You are on page 1of 5

Prace poglądowe

on the perinatal development of the gut structure and of Gram-positive and Gram-negative bacteria to the gut 14. Mickiewicz M., Zabielski R., Grenier B., Le Normand L.,
function. Reprod. Biol. 2014, 14, 51–60. epithelium – in vitro study. J. Physiol. Pharmacol. 2008, Savary G., Holst J.J.: Structural and functional develop-
7. Skrzypek T., Valverde Piedra J.L., Skrzypek H., Kazimier- 59, 795–810. ment of small intestine in intrauterine growth retarded
czak W., Biernat M., Zabielski R.: Gradual disappearance 11. Fanca-Berthon P., Hoebler C., Mouzet E., David A., Mi- porcine offspring born to gilts fed diets with differing pro-
of vacuolated enterocytes in the small intestine of neona- chel C.: Intrauterine growth restriction not only modi- tein ratios throughout pregnancy. J. Physiol. Pharmacol.
tal piglets. J. Physiol. Pharmacol. 2007, 58, 87–95. fies the cecocolonic microbiota in neonatal rats but also 2012, 63, 225–239.
8. Skrzypczak W., Stefaniak T., Zabielski R.: Fizjologia nowo- affects its activity in young adult rats. J. Pediatr. Gastro- 15. WHO, Department of Child and Adolescent Health and
rodka z elementami patofizjologii. PWRiL, 2011, 53–60. enterol. Nutr. 2010, 51, 402–413. Development. Interventions for physical growth and psy-
9. D’Inca R., Kloareg M., Gras-Le Guen C., Le Huërou-Lu- 12. Zhong G., Wang T., Zhang X., Li W.: Heat shock protein chological development; 1999.
ron I.: Intrauterine growth restriction modifies the de- 70 is upregulated in the intestine of intrauterine growth
velopmental pattern of intestinal structure, transcripto- retardation piglets. Cell Stress Chaperones.2010, 15,
mic profile, and bacterial colonization in neonatal pigs. ­335–342.
J. Nutr. 2010, 140, 925–931. 13. Liu H.Y., Dicksved J., Lundh T., Lindberg J.E.: Expression
10. Jankowska A., Wrzesinski M., Laubitz D., Kazimierczak of heat shock proteins 27 and 72 correlates with specific
W., Skrzypek H., Bardowski J.: Intestinal MMC-related commensal microbes in different regions of porcine ga- Karolina Ferenc,
Electric fields and pancreatic juice control the adhesion strointernal tract. Americ. J. Phys. 2010, 51, 402–413. e-mail: karolina.ferenc@hotmail.com

Microbiome – its characteristics and the role Mikrobiom –


Gliński Z., Kostro K., Faculty of Veterinary charakterystyka i znaczenie
Medicine, University of Life Sciences in Lublin

The aim of this article was to present the role of mi- Zdzisław Gliński, Krzysztof Kostro
crobiome and its significance for each animal host.
Human and animal microbiome consists of diverse z Wydziału Medycyny Weterynaryjnej w Lublinie
species of microbes. Many of them cannot be cultivat-
ed outside the host as they establish unique genom- miejscach, np. przewód pokarmowy, skóra, Badania nad mikrobiomem zostały pod-
ic and environmental interactions. Gut microbiome układ rozrodczy, górne drogi oddechowe, jęte w latach 90. XX w. Zaczęto nawet mi-
can influence stress, anxiety, and depression-relat- i dlatego można rozróżnić w organizmie krobiom określać jako „nowo odkryty na-
ed behavior via effects on the host neuroendrocrine mikrobiomy zasiedlające różne obszary rząd” wpływający na stan zdrowia oraz
system. Beneficial effects of the microbial commu- ciała. Odkrycie, że mikrobiom u człowie- czynnik decydujący o  wystąpieniu pew-
nities on human and animal physiology range from ka, a także u zwierząt, wpływa na rozwój nych chorób. Ustalono przy tym, że liczeb-
influencing local immunity development, homeosta- i różnorodne funkcje organizmu, zinten- ność komórek mikrobiomu przewyższa
sis and food digestion to balancing the host metab- syfikowało jego badania (1). Dużym bodź- 10-krotnie liczbę komórek, z których jest
olism and promoting numerous diseases, including cem były badania nad mikrobiomem gleby zbudowany organizm zdrowego człowie-
inflammatory bowel disease, diabetes mellitus, obe- i poszukiwanie bakterii glebowych wytwa- ka, a jego masa wynosi około 2 kg.
sity, ­cardiovascular diseases and cancer. Microbiome rzających nowe antybiotyki, ale też sub-
plays the key role in education and modulation of the stancje pomocne w leczeniu nowotworów Charakterystyka mikrobiomów
innate and adaptive immunity. The composition and oraz powielenie ich genów. Jednak dopie-
functions of microbiome and its role in human and ro z chwilą wprowadzenia nowych technik W  procesie ewolucji pojawiły się moż-
animal diseases are discussed. identyfikacji drobnoustrojów, głównie me- liwości zasiedlenia przez drobnoustroje
tod genetycznych, a ostatnio metody iChip, nowych nisz ekologicznych i pozyskiwa-
Keywords: microbiome, innate and adaptive umożliwiającej izolację i hodowlę bakterii, nia nowych źródeł pożywienia. Następ-
immunity, diseases. których dotychczas nie można było hodo- stwem tego procesu, jak również kontak-
wać na sztucznych podłożach, a które były tów pomiędzy człowiekiem, zwierzętami
wykrywane metodami genetycznymi, wie- a środowiskiem, jest obecność przez całe

N owe odkrycia z dziedziny mikrobiolo-


gii i immunologii, rozwój metod iden-
tyfikacji mikroorganizmów, nowatorskie
dza o składzie mikrobiomu, głównie czło-
wieka i gleby, uległa ogromnemu wzboga-
ceniu. IChip (Insertional chromatin im-
życie lub tylko okresowo, zarówno na po-
włokach ciała, jak i w ciele licznych, często
bardzo zróżnicowanych populacji drobno-
sposoby rozwiązywania problemów na- munoprecipitation) umożliwia hodowlę ustrojów, pozostających przez całe życie
ukowych, podejmowanie prób coraz do- mikrokolonii bakterii w  ich naturalnym lub tylko okresowo. Są to głównie drob-
kładniejszego wyjaśniania przyczyn zja- środowisku, np. w glebie, w żywym orga- noustroje saprofityczne lub komensale,
wisk i ich wzajemnych powiązań umożli- nizmie człowieka lub zwierząt (2). Tą me- a tylko incydentalnie drobnoustroje cho-
wiło odkrywanie nieznanych dotychczas todą można badać drobnoustroje, które robotwórcze.
dziedzin wiedzy. Taką nową dziedziną, znanymi metodami nie dają się hodować Każdą część ciała zasiedla specyficzna
budzącą coraz większe zainteresowanie w  laboratorium na sztucznym podłożu. populacja drobnoustrojów określanych
nauk biologicznych, medycyny i agrobio- Stosując iChip, nie trzeba ich odizolowy- jako mikrobiom, ściśle dopasowana do
logii, jest mikrobiom. Mikrobiom tworzą wać od otoczenia, co często jest niemoż- poszczególnych miejsc ciała u osobników
wszystkie drobnoustroje saprofityczne, ko- liwe, i przenosić do laboratorium. Wyda- określonego gatunku w określonym prze-
mensale i pasożyty które zasiedlają orga- je się, że większość bakterii potrzebuje do dziale wiekowym (np. noworodki, mło-
nizm ludzi, zwierząt, roślin lub glebę, ich swojego rozwoju współdziałania z innymi dzież, osoby dorosłe). Zwykle spełnia ona
genomy i wzajemne zależności oraz inte- bakteriami tworzącymi mikrobiom i pro- funkcję ochronną, dzięki współzawodnic-
rakcje ze środowiskiem. Mikrobiom nie dukowanymi przez nie substancjami oraz twu o  miejsce oraz o  pokarm z  drobno-
jest przypadkowo rozproszony w organi- odpowiednich ich proporcji, które wystę- ustrojami warunkowo chorobotwórczy-
zmie, ale lokalizuje się w ściśle określonych pują w naturalnych warunkach. mi i patogenami (1).

446 Życie Weterynaryjne • 2015 • 90(7)


Prace poglądowe

Mikrobiom, zwłaszcza człowieka, które- w skład mikrobiomu zdrowej skóry i jest Bergeyella zoohelcum, Capnocytophaga
go skład dość precyzyjnie ustalono w opar- jednym z czynników, które chronią ją przed canimorsus, C. cynodegmi, Nocardia spp.,
ciu o analizę rybosomalnego 16S rRNA, ba- patogenami (8). Ponieważ skóra człowieka Mycoplasma feliminutum, Ureaplasma
dania metagenomiczne, a ostatnio technikę produkuje łój zawierający więcej triglice- spp.. Mikroflorę beztlenowa tworzą: Bacte-
iChip, wykazuje daleko posunięte zróżnico- rydów aniżeli skóra innych gatunków ssa- roides spp., Porphyromonas spp., Prevotella
wanie. Pomimo różnic pomiędzy poszcze- ków, na skórze człowieka P. acnes wystę- spp., Fusobacterium spp., Clostridium spp.,
gólnymi ludźmi lub gatunkami zwierząt, puje obficiej (9). Często w  skórze zdro- Actinomyces viscosus, Peptostreptococcus
w mikrobiomach poszczególnych obszarów wej jest obecna Malassezia, rzadko skórę anaerobius, Wolinella spp. Żadne te bak-
ciała (skóra, treść jelit, układ moczowo- zdrową kolonizuje Candida. U diabetyków terie w jamie ustnej zdrowych osobników
-płciowy) występują zawsze pewne gatunki Candida, a  także S. epidermidis będący nie wywierają działania patogennego (13).
bakterii. U człowieka i zwierząt największy komensalem, powoduje zakażenie skóry. Najczęściej z  jamy ustnej człowie-
i najbardziej zróżnicowany mikrobiom wy- Mikrobiom skóry nie tylko chroni przed ka i  zwierząt izoluje się Bacteroides, Fu-
stępuje w jelitach. Jednak pomimo różnic patogenami, ale też indukuje odpowiedź sobacterium, Actinomyces, Clostridium
pomiędzy poszczególnymi ludźmi zawsze immunologiczną, oddziałując na limfo- i Peptostreptococcus. Na przykład u kotów
w skład mikrobiomu jelit wchodzą bakte- cyty T obecne w skórze (10). 72,66% izolatów należy do obligatoryjnych
rie z rodzajów Faecalibacterium, Rumino- beztlenowców, wśród nich Acctinomyces
coccus, Eubacterium, Dorea, Bacteroides, Mikrobiom jamy ustnej (A. vis­cosus, A. hordeovulneris i A. denti-
Alistipes i Difidobacterium (1, 3). i górnych dróg oddechowych colens) stanowiły 12%, Pasteurella multo-
cida 9,33%, Propionibacterium 6%. Bacte-
Mikrobiom skóry Jama ustna stanowi unikalne środowisko roides i Fusobacterium stanowiły 77% ob-
dla kolonizacji bakteryjnej dzięki kontak- ligatoryjnych beztlenowców, Clostridium
Skóra jest fizyczną barierą, która chroni tom z wodą, pożywieniem i glebą zanie- villosum 10,1%, Peptostreptococcus anaero-
wnętrze ciała przed zakażeniem, urazami czyszczoną przez drobnoustroje, w  tym bius 4,58%, Wolinella 6,42% (14). Mikro-
oraz działaniem substancji toksycznych. przez patogeny. Obecność zębów, któ- organizmy zasiedlające jamę ustną cechu-
Skóra jest przy tym złożonym ekosyste- rych powierzchnie nieulegające złuszcze- ją się kilkoma unikatowymi właściwościa-
mem z wysoce wyspecjalizowanymi nisza- niu umożliwiają namnożenie w  krótkim mi. Należy do nich zdolność do adherencji
mi ekologicznymi, które zasiedlają różne czasie dużej ilości drobnoustrojów. Kolo- oraz kongregacji i w efekcie do tworzenia
gatunki drobnoustrojów. Pełni ona też rolę nizacja jamy ustnej przez drobnoustroje biofilmów bakteryjnych. Wśród bakterii
„powierzchni granicznej” pomiędzy orga- i związane z nią nosicielstwo dzięki spraw- tworzących biofilm występuje S. epider-
nizmem i środowiskiem z występującymi ności układu odpornościowego z reguły nie midis, S. ureus, Pseudomonas aerugino-
w  nim drobnoustrojami (4). Pomimo że prowadzi do rozwoju stanów patologicz- sa, E. coli, Enterococcus faecalis (15, 16).
powierzchnia skóry nie jest dla mikroor- nych. Urazy oraz pojawienie się luk w sys- Następstwem tych działań jest tworzenie
ganizmów szczególnie przyjaznym środo- temie obronnym miejscowym jamy ustnej przez bakterie tlenowe i beztlenowce, pro-
wiskiem, skórę kolonizują drobnoustroje i ogólnym systemie obronnym organizmu dukty metabolizmu drobnoustrojów, gliko-
dla niej obojętne lub korzystne, niekiedy narusza równowagę biologiczną mikroflo- proteiny występujące w ślinie osadu na po-
też patogeny. W  skład mikrobiomu skó- ry jamy ustnej i powoduje jej przesunięcie wierzchni zębów o lepkiej konsystencji, co
ry człowieka wchodzą głównie bakterie w stronę choroby (11). prowadzi do pojawienia się płytki nazęb-
Gram-dodatnie (Staphylococcus epidermi- Jamę ustną noworodka zaczynają kolo- nej. Jej tworzenie zapoczątkowują ziarniaki
dis i Propionibacterium acnes). Tak jak mi- nizować Gram-dodatnie ziarniaki (S. sa- tworzące mikrokolonie na szkliwie zębów
krobiom jelit i mikrobiom skóry zdrowe- livarius), w  mniejszym stopniu pałeczki (17, 18, 19). Zarówno same bakterie (Acti-
go człowieka jest dość dobrze poznany, to Gram-ujemne (Lactobacillus) i  niektóre nomyces spp., Streptococcus spp.) tworzą-
nadal dysponujemy ograniczonymi wiado- beztlenowce. Populacja bakteryjna na języ- ce biofilm, jak i wydzielane przez nie pro-
mościami o mikroflorze saprofitycznej skó- ku i ścianach jamy ustnej różni się od bak- dukty wnikają do szczeliny dziąsłowej po-
ry świń, poza tym że w jej skład wchodzą terii występujących na zębach oraz w szcze- między zębem a wolnym brzegiem dziąsła
głównie bakterie Gram-dodatnie, a wśród linach międzyzębowych. Większość bak- i wraz z rosnącą warstwą osadu zmieniają
nich paciorkowce i gronkowce. Natomiast terii występujących na zębach to bakterie warunki środowiskowe na mikroaerofilne,
bakteryjna mikroflora patogenna skóry in- kwasu mlekowego. W warunkach fizjolo- co ułatwia zasiedlenie przez bardziej pato-
nych gatunków zwierząt jest trochę lepiej gicznych obecna w jamie ustnej tzw. opor- genne bakterie, których efektem działania
poznana, ale dotyczy to zwłaszcza bakterii tunistyczna mikroflora nie działa szkodli- są zmiany chorobowe (20). W miejscu za-
zakażających rany, a w mniejszym stopniu wie. Cechuje się ona przy tym zdolnością każenia wzrasta ilość Gram-ujemnych pro-
bakterii będących przyczyną chorób skóry. do zmian i do adaptacji w zmieniających teolitycznych bakterii, szczególnie Prophy-
I tak, u trzody chlewnej dobrze poznano się warunkach panujących w  jamie ust- romonas spp. i Tannerella spp., które domi-
zakażenia wywołane przez niektóre gatun- nej. Tylko część tej mikroflory może zmie- nują w biofilmie (21). W tych warunkach
ki gronkowców i paciorkowców, zwłaszcza niać się w zależności od rodzaju pokarmu bakterie, zwłaszcza anaeroby, przeformo-
przez Streptococcus suis, u psów florę bak- i stanu higieny jamy ustnej, część nie ule- wują szczelinę międzydziąsłową u  zdro-
teryjną odpowiedzialną za różne postacie ga zmianom. wych osobników w stosunkowo głęboką,
ropnego zapalenia skóry. Bakterie koloni- Badania ostatnich lat wykazały, że mi- chorobową kieszonkę dziąsłową. Zwiększa
zujące powierzchowne i głębsze warstwy kroflora jamy ustnej dorosłych osobników się ilość anaerobów Gram-ujemnych, obda-
skóry występują też w ślinie, spojówkach jest obfita i zróżnicowana (12). W jej skład rzonych ruchem (Prevotella spp., Porphy-
oczu oraz w przewodzie pokarmowym (5). wchodzą bakterie tlenowe: Streptococcus romonas spp., Actinobacillus actinomyce-
Mikroflora zdrowej skóry jest bardzo spp., Pasteurella multocida subsp. multo- temcomitans, Tannerella forsytha, Trepo-
zróżnicowana (6). Tworzy ją Propionibac- cida, P. multocida subsp. septica, P. mul- nema spp.) zapoczątkowujących zapalenie
terium acnes, Staphylococcus epidermidis, tocida subsp. gallicida, P. canis, Moraxella przyzębia. Z chorób przyzębia izolowano
Staphylococcus aureus, Corynebacterium spp., Flavobacterium sensu lato, Pseudomo- też Actinomyces israeli (22).
spp., Pseudomonas aeruginosa (7). Staphy- nas spp., Corynebacterium spp., Neisseria Mikroflorę górnych dróg oddechowych
lococcus epidermidis najczęściej wchodzi animaloris, N. zoodegmatis, N. veaveri, stanowią głównie bakterie Gram‑dodatnie,

Życie Weterynaryjne • 2015 • 90(7) 447


Prace poglądowe

niektóre identyczne z bakteriami zasiedla- produkują hormony wpływające na odkła- Bakterie przewodu pokarmowego wy-
jącymi skórę. W jamie nosowo‑gardłowej danie się tłuszczu w organizmie (25). Dzię- kazują szerokie spektrum działania, łącz-
zdrowych ludzi dominuje Actinobacter ki współzawodnictwu o  pokarm i  miej- nie z wpływem na układ immunologiczny.
i Firmicutes, przy czym z reguły ma prze- sce mikrobiom jelit hamuje rozmnażanie Stymulują bowiem zarówno swoiste, jak
wagę jedna z tych grup drobnoustrojów. patogenów (C. difficile, Candida). Dzia- i nieswoiste mechanizmy odporności or-
Najczęściej izoluje się Corynebacterium, łanie przeciwbakteryjne wywierają rów- ganizmu, wpływając na tkankę limfatyczną
Propionibacterium i Staphylococcus (23). nież bakteriocyny produkowane przez au- związaną z błonami śluzowymi (mucosal
Izoluje się też Neisseria, Bordetella Strep- tochtoniczną mikroflorę jelit (26). U pa- associated lymphoid tissue – MALT). Sty-
tococcus Pseudomonas, Prevotella, Fuso- cjentów z rakiem jelita grubego szczepy mulują syntezę przeciwciał klas IgG, IgM
bacterium, Haemophilus, Porphyromonas, E. coli produkują kolicyny, które uszka- i IgA, SIgA i SIgM zapobiegających adhe-
Bacteroides. Około 1/3 populacji jest no- dzają DNA. Uważa się, że mają one udział zji do nabłonka śluzówki jelit i wnikaniu
sicielem S. aureus. Główny sprawca zaka- w etiologii raka. w głąb błon śluzowych. Bakterie saprofi-
żeń pooperacyjnych S. aureus zasiedlający tyczne przewodu pokarmowego hamują za-
nos i gardło oraz skórę u osobników o ob- Wpływ mikrobiomu na odporność palenie, mają wpływ na uszczelnienie barie-
niżonej odporności jest przyczyną ciężkich ry jelitowej. Lactobacillus acidophilus i L.
zatruć. W dolnym odcinku jamy nosowo- Częściowo już w życiu płodowym, o czym rhamnosus przywracają szczelność połą-
-gardłowej człowieka występuje Coryne- świadczą badania płodów ludzkich, a głów- czeń międzykomórkowych nabłonka jelit
bacterium, S. aureus, Moraxella cathar- nie zaraz po urodzeniu, rozwija się mikro- uszkodzonych przez TNFα i INFγ u dzie-
ralis oraz S. pneumoniae. biom, co przyczynia się do homeostazy or- ci z alergią (28).
ganizmu przez rozwój bariery ochronnej Mikrobiom wywiera działanie, wpły-
Mikrobiom jelit nabłonków, współzawodnictwo o miejsce wając na ekspresję receptorów Toll-po-
i pokarm oraz stymulację odporności na- dobnych (TLRs), inflammasomów, lektyn
W przewodzie pokarmowym zwierząt mię- turalnej i nabytej (27). Ważną rolę w tych typu C, RIG podobnych helikaz (RIG-like
sożernych i  wszystkożernych oraz czło- procesach odgrywa przewód pokarmowy helicases; 35, 36). Receptory Toll-podob-
wieka występuje 1014 gatunków drobno- i skóra. Rola tych dwóch układów w me- ne znajdują się głównie na powierzchni ko-
ustrojów, w przeważającym odsetku jest to chanizmach odpowiedzialnych za odpor- mórek układu odpornościowego, w mniej-
mikroflora komensaliczna, w  mniejszym ność nieswoistą i swoistą, a także wpływ szym zakresie na komórkach nabłonka dróg
występują gatunki drobnoustrojów pato- modulacyjny odporności na mikrobiom oddechowych, przewodu pokarmowego,
gennych. Zarówno komensale, jak i pato- jest w pełni udokumentowana. Natomiast adipohemocytach, fibroblastach i kardio-
geny odpowiadają za stymulację miejsco- mniej danych dotyczy wpływu mikrobio- miocytach. Receptory TRL‑2 i TRL‑4 poja-
wej i ogólnej odporności przeciwzakaźnej. mu na kształtowanie się odporności miej- wiają się na powierzchni enterocytów mię-
Wydzielnicze IgA oraz mukopolisachary- scowej i ogólnej, a także na wzajemne za- dzy 1­ 8 a 21 dniem życia płodu, rozpoznają
dy śluzu jelitowego tworzą warstwę chro- leżności pomiędzy mikrobiomem i pato- wzorce patogenności (pathogen recogni-
niącą nabłonek jelit, neutralizując szkodli- genami (11, 28, 29). tion receptors – PRRs), takie jak endotok-
we produkty powstające podczas niszcze- Nasilenie odporności miejscowej syna (LPS), peptydoglikan, glikoproteiny,
nia bakterii, zobojętniają działanie toksyn i  ogólnej jest ściśle uzależnione od mi- kwasy uronowe bakterii, białka szoku ter-
i  enzymów proteolitycznych, alergenów kroflory komensalicznej zasiedlającej ta- micznego. Następstwem specyficznej ak-
i  składników pokarmu o  właściwościach kie nisze ekologiczne, jak przewód po- tywacji szlaków sygnałowych jest ekspresja
antygenów. Bakterie jelitowe pobudzają karmowy, układ oddechowy, układ mo- genów regulujących odpowiedź immuno-
produkcję czynnika martwicy nowotwo- czowo-płciowy, wchodzącej w  skład logiczną. Ma miejsce indukcja wielu cyto-
rów (TNF), który wpływa na aktywność mikrobiomów tych nisz (11). Mikrobio- kin prozapalnych (IL-1, IL-6, IL-8, IL-12),
limfocytów i metabolizm komórek, a tak- my jelit i skóry odgrywają kluczową rolę TNFα. Jeden receptor PRR może rozpo-
że na apoptozę komórek nowotworowych. w zainicjowaniu i ciągłej stymulacji od- znać kilka wzorców molekularnych. PRR
Autochtoniczna mikroflora jelit w po- porności miejscowej i  ogólnej organi- są rozpoznawane w ramach mechanizmów
nad 90% jest utworzona przez bezwzględ- zmu (30). Bakterie, które kolonizują prze- naturalnej odpowiedzi immunologicznej
ne beztlenowce, głównie, a niekiedy wy- wód pokarmowy po urodzeniu, w dużym i mogą zapoczątkować rozwój uogólnio-
łącznie, przez producentów kwasu mle- stopniu decydują o składzie mikrobiomu nej reakcji zapalnej (37).
kowego (Bifidobacterium/Lactobacillus) w ciągu całego życia i charakterze odpo- Na ekspresję peptydów przeciwbakte-
i  producentów lotnych kwasów tłusz- wiedzi immunologicznej (31, 32). Wpływ ryjnych w różny sposób wpływają komen-
czowych (Bacteroidaceae, Eubacterium). odgrywają przy tym zmiany w  składzie sale i patogeny skóry, aktywując różne szla-
U człowieka Bacteroides stanowią około mikrobiomu z chwilą odsadzenia. Prze- ki sygnałowe. Komensaliczne gronkow-
30% wszystkich drobnoustrojów prze- stają bowiem dominować w mikrobiomie ce skóry indukują defensyny β (HBD-3)
wodu pokarmowego. 1 g treści okrężni- względne beztlenowce na korzyść beztle- i RNAzy 7 w keratynocytach przez akty-
cy człowieka zawiera 1012 bakterii, a oko- nowców bezwzględnych. Także wszel- wację receptora Toll-podobnego 7 (TRL-7),
ło 30% treści okrężnicy tworzy E. coli. kie zmiany diety znajdują swoje odbicie EGFR i czynnika transkrypcyjnego N ­ F-κB.
W skład mikroflory pomocniczej (satel- w  składzie mikrobiomu i  w  odporności Komensale zwiększają wrodzoną odpor-
lite flora) stanowiącej poniżej 1% ogól- lokalnej (33). Badania na myszach po- ność keratynocytów na patogeny przez
nej ilości bakterii wchodzą fakultatyw- zbawionych bakterii jednoznacznie po- zwiększenie ekspresji adenozynomonofos-
ne beztlenowce (E. coli, enterokoki, zaś twierdzają znaczenie mikrobiomu w od- foranu (AMP) i hamowanie supresji N ­ F-κB.
0,01% mikroflory to Clostridia, Proteus, porności miejscowej. Działanie ochron- Natomiast chorobotwórcze gronkowce ak-
gronkowce, Pseudomonas, Candida, Sac- ne na zakażenie salmonelami jest wyższe tywują szlak sygnałowy kinazy białkowej
charomyces, Aspergillus, Penicillium; 24). u myszy z typową mikroflorą przewodu aktywowanej mitogenem i kinazy fosfaty-
Dzięki bakteriom jelitowym są fermento- pokarmowego aniżeli u myszy o mikro- dyloinozytolu 3 i powodują supresję NF-κB
wane niestrawione węglowodany, kwasy florze przewodu pokarmowego zmienio- (38). Moduliny wytwarzane przez S. epi-
żółciowe i sterole, komensale produkują nej, np. skolonizowanej przez mikrobiom dermidis hamują selektywnie takie patoge-
biotynę i  witaminę K. Bakterie jelitowe jelit cienkich człowieka (34). ny skóry, jak paciorkowce z grupy A oraz

448 Życie Weterynaryjne • 2015 • 90(7)


Prace poglądowe

S. aureus i zapobiegają tworzeniu biofilmu mózgu. Mózg w okresie perinatalnym pod- metabolizm tłuszczów, działając na biał-
przez tę bakterię (39). Uruchomienie szla- lega wielu stresom. Badania epidemiolo- ko Angptl-4, które wpływa na oksydację
ków sygnałowych Toll-podobnych okazało giczne wykazały na istnienie zależności kwasów tłuszczowych, wzrasta masa cia-
się niezbędne do przeżycia komórek i re- pomiędzy schizofrenią i autyzmem a za- ła i oporność na insulinę u myszy w mię-
peracji komórek uszkodzonych w procesie każeniem w  okresie okołoporodowym. śniach i  w  tkance tłuszczowej. Badania
zakażenia. Kwas lipotejchojowy produko- Bifidobacterium infantis będący składni- Turnbaugh i wsp. (50) wykazały, że mi-
wany przez S. epidermidis przez aktywa- kiem mikrobiomu jelit przez modulujący krobiom osobników otyłych uzyskuje wię-
cję TRL-2 i TRL-3 hamuje proces zapal- wpływ na metabolizm tryptofanu w koń- cej energii z pokarmu aniżeli mikrobiom
ny w  skórze, indukuje w  keratynocytach cowym efekcie wpływa na produkcję sero- osobników nieotyłych.
ekspresję AMP. Aktywacja przez flageli- toniny (44). Zakażenie przez E. coli i jed-
nę i  LPS Gram-ujemnych bakterii, pep- noczesna iniekcja endotoksyny (LPS) we Kierunki badań
tydoglikan i kwas lipotejchojowy bakterii wczesnym dzieciństwie jest przyczyną
Gram-dodatnich mikrobiomu skóry, man- zaburzeń pamięci u szczurów dorosłych, Badania nad składem i rolą mikrobiomu
nan i zymozynę ściany grzybów receptorów u których zmniejsza się liczba astrocytów są najbardziej zaawansowane u człowieka
TRLs, receptorów mannozy i NOD-podob- w hipokampie. (11). Duży postęp notuje się w badaniach
nych receptorów zainicjowuje odpowiedź Wpływ mikrobiomu jelit na układ neu- składu mikrobiomu jelit i jego wpływu na
immunologiczną. Efektem współdziałania roendokrynalny ilustruje zachowanie my- choroby autoimmunologiczne, raka jelita
keratynocytów, komórek układu immuno- szy karmionych Lactobacillus rhamnosus grubego, próchnicę zębów człowieka, po-
logicznego i mikrobiomu jest pojawienie i poddanych testom wysiłkowym. Wystę- wiązania pomiędzy mikrobiomem i móz­
się peptydów przeciwbakteryjnych, cytokin puje u nich mniejszy niepokój oraz docho- giem (ewentualny wpływ na depresję i au-
i chemokin. Komensale układu oddecho- dzi do większej ekspresji receptorów GABA tyzm). Bada się też wpływ mikrobiomu
wego oddziaływają na limfocyty T CD4+ (kwas γ-aminomasłowy) w mózgu. Zaka- matki na zasiedlanie organizmu noworod-
i T CD8+ i na odpowiedź immunologicz- żenie w okresie okołoporodowym lub po- ka przez łożysko lub nawet na przedwcze-
ną na zakażenie wirusem grypy (5). porodowym wiąże się z autoimmunizacją sne porody. Ważną dziedziną badań jest
przez drobnoustroje saprofityczne i pato- wpływ zmian środowiska na mikrobiom
Mikrobiom a choroby cywilizacyjne genne. Produkcja przeciwciał skierowa- i rozwój chorób cywilizacyjnych, zwłasz-
nych przeciwko strukturom mózgu pro- cza na cukrzycę i celiakię. Nadal niewie-
Medycyna w  związku z  chorobami cy- wadzi do schizofrenii lub autyzmu (45). le badań poświęcono możliwości adapta-
wilizacyjnymi dąży do wyjaśnienia przy- cji mikrobiomu do zmian środowiska by-
czyn ich występowania i ustalenia czynni- Otyłość towania ludzi i zwierząt. Zapoczątkowano
ków ryzyka. Ciekawe obserwacje dotyczą natomiast pionierskie badania nad wzajem-
wpływu mikrobiomu na rozwój i  czyn- Otyłość jest ważną chorobą cywilizacyjną, nymi powiązaniami mikrobiomu roślin,
ność mózgu, choroby neurologiczne oraz w etiologii której uczestniczy wiele czyn- gleby, człowieka i zwierząt w określonych
na rolę mikrobiomu w otyłości i w zapale- ników. Istnieją dane, które świadczą o roli niszach ekologicznych oraz nad możliwo-
niu jelit. Mikrobiom jelit wpływa na rozwój mikrobiomu jelit w złożonej etiologii tej ścią sterowania mikrobiomem bez wywo-
mózgu, czego efektem jest nie tylko zmia- choroby. Zarówno u ludzi, jak i u zwie- łania zmian niepożądanych.
na behawioru (1, 40), ale też ma wpływ na rząt w  otyłości obserwuje się naciecze-
rozwój ośrodkowego układu nerwowe- nie tkanki tłuszczowej przez makrofagi Piśmiennictwo
go i na odpowiedź na stres. U dorosłych i limfocyty T CD8+ i T CD4+, ekspresję
zwierząt mikrobiom moduluje czynno- cytokin prozapalnych i chemokin, w tym 1. Human Microbiome Project Consortium: Structure, func-
tion and diversity of the healthy human microbiome. Na-
ści układu nerwowego przez wpływ na oś TNF-α, IL-6, IL-17 i INF-γ (46). Interleu- ture 2012, 486, 207–214.
podwzgórze-przysadka-nadnercze. Nerw kina 17 (IL-17) jest czynnikiem regulują- 2. Fujita T., Fuji H.: Efficient isolation of specific genomic
błędny odgrywa istotną rolę w przesyłaniu cym adipogenezę, poziom glukozy i oty- regions by insertional chromatin immunoprecipitation
(iChIP) with a second-generation tagged LexA DNA-bin-
sygnałów pomiędzy mikrobiomem jelit łość (47). Zmiany mikrobiomu jelit indu- ding domain. 2012. (http://www.SciRP.org/journal/abb/
i  ośrodkowym układem nerwowym (41, kują zapalenie i otyłość przez wpływ na 3. Luckey M.F.: Introduction to intestinal microecology.
Amer. J. Clin. Nutr. 1972, 25, 1292–1294.
42). Świadczą o tym zarówno obserwacje komórki nabłonka jelitowego i na entero- 4. Cogen, A.L., Nizet, V. & Gallo, R.L. Skin microbiota: a sour-
poczynione u  ludzi, jak i  eksperymenty endokrynowe komórki i wydzielanie hor- ce of disease or defence? Br. J. Dermatol. 2008, 158, 442–455.
na zwierzętach (43). Badania aktywności monów jelitowych: glukagonopodobnych 5. Lathrop S.K., Bloom S.M., Roa S.M., Nutsch K., Lio C.W.,
Santacruz N., Peterson D., Stappenbeck T.S., Hsieh C.S.:
motorycznej i zachowania pod wpływem peptydów 1 i 2 (GLP-1 I GLP-2). GLP‑1 Peripheral education of the immune system by colonic
stresu u myszy wykazały, że osobniki po- stymuluje wydzielanie insuliny, opóźnia commensal microbiota. Nature 2011, 478, 250–254.
zbawione bakterii cechują się zwiększo- pasaż pożywienia przez żołądek, wywo- 6. Hammedy M., Knight R.: Microbial community profiling
for Human Microbiome Project: Tools, techniques, and
ną aktywnością ruchową i zmniejszeniem łuje objaw sytości i spadek wagi, GLP‑2 challenges. Genome Res. 209, 19, 1141–1152.
stopnia niepokoju w  porównaniu z  my- zwiększa transport glukozy z  jelit i  ob- 7. Selkin B.A., Murakawa G.J.: Skin microflora and bacte-
rial infections of the skin. Investig. Dermatol. Symp. Proc.
szami z mikrobiomem zdrowych jelit. Te niża przepuszczalność ściany jelita. Tak 2001, 6, 170–174.
różnice w behawiorze wiążą się ze zmie- więc mikrobiom, działając na enteroen- 8. Kong H.H.: Skin microbiome: genomics-based insight
nioną ekspresją genów drugiego szlaku dokrynowe komórki, wpływa na metabo- into the diversity and role of skin microbes. Trends.Mol.
Med. 2011, 17, 320–328.
informacyjnego i  długotrwającą poten- lizm (48). Ponadto u myszy bez genu lep- 9. Webster G.F., Ruggieri M.R., McGinley K.J.: Correlation
cjalizacją obszarów mózgu odpowiedzial- tyny (ob/ob) występują w jelitach zmia- of Propionibacterium acnes populations with the presen-
nych za kontrolę aktywności motorycznej ny w proporcji pomiędzy Firmicutes spp. ce of triglycerides on nonhuman skin. Appl. Environ. Mi-
crobiol. 1981, 41, 1269–1270.
i strach. Myszy pozbawione bakterii eks- i Bacteroides spp. w porównaniu do he- 10. Wanke I., Steffen H., Christ C., Krismer B., Gotz F., Pe-
ponowane we wczesnym okresie życia na terozygot (ob/+) na niekorzyść Bactero- schel A., Schaller M., Schittek B., Skin commensals am-
plify the innate immune response to pathogens by acti-
bakterie jelitowe zachowują się w sposób ides. Również u otyłych ludzi ilość Bac- vation of distinct signaling pathways. J. Invest. Dermatol.
podobny jak myszy wolne od swoistych pa- teroides w  jelitach jest mniejsza (49). 2011, 13, 282–290.
togenów (SPF). Ulega redukcji ekspresja W  przeciwieństwie do człowieka ilość 11. Pflughoeft K.J., Versalovic J.: Human microbiome in he-
alth and disease. Ann. Rev. Pathol. 2012, 7, 90–122.
PSD-95 (postsynaptic density – 95 prote- Bacteroides jest wyższa u chudych szczu- 12. Hansen W., Bollet C. Precise de bakteriologie clinique.
in) i synaptofizyny w ciele prążkowanym rów i świń. Mikrobiom jelitowy reguluje Eska, Paris, 2000.

Życie Weterynaryjne • 2015 • 90(7) 449


Prace poglądowe

13. Buiuc D., Negut M.: Tratat de mikrobiologie clinica. Me- 27. Kasper D.L., Blumberg R.S.: Microbial exposure during 39. Iwase T., Uehara Y., Shinji H., Tajima A., Seo H., Taka-
dical Issai, 2009. early life has persistent effects on natural killer T cell func- da K., Agata T., Mizuneo Y. Staphylococcus epidermidis
14. Love D.N., Vekselstein R., Collings S.: The oibligate and tion. Science 2012, 336, 489–493. Esp., inhibits Staphylococcus aureus biofilm formation
facultative anaerobic bacterial flora of the normal feline 28. Macpherson A.J., Harris N.L.: Interactions between com- and nasal colonization. Nature 2010, 465, 346–349.
gingival margin. Vet. Microbiol. 1990, 22, 263–275. mensal intestinal bacteria and the immune system. Nat. 40. Bilbo S.D., Yirmiya R., Amat J., Paul E.D., Watkins L.R.,
15. Bendouah Z., Barbeau J., Hamad W.A., Desrosiers M.: Bio- Rev. Immunol. 2004, 4, 478–485. Maier S.F.: Bacterial infection early in life protects aga-
film formation by Staphylococcus aureus and Pseudomo- 29. Grice E.A., Segre J.A.: The skin microbiome. Nature Rev. inst stressor-induced depressive-like symptoms in adult
nas aeruginosa is associated with an unfavorable evolu- Microbiol. 2011, 9, 244–253. rats. Psychoendocrin. 2008, 33, 261–269.
tion after surgery for chronic sinusitis and nasal polypo- 30. Chung H., Pamp S.J., Hill J., Surana N.K., Edelman S.M., 41. Forsythe P., Kunze W.A., Bienenstock J.: On communi-
sis. Othoralyngol. Head Neck Surg. 2006, 134, 991–996. Troy E.B., Reading N.C., Villablanca E.J., Wang S., Mora cation between gut microbes and the brain. Curr.Opin.
16. Mahomed J.A., Huang D.B.: Biofilm formation by ente- J.R., Umesaki Y., Mathis D., Benoist C., Relman D., Kasper Gastroenterol. 2012, 28, 557–562.
rococci. J. Med. Microbiol. 2007, 56, 1581–1588. D.L.: Gut immune maturation depends on colonization 42. Douglas-Escober M., Elliott M., Neu J.: Effect of intesti-
with a host-specific microbiota. Cell 2012, 149, 1578–1593. nal microbial ecology on the developing brain. J.Amer.
17. Wierzbicka M.: Periodontologia kliniczna. Wyd. Sanme-
31. Lathrop S.K., Bloom S.M., Rao S.M., Nutsch K., Lio C.W., Med. Ass. Pediatr. 2013, 167, 374–379.
dia, Warszawa 1995.
Santacruz N., Peterson D., Stappenbeck T.S, Hsieh C.S.: 43. Cho I., Blaser M.J.: The human microbiome: at the inter-
18. Harley C.: Shape and size of teeth of dogs and cats – re-
Peripheral education of the immune system by colonic face of health and disease. Nature Rev. Genet. 2012, 13,
levance to studiem of plaque and calculus accumulation.
commensal microbiota. Nature 2011, 478, 250–254. 260–270.
J. Vet. Dent. 2002, 19, 189–195.
32. Olszak T. An D., Zeissig S., Vera M.P., Richter J., Franke 44. Bilbo S.D., Levkoff L.H., Mahoney J.H., Watkins L.R., Rudy
19. Lewis J.R., Reiter A.M.: Management and generalized gin- J.W., Maier S.F.: Neonatal infection induces memory im-
A., Glickman J.N., Siebert R., Baron R.M., Kasper D.L.,
gival enlargement in dog-case report ant literature review. pairments following an immune challenge in adulthood.
Blumberg R.S.: Microbial exposure during early life has
J. Vet. Dent. 2005, 22, 160–169. Behav. Neurosci. 2005, 119, 293–301.
persistent effects on natural killer T cell function. Scien-
20. Mallonee D.H., Harvey C.E., Venner M., Hammond B.F.: 45. Hornig M.: The role of microbes and autoimmunity in
ce 2012, 336, 489–493.
Bacteriology of periodontal disease in the cat. Arch, Oral the pathogenesis of neuropsychiatric illness. Curr. Opin.
33. Kau A.L., Ahern P.P., Griffin N.W., Goodman A.L., Gordon
Biol. 1988, 33, 677–683. Rheumatol. 2013, 25, 488–795.
J.I.: Human nutrition, the gut microbiome, and immune
21. Norris J.M., Love D.N.: Associations amongst three feli- 46. Gregor M.F., Hotamisligil G.S.: Inflammatory ­mechanisms
system: envisioning the future. Nature 2011, 474, 327–336.
ne Porphyromonas species from the gingival margin of 34. Villablanca Chung H., Pamp S.J., Hill J., Surana N.K., Edel- in obesity. Ann Rev Immunol. 2011, 29, 415–445.
cats during periodontal health and disease.Vet. Micro- man S.M., Troy E.B., Reading N.C., Wang S., Mora J.R., 47. Zúñiga L.A., Shen W.J., Joyce-Shaikh B., Pyatnova E.A.,
biol. 1999, 65, 195–207. Umesaki Y., Mathis D., Benoist C., Relman D., Kasper D.L.: Richards A.G., Thom C., Andrade S.M., Cua D.J., Kra-
22. Gliński Z., Chełmiński A.: Infekcje ludzi i zwierząt wywo- Gut immune maturation depends on colonization with emer F.B., Butcher E.C.:IL-17  regulates adipogenesis,
łane przez Actinomyces. Życie Wet. 2014, 89, 499–504. a host-specific microbiota. Cell 2012, 149, 1578–1593. glucose homeostasis, and obesity. J Immunol. 2010, 185,
23. Charlson E.S., Bittinger K., Haas A.R., Fitzgerald A.S., 35. Pichlmair A.: RIG-I-Mediated antiviral responses to sin- ­6947–6959.
Frank I., Yadav A., Bushman F.D., Collman R.G.. Topo- gle-stranded RNA searing 5’-phosphates. Science 2006, 48. Strober W.: Impact of the gut microbiome on mucosal
graphical continuity of bacterial populations in healthy 314, 997–1001. inflammation. Trends Immunol. 2013, 34, 423–430.
human respiratory tract. Amer. J. Respir. Crit. Care Med. 36. Kawai T., Akira S.: The role of TLRs, RLRs and NLRs in 49. Ley R.E.: Obesity and the human microbiome. Curr. Opin.
2011, 184, 957–963. pathogen recognition. Int. Immunol. 2009, 21, 317–337. Gastroenterol. 2010, 26, 5–11.
24. Gedek B.: Intestinal microflora and bioregulation. Rev. 37. Cinel I., Opal S.M.: Molecular biology of inflammation 50. Turnbaugh P.J., Ley R.E., Mahowald M.A., Magrini V.,
sci. tech. Off. int. Epiz., 1989, 8, 417–437. and sepsis: a primer. Crit. Care Med. 2009, 37, 291–304. Mardis E.R., Gordon J.I.:An obesity-associated gut mi-
25. Turnbaugh P.J., Gordon J.I.: The core gut microbiome, 38. Wanke I., Steffen H., Christ C., Krismer B., Gotz F., Pe- crobiome with increased capacity for energy harvest. Na-
energy balace, and obesity. J. Physiol. 2009, 17, 4153–4158 schel A., Schaller M., Schittek B., Skin commensals am- ture 2006, 444, 1027–1031.
26. Chow J., Lee S.M., Shen Y., Khosravi A., Mazmanian S.K.: plify the innate immune response to pathogens by acti-
Host-bacteria symbiosis in health and disease. Adv. Im- vation of distinct signaling pathways. J. Invest. Dermatol.
munol. 2010, 107, 243–274. 2011, 13, 282–290. Prof. zw. dr hab. mgr Zdzisław Gliński, e-mail: zglinski@o2.pl

pH oraz koncentracji tlenu i związków


Stres i zależne od stresu azotowych, które normalnie zachodzą
w umiarkowanym zakresie w każdym
bakteryjne choroby ryb zbiorniku wodnym.
3. Napływ do zbiornika wodnego substancji
toksycznych zawartych w ściekach ko-
Jerzy Antychowicz, Agnieszka Pękala1 munalnych, przemysłowych, rolniczych
oraz pojawiających się w  środowisku
z Zakładu Chorób Ryb Państwowego Instytutu Weterynaryjnego – Państwowego Instytutu wodnym po przeprowadzeniu oprysków
Badawczego w Puławach1 lub w czasie awarii zbiorników, w któ-
rych gromadzone są toksyczne odpady.

Ś nieszko (1) jako jeden z  pierwszych


zwrócił uwagę na istotną rolę stresu
w patogenezie chorób ryb. Uważał on mia-
przez różnego rodzaju słabo patogenne mi-
kroorganizmy. Zrozumienie mechanizmów
działania czynników stresotwórczych jest
Nie jest to ścisły podział, bowiem pod-
czas odłowu w trudnych warunkach, np.
w zamulonym stawie, oprócz nadmierne-
nowicie, że reakcja organizmu ryby okre- bardzo istotne również do prowadzenia go pobudzenia nerwowego występującego
ślana jako stres powoduje w  końcowym skutecznej profilaktyki chorób ryb. u ryb wskutek ekstremalnego wysiłku czy
efekcie osłabienie układu odpornościo- też podczas prób ucieczki, może dojść rów-
wego tych zwierząt. Wówczas nawet nie- Czynniki stresotwórcze nież do okresowego deficytu tlenu w łowisku
szkodliwe mikroorganizmy, które nor- oraz wzrostu koncentracji amoniaku, azo-
malnie występują w środowisku wodnym Można rozróżnić następujące grupy czyn- tynów i siarkowodoru, będących produkta-
i w przewodzie pokarmowym, mogą wy- ników stresotwórczych dla ryb: mi beztlenowego rozkładu substancji orga-
woływać objawy chorobowe. W ostatnim 1. Manipulacje rybami podczas odłowu, nicznych nagromadzonych na dnie stawu.
czasie znacznie wzrosła wiedza na temat sortowania, ważenia i transportu oraz Należy również pamiętać, że podczas odło-
szkodliwości dla organizmu ryby nadmier- obsadzanie ryb w stawie, szczególnie je- wów oprócz reakcji stresowej dochodzi rów-
nej reakcji stresowej powstającej w wyniku żeli jest on zasilany wodą o innych wła- nież do mechanicznego uszkodzenia skóry
działania czynników zewnętrznych. Wie- ściwościach biochemicznych niż te, do po kontakcie ryb z twardymi przedmiota-
dza ta jest niezbędna do zrozumienia pa- których ryby były zaadaptowane. mi oraz podrażnienia, a nawet uszkodzenia
togenezy przede wszystkim bakteryjnych 2. Fizykochemiczne zmiany w  wodzie skrzeli ziarnkami piasku lub torfu. Ubyt-
chorób ryb, ale również innego typu chorób o dużej amplitudzie wahań, np. w za- ki skrzeli i powłok zewnętrznych przy ni-
tych zwierząt, szczególnie wywoływanych kresie dobowych i sezonowych zmian skiej temperaturze goją się długo, co sprzyja

450 Życie Weterynaryjne • 2015 • 90(7)

You might also like