面，输入如图下命令：
其中，Zr =r 代表距离 Zr 原子的距离为 r，“z_matrix O2 Zr =r; O1 90” 中的“O1 90”代
表 O2 原子与 Zr-O1 的夹角为 90 度。
2.点击 update。
75
利用刚体编辑器创建苯环模型：
76
4.2 利用文献中的结构参数建立刚体模型
考虑如下结构片段，H 原子被忽略：
根据文献，它的各原子的坐标如下：
x y z
O1 0.5255 0.243 0.871
C1 0.6106 0.256 0.842
C2 0.6458 0.463 0.681
C3 0.6613 0.063 0.973
C4 0.7317 0.477 0.652
C5 0.7472 0.077 0.943
C6 0.7824 0.284 0.783
C7 0.8741 0.298 0.752
O2 0.9091 0.511 0.692
O3 0.9179 0.104 0.83
原子的分数坐标是相对于晶胞参数而言，即其坐标基矢为晶胞参数。所以用刚体编辑
器表示原子分数坐标，需转变为卡迪尔坐标，就是乘以每个方向的晶胞参数。
上述结构的晶胞参数：
a (Å) 16.0608 ； b (Å) 5.38291 ；c (Å) 3.63834
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具体输入内容如下图：
1.输入，然后 update。
2.可以把上图的卡迪尔坐标变换为更加有用的 Z-matrix 表示法。点击“First guess Z
matrix”。
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4.3 扭转（Torsions）
当使用 Z-matrix 表示方式时，对每个原子的键长和键角进行修正变得非常方便。
TOPAS 软件有很多种方式引入和修正刚体的扭转，具体细节请参考技术参考手册。最简
单的宏命令为：
Rotate_about_points
以 4.2 中例子为例：
插入命令：
Rotate_about_points(45, C6, C7, “O2 O3”)

其中，“45”代表转动 45 角度，“C6， C7”代表这两个原子组成的矢量方向为旋转矢
量方向，““O2 O3””代表要转动的原子，这里为两个。
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TOPAS 4.2 中文教程2013830103816 PDF

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BRUKER AXS GMBH

DIFFRAC TOPAS 4.2

德国布鲁克 AXS 有限公司北京代表处

2.4 Rietveld 结构精修---------------------------------------45

GUI （窗口式用户界面模式）和 Launch 模式（直接命令模式）

2. 利用“Import Data File(s)”调入数据：CeO2.raw，文件默认位置为：C:\TOPAS4-

4.手动插入峰位：打开“Peak Details”对话框，选择split-PVII 函数(SPVII)，点击左键，

5.在主参数窗口，查看“Emission Profile（光源信息）”。右键“Load Emission Profile”

展开“Peaks Phase”(点它前面的加号)，其中“Peak SPVII”选项，则会显示所有参数的

（FWHM left\right）及左右指数（M left\right）4独立参数，并分别赋予相同的变量和初始

10. 查看“Peaks Phase”选项，选择“Value”界面。改变峰形函数（Peak Type）为FP。

4. 进行寻峰（Peak Search ）操作。在“Peak Search Dialog”对话框中设定“Peak

晶粒尺寸（Cry Size L）设为同一变量“csl”。

4. 设备选项选择“Simple Axial Model ”，同时“Code”改为“Refine”。

说明：尽可能的减少所选的 Bravais 格子。

10. 在“Solutions”界面，选择想修正的解。点击右键“Copy all/selection”复制指标化结

11. 选择“Ex2.xdd”，取消“Indexing”项。右键“Ex2.xdd”，点击“Add hkl Phase”插

13. 查看“Peak Phase” ，选中“use”，取消对号，如下图。

15. 展开“hkl_Phase”，右键“Indexing Details”点击“Paste Indexing details”。

LP 搜索是一种全谱分解方法，因此作为选项出现在 hkl phase 模型的 Phase Details 列

尽可能的小以避免计算过程中找到 2 倍或是 3 倍的晶胞参数。一般第一个衍射峰的 d 值被

1. 打开 TOPAS，调入 PbSO4.raw ，目标位置：C:\TOPAS4-2\TUTORIAL\PbSO4。

3. 查看背底选项，选择 Chebychev 多项式 5 级和 1/x。

5. 查看 Corrections 选项，选中 LP factor 输入 26.4，如下图：

6. 查看 Miscellaneous 选项，Finish X 设置为 51.6（设定计算范围）。

7. 放大 10-51.6 度，点击 peak search，寻峰。

如有没寻到的峰，需手动插入。注：21 度处和 44.5 附件均为两个峰。

8. 查看 Peaks Phase 选项，峰形 TYPE 均选择：FP

9. 点击上图中“Codes”按钮，Cry Size L 项的“Refine”均改为“cry”

10．点击拟合，得到 Cry size L 为 280.9。

11. 查看 Background，把 Refine 改为 Fix。

以下部分为 LP search 部分：

12. 删除 Peaks Phase，并右键数据 PbSO4.raw，选择 Add hkl Phase。

（16 号）。给定晶胞参数的初始值以及变化范围，这里 3-15。晶胞参数 code 为 Refine。

输入上述得到的 cry size L 值：280.9；code 为 fix。选中 Cell Volume，并设定 min 和 max

14. 在拟合窗口，打开 Refinement Options，选中“Continue After Convergence”，OK。

15. 点击拟合，观察拟合窗口 Rwp 的变化，当 Rwp<9%时，认为找到了正确的晶胞参数。

此时，点击停止，选 Yes。软件会自动显示 Rwp 最小时的晶胞参数值。

16. 取消 Continue After Convergence 选项，OK。

17. 取消 LP Search 项，点击拟合（也可以把背底、Zero error（零点）、Cry size L（晶粒

18. 查看 Miscellaneous 选项，放开修正范围，比如 Finish X 设为 90 度。再拟合。查看结

1. 打开 TOPAS，调入 AlVO4.raw ，目标位置：C:\TOPAS4-2\TUTORIAL\AlVO4

7. 插入 hkl_Phase：右键数据“AlVO4 .raw”，点击“Add hkl Phase”:

点击“Peak Tye”，在 peak Tye 后面的框中选择“PV_TCHZ”函数：

10. 改变修正范围，取消 Finish，Miscellaneous 选项：

2. 光源文件：CuKa5.lam；背底选择 Chebychev 多项式 4 级和 1/x 函数。仪器参数如下图：

4. 插入 hkl_Phase：右键数据“PbSO4 .raw”，点击“Add hkl Phase”,并按如下图输入参数：

2.4 Rietveld 结构精修

1.打开 TOPAS，调入数据 PObSO4.raw。

2. 光源文件：CuKa5.lam；背底选择 Chebychev 多项式 4 级和 1/x 函数。仪器参数如下图：

b. 调入 TOPAS STR 文件；

插入一个新的结构。右键 PbSO4.raw，选择 Add Structure，并命名为 PbSO4。

6. 展开（点击加号）PbSO4 结构选项，选择“Sites”，点击左下角“Add Site at bottom”

1/3、2/3、1/6、5/6 等位置，要在 Codes 中以“=1/3”的方式表示。

特殊位置不用修正，且如特殊位置为 1/3、2/3、1/6、5/6 等位置，要在 Codes 中以

CPD-2样品含有“Corundum、Fluorite 、Zincite和 Brucite”四种物相。

• “str” 文件： TOPAS专用结构文件。可到“Structure_Database”文件夹（Bruker

12. 1-5步相同，调入结构文件时选择“Load CIF(s)”。四种物相Cif结构文件默认位置

① 晶胞参数，“Codes”改为“Refine”。晶胞参数 a 、b、 c、 alpha、 beta、 gamma 都

改成“refine”，双击“fix”即可改好，如 Zincite（ZnO）的结构文件只有 a 和 c，改这两个

②原子坐标: “Sites”修改。检查原子坐标 x、y、z 是否有 1/3、2/3、1/6 等不能整除的特殊

注：当Cif文件修改好后，右键点击“Save Structure in STR format”，可保存成Str格式以

8. 展开“Structures/ hkl Phases”选项，点击“Quantitative”项。定义Corundum为内标相，