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CAPITULO 3 Proteinas http://booksmedicos.blogspot.com Las proteinas ocupan un lugar de maxima im- portancia entre las moléculas constituyentes de Jos seres vivos. En los vertebrados, las proteinas son los compuestos orgdnicos més abundantes, putes representan alrededor del 50% del peso seco de los tejidos. Practicamente todos los procesos biolégicos dependen de la presencia y/o actividad de este tipo de sustancias. Bastan algunos ejem- plos para dar idea de la variedad y (rascendencia de funciones a ellas asignadas. Son protefnas casi todas las enzimas, catalizadores de reacciones qui- micas en organismos vivientes; muchas hormo- nas, reguladores de actividades celulares; la he- moglobina y otras moléculas con funciones de transporte en 1a sangre; anticuerpos, encargados de acciones de defensa natural contra infeccio- nes 0 aggntes extrafios; los receprores de las cé- lulas, a los cuales se fijan moléculas capaces de desencadenar una respuesta determinada; la actina y la miosina, responsables finales del acor- tamiento del masculo durante Ja contraccién; el coldgeno, integrante de fibras altamente resisten- tes en tejidos de sostén. Se ha avanzado enormemente durante los tl- timos 50 afios en el conocimiento de este grupo de sustancias; hoy es posible interpretar meca- nismos intimos que condicionan muchos procesos vitales y, sobre todo, demostrar la estrecha relacién existente entre estructura molecular y funcién Uno de los problemas muds dificiles planteados inicialmente a Jos investigadores en este campo fue aislar y purificar una determinada proteina a partir de la complejisima mezcla de moléculas que consti- tuye la materia viva. El perfeccionamiento de méto- dos de separacién ha petmitido obtener protefnas al estado puro. cristalino, apto para el estudio de su esiructura y propiedades. Todas las proteinas contienen carbono, hidré- geno, oxigeno y nitrdgeno y casi todas poseen también azufre. Si bien hay ligeras variaciones en diferentes proteinas, el contenido de nitrége- no representa, (émmo medio, 16% de la masa total de la molécula; es decir, cada 6,25 g de protei- na contienen | g de N. E] factor 6,25 se utiliza para estimar la cantidad de proteina existente en una muestra a partir de la medicidn del N de la misma. Las proteinas son macromoléculas formadas por aminodcidos Las protefnas son moféculas de enorme ta- mafio; pertenecen @ la categorfa de macromolé- culas, constituidas por gran mimero de unidades estructurales. En otros términos, se trata de poli- meros (poli: muchos; meros: partes). Debido a su gran tamafio, cuando estas moléeu- las se dispersan en un solvente adecuado, forman obligadamente soluciones coloidales, con caracte- risticas que las distinguen de las soluciones de moléculas pequefias Por hidrdlisis*, las moléculas protefnicas son escindidas en numerosos compuestos relativa- mente simples, de pequefio peso, que son las uni- dades fundamentales constituyentes de la macro- molécula. Estas unidades son los aminodcidos, de los cuales existen veinte especies diferentes. Cientos 0 miles de estos aminoacids pueden participar en la formacién de Ja gran molécula polimérica de una proteina Como los aminodcidos son los bloques unita- ios 0 “ladrillos” con los cuales se constraye el gran edificio molecular de las protefnas, se consideraré en primer término su estructura y propiedades * Se denomina hidrélisis a la ruptura de un enlace covalente por adicién de agua: R-R' + H.OH —> RH+R'O8, 21 22 QUIMICA BIOLOGICA AMINOACIDOS Los aminodcidos constituyentes de protefnas son compuestos con un grupo dcido, carboxilo (-COOH) y un grupo basico, amina (-NH,), uni- do al carbono o: (el carbono 0 de un dcido orgs- nico es el inmediato al carboxilo). Son, enton~ ces, o-aminodcidos y su férmula general es: ‘ H2N— C—H 1 COOH donde R corresponde a la cadena lateral, diferen- te para cada uno de los veinte aminoiicidos dis- tintos que se obtienen de fa hidrélisis de proteins, De acuerdo con la formula general presenta- da, todos Jos aminodcidos (excepto glicina, en la cual R es un hidrogeno) tienen las cuatro valencias del carbono & saturadas por grupos diferentes te hecho determina la existencia de dos is6- meros 6pticos, con configuracién espacial dis- tinta, para cada aminodcido Isomeria éptica Se denomina isémeros a compuestos diferentes, con la misma f6rmuta molecular. Contienen igual numero y clase de étomos, pero unidos entre sf de manera distinta, Cuando difieren en su disposici6n espacial, se tienen isémeros espaciales 0 estereo- isémeros, categoria a la cual pertenecen los isomeros Sptizos Segiin Ja teoria tetraédrica, los cuatro enlaces de! stomo de carbon son equivalentes y orienta- dos hacia los vértices de un tetraedro regular. Cuan- do cada una de las valencias esti saturada por ele- mentos © grupos atémicos diferentes, la molécula resulta asimétrica. Se dice en ese caso que el carbo- no es asimétrico Por ejemplo, en el aminodcido alanina: ee HN-C—H COOH el carbono en rojo es asimétrico porque est unido a cuatro grupos atGmicos distintos (-H, -CH,, -N¥ y COOH). Los grupos unidos al carbono asimétrico cen- wal pueden ser dispuestos en el espacio de dos maneras diferentes. De ello resultan dos moléculas cada una de las cuales es la imagen en el espejo de la otra. Estos isémeros no son superponibles: guar- dan entre si }a misma relaci6n existente entre fa mano izquierda y la derecha, de allf el nombre de com- puestos quirales dado a este tipo de ismeros (del griego Kiros: mano). Se los conoce también como, isémeros dpticos, enantiomorfos 0 enantismeros. La figura 3-1 presenta los dos isémeros épticos de la alanina, << COOH HAN Pig. 3-1. Enantiémeros de atanina, Isémeros de este tipo poseen muchas de sus propiedades quimicas iguales y propiedades fisicas idénticas, excepto su capacidad para desviar el plano de vibracién de la luz polarizada en uno u otro sentido Luz polarizada. Un haz de luz ordinaria esté com- puesto por vibraciones dispuestas en tacos los pla~ nos que se intersectan en el eje de propagacién del haz (fig. 3-2). Se Hama Tu potarizada a aquella cuyas vibraciones ocupan sélo uno de esos planos. S puede obtener luz polarizada haciendo pasar un haz de luz ordinaria a través de un prisma de Nicol (dis positive construido con cristales de calcita), 0 de un material sintético Vamado Polaroid. La luz que ha atravesado estos medios esté constituida por vi ‘braciones en un solo plano. —— oie (D Fig, 3.2. A. Representacién idealizada de un haz de luz ordinaria. Se indican algunos de los infinitos planos que se intersectan en ¢] eje de propagacién dei haz y en los cuales tienen lugar las vibraciones que componea la luz. B. Haz de luz polarizada. Las vibraciones s6lo ocupan un, plano, Los circulos a la derecha representan el corte trans- versal ideal del faz de luz. Actividad éptica. Si un baz de luz polarizada atra viesa una solucién de un compuesto quital, el plano de vibracién es rotado sobre su eje y desviado a otra posicisn (fig. 3-3). Se dice que la sustancia es 6pticamente activa. Por convencién, cuando el giro tiene el sentido del movimiento de las agujas del reloj, se lo considera hacia la derecha 0 positivo (+); la rota- cidn en sentido contrario es izquierda o negativa (-) Fig. 3-3. Rotacién de la luz polarizada. El plano de vibraci6n de la luz, después de atravesar el wbo que contiene una solucién de una sustancia épticamente activa, ¢s desviado de su posicién origi- ral (en este caso, hacia la derecha). Los compuestos que desvian hacia la derecha el plano de vibracién de ta luz polarizada se Haman dextrorrotatorios 0 dextrégiros y los que lo rotan hacia fa izquierda son levorrotatorios 0 levdgiros, La magnitud de la rotacién se determina median- te un aparato Hamado polarfmetto, que permite me- dir el Angulo del giro producido en el plano de la luz. En condiciones determinadas de temperatura, Jongitud de onda de la luz inctdente, concentracién de sustancia en la solucién y espesor de solucién recorrido por la luz, cada compuesto produce un giro definido del plano de la fuz polarizada, corres- pondiente a la rotacién especifica, caracteristica para cada sustancia dpticamente activa, Los dos isémeros 6pticos de un mismo compuesto desvian Ja luz polarizada en un angulo exactamente igual, uno hacia la detecha (dextrdgiro) y el otro hacia la izquierda (levégiro) Notacién. Los isémeros dpticos se distinguen por la configuracidn de los cuatro sustituyentes en temo al Atomo de carbono quiral o asimétrico, lo cual se puede determinar mediante estudios de difraccién de rayos X. El compuesto de referencia es el gliceraldehido. Los dos isémetos dpticos de esta sustancia, uno lev6giro y otro dextrégiro, se designan anteponien- do al nombre las letras L y D respectivamente y sus formulas se indican de la siguiente manera: 1 ‘CH,OH Degliceraldehido CH;OH L-gliceraldehido 31 isdmero L es representado con el hidroxilo unido al carbono asimétrico hacia la izquierda y el isémero D, con dicho grupo hacia la detecha Por convencién, todos los compuestos de con- figuracién comparable a la del L-gliceraldeh{do, son denominados L, aun cuando no sean levégiros, y los relacionados con la disposicién espacial del D- gliceraldehfdo, son llamados D aunque no sean dextedgiros. De este modo, D y L denotan fa confi- guracién, y no corresponden en todos los casos a compuestos dextrdgiros y levégiros respectivamen- te. Por esta raz6n se debe indicar el sentido de la rotacién con un signo (+) 0 (-) a continuacién de la PROTEINAS. 23 letra. La L-alanina, por ejemplo, tiene una rotacién especifica de +1,8°; su notacién es L(+)-alanina. CHs Gls HaN=C—H H=G—NH COOH COOH L-alanina Dealanina Para evitar las ambigliedades de la designacién D-L, se ha propuesto otro sistema, Hamado RS. En este texto seguiremos utilizando la notacién D-L, Todos los aminodcidos, excepto la glicina, presen- (an isémeros D y L. Los aminodcidos isoleucina y treonina tienen un segundo carbono asimétrico ade- més det ot, razén por la cual existen cuatro isémeros de cada uno. Sélo uno de esos cuatro participa en la constitucién de protefnas. Las células de los seres vivos distinguen con gran eficiencia los estereoisémeros. Sélo los amino~ fcidos de configuracién L son incorporados pro- teinas y presentan mayor interés en bioguimica hu- mana. A ellos nos referiremos casi exclusivamente en lo sucesivo. En los casos en los cuales no se an- tepone letra al nombre, debe entenderse que se tra- ta de L-aminodcidos. Clasificacién de aminodcidos ‘De los ot-aminodcidos obtenidos por hidrélisis de protefnas, la mayorfa posee un grupo Acido carboxilo y un grupo basico amina, raz6n por la cual se los considera neutros. Dos de ellos tienen un grupo carboxilo adicional que les confiere ca- racter acido, mientras otros poseen grupos bési- cos adicionales. Dos de los aminoacidos contie- nen azufre en su molécula, Finalmente hay uno, denominado prolina, en el cual el carbono adya- cente al de 1a funcién carboxilo forma parte de un ciclo. A continuacién se presentan los aminodcidos constituyentes de protefnas, agrupados segiin las caracteristicas de sus cadenas laterales. Habitual- mente se utilizan notaciones abreviadas, una de tres y otra de una letra, para indicar cada ami- nodcido. Ambas figuran al pie de la férmula res- pectiva. Las cadenas laterales se representan en rojo. 24 QUIMICA BIOLOGICA Aminodcidos alifaticos neutros con cadena no polar Glicina posee sélo un hidrégeno ademas de los grupos carboxilo y amina; estos grupos pola- res predominan claramente en su molécula. Alanina, con un metilo como cadena lateral, es mas soluble en agua que los siguientes, en los cuales la cadena hidrofébica es de mayor tama- fio, Valina, leucina ¢ isoleucina tienen cadenas apolares ramificadas. HN-G=H WN-C-H COOH COOH Glicinao glicocola Alanina (Gly-G) (Ala - A) He Ch i HoN-C—-H CH, H.N-C-H 00H Leucina Jsoleucina (Leu-L) (lle - 1) Aminodeidos alifiticus neutros con cadena polar no ionizable Serina y treonina contienen en su cadena la- teral una fncién hidroxilo que les otorga cardc- ter polar. CH;—OH CH-OH HiN-G-H HNC —H COOH COOH Serina ‘Treonina (Ser-S) (Thr) Aminodcidos neutros aromdticos Fenilalanina posee un niicleo bencénico y rriptéfano, el nécleo heterociclico indol; ambos. apolares y marcadamente hidréfobos. Tirosina tie- ne un hidroxilo fendlico que le da polaridad. Por encima de pH 10 libera un protén y adquiere car- ga negativa. H.N-C—H | COOH Fenilalanina (Phen - F) Triptéfano (Tm- W) Los aminodcidos arométicos absorben fuer temente la luz en la regi6n ultravioleta del espec- tro (280 nm). Esta propiedad es usada para de- tectar la presencia de proteinas en una muestra, Aminodcidos con azufre Cisteina contiene el grupo ~SH (sulfhidrilo), ligeramente polar; a pH 9 libera un prot6n. La cadena lateral de metionina es apolar. CHp— CH. Che HN=6-H HiN-G-H COOH COOH Cisteina Metionina (Cys) (Met - M) Aminodcidos dcidos (dicarboxilicas) Acido aspartico y dcido glutmico son ami- noécidos con un carboxilo adicional que puede liberar un protén y adquirir carga negativa al pH de los Ifquidos biolégicos. A menudo se los de- signa con el nombre de la forma ionizada, aspartato y glutamato. I H.N-C—-H H).N-C—H I I COOH COOH Acido aspartico Acido glutamico (Asp- D) (Glu-E) Asparragina y glutamina son derivados de los aminodcidos dcido aspartico y glutémico res- pectivamente; poseen funcién amida en el car- bono distal al Co. A diferencia de sus andlogos acidicos, asparragina y glutamina no tienen car- ga.en su cadena {ateral, pero son decididamente polares. O— NH: CO-NH oH, I CH H i i H)N-C—-H H)N-C—H | i COOH COOH = Asparragina Glutamina {Asn - Ny (Gin -Q) Aminodcidos basicos Son aminoscidos con carga positiva al pH rei- nante en las cétulas. Lisina, con tina funcién amina adicional, y arginina, con un grupo guanidino, pueden aceptar protones. C=NH i CH, —NH; VH i 1 Hi CH i 7 oH | CH, H HN=C=H HaN-C—H COOH COOH Lisina ‘Arginina (Lys - K) (Arg R) Histidina tiene el micleo heterociclico imida- zol, uno de cuyos nitrégenos puede adguirir una PROTEINAS 25 carga positiva. El pK de ionizacién del imidazol en la cadena de histidina es de alrededor de 6,0. Todos los aminodcidos basicos son fuertemente. polares. ye a COOH H ‘Histidina (Fis-#) En la proteina del colageno se encuentra hidroxilisina, derivado de la lisina con un hidroxilo en el carbono 5 (los carbonos de la cadena se cuen tan a partir del que posee la funcidn carboxilo). Prolina En la prolina el carbono ot y el nitrégeno a é] unido estan incluidos en un ciclo pirrolidina. El compuesto tiene cardcter alifitico, t 4 “2 <-~COOH A COOH nm ~N H H Prolina @r0-¥) 4-hidroxiprotina Algunos autores consideran que el nitrégeno forma una funcién imino ¢=NH), razén por la cual Haman a la prolina iminodcido. La inclusi6n del carbono ay el Nen el anillo otorga a las uniones de esos atomos mayor rigidez que Ia existente en los otros aminodcidos. En algunas protefnas se encuentra un derivado hidroxilado de la prolina, la hidroxiprolina. Otros aminodeidos Los aminoécidos presentados participan en Ja constitucién de protefnas. Algunos de ellos suelen sufrir modificaciones por adicién covalente de dife- rentes grupos. Por ejemplo, ademas de 4-hidro- xiprolina y S-hidroxilisina, ya mencionados, fosfo- serina, y ¥-carboxighutémico HoOCc coo cH i 12 cH 1 1 HN-CG-H —C-H 1 HN ¢ COOH COOH Acido S-hidroxilisina ‘eeatboxigturémico 26 =~ QUIMICA BIOLOGICA Existen ottos aminodcidos biokigicamente impor- tantes, como B-alanina, D-alanina, sarcosina, ‘-amni- nobutirico, D-dcido glutémico, ornitina, homoserina, tiroxina, citrulina (p4g. 293), homocisteina (pag. 300), a los cuales se los encuentra libres o integrando moléculas no protefnicas, CH2-O-POsH2 — CHa—NH2 HN é =H ot COOH COOH O-fostoserina B-alanina CHs CHa NH, NH Cha CHa Gite COOH COOH Sarcosina Acido yaminobutirico CHy—-NH> at ce vy H.N-C-H Se boon i* Ornitioa i CHe-OH CH: i HN-O-H HNC =H door COOH Homoserina, Tiroxina Propiedades de aminodcidos Las propiedades de la cadena de cada amino- Acido permiten predecir su comportamiento. El grepo sulfhidrilo de cistesna es altamente reactivo y con facilidad se combina con otro similar para formar uniones disulfuro (-S-S-). Dos cisteinas ligadas por este tipo de enlace covalente forman cistina CH; ~S—S~CH, HyN-G-H HN-6-H do0H boon Cistina El grupo carboxilo adicional de dcidos aspartico y glutamico, ademas de otorgarles cardcter dci- do, da a estos aminodcidos la propiedad de interactuar con sustancias basicas para formar uniones de tipo salino. También pueden estable- cer atracciones electrostaticas de este tipo los aminodcidos diaminados Las caracter(sticas de las cadenas laterales per- miten agrupat los aminodcidos en Polares: glicina, serina, treonina, cistefna, tiro- sina, écido aspartico, dcido glutémico, asparragi- na, glutamina, lisina, histidina y arginina. Apolares: alanina, valina. \eucina, isoleucina, metionina, fenilalanina, tript6fano y prolina. Propiedades dcido-hase de aminodcidos Laexistencia, en una misma molécula, de gru pos Acido y basico, da a los aminodcidos propie- dades eléétricas particulates. Come se ha visto, el grupo carboxilo se comporta como acide 0 dador de protones: -COOH + -COO- + Ht el grupo amina acepta protones; actiia como base: -NH, + Ht > -NHy En las f6rmulas precedentes se ha presentado alos aminoScidos can sus funciones no ionizadas, situacidn improbable en los medios bioldgicos, En realidad, al estado cristalino o en soluciones acuosas, estos compuestos se encuentran diso- ciados, con cargas positiva y negativa sobre la misma molécula, Por esta raz6n, se dice que los aminoscidos son iones dipolares, anfolitos © anfoteros, El vocablo aleman zwitterion también se utiliza para designar este tipo de iones. Por ello, es mas correcto representar a los c-amino- &cidos como iones dipolares (en rojo, los grupos disociados): R | aN -C—H 1 coo" En soluciones Acidas fuertes, el ion dipolar capta un ion hidrégeno o protén a nivel de su carboxilo, el cual, en esas condiciones, se com porta como una base. El aminodcido se convier- te entonces en un ion con carga positiva 0 catién es decir, migra hacia el catodo si se establece un campo eléctrico en la solucién i i t “HN CH + Hi HaN-C—H coo- COOH En solucién alcalina, el protén de la funcion -NH,* reacciona con iones hidroxilo para formar agua y 2] aminodcido queda cargado negativamente (ion negativo o anién). Es decir, aun pH fuertemente al- calino, el grupo ~NH,* se comporta como cide. . ; I "HaN-G—H +OH > aN Ha fies coo” cco" La carga eléctrica del aminodcido depende del PH del medio en el cuai esta disuelto. Si la con- centracién de iones hidrégeno aumenta en el me- dio, los jones -COO- (carboxilato) captan proto- nes, disminuyen progresivamente las formas idni- cas dipolares y se forman cationes. En cambio, cuando disminuye la concentracién de H*, esto es, aumenta la de OH", os grupos -NH,* ceden H°, pierden su carga y se forman aniones. Hay un valor de pH, caracteristico para cada aminodcido, en el cual la disociacién de cargas positivas y negativas se iguala y, por lo tanto, la PROTEINAS 27 carga (otal de] aminodcido es nula. A este valor de pH se Jo denomina punto isoeléctrico (pHi o pl). En estas condiciones, el aminodcida no tien- de a desplazarse hacia ninguno de los polos cuan- do se establece un campo eléctrico a través de la solucién. En los aminodcidos dicarboxilicos o diamina. dos existe un grupo disociable adicional. Al ana- lizar el comportamiiento del 4cido aspartico, por ejemplo, se puede comprobar que en un medio Acido fuerte esté completamente protonado. Si se alealiniza la soluci6n por adicién de una base fuer te (NaOH), el aminoacido cedera protones, E] dci- do aspartico forma sucesivamente distintas espe- cies idnicas a medida que el pH aumenta (fig. 3-4) Andlogacomprobacién se puede hacer con amino cidos diaminados como, por ¢j., la lisina (fig. 3-5) Curva de titulacién de aminodcidos El estudio de las curvas de Gtulacién de dcidos y bases débiles. consideradas en el capitulo ante- tior, tiene interés para comprender el comportamien- to dcido-base de esas sustancias em solucién. Ana- lizaremos la curva correspondiente a un aminodcido con dos grupos ionizables y tomaremos como ejem- plo la alanina (*H,N-CHR-COO>: R corresponde a metito en la alanina). GooH 00H goo 00" CH, + OH, CH: + OH, GH, + OH, CHa THN G=H OHH CHIN-G—H OFA HN GOH “FHE HAN-O—H COOH coo- coo- coo" C+ HH 2,9 ( op ol (0) o @ Fig, 3-4. Efecto del pH del medio sobre la carga eléctrica del dcido asparti Entre paréntesis, valory signo de la carga neta CHaNHS CHANHS GHaNHs CHNHe Oe Cle CH. GH: a a Ge +H* GHe +H* CHa +H* Che HN-G-H HIN-C=H HaN-O-H HAN-G-H COOH coo" coo- coo” (2) (1) oO «1 Fig, $5. Bfecto det pHi del medio sobre la carga eléctrica dela lisina. Entre paréntesis, valor y signo de l carga neta, 28 — QUIMICA BIOLOGICA Los equilibrios de disociacién para cada uno de Jos grupos ionizables de! aminodcido se indican en Jas ecuaciones siguientes Para el carboxilo: *H\N-CHR-COOH = *H,N-CHR-COO-+ H+ [H,N-CHR-COO"}[H"] {/ H,N-CHR - COOH] Para Ja amina: *H,N-CHR-COO- = H,N-CHR-COO-+H* [H,N- CHR - COO”) (H"] (H,N-CHR -C00"} En una solucién de alanina en agua pura, las dos funciones del aminodcido estén ionizadas y el pH del media es el correspondiente al punto isoeléc trico de alanina (pH = 6,02). A partir de este punto se pueden realizar dos titulaciones por separado, la del grupo -COO-, que se comporta como una base al aceplar protones y la del grupo -NH,". que actéa como acido débil, liberando H’. Para la primera neu- tralizaci6n puede utilizarse una solucién de HCl y para Ia segunda, una de NaOH. La representacién conjunta de los cambios de pH producidos en el curso de ambas valoraciones da una curva bifisica (ig. 3-6), Antes de agregar HCl, todas las moléculas det aminodcida se encuentran al estado de ion dipolar (pH = 6,02 = pHi). La adicién de dcido aumenta la concentracién de H* del medio y determina la acep- tacién de protones por parte dé grupos -COO”, Al legar a pH 2,34. la mitad de los grupos COOH pre- sentes se encuentta al estado no disociado; las con 13 2 | tan-cHR-coo", " plt= p= 9,69 + ¢ H; N-CHR-COO™ 10 0 5 ° 5 10 Volumen HCI (mi) ———— Volumen NaOH (mi) -6. Curva de titwlacién de alanina centraciones de las formas *H,N-CHR-COOH y *H,N-CHR-COO*

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