User Manual SYMRI

SyMRI ®
SyntheticMR AB
2018-08-30
User Manual
Version 11.0.7
UDI: (01)07340024700030(8012)11.0.7
SyMRI 11
Applicable Regulations
This section contains important information about regulatory clearance and usage of
SyMRI. Note that SyMRI is classified as a medical device (MD) and is therefore subject
to regulation that applies for clinical and non-clinical use.
For instance, in the European union the Medical Device Directive (MDD) applies.
SyMRI may only be used if and when legally permitted, check with local authorities and
SyntheticMR AB if uncertain if this version of SyMRI can be legally used by you in your
domain.
WARNING: If the regulatory domain that applies for you is not listed in this
section SyMRI may not be used for any other purpose than demonstration
or investigation as a non-medical device and shall not be used for diagnosis
or any kind of patient management purposes.
The marking “MEDIC AL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) ” on each page of this manual is a
reference to this section for further details.
Certified Use
SyMRI complies with the following regulatory requirements. Usage is subject to local law
and the conditions of the regulations. Additional restrictions, conditions or regulations
may apply.
• CE (European Union):
SyMRI 11 is a CE-marked medical device that complies with the Council Directive
93/42/EEC (MDD). 0413
• USA/HSS (FDA):
CAUTION: United States Federal law restricts this device to sale by or
on the order of a physician
• Australia (Therapeutic Goods Administration, TGA): For the Australian market the
regulatory sponsor is: Philips Electronics Australia Ltd, 65 Epping Road
North Ryde, NSW Australia 2113
Not For Clinical Use (NFCU)

This section lists domains in which SyMRI may under certain restrictions be used in a
non-clinical setting (NFCU). For domains where NFCU usage may apply, pay attention
to the warning text that applies and any additional restrictions, conditions or regulations
that may apply.
• Canada and the countries where Health Canada regulations is applicable:
Investigational Device – To Be Used by Qualified Investigators Only

Instrument de recherche – Réservé uniquement à l’usage de chercheurs compétents
SyMRI® | MEDICAL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) APPLIC ABLE REGUL ATIONS I
Contents
APPLICABLE REGULATIONS............................................ I
Certified Use.......................................................................... I
Not For Clinical Use (NFCU).................................................. I
1 INTRODUCTION.........................................................1
1.1 Device Description.......................................................... 1
1.2 Intended Use.................................................................. 1
1.2.1 Indications for use..............................................................1
1.3 Advantages of SyMRI...................................................... 2
1.4 Abbreviations.................................................................. 3
1.5 Warnings, Cautions and Notes....................................... 4
1.5.1 Note...................................................................................4
1.5.2 CAUTION...........................................................................4
1.5.3 WARNING..........................................................................4
PART I – WORK WITH SYMRI®....................................5

2 DEPLOYMENTS OF SYMRI............................................ 6
2.1 SyMRI for Sectra PACS IDS7 (Plug-In)............................. 6
2.1.1 Starting and Exiting...........................................................6
2.1.1.1 Start SyMRI.............................................................6
2.1.1.2 Close SyMRI...........................................................7
2.2 SyMRI StandAlone for Microsoft Windows..................... 7
2.2.1.1 Start SyMRI.............................................................7
2.2.1.2 Close SyMRI...........................................................7
2.3 SyMRI StandAlone for macOS........................................ 7
2.3.1.1 Start SyMRI.............................................................7
2.3.1.2 Close SyMRI...........................................................7
2.3.2 Keyboard Shortcuts............................................................7
2.4 SyMRI for Network.......................................................... 8
2.4.1.1 Start SyMRI.............................................................8
2.4.1.2 Close SyMRI...........................................................8
3 CONCEPTS AND FUNCTIONS...................................... 9

3.1 Concepts......................................................................... 9
3.1.1 Package..............................................................................9
3.1.1.1 SyMRI IMAGE.........................................................9
3.1.1.2 SyMRI NEURO........................................................9
3.2 Workspace...................................................................... 9
3.2.1 Viewport...........................................................................10
3.2.1.1 Viewport Image Information................................10
3.3 Toolbar.......................................................................... 11
3.4 Options and Preferences.............................................. 12
3.4.1 Layout Options................................................................12
3.4.2 View Options...................................................................12
3.4.3 Other................................................................................13
3.5 Viewing Images............................................................. 13
3.5.1 Zoom................................................................................13
3.5.2 Navigate...........................................................................13
3.5.3 Windowing.......................................................................14
SyMRI® | MEDICAL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) CONTENTS II

PART II – SYMRI® IMAGE..........................................15
4 FUNCTIONS IN SYMRI IMAGE..................................... 16
4.1 Synthetic Contrast Weighted Images........................... 16
4.1.1 Display of Synthetic Contrast Weighted Images.............17
4.1.2 Adjusting the Image Contrast..........................................18
4.1.3 Adjusting FLAIR Images...................................................19
4.1.4 Adjusting Double IR Images............................................19
4.1.5 Navigation Window for Contrast Images.........................20
4.2 SyMaps......................................................................... 20
4.2.1 Display of SyMaps............................................................20
4.3 Region of Interest (ROI)................................................ 21
4.3.1 Create and Adjust ROI.....................................................21
4.3.2 Information in ROI............................................................21
4.3.3 ROI Preferences...............................................................22
4.3.4 Functions on a ROI..........................................................23
4.4 Plots.............................................................................. 23
4.5 Save and Load.............................................................. 24
4.5.1 Save SyMaps....................................................................24
4.5.1.1 Save Time.............................................................25
4.5.2 Save a Screenshot of the Workspace...............................25
4.5.3 Save Image Stacks...........................................................25
4.5.3.1 Save this Stack.....................................................25
4.5.3.2 Save all visible stacks...........................................26
PART III – SYMRI® NEURO....................................... 27

5 FUNCTIONS IN SYMRI NEURO....................................28
5.1 The Intracranial Mask.................................................... 28
5.1.1 Adjusting the Intracranial Mask........................................29
5.1.2 Additional Functions for the Intracranial Mask................30
5.2 Tissue Segmentation.................................................... 30
5.2.1 Brain Parenchyma and CSF Segmentation......................30
5.2.2 Myelin Correlated (MyC) Partial Volume Mapping..........31
5.3 Segmentation Maps...................................................... 32
5.3.1 Display Segmentation Maps............................................33
5.3.2 Background Image for Segmentation..............................33
5.4 User Mask for User Defined Segmentation................... 34
5.4.1 Display the User Mask......................................................34
5.4.2 Measuring Volume Using the User Mask.........................34
5.4.3 Create and Adjust User Mask..........................................34
5.4.3.1 Edit User Mask Using a ROI.................................34
5.4.3.2 Additional Ways to Adjust the User Mask............35
5.4.4 Save and Load the User Mask..........................................36
5.5 Segmentation Table...................................................... 36
5.5.1 Displaying Volumes per Slice...........................................37
5.5.2 User Mask in the Segmentation Table.............................37
5.5.3 Exporting the Segmentation Table..................................37
5.6 ROI in SyMRI NEURO................................................... 37
5.6.1 Measuring the Volume of Segmented Tissue..................38
5.7 Plots in SyMRI NEURO.................................................. 38
SyMRI® | MEDICAL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) CONTENTS III

PART IV – IMPORTANT INFORMATION........................ 39
6 WARNINGS............................................................ 40
6.1 Image Artifacts.............................................................. 40
6.1.1 Motion Artifacts...............................................................40
6.2 Deviations – Synthetic MRI........................................... 40
6.2.1 Black Blood .....................................................................40
6.2.2 Flow Sensitivity................................................................41
6.2.3 Small Features Might Disappear......................................41
6.3 Functions Specific for Synthetic MRI............................. 41
6.3.1 Use ROI to Null Tissue.....................................................41
6.3.2 Quantitative Measurements.............................................42
6.3.2.1 Dynamic Range....................................................43
6.3.3 Segmentation...................................................................43
6.3.4 Factors Affecting the Volume Estimations.......................43
6.3.4.1 Accuracy...............................................................44
6.3.4.2 Repeatability........................................................44
6.4 Additional Warnings..................................................... 45
6.4.1 System Requirements......................................................45
6.4.1.1 Slice Gap..............................................................45
6.4.1.2 Slice Thickness.....................................................46
6.4.2 Follow-up Examinations Using Different Analysis Tools...46
6.4.3 Character Encoding.........................................................46
6.4.4 Anonymization Software..................................................46
6.5 Scanner Specific Warnings............................................ 47
6.5.1 GE....................................................................................47
6.5.1.1 Anonymization.....................................................47
6.5.2 Philips...............................................................................47
6.5.2.1 Multiple Packages................................................47
6.5.2.2 Slice Order...........................................................47
6.5.3 Siemens............................................................................47
6.5.3.1 Patient Position....................................................48
PART V – APPENDIX.............................................. 49
7 KEYBOARD SHORTCUTS............................................50
SyMRI® | MEDICAL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) CONTENTS IV

1 Introduction
1.1 Device Description
SyMRI allows the user to generate multiple image contrasts from a single acquisition
scan. This is accomplished by post-processing a multi-delay, multi-echo acquisition
(MDME) into parametric maps. The parametric maps are R1, R2 relaxation rates, and
proton density (PD). The inverse relaxation parameters, T1 relaxation time (1/R1), and
T2 relaxation time (1/R2) are also provided as parametric maps. The parametric maps
can be visualized as contrast weighted MR images, such as T1-, T2-, PD, and Inversion
Recovery (IR) weighted images (including T1W FLAIR, T2W FLAIR, STIR, Double IR,
and PSIR weighted images). SyMRI calculates the pixel signal intensity as a function of
R1, R2, PD, and desired MR scanner settings, such as echo time (TE), repetition time
(TR), and inversion delay time (TI). A number of default settings for TE, TR, and TI
are provided, but the user has the ability to change the contrast of the images. SyMRI
generates all the different image contrasts from the same parametric maps, derived from
the same acquisition. This leads to enhanced image slice registration, owing to the absence
of inter-acquisition patient movement. SyMRI provides the user the ability to change the
contrast of the images after the acquisition. This is performed by adjusting the TE, TR,
and/or TI parameters post-acquisition, to generate the specific contrast desired.
SyMRI also enables the users to obtain volumetric information in the head, including
white matter (WM), grey matter (GM), cerebrospinal fluid (CSF), Myelin correlated (MyC)
partial volume, brain parenchyma (BP) and intracranial cavity (IC). This is accomplished by
using tissue definitions based on the parametric maps. The tissue definitions
provide tissue partial volume, or tissue fraction, per voxel. SyMRI also provides
image processing tools to extract the values of the parametric maps, and tissue partial
volume, per individual pixel, per region of interest, or the entire imaging volume.
SyMRI is intended to be used on data produced by any of the following acquisition
sequences:
• MDME sequence data from GE MAGiC
• MDME sequence data from Philips SyntAc
• MDME sequence data from Siemens MDME (C2P)1
1.2 Intended Use

1.2.1 Indications for use
SyMRI is a post-processing software medical device intended for use in visualization
of the brain. SyMRI analyzes input data from MR imaging systems. SyMRI utilizes
data from a multi-delay, multi-echo acquisition (MDME) to generate parametric maps of
R1, R2 relaxation rates, and proton density (PD). SyMRI can generate multiple image
contrasts from the parametric maps. SyMRI enables post-acquisition image contrast
adjustment. SyMRI is indicated for head imaging.
SyMRI is also intended for automatic labeling, visualization and volumetric quantification
of segmentable brain tissues from a set of MR images. Brain tissue volumes are
determined based on modeling of parametric maps from MDME images.
When interpreted by a trained physician, SyMRI images can provide information useful
in determining diagnosis. SyMRI should always be used in combination with at least
one other, conventional MR acquisition (e.g. T2W FLAIR).
1
Not yet 510(k) cleared by the US FDA and thus currently not available for sale in the US unless
limited to research or investigational use
SyMRI® | MEDICAL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) 1 INTRODUCTION 1

1.3 Advantages of SyMRI
SyMRI only uses a single acquisition to obtain R1, R2 and PD values. Synthetic T1W,
T2W and FLAIR images with any choice of echo time TE, repetition time TR and
inversion delay time TI can be shown without the need to rescan the patient. Therefore,
the method can save valuable scan time for the MR examination.
CAUTION: The synthetic T2W FLAIR shows an edge-enhancement effect

at the interface of CSF and brain tissue. It is the result of partial volume
effects of the acquisition voxels at the interface.
Use of the synthetic T2W FLAIR contrast depends on the clinical question. The synthetic
T2W FLAIR has an excellent sensitivity for changes in brain tissue.
CAUTION: We recommend that any changes visible in T2W FLAIR are

confirmed using the T2W, PDW, PSIR or Double IR of the same synthetic
dataset.
Since all synthetic contrast weighted images are generated from the same parametric
maps, from the same acquisition, the synthetic images will be registered. This means
that a finding in T2W FLAIR will appear in the exact same pixel in the other synthetic
contrast weightings (T2W, PDW, PSIR or Double IR) for confirmation or rejection as
a false positive.
CAUTION: For diagnosis of illnesses resulting in edge-enhancements in the

T2W FLAIR, such as inflammatory reactions or hemorrhages, the synthetic
sequence alone may not be sufficient for diagnosis. In case of doubt, the
addition of for example a conventional 3D-FLAIR is recommended.
WARNING: Patient management decisions should not be made based solely

on synthetic contrast weighted images from SyMRI and should always be
used in combination with conventional MRI or other diagnostic tools applicable.
The tissue segmentation features provide quantitative measures. This can support
objective assessment of the patient.
This user manual provides an overview of available functionality and describes all concepts
used in the software.

1.4 Abbreviations
The following abbreviations are used in the manual.
BPV The Brain Parenchymal Volume; the volume of all tissues in

the ICV excluding the CSF volume
BPF The Brain Parenchymal Fraction, the BPV divided by the ICV
CSF SyMRI’s definition of Cerebrospinal Fluid (see Section 5.2)

DIR Double IR, an inversion recovery image with two inversion times
FLAIR FLuid Attenuated Inversion Recovery, an MR image where the

signal from CSF is suppressed
GM SyMRI’s definition of gray matter (see Section 5.2)
HUD Heads-Up Display; the information presented alongside an
image in SyMRI, like patient- and image information
ICV Intracranial Volume; the total volume of the Intracranial mask
IR Inversion Recovery; imaging where an inversion prepulse is applied.

MRI Magnetic Resonance Imaging
MyC SyMRI’s tissue definition that correlates with Myelin
Non-WM/GM/CSF Tissue with characteristics which deviate from WM, GM and
CSF (see Section 5.2)
PD The proton density
PDW An image with PD-weighted contrast, typically short TE and long TR
PSIR Phase Sensitive Inversion Recovery, an image with inversion
recovery where the signal sign is kept
R1 The longitudinal R1 relaxation rate (1/T1)
R2 The transverse R2 relaxation rate (1/T2)
ROI Region of Interest; a user-defined region in one slice in the data
set, drawn with a dedicated ROI-tool
STIR Short T1 IR image, a fat suppression technique
SyMaps A map that shows one of the quantitative values T1, T2, R1, R2 or PD
T1 The longitudinal T1 relaxation time (1/R1)
T1W An image with T1-weighted contrast, typically short TE and short TR
T2 The transverse T2 relaxation time (1/R2)
T2W An image with T2-weighted contrast, typically long TE and long TR
TE The echo time
TI The inversion delay time after an inversion pulse
TR The repetition time
UM User Mask, see Section 5.4
WM SyMRI’s definition of (myelinated) white matter (see Section 5.2)

1.5 Warnings, Cautions and Notes
1.5.1 Note
Notes contain important information about features in SyMRI that needs to be highlighted.
Information presented as Notes includes helpful tips, specific limitations to the
availability of certain functions, as well as highlighting behavior in SyMRI that may not
be intuitive to the user.
NOTE: Example of Note
1.5.2 CAUTION
Cautions indicate potentially hazardous situations for the patient or user that could
result in lost time, reduced image quality and/or the patient having to be re-examined.
Cautions also indicate how such situations are avoided.
CAUTION: Example of Caution
1.5.3 WARNING
Warnings indicate potentially hazardous situations that could result in injury for the
patient, mainly in the form of misinterpretation and misdiagnosis. Warnings also indicate
how such situations are avoided.
The ISO 15223-1:2016 warning symbol is used with these warnings to highlight the
importance of the warning.
WARNING: Example of Warning

Part I
Work with SyMRI®
2 Deployments of SyMRI
SyMRI is available in several deployments, depending on your system and licensing one
or more deployment modes are available.
Please consult your system administrator or manager for queries on which deployments
are available for your use.
Most functionality, behavior and user interface interactions are identical across all deploy-
ments whereas some aspects differ slightly. The following chapters of this part of
the user manual describes the differences and some particulars of the deployments.
In some places in the other parts of the user manual there are sections that only apply
to one of the deployments. These sections are marked with a margin note and a vertical
bar in the following manner:
This paragraph only applies to SyMRI for Sectra PACS IDS7 (Plug-In). Plug-In
This paragraph only applies to SyMRI StandAlone. StandAlone
This paragraph only applies to SyMRI for Microsoft Windows. Windows
This paragraph only applies to SyMRI for macOS. macOS
This paragraph only applies to SyMRI for Network. Network
2.1 SyMRI for Sectra PACS IDS7 (Plug-In)

When SyMRI is used as a plugin in Sectra PACS IDS7 the application toolbar and menu
are placed in a floating toolbar window instead of attached to the main window. The
floating toolbar can be freely moved at your discretion.
The workspace with the floating toolbar can be seen in Figure 2.1.
Figure 2.1: The workspace in SyMRI with a floating toolbar.
2.1.1 Starting and Exiting

This chapter describes how to start SyMRI on a Sectra IDS7 workstation.
2.1.1.1 START SYMRI

• Start and log on to Sectra IDS7.
• Open desired image stack in a Sectra IDS7 image window.
• Select “SyMRI” in the clinical application menu.
• SyMRI starts and can be used.
In the event of non-recoverable errors during loading, SyMRI will terminate and return
to Sectra PACS IDS7 after displaying a message box with information about the error.
SyMRI® | MEDICAL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) 2 DEPLOYMENTS OF SYMRI 6

2.1.1.2 CLOSE SYMRI
SyMRI is closed by using the menu item File›Exit SyMRI in the floating toolbar (see
Section 3.3).
Do not close the Sectra image window before exiting SyMRI since it can cause incorrect
termination of SyMRI.
2.2 SyMRI StandAlone for Microsoft

Windows
This chapter describes how to start the StandAlone deployment of SyMRI.
2.2.1.1 START SYMRI

• Start the SyMRI stand-alone program.
• Click on the main window background and select the desired dataset.
In the event of a dataset related error during loading, SyMRI will return to the main
window where you can click to start on a different dataset after a message box with
information about the error has been displayed. If the error is not recoverable, SyMRI
may exit after displaying the error message.
2.2.1.2 CLOSE SYMRI

SyMRI can be closed using the menu item File›Exit SyMRI in the toolbar (see Section
3.3) or by pressing the main window’s close button.
2.3 SyMRI StandAlone for macOS

This chapter describes how to start the StandAlone deployment of SyMRI.
2.3.1.1 START SYMRI

• Start the SyMRI stand-alone program.
• Click on the main window background and select the desired dataset.
In the event of a dataset related error during loading, SyMRI will return to the main
window where you can click to start on a different dataset after a message box with
information about the error has been displayed. If the error is not recoverable, SyMRI
may exit after displaying the error message.
2.3.1.2 CLOSE SYMRI

SyMRI can be closed using the menu item SyMRI›Exit SyMRI in the menubar (see
Section 3.3) or by pressing the main window’s close button.
2.3.2 Keyboard Shortcuts

On macOS the following shortcut keys are different from Windows:
• instead of Ctrl.
• F13 instead of Insert.

2.4 SyMRI for Network
This chapter describes how SyMRI is used in networking mode.
2.4.1.1 START SYMRI

• Start SyMRI from PACS.
• Depending on if a single series or a study has been selected, a list of series which can
be loaded is presented.
• If there are saved user masks or intracranial masks, one of these may be selected after
the series has been loaded from the network.
In the event of non-recoverable errors during loading, SyMRI will terminate after displaying
a message box with information about the error.
2.4.1.2 CLOSE SYMRI

SyMRI can be closed using the menu item File›Exit SyMRI in the toolbar (see Section 3.3)
or by pressing the main window’s close button.

3 Concepts and Functions
This chapter describes general concepts, functions, user commands and functions accessible
in all packages within SyMRI. Specific functionality for each separate package is
covered in the following chapters.
3.1 Concepts
3.1.1 Package
There are two packages available in SyMRI, SyMRI IMAGE (Chapter 4) and SyMRI NEURO
(Chapter 5). Depending on your licensing one or more of them are available for use.
When a dataset has been loaded, the active package can (if your licensing permits) be
changed via the menu item Preferences›Switch Package.
3.1.1.1 SYMRI IMAGE

The SyMRI IMAGE package is available with an IMAGE or NEURO license. See
Chapter 4 for a description of the SyMRI IMAGE package and its functionality.
3.1.1.2 SYMRI NEURO

The SyMRI NEURO is only available with a NEURO license and will automatically be
selected when a brain dataset is loaded and classified as a brain (the text: “Recognized
Object: Brain” appears on the left side of the image).
If the dataset is classified as another anatomy/object, the SyMRI IMAGE package will
be selected instead. You can change to SyMRI NEURO using the menu item Preferences
›Switch Package.
SyMRI NEURO contains all features of SyMRI IMAGE, but also provides automatic
tissue segmentation, volume calculations and BPF-measurement. See Chapter 5 for a
description of the SyMRI NEURO package and its functionality.
3.2 Workspace
The complete window covered by SyMRI is called the workspace. The workspace (Figure
3.1) includes one or several viewports with images or tables.
The workspace is controlled by using the SyMRI menu and toolbar (section 3.3). The
keyboard and mouse can also be used.
Figure 3.1: The

workspace in SyMRI
configured with five
viewports. The contents
in the toolbar and
menus depend on the
current package and
your licensing.
SyMRI® | MEDICAL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) 3 CONCEPTS AND FUNCTIONS 9

3.2.1 Viewport
Each separate image or table within the workspace of SyMRI is called a viewport. Each
viewport can display one image with image information (Figure 3.2), or (if your licensing
permits) a table of tissue volumes. The viewport where the mouse pointer is placed is
always active. The viewport content is controlled by the right-click menu.
Figure 3.2: Two viewports in the SyMRI workspace. When a ROI is active,
additional information is displayed on the right side of the viewport.
3.2.1.1 VIEWPORT IMAGE INFORMATION

The viewport image information can also be referred to as the “HUD” (Heads-Up Display).
The information displayed in the HUD depends on what type of image is shown
in the viewport.
Patient information: The patient information is displayed in the upper left corner and
includes patient name, ID, age, and gender.
Examination information: The examination information is displayed in the upper left
corner, below the patient information. Protocol name, acquisition date and time
is displayed, and if applicable, information about administered contrast agent.
NOTE: If any of the displayed information is missing from the data set, e.g. due to
anonymization, the line usually displaying this data will be completely removed from
the HUD and the subsequent lines will be moved up so that no empty space is visible.
WARNING: Information about the contrast agent/bolus is shown only if

the dataset contains the DICOM tag that indicates that a contrast agent or
bolus was used in the scanning. When this tag is present, a line starting
with “Contrast:” is shown. If the tag is present but has no value, the line
will be “Contrast: Yes”. If the tag has a custom value, the custom value will
be displayed instead of Yes. When this DICOM tag is not present, meaning
that no contrast agent/bolus was used, the contrast/bolus line is not shown.

Acquisition geometry: The aquisition geometry is displayed in the bottom left corner
of the viewport. This includes FOV, slice thickness, slice gap, number of slices
and the position of the current slice.
Zoom and Windowing: The current zoom, as well as the center and width of the win-
dowing is displayed in the upper right corner.
Information on contrast weighting is only visible in viewports where a contrast weighted

image is displayed.
Contrast weighting information: The contrast weighting information is displayed in the

upper left corner, below the Examination information, and at the top of the
viewport. The information to the left contains the scanner parameters, like TE,
TR, etc. (Section 4.1). The current contrast weighting is written at the top of the
viewport.
Navigation window: The navigation window appears below the text in the upper left
corner. (Section 4.1.5)
There is also some information that is only displayed when a ROI is active in a viewport
(Section 4.3).
ROI info: Statistical information about the ROI appear in the upper right corner, below
the Zoom and Windowing information. It contains information about the tissue
properties within the ROI, as well as the signal intensity (Section 4.3.2).
ROI plot: A scatter plot also appears in the bottom right corner of the viewport (Section 4.4).
Some additional information may be displayed when using a SyMRI NEURO license
(Section III).
3.3 Toolbar
The commands available in the SyMRI toolbar target the entire workspace rather than
one specific viewport. The contents in the toolbar and menus depend on the current
package and your licensing. For example language and workspace settings are found in
the toolbar, along with functions for exporting entire datasets and screenshots.
The availability of some features depends on your licensing.
Figure 3.3: The toolbar in SyMRI. The upper is the toolbar for SyMRI NEURO
with the AutoROI Tool. The lower is the toolbar in SyMRI IMAGE.
The specific commands in the toolbar and on the right-click menu are described in the
following sections.
NOTE: Even though SyMRI is integrated in Sectra IDS7, it is a separate program.

The tools available in the Sectra IDS7 application can NOT be used in SyMRI and Plug-In
vice versa. Only the tools on the SyMRI floating toolbar are applicable to SyMRI.
Pressing the close button or closing the Sectra IDS7 main window without exiting
SyMRI may cause SyMRI to terminate incorrectly or leave the floating toolbar
window accessible until a new patient or examination is selected.
In macOS the menubar is found at the top of the screen when SyMRI is in focus. macOS

3.4 Options and Preferences
3.4.1 Layout Options
The number of viewports can be changed.
View › 1 Viewport «Ctrl+1» Show one viewport
View › 2 Viewports «Ctrl+2» Show two viewports
View › 3 Viewports «Ctrl+3» Show three viewports
View › 4 Viewports «Ctrl+4» Show four viewports
View › 5 Viewports «Ctrl+5» Show five viewports
View › 6 Viewports «Ctrl+6» Show six viewports
Viewport layouts, including the settings of each viewport, can be saved and loaded.
Preferences › Save Current Layout Save current layout with number of viewports, time
parameters, overlay type, type of SyMaps and image settings. When saving the layout,
a dialog box asking for a name of the layout is shown.
If there are any saved layouts, SyMRI will select one as start-up layout whenever SyMRI
is started. Which layout is selected depends on three criteria:
1. Acquisition orientation
2. Recognized object
3. Field strength
If no exact match can be found, the closest match will be selected by matching the
criterias in the order specified above.
Preferences › Load Layout Load a saved layout. Each saved layout is an item in a submenu
with the name given when saving the layout. Selecting one of the items loads that
layout. This layout will be used as default layout when starting SyMRI.
Preferences › Delete Layout Delete a saved layout. Each saved layout is an item in a

submenu with the name given when saving the layout. Selecting one of the items deletes
that layout.
3.4.2 View Options

View › Link Zoom and Pan All viewports in the workspace are linked. The pan and
zoom will be adjusted simultaneously in all viewports. This will make the zoom and pan
identical for all images.
View › Interpolate «Ctrl+P» Interpolation gives a smoother visualization of contrast

weighted images and SyMaps. Interpolation of images is active by default and is always
linked between all viewports. This setting is not affected by, and does not effect,
View › Link Zoom and Pan.

NOTE: Zooming out far while interpolation is turned off may cause aliasing artifacts in
the image.
Right-Click › Image Settings › Color «C» When the color option is activated, the image
stack is displayed in color instead of grayscale. Synthetic contrast weighted images
cannot be visualized in color. (See Section 5.3.2)
3.4.3 Other
Preferences › Language Choose desired language from the list of available languages.
When any language other than English is used the menu item always contains the text
“(Language)” (in English) after the word for language in the currently chosen language.
The sub-menu contents are the names of each available language, written in that language
File › About SyMRI Information about the currently running version of SyMRI will Windows
be displayed.
SyMRI › About SyMRI Information about the currently running version of SyMRI macOS
will be displayed.
3.5 Viewing Images

3.5.1 Zoom
Zoom Tool «Z» Moving the mouse while keeping the left mouse button down will zoom
the image stack in the viewport. Movement forward zooms in and movement backward
zooms out. Tables and plots cannot be zoomed.
Right-Click › Zoom › Zoom in «Ctrl+Z» The image is zoomed in one step.
Right-Click › Zoom › Zoom out «Ctrl+Shift+Z» The image is zoomed out one step.
The zoom steps are predefined.
Right-Click › Zoom › Zoom to Fit Window The size of the image is adjusted to the size
of the viewport.
Right-Click › Zoom › Pixel to Pixel One voxel in the original DICOM-dataset is displayed
using one pixel on the computer screen. For non-square voxels the shortest side of the
voxel in the image plane is mapped to one pixel on the computer screen.
3.5.2 Navigate
Scroll through image stack: Scroll through the image stack by scrolling the mouse wheel
or using the «Page Up» and «Page Down» keys. The first slice of an image stack
is reached through «Home». The last slice is reached through «End».
The following tools can be found in the SyMRI toolbar.
Paging Tool «F4» Moving the mouse while keeping the left mouse button down will
scroll through the image stack.
Pan Tool «F5» «P» Moving the mouse while keeping the left mouse button down will
pan the image stack in the viewport. Tables and plots cannot be panned.

3.5.3 Windowing
Windowing: Keep the middle mouse button or mouse wheel down and move the mouse
to adjust the contrast and intensity of the image. Horizontal movement will change
the window centre and vertical movement changes the window width. The centre
and width will determine the gray- or color-scale of the image, which in turn affects
brightness and contrast.
Right-Click › Image Settings › Auto Scale «A» The image brightness and contrast is set
to suit the image in the viewport.

Part II
SyMRI® IMAGE
4 Functions in SyMRI IMAGE
In SyMRI IMAGE the functionality to perform Synthetic Magnetic Resonance Imaging
is available. The approach uses a single MR quantification scan to measure the tissue
properties R1 and R2 relaxation rates and proton density PD. Based on these three
properties contrast weighted images such as T1W, T2W or FLAIR can be synthesized
with a free choice of echo time TE, repetition time TR, in case of an inversion pulse,
inversion delay time TI, and in case of a double inversion pulse, a second inversion delay
time TI2.
Default settings for common contrast weighted images are provided but the user may
alter TE, TR, TI and TI2 to any possible value.
CAUTION: The synthetic images are acquired and calculated differently

than actual conventional images and therefore the image contrast is very
similar, but not necessarily identical, even at the same settings for TE, TR
and TI. Take your time to find a setting of TE, TR and TI such that either
the appearance of the images is similar to those you are accustomed to, or
optimized according to your needs.
Interpretation of synthetic images should be done with care and an educational
period to learn the nuance differences between synthetic and conventional
images is recommended.
Figure 4.1: When SyMRI IMAGE is started, four viewports are shown with
synthetic contrast weighted images: T2W, T2W FLAIR, PSIR and T1W
4.1 Synthetic Contrast Weighted Images

The synthetic contrast weighted images are calculated using the measured R1, R2 and
PD values in combination with the selected TE, TR, TI and TI2 settings.
SyMRI® | MEDICAL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) 4 FUNCTIONS IN SYMRI IMAGE 16

4.1.1 Display of Synthetic Contrast Weighted Images
A number of preset contrast weightings can be selected using the right-click menu or
keyboard commands. The available settings may depend on your licensing.
Contrast Layout «Ctrl+R» Four viewports with contrast images are displayed: a T2W,
a T2W FLAIR, a T1W and a PSIR. Default values for TE, TR and TI are listed in table
4.1. Table 4.2 shows the defaults for DIR when a DIR enabled license is used.
Right-Click › T1W «1» A T1-weighted image is displayed in the active viewport. In
T1-weighted images, areas with low proton density are weighted to enhance the image
contrast between gray and white matter.
Right-Click › T2W «2» A T2-weighted image is displayed in the active viewport.
Right-Click › PDW A PD-weighted image is displayed in the active viewport.
Right-Click › T1W FLAIR A T1-weighted Fluid Attenuated IR image is displayed in the
active viewport.
Right-Click › T2W FLAIR «3» A T2-weighted Fluid Attenuated IR image is displayed
in the active viewport.
Right-Click › STIR «4» A T2-weighted Short Tau IR image is displayed in the active
viewport.
Right-Click › PSIR «5» A Phase Sensitive IR image is displayed in the active viewport.
Right-Click › PSIR (vessel) A Phase Sensitive IR image to highlight blood vessels is
displayed in the active viewport.
Right-Click › Double IR (WM supp) A Double IR image is displayed in the active viewport,
which suppresses both WM and CSF.
Right-Click › Double IR (GM supp) A Double IR image is displayed in the active viewport,
which suppresses both GM and CSF.
NOTE: The DIR menu items are only available if you have a license that enables the
DIR feature.
Table 4.1: Default values for TE, TR, TI for the different synthetic contrast weighted images.
Image Type TE TR TI
T1W 10 ms 500 ms
T2W 100 ms 4 500 ms
PDW 10 ms 8 000 ms
T1W FLAIR 10 ms 2 500 ms 1 050 ms
T2W FLAIR 100 ms 15 000 ms 3 000 ms
STIR 100 ms 15 000 ms 300 ms
PSIR 10 ms 6 000 ms 500 ms
PSIR (vessel) 10 ms 8 000 ms 10 ms
Table 4.2: Default TE, TR, TI and TI2 values for DIR for the supported field strengths.
Image Type Field Strength TE TR TI TI2
Double IR (WM supp) 1.5 T 100 ms 15 000 ms 420 ms 3 600 ms
Double IR (GM supp) 1.5 T 10 ms 6 000 ms 700 ms 3 200 ms

4.1.2 Adjusting the Image Contrast
SyMRI allows post-examination control of the contrast weighting in the synthetic contrast
weighted images. This is done by adjusting TE, TR, TI and TI2. These options can
be selected in the right-click menu, their toolbar icon or keyboard shortcuts as indicated
below. When adjusting the contrast weighting by holding down the left mouse button,
you can revert the changes by pressing «Esc» before releasing the left mouse button.
Adjust TE «Q» TE is adjusted by moving the mouse while holding down the left mouse
button.
Adjust TR «W» TR is adjusted by moving the mouse while holding down the left mouse
button.
Adjust TR/TE «E» TR and TE are adjusted simultaneously by moving the mouse while
holding down the left mouse button.
Adjust TI «R» TI is adjusted by moving the mouse while holding down the left mouse
button. The option is available when the inversion pre-pulse is activated.
Adjust TI-TI «T» TI and TI2 are adjusted by moving the mouse while holding down
the left mouse button. The option is available when the double inversion pre-pulse is
activated.
NOTE: When the Adjust TI or Adjust TI-TI tool is selected, the mouse pointer will become
a red circle when passing over contrast weighted images where the corresponding inversion
pulse(s) are not active. Attempting to adjust TI or TI2 for such an image will trigger a dialog
box, asking you if you want to activate the corresponding inversion pulse(s).
ROI Right-Click › Use ROI to Null Tissue The contrast weight of the image will be
adjusted, making tissue within the ROI appear black in the image. This is done through an
inversion pre-pulse with an optimized TI. To null tissue of a certain type: place and adjust
the size of a ROI so that the ROI only includes tissue of the type you want to cancel out
the signal from. This will adjust TI in the shown image. In a DIR image, the TI used to null
CSF will be adjusted to keep nulling CSF, while the other TI will be optimized to null the
tissue in the ROI. Functions to draw a ROI are described in Section 4.3.
Also, see Section 6.3.1 (Use ROI to Null Tissue).
Right-Click › Image Settings › Inversion Prepulse «Ctrl+I» An inversion pre-pulse will

be activated in the image. The TI of the inversion pre-pulse is displayed to the left in
the view and can be adjusted using Adjust TI.
Right-Click › Image Settings › Double Inversion Prepulse Activate double inversion

prepulse in the image. The inversion times are displayed to the left in the view and can
be adjusted using Adjust TI-TI.
Right-Click › Image Settings › Enable PSIR When PSIR is inactivated, negative values

are visualized as the corresponding absolute value. Negative values occur in images with
an inversion pulse, for example PSIR. In conventional MRI, only the absolute value can
be displayed. Using SyMRI the negative values can be shown by activating PSIR. When
PSIR is activated the string “PSIR (synthetic)” will be shown in the viewport HUD.

4.1.3 Adjusting FLAIR Images
In a FLAIR image, fluid (CSF) is suppressed using a combination of an inversion pulse
and an inversion delay such that the fluid signal is nulled. The combination of TR and
TI used may vary across hospitals and it is important to be aware of the differences.
Figure 4.2: Various setting of T2W FLAIR on an MS patient (post-Gd). A: TR/TI = 12 000/2 850 ms, B:
TR/TI = 12 000/2600 ms, C: TR/TI = 12 000/2 400 ms, D: TR/TI = 6 000/2 000 ms. The TE = 100 ms in
all cases.
In Figure 4.2, a number of examples are given for optimization of FLAIR images: CSF
is exactly nulled using the combination TR/TI = 12 000/2 600 ms, resulting in very
black CSF (Figure 4.2 B). However, a longer TI at the same TR still has a reasonably
suppressed CSF but higher GM/WM contrast (Figure 4.2 A). A typical clinical FLAIR
setting, using a short TR for scan time reduction, leads to degradation of GM/WM
contrast but no change in scan time for synthetic MRI (Figure 4.2 D).
SyMRI annotates an image as FLAIR when the TI value is near the value that suppresses
CSF completely. For other TI values the image is annotated as IR.
Also, see Section 6.3.1 (Use ROI to Null Tissue).
4.1.4 Adjusting Double IR Images

In a Double IR image two tissues of choice are suppressed using a combination of two
inversion pulses and inversion delay times. For example, WM, GM or fat can be
suppressed simultaneously as CSF. In Figure 4.3 a number of examples are provided
together with the suggested settings.
Figure 4.3: Example settings for Double IR at 3 T.

A: A DIR where white matter and CSF are suppressed using TE/TR/TI1/TI2
= 100/15 000/470/3 750 ms (Female, 35 years),
B: A DIR for pediatric applications, using TE/TR/TI1/TI2 =
10/8 000/900/3 950 ms (Male, 8 months) and
C: A fat-suppression DIR similar to a T2W FLAIR image with fat-suppression,
using TE/TR/TI1/TI2 = 100/15 000/250/3 200 ms (Male, 10 years).

To set two TI correctly is challenging and the “Use ROI to Null Tissue” (Section 4.1.2)
function is recommended.
4.1.5 Navigation Window for Contrast Images

The current contrast weighting of the image is displayed in the viewport in two ways;
as a navigation window at the left side of the viewport and as text at the top of the
viewport.
The navigation window (Figure 4.4) is displayed together with contrast weighted images.
In the navigation window, the contrast weighting of the image is indicated by a yellow
dot. When TR or TE is adjusted, use the navigation window to see how the changes
affect the contrast weighting. It is also possible to adjust TE and TR by clicking on and
dragging the yellow dot.
Figure 4.4: The circle in

the navigation window
indicates the contrast
weighting of the image
displayed in the viewport.
The text displayed at the top of the viewport changes depending on the current contrast
weighting. For spin-echo images, it can be T1W, T2W, PDW or T1+T2 weight. If an
inversion pre-pulse is active, the text will be IR, PSIR, STIR, T1W FLAIR, T2W FLAIR or
FLAIR. If two inversion pre-pulses are activated, the contrast weighting will be DIR.
4.2 SyMaps
The quantification maps in SyMRI display the measured values for tissue properties
per voxel in a dataset. The quantification maps for R1-relaxation rate, R2-relaxation
rate and proton density (PD) are the foundation of synthetic MRI. In addition to these
quantification maps the inverted relaxation times T1 and T2 are available.
4.2.1 Display of SyMaps

The quantification maps described below can be selected with the right click menu or
the indicated keyboard shortcut.
Figure 4.5: The SyMaps layout contains a synthetic contrast weighted T2W

image, SyMaps for PD, R1 and R2.
Each parameter represented as a SyMaps has a certain range within which it can be
measured. This is known as the dynamic range of SyMRI. The dynamic range of each
parameter i listed in Table 6.2.
SyMaps Layout «Ctrl+F» Four viewports are displayed with R1-map, R2-map, PD-map
and T2W synthetic contrast weighted image.
Right-Click › SyMaps › T1 Map The T1 relaxation times are displayed in ms.
Right-Click › SyMaps › T2 Map The T2 relaxation times are displayed in ms.
1
Right-Click › SyMaps › R1 Map The R1 relaxation rate is displayed in s−1, R1 = .
T1
1
Right-Click › SyMaps › R2 Map The R2 relaxation rate is displayed in s−1, R2 = .
T2
Right-Click › SyMaps › PD Map The proton density is displayed in percentage units (pu)
relative to a reference value of 100 pu, which is the proton density of water. Fat has
higher proton density than water and is therefore displayed with values above 100 pu.
4.3 Region of Interest (ROI)

A ROI can be created to select an area in the image. Through the ROI, R1, R2, PD
and the signal intensity within the marked region can be analyzed.
4.3.1 Create and Adjust ROI

Create a ROI by placing the mouse pointer on a selected spot, push down the left mouse
button and draw desired shape and size, then release the mouse button. To activate the
tool for drawing ROI, use any of the following alternatives:
Freehand ROI «F6» A ROI of free shape can be drawn. The ROI will be closed by a
linear segment when the mouse button is released.
Rectangle ROI «F7» A rectangular ROI can be drawn. The rectangular ROI can be
adjusted by marking one of the corners, holding the left mouse-button and adjusting the
ROI to the desired size.
4.3.2 Information in ROI

Information related to the ROI is displayed in the upper right corner of the viewport
(Figure 4.6), below the zoom and windowing. This block of text is referred to as ROI Info.
Figure 4.6: ROI and

related information. Two
of the lines display the
mean value and standard
deviation for R1 and R2 by
default. These two lines
can be changed to display
T1 and T2 instead.

The following information is displayed:
Position: The center coordinates of the ROI relative to the image are specified as “ROI
[#,#]”. For the free-hand ROI, the center is that of its bounding rectangle.
R1 or T1: Mean value and standard deviation of R1 or T1 within the ROI. For T1-
maps, T1 is displayed and for R1-maps, R1 is displayed.
R2 or T2: Mean value and standard deviation of R2 or T1 within the ROI. For T2-
maps, T2 is displayed and for R2-maps, R2 is displayed.
PD: Mean value and standard deviation of PD within the ROI.
Signal: Mean value and standard deviation of the voxel intensity. In synthetic images
this will correspond to the signal strength of the simulated MRI signal.
Also, see sections 5.1, 5.4 and 5.6 for additional ROI operations available in SyMRI NEURO.
4.3.3 ROI Preferences

SyMRI supports several ROI per viewport and each ROI can be specific to a certain slice.
Preferences › Multiple ROIs Enables the user to have more than one ROI per viewport.
Default is off. The active ROI has a solid outline while the other ROI have dotted
outlines. The appearance of an active and inactive ROI can be seen in Figure 4.7.
When Multiple ROIs is off, a ROI is automatically deleted when a new ROI is drawn
in the same viewport. When Multiple ROIs is on, existing ROI remain with a dotted outline.
Preferences › ROI per Slice Locks ROI to the specific slice where the ROI was drawn.
Default is off.
When ROI per Slice is off, a ROI remains visible when scrolling through the slices. ROI Info
is updated to display the statistics for the ROI in the currently visible slice. When ROI per
Slice is on, a ROI is only visible in the slice where it was drawn. When scrolling to a
different slice, the ROI will not be visible. ROI Info will only be visible in slices with a ROI.
Figure 4.7: Two ROI in the same viewport. The upper ROI is active and therefore displayed with a
solid line outline. The lower ROI is not active and therefore displayed with a dotted outline
NOTE: The information shown in the viewport is related to the ROI marked as active.
A ROI is activated by clicking on it with the left mouse button. When a new ROI is
drawn it is automatically marked as active. Which ROI is active may also be chosen by
pressing «Tab» or «Shift+Tab».

4.3.4 Functions on a ROI
Right-clicking on a ROI will display the ROI right-click menu. This menu contains
several operations for the ROI.
ROI Right-Click › Cut ROI «Ctrl+X» The ROI is copied and removed from the viewport.
ROI Right-Click › Copy ROI «Ctrl+C» The ROI is copied.
ROI Right-Click › Paste ROI «Ctrl+V» A previously copied ROI is pasted to the active
viewport.
The key command «Ctrl+V» must be used to paste the ROI into a viewport without a
ROI present. The key command «Ctrl+V» can also be used to paste the ROI as text.
The text can then be copied and pasted into SyMRI to generate an identical ROI.
ROI Right-Click › Disable ROI «Backspace» The ROI is deleted from the viewport.
ROI Right-Click › Show Plot The plot will be hidden or shown.
ROI Right-Click › Use ROI to Null Tissue See Section 4.1.2 (Adjusting the Image Contrast).
This function is automatically deactivated when changing slice.
4.4 Plots
With a ROI displayed in the image, a plot will automatically be displayed in the lower
right part of the viewport. The values of the voxels in the ROI are plotted in the graph
(Figure 4.8). The color indicates the amount of voxels that have a certain combination of
values. Red indicates a relatively high number of voxels and blue a low number (Figure 4.9).

Figure 4.8:
In the plot all
voxels within the
ROI are plotted.
The plot can be customized through the plot right-click menu.

There are three types of graphs are available in the plot right-click menu: R1-R2, R1-PD and
R2-PD plots. The plot’s axis and description change to match the selected plot type.
There are two options available for the plot scale. One small plot scale which is adapted
for values typically encountered in the brain. The other scale is a larger scale that provides a
larger interval for the R1-R2, R1-PD and R2-PD axes. The small scale is the default and
recommended scale for the brain anatomy, other anatomies will default to the large scale.
Figure 4.9: The plot

right-click menu

4.5 Save and Load
Various types of images and image stacks can be saved from SyMRI to your workstation
or PACS. Which save and load options are available depends on which deployment of
SyMRI you are using.
CAUTION: Only the SyMaps and MDME source data can be re-opened
by SyMRI. The saved contrast weighted image stacks cannot be opened by
SyMRI, but can be opened by other DICOM image viewers.
WARNING: Observe that if the workstation is shut down or an error occurs

while data is saved, the resulting data is not reliable. Remove any saved data
and save again.
Note that for some deployments the save operation might only be partially
completed when it has been completed in SyMRI. For instance, the Sectra
PACS IDS7 deployment imports the saved data as a separate step.
The Sectra PACS IDS7 starts the import when SyMRI initiates the save
operation, however even after SyMRI exits the Sectra PACS IDS7 might
still have images queued for import. If the Sectra PACS IDS7 crashes Plug-In
after SyMRI has exited you should inspect the saved data. Please refer
to your Sectra PACS IDS7 documentation for details on how the Sectra
PACS IDS7 import works.
4.5.1 Save SyMaps

The File-menu contains options for saving SyMaps.
NOTE: This function only available when using SyMRI with an MDME dataset.
NOTE: SyMaps are usually encrypted. If this is the case, there will be one file per slice.
Encrypted SyMaps can be opened in a DICOM viewer, and will be displayed as a T2W
series. The encrypted SyMaps can be opened correctly only in SyMRI.
MDME data for SyMRI typically contains over 300 images, while the quantified SyMaps
contains one or three images per slice and approximately 20 to 300 images in total.
Never delete the original dataset! Observe that the original dataset might be needed to
make reliable comparisons in future releases of the software.
File › Save SyMaps (T1T2PD) to PACS A quantified image stack will be saved to Plug-In
PACS as a separate series in the current examination.
File › Save SyMaps (T1T2PD) to Local Folder... A quantified image stack will

be saved in DICOM-format to the selected folder on the local workstation. StandAlone
A DICOMDIR is created in the folder and the stack data is saved in a subfolder.
If a DICOMDIR file already exists it is updated.
File › Save SyMaps (T1T2PD) to PACS A quantified image stack will be saved to

Network
the configured PACS via network as a separate series in the current examination.

4.5.1.1 SAVE TIME
Before SyMRI is closed, saving the quantified SyMaps is recommended if you want to
load the dataset at a later time. This is recommended because it is faster to load
quantified SyMaps than starting from unquantified raw data (MDME).
4.5.2 Save a Screenshot of the Workspace

The File-menu contains options for saving a screenshot of the workspace.
NOTE: The screenshot image cannot be opened by SyMRI but can be viewed in other
DICOM image viewers.
File › Save Screenshot to PACS Screenshot of the SyMRI workspace is saved to

Plug-In
PACS as a new series in the current examination.
File › Save Screenshot to File... Screenshot of the SyMRI workspace is saved in

DICOM format in the specified folder and given a specified file name on the workstation. StandAlone
A DICOMDIR is created in the folder and the file is saved in a subfolder. If
a DICOMDIR file already exists, it is updated.
File › Save Screenshot to PACS Screenshot of the SyMRI workspace is saved to the Network
configured PACS via network, as a new series in the current examination.
4.5.3 Save Image Stacks

NOTE: The saved contrast weighted image stack cannot be opened by SyMRI, but can
be viewed in other DICOM image viewers.
NOTE: The format of the saved images is different depending on the color setting. If
color is on, the images will be saved as RGB-images. If color is off the images will be
saved as grayscale. See Section 3.4.2.
4.5.3.1 SAVE THIS STACK

The right-click menu for each viewport contains the option for saving the stack shown in
the current viewport to a new series. The stack retains the settings from the viewport,
e.g. windowing, contrast weighting and color settings.
Right-Click › Save this Stack to PACS Saves the stack to PACS as a new series in Plug-In
the current examination.
Right-Click›Save this Stack to Local Folder... Saves the stack in DICOM format
to the specified directory on the workstation. A DICOMDIR is created in the folder StandAlone
and the stack data is saved in a subfolder. If a DICOMDIR file already exists it is
updated.
Right-Click›Save this Stack to PACS Saves the stack to the configured PACS via Network
network, as a new series in the current examination.

4.5.3.2 SAVE ALL VISIBLE STACKS
The toolbar and File-menu contains the option to save all currently visible viewports as
new series. If raw data has been opened, SyMaps are also saved.
File › Save all Visible Stacks to PACS Saves all visible stacks (along with SyMaps Plug-In
if opened from raw data) to PACS as new series in the current examination.
File › Save all Visible Stacks to Local Folder... Saves all visible stacks (along with
SyMaps if opened from raw data) in DICOM format to the specified directory on StandAlone
the workstation. A DICOMDIR is created in the folder and the stack data is saved
in a subfolder. If a DICOMDIR file already exists it is updated.
File › Save all Visible Stacks to PACS Saves all visible stacks (and SyMaps if opened
Network
from raw data) to the configured PACS via network, as new series in the current
examination.

Part III
SyMRI® NEURO
5 Functions in SyMRI NEURO
In SyMRI NEURO, the functionality to perform brain tissue characterization and brain
volume measurement is available. Using the tissue properties R1, R2 and PD the tissue
partial volumes are automatically measured. In this way, the intracranial volume (ICV)
and the brain parenchymal volume (BPV), as well as white matter (WM), gray matter
(GM), cerebrospinal fluid (CSF) and myelin correlated component (MyC) volumes are
estimated. A user mask is available to measure volumes of user-defined selection of tissue.
CAUTION: The precision of these measurements depends on several parameters,

including sequence settings, scanner manufacturer and field strength.
Measuring the same patient again with the same sequence and the same
MR scanner has a high repeatability. Any parameter change, however, such
as changing the sequence or using another MR scanner, may decrease the
precision. The brain volumes were validated at both 1.5 T and 3 T, but
tolerance between scanners can always lead to differences. It is therefore
recommended to use identical settings when doing longitudinal studies.
Figure 5.1: When SyMRI

NEURO is started five
viewports are shown. In
three of the viewports,
synthetic contrast weighted
images are displayed.
One viewport displays a
segmentation map of CSF.
The rightmost viewport
displays a segmentation
table with volume
results. Use the keyboard
accelerator «Ctrl+R» to
return to this layout.
5.1 The Intracranial Mask

WARNING: Before analyzing tissue volumes, the user shall verify that the
intracranial mask is anatomically correct. If the automatic generation is
unsuccessful, the mask must be corrected by the user using the ROI functionality.
Problems typically occur at the orbits and at the vertex and base of the skull.
SyMRI® | MEDICAL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) 5 FUNCTIONS IN SYMRI NEURO 28

Figure 5.2: The
intracranial mask
defines the ICV in
SyMRI NEURO. The
red line indicates the
outside of the ICV.
The intracranial mask defines the intracranial volume in SyMRI NEURO. All segmentation
and volume calculations are applied to the voxels included in the intracranial mask.
The intracranial mask is found by including WM, GM and CSF, followed by a region
growing algorithm to ensure a contiguous volume The edge of the mask is defined at PD
= 50, based on the assumption that the ICV edge is halfway CSF (with PD = 100) and
skull bone (PD = 0). Finally, the intracranial mask is made 0.5 mm smaller to remove
the dura mater. Note that the red ICV edge line, as displayed in Figure 5.2, is plotted
outside the ICV volume.
5.1.1 Adjusting the Intracranial Mask

The intracranial mask should be adjusted using the following steps:
1. Show the intracranial mask by selecting Intracranial Mask on the right-click menu, or
by pressing «I».
2. Scroll through all slices and verify that the intracranial mask is correct.
3. Add areas to the mask by drawing a ROI around the area. Add the area to the mask by
using Add to Intracranial Mask in the ROI right-click menu, or by pressing «Insert» on
the keyboard. Parts of the ROI that extend outside the image are ignored when editing.
4. Remove areas from the mask by drawing a ROI around the area. Remove the area
from the mask by using Remove from Intracranial Mask in the ROI right-click menu, or
by pressing «Delete» on the keyboard. Parts of the ROI that extend outside the image
matrix are ignored when editing.
5. Save the intracranial mask When the mask is correct, save changes using Save
Intracranial Mask in the File-menu. When the mask is saved, the text below the
segmentaion table will be updated to: “Intracranial mask last modified by ‘name of
user’, ‘date’, ‘time’”.
The intracranial mask is not saved automatically when SyMaps are saved, but will
be recalculated when the SyMaps are opened. It is possible to save the intracranial
Plug-In
mask when SyMaps are opened. Once an intracranial mask has been saved with
the SyMaps, this mask will be automatically loaded and displayed whenever the
SyMaps are opened.
WARNING: The intracranial mask (Figure 5.2) corresponds to SyMRI NEURO’s

definition of ICV. The tissue segmentation and volume estimation is performed for
all voxels in the intracranial mask. Tissue outside the mask will not be included in the
estimation of tissue volumes.

5.1.2 Additional Functions for the Intracranial Mask
Menu items for the intracranial mask are found in both the File- and Edit-menu:
File › Save Intracranial Mask The intracranial mask is saved and will be loaded
automatically the next time the examination is used. This menu option is only available
when a SyMaps dataset has been opened.
The information is saved to a presentation state DICOM-object file in a new series

in the same folder the data-set was loaded from. StandAlone
When saving SyMaps the intracranial mask is saved to the saved SyMaps dataset.
The information is saved to a presentation state DICOM-object in PACS in a new Plug-In
series in the same examination as the loaded data-set.
The information is saved to a presentation state DICOM-object in the configured
PACS via the network in a new series in the same examination as the loaded data-set. Network
When saving SyMaps the intracranial mask is saved to the saved SyMaps dataset.

File › Load Intracranial Mask The last saved intracranial mask is loaded.
Edit › Recalculate Intracranial Mask The intracranial mask is regenerated by the

algorithm included in SyMRI NEURO.
Edit › Clear Intracranial Mask The intracranial mask is erased. All calculated volumes are
set to zero. This function is useful when the user wants to define the brain from scratch.
Right-Click › Show Intracranial Mask Edge «H» Toggle show or hide the intracranial
mask edge.
WARNING: To create accurate segmentation results the complete skull volume

must be included in the intracranial mask. The intracranial mask shall not be used to
estimate the volume of specific parts of the brain e.g. ventricles. To segment smaller
regions of the brain the user mask (Chapter 5.4) can be used.
5.2 Tissue Segmentation

SyMRI automatically segments several tissue types. These include WM, GM, CSF
and MyC. The automatic segmentation is done on all voxels contained within the ICV,
defined by the intracranial mask.
The results of the tissue segmentations are presented in two ways, both as total volumes
presented in the segmentation table (Section 5.5) and as segmentation maps (Section 5.3).
5.2.1 Brain Parenchyma and CSF Segmentation

Within the ICV, SyMRI segments tissue into four types, where each voxel within the
ICV contains partial volumes in the interval 0 to 100 % of the voxel volume for each
tissue type. The four tissue types in SyMRI’s segmentation model are:
• WM , (Myelinated) White Matter

• GM , Gray Matter
• CSF , Cerebrospinal Fluid
• Non-WM/GM/CSF, tissue/fluid with characteristics which deviate from WM, GM and CSF
NOTE: Tissue segmented as Non-WM/GM/CSF should not be assumed to be

pathological, it is merely the remainder of the voxel volume that was not segmented
as WM, GM or CSF.
The tissue definitions of WM, GM and CSF were defined using analysis of R1, R2
and PD, as quantified by SyMRI. A neuroradiologist placed several ROI to mark areas
of pure WM, GM and CSF in brain datasets of a number of adult healthy volunteers.
Statistical analysis of the tissue properties within these ROI was used to define Gaussian
distributions of R1-R2-PD for each tissue type, also referred to as tissue clusters.
WARNING: The tissue types are similar to but not identical to tissue according
to histological classification. For example, in very young children, where
white matter has not been fully myelinated, the tissue may be segmented
as GM instead of WM. This happens since WM is modeled for myelinated
white matter and the unmyelinated white matter more closely matches the
tissue properties of GM.
WARNING: No comparison with biological white matter, gray matter or

CSF has been made.
5.2.2 Myelin Correlated (MyC) Partial Volume Mapping

Separate from the segmentation maps for WM, GM, CSF and Non-WM/GM/CSF,
SyMRI can also display a segmentation map for Myelin correlated component, MyC.
This map has a high correlation to the partial volume of myelin in each acquisition
voxel. Typical values for MyC are 0–8 % in cortical GM and 30–45 % in WM in adults.
MyC is displayed in the image as a color scale from 0 to 40 %, but the values may be
higher. Use the ROI function to verify MyC values in specific areas (see Section 5.6.1).
In the human brain, MyC typically does not exceed 50 %. MyC is not linearly proportional
to the WM partial volume, e.g. MyC may vary in areas homogeneously segmented
as 100 % WM.
MyC is based on another segmentation model than WM, GM, CSF and Non-WM/GM/CSF.
The sum of the volumes of WM, GM, CSF and Non-WM/GM/CSF add up to the total
ICV, without including MyC. Real myelin contains very thin layers of water, where
relaxation occurs too fast to be directly observed by the SyMRI acquisition. Owing to
magnetization exchange, however, the fast relaxing myelin water has an effect on the
surrounding, slower relaxing water, comprising axonal, intracellular and extracellular
water. Hence, the MyC values are based on the magnetic exchange between myelin and
the surrounding water. When myelin is present, the observed relaxation rates of the
surrounding water is higher, and the observed PD is lower, than a situation where no
myelin is present.
The MyC model contains four partial volumes, each with their own set of relaxation
rates and proton density parameters. The four partial volumes are MyC, cellular partial
volume, free water partial volume and excess parenchymal water partial volume. The
sum of these four partial volumes is 100 % for each acquisition voxel. An algorithm
is used to determine the optimal distribution of the four partial volumes to obtain the

measured R1, R2 and PD values for each voxel in the parametric maps. The MyC
partial volume has high R1 and R2 relaxation rates and low PD. The algorithm will
find a higher contribution of MyC in WM than GM, since the relaxation rates in WM
are higher than in GM, while the PD is lower in WM than in GM. Only the compartment
containing MyC can be displayed in SyMRI. More details on the model for determining
MyC are described in an open source journal which is freely downloadable via
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fneur.2016.00016/full
NOTE: There is a high correlation between MyC values and optical density of
histologically stained specimen with Luxol Fast Blue. Since the MyC represents the total
magnetic effect of myelin on the R1, R2 and PD of surrounding tissue, however, it is not
validated whether the partial volumes of MyC and real myelin are identical.
CAUTION: Pathological changes in the brain tissue that causes R1, R2 and
PD to deviate greatly from those found in non-pathological brain parenchyma
may affect the MyC segmentation. One example of such a change is severe
edema where the relaxation rates approach those of pure CSF.
5.3 Segmentation Maps

Segmentation maps are used to visualize the tissue content in each voxel within the
ICV. As default, segmentation maps are displayed as overlays, colored images that are
displayed over contrast weighted images. The contrast weighted image then acts as
a frame of reference, while the colored overlay displays tissue content. The overlays
have different color depending on which tissue they represent. Figure 5.3 displays four
different segmentation maps, displayed as overlays over contras weighted images.
For WM/GM/CSF, the tissue maps model partial volume of healthy adult tissue, which
means that the maps saturate at 100 % for tissue corresponding to pure WM/GM/CSF
and (nonpathological) changes in e.g. myelination within pure white matter are not
displayed since they are all mapped to 100 % in the WM map.
The segmentation maps (Figure 5.3) are displayed on a background, which can be a
contrast weighted image or solid black. When a segmentation map is shown on a black
background, the color scale bar is displayed in the upper right corner of the viewport.
Figure 5.3:
Segmentation maps
as overlays on T2W
backgrounds.

5.3.1 Display Segmentation Maps
The segmentation maps are activated in the Right-Click menu or through the associated
keyboard accelerator.
Segmentation Layout «Ctrl+S» Display the default segmentation layout which consists
of 5 viewports with: WM, GM, CSF, Non-WM/GM/CSF and the Segmentation Table.
Right-Click › White Matter «7» The segmentation map for WM is displayed as an overlay.
Right-Click › Gray Matter «8» The segmentation map for GM is displayed as an overlay.
Right-Click › Cerebro-Spinal Fluid «9» The segmentation map for CSF is displayed as

an overlay.
Right-Click › Non-WM/GM/CSF «0» The segmentation map for tissue that does not
correspond to the definition of WM, GM or CSF is displayed as an overlay.
Right-Click › Myelin (MyC) «Y» The segmentation map for MyC is displayed as an overlay.
When a segmentation map is visible, the total volume of the segmented tissue within
the current slice is shown in the top of viewport.
When a ROI is active and a segmentation overlay is visible, the volume within the ROI
is shown in the upper right corner of the viewport. See section 5.6 for more information.
It is also possible to disable displaying the intracranial mask edge via menu option Show
Intracranial Mask Edge or short key «H».
5.3.2 Background Image for Segmentation

To see how the color of the segmentation maps correlates to the tissue content, the
background must be turned off. When this is done, a colorbar appears in the upper
right corner of the viewport, which displays the color scale.
To view the segmentation maps on a linear scale from black to white, where white is
100 % and black is 0 % tissue content, the color can be turned off. The color can only
be turned off after the background is disabled.
Right-Click › Disable Background «Ctrl+B» Black background is used. The color bar

for the segmentation map is displayed in the upper right corner (Figure 5.4).
Right-Click › Image Settings › Color «C» Disable color
Figure 5.4: When the

background is turned off a
colorbar is displayed. This
colorbar shows how the tissue
content is mapped to color.

5.4 User Mask for User Defined Segmentation
The user mask gives the user the possibility to mark selected parts of the image stack
and add it to a user mask. The user mask can include tissue both inside and outside
the inracranial mask. The mask can be used to segment the volume of specific tissues,
lesions and anatomies. The user mask is automatically displayed if SyMRI NEURO is
started with a dataset that contains a previously saved user mask.
5.4.1 Display the User Mask

The user mask is activated in the right-click menu.
Right-Click › Show User Mask «U» The user mask is displayed in the viewport as an overlay.
5.4.2 Measuring Volume Using the User Mask

The main function of the user mask is to measure the volume of some user defined
region(s). The volume is calculated using the voxel volume, including the underlying
slice gap. The volume of the user mask can include all, or part of each voxel. The user
mask volume in the current slice is displayed at the top of the view port(s) in which the
user mask is displayed.
Partial volume can be added to the user mask by copying partial tissue content from a
segmentation map to the user mask (see 5.4.3). The partial volume of the segmented
tissue is then added to the user mask volume. For example, if the partial volume of tissue
in a voxel is 25 %, only 25 % of the voxel volume is added to the user mask volume.
User mask that only includes part of the voxel volume is partially transparent. More
transparency represents lower partial volume.
Options for color and background are identical to those for segmentation maps. See
Section 5.3.2.
5.4.3 Create and Adjust User Mask

The user mask is created by adding or removing regions. This can be done by adding
or removing regions marked by a ROI, by adding segmented tissue marked by a ROI, or
by copying complete slices from a segmentation map.
5.4.3.1 EDIT USER MASK USING A ROI

When using a ROI to edit the user mask, areas and tissues can be added or removed
from the user mask via the ROI Right-Click menu. Start by placing a ROI around the
area you wish to change.
ROI Right-Click › Add to User Mask All voxels within the ROI are added to the user
mask. The total volume of each voxel is included in the user mask volume.
ROI Right-Click › Remove from User Mask Removes all voxels within the ROI from the
user mask. The volume contributed by these voxels is removed from the user mask.
It is also possible to copy tissue from a segmentation map.
ROI Right-Click › Copy Tissue in ROI to User Mask - Scale Up All voxels containing
more than 1 % of the tissue in the segmentation map is added to the user mask. The
total volume of each voxel is included in the user mask volume.

ROI Right-Click › Copy Tissue in ROI to User Mask - Partial Volume Partial volumes
are copied to the user mask.
Figure 5.5:
Copying with
partial volume
using a ROI with
segmentation
overlay
5.4.3.2 ADDITIONAL WAYS TO ADJUST THE USER MASK

It is possible to add all segmented tissue, in one or more slices, to the user mask at once.
This option appears on the right-click menu when a segmentation map is visible.
Figure 5.6:
Complete slices
of segmented
tissue can be
copied to the
user mask.
Right-Click › Copy Tissue to User Mask Copy all tissue in the visible map, within a
certain slice range, to the user mask. A dialog box appears, asking you to select the slice
range (Figure 5.6). By default, partial tissue volume is added. Tick the box “Scale up
partial volume to 100%” to include the total voxel volume of all voxels with more than
1 % partial tissue volume.
Edit › Clear User Mask All voxels are removed from the user mask and the user mask
volume is set to zero.

5.4.4 Save and Load the User Mask
It is possible to save the user mask, and to load a previously saved mask.
File › Save User Mask The user mask is saved. A dialog box appears asking you to give
the user mask a name. It is possible to save several user masks with different names.
The next time the data set is loaded in SyMRI NEURO, a list of all saved usermasks
listed in the DICOMDIR-file will be displayed. If no other user mask is selected, or
there is only one saved used mask, the last saved user mask will be displayed.
The information is saved to a presentation state DICOM-object file in a new series StandAlone
in the same folder the data-set was loaded from.
The information is saved to a presentation state DICOM-object in PACS in a new Plug-In

series in the same examination as the loaded data-set.
The information is saved to a presentation state DICOM-object in the configured Network

PACS via the network in a new series in the same examination as the loaded dataset.
File › Load User Mask The last saved user mask is loaded. Any current changes will be
replaced by the last saved mask. The last saved user mask for a dataset will be loaded
automatically when SyMRI NEURO is started.
5.5 Segmentation Table

The segmentation table provides volumetric information of all segmented tissue types in
SyMRI NEURO, as well as the user mask. The total volumes for the whole brain are
always shown, and the table can be expanded to show tissue volumes per slice.
Figure 5.7: In the segmentation table,

calculated volumes of WM, GM, CSF,
Non-WM/GM/CSF and MyC are shown.
The relative volumes, as a percentage
of brain volume and ICV are also displayed.
Right-Click › Segmentation Table «6» Display the segmentation table in the viewport.
In the segmentation table the following volumes are displayed:

• Sum (ml): Total volume of WM, GM, CSF, Non-WM/GM/CSF and MyC in the intracrani-
al mask.
• % BPV: Volumes of WM, GM, Non-WM/GM/CSF and MyC as percentages of the total
brain parenchyma volume. Note that the percentages of WM, GM and NON sum up to
100 % while the percentage of MyC is a percentage of BPV independent of the other
tissue types.
• % ICV: Volumes of WM, GM, CSF, Non-WM/GM/CSF and MyC as percentages of the
total intracranial volume. Note that the percentages of WM, GM, CSF and NON sum
up to 100 % while the percentage of MyC is a percentage of ICV independent of the
other tissue types.
• Brain parenchymal fraction (BPF). The Parenchymal fraction is the sum of the volumes
for WM + GM + Non-WM/GM/CSF divided by the total volume of the
(
intracranial mask BPF =
BPV ICV-CSF WM +GM +NON
ICV
=
ICV
=
ICV
.)
NOTE: The percentage of MyC is not included in the calculation of BPF since it
is independent of the other tissue types that completely partitions the content of ICV.

The name of the user that created or saved the intracranial mask is displayed below the
table together with time and date.
5.5.1 Displaying Volumes per Slice

The segmentation table can be expanded to show the tissue volumes for each individual
slice.
Segmentation table right-click › Show Slices expands the segmentation table to show

the tissue volumes in each slice.
• Slice Volume of WM, GM, CSF, Non-WM/GM/CSF and MyC per slice.
5.5.2 User Mask in the Segmentation Table

If the user mask contains at least one voxel, a new column appears in the segmentation
table named “UM”. This column presents the user mask volume in the same way as WM,
GM, CSF, etc. Both the volume per slice, total volume, and volume as percentage of
ICV and BPV are displayed.
5.5.3 Exporting the Segmentation Table

File › Save Segmentation Table as text... The table with the segmentation results is
saved locally on the workstation as a text file. In the file, patient name, examination ID
and the versions of SyMRI used are saved.
File › Save Segmentation Table as Structured Report... The same command as above,

but the table is saved as a DICOM object using the structured report format. Please
refer to the DICOM Conformance Statement for SyMRI for further (technical) details
on this format.
Segmentation table right-click › Copy Segmentation Table «Ctrl+C» Copy the

segmentation table as text and lets you paste it into documents, emails etc.
5.6 ROI in SyMRI NEURO

In addition to the functionality that the ROI has in SyMRI IMAGE (Section 4.3) the
ROI is used for three functions specific to SyMRI NEURO:
1. To adjust the intracranial mask (Section 5.1.1).
2. To adjust the user mask (Section 5.4.3).
3. Measuring the volume of segmented tissue.
Figure 5.8: ROI and

related information

5.6.1 Measuring the Volume of Segmented Tissue
When a segmentation map is visible, two new lines appear in the ROI Info text. The
first line starts with the name of the visible segmentation map, e.g WM or CSF. This
line gives the mean and standard deviation of partial volume segmented tissue content
within the ROI, as a percentage of the total ROI volume. The second line starts with
Vol. and displays the volume of segmented tissue within the ROI, followed by the total
volume of the ROI. The volumes are given in milliliters (ml).
If a user mask is visible, the volume information for the User Mask within the ROI
will be displayed in the same manner in ROI Info. In case both a user mask and a
segmentation overlay are visible, the volume information for the user mask is displayed
below the volume information for the segmented tissue. See Figure 5.8.
Also note that the line displaying Signal is removed when the volume information for a
user mask or segmented tissue is displayed.
5.7 Plots in SyMRI NEURO
Figure 5.9: The ROI-

plot in SyMRI NEURO.
The plots in SyMRI NEURO has the same functionality as in SyMRI IMAGE (Section 4.4)
with the addition of displaying the mean value of the defined tissue types with a cross.
Plot Right-Click › Brain Cluster Reference clusters for CSF, WM and GM are displayed.

Part IV
Important Information
6 Warnings
Read all information in this chapter, it contains important information
regarding safe usage of SyMRI.
6.1 Image Artifacts

The types of image artifacts appearing in conventional MR-images might also appear in
synthetic MRI. Image artifacts such as motion artifacts, noise, folding etc. can appear
for identical reasons. The effect on the images, however, might be different as the signal
sampling is different.
6.1.1 Motion Artifacts
Figure 6.1: Patient

motion might lead to
folding and ghosting.
A: T2W B: FLAIR C:
T2W with Non-WM/
GM/CSF-map
Just like conventional MRI, synthetic MRI is affected by movement. Movement results in
artifacts that decrease the quality of the images. Synthetic images are made from several
consecutive readings. Therefore, motion artifacts might appear different compared to
conventional images. “Ghosting”-artifacts are similar to the ones seen in conventional
images. In most cases the segmentation algorithm performs well, apart from the area
affected by ghosting. Movement leads to fuzzy images with blurry edges.
WARNING: If the patient moves from her/his original position this will
lead to errors in the transitions between tissues in the R2-map and severe
measurement errors in the R1-map. This will result in unusable contrast
images and poor segmentation. Figure 6.1 displays a stroke patient who has
been moving during the examination.
6.2 Deviations – Synthetic MRI

The synthetic contrast weighted images are intended to look similar to conventional
MRI images. There are however factors that make the synthetic images different from
conventional ones.
6.2.1 Black Blood

Figure 6.2: The signal from moving blood is
suppressed in Synthetic images. For example
arteries will not be enhanced in a synthetic T1W-
image (to the right) after contrast agent has been
administrated, as they would in a conventional
T1W-image (left).
SyMRI® | MEDICAL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) 6 WARNINGS 40

The image acquisition for quantification suppresses the signal from moving blood. This
results in synthesized images with “black blood”-features. Arteries will not be enhanced
in the image, even if a contrast agent has been administrated. Non-moving blood, caused
by for example leakage, will enhance the T1-value in synthetic images. This also applies
when contrast agent has accumulated within tissue.
WARNING: It is recommended to perform MDME acquisition prior to contrast

agent administration.
6.2.2 Flow Sensitivity
Figure 6.3: Hyper-

intense signal due
to a CSF flow jet.
Similar to conventional MRI, synthetic MRI may suffer from artifacts caused by flow.
Examples are a band of ghosting artifacts due to a large artery or a flow jet in CSF (see
Figure 6.3).
WARNING: Flow artifacts in particular are more pronounced for thinner

slices. The thinner the slice, the more likely and pronounced the flow artifacts
will be. Flow in arteries may also cause an apparent Hyper-intense Vessel
Sign (also known as Arterial Hyperintensities) in FLAIR images.
6.2.3 Small Features Might Disappear

As in conventional MRI, small features will disappear if the resolution is too low for the
particular feature of interest.
WARNING: In synthetic MRI, the calculations of R1, R2 and PD are based

on a model assuming that the relaxation in each voxel is mono-exponential.
Therefore, small structures not becoming the dominating component in any
voxel might disappear and not be visible in the synthetic images.
6.3 Functions Specific for Synthetic MRI

6.3.1 Use ROI to Null Tissue
WARNING: Selecting large areas where there is more than one tissue type
may cause the nulling algorithm to select a TI which corresponds to neither
tissue type. For instance, selecting a large ROI containing both WM and
CSF in roughly equal proportions will cause incorrect nulling. See Figure
6.4 for an illustration of the effects. Best results are achieved by creating a
ROI that contains only the tissue of interest.

Figure 6.4: Effects of ROI placement for the null tissue function. Note that in 6.4d the caudate nucleus
(nucleus caudatus) can be seen after the white matter has been cancelled
6.3.2 Quantitative Measurements

The quantitative measurements of R1 (T1), R2 (T2) and PD have been verified in phantom
studies. A set of phantoms with differet combinations of R1 and R2 were scannned
and quantified with SyMRI, and the results were compared to inversion recovery for
R1 and multi-echo CPMG (Carr-Purcell-Meiboom-Gill) for R2. For PD, a different
phantom with various concentrations of heavy water for was used. A good correlation
was shown for all parameters. The mean difference, standard deviation and verification
range (interval) for the quantitative parameters, as well as different manufacturers and
field strengths can be found in Table 6.1.
NOTE: Using SyMRI on MDME input data from Siemens scanners is not yet 510(k) cleared
by the US FDA and thus currently not available for sale in the US unless limited to research
or investigational use.
Table 6.1: Accuracy of SyMRI compared to gold standard on phantoms

Philips GE Siemens
Parameter Interval
1.5 T 3.0 T 1.5 T 3.0 T 1.5 T 3.0 T
R1 0.5 − 3.33 s −1
4±7% 9±7% 5±7% 7±6% 0 ± 11 % 1 ± 11 %
R2 2.5 − 25 s−1
7±2% 16 ± 10 % 12 ± 13 % 16 ± 10 % 11 ± 6 % 17 ± 4 %
PD 20 – 100 pu 7±8% 5 ± 11 % 2±4% -1 ± 5 %
The results from the phantom studies are exemplified in Figure 6.5.
Figure 6.5: SyMRI quantitative measurements in comparison with gold standard

quantitative measurements on phantoms for GE Discovery MR750 3 T.

6.3.2.1 DYNAMIC RANGE
The dynamic range of the measurements for the quantitative tissue parameters are listed
in Table 6.2.
WARNING: Values outside the dynamic range will be truncated.
Table 6.2: Dynamic Range for SyMRI.
Value Unit Min Max
T1 ms 250 4 300
R1 s
−1
0.23 4
T2 ms 10 2 000
R2 s
−1
0.5 100
PD pu 0 160
6.3.3 Segmentation
The segmentation in SyMRI is based on pre-defined clusters (WM, GM, CSF) defined to
represent white matter, gray matter and cerebro spinal fluid. Observe that pathological
tissue can have values corresponding to any of the healthy definitions, in the same
way healthy tissue might fall outside the defined tissue definitions. Partial volume is
calculated through a simulation model (Bloch simulator) which aligns the values between
two tissue clusters to estimated partial tissue type.
CAUTION: An absolute comparison between different brains, or a brain

scanned at several points in time, must be made in comparable versions of
SyMRI. Present Release Notes will state whether changes have been made
compared to earlier versions of SyMRI.
WARNING: In voxels with partial volume of known tissue and partial volume
of bone, air or other tissue with low PD, the segmentation may erroneously
classify the voxel as Non-WM/GM/CSF instead of partial volume known
tissue and partial volume Non-WM/GM/CSF.
WARNING: If there are mixtures of pathological tissues within a voxel the

tissue within the voxel might be partially misclassified as a result of partial
volume effects. For instance, a voxel containing two pathological tissues,
where the mix intersects a known tissue, may cause misclassification as a
partial volume of the known tissue.
WARNING: The administration of oxygen during MRI acquisition may increase

R2 relaxation rate in brain tissue and hence affect the segmentation
analysis.
6.3.4 Factors Affecting the Volume Estimations

Verification and validation have been performed to evaluate the repeatability of the
volume measurements. The measurements are based on pre-defined tissue definitions.

6.3.4.1 ACCURACY
For volume estimations made in SyMRI, the volume for each separate voxel is calculated
as the product of the voxel base area in the slice and the slice spacing (which includes the
slice gap). The slice spacing is used instead of the slice thickness to include the complete
brain volume. Figure 6.6 illustrates how the spacing, thickness and gap are connected.
CAUTION: SyMRI estimates the tissue content in the slice gap based on
the two adjecent slices. The slice gap (Figure 6.6) shall be low to avoid large
approximations in the measurements.
Figure 6.6: Illustration of the

relationships between Slice
Spacing, Slice Gap, and
Slice Thickness.
6.3.4.2 REPEATABILITY
To validate the repeatability of the segmentation method, in vivo measurements was
performed on 7 healthy subjects (age 32–48 years) that were scanned using a GE 450W
1.5 T, a GE 750 3 T, a Philips Ingenia 1.5 T, a Philips Ingenia 3 T, a Siemens Aera
1.5 T, and a Siemens Prisma 3 T scanner. The subjects were scanned twice on each
scanner, and were removed from the scanner between the acquisitions. Not all subjects
were scanned using the Siemens scanners.
The repeatability of brain tissue volumes as a percentage of ICV, as well as the

repeatability of BPF are reported in Table 6.3. The repeatability reported is the within-
subject standard deviation, which means that the repeatability coefficient can be obtained
by multiplying the values by 2.77.
NOTE: Using SyMRI on MDME input data from Siemens scanners is not yet 510(k) cleared
by the US FDA and thus currently not available for sale in the US unless limited to research
or investigational use.

Table 6.3: Repeatability for SyMRI.
WM GM CSF NON MyC BPF
GE 450W 1.5 T 0.38 % 0.42 % 0.14 % 0.10 % 0.12 % 0.14 %
GE 750 3 T 0.62 % 0.58 % 0.15 % 0.15 % 0.21 % 0.15 %
Philips Ingenia 1.5 T 0.29 % 0.27 % 0.05 % 0.10 % 0.09 % 0.05 %
Philips Ingenia 3 T 0.56 % 0.94 % 0.18 % 0.30 % 0.17 % 0.18 %
Siemens Aera 1.5 T 0.45 % 0.50 % 0.11 % 0.13 % 0.13 % 0.11 %
Siemens Prisma 3 T 0.39 % 0.32 % 0.10 % 0.06 % 0.14 % 0.10 %
CAUTION: To acquire comparable volume measurements, it is important

that the same software version of SyMRI is used for all examinations. Volumetric
measurements performed by different versions of SyMRI may be different due to
changes in the software. Only compare datasets that have been quantified and
segmented by the same version of SyMRI.
CAUTION: SyMaps from the same dataset but generated using different
versions of SyMRI are not identical. Segmentation is performed base on the
combination of R1, R2 and PD in each voxel. Therefore, any difference in
the SyMaps may affect the segmentation and volume measurement. In short,
using SyMaps generated by different versions of SyMRI may give different
volumes even if they are both based on the same MDME acquisition data,
and even if both are loaded into the same version of SyMRI.
6.4 Additional Warnings

6.4.1 System Requirements
WARNING: SyMRI is only to be used according to the system requirements.

Any deviation from the system requirements may cause anything from very
subtle changes, to rendering datasets unloadable by SyMRI. Attempting to
load data that was not generated as specified by the system requirements
violates the intended use of SyMRI.
6.4.1.1 SLICE GAP

The slice gap affects the quantification of R2 (T2) and volume estimations in segmentation.
The recommended slice gap is 25 % of the slice thickness. This gap is recommended
since it provides a good trade-off between cross-talk and volume estimation error.
CAUTION: The slice gap should be at least 10 % of the slice thickness to

avoid cross-talk between slices. Cross-talk affects the R2 (T2) quantification,
and causes R2 to be overestimated. This will lead to an overestimation of
MyC content.
If the slice gap is wide, the estimation error for tissue volumes within the slice gap may
increase. See Section 6.3.4.1.

6.4.1.2 SLICE THICKNESS
The slice thickness affects the quantification, resolution of small features and the risk
of flow artifacts. The recommended slice thickness provides a good trade-off between
resolution and flow artifacts.
If the slices are thin, flow artifacts become more likely. For more information, see Section 6.2.2.
If the slices are thick, the quantification will be affected by partial volume effects. For
more information, see Section 6.2.3.
6.4.2 Follow-up Examinations Using Different Analysis Tools
WARNING: Different analysis tools use different models and methods of

volume estimation, including different definitions of tissues. This results in
systematic differences between different tools. Comparing the volumes given
by SyMRI to other analysis tools in follow-ups of examinations can result in
incorrect interpretation and/or conclusion. If comparing the segmentation
volumes given by e.g. NeuroQuant, based on a T1W 3D acquisition, with the
volumes given by SyMRI based on a 2D MDME acquisition, the volumes
may differ for several reasons. Amongst others, the tissue definitions in
NeuroQuant and SyMRI are different. E.g., SyMRI uses partial volumes,
while NeuroQuant assigns one tissue type to each voxel.
In general, comparing data between different analysis tools should be
avoided unless justification for the validity of comparing the different
analysis tools can be provided.
SyntheticMR AB strongly recommend always using the same analysis

tool to ensure that data from follow-up examinations can be compared, and
to perform the comparisons using applicable clinical protocol and practice
for follow-ups.
NOTE: SyMRI can only analyze tissue volumes on data from sequences that are approved
for use with SyMRI. For a list of approved sequences with recommended sequence
parameters please consult the FORM 75-10 System Requirement List.
6.4.3 Character Encoding
WARNING: If a dataset with non-west European characters for any of the

textual information displayed in the HUD in SyMRI is loaded, this information
will not be displayed correctly. For more information about what
textual information is displayed in the HUD, see Section 3.2.1.1.
6.4.4 Anonymization Software
WARNING: SyMRI uses certain private DICOM tags to be able to load

datasets (see DICOM conformance statement). If anonymizing software is
used, check that these tags are preserved.

6.5 Scanner Specific Warnings
6.5.1 GE
The following warnings only applies to usage on GE MRI scanners.
6.5.1.1 ANONYMIZATION
CAUTION: GE uses private DICOM tags to store a few acquisition parameters
required by SyMRI. Use anonymization tools provided by GE to
preserve these tags in anonymization. Datasets were the tags are missing
can not be opened by SyMRI.
The tags required by SyMRI are listed in the DICOM conformance statement. If an
anonymization tool not provided by GE is used, please confirm that the required tags
are preserved.
6.5.2 Philips
The following warnings only applies to usage on Philips MRI scanners.
6.5.2.1 MULTIPLE PACKAGES

Note that the FORM 75–10 System Requirement List requires that the scanner does not
generate multiple packages.
On Philips MRI scanners with Philips software version 4.x.y (only available for 3T) or
5.1.x (available both for 1.5T and 3T) the scanner console will show that it is going to
generate multiple packages but it does not store this information in the DICOM-objects;
this means that it is not possible for post-processing software, such as SyMRI, to detect
if the scanner has generated multiple packages after the scanning. Therefore, it is up to
the scanner operator to ensure that the scanner reports that it will not generate multiple
packages.
From Philips software version 5.2.x multiple packages will generate a conflict in the exam
card and scanning can not be started.
WARNING: Loading multiple package data might cause unpredictable results

which might not be apparently incorrect.
6.5.2.2 SLICE ORDER

CAUTION: On Philips MRI scanners with Philips software version 4.x.y
(only available for 3T) or 5.1.x (available both for 1.5T and 3T) make sure
that slice order in the exam card is set to Ascending or Descending and not
Default or Interleaved.
The latter will cause quantification of T1 to oscillate between slices which can be seen by
selecting a large ROI and scrolling through the slices. The curve for normal brain tissue
in R1-R2-plot will then shift to the right/left almost every other slice. From Philips software
version 5.2.x the slice order options Default and Interleaved have been removed.

6.5.3 Siemens
The following warnings only applies to usage on Siemens MRI scanners.
NOTE: Using SyMRI on MDME input data from Siemens scanners is not yet
510(k) cleared by the US FDA and thus currently not available for sale in
the US unless limited to research or investigational use.
6.5.3.1 PATIENT POSITION

CAUTION: Always position the patient so that the imaged anatomy is placed
at the ISO-center of the scanner. If the Patient is incorrectly placed, the B1-field
will be sub-optimal and the quantification may not be performed correctly.
MRI scanners have optimal imaging conditions at the center of the coil, the ISO-center
of the magnetic field. Using the laser to position the patient correctly will ensure optimal
quantification, and thereby optimal image quality in the synthetic images.

Part V
Appendix
7 Keyboard Shortcuts
A listing of all available keyboard shortcuts and their function available in SyMRI.
On macOS the following shortcut keys are different from Windows:

• instead of Ctrl. macOS
• F13 instead of Insert.
Keyboard shortcut Function

1 T1W
2 T2W
3 T2W FLAIR
4 STIR
5 PSIR
Page Up Go to preceding slice

Up-arrow Go to preceding slice1
Page Down Go to succeeding slice
Down-arrow Go to succeeding slice1
Home Go to first slice
End Go to last slice
Ctrl+R Contrast Layout

Ctrl+F SyMaps Layout
A Auto Scale
C Color
Ctrl+Z Zoom in
Ctrl+Shift+Z Zoom out
Ctrl+P Interpolate
Ctrl+X Cut ROI

Ctrl+C Copy ROI
Ctrl+V Paste ROI
Backspace Disable ROI
Tab Activate next ROI2
Shift+Tab Activate previous ROI2
Ctrl+1 1 Viewport
Ctrl+2 2 Viewports
Ctrl+3 3 Viewports
Ctrl+4 4 Viewports
Ctrl+5 5 Viewports
Ctrl+6 6 Viewports
1
This shortcut is not available in SyMRI Plug-In since the Sectra PACS IDS7 host window uses it.
2
For Multiple ROIs
SyMRI® | MEDICAL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) 7 KEYBOARD SHORTCUTS 50

F4 Paging Tool
F5 Pan Tool1
P Pan Tool
F6 Freehand ROI
F7 Rectangle ROI
Z Zoom Tool
Q Adjust TE
W Adjust TR
R Adjust TI
T Adjust TI-TI3
Ctrl+I Inversion Prepulse
Ctrl+O Open...
Ctrl+Shift+S Save all Visible Stacks to Local Folder...
Pan Tool is also available by holding the «Shift» key pressed.

Zoom Tool is also available by holding the «Ctrl» key pressed.
«S» and «F» can be used together with Adjust TR, Adjust TI or Adjust TI-TI to decrease
or increase the rate by which the time parameters are changed when the cursor is moved.
They can also be used to scroll faster between slices and when adjusting the windowing.
When the User Mask feature is available the following keyboard shortcuts can be used.

U Show User Mask
Ctrl+B Disable Background
With SyMRI NEURO the following keyboard shortcuts are also available.

Ctrl+S Segmentation Layout
Ctrl+C Copy Segmentation Table
6 Segmentation Table
7 White Matter
8 Gray Matter
9 Cerebro-Spinal Fluid
0 NON-WM/GM/CSF
Y Myelin (MyC)
I Intracranial Mask
H Show Intracranial Mask Edge
Ctrl+B Disable Background
Insert Add to Intracranial Mask

Delete Remove from Intracranial Mask
M Add to User Mask
Comma (,) Copy Tissue in ROI to User Mask - Scale Up
Period (.) Copy Tissue in ROI to User Mask - Partial Volume
Subtract (-) Remove from User Mask
3
DIR-license is required.
SyMRI® | MEDICAL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) 7 KEYBOARD SHORTCUTS 51

SyMRI ®
SyMRI® 11
Version 11.0.7
UDI: (01)07340024700030(8012)11.0.7
2018-08-30
SyntheticMR AB
Storgatan 11
SE-582 23 Linköping, SWEDEN
www.syntheticmr.com
support@syntheticmr.com
®
SyMRI
SyntheticMR AB
2018-08-30
Mode d’emploi
Version 11.0.7
UDI : (01)07340024700030(8012)11.0.7
SyMRI 11
Règlements applicables
La présente section contient des informations importantes sur l’autorisation réglemen-
taire et l’utilisation de SyMRI. Il convient de noter que SyMRI est considéré comme un
dispositif médical (DM) et, par conséquent, est assujetti à la réglementation en vigueur
pour les utilisations cliniques et non cliniques.
Dans l’Union européenne, par exemple, la Directive relative aux dispositif médicaux
(DDM) s’applique.
SyMRI ne peut être utilisé qu’avec l’autorisation légale. Se renseigner auprès des autorités
locales et SyntheticMR AB en cas de doute si la version de SyMRI peut être légalement
utilisée par vous dans votre domaine.
AVERTISSEMENT : Si le domaine réglementaire qui s’applique dans votre

cas ne figure pas dans cette section, SyMRI ne peut être utilisé à d’autres
fins que la démonstration ou la recherche en tant que dispositif non médical
et ne doit pas être utilisé pour le diagnostic ou autres buts de gestion des
patients.
La mention « La réglementation médicale s’applique (page i) » sur chaque page de ce

manuel est une référence à cette section pour plus de détails.
Utilisation certifiée
SyMRI conforme aux exigences réglementaires suivantes. L’utilisation est soumise à la
législation locale et aux conditions fixées par les règlements. D’autres restrictions, condi-
tions ou règlements peuvent s’appliquer.
• CE (Union européenne) :
SyMRI 11 dispositif médical portant le marquage CE et conforme à la Directive
93/42/CEE du Conseil (DDM).
0413
• USA/HSS (FDA) :
MISE EN GARDE : La loi fédérale des États-Unis oblige à vendre cet

appareil par ou sous la prescription d’un médecin
• Australie (Therapeutic Goods Administration, TGA) :

Pour le marché australien, le commanditaire réglementaire est :
Philips Electronics Australia Ltd
65 Epping Road
Non conçu pour une utilisation clinique (NFCU)

Cette section répertorie les domaines dans lesquels SyMRI peut, avec certaines restric-
tions, être utilisé dans un cadre non clinique (NFCU, de l’anglais « Not For Clinical
Use »). Pour les domaines où l’utilisation NFCU peut s’appliquer, prêter attention au
SyMRI® La réglementation médicale s’applique (page i) i

texte d’avertissement applicables et aux restrictions, conditions ou règlements supplé-
mentaires pouvant s’appliquer.
• Canada et pays où la réglementation de Santé Canada est applicable :
Investigational Device - To Be Used by Qualified Investigators Only

Instrument de recherche - Réservé uniquement à l’usage de chercheurs com-
pétents
SyMRI® La réglementation médicale s’applique (page i) ii

Table des matières
Table des matières

Règlements applicables . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . i
Utilisation certifiée . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . i
Non conçu pour une utilisation clinique (NFCU) . . . . . . . . . . . . . . . . i
1 Introduction 1
1.1 Description du dispositif . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1
1.2 Destination . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2
1.2.1 Indications pour l’utilisation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2
1.3 Avantages de SyMRI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3
1.4 Abréviations . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4
1.5 Mises en garde, avertissements et notes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
1.5.1 Rem. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
1.5.2 MISE EN GARDE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
1.5.3 AVERTISSEMENT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
Première partie Travailler avec SyMRI® 7
2 Déploiement de SyMRI 8
2.1 SyMRI pour Sectra PACS IDS7 (Plug-In) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
2.1.1 Lancement et fermeture du programme . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
2.1.1.1 Lancement de SyMRI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
2.1.1.2 Fermeture de SyMRI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
2.2 SyMRI StandAlone pour Microsoft Windows . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
2.3 SyMRI StandAlone pour macOS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
2.3.2 Raccourcis clavier . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
2.4 SyMRI pour réseau . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12
3 Concepts et fonctionnalités 13
3.1 Concepts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13
3.1.1 Module . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13
3.1.1.1 SyMRI IMAGE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13
3.1.1.2 SyMRI NEURO . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13
3.2 Espace de travail . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14
3.2.1 Zone . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14
3.2.1.1 Données d’image de zone . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15
3.3 Barre d’outils . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17
SyMRI® La réglementation médicale s’applique (page i) iii

Table des matières
3.4 Options et préférences . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18

3.4.1 Options de configuration . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18
3.4.2 Options d’affichage . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18
3.4.3 Autre . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19
3.5 Affichage d’images . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
3.5.1 Zoom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
3.5.2 Navigation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
3.5.3 Fenêtrage . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
Deuxième partie SyMRI® IMAGE 21
4 Fonctions de SyMRI IMAGE 22

4.1 Images de synthèse pondérées en contraste . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23
4.1.1 Affichage des images de synthèse pondérées en contraste . . . . . . . . 23
4.1.2 Réglage du contraste d’image . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24
4.1.3 Modification des images FLAIR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25
4.1.4 Mise au point des images double IR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26
4.1.5 Fenêtre de navigation pour images de contraste . . . . . . . . . . . . . 26
4.2 SyMaps . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28
4.2.1 Affichage des SyMaps . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28
4.3 Région d’intérêt (ROI) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29
4.3.1 Création et mise au point d’une ROI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29
4.3.2 Données de la ROI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29
4.3.3 Préférences ROI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30
4.3.4 Suppression d’une ROI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30
4.4 Graphiques . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32
4.5 Enregistrement et chargement . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33
4.5.1 Enregistrement d’une SyMaps . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33
4.5.1.1 Gain de temps . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
4.5.2 Enregistrement d’une capture d’écran . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
4.5.3 Enregistrement d’une pile d’images . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
4.5.3.1 Enregistrement de la pile d’images . . . . . . . . . . . . . . . 35
4.5.3.2 Enregistrement de toutes les piles visibles . . . . . . . . . . . 35
Troisième partie SyMRI® NEURO 36
5 Fonctions de SyMRI NEURO 37

5.1 Le masque intra-crânien . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
5.1.1 Ajustement du masque intra-crânien . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
5.1.2 Masque intra-crânien – fonctions complémentaires . . . . . . . . . . . 39
5.2 Segmentation des tissus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41
5.2.1 Parenchyme cérébral et CSF segmentation . . . . . . . . . . . . . . . . 41
5.2.2 Cartographie du volume partiel en corrélation avec la myéline (MyC) . 41
5.3 Cartes de segmentation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43
5.3.1 Affichage des cartes de segmentation . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43
5.3.2 Segmentation – Images d’arrière-plan . . . . . . . . . . . . . . . . . . 44
SyMRI® La réglementation médicale s’applique (page i) iv

Table des matières
5.4 Masque utilisateur pour segmentation définie par l’utilisateur . . . . . . . . . . 46

5.4.1 Affichage du masque utilisateur . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 46
5.4.2 Mesure du volume à l’aide du masque utilisateur . . . . . . . . . . . . 46
5.4.3 Création et mise au point d’un masque utilisateur . . . . . . . . . . . . 46
5.4.3.1 Modification d’un masque utilisateur à l’aide d’une ROI . . . 46
5.4.3.2 Autres ajustements du masque utilisateur . . . . . . . . . . . 47
5.4.4 Enregistrement et chargement du masque utilisateur . . . . . . . . . . 48
5.5 Table de segmentation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 49
5.5.1 Affichage des volumes par tranche . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 49
5.5.2 Masque utilisateur dans la table de segmentation . . . . . . . . . . . . 50
5.5.3 Exportation de la table de segmentation . . . . . . . . . . . . . . . . . 50
5.6 ROI dans SyMRI NEURO . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 51
5.6.1 Mesure du volume du tissu segmenté . . . . . . . . . . . . . . . . . . 51
5.7 Graphiques dans SyMRI NEURO . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 52
Quatrième partie Informations importantes 53
6 Avertissements 54
6.1 Artefacts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54
6.1.1 Artefacts de mouvement . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54
6.2 Écarts - IRM synthétique . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55
6.2.1 « Sang noir » . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55
6.2.2 Sensibilité aux flux . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55
6.2.3 Certaines caractéristiques peuvent disparaître . . . . . . . . . . . . . . 56
6.3 Fonctionnalités spécifiques à l’IRM synthétique . . . . . . . . . . . . . . . . . 57
6.3.1 Util. ROI pour tissu à suppr. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 57
6.3.2 Mesures quantitatives . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 57
6.3.2.1 Plage dynamique . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58
6.3.3 Segmentation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58
6.3.4 Facteurs influant sur les estimations de volume . . . . . . . . . . . . . 59
6.3.4.1 Précision . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59
6.3.4.2 Reproductibilité . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 60
6.4 Avertissements complémentaires . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62
6.4.1 Exigences système . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62
6.4.1.1 Espace inter-coupe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62
6.4.1.2 Épaisseur des tranches . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62
6.4.2 Suivi des examens à l’aide de différents outils d’analyse . . . . . . . . . 63
6.4.3 Codage des caractères . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63
6.4.4 Logiciel de protection de l’anonymat . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63
6.5 Mises en garde spécifiques aux scanners . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
6.5.1 GE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
6.5.1.1 Anonymization . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
6.5.2 Philips . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
6.5.2.1 Modules multiples . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
6.5.2.2 Ordre des coupes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
6.5.3 Siemens . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65
6.5.3.1 Installation du patient . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65
SyMRI® La réglementation médicale s’applique (page i) v

Table des matières
Cinquième partie Annexe 66
7 Raccourcis clavier 67
SyMRI® La réglementation médicale s’applique (page i) vi

1 Introduction
1 Introduction
1.1 Description du dispositif
SyMRI permet à l’utilisateur de générer plusieurs contrastes d’image à partir d’une
seule acquisition. Ceci suppose le post-traitement d’une acquisition multi-échos, multi-
délais (MDME) dans des cartes paramétriques. Les cartes paramétriques sont celles
des vitesses de relaxation R1 et R2 et de la densité protonique (PD). Les paramètres de
relaxation inverse, le temps de relaxation T1 (1/R1) et le temps de relaxation T2 (1/R2)
sont également fournis sous forme de cartes paramétriques. Les cartes paramétriques
peuvent être visualisées sous forme d’images RM pondérées en contraste, comme les
images à pondération T1, T2, PD et IR (Inversion Récupération), y compris les images
à pondération T1W FLAIR, T2W FLAIR, STIR, Double IR et PSIR. SyMRI calcule
l’intensité du signal de pixel en fonction de R1, R2 et PD et des paramètres définis
de l’appareil d’IRM, comme le temps d’écho (TE), le temps de répétition (TR) et le
temps d’inversion (TI). Des paramètres sont définis par défaut pour TE, TR et TI,
mais l’utilisateur a la possibilité de modifier le contraste des images. SyMRI génère tous
les différents contraste d’image à partir des même cartes paramétriques, provenant de la
même acquisition. Ceci permet un meilleur recalage des coupes, en raison de l’absence de
mouvement du patient entre les acquisitions. SyMRI permet à l’utilisateur de modifier le
contraste des images après l’acquisition. Il suffit pour ce faire d’ajuster la post-acquisition
des paramètres TE, TR et/ou TI afin de générer le contraste spécifique souhaité.
SyMRI permet également aux utilisateurs d’obtenir des informations volumétriques sur
le cerveau, notamment la substance blanche (WM), la matière grise (GM), le liquide
céphalorachidien (CSF), le volume partiel en corrélation avec la myéline (MyC), le pa-
renchyme cérébral (BP) et la cavité intracrânienne (IC). Ceci suppose l’utilisation des
définitions de tissus en fonction des cartes paramétriques. Les définitions de tissus in-
diquent le volume partiel de tissus, ou fraction de tissu, par voxel. SyMRI propose
également des outils de traitement d’image permettant d’extraire les valeurs des cartes
paramétriques, ainsi que le volume partiel de tissus, par pixel, par région d’intérêt, ou
la totalité du volume d’imagerie.
SyMRI est conçu pour être utilisé sur les données produites par l’une des séquences
d’acquisition suivantes
• Données de séquence MDME de GE MAGiC
• Données de séquence MDME de Philips SyntAc
• Données de séquence MDME de Siemens MDME (C2P)1
1. Non approuvé 510(k) à ce jour par la FDA américaine, et donc non disponible à la vente aux
États-Unis à moins d’être limité à un usage expérimental ou à des fins de recherche.
SyMRI® La réglementation médicale s’applique (page i) 1

1 Introduction
1.2 Destination
1.2.1 Indications pour l’utilisation
SyMRI est un appareil médical à logiciel de post-traitement conçu pour la visualisation
du cerveau. SyMRI analyse les données entrées à partir des systèmes IRM. SyMRI utilise
les données d’une acquisition multi-écho, multi-délais (MDME) pour générer les cartes
paramétriques des vitesses de relaxation R1, R2 et de la densité protonique (PD). SyMRI
peut générer plusieurs contrastes d’image à partir des cartes paramétriques. SyMRI
permet de régler le contraste des images après l’acquisition. SyMRI est indiqué pour
l’imagerie cérébrale.
SyMRI est également indiqué pour le balisage automatique, la visualisation et la quan-
tification volumétrique des tissus cérébraux segmentables d’un ensemble d’images RM.
Le volume des tissus cérébraux est déterminé sur la base de la modélisation des cartes
paramétriques des images MDME.
Interprétées par un médecin dûment formé, les images SyMRI apportent une information
susceptible d’aider à poser un diagnostic. SyMRI doit toujours être utilisé conjointement
à au moins une autre acquisition RM classique (p. ex. T2W FLAIR).

1 Introduction
1.3 Avantages de SyMRI

Une seule acquisition suffit à SyMRI pour dégager les valeurs R1, R2 et PD. Quelles que
soient les valeurs TE (temps d’écho), TR (temps de répétition) et TI (temps d’inversion),
les images synthétiques T1W, T2W et FLAIR sont visualisables sans nécessité de faire
un nouveau scan du patient. Cette méthode accélère considérablement l’examen IRM.
MISE EN GARDE : L’image T2W FLAIR synthétique montre un effet d’amé-
lioration des contours au niveau de l’interface du CSF et des tissus cérébraux.
Ceci est le résultat des effets de volume partiels des voxels de l’acquisition
au niveau de l’interface.
L’utilisation du contraste de l’image T2W FLAIR synthétique dépend de la question
clinique. L’image T2W FLAIR synthétique offre une excellente sensibilité pour les mo-
difications dans les tissus cérébraux.
MISE EN GARDE : Nous recommandons que toutes les modifications vi-
sibles dans la T2W FLAIR soient confirmées en utilisant la T2W, PDW,
PSIR ou la double IR du même groupe de données synthétique.
Étant donné que toutes les images de synthèse pondérées en contraste sont générées
à partir des mêmes cartes paramétriques, les images de synthèse seront recalées. Par
conséquent, toute constatation dans la T2W FLAIR apparaîtra au même pixel dans les
autres pondérations en contraste (T2W, PDW, PSIR ou Double IR) pour la confirmation
ou le rejet comme faux positif.
MISE EN GARDE : Pour le diagnostic des maladies provoquant une amé-
lioration des contours dans la T2W FLAIR (réactions inflammatoires ou
hémorragies), la séquence synthétique seule ne suffit pas. En cas de doute,
l’ajout par exemple d’une image 3D-FLAIR classique est recommandé.
AVERTISSEMENT : Aucune décision de prise en charge du patient ne doit

être prise sur la seule foi des images de synthèse pondérées en contraste four-
nies par SyMRI. Ce dernier doit impérativement être exploité conjointement
avec un IRM classique ou tout autre outil de diagnostic adapté.
La fonctionnalité de segmentation des tissus fournit des données quantitatives. Ceci

permet une plus grande objectivité dans l’évaluation du patient.
Le présent manuel présente les fonctionnalités et décrit les concepts utilisés dans le
logiciel.

1 Introduction
1.4 Abréviations
Voici les abréviations en usage dans le manuel.
ATH Affichage tête haute ; les informations accompagnant une

image dans SyMRI, telles que des informations sur l’image
et le patient
BPV Volume du parenchyme cérébral ; volume de tous les tissus
intracrâniens, à l’exception du volume CSF
(de l’anglais Brain Parenchymal Volume)
BPF Fraction du parenchyme cérébral : BPV divisé par ICV
(de l’anglais Brain Parenchymal Fraction)
CSF Liquide céphalo-rachidien dans la définition de SyMRI (voir
Section 5.2)
(de l’anglais Fluid)
DIR Double IR, une image d’inversion-récupération avec deux
temps d’inversion
(de l’anglais Inversion Recovery)
FLAIR « FLuid Attenuated Inversion Recovery » (inversion-
récupération avec atténuation du liquide céphalo-rachidien) :
image RM d’où le signal du CSF a été éliminé
(de l’anglais Attenuated Inversion Recovery)
GM Matière grise dans la définition de SyMRI (voir Section 5.2)
(de l’anglais Gray Matter)
ICV Volume intracrânien : volume intracrânien total (« masque
intra-crânien »)
(de l’anglais Intra-Cranial Volume)
IR Inversion-récupération ; imagerie pour laquelle une impulsion
préalable est envoyée.
(de l’anglais Inversion Recovery)
IRM Imagerie par résonance magnétique
MyC SyMRI définition de tissu en corrélation avec la myéline
(de l’anglais Myelin Correlated)
NON-WM/GM/CSF Tissu aux caractéristiques différentes de celles de la WM, de
la GM et du CSF (voir Section 5.2)
PD Densité protonique
(de l’anglais Proton Density)
PDW Image pondérée en densité de protons (généralement TE court
et TR long)
(de l’anglais Proton Density Weighted)
PSIR Inversion-récupération sensible à la phase : image avec
inversion-récupération, sans élimination du signal
(de l’anglais Phase Sensitive Inversion Recovery)
R1 Vitesse de relaxation longitudinale (1/T1)
R2 Vitesse de relaxation transversale (1/T2)
ROI Région d’intérêt ; région définie par l’utilisateur dans une
coupe du groupe de données, tracée à l’aide d’un outil ROI
dédié
(de l’anglais of Interest)
STIR Courte image T1 IR, technique d’occultation des graisses
(de l’anglais Tau/TI Inversion Recovery)

1 Introduction
SyMaps Cartographie de l’une des valeurs quantitatives (T1, T2, R1,

R2 ou PD)
T1 Temps de relaxation longitudinale (1/R1)
T1W Image pondérée en contraste T1 (généralement TE court et
TR court)
(de l’anglais T1 Weighted)
T2 Temps de relaxation transversale (1/R2)
T2W Image pondérée en contraste T2 (généralement TE long et TR
long)
(de l’anglais T2 Weighted)
TE Temps d’écho
TI Délai au bout duquel se produit l’inversion (« temps d’inver-
sion ») suite à une impulsion d’inversion
TR Temps de répétition
UM Masque util., voir Section 5.4
(de l’anglais User Mask)
WM SyMRI :s définition de substance blanche (myélinisée) (voir
Section 5.2)
(de l’anglais White Matter)

1 Introduction
1.5 Mises en garde, avertissements et notes

1.5.1 Rem.
Les notes reprennent des spécificités de SyMRI qui doivent être soulignées. Les infor-
mations présentées sous forme de Notes incluent des conseils, des limites d’utilisation
spécifiques de certaines fonctions, ainsi que des comportements du SyMRI qui ne sont
pas forcément intuitifs pour l’utilisateur.
Rem. : Exemple de note
1.5.2 MISE EN GARDE

Les mises en garde indiquent des situations potentiellement dangereuses pour le patient
ou l’utilisateur, pouvant entraîner une perte de temps, une qualité réduite de l’image
et/ou un nouvel examen du patient. Les mises en garde indiquent également comment
éviter de telles situations.
MISE EN GARDE : Exemple de mise en garde
1.5.3 AVERTISSEMENT
Les avertissements indiquent des situations potentiellement dangereuses susceptibles
d’entraîner des dommages pour le patient, essentiellement du fait d’une interprétation
ou d’un diagnostic erroné. Les avertissements indiquent également comment éviter de
telles situations.
Le symbole d’avertissement ISO 15223-1 :2016 est utilisé afin de marquer l’importance
de l’avertissement.
AVERTISSEMENT : Exemple d’avertissement

Première partie
Travailler avec SyMRI®
La réglementation médicale s’applique (page i)

2 Déploiement de SyMRI
SyMRI est accessible dans plusieurs variantes. Selon votre système et licence, un ou
plusieurs modes sont accessibles.
Votre administrateur système ou manager vous indiquera quelles variantes sont à votre
disposition.
La plupart des fonctionnalités, comportements et interactions avec l’interface utilisateur

sont les mêmes pour toutes les variantes, avec quelques légères différences. Les chapitres
suivants décrivent ces différences ainsi que quelques aspects particuliers des différentes
variantes.
D’autres sections du présent manuel de l’utilisateur ne concernent qu’une variante spé-
cifique. Ces sections sont signalées par une note en marge ainsi qu’une barre verticale,
comme suit :
Ce paragraphe concerne uniquement SyMRI pour Sectra PACS IDS7 (Plug-In). Plug-In
Ce paragraphe concerne uniquement SyMRI StandAlone. StandAlone
Ce paragraphe concerne uniquement SyMRI pour Microsoft Windows. Windows
Ce paragraphe concerne uniquement SyMRI pour macOS. macOS
Ce paragraphe s’applique uniquement à SyMRI pour mode réseau. Network

2.1 SyMRI pour Sectra PACS IDS7 (Plug-In)

Si SyMRI sert en tant que plugin dans Sectra PACS IDS7, la barre d’outils et le menu
de l’application s’affichent sous forme de fenêtre flottante, indépendante de la fenêtre
principale. La barre d’outils flottante est repositionnable à volonté.
L’espace de travail avec la barre d’outils flottante est visible à la Fig. 2.1.
Fig. 2.1 : Espace de travail dans SyMRI avec barre d’outils flottante.
2.1.1 Lancement et fermeture du programme

Ce chapitre indique comment lancer SyMRI sur un poste de travail Sectra IDS7.
2.1.1.1 Lancement de SyMRI

• Démarrer et se connecter sur Sectra IDS7.
• Ouvrir la pile d’images voulue dans une fenêtre d’images Sectra IDS7.
• Sélectionner « SyMRI » dans le menu de l’application clinique.
• SyMRI démarre. Le programme est prêt à l’utilisation.
En cas d’erreur irréparable en cours de chargement, le système ferme SyMRI et revient

à Sectra PACS IDS7 après affichage d’une fenêtre d’information détaillant l’erreur.
2.1.1.2 Fermeture de SyMRI

SyMRI est fermé en utilisant le menu Fichier ›Quitter SyMRI dans la barre d’outils
flottante (voir Section 3.3).
Ne pas fermer la fenêtre d’images Sectra avant de fermer SyMRI pour éviter une mauvaise
fermeture de SyMRI.

2.2 SyMRI StandAlone pour Microsoft Windows

Ce chapitre indique comment lancer SyMRI.

• Démarrer le programme SyMRI.
• Cliquer sur la fenêtre principale et sélectionner le groupe de données voulu.
En cas d’erreur liée à un groupe de données en cours de chargement de SyMRI, le système

rappelle la fenêtre principale, à partir de laquelle vous pouvez sélectionner un groupe
de données différent après affichage d’une fenêtre d’information détaillant l’erreur. S’il
s’agit d’une erreur irréparable, le système peut fermer SyMRI après affichage du message
d’erreur.

SyMRI peut être fermée à l’aide de l’option de menu Fichier › Quitter SyMRI de la
barre d’outils (voir section 3.3), ou en cliquant sur le bouton de fermeture de la fenêtre
principale.

2.3 SyMRI StandAlone pour macOS

Ce chapitre indique comment lancer SyMRI.

• Démarrer le programme SyMRI.
• Cliquer sur la fenêtre principale et sélectionner le groupe de données voulu.
En cas d’erreur liée à un groupe de données en cours de chargement de SyMRI, le système

rappelle la fenêtre principale, à partir de laquelle vous pouvez sélectionner un groupe
de données différent après affichage d’une fenêtre d’information détaillant l’erreur. S’il
s’agit d’une erreur irréparable, le système peut fermer SyMRI après affichage du message
d’erreur.

SyMRI peut être fermée à l’aide de l’option de menu SyMRI › Quitter SyMRI de la
barre de menu (voir section 3.3), ou en cliquant sur le bouton de fermeture de la fenêtre
principale.
2.3.2 Raccourcis clavier

Les touches de raccourci sur macOS sont différentes de celles de Windows :
• au lieu de Ctrl.
• F13 au lieu d’Insert.

2.4 SyMRI pour réseau

Ce chapitre explique comment utiliser SyMRI en mode réseau.

• Lancement de SyMRI depuis PACS.
• Selon qu’on a sélectionné une seule série ou une étude, une liste des séries qui
peuvent être chargées est proposée.
• Si des masques utilisateur ou des masques intra-crâniens ont été enregistrés, on

peut sélectionner l’un d’eux après téléchargement de la série sur le réseau.
En cas d’erreur irréparable en cours de chargement, le système ferme SyMRI après

affichage d’une fenêtre d’information détaillant l’erreur.

SyMRI peut être fermée à l’aide de l’option de menu Fichier › Quitter SyMRI de la
barre d’outils (voir section 3.3), ou en cliquant sur le bouton de fermeture de la fenêtre
principale.

3 Concepts et fonctionnalités
Ce chapitre décrit les concepts généraux, les fonctionnalités, les commandes et fonc-
tionnalités utilisateur accessibles dans tous les modules de SyMRI. Les fonctionnalités
spécifiques de chaque module sont décrites dans les chapitres suivants.
3.1 Concepts
3.1.1 Module
Nous proposons deux modules : SyMRI, SyMRI IMAGE (Chapitre 4) et SyMRI NEURO
(Chapitre 5). Les modules auxquels vous avez accès sont fonction de votre licence.
Une fois un groupe de données chargé, il est possible de changer de module actif via le
menu (si votre licence le permet). Préférences › Permuter module.
3.1.1.1 SyMRI IMAGE

Le module SyMRI IMAGE est proposé sous licence IMAGE ou NEURO. Voir Chapitre
4 pour une description du module SyMRI IMAGE et de ses fonctions.
3.1.1.2 SyMRI NEURO

SyMRI NEURO n’est disponible qu’avec une licence NEURO et sera automatiquement
sélectionné lorsqu’un groupe de donnés cérébrales sera chargé et classifié comme « cer-
veau » (le texte « Objet reconnu : Cerveau » s’affiche sur la gauche de l’image).
Si le groupe de données est classifié comme une autre partie de l’anatomie/un autre
objet, SyMRI IMAGE le module sera sélectionné à la place. Vous pouvez basculer sur
SyMRI NEURO en utilisant l’option du menu Préférences › Permuter module.
SyMRI NEURO SyMRI NEURO inclut également toutes les caractéristiques de l’image
SyMRI, mais ajoute une segmentation automatique des tissus, les calculs de volume et
les mesures BPF. Voir le Chapitre 5 pour la description du module SyMRI NEURO et
ses fonctionnalités.

3.2 Espace de travail

On appelle « espace de travail » la fenêtre principale de SyMRI. L’espace de travail
(Fig. 3.1) se subdivise dans une ou plusieurs zones affichant images ou tableaux.
La configuration de l’espace de travail se fait à l’aide du menu SyMRI et de la barre
d’outils (section 3.3) Elle se fait également à l’aide du clavier et de la souris.
Fig. 3.1 : Espace de travail SyMRI configuré en cinq zones. Les fonctionnalités
accessibles via la barre d’outils et les menus sont fonction du module actif et
de votre licence.
3.2.1 Zone
On appelle « zone » chaque image ou tableau affiché dans l’espace de travail de SyMRI.
Chaque zone peut afficher une image et les données s’y rapportant (Fig. 3.2) ou, (si
votre licence l’autorise) un tableau des volumes tissulaires. La zone active est toujours
celle où se trouve le pointeur de la souris. Le contenu des zones est fonction du menu
contextuel (clic droit).

Fig. 3.2 : Deux zones dans l’espace de travail SyMRI. Lorsqu’une ROI est ac-
tive, des informations complémentaires apparaissent sur la droite de la zone.
3.2.1.1 Données d’image de zone

Les données d’image de zone sont également appelées « affichage tête haute » (ATH).
Les informations affichées dans l’ATH dépendent du type d’image affichée dans la zone.
Informations patient : Les informations relatives au patient s’affichent dans le coin su-
périeur gauche ; elles incluent le nom du patient, son n° d’identification, son âge
et son sexe.
Informations sur l’examen : Les informations sur l’examen s’affichent dans le coin su-
périeur droit, au-dessous des informations patient. Le nom du protocole, la date
et l’heure d’acquisition s’affichent, de même que, le cas échéant, des informations
concernant le produit de contraste administré.
Rem. : Si certaines de ces informations sont absentes du groupe de données en raison, par
exemple, de l’anonymisation, la ligne sur laquelle ces données se trouvent normalement
sera supprimée de l’ATH et les lignes suivantes remonteront afin de ne pas laisser d’espace
vide.
AVERTISSEMENT : Les informations relatives au produit de contraste/au

bolus apparaissent uniquement si le groupe de données inclut l’étiquette
DICOM indiquant qu’un produit de contraste ou un bolus a été utilisé lors
du scanner. Lorsque cette étiquette est présente, une ligne commençant par
« Contraste : » s’affiche Si l’étiquette est présente mais ne comporte au-
cune valeur, la ligne se présentera comme suit : « Contraste : Oui » Si
la valeur de l’étiquette est personnalisée, cette valeur s’affichera à la place
de Oui. Lorsque cette étiquette DICOM est absente, ce qui signifie qu’au-
cun produit de contraste/bolus n’a été administré, la ligne correspondant au
contraste/bolus n’apparaît pas.
Géométrie de l’acquisition : La géométrie de l’acquisition est affichée dans l’angle infé-

rieur gauche de la zone. Elle inclut le FOV, l’épaisseur des coupes, l’espace inter-
coupe, le nombre de coupes et l’emplacement de la coupe active.

Zoom et fenêtrage : Le zoom actif ainsi que le centre et la largeur du fenêtrage, s’af-
fichent dans le coin supérieur droit.
Les informations relatives à la pondération en contraste ne sont visibles que dans les
zones où une image pondérée en contraste apparaît.
Informations relatives à la pondération en contraste : Les informations relatives à la
pondération en contraste s’affichent dans le coin supérieur gauche, au-dessous de
Informations sur l’examen, et en haut de la zone Les informations à gauche incluent
les paramètres du scanner, tels que TE, TR, etc. (Section 4.1). La pondération en
contraste active est indiquée en haut de la zone.
Fenêtre de navigation : La fenêtre de navigation s’affiche au-dessous du texte, dans le
coin supérieur gauche. (Section 4.1.5)
Certaines informations, également, ne s’affichent que lorsqu’une ROI est active dans une
zone (Section 4.3).
Infos ROI : Les informations statistiques concernant les ROI s’affichent dans le coin su-
périeur droit, sous les informations Zoom et fenêtrage. Elles incluent des précisions
sur les propriétés des tissus dans la ROI ainsi que l’intensité du signal (Section
4.3.2).
ROI plot : Un graphique en nuage s’affiche également dans le coin supérieur droit de
la zone (Section 4.4).
Certaines informations complémentaires peuvent apparaître lors de l’utilisation d’une
licence SyMRI NEURO (Section Troisième partie).

3.3 Barre d’outils

Les commandes disponibles dans la barre d’outils SyMRI concernent l’espace de travail
complet, et pas simplement une zone particulière. Le contenu de la barre d’outils et des
menus dépend du module en cours et de votre licence. On y trouve par exemple les
paramètres de langue ainsi que les réglages de l’espace de travail. Elle donne également
accès à des fonctions d’exportation de groupes de données complets ainsi que de capture
d’écran.
L’accès à certaines fonctionnalités dépend de votre licence.
Fig. 3.3 : La barre d’outils dans SyMRI. La barre du haut correspond à SyMRI
NEURO avec l’Outil AutoROI. La barre du bas correspond à SyMRI IMAGE.
Les différentes commandes accessibles via la barre d’outils ainsi que le menu contextuel
(clic droit) sont décrites ci-après.
Rem. : Même si SyMRI est intégré dans Sectra IDS7, il s’agit d’un programme
indépendant. Les outils disponibles dans l’application Sectra IDS7 NE PEUVENT
PAS être utilisés dans SyMRI et vice versa. Seuls les outils dans la barre flottante
Plug-In
SyMRI sont applicables à SyMRI.
Le fait de cliquer sur le bouton Fermeture ou de fermer la fenêtre Sectra IDS7
principale sans fermer SyMRI peut entraîner une fermeture incorrecte de SyMRI ou
laisser la barre d’outils flottante accessible jusqu’à sélection d’un nouveau patient
ou examen.
Sous macOS, la barre de menus se trouve en haut de l’écran lorsque SyMRI est
macOS
actif.

3.4 Options et préférences

3.4.1 Options de configuration
Le nombre de zones peut être modifié.
Vue › 1 sous-fenêtre « Ctrl+1 » Affichage d’une zone unique
Vue › 2 sous-fenêtres « Ctrl+2 » Affichage de deux zones
Vue › 3 sous-fenêtres « Ctrl+3 » Affichage de trois zones
Vue › 4 sous-fenêtres « Ctrl+4 » Affichage de quatre zones
Vue › 5 sous-fenêtres « Ctrl+5 » Affichage de cinq zones
Vue › 6 sous-fenêtres « Ctrl+6 » Affichage de six zones
La configuration des zones, y compris le paramétrage de chaque zone, peut être enregis-
trée et téléchargée.
Préférences › Enreg. disp. actuelle Enregistre la configuration active avec le nombre de
zones, les paramètres de temps, le type de calque, de type de SyMaps et les paramètres
d’images. Lors de l’enregistrement de la configuration, une boite de dialogue demande
un nom pour la configuration affichée.
Si des configurations ont été enregistrées, SyMRI en sélectionnera une comme configu-
ration au démarrage lors du lancement de SyMRI. La configuration sélectionnée dépend
de trois critères :
1. L’orientation de l’acquisition
2. L’objet reconnu
3. La puissance du champ
En l’absence de correspondance exacte, la correspondance la plus proche sera sélectionnée
sur la base des critères ci-dessus, dans l’ordre.
Préférences › Charger disposition Ouvrir une configuration enregistrée. Chaque confi-
guration enregistrée devient un élément d’un sous-menu sous le nom attribué en l’en-
registrant. En sélectionnant un de ces éléments, on ouvre cette configuration. Cette
configuration servira de configuration par défaut au démarrage de SyMRI.
Préférences › Supprimer configuration Supprimer une configuration enregistrée. Chaque
configuration enregistrée devient un élément d’un sous-menu sous le nom attribué en
l’enregistrant. En sélectionnant un de ces éléments, on supprime cette configuration.
3.4.2 Options d’affichage

Vue › Lier zoom et vue pan Les différentes zones ouvertes dans l’espace de travail sont
liées. Le défilement panoramique et le zoom y sont synchronisés. En d’autres termes,
panoramique et zoom sont identiques pour chaque image.
Vue ›Interpoler « Ctrl+P » L’interpolation lisse la visualisation des images pondérées
en contraste et SyMaps. L’interpolation des images est activée par défaut ; elle agit
simultanément sur chaque zone. Ce paramétrage n’est pas affecté et n’affecte pas Vue ›
Lier zoom et vue pan.
Rem. : Un zoom arrière important alors que l’interpolation est désactivée peut faire
apparaître sur l’image des artefacts de repliement.

Clic droit › Paramètres de l’image ›Couleur « C » Si l’option couleur est activée, affi-
chage de la pile d’images en couleur au lieu de niveaux de gris. Les images de synthèse
pondérées en contraste ne peuvent être affichées en couleur.
3.4.3 Autre
Préférences › Langue (Language) Choix de la langue voulue dans la liste des langues
proposées. Pour toute langue sélectionnée, à l’exception de l’anglais, l’option de menu
se présente comme suit : traduction du mot « Langue » dans la langue actuellement
sélectionnée + mention anglaise «(Language) ». Les options de sous-menu sont les noms
des différentes langues proposées dans cette langue.
Windows Fichier › À propos SyMRI Affichage de la description de la version active de SyMRI.
macOS SyMRI › À propos SyMRI Affichage de la description de la version active de SyMRI.

3.5 Affichage d’images

3.5.1 Zoom
Outil Zoom « Z » Appuyer sur le bouton de gauche de la souris tout en déplaçant celle-
ci pour modifier la taille d’affichage de la pile d’images. Avancer la souris pour faire un
zoom avant, la reculer pour un zoom arrière. Le zoom est sans effet sur les tableaux et
graphiques.
Clic droit › Zoom › Zoom avant « Ctrl+Z » Zoom avant pas á pas.
Clic droit › Zoom › Zoom arrière « Ctrl+Shift+Z » Zoom arrière pas á pas.
Les plages d’agrandissement sont prédéfinies.
Clic droit › Zoom › Zoom d’ajust à la fenêtre Taille d’image maximisée (taille de la
zone).
Clic droit › Zoom › Pixel à pixel Affichage d’un voxel du groupe de données DICOM
original = un pixel. Pour les voxels non carrés, le côté le plus court du voxel dans le plan
de l’image est mappé à un pixel de l’écran de l’ordinateur.
3.5.2 Navigation
Défilement de la pile d’images : Pour faire défiler la pile d’images, il suffit d’actionner
la roulette de la souris ou d’appuyer sur les touches « Page précédente » et « Page
suivante ». La touche « Début » affiche la première image d’une pile d’images
(coupes), et la touche « Fin » la dernière.
Les outils suivants sont présents dans la barre d’outils SyMRI.
Outil Défil. « F4 » Appuyer sur le bouton de gauche de la souris tout en déplaçant

celle-ci pour faire défiler la pile d’images.
Outil Pan. « F5 » « P » Appuyer sur le bouton de gauche de la souris tout en déplaçant
celle-ci pour faire défiler la pile d’images de gauche à droite ou de droite à gauche. Le
défilement panoramique est sans effet sur les tableaux et graphiques.
3.5.3 Fenêtrage
Fenêtrage : Gardez le bouton du milieu ou la molette de la souris enfoncé et déplacez la
souris afin d’ajuster le contraste et l’intensité de l’image. Un mouvement horizontal
modifie le centrage de la fenêtre, et un mouvement vertical sa largeur. Selon le
centrage et la largeur de la fenêtre, l’image est affichée en dégradés de gris ou en
couleur, ce qui joue sur la luminosité et le contraste.
Clic droit › Paramètres de l’image ›Échelle autom. « A » Réglage automatique de la

luminosité du et contraste de l’image dans la zone.

Deuxième partie
SyMRI® IMAGE

4 Fonctions de SyMRI IMAGE

SyMRI IMAGE est doté d’une fonctionnalité d’imagerie par résonance magnétique de
type synthétique. Ce système mesure les propriétés des tissus Vitesses de relaxation
R1 et R2 et PD (densité protonique). Sur la base de ces trois propriétés, les images
pondérées en contraste, telles que T1W, T2W ou FLAIR, peuvent être synthétisées en
choisissant librement le temps d’écho TE, le temps de répétition TR, en cas d’impulsion
d’inversion, le temps d’inversion TI, et en cas d’impulsion de double inversion, un second
temps d’inversion TI2.
Les paramètres par défaut pour les images pondérées en contraste ordinaires sont fournis,
mais l’utilisateur peut modifier TE, TR, TI et TI2 pour leur donner l’une des valeurs
possibles.
MISE EN GARDE : L’acquisition et le calcul des images de synthèse se
font différemment des images classiques. Le contraste d’image est donc très
similaire, mais pas nécessairement identique, y compris pour un même para-
métrage TE, TR et TI. Prenez le temps de définir des paramètres TE, TR
et TI donnant des images similaires à celles dont vous avez l’habitude, ou
optimisées compte tenu de vos besoins.
L’interprétation des images de synthèse doit être faite avec soin. Une pé-
riode d’apprentissage est recommandée, car nécessaire pour savoir faire la
différence entre images de synthèse et images classiques.
Fig. 4.1 : Au démarrage de SyMRI IMAGE, l’espace de travail est divisé en

quatre zones affichant des images de synthèse pondérées en contraste : T2W,
T2W FLAIR, PSIR et T1W

4.1 Images de synthèse pondérées en contraste

Les images de synthèse pondérées en contraste sont calculées sur la base des valeurs R1,
R2 et PD en combinaison avec les paramètres TE, TR, T1 et TI2 choisis.
4.1.1 Affichage des images de synthèse pondérées en contraste

Un certain nombre de pondérations en contraste préréglées peuvent être sélectionnées à
l’aide du menu du clic droit ou de commandes clavier. Les paramètres accessibles peuvent
être fonction de votre licence.
Disposition contraste « Ctrl+R » Affichage de quatre zones avec images de contraste :

T2W, T2W FLAIR, T1W et PSIR. Les valeurs par défaut de TE, TR et TI sont indiquées
dans le tableau 4.1. Le Tab. 4.2 indique les valeurs par défaut de DIR dans le cas d’une
licence avec activation DIR.
Clic droit › T1W « 1 » Une image pondérée T1 s’affiche dans la zone active. Dans les
images pondérées T1, les zones présentant une faible densité de protons sont pondérées
de façon à rehausser le contraste entre matière grise et blanche.
Clic droit › T2W « 2 » Une image pondérée T2 s’affiche dans la zone active.
Clic droit › PDW Une image pondérée en PD s’affiche dans la zone active.
Clic droit › T1W FLAIR Une image FLAIR pondérée T1 s’affiche dans la zone active.
Clic droit › T2W FLAIR « 3 » Une image FLAIR pondérée T2 s’affiche dans la zone
active.
Clic droit › STIR « 4 » Une image STIR pondérée T2 s’affiche dans la zone active.
Clic droit › PSIR « 5 » Une image IR sensible à la phase s’affiche dans la zone active.
Clic droit › PSIR (vaisseau) Une image IR sensible à la phase pour accentuer les vais-
seaux sanguins s’affiche dans la zone active.
Clic droit › Double IR (WM supp) Une image à double IR pour supprimer WM et CSF
s’affiche dans la zone active.
Clic droit › Double IR (GM supp) Une image à double IR pour supprimer GM et CSF
s’affiche dans la zone active.
Rem. : L’option de menu DIR n’est accessible que si votre licence active la fonctionnalité
DIR.

Tab. 4.1 : Valeurs par défaut de TE, TR et TI pour les différentes images de
synthèse pondérées en contraste.
Type d’image TE TR TI
T1W 10 ms 500 ms
T2W 100 ms 4 500 ms
PDW 10 ms 8 000 ms
T1W FLAIR 10 ms 2 500 ms 1 050 ms
T2W FLAIR 100 ms 15 000 ms 3 000 ms
STIR 100 ms 15 000 ms 300 ms
PSIR 10 ms 6 000 ms 500 ms
PSIR (vaisseau) 10 ms 8 000 ms 10 ms
Tab. 4.2 : Valeurs par défaut de TE, TR, TI et TI2 pour DIR pour les puis-
sances de champ prises en charge.
Type d’image Puissance de champ TE TR TI TI2

4.1.2 Réglage du contraste d’image

SyMRI permet le réglage post-examen de la pondération en contraste des images de
synthèse pondérées en contraste. Il suffit pour ce faire de modifier le temps d’écho (TE),
le temps de répétition (TR) et le temps d’inversion (TI). Ces options sont accessibles via
le menu contextuel (clic droit), leur icône de la barre d’outils ou encore les raccourcis
clavier ci-dessous. Lors du réglage de la pondération en contraste en appuyant sur le
bouton gauche de la souris, vous pouvez annuler les changements en appuyant sur « Esc »
avant de relâcher le bouton gauche de la souris.
Ajuster TE « Q » Pour modifier TE, déplacer la souris en appuyant sur son bouton de
gauche.
Ajuster TR « W » Pour modifier TE, déplacer la souris en appuyant sur son bouton de
gauche.
Ajuster TR/TE « E » TR et TE sont ajustés simultanément en déplaçant la souris tout
en maintenant le bouton gauche de la souris enfoncé.
Ajuster TI « R » Pour modifier TI, déplacer la souris en appuyant sur son bouton de
gauche. Cette option est accessible quand la pré-impulsion d’inversion est active.
Ajuster TI-TI « T » Pour modifier TI et TI2, déplacer la souris en appuyant sur son
bouton de gauche. Cette option est accessible quand la pré-impulsion de double inversion
est active.
Rem. : Lorsque l’outil Ajuster TI ou Ajuster TI-TI est sélectionné, le pointeur de la souris
se change en un cercle rouge lorsqu’il passe au-dessus des images pondérées en contraste si
l’impulsion/les impulsions d’inversion ne sont pas actives. Toute tentative d’ajustement
de TI ou TI2 pour ce type d’image déclenche une boite de dialogue vous demandant si
vous souhaitez activer l’impulsion/les impulsions d’inversion correspondantes.

ROI Clic droit › Util. ROI pour tissu à suppr. La pondération de l’image en contraste
est ajustée, de sorte que les tissus de la ROI s’affichent en noir. Ce réglage se fait par le
biais d’une pré-impulsion d’inversion avec TI optimisé. Pour occulter un tissu d’un type
donné : positionner et dimensionner la ROI de manière à n’englober que du tissu du
type voulu. Le TI de l’image affiché s’ajuste en conséquence. Dans une image DIR, le TI
utilisé pour occulter CSF sera ajusté afin de continuer à occulter CSF, tandis que l’autre
TI sera optimisé pour occulter le tissu dans la ROI. Les fonctionnalités de définition de
la ROI sont décrites au chapitre 4.3.
Voir Section 6.3.1 (Util. ROI pour tissu à suppr).
ROI Clic droit › Paramètres de l’image ›Pré-impulsion d’inversion « Ctrl+I » Une pré-
impulsion d’inversion sera activée dans l’image. Le TI de la pré-impulsion d’inversion
est affiché sur la gauche de la zone et peut être modifié à l’aide de l’option Ajuster TI.
ROI Clic droit › Paramètres de l’image ›Pré-impulsion de double inversion Permet
d’activer la pré-impulsion de double inversion dans l’image. Les temps d’inversion sont
affichés sur la gauche de la zone et peuvent être modifiés à l’aide de l’option Ajuster
TI-TI.
ROI Clic droit › Paramètres de l’image › Activer PSIR Si l’affichage PSIR est désactivé,
la visualisation des valeurs négatives se fait par le biais des valeurs absolues correspon-
dantes. On a des valeurs négatives dans des images présentant une impulsion d’inversion
(PSIR, etc.) En IRM classique, seule la valeur absolue peut être affichée. Dans SyMRI,
il est possible d’afficher les valeurs négatives en activant PSIR. Si PSIR est activé, la
chaîne « PSIR (synthetic) » s’affiche dans la zone.
4.1.3 Modification des images FLAIR

Dans une image FLAIR, le liquide céphalo-rachidien (CSF) est occulté par le biais d’une
impulsion d’inversion et d’un retard d’inversion simultanés qui annulent le signal. La
combinaison TR – TI peut varier d’un hôpital à l’autre. Il faut donc avoir conscience
des écarts possibles.
Fig. 4.2 : Différents paramétrages T2W FLAIR – patient atteint de SEP (post-
AC). A : TR/TI = 12 000/2 850 ms, B : TR/TI = 12 000/2 600 ms, C : TR/TI
= 12 000/2 400 ms, D : TR/TI = 6 000/2 000 ms. Valeur TE = 100 ms dans
tous les cas.
La Fig. 4.2 donne des exemples d’optimisation des images FLAIR : L’occultation du
CSF se fait par le biais d’une combinaison TR/TI = 12 000/2 600 ms, qui donne un CSF
bien noir (Fig. 4.2B). Toutefois, une valeur TI plus longue pour un TR inchangé donne
une occultation raisonnable du CSF tout en assurant un meilleur contraste GM/WM
(Fig. 4.2A). Un paramétrage FLAIR clinique type reposant sur un TR court (réduction

du temps d’acquisition) débouche sur une dégradation du contraste GM/WM, mais la

durée d’acquisition reste inchangée en IRM synthétique (Fig. 4.2D).
SyMRI annote une image = FLAIR quand la valeur TI approche la valeur qui élimine
complètement CSF. Pour d’autres valeurs TI , l’annotation de l’image = IR.
Voir aussi Section 4.1.2 (Réglage du contraste d’image).
4.1.4 Mise au point des images double IR

Dans une image double IR, deux types de tissu sont occultés à l’aide d’une combinaison
de deux impulsions d’inversion et d’un retard d’inversion. Par exemple, on peut occulter
simultanément substance blanche, matière grise ou graisses et CSF. La Fig. 4.3 donne
des exemples ainsi qu’une suggestion de paramétrage.
Fig. 4.3 : Exemple de paramétrage pour double IR à 3T.

A : DIR lorsque la substance blanche et le CSF sont supprimés via
TE/TR/TI1/TI2 = 100/15 000/470/3 750 ms (femme, 35 ans),
B : DIR pour applications pédiatriques, via TE/TR/TI1/TI2 =
10/8 000/900/3 950 ms (sexe masculin, 8 mois) et
C : DIR avec occultation des graisses, similaire à une image FLAIR T2W avec
occultation des graisses, via TE/TR/TI1/TI2 = 100/15 000/250/3 200 ms
(sexe masculin, 10 ans).
Le paramétrage correct de deux TI est une opération délicate et le recours à la fonction

« Util. ROI pour tissu à suppr. » (occulter tissus à l’aide d’une région d’intérêt, section
4.1.2) est recommandé.
4.1.5 Fenêtre de navigation pour images de contraste

La pondération en contraste active de l’image s’affiche dans la zone de deux manières :
sous la forme d’une fenêtre de navigation sur la gauche de la zone, et sous forme de texte
en haut de la zone.
La fenêtre de navigation (Fig. 4.4) s’affiche avec les images pondérées en contraste. Dans
la fenêtre de navigation, la pondération en contraste active de l’image est indiquée par
un point jaune. Lors de l’ajustement de TR ou de TE, utilisez la fenêtre de navigation
pour voir de quelle manière les modifications affectent la pondération en contraste. Il est
également possible d’ajuster TE et TR en cliquant sur le point jaune et en le tirant.

Fig. 4.4 : Le cercle dans la fenêtre de navigation indique la pondération en

contraste de l’image affichée dans la zone.
Le texte s’affiche en haut des modifications de la zone, en fonction de la pondération en

contraste active. Pour les images obtenues dans le cadre d’une séquence d’écho de spin,
la pondération peut être T1W, T2W, PDW ou T1+T2. Si une pré-impulsion d’inversion
est active, le texte sera IR, PSIR, STIR, T1W FLAIR, T2W FLAIR ou FLAIR. Si deux
pré-impulsions d’inversion sont activées,la pondération en contraste sera DIR.

4.2 SyMaps
Les cartes de quantification de SyMRI affichent les valeurs mesurées pour les propriétés
des tissus pour chaque voxel d’un groupe de données. Les cartes de quantification pour la
vitesse de relaxation R1, la vitesse de relaxation R2 ainsi que pour la densité protonique
(PD) sont la base de l’IRM synthétique. Outre ces cartes de quantification, on dispose
des temps de relaxation inversés T1 et T2.
4.2.1 Affichage des SyMaps

La sélection des cartes de quantification décrites ci-dessous se fait à l’aide du menu
contextuel ou du raccourci clavier indiqué.
Fig. 4.5 : La configuration SyMaps inclut une image de synthèse pondérée en

contraste T2W, SyMaps pour PD, R1 et R2.
Chaque paramètre représenté sous la forme SyMaps dispose d’une certaine plage dans
laquelle il peut être mesuré. C’est ce que l’on appelle la plage dynamique de SyMRI. La
plage dynamique de chaque paramètre est présentée dans Tab. 6.2.
Disposition de SyMaps « Ctrl+F » L’espace de travail est divisé en quatre zones affi-
chant une carte R1, une carte R2, une carte PD et une image de synthèse à pondération
de contraste T2W.
Clic droit › SyMaps › Cart T1 Les temps de relaxation T1 s’affichent en ms.
Clic droit › SyMaps › Cart T2 Les temps de relaxation T2 s’affichent en ms.
1
Clic droit › SyMaps › Cart R1 La vitesse de relaxation R1 s’affiche dans s−1 , 𝑅1 = 𝑇1.
1
Clic droit › SyMaps › Cart R2 La vitesse de relaxation R2 s’affiche dans s−1 , 𝑅2 = 𝑇2.
Clic droit › SyMaps › Cart PD La densité protonique s’affiche en points de pourcentage
(pu) par rapport à une valeur de référence de 100 pu, qui correspond à la densité proto-
nique de l’eau. La graisse a une densité protonique plus élevée que l’eau. Les valeurs la
concernant sont donc supérieures à 100 pu.

4.3 Région d’intérêt (ROI)

Une ROI peut être créée pour sélectionner une zone de l’image. Via la ROI, R1, R2, PD
et l’intensité du signal dans la région visée peuvent être analysés.
4.3.1 Création et mise au point d’une ROI

Pour créer une ROI, placer le pointeur de la souris sur un point donné, appuyer sur
le bouton de gauche et dessiner la zone voulue (forme et dimensions), puis relâcher le
bouton. Pour activer l’outil de dessin des ROI, choisir l’une des méthodes suivantes :
ROI main libre « F6 » Permet de dessiner une ROI de la forme exacte voulue. Un trait
droit boucle la région dessinée quand on relâche le bouton de la souris.
ROI rectangulaire « F7 » Permet de dessiner une ROI de forme rectangulaire. Pour
modifier la taille de cette forme rectangulaire, sélectionner l’un de ses coins et déplacer
la souris en appuyant sur le bouton de gauche.
4.3.2 Données de la ROI

Les données liées à la ROIs’affichent dans l’angle supérieur droit de la zone (Fig. 4.6),
sous le zoom et le fenêtrage. Ce bloc de texte est appelé Infos ROI.
Fig. 4.6 : ROI et données s’y rapportant.
Deux des lignes affichent la valeur médiane et l’écart type de R1 et R2 par défaut. Ces
deux lignes peuvent être modifiées afin d’afficher T1 et T2 à la place
Ces données sont les suivantes :
Position : Coordonnées centrales de la ROI par rapport à l’image : « ROI [#,#] ». Dans
le cas de la ROI libre, le centre est celui du rectangle qui l’englobe.
de R1 ou T1 : Valeur médiane et écart type de R1 ou T1 dans la ROI. Pour les cartes
T1, T1 est affiché et pour les cartes R1, R1 est affiché.
R2 ou T2. : Valeur médiane et écart type de R2 ou T1 dans la ROI. Pour les cartes
T2, T2 est affiché et pour les cartes R2, R2 est affiché.
PD : Valeur médiane et écart type de la PD dans la ROI
Signal : Valeur médiane et écart type de la luminosité du voxel. Dans les images de
synthèse, correspond à la puissance du signal IRM simulé.
Voir aussi les sections 5.1, 5.4 et5.6, qui décrivent les autres opérations ROI accessibles
dans SyMRI NEURO.

4.3.3 Préférences ROI

SyMRI supporte plusieurs ROI par zone, et chaque ROI peut être spécifique à une coupe
particulière.
Préférences › Multiple ROI Permet à l’utilisateur d’obtenir plusieurs ROI par zone.
Désactivé par défaut. La ROI active se caractérise par un contour en trait plein, alors
que les autres ROI ont leur contour en pointillés. L’apparence d’une ROI active et inac-
tive est visible dans Fig. 4.7.
Lorsque Multiple ROI est désactivées, une ROI est automatiquement supprimée lors-
qu’une nouvelle ROI est tracée dans la même zone. Lorsqu Multiple ROI est activée, les
ROI existantes conservent leur contour en pointillés.
Préférences › ROI par tranche Verrouille la ROI sur la tranche spécifique au moment
où cette ROI a été tracée. Par défaut si désactivée.
Lorsque la ROI par tranche est désactivée, une ROI reste visible lors du défilement des
tranches. Infos ROI est mis à jour afin d’afficher les statistiques pour la ROI de la
tranche visible. Lorsque ROI par tranche est activé, une ROI n’est visible que dans la
tranche où elle a été tracée. Lorsque l’on passe par défilement à une autre tranche, la
ROI ne sera pas visible. Infos ROI ne sera visible que dans les tranches avec une ROI.
Fig. 4.7 : Deux ROI dans la même zone. La ROI supérieure est active : elle
est affichée avec un contour en ligne continue. La ROI inférieure n’est pas
active :elle est affichée avec un contour en pointillés
Rem. : Les informations affichées dans la zone correspondent à la ROI indiquée comme
active. Pour activer une ROI, cliquer sur le bouton gauche de la souris. Lorsqu’une
nouvelle ROI est tracée, elle est automatiquement indiquée comme active. La ROI active
peut également être sélectionnée en appuyant sur « Tab » ou « Maj+Tab ».
4.3.4 Suppression d’une ROI

Un clic droit sur une ROI affichera le menu clic droit ROI. Ce menu inclut diverses
actions sur la ROI.
ROI Clic droit › Couper ROI « Ctrl+X » La ROI sera copiée dans le presse-papiers, puis
supprimée de la zone.
ROI Clic droit › Copier ROI « Ctrl+C » La ROI sera copiée dans le presse-papiers.

ROI Clic droit › Coller ROI « Ctrl+V » S’il y a une ROI dans le presse-papiers, elle sera
collée dans la zone active.
La commande par touches « Ctrl+V » est utilisée pour coller la ROI dans une nouvelle
zone sans ROI. La commande par touches « Ctrl+V » peut également être utilisée pour
coller la ROI sous forme de texte dans un programme de traitement de texte. Le texte
peut alors être copié et collé dans SyMRI afin de générer une ROI identique.
ROI Clic droit › Désactiver ROI « Backspace » La ROI est supprimée de la zone.
ROI Clic droit › Afficher graphique Le graphique est masqué ou s’affiche.
ROI Clic droit › Util. ROI pour tissu à suppr. Voir la Section 4.1.2 (Réglage du contraste
d’image). Cette fonction est automatiquement désactivée lors du changement de tranche.

4.4 Graphiques
Quand une ROI est présente dans une zone, un graphique s’affiche automatiquement
dans son angle inférieur droit. Les valeurs des voxels de la ROI sont représentées dans la
courbe (Fig. 4.8). Les couleurs indiquent le nombre de voxels présentant une combinaison
de valeurs données. Le rouge signale un nombre relativement important de voxels, et le
bleu un nombre réduit (Fig. 4.9).
Fig. 4.8 : Le graphique représente tous les voxels de la ROI.
Le graphique peut être personnalisé avec le menu graphique clic droit.

Le menu contextuel du graphique donne par ailleurs accès à trois types de courbes :
R1-R2, R1-PD et R2-PD. L’axe et la description du graphique changent en fonction du
type de courbe sélectionné.
Il y a deux options concernant l’échelle du graphique. La petite échelle convient pour
des valeurs types du cerveau. L’autre échelle, plus importante, donne des intervalles
plus grands pour les axes R1-R2, R1-PD et R2-PD. La petite échelle est l’option par
défaut. Elle est recommandée pour le cerveau. Pour les autres éléments anatomiques, le
graphique passe automatiquement à l’échelle supérieure.
Fig. 4.9 : Le menu graphique clic droit.

4.5 Enregistrement et chargement

Différents types d’images et de piles d’images peuvent être enregistrés à partir de SyMRI
sur le poste de travail ou PACS. Les options d’enregistrement et de chargement sont
fonction de la variante de SyMRI utilisée.
MISE EN GARDE : Il convient de noter que seules les données sources pro-
venant de SyMaps et MDME peuvent être rouvertes par SyMRI. Les images
pondérées en contraste enregistrées peuvent être ouvertes par d’autres affi-
cheurs d’image DICOM.
AVERTISSEMENT : Attention : en cas d’arrêt intempestif du poste de tra-

vail ou d’erreur en cours d’enregistrement des données, ces dernières ne
seront pas fiables. Supprimer les données enregistrées et enregistrer à nou-
veau.
Remarque : dans certaines variantes, l’enregistrement pourrait n’avoir été
fait que partiellement s’il a été fait dans SyMRI. Par exemple, le déploiement
Sectra PACS IDS7 importe les données enregistrées lors d’une procédure
distincte.
Sectra PACS IDS7 démarre l’importation quand SyMRI lance l’enregis-
trement. Mais une fois SyMRI fermée, Sectra PACS IDS7 peut encore
avoir des images en attente d’importation. En cas de plantage de Sectra
Plug-In
PACS IDS7 après fermeture de SyMRI, il convient d’inspecter les don-
nées enregistrées. La documentation Sectra PACS IDS7 décrit le fonc-
tionnement de l’importation dans Sectra PACS IDS7.
4.5.1 Enregistrement d’une SyMaps

Le menu Fichier comprend des options d’enregistrement d’une SyMaps.
Rem. : Cette fonction n’est accessible qu’avec SyMRI et un groupe de données MDME.
Rem. : Les SyMaps sont généralement cryptées. Dans ce cas, il n’y aura qu’un fichier par
tranche. Les SyMaps cryptées peuvent être ouvertes dans un afficheur DICOM où elles
apparaîtront comme une série T2W. Les SyMaps cryptées ne peuvent être correctement
ouvertes que dans SyMRI.
MDME Les données pour SyMRI comportent généralement plus de 300 images, alors
qu’une SyMaps quantifiée contient une ou trois images par tranche, et environ 20 à 300
images au total.
Ne jamais supprimer le groupe de données original ! Il pourrait être nécessaire à la fiabilité
de comparaisons faites par le biais de versions futures du logiciel. Cette fonction n’est
pas accessible si SyMRI a été lancé avec un groupe de données quantifié.
Fichier › Enregistrer SyMaps (T1T2PD) sur PACS Une pile d’images quantifiée est
Plug-In
enregistrée dans PACS sous forme de série distincte pour l’examen en cours.

Fichier › Enregistrer SyMaps (T1T2PD) dans dossier local... Une pile d’images
quantifiée est enregistrée au format DICOM dans le dossier voulu sur le poste de
StandAlone travail (enregistrement local). Le système crée un DICOMDIR dans le dossier et enre-
gistre les données de pile dans un sous-dossier. S’il existe déjà un fichier DICOMDIR,
ce dernier est actualisé.
Fichier › Enregistrer SyMaps (T1T2PD) sur PACS Une pile d’images quantifiée est
Network enregistrée dans le PACS configuré via le réseau sous forme de série distincte pour
l’examen en cours.
4.5.1.1 Gain de temps

Avant de fermer SyMRI, il est recommandé d’enregistrer la SyMaps quantifiée si on
prévoit de charger le groupe de données ultérieurement. En effet, le chargement d’une
SyMaps quantifiée est plus rapide que celui de données brutes non quantifiées (MDME).
4.5.2 Enregistrement d’une capture d’écran

Le menu Fichier comporte des options de sauvegarde d’une capture d’écran de l’espace
de travail.
Rem. : n’ouvre pas les captures d’écran SyMRI qui sont visualisables dans d’autres
visionneuses DICOM.
Fichier › Enregstrer copie écran sur PACS Une copie de l’espace de travail de
SyMRI est enregistrées dans PACS sous la forme d’une nouvelle série pour l’examen Plug-In
en cours.
Fichier › Enregistrer copie écran dans fichier... Une copie de l’espace de travail
de SyMRI est enregistrée au format DICOM dans le fichier voulu, sur le poste de
StandAlone
travail. Le système crée un DICOMDIR dans le dossier et enregistre le fichier dans
un sous-dossier. S’il existe déjà un fichier DICOMDIR, ce dernier est actualisé.
Fichier › Enregstrer copie écran sur PACS Une capture d’écran de l’espace de travail
de SyMRI est enregistrée dans le PACS configuré via le réseau sous la forme d’une Network
nouvelle série pour l’examen en cours.
4.5.3 Enregistrement d’une pile d’images
Rem. : La pile d’images pondérées en contraste ne peut pas être ouverte avec SyMRI,
mais peut être visualisée dans d’autres afficheurs d’images DICOM.
Rem. : Le format des images enregistrées est différent en fonction des paramètres de
couleur. Si la couleur est activée, les images seront enregistrées comme des images RGB.
Si la couleur est désactivée les images seront enregistrées en nuances de gris. Voir Section
3.4.2.

4.5.3.1 Enregistrement de la pile d’images

Le menu clic droit pour chaque zone inclut l’option d’enregistrement de la pile affichée
dans la zone active pour une nouvelle série. La pile conserve les paramètres de la zone,
par exemple le fenêtrage, la pondération en contraste et les paramètres de couleur.
Clic droit › Enregistrer pile sur PACS La pile d’images présente dans la zone est
Plug-In
enregistrées dans PACS sous la forme d’une nouvelle série pour l’examen en cours.
Clic droit › Enregistrer pile dans dossier local... Enregistre toutes les piles visibles
(avec SyMaps si le programme exploitait des données brutes) dans le format DICOM
StandAlone vers le répertoire spécifié sur le poste de travail. Un DICOMDIR est créé dans le
dossier et les données de la pile sont enregistrées dans un sous-dossier. Si un fichier
DICOMDIR existe déjà, il est mis à jour.
Clic droit › Enregistrer pile sur PACS Enregistre toutes les piles visibles (avec
Network SyMaps si le programme exploitait des données brutes) dans le PACS configuré
via le réseau, sous la forme d’une nouvelle série dans l’examen en cours.
4.5.3.2 Enregistrement de toutes les piles visibles

La barre d’outils et le menu Fichier intègrent l’option d’enregistrement de toutes les zones
visibles sous forme de série distincte. Si le programme exploitait des données brutes, des
SyMaps sont enregistrées également.
Fichier › Enregistrer toutes piles visibles sur PACS Enregistre toutes les piles vi-
Plug-In sibles (avec SyMaps si le programme exploitait des données brutes) dans PACS sous
la forme d’une nouvelle série dans l’examen en cours.
Fichier › Enregistrer toutes visibles dans dossier local... Chaque zone visible (et
SyMaps si le programme exploitait des données brutes) est enregistrée sous la forme
d’une série DICOM distincte dans un dossier de l’ordinateur portant le nom du type
StandAlone
d’images affichées dans la zone concernée. Le système crée un DICOMDIR dans le
dossier et enregistre les données de pile dans un sous-dossier. S’il existe déjà un
fichier DICOMDIR, ce dernier est actualisé.
Fichier › Enregistrer toutes piles visibles sur PACS Chaque zone visible (et SyMaps
Network si le programme exploitait des données brutes) est enregistrée sous la forme d’une
série distincte pour l’examen en cours dans le PACS configuré via le réseau.

Troisième partie
SyMRI® NEURO

5 Fonctions de SyMRI NEURO

SyMRI NEURO est doté d’une fonctionnalité de caractérisation des tissus cérébraux et
de mesure du volume cérébral. Les propriétés des tissus R1, R2 et PD permettent la
mesure automatique des volumes partiels de tissus. De cette manière, on peut estimer le
volume intracrânien (ICV) et le volume du parenchyme cérébral (BPV) ainsi que de la
substance blanche (WM), de la matière grise (GM), du liquide céphalo-rachidien (CSF)
et des composants liés à la myéline (MyC). Un masque utilisateur permet de mesurer le
volume des tissus intracrâniens définis par l’utilisateur.
MISE EN GARDE : La précision de ces mesures dépend de plusieurs pa-
ramètres, y compris le paramétrage de la séquence, le fabricant de l’IRM
et la puissance de champ. En d’autres termes, toute modification de para-
mètre (ordre modifié, autre appareil) peut nuire à la précision. Les volumes
cérébraux ont été validés à 1,5T et 3T, mais les tolérances entre appareils
peuvent déboucher sur des écarts. Il est donc recommandé de s’en tenir à un
paramétrage fixe pour les études longitudinales.
Fig. 5.1 : Au démarrage de SyMRI NEURO, cinq zones s’affichent. Trois

d’entre elles affichent des images de contraste synthétiques. Une autre affiche
une carte de segmentation. Cette dernière affiche le CSF. La zone tout à droite
affiche une table de segmentation avec résultats en volume. Le raccourci clavier
« Ctrl+R » permet de revenir à cette configuration.

5.1 Le masque intra-crânien
AVERTISSEMENT : Avant d’analyser les volumes de tissus, l’utilisateur

doit s’assurer que le masque intracrânien est anatomiquement correct. Si le
rendu automatique échoue, l’utilisateur doit corriger le masque à l’aide de
la fonctionnalité ROI. Les problèmes se situent généralement au niveau des
orbites ainsi qu’au sommet et à la base du crâne.
Fig. 5.2 : Le masque intracrânien définit l’ICV dans SyMRI NEURO. La ligne
rouge indique l’extérieur de l’ICV.
Le masque intracrânien définit le volume intracrânien dans SyMRI NEURO. L’ensemble

des segmentations et calculs de volume sont appliqués aux voxels faisant partie du masque
intracrânien.
Le masque intracrânien est obtenu en incluant WM, GM et CSF, suivis par un algorithme
de croissance de la zone d’acquisition pour obtenir un volume contigu.(Fig. 5.2). Les
bords du masque sont définis selon PD = 50, compte tenu de l’hypothèse que le bord de
l’ICV se situe à mi-chemin entre CSF (où PD = 100) et os (PD = 0). Enfin, on réduit
le masque intracrânien de 0.5 mm pour éliminer la dure-mère. Notez que la ligne rouge
ICV affichée à la Fig. 5.2, est tracée à l’extérieur du volume de l’ICV.
5.1.1 Ajustement du masque intra-crânien

Le masque intracrânien doit être ajusté comme suit :
1. Pour afficher le masque intra-crânien sélectionnerMasque intracrânien dans
le menu contextuel (clic droit) ou appuyer sur la touche « I ».
2. Faire défiler les coupes et s’assurer que le masque intracrânien est correct.
3. Agrandir le masque en définissant une ROI autour de la zone. Ajouter la région
d’intérêt au masque à l’aide de Ajouter au masque intracrânien dans le menu clic
droit de la ROI ou en appuyant sur la touche « Insert » du clavier. Les parties
de la ROI situées à l’extérieur de la matrice d’image sont ignorées lors de l’édition.
4. Réduire le masque en définissant une nouvelle ROI. Supprimer la région d’intérêt
au masque à l’aide de Retirer du masque intracrânien dans le ROI menu clic droit
ou en appuyant sur la touche « Suppr » du clavier.. Les parties de la ROI situées
à l’extérieur de la matrice d’image sont ignorées lors de l’édition.

5. Enregistrement du masque intra-crânien Quand le masque est correct, enre-

gistrer les modifications en sélectionnant Enregistrer masque intracrânien dans le
menu Fichier. Une fois le masque enregistré, la zone affichant le tableau est mise
à jour et affiche le texte : « Dernière modif. masque intracrânien par “nom de
l’utilisateur”, “date’” “heure” ».
Le masque intracrânien n’est pas enregistré automatiquement lors de l’enregistre-

ment de SyMaps, mais il sera recalculé lors de l’ouverture de SyMaps. Il est possible
Plug-In d’enregistrer le masque intracrânien lorsque les SyMaps sont ouvertes. Une fois le
masque intracrânien enregistré avec SyMaps, ce masque sera automatiquement char-
gé et affiché lors de l’ouverture des SyMaps.
AVERTISSEMENT : Le masque intracrânien (Fig. 5.2) correspond à la défi-

nition SyMRI NEURO de l’ICV. La segmentation des tissus et l’estimation
des volumes sont effectuées pour tous les voxels du masque intracrânien. Les
tissus hors masque ne sont pas pris en compte dans l’estimation des volumes
de tissus.
5.1.2 Masque intra-crânien – fonctions complémentaires

Fichier › Enregistrer masque intracrânien Le masque intra-crânien est enregistré et sera
chargé automatiquement lors de la prochaine consultation de l’examen. Cette option de
menu n’est disponible que si un groupe de données SyMaps a été ouvert.
L’information est enregistrée dans un fichier objet DICOM d’affichage sous forme
de série distincte, dans le dossier à partir duquel le groupe de données a été chargé.
StandAlone
Quand on enregistre des SyMaps, le masque intra-crânien est enregistré dans le
groupe de données SyMaps enregistré.
L’information est enregistrée dans PACS dans un objet DICOM d’affichage sous
Plug-In forme de série distincte, dans le dossier d’examen à partir duquel le groupe de
données a été chargé.
Les informations sont enregistrées dans un objet DICOM Affichage (Presentation

State) dans le PACS configuré via le réseau sous forme d’une nouvelle série dans le
Network dossier d’examen à partir duquel le groupe de données a été chargé.
Quand on enregistre des SyMaps, le masque intra-crânien est enregistré dans le
groupe de données SyMaps enregistré.
Fichier › Charger le masque intracrânien Chargement du masque intra-crânien enregis-

tré en dernier.
Modifier › Recalculer le masque intracrânien Le masque intra-crânien est regénéré par
un algorithme de SyMRI NEURO.
Modifier › Effacer le masque intracrânien Suppression du masque intra-crânien. Tous
les volumes calculés sont remis à zéro. Cette fonction trouve son utilité quand l’utilisateur
désire reprendre à zéro la définition du cerveau.
Clic droit › Montrer Bords Masque Intra-crânien « H » Affichez et cachez les bords du
masque intracrânien.

AVERTISSEMENT : Pour des résultats de segmentation précis, le masque

intra-crânien doit comprendre le volume total du crâne. Le masque intra-
crânien ne doit pas servir à l’estimation du volume d’éléments cérébraux
spécifiques (ventricules, etc.) Le masque utilisateur (chapitre 5.4) peut servir
à la segmentation de zones plus réduites du cerveau.

5.2 Segmentation des tissus

SyMRI segmente automatiquement différents types de tissus. Il s’agit de WM, GM, CSF
et MyC. Cette segmentation automatique est effectuée sur tous les voxels inclus dans
l’ICV défini par le masque intracrânien.
Le résultat des segmentations de tissus est affiché de deux manières, sous la forme de
volume total dans la table de segmentation (Section 5.5) soit sous la forme de cartes de
segmentation (Section 5.3).
5.2.1 Parenchyme cérébral et CSF segmentation

SyMRI segmente le tissu en quatre types, chaque voxel de l’ICV contenant des volumes
partiels sur une plage de 0 à 100 % du volume du voxel pour chaque type de tissu. Les
quatre types de tissu dans le modèle de segmentation de SyMRI sont :
• WM (de l’anglais White Matter) Substance blanche (myélinisée)
• GM (de l’anglais Gray Matter) Matière grise
• CSF (de l’anglais Cerebro-Spinal Fluid) Liquide céphalo-rachidien
• NON-WM/GM/CSF, tissu/fluide aux caractéristiques différentes de celles de la

WM, de la GM et du CSF
Rem. : Un tissu segmenté comme NON-WM/GM/CSF ne doit pas être supposé

pathologique, c’est simplement le reliquat du volume de voxel qui n’a pas été
segmenté comme WM, GM ou CSF.
Les définitions des tissus de WM, GM et CSF ont été établies sur la base des analyses
de R1, R2 et PD, quantifiées par SyMRI. Un neuroradiologue a défini plusieurs ROI afin
de repérer les zones purement WM, GM et CSF dans le groupe de données cérébrales
d’un certain nombre d’adultes volontaires sains. Les analyses statistiques des propriétés
tissulaires dans ces ROI ont été utilisées pour définir des répartitions gaussiennes de
R1-R2-PD pour chaque type de tissus, également appelées groupes de tissus.
AVERTISSEMENT : Les types de tissus sont similaires mais pas identiques

à la classification histologique. Chez les tout jeunes enfants, par exemple,
dont la substance blanche n’est pas encore complètement myélinisée, le tissu
peut être segmenté comme GM au lieu de WM. Cela est dû au fait que WM
modélise une substance blanche myélinisée et que la substance blanche non
myélinisée présente des propriétés plus proches de celles de la GM.
AVERTISSEMENT : Aucune comparaison n’a été faite avec la substance

blanche, la matière grise ou le liquide céphalo-rachidien.
5.2.2 Cartographie du volume partiel en corrélation avec la myéline (MyC)

À part les cartes de segmentation pour WM, GM, CSF et NON-WM/GM/CSF, SyMRI
peut également afficher une carte de segmentation des composants corrélés à la myé-
linisation, MyC. Cette carte est fortement corrélée au volume partiel de myéline dans

chaque voxel d’acquisition. Les valeurs typiques de MyC chez l’adulte sont 0–8 % dans
la GM corticale et de 30–45 % dans le WM. MyC est affiché dans l’image dans une plage
colorimétrique de 0 à 40 % ; cependant, les valeurs peuvent être plus élevées. Utilisez la
fonction ROI pour vérifier les valeurs de MyC dans des zones spécifiques (voir Section
5.6.1). Dans le cerveau humain, MyC n’excède généralement pas 50 %. MyC n’est pas
linéairement proportionnel au volume partiel de WM, par exemple MyC peut varier dans
les zones segmentées de manière homogène jusqu’à 100 % de WM.
MyC se fonde sur un autre modèle de segmentation que WM, GM, CSF et NON-WM/
GM/CSF. La somme des volumes de WM, GM, CSF et NON-WM/GM/CSF s’ajoute
à l’ICV total, hors MyC. La myéline réelle comporte de très fines couches d’eau, dans
lesquelles la relaxation se déroule trop rapidement pour être directement observée lors de
l’acquisition SyMRI. En raison des échanges magnétiques, toutefois, l’eau contenue dans
la myéline avec une relaxation rapide a des effets sur l’environnement, en abaissant la
vitesse de relaxation de l’eau, y compris de l’eau axonale, intracellulaire et extracellulaire.
Ainsi, les valeurs de MyC se fondent sur les échanges magnétiques entre la myéline et
l’eau environnante. En présence de myéline, le temps de relaxation de l’eau environnante
est plus important, et la PD est inférieure, par rapport à une situation sans présence de
myéline.
Le modèle MyC inclut quatre volumes partiels, chacun avec son propre ensemble de
temps de relaxation et paramètres de densité protonique. Les quatre volumes partiels
sont MyC, le volume cellulaire partiel, Le volume d’eau libre partiel et le volume d’eau
parenchymale en excès partiel. La somme de ces quatre volumes partiels est de 100 %
pour chaque voxel d’acquisition. Un algorithme est utilisé afin de déterminer la distri-
bution optimale des quatre volumes partiels, afin d’obtenir les valeurs de R1, R2 et PD
mesurées pour chaque voxel des cartes paramétriques. Le volume partiel MyC présente
des temps de relaxation R1 et R2 élevés et une PD faible. Cet algorithme obtiendra
une plus forte contribution de MyC dans la WM que dans la GM, puisque les temps
de relaxation dans la WM sont supérieurs à ceux de la GM, tandis que la PD est plus
faible dans la WM que dans la GM. Seul le compartiment incluant MyC peut être
affiché dans SyMRI. Vous trouverez de plus amples détails concernant le modèle de dé-
termination de MyC dans le journal en open source téléchargeable gratuitement depuis
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fneur.2016.00016/full.
Rem. : Il existe une corrélation élevée entre les valeurs de MyC et la densité optique
d’un spécimen coloré par bleu Luxol rapide. Étant donné que le MyC représente l’effet
magnétique total de la myéline de R1, R2 et PD pour les tissus environnants, il n’est
pas validé si les volumes partiels de MyC et de la myéline réelle sont identiques.
MISE EN GARDE : Des modifications pathologiques des tissus cérébraux

impliquant une importante déviation de R1, R2 et PD par rapport à ceux
identifiés dans un parenchyme cérébral non pathologique, peuvent affecter
la segmentation de MyC. Une telle modification peut être, par exemple, un
œdème sévère avec lequel le temps de relaxation approche celui d’un CSF
pur.

5.3 Cartes de segmentation

Les cartes de segmentation sont utilisées pour afficher le contenu des tissus dans chaque
voxel de l’ICV. Par défaut, les cartes de segmentation sont affichées en superposition
(calques), sous la forme d’images en couleur apparaissant au-dessus des images pondérées
en contraste. Les images pondérées en contraste jouent alors le rôle de cadre de référence,
tandis que le calque en couleur affiche le contenu des tissus. Les calques présentent des
couleurs différentes en fonction du tissu qu’ils représentent. La Fig. 5.3 présente quatre
cartes de segmentation, affichées en superposition (calques) au-dessus d’images pondérées
en contraste.
Pour WM/GM/CSF, les cartes tissulaires modélisent le volume partiel de tissus sains
d’adultes, ce qui signifie que leur saturation est de 100 % pour les tissus correspondant à
une WM/GM/CSF pure et que les modifications (non pathologiques) dans, par exemple,
la myélinisation dans la substance blanche pure ne sont pas affichées dans la mesure où
elles sont modélisées à 100 % dans la carte WM.
Les cartes de segmentation (Fig. 5.3) sont affichées sur un arrière-plan qui peut être une
image pondérée en contraste ou un fond noir uni. Si la carte de segmentation s’affiche
sur fond noir, la barre de couleurs s’affiche dans l’angle supérieur droit de la zone.
Fig. 5.3 : Cartes de segmentation sur arrière-plan T2W.
5.3.1 Affichage des cartes de segmentation

L’activation des cartes de segmentation se fait par le biais du menu Clic droit ou du
raccourci clavier correspondant.
Disposition segmentation « Ctrl+S » Affichage de la configuration de segmentation

par défaut, qui se compose de 5 zones : WM, GM, CSF, NON-WM/GM/CSF et Table

de segmentation.
Clic droit › Matière blanche « 7 » La carte de segmentation de la WM s’affiche sous
forme de calque.
Clic droit › Matière grise « 8 »La carte de segmentation de la GM s’affiche sous forme
de calque.
Clic droit › Liquide céphalo-rachidien « 9 » La carte de segmentation du CSF s’affiche
sous forme de calque.
Clic droit › NON-WM/GM/CSF « 0 » La carte de segmentation des tissus ne corres-
pondant pas aux définitions de la WM, de la GM ou CSF s’affiche sous forme de calque.
Clic droit › Myéline (MyC) « Y » La carte de segmentation du MyC s’affiche sous forme
de calque.
Lorsqu’une carte de segmentation est visible, le volume total du tissu segmenté dans la
tranche active apparaît en haut de la zone.
Quand une ROI est active dans un calque de segmentation, le volume au sein de la ROI
s’affiche dans l’angle supérieur droit de la zone. Pour plus d’information, voir la section
5.6.
Il est également possible de désactiver l’affichage des bords du masque intra-crânien au
moyen de l’option de menu Montrer Bords Masque Intra-crânien ou du raccourci clavier
« H ».
5.3.2 Segmentation – Images d’arrière-plan

Pour voir la corrélation de la couleur des cartes de segmentation avec le contenu des
tissus, l’arrière-plan doit être désactivé. Ensuite, une barre de couleurs s’affiche dans le
coin supérieur droit de la zone affichant l’échelle colorimétrique.
Pour afficher les cartes de segmentation sur une échelle linéaire allant du noir au blanc,
pour laquelle le blanc correspond à 100 % et le noir à 0 % du contenu tissulaire, la
couleur peut être désactivée. La couleur ne peut être désactivée qu’après la désactivation
de l’arrière-plan.
Clic droit › Désactiver arrière-plan « Ctrl+B » Un fond noir s’affiche. La barre de cou-
leurs de la carte de segmentation s’affiche dans l’angle supérieur droit. (Fig. 5.4)
Si l’arrière-plan est désactivé, les couleurs peuvent être désactivées pour le calque.
Clic droit › Paramètres de l’image › Couleur « C » Désactivation de la couleur

Fig. 5.4 : Lorsque l’arrière-plan est désactivé, une barre de couleurs s’affiche.
Celle-ci indique la représentation colorimétrique du contenu tissulaire.

5.4 Masque utilisateur pour segmentation définie par

l’utilisateur
Le masque utilisateur permet à ce dernier de marquer les parties sélectionnées de la pile
d’images et de les ajouter à un masque utilisateur. Le masque utilisateur peut inclure
des tissus à l’intérieur comme à l’extérieur du masque intracrânien. Ce masque peut être
utilisé pour segmenter le volume de tissus, lésions et éléments anatomiques spécifiques.
Le masque utilisateur s’affiche automatiquement au démarrage de SyMRI NEURO si le
groupe de données comprend un masque utilisateur enregistré précédemment.
5.4.1 Affichage du masque utilisateur

L’activation du masque utilisateur se fait dans le menu contextuel (clic droit).
Clic droit › Montrer masque utilisateur « U » Le masque utilisateur s’affiche dans la

zone sous forme de calque.
5.4.2 Mesure du volume à l’aide du masque utilisateur

La fonction principale du masque utilisateur est de mesurer le volume de certaines régions
définies par l’utilisateur. Ce volume est calculé sur la base du volume des voxels, y compris
l’espace entre les tranches. Le volume du masque utilisateur peut inclure tout ou partie
de chaque voxel. Le volume du masque utilisateur de la tranche active s’affiche en haut
de la ou des zones dans lesquelles le masque utilisateur apparaît.
Un volume partiel peut être ajouté au masque utilisateur en copiant sur le masque
utilisateur le contenu tissulaire partiel à partir d’une carte de segmentation (voir 5.4.3).
Le volume partiel du tissu segmenté est ensuite ajouté au volume du masque utilisateur.
Par exemple, si le volume partiel d’un tissu dans un voxel est de 25 %, seul 25 % volume
du voxel est ajouté au volume du masque utilisateur.
Le masque utilisateur inclut uniquement la partie du volume du voxel partiellement
transparente. Une plus grande transparence correspond à un volume partiel plus faible.
Les options de couleurs et d’arrière-plan sont identiques à celles des cartes de segmen-
tation. Voir Section 5.3.2.
5.4.3 Création et mise au point d’un masque utilisateur

La création d’un masque utilisateur se fait par l’ajout ou la suppression de zones d’ac-
quisition. Il s’agit ici d’ajouter ou de retirer des régions indiquées par une ROI, d’ajouter
du tissu segmenté indiqué par une ROI, ou de copier des tranches complètes à partir
d’une carte de segmentation.
5.4.3.1 Modification d’un masque utilisateur à l’aide d’une ROI

Lors de l’utilisation d’une ROI pour éditer le masque utilisateur, des zones et des tissus
peuvent être ajoutés ou supprimés du masque via le menu ROI Clic droit. Commencez
par définir une ROI autour de la zone à modifier.
ROI Clic droit › Aj. au masq utilis. Tous les voxels de la ROI sont ajoutés au masque
utilisateur. Le volume total de chaque voxel est inclus dans le volume du masque utili-
sateur.

ROI Clic droit › Retirer du masque utilisateur Retire tous les voxels de la ROI du
masque utilisateur. La contribution de ces voxels en terme de volume est retirée du
masque utilisateur.
Il est également possible de copier des tissus à partir d’une carte de segmentation.
ROI Clic droit › Copier tissu de ROI dans masque util. - Mise à l’éch. Tous les voxels
incluant plus de 1 % du tissu dans la carte de segmentation sont ajoutés au masque utili-
sateur. Le volume total de chaque voxel est inclus dans le volume du masque utilisateur.
ROI Clic droit › Copier tissu de ROI dans masque util. - Volume partiel Les volumes
partiels sont copiés dans le maque utilisateur.
Fig. 5.5 : Copie avec volume partiel à l’aide d’une ROI avec calque de segmentation
5.4.3.2 Autres ajustements du masque utilisateur

Il est possible d’ajouter tous les tissus segmentés, dans une ou plusieurs couches, en une
seule fois dans le masque utilisateur. Cette option apparaît dans le menu contextuel (clic
droit) lorsqu’une carte de segmentation est visible.

Fig. 5.6 : Des coupes complètes de tissu segmenté peuvent être collées dans le
masque utilisateur.
Clic droit › Copier tissu dans masque util. Copie dans le masque utilisateur tous les
tissus dans une carte visible, dans une certaine plage de coupes. Une boite de dialogue
s’affiche, vous demandant de sélectionner la plage de coupes (Fig. 5.6). Par défaut, le
volume tissulaire partiel est ajouté. Cochez la case « Mettre à l’éch. volume partiel à
100% » afin d’inclure le volume total de tous les voxels incluant plus de 1 % du volume
tissulaire partiel.
Modifier › Effacer masque util. Tous les voxels sont retirés du masque utilisateur et
celui-ci est remis à zéro.
5.4.4 Enregistrement et chargement du masque utilisateur

Il est possible d’enregistrer le masque utilisateur et de charger un masque précédemment
enregistré.
Fichier › Enregistrer masque util. Le masque utilisateur est enregistré. Une boite de
dialogue s’affiche, vous demandant de nommer le masque utilisateur. Il est possible d’en-
registrer plusieurs masques sous des noms différents. La prochaine fois que ce groupe de
données sera chargé dans SyMRI NEURO, la liste de tous les masques utilisateurs en-
registrés dans le fichier DICOMDIR s’affichera. Si aucun autre masque utilisateur n’est
sélectionné, ou si un seul masque a été enregistré, le dernier masque utilisateur enregistré
sera utilisé.
L’information est enregistrée dans un fichier objet DICOM d’affichage sous forme
StandAlone
de série distincte, dans le dossier à partir duquel le groupe de données a été chargé.
L’information est enregistrée dans PACS dans un objet DICOM d’affichage sous
forme de série distincte, dans le dossier d’examen à partir duquel le groupe de Plug-In
données a été chargé.
Les informations sont enregistrées dans un objet DICOM Affichage (Presentation

State) dans le PACS configuré via le réseau sous forme d’une nouvelle série dans le Network
dossier d’examen à partir duquel le groupe de données a été chargé.
Fichier › Charger masque util. Chargement du masque utilisateur enregistré en dernier.

Toutes modifications récentes sont remplacées par le masque enregistré en dernier. Le
masque utilisateur enregistré en dernier pour un groupe de données est chargé automa-
tiquement au démarrage de SyMRI NEURO.

5.5 Table de segmentation

La table de segmentation fournit des informations volumétriques sur tous les types de
tissus automatiquement segmentés dans SyMRI NEURO, ainsi que sur le masque uti-
lisateur. Le total des volumes pour le cerveau complet est toujours affiché, et la table
peut être développée afin d’afficher les volumes tissulaires par tranche.
Fig. 5.7 : La table de segmentation affiche les volumes calculés de WM, GM,
CSF, NON-WM/GM/CSF et de MyC par coupe, ainsi que le volume total.
Clic droit › Table de segmentation « 6 » Affiche la table de segmentation dans la zone.
La table de segmentation affiche les volumes suivants :

• Somme ml : Volume de WM, GM, CSF, NON-WM/GM/CSF et MyC par coupe.
Ces informations sont masquées par défaut, mais peuvent être activées au moyen
de l’option Montrer Coupes du menu contextuel.
• % BPV : Volumes de WM, GM, NON-WM/GM/CSF etMyC sous la forme de

taux du volume du parenchyme cérébral total. Notez que les taux de WM, GM et
NON donnent 100 % tandis que le taux de MyC correspond à un taux de BPV
indépendant des autres types de tissus.
• % ICV : Volumes de WM, GM, CSF, NON-WM/GM/CSF et MyC sous la forme

de taux du volume intracrânien. Notez que les taux de WM, GM, CSF et NON
donnent 100 % tandis que le taux de MyC correspond à un taux de ICV indépen-
dant des autres types de tissus.
• Fraction du parenchyme cérébral (BPF). La BPF est la somme des volumes WM

+ GM + NON-WM/GM/CSF divisée par le volume total du masque intra-crânien
(𝐵𝑃 𝐹 = = = ).
ICV ICV ICV
Rem. : Le taux de MyC n’est pas inclus dans le calcul de BPF dans la mesure où
il est indépendant des autres types de tissus segmentant totalement le contenu du
ICV.
Le nom de l’utilisateur ayant créé le masque intra-crânien fondant les volumes de seg-
mentation s’affiche sous la table, avec l’heure et la date.
5.5.1 Affichage des volumes par tranche

La table de segmentation peut être développée afin d’afficher les volumes tissulaires pour
chaque tranche.
Table de segmentation clic droit › Montrer Coupes développe la table de segmentation

afin d’afficher les volumes tissulaires dans chaque tranche.
• Coupe Volume de WM, GM, CSF, NON-WM/GM/CSF et MyC par tranche.

5.5.2 Masque utilisateur dans la table de segmentation

Si le masque utilisateur contient au moins un voxel, une nouvelle colonne intitulée « UM »
s’affiche dans la table de segmentation. Cette colonne présente le volume dans le masque
utilisateur, de la même manière que WM, GM, CSF, etc. Le volume par tranche ainsi
que le volume total et le volume sous forme de pourcentage de ICV etBPV sont affichés.
5.5.3 Exportation de la table de segmentation

Fichier › Enregistrer la table de segmentation sous forme de texte... La table des ré-
sultats de segmentation est enregistrée localement (sur le poste de travail) sous forme de
fichier texte. Le nom du patient, l’identifiant d’examen et les versions de SyMRI utilisées
sont enregistrés dans ce fichier.
Fichier › Enregistrer la table de segmentation sous forme de rapport structuré... La

commande est identique à celle qui précède, mais la table est enregistrée en tant qu’objet
DICOM utilisant le format de rapport structuré. Pour plus de détails (techniques) sur
ce format, se reporter à la Déclaration de conformité DICOM pour SyMRI.
Table de segmentation clic droit › Copier la table de segmentation « Ctrl+C » Copie
la table de segmentation sous forme de texte et permet de la coller dans des documents,
e-mails, etc.

5.6 ROI dans SyMRI NEURO

Outre ses fonctionnalités dans SyMRI IMAGE (section 4.3), la ROI est exploitée par
trois fonctions spécifiques à SyMRI NEURO :
1. Mise au point du masque intra-crânien (section 5.1.1).
2. Mise au point du masque utilisateur (section 5.4.3).
3. Mesure du volume du tissu segmenté.
Fig. 5.8 : ROI et données s’y rapportant
5.6.1 Mesure du volume du tissu segmenté

Lorsqu’une carte de segmentation est visible, deux nouvelles lignes apparaissent dans le
texte Infos ROI.
La première ligne commence par le nom de la carte de segmentation visible, par exemple
WM ou CSF. Cette ligne indique la valeur médiane et l’écart type du volume partiel du
contenu du tissu segmenté dans la ROI, sous la forme d’un pourcentage du volume total
de la ROI.
La seconde ligne commence par Vol. et affiche le volume du tissu segmenté dans la ROI,
suivi du volume total de la ROI. Les volumes sont en millilitres (ml).
Si un masque utilisateur est visible, les informations relatives aux volumes pour le
Masque util. dans la ROI apparaîtront de la même manière dans Infos ROI. Dans le
cas où, à la fois, un masque utilisateur et un calque de segmentation sont visibles, les
informations du masque utilisateur relatives aux volumes s’affichent au-dessous des in-
formations de volume du tissu segmenté. Voir Fig. 5.8.
Notez également que la ligne affichant le Signal est supprimée lorsque les informations
relatives au volume pour un masque utilisateur ou un tissu segmenté sont affichées.

5.7 Graphiques dans SyMRI NEURO
Fig. 5.9 : Graphique ROI dans SyMRI NEURO.
Les graphiques ont la même finalité dans SyMRI NEURO que dans SyMRI IMAGE
(section 4.4), mais ils indiquent de surcroît la valeur médiane des types de tissus définis
(croix).
Graphique Clic droit › Bloc cerveau Les groupes de référence pour CSF, WM et GM
sont affichés.

Quatrième partie
Informations importantes

6 Avertissements
6 Avertissements
Lire attentivement le présent chapitre : il contient des informations importantes concer-
nant la sûreté de l’utilisation de SyMRI.
6.1 Artefacts
Les artefacts présents en imagerie RM classique peuvent l’être également en IRM syn-
thétique. La présence de ces artefacts (mouvement, bruit, repliement, etc.) peut avoir
les mêmes causes. Toutefois, leur effet sur les images peut différer, car l’échantillonnage
du signal n’est pas le même.
6.1.1 Artefacts de mouvement
Fig. 6.1 : Les mouvements du patient peuvent créer des artefacts (repliement,
ghosting). A : T2W B : FLAIR C : T2W avec cartographie NON-WM/GM/
CSF
Comme en IRM classique, les mouvements du patient nuisent à la clarté de l’acquisition

en IRM synthétique. Ils produisent des artefacts qui dégradent la qualité des images. Les
images de synthèse sont le produit de plusieurs acquisitions consécutives. Les artefacts
de mouvement peuvent donc se présenter sous une forme différente par rapport à l’IRM
classique. Les artefacts de type « ghosting » (images fantômes) sont comparables à ceux
constatés en IRM classique. Dans de nombreux cas, l’algorithme de segmentation traite
correctement l’image, à l’exception de la zone touchée par le ghosting. Les mouvements
du patient donnent des images floues, y compris sur les bords.
AVERTISSEMENT : Un changement de position du patient induit des er-

reurs au niveau des transitions entre tissus sur la cartographie R2, ainsi que
d’importantes erreurs de mesure sur la cartographie R1. Cela donne des
images pondérées en contraste inutilisables et une mauvaise segmentation.
La Fig. 6.1 concerne une victime d’AVC ayant bougé en cours d’examen.

6 Avertissements
6.2 Écarts - IRM synthétique

Les images de synthèse pondérées en contraste se veulent similaires aux images classiques.
Certains facteurs les en différencient toutefois.
6.2.1 « Sang noir »
Fig. 6.2 : Le signal du sang en mouvement est éliminé des images de synthèse.
Ainsi, sur une image synthétique T1W (à droite), les artères ne sont pas accen-
tuées après administration d’un agent de contraste, contrairement à une image
T1W classique (à gauche).
L’acquisition à des fins de quantification élimine le signal du sang en mouvement. Les

images ainsi obtenues se caractérisent par ce qu’on a nommé « sang noir ». Les artères
ne sont pas accentuées, même après administration d’un agent de contraste. Le sang
immobile (par exemple du fait d’une fuite) rehausse la valeur T1 des images de synthèse.
C’est également le cas quand de l’agent de contraste s’est accumulé dans les tissus.
AVERTISSEMENT : Il est recommandé d’effectuer l’acquisition MDME

avant l’administration d’un agent de contraste.
6.2.2 Sensibilité aux flux
Fig. 6.3 : Signal hyper-intense lié à un écoulement en jet du CSF.
En IRM synthétique comme en IRM classique, les flux peuvent produire des artefacts
nuisant au rendu. Il peut s’agir par exemple d’un ghosting important lié à une grosse
artère ou à un écoulement en jet du CSF (voir Fig. 6.3).

6 Avertissements
AVERTISSEMENT : Plus particulièrement, les artefacts de flux seront plus

prononcés sur les couches minces. Plus la couche sera mince, plus le risque
d’artefacts de flux sera élevé. Sur des images FLAIR, les flux au niveau des
artères peuvent par ailleurs donner l’impression d’un signal hyper-intense
(également appelé hyperintensité artérielle).
6.2.3 Certaines caractéristiques peuvent disparaître

Comme en IRM classique, des détails disparaissent si la résolution est insuffisante pour
la zone à examiner.
AVERTISSEMENT : En IRM synthétique, le calcul des valeurs R1, R2 et PD

repose sur un modèle considérant comme mono-exponentielle la relaxation
de chaque voxel. En d’autres termes, les petites structures ne devenant pas
l’élément dominant du voxel sont susceptibles d’être absentes des images de
synthèse.

6 Avertissements
6.3 Fonctionnalités spécifiques à l’IRM synthétique

6.3.1 Util. ROI pour tissu à suppr.
AVERTISSEMENT : dans le cas d’une zone importante présentant plusieurs

types de tissus, l’algorithme d’occultation pourrait sélectionner un TI ne
correspondant à aucun des types de tissu. Par exemple, si une grande ROI
comprend en proportions plus ou moins égales de la WM et du CSF, l’occul-
tation sera incorrecte. La Fig. 6.4 illustre ces effets. Pour un résultat optimal,
définir une ROI ne contenant que le type de tissu voulu.
Fig. 6.4 : Effets du positionnement de la ROI sur la fonctionnalité d’occulta-

tion des tissus. À noter qu’en 6.4d, le noyau caudé (nucleus caudatus) devient
visible après occultation de la substance blanche.
6.3.2 Mesures quantitatives

Les mesures quantitatives de R1 (T1), R2 (T2) et PD ont été contrôlées par le biais
d’études sur fantôme. Une série de fantômes avec différentes combinaisons de R1 et R2
ont été scannés et quantifiés avec SyMRI, et les résultats ont été comparés en inversion-
récupération pour R1 et multi-echos CPMG (Carr-Purcell-Meiboom-Gill) pour R2. Pour
PD, un fantôme différent avec des concentrations diverses d’eau lourde a été utilisé.
Une bonne corrélation a été dégagée pour tous les paramètres. L’écart médian, l’écart
type et la plage de vérification (intervalle) pour les paramètres quantitatifs et différents
fabricants et puissances de champ magnétique figurent au Tab. 6.1.
Rem. : L’utilisation de SyMRI sur des données d’entrée MDME provenant

d’appareils Siemens n’a pas encore été approuvée 510(k) par la FDA améri-
caine, c’est pourquoi il n’est pas encore disponible à la vente aux États-Unis
à moins d’être limité à un usage expérimental ou à des fins de recherche.
Tab. 6.1 : Précision de SyMRI par rapport à la norme pour les fantômes
Philips GE Siemens
Paramètre Intervalle
1.5 T 3.0 T 1.5 T 3.0 T 1.5 T 3.0 T
𝑅1 0.5 − 3.33 𝑠−1 4±7 % 9±7 % 5±7 % 7±6 % 0 ± 11 % 1 ± 11 %
𝑅2 2.5 − 25 𝑠−1 7 ± 2 % 16 ± 10 % 12 ± 13 % 16 ± 10 % 11 ± 6 % 17 ± 4 %
𝑃𝐷 20 – 100 pu 7±8 % 5 ± 11 % 2 ± 4 % −1 ± 5 %
Voir à la Fig. 6.5 des exemples de résultats des études sur fantôme.

6 Avertissements
25 120
3.5
3 100
R2_MDME (s-1) at 3T
20
R1_MDME (s-1) at 3T
PD_MDME (%) at 3T
2.5 80
15
2
60
1.5 10
40
1
5
20
0.5
0
0 0
0 5 10 15 20 25 0 20 40 60 80 100 120
0 0.5 1 1.5 2 2.5 3 3.5
R2_ME (s-1) at 3T Normal water (%) at 3T
R1_IR (s-1) at 3T
10
Difference in normal water (%) at 3T

0.5 0.5 8
0.4 0.4 6
Diff/mean in R2 (s-1) at 3T
0.3 0.3 4
0.2 0.2 2
0.1 0.1
0
0.0 0.0
-2
-0.1 -0.1
-0.2 -0.2 -4
-0.3 -0.3 -6
-0.4 -0.4 -8
-0.5 -0.5 -10
0 0.5 1 1.5 2 2.5 3 3.5 0 5 10 15 20 25 0 20 40 60 80 100 120
Mean R1 (s-1) at 3T Mean R2 (s-1) at 3T Mean normal water (%) at 3T
Fig. 6.5 : SyMRI mesures quantitatives par rapport à la norme pour les fan-
tômes prises sur GE Discovery MR750 3 T.
6.3.2.1 Plage dynamique

La plage dynamique des mesures concernant les paramètres quantitatifs des tissus figure
au tableau 6.2.
AVERTISSEMENT : Les valeurs hors plage dynamique sont éliminées.
Tab. 6.2 : Plage dynamique SyMRI.
Valeur Unité Min Max

T1 ms 250 4 300
R1 𝑠−1 0.23 4
T2 ms 10 2 000
R2 𝑠−1 0.5 100
PD pu 0 160
6.3.3 Segmentation
Dans SyMRI, la segmentation repose sur des groupes prédéfinis : substance blanche
(WM), matière grise (GM) et liquide céphalo-rachidien (CSF). À noter que des tissus
pathologiques peuvent présenter des valeurs correspondant à l’une des définitions d’un
tissu sain. Inversement, les valeurs d’un tissu sain pourraient sortir du cadre des défi-
nitions en la matière. Le volume partiel est calculé à l’aide d’un modèle de simulation
(Bloch) qui aligne les valeurs entre deux groupes de tissus sur des types de tissu partiels
estimatifs.
MISE EN GARDE : Toute comparaison absolue de différents cerveaux ou
d’images d’un même cerveau prises à différentes époques doit être faite dans
des versions comparables de SyMRI. Les présentes Instructions d’utilisation

6 Avertissements
indiquent si des changements ont été apportés par rapport à des versions
précédentes de SyMRI.
AVERTISSEMENT : Dans le cas d’un voxel présentant des tissus connus

ainsi que des tissus osseux, de l’air ou d’autres tissus à faible PD, la segmen-
tation pourrait le classer à tort comme voxel NON-WM/GM/CSF, et non
pas comme voxel regroupant des tissus connus et des tissus NON-WM/GM/
CSF.
AVERTISSEMENT : Si des tissus pathologiques sont présents dans un voxel,

la classification des tissus présents dans ce dernier pourrait être en partie
erronée (effets de volume partiels). Ainsi, dans le cas d’un voxel contenant
deux tissus pathologiques et un tissu connu, les premiers pourraient être
classés comme faisant partie du second.
AVERTISSEMENT : L’administration d’oxygène lors de l’IRM peut aug-

menter le temps de relaxation R2 des tissus cérébraux, nuisant à l’analyse
de la segmentation.
6.3.4 Facteurs influant sur les estimations de volume

Une vérification et une validation ont permis d’évaluer la reproductibilité des mesures de
volume. Ces mesures reposent sur des définitions de tissus établies au préalable. Aucune
comparaison n’a été faite avec la substance blanche, la matière grise ou le liquide céphalo-
rachidien.
6.3.4.1 Précision
Concernant les estimations de volume faites dans SyMRI, le volume de chaque voxel
est le produit de sa superficie de base et de l’espace inter-coupe (qui inclut la distance)
inter-coupe. L’espace inter-coupe a été préféré à l’épaisseur de la coupe de façon à rendre
compte du volume cérébral total. La Fig. 6.6 illustre le lien entre l’espace, l’épaisseur et
la distance.
MISE EN GARDE : SyMRI estime le contenu tissulaire dans l’espace inter-
coupe, par rapport aux deux coupes adjacentes. L’espace inter-coupe (Fig.
6.6) doit être faible pour éviter une imprécision excessive des mesures.

6 Avertissements
Espace inter-coupe =
Distance inter-coupe +
Épaisseur de coupe
Fig. 6.6 : Illustration des relations entre Espace inter-coupe, Distance inter-
coupe et Épaisseur de coupe.
6.3.4.2 Reproductibilité
Pour valider la reproductibilité de la méthode de segmentation, des mesures in vivo ont
été effectuées chez 7 sujets en bonne santé (âgés de 32 à 48 ans) à l’aide des appareils
suivants : GE 450W 1.5 T, GE 750 3 T, Philips Achieva 1.5 T, Philips Ingenia 3 T, Sie-
mens Aera 1.5 T et Siemens Prisma 3 T. Chaque sujet a fait l’objet de deux acquisitions
sur chaque appareil, le sujet sortant de l’appareil entre les deux acquisitions. Certains
sujets n’ont pas été scannés avec des scanners Siemens.
La répétabilité des volumes de tissu cérébral en tant que pourcentage du volume in-
tracrânien et la répétabilité de la BPF sont consultables sous Tab. 6.3. La répétabilité
mentionnée dans le rapport est dans les limites de l’écart standard par sujet, de sorte
que le coefficient de répétabilité peut être obtenu en multipliant les valeurs par 2,77.
Rem. : L’utilisation de SyMRI sur des données d’entrée MDME provenant d’appareils
Siemens n’a pas encore été approuvée 510(k) par la FDA américaine, c’est pourquoi il
n’est pas encore disponible à la vente aux États-Unis à moins d’être limité à un usage
expérimental ou à des fins de recherche.
Tab. 6.3 : Reproductibilité pour SyMRI.

GE 450W 1.5 T 0.38 % 0.42 % 0.14 % 0.10 % 0.12 % 0.14 %
GE 750 3 T 0.62 % 0.58 % 0.15 % 0.15 % 0.21 % 0.15 %
Siemens Aera 1.5 T 0.45 % 0.50 % 0.11 % 0.13 % 0.13 % 0.11 %
Siemens Prisma 3 T 0.39 % 0.32 % 0.10 % 0.06 % 0.14 % 0.10 %
MISE EN GARDE : Pour acquérir des mesures volumétriques comparables,

il est important d’utiliser la même version du logiciel SyMRI pour tous les
examens. Les mesures volumétriques réalisées avec différentes versions de
SyMRI peuvent diverger en raison de modifications apportées au logiciel.

6 Avertissements
Ne comparez que les groupes de données quantifiés et segmentés dans la

même version de SyMRI.
MISE EN GARDE : Les SyMaps provenant du même groupe de données

mais générées à partir de versions différentes de SyMRI, ne sont pas iden-
tiques. La segmentation est réalisée à partir de la combinaison de R1, R2
et PD dans chaque voxel. Ainsi, toute différence dans SyMaps peut affecter
la segmentation et les mesures de volume. En bref, l’utilisation de SyMaps
générées par des versions différentes de SyMRI peut avoir pour résultat des
volumes différents, même si elles ont été réalisées à partir des mêmes don-
nées d’acquisition MDME et même si elles sont téléchargées dans la même
version de SyMRI.

6 Avertissements
6.4 Avertissements complémentaires

6.4.1 Exigences système
AVERTISSEMENT : L’utilisation du logiciel SyMRI doit se faire dans le

respect des exigences système. Tout écart par rapport à ces dernières peut
provoquer un dysfonctionnement allant du plus minime à une impossibilité
de chargement de groupes de données par SyMRI. Toute tentative de char-
gement de données non générées conformément aux exigences système viole
les règles d’utilisation de SyMRI.
6.4.1.1 Espace inter-coupe

L’espace inter-coupe affecte la quantification de R2 (T2) et les évaluations de volume
dans la segmentation. L’espace inter-coupe recommandé est de 25 % de l’épaisseur de
la tranche. Ces espace est recommandé car il représente un bon compromis entre la
diaphonie et l’erreur d’estimation du volume.
MISE EN GARDE : L’espace inter-coupe doit être au moins égal à 10 %
de l’épaisseur de la tranche afin d’éviter la diaphonie entre les tranches. La
diaphonie affecte la quantification de R2 (T2) et une surestimation de R2,
ce qui entraîne une surestimation du contenu de la MyC.
Si l’espace inter-coupe est important, l’erreur d’estimation des volumes tissulaires dans
cet espace est susceptible d’augmenter. Voir Section 6.3.4.1.
6.4.1.2 Épaisseur des tranches

L’épaisseur des tranches affecte la quantification, la résolution des détails et le risque
d’artefacts de flux. L’épaisseur recommandée représente un bon compromis entre la
diaphonie et les artefacts de flux.
Si les couches sont minces, la probabilité d’artefacts de flux augmente. Pour de plus
amples informations, voir Section 6.2.2.
Si les tranches sont épaisses, la quantification sera affecté par les effets de volume partiel.
Pour de plus amples informations, voir Section 6.2.3.

6 Avertissements
6.4.2 Suivi des examens à l’aide de différents outils d’analyse
AVERTISSEMENT : Des outils d’analyses différents utilisent des modèles

et méthodes d’estimation du volume, notamment des définitions des tissus,
différents. Il s’ensuit des différences systématiques entre les outils. La
comparaison de volumes obtenus avec SyMRI à d’autres outils d’analyse
lors des examens de suivi peut entraîner une interprétation et/ou des
conclusions erronées. La comparaison des volumes de segmentation obtenus,
par exemple, avec NeuroQuant, sur la base d’une acquisition T1W 3D, avec
les volumes obtenus avec SyMRI à partir d’une acquisition 2D MDME
peut montrer une divergence entre les volumes due à diverses raisons.
En particulier, la définition des tissus est différente dans NeuroQuant et
dans SyMRI. Par exemple, SyMRI utilise les volumes partiels tandis que
NeuroQuant affecte un type de tissu à chaque voxel.
En général, il convient d’éviter de comparer les données des différents outils
d’analyse, sauf si la validité de la comparaison des différents outils d’analyse
peut être justifiée.
SyntheticMR AB recommande fortement de toujours utiliser le même

outil d’analyse pour s’assurer que les données des examens de contrôle
peuvent être comparés, et d’effectuer les comparaisons en appliquant les
bonne pratiques et le protocole clinique approprié pour le suivi.
Rem. : SyMRI peut seulement analyser les volumes de tissus sur les données provenant
de séquences approuvées pour être utilisées avec SyMRI. Pour obtenir une liste des
séquences approuvées avec les paramètres de séquence recommandés, consulter le FORM
75-10 System Requirement List.
6.4.3 Codage des caractères
AVERTISSEMENT : Si un groupe de données est téléchargé avec des carac-

tères non latins pour des informations textuelles affichées dans l’ATH dans
SyMRI, ces informations ne s’afficheront pas correctement. Pour de plus
amples informations concernant les informations textuelles pouvant être af-
fichées dans l’ATH, reportez-vous à Section 3.2.1.1.
6.4.4 Logiciel de protection de l’anonymat
AVERTISSEMENT : SyMRI utilise certaines étiquettes DICOM privées

pour pouvoir charger des ensembles de données (voir la déclaration de confor-
mité DICOM). Si un logiciel de protection de l’anonymat est utilisé, vérifiez
que ces étiquettes sont conservées.

6 Avertissements
6.5 Mises en garde spécifiques aux scanners

6.5.1 GE
Les mises en garde suivantes ne concernent que les applications sur des IRM GE.
6.5.1.1 Anonymization
MISE EN GARDE : GE utilise des étiquettes privées DICOM pour enre-

gistrer quelques paramètres d’acquisition requis par SyMRI. Il utilise des
outils d’anonymisation fournis par GE afin de protéger l’anonymat de ces
étiquettes. Les groupes de données ne comportant pas d’étiquette ne peuvent
pas être ouverts par SyMRI.
Les étiquettes obligatoires avec SyMRI sont présentées dans la déclaration de conformité
DICOM. Si l’outil d’anonymisation utilisé n’est pas fourni par GE, veuillez confirmer
que les étiquettes requises sont conservées.
6.5.2 Philips
Les mises en gardes suivantes concernent uniquement l’utilisation des appareils d’IRM
Philips.
6.5.2.1 Modules multiples

Attention : compte tenu des FORM 75-10 System Requirement List, l’appareil d’IRM
ne doit pas générer de modules multiples.
Sur les IRM Philips avec la version 4.x.y du logiciel Philips (uniquement disponible pour
3T) ou 5.1.x (disponible pour 1.5T et 3T), la console de l’IRM indique que l’appareil va
générer des modules multiples, mais n’enregistre pas cette information dans les objets
DICOM ; en d’autres termes, le logiciel de post-traitement, tel que SyMRI, ne peut pas
détecter si l’IRM a ou non produit des modules multiples au terme de l’acquisition.
Il incombe donc à l’utilisateur de l’IRM de veiller à ce que l’appareil indique qu’il ne
générera pas de modules multiples.
Avec la version 5.2.x du logiciel Philips, les modules multiples créeront un conflit dans
la carte d’examen et l’IRM ne pourra pas être démarré.
AVERTISSEMENT : Le chargement de données de modules multiples pour-

rait déboucher sur des résultats imprévisibles mais pouvant sembler corrects.
6.5.2.2 Ordre des coupes
MISE EN GARDE : Sur les scanners IRM Philips équipés du logiciel Phi-
lips version 4.x.y (uniquement pour 3T) ou 5.1.x (pour 1.5T et 3T), veillez
à ce que l’ordre des coupes sur la carte d’examen soit paramétré sur Ascen-
ding/croissant ou Descending/décroissant et pas sur Default/par défaut ou
Interleaved/imbriqué.
Sinon, la quantification de T1 oscillerait d’une coupe à l’autre, comme on le voit en
sélectionnant une grande ROI et en faisant défiler les coupes. La courbe des tissus cé-
rébraux normaux dans un graphique R1-R2 bascule alors vers la droite/gauche presque

6 Avertissements
une coupe sur deux. Avec la version 5.2.x du logiciel Philips, les options d’ordre des
coupes Default/par défaut et Interleaved/imbriqué ont été supprimées.
6.5.3 Siemens
Les mises en garde suivantes ne concernent que les applications sur des IRM Siemens.
Rem. : L’utilisation de SyMRI sur des données d’entrées MDME provenant

d’IRM Siemens n’est pas encore approuvée dans le cadre de la procédure
510(k) de la FDA des États-Unis, et elle n’est dont pas encore commercialisée
aux États-Unis, sauf pour les activités de recherche et d’analyse.
6.5.3.1 Installation du patient
MISE EN GARDE : Installez toujours le patient de manière à ce que l’image

anatomique se trouve à l’isocentre de l’IRM. Si le patient est mal positionné,
le champ B-1 sera sous-optimal et la quantification peut ne pas se dérouler
correctement.
Les conditions d’imagerie sont optimales au centre de la bobine de l’IRM, l’isocentre
du champ magnétique. L’utilisation du laser pour positionner correctement le patient
permettra une quantification optimale, et de fait, une qualité optimale des images de
synthèse.

Cinquième partie
Annexe

7 Raccourcis clavier
La liste de tous les raccourcis clavier existants et de leur fonction est disponible dans
SyMRI.
Les touches de raccourci sur macOS sont différentes de celles de Windows :
macOS • au lieu de Ctrl.
• F13 au lieu d’Insert.
Raccourci clavier Fonction

1 T1W
2 T2W
3 T2W FLAIR
4 STIR
5 PSIR
Page précédente Coupe précédente

Flèche Coupe précédente1
Page suivante Coupe suivante
Flèche descendante Coupe suivante1
Début Go Première coupe
Fin Dernière coupe
Ctrl+R Disposition contraste

Ctrl+F Disposition de SyMaps
A Échelle autom.
C Couleur
Ctrl+Z Zoom avant
Ctrl+Shift+Z Zoom arrière
Ctrl+P Interpoler
Ctrl+X Couper ROI

Ctrl+C Copier ROI
Ctrl+V Coller ROI
Backspace Désactiver ROI
Tab Activer suivante ROI2
2
Shift+Tab Activer précédente ROI
Ctrl+1 1 sous-fenêtre
Ctrl+2 2 sous-fenêtres
1. Ce raccourci est indisponible dans SyMRI Plug-In car il est utilisé par le fenêtre hôte Sectra PACS
IDS7.
2. Pour Multiple ROI

F4 Outil Défil.
F5 Outil Pan.1
P Outil Pan.
F6 ROI main libre
F7 ROI rectangulaire
Z Outil Zoom
Q Ajuster TE
W Ajuster TR
E Ajuster TR/TE
R Ajuster TI
T Ajuster TI-TI3
Ctrl+I Pré-impulsion d’inversion
Ctrl+O Ouvrir...
Ctrl+Shift+S Enregistrer toutes visibles dans dossier local...
Outil Pan. s’obtient également en maintenant pressée la touche « Shift ». Outil Zoom
s’obtient également en maintenant pressée la touche « Ctrl ».
« S » et « F » utilisées en combinaison avec Ajuster TR, Ajuster TI ou Ajuster TI-TI
permettent de diminuer ou augmenter la vitesse de changement des paramètres temporels
quand on déplace le curseur. Ces données peuvent être utilisées pour faire défiler les
coupes plus rapidement et lors de l’ajustement de la fenêtre.
Lorsque la fonction Masque util. est disponible, les raccourcis clavier suivants peuvent
être utilisés.
U Montrer masque utilisateur
Ctrl+B Désactiver arrière-plan
Avec SyMRI NEURO, les raccourcis clavier suivants sont également disponibles.

Ctrl+S Disposition segmentation
6 Table de segmentation
7 Matière blanche
8 Matière grise
9 Liquide céphalo-rachidien
0 NON-WM/GM/CSF
Y Myéline (MyC)
I Masque intracrânien
H Montrer Bords Masque Intra-crânien
Ctrl+B Désactiver arrière-plan
Insérer Ajouter au masque intracrânien

Supprimer Retirer du masque intracrânien
M Aj. au masq utilis.
3. Licence sDIR requise.

Virgule (,) Copier tissu de ROI dans masque util. - Mise à l’éch.
Point (.) Copier tissu de ROI dans masque util. - Volume partiel
Moins (-) Retirer du masque utilisateur
Ctrl+C Copier la table de segmentation

®
SyMRI® 11
SyMRI
Version 11.0.7
SyntheticMR AB
Storgatan 11
UDI : (01)07340024700030(8012)11.0.7 SE-582 23 Linköping, SWEDEN
2018-08-30 www.syntheticmr.com
®
SyMRI
SyntheticMR AB
2018-08-30
Benutzerhandbuch
Version 11.0.7
UDI: (01)07340024700030(8012)11.0.7
SyMRI 11
Geltende Vorschriften
Diese Abschnitte enthalten wichtige Informationen zur behördlichen Genehmigung und
Verwendung von SyMRI. Es ist zu beachten, dass SyMRI als ein medizinisches Produkt
(MD) eingestuft wird und es deshalb Vorschriften unterliegt, die für klinische und nicht-
klinische Anwendungen gelten.
Beispielsweise gilt die Medizinprodukterichtlinie (MDD) der Europäischen Union.
SyMRI darf nur verwendet werden, wenn dies rechtlich genehmigt ist. Bei den lokalen
Behörden und SyntheticMR AB kann geprüft werden, ob diese Version des SyMRI durch
Sie und in Ihrem Bereich legal verwendet werden darf.
WARNUNG: Wenn der rechtliche Bereich, der auf Sie zutrifft, in diesem
Abschnitt nicht aufgeführt ist, darf SyMRI ausschließlich zum Zweck der
Vorführung oder Untersuchung als nicht-medizinisches Produkt verwendet
werden und darf nicht verwendet werden, um Diagnosen zu stellen bzw.
jegliche andere Zwecke der Patientenverwaltung.
Die Markierung „Es gelten Bestimmungen zu Medizinprodukten (Seite i)“ auf jeder Seite
dieser Anleitung ist ein Bezug auf diesen Abschnitt für weitere Informationen.
Zertifizierter Einsatz
SyMRI erfüllt die folgenden gesetzlichen Anforderungen. Die Verwendung unterliegt ört-
lichen Gesetzen und den Bedingungen der Vorschriften. Zusätzliche Einschränkungen,
Bedingungen und Vorschriften könnten zutreffen.
• CE (Europäische Union):
SyMRI 11 ist ein CE-zertifiziertes medizinisches Produkt, das die Richtlinie des
Rates 93/42/EWG (Richtlinie für Medizinprodukte) erfüllt.
0413
• USA/HSS (FDA):
ACHTUNG: Die Bundesgesetze der Vereinigten Staaten beschränken

den Verkauf dieses Geräts auf Bestellungen durch oder im Namen von
Ärzten
• Australien (Therapeutic Goods Administration, TGA):

Für den australischen Markt ist der gesetzliche Sponsor:
65 Epping Road
Nicht für klinischen Gebrauch (NFCU)

In diesem Abschnitt werden Bereiche aufgeführt, in welchen SyMRI mit bestimmten
Einschränkungen in einer nicht-klinischen Umgebung verwendet werden darf (NFCU, aus
dem Englischen „Not For Clinical Use“). Für Bereiche, in welchen NFCU-Verwendung
SyMRI® Es gelten Bestimmungen zu Medizinprodukten (Seite i) i

zutreffen könnte, ist auf den zutreffenden Warntext zu achten, sowie auf alle zusätzlichen
Einschränkungen, Bedingungen oder Vorschriften, die zutreffen könnten.
• Kanada und Länder, in welchen die Vorschriften von Health Canada gelten:

pétents
SyMRI® Es gelten Bestimmungen zu Medizinprodukten (Seite i) ii

Inhaltsverzeichnis
Inhaltsverzeichnis
Geltende Vorschriften . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . i
Zertifizierter Einsatz . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . i
Nicht für klinischen Gebrauch (NFCU) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . i
1 Einleitung 1
1.1 Gerätebeschreibung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1
1.2 Vorgesehener Einsatz . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2
1.2.1 Hinweise zur Bedienung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2
1.3 Die Vorteile von SyMRI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3
1.4 Abkürzungen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4
1.5 Signalwörter Warnung, Achtung und Hinweis . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
1.5.1 Hinweis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
1.5.2 ACHTUNG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
1.5.3 WARNUNG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
I Mit SyMRI®arbeiten 7
2 Einsatz von SyMRI 8

2.1 SyMRI für Sectra PACS IDS7 (Plug-In) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
2.1.1 Starten und verlassen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
2.1.1.1 SyMRI starten . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
2.1.1.2 SyMRI schließen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
2.2 SyMRI StandAlone für Microsoft Windows . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
2.2.1.1 SyMRI starten . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
2.2.1.2 SyMRI schließen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
2.3 SyMRI StandAlone für macOS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
2.3.1.1 SyMRI starten . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
2.3.1.2 SyMRI schließen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
2.3.2 Tastenkombinationen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
2.4 SyMRI für das Netzwerk . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12
2.4.1.1 SyMRI starten . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12
2.4.1.2 SyMRI schließen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12
3 Konzepte und Funktionen 13

3.1 Konzepte . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13
3.1.1 Paket . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13
3.1.1.1 SyMRI IMAGE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13
3.1.1.2 SyMRI NEURO . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13
3.2 Arbeitsbereich . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14
3.2.1 Darstellungsfeld . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14
3.2.1.1 Bildinformationen im Darstellungsfeld . . . . . . . . . . . . . 15
3.3 Symbolleiste . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17
SyMRI® Es gelten Bestimmungen zu Medizinprodukten (Seite i) iii

Inhaltsverzeichnis
3.4 Optionen und Einstellungen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18

3.4.1 Layout-Optionen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18
3.4.2 Ansichtsoptionen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18
3.4.3 Sonstiges . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19
3.5 Bilder ansehen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
3.5.1 Zoom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
3.5.2 Navigieren . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
3.5.3 Fensterung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
II SyMRI® IMAGE 21
4 Funktionen in SyMRI IMAGE 22

4.1 Synthetische kontrastgewichtete Bilder . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23
4.1.1 Anzeige synthetischer kontrastgewichteter Bilder . . . . . . . . . . . . 23
4.1.2 Anpassung des Bildkontrasts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24
4.1.3 Anpassen von FLAIR-Bildern . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25
4.1.4 Double IR-Bilder anpassen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26
4.1.5 Navigationsfenster für Kontrastbilder . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26
4.2 SyMaps . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28
4.2.1 Anzeige der SyMaps . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28
4.3 Untersuchungsbereich (ROI) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29
4.3.1 ROI erstellen und anpassen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29
4.3.2 Informationen im ROI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29
4.3.3 ROI-Einstellungen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30
4.3.4 Einen ROI entfernen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30
4.4 Plots . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32
4.5 Speichern und laden . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33
4.5.1 SyMaps speichern . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33
4.5.1.1 Zeit einsparen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
4.5.2 Screenshot des Arbeitsbereichs speichern . . . . . . . . . . . . . . . . 34
4.5.3 Bildstapel speichern . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
4.5.3.1 Diesen Stapel speichern . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35
4.5.3.2 Alle sichtbaren Stapel speichern . . . . . . . . . . . . . . . . 35
III SyMRI® NEURO 36
5 Funktionen in SyMRI NEURO 37

5.1 Die Hirnmaske . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
5.1.1 Die Hirnmaske anpassen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
5.1.2 Zusätzliche Funktionen für die Hirnmaske . . . . . . . . . . . . . . . . 39
5.2 Gewebesegmentierung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41
5.2.1 Hirnparenchym- und CSF-Segmentierung . . . . . . . . . . . . . . . . 41
5.2.2 Myelin-korrelierte (MyC) Teilvolumenabbildung . . . . . . . . . . . . . 42
5.3 Segmentierungskarten . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43
5.3.1 Segmentierungskarten anzeigen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43
5.3.2 Hintergrundbild für die Segmentierung . . . . . . . . . . . . . . . . . . 44
SyMRI® Es gelten Bestimmungen zu Medizinprodukten (Seite i) iv

Inhaltsverzeichnis
5.4 Benutzermaske für benutzerdefinierte Segmentierung . . . . . . . . . . . . . . 46

5.4.1 Die Benutzermaske anzeigen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 46
5.4.2 Volumen mit der Benutzermaske messen . . . . . . . . . . . . . . . . . 46
5.4.3 Eine Benutzermaske erstellen und anpassen . . . . . . . . . . . . . . . 46
5.4.3.1 Die Benutzermaske mit einem ROI bearbeiten . . . . . . . . . 46
5.4.3.2 Weitere Möglichkeiten, die Benutzermaske anzupassen . . . . 47
5.4.4 Die Benutzermaske speichern und laden . . . . . . . . . . . . . . . . . 48
5.5 Segmentierungstabelle . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 49
5.5.1 Anzeige der Volumina pro Schicht . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 49
5.5.2 Benutzermaske in der Segmentierungstabelle . . . . . . . . . . . . . . 50
5.5.3 Exportieren der Segmentierungstabelle . . . . . . . . . . . . . . . . . . 50
5.6 ROI in SyMRI NEURO . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 51
5.6.1 Messen des Volumens von segmentiertem Gewebe . . . . . . . . . . . . 51
5.7 Plots in SyMRI NEURO . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 52
IV Wichtige Informationen 53
6 Warnungen 54
6.1 Bildartefakte . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54
6.1.1 Bewegungsartefakte . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54
6.2 Abweichungen – synthetisches MRT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55
6.2.1 Schwarzes Blut . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55
6.2.2 Flussempfindlichkeit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55
6.2.3 Kleine Elemente verschwinden möglicherweise . . . . . . . . . . . . . . 56
6.3 Funktionen spezifisch für synthetisches MRT . . . . . . . . . . . . . . . . . . 57
6.3.1 ROI zum Nullen von Gewebe verwenden . . . . . . . . . . . . . . . . . 57
6.3.2 Quantitative Messungen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 57
6.3.2.1 Dynamischer Bereich . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58
6.3.3 Segmentierung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58
6.3.4 Faktoren, die die Volumenberechnung beeinflussen . . . . . . . . . . . 59
6.3.4.1 Genauigkeit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59
6.3.4.2 Wiederholbarkeit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 60
6.4 Weitere Warnungen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62
6.4.1 Systemanforderungen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62
6.4.1.1 Schnittspalt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62
6.4.1.2 Schnittstärke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62
6.4.2 Nachuntersuchungen mit anderen Analyseinstrumenten . . . . . . . . . 63
6.4.3 Zeichenkodierung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63
6.4.4 Anonymisierungssoftware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63
6.5 Scanner-spezifische Warnungen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
6.5.1 GE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
6.5.1.1 Anonymization . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
6.5.2 Philips . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
6.5.2.1 Mehrere Pakete . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
6.5.2.2 Reihenfolge der Schichten . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
6.5.3 Siemens . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65
6.5.3.1 Patientenlage . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65
SyMRI® Es gelten Bestimmungen zu Medizinprodukten (Seite i) v

Inhaltsverzeichnis
V Appendix 66
7 Tastenkombinationen 67
SyMRI® Es gelten Bestimmungen zu Medizinprodukten (Seite i) vi

1 Einleitung
1 Einleitung
1.1 Gerätebeschreibung
SyMRI ermöglicht dem Nutzer, verschiedene Bildkontraste aus einem einzelnen Aufnah-
mescan zu erzeugen. Dafür wird eine Multi-Echo-Aufnahme mit Mehrfachverzögerung
(Multi-delay multi-echo – MDME) in Parameterkarten verarbeitet. Die Parameterkarten
sind R1-, R2-Relaxationsraten und Protonendichte (PD). Die inversen Relaxationspa-
rameter, T1-Relaxationszeit (1/R1) und T2-Relaxationszeit (1/R2) werden ebenfalls als
Parameterkarten zur Verfügung gestellt. Die Parameterkarten können als kontrastge-
wichtete MR-Bilder, wie z. B. T1-, T2-, PD- und IR (Inversion Recovery) (einschließlich
T1W FLAIR, T2W FLAIR, STIR, Double IR und PSIR gewichtete Bilder). SyMRI
berechnet die Pixelsignalintensität als eine Funktion von R1, R2, PD und gewünschte
MR-Scannereinstellungen, wie z.B. Echozeit (TE), Repetitionszeit (TR) und Inversions-
Verzögerung (TI). Eine Reihe von Standardeinstellungen für TE, TR und TI werden
bereitgestellt, der Benutzer kann aber den Kontrast der Bilder noch ändern. SyMRI
erzeugt alle verschiedenen Bildkontraste aus den gleichen Parameterkarten, die von der-
selben Aufnahme abgeleitet werden. Dies führt zu einer verstärkten Bildschnittregistrie-
rung aufgrund der fehlenden Patientenbewegung zwischen den Aufnahmen.SyMRI bie-
tet dem Nutzer die Möglichkeit, den Kontrast der Bilder nach der Aufnahme zu ändern.
Dies wird durch die nachträgliche Anpassung von TE-, TR- und/oder TI-Parametern
durchgeführt, um den spezifischen, gewünschten Kontrast zu erzeugen.
SyMRI ermöglicht den Nutzern auch, volumetrische Informationen in dem Kopf zu erhal-
ten, einschließlich weiße Substanz (WM), graue Substanz (GM), Zerebrospinalflüssigkeit
(CSF) Myelin-korreliertes Teilvolumen (MyC), Hirnparenchym und intrakraniale Kavi-
tät (IC). Dies wird erzielt, indem die Gewebedefinitionen basierend auf den Parameter-
karten verwendet werden. Die Gewebedefinitionen bieten das Gewebe-Teilvolumen oder
Gewebefraktion pro Voxel. SyMRI bietet auch Bildbearbeitungswerkzeuge zum Extra-
hieren der Werte der Parameterkarten und des Gewebe-Teilvolumens, pro individuellem
Pixel, pro Untersuchungsbereich oder für das gesamte Bildvolumen.
SyMRI soll an Daten verwendet werden, die durch eine der folgenden Aufnahmesequen-
zen erzeugt wurden:
• MDME-Sequenzdaten von GE MAGiC
• MDME-Sequenzdaten von Philips SyntAc
• MDME-Sequenzdaten von Siemens MDME (C2P)1
1
Durch die US FDA noch nicht nach 510(k) zugelassen und deshalb in den USA noch nicht zu kaufen,
außer für eingeschränkten Forschungs- und Untersuchungsgebrauch
SyMRI® Es gelten Bestimmungen zu Medizinprodukten (Seite i) 1

1 Einleitung
1.2 Vorgesehener Einsatz

1.2.1 Hinweise zur Bedienung
SyMRI ist ein medizinisches Gerät mit Software zur Nachbearbeitung, das für die Ver-
wendung zur Visualisierung des Gehirns vorgesehen ist. SyMRI analysiert Eingabedaten
von Magnetresonanztomographen. SyMRI verwendet Daten einer Multi-Echo-Aufnahme
mit Mehrfachverzögerung (MDME), um Parameterkarten von R1-, R2-Relaxationsraten
und Protonendichte (PD) zu erzeugen. SyMRI kann verschiedene Bildkontraste von
Parameterkarten erzeugen. SyMRI ermöglicht eine Anpassung des Kontrasts nach Auf-
nahme des Bildes. SyMRI wird für Bildgebung des Kopfes indiziert.
SyMRI ist außerdem für automatische Beschriftung, Visualisierung und volumetrische
Quantifizierung von segmentierbarem Gehirngewebe aus einem Satz mit MR-Bildern
vorgesehen. Hirngewebevolumina werden basierend auf Modellen berechnet, die aus Pa-
rameterkarten von MDME-Bildern erstellt wurden.
Bei der Interpretation durch einen geschulten Arzt können SyMRI-Bilder Informationen
bieten, die für die Feststellung der Diagnose hilfreich sein könnten. SyMRI sollte immer
in Kombination mit mindestens einer anderen, konventionellen MR-Aufnahme verwendet
werden (z.B. T2W FLAIR).

1 Einleitung
1.3 Die Vorteile von SyMRI

SyMRI verwendet nur eine einzige Aufnahme, um die R1-, R2- und PD-Werte zu er-
rechnen. Es können synthetische T1W-, T2W- und FLAIR-Bilder mit jeder beliebigen
Echozeit TE, Repetitionszeit TR und Inversionsverzögerung TI angezeigt werden, oh-
ne dass der Patient erneut gescannt werden muss. Diese Methode kann also wertvolle
Scan-Zeit bei der MR-Untersuchung einsparen.
ACHTUNG: Das synthetische T2W FLAIR zeigt einen Kantenverstärkungs-
effekt an der Schnittstelle von CSF und Hirngewebe. Dies ist das Ergebnis
von Teilvolumeneffekten auf die Aufnahmevoxel an der Schnittstelle.
Die Verwendung des synthetischen T2W FLAIR-Kontrasts hängt von der klinischen
Fragestellung ab. Der synthetische T2W FLAIR hat eine exzellente Empfindlichkeit für
Änderungen im Hirngewebe.
ACHTUNG: Wir empfehlen, dass alle Änderungen, die in T2W FLAIR sicht-
bar sind, mit T2W, PDW, PSIR oder Double IR desselben synthetischen
Datensatzes bestätigt werden.
Da alle synthetischen kontrastgewichteten Bilder von den gleichen Parameterkarten von
derselben Aufnahme erzeugt werden, werden die synthetischen Bilder registriert. Dies
bedeutet, dass ein Befund in einem T2W FLAIR in genau dem gleichen Pixel in der
anderen synthetischen Kontrastgewichtung (T2W, PDW, PSIR oder Double-IR) zur
Bestätigung oder Ablehnung als falsches Positiv erscheinen.
ACHTUNG: Für die Diagnose von Krankheiten, die zu Kantenverstärkun-
gen im T2W FLAIR führen, wie z.B. Entzündungsreaktionen oder Blutun-
gen, ist die synthetische Sequenz allein möglicherweise nicht ausreichend für
die Diagnose. In Zweifelsfällen wird der Zusatz von beispielsweise einem kon-
ventionellen 3D-FLAIR empfohlen.
WARNUNG: Entscheidungen, die das Patientenmanagement betreffen, soll-

ten nicht nur aufgrund von synthetischen gewichteten Bildern SyMRI getrof-
fen werden und sollten immer in Verbindung mit traditionellen MRT-Bildern
oder anderen entsprechenden diagnostischen Hilfsmitteln verwendet werden.
Die Funktionen der Gewebesegmentierung bietet quantitative Messungen. Dadurch kann

die objektive Beurteilung des Patienten unterstützt werden.
Dieses Benutzerhandbuch gibt einen Überblick über die verfügbaren Funktionen und
beschreibt alle Konzepte, die in der Software verwendet werden.

1 Einleitung
1.4 Abkürzungen
Die folgenden Abkürzungen werden im Benutzerhandbuch verwendet.
BPV Das Hirnparenchymvolumen; das Volumen allen Gewebes des

ICV ohne das Volumen der CSF
(aus dem Englischen Brain Parenchymal Volume)
BPF Die Hirnparenchymfraktion, das BPV geteilt durch das ICV
(aus dem Englischen Brain Parenchymal Fraction)
CSF SyMRI:s Definition von Zerebrospinalflüssigkeit (siehe Ab-
schnitt 5.2)
(aus dem Englischen Cerebrospinal Fluid)
DIR Doppel-IR, ein Inversionswiederherstellungsbild mit zweit In-
versionszeiten
(aus dem Englischen Double Inversion Recovery)
FLAIR FLuid Attenuated Inversion Recovery, ein MR-Bild, in dem
das Signal der CSF unterdrückt wird
(aus dem Englischen FLuid Attenuated Inversion Recovery)
GM SyMRI:s Definition von grauer Substanz (siehe Abschnitt 5.2)
(aus dem Englischen Gray Matter)
HUD Die Informationen, die neben einem Bild in SyMRI dargestellt
werden, wie Patienten- und Bildinformationen
(aus dem Englischen Heads-Up Display)
ICV Intrakranielles Volumen; das Gesamtvolumen der Hirnmaske
(aus dem Englischen Intra-Cranial Volume)
IR Bilder, auf welchen ein Präpuls mit Inversion angewendet wur-
de.
(aus dem Englischen Inversion Recovery)
MRT Magnetresonanztomographie
MyC SyMRI:s Gewebedefinition die mit Myelin korreliert
(aus dem Englischen Correlated)
NON-WM/GM/CSF Gewebe mit Eigenschaften, die von WM, GM und CSF abwei-
chen (siehe Abschnitt 5.2)
PD Die Protonendichte
(aus dem Englischen Proton Density)
PDW Ein Bild mit PD-gewichtetem Kontrast, typische kurze TE
und lange TR
(aus dem Englischen Proton Density Weighted)
PSIR Phase Sensitive Inversion Recovery, ein Bild mit Inversion Re-
covery, bei der das Signalzeichen nicht verschwindet
(aus dem Englischen Phase Sensitive Inversion Recovery)
R1 Die longitudinale R1 Relaxionsrate (1/T1)
R2 Die transversale R2 Relaxionsrate (1/T2)
ROI Untersuchungsbereich; ein benutzerdefinierter Bereich in einer
Schicht im Datensatz, mit einem zugeordneten ROI-Werkzeug
gezeichnet
(aus dem Englischen Region of Interest)
STIR Kurzes T1 IR-Bild, eine Fettverdrängungstechnik
(aus dem Englischen Short Tau/TI Inversion Recovery)
SyMaps Eine Karte, die einen der quantitativen Werte T1, T2, R1, R2
oder PD zeigt

1 Einleitung
T1 Die longitudinale T1 Relaxionsrate (1/R1)

T1W Ein Bild mit T1-gewichtetem Kontrast, normalerweise kurzer
TE und kurzer TR
(aus dem Englischen T1 Weighted)
T2 Die transversale T2 Relaxionszeit (1/R2)
T2W Ein Bild mit T2-gewichtetem Kontrast, normalerweise langer
TE und langer TR
(aus dem Englischen T2 Weighted)
TE Die Echozeit
TI Die Inversionsverzögerung nach einem Inversionspuls
TR Die Repetitionszeit
UM Benutzermaske, siehe Abschnitt 5.4
(aus dem Englischen User Mask)
WM SyMRI:s Definition der (markhaltigen) weißen Substanz (siehe
Abschnitt 5.2)
(aus dem Englischen White Matter)

1 Einleitung
1.5 Signalwörter Warnung, Achtung und Hinweis

1.5.1 Hinweis
Hinweise enthalten wichtige Informationen zu Funktionen in SyMRI, die hervorgeho-
ben werden müssen. Informationen, die in Hinweisen enthalten sind, sind unter anderem
hilfreiche Tipps, bestimmte Einschränkungen der Verfügbarkeit von bestimmten Funk-
tionen und ein Hervorhebeverhalten in SyMRI, das für den Benutzer möglicherweise
nicht intuitiv erscheint.
Hinweis: Beispiel für einen Hinweis
1.5.2 ACHTUNG
Das Signalwort Achtung kennzeichnet möglicherweise gefährliche Situationen für den Pa-
tienten oder Benutzer, die zu Zeitverlust oder verringerter Bildqualität führen und/oder
eine erneute Untersuchung des Patienten erforderlich machen können. Hinter dem Si-
gnalwort Achtung ist auch angegeben, wie solche Situationen vermieden werden können.
ACHTUNG: Beispiel für die Verwendung des Signalworts Achtung
1.5.3 WARNUNG
Warnungen kennzeichnen möglicherweise gefährliche Situationen, die zu Verletzungen
des Patienten führen können, vor allem in Form von Fehlinterpretation und Falschdia-
gnosen. Hinter Warnungen ist auch angegeben, wie solche Situationen vermieden werden
können.
Bei diesen Warnungen wird das Warnsymbol gemäß ISO 15223-1:2016 verwendet, um
die Bedeutung der Warnung hervorzuheben.
WARNUNG: Beispiel für eine Warnung

Teil I
Mit SyMRI®arbeiten
Es gelten Bestimmungen zu Medizinprodukten (Seite i)

2 Einsatz von SyMRI
2 Einsatz von SyMRI

SyMRI ist in verschiedenen Versionen verfügbar. Je nach System und Lizenz sind eine
oder mehrere Versionen verfügbar.
Bitte erkundigen Sie sich bei Ihrem Systemadministrator oder Vorgesetzten, welche Ver-
sionen verwendet werden können.
Die meisten Funktionen, Verhaltensweisen und Befehle der Benutzeroberfläche sind bei
allen Versionen gleich, jedoch unterscheiden sich auch einige Aspekte. Die folgenden
Kapitel in diesem Abschnitt der Gebrauchsanweisung beschreiben die Unterschiede und
einige Besonderheiten der Versionen.
An anderer Stelle der Gebrauchsanweisung finden Sie Abschnitte, die sich nur auf ei-
ne bestimmte Version beziehen. Diese Abschnitte sind mit einem Hinweis und einem
Senkrechtstrich folgendermaßen gekennzeichnet:
Dieser Absatz gilt nur für SyMRI für Sectra PACS IDS7 (Plug-In). Plug-In
Dieser Absatz gilt nur für SyMRI StandAlone. StandAlone
Dieser Absatz gilt nur für SyMRI für Microsoft Windows. Windows
Dieser Absatz gilt nur für SyMRI für macOS. macOS
Dieser Paragraf gilt nur für SyMRI für den Netzwerkmodus. Network

2 Einsatz von SyMRI
2.1 SyMRI für Sectra PACS IDS7 (Plug-In)

Wird SyMRI als Plugin in Sectra PACS IDS7 verwendet, werden die Symbolleiste und
das Menü der Anwendung in einem unverankerten Fenster mit der Symbolleiste und
nicht im Hauptfenster angezeigt. Das unverankerte Fenster kann beliebig angeordnet
werden.
Der Arbeitsplatz mit der beweglichen Symbolleiste ist in Abbildung 2.1 dargestellt.
Abbildung 2.1: Der Arbeitsbereich in SyMRI mit einer unverankerten Symbolleiste.
2.1.1 Starten und verlassen

In diesem Kapitel wird beschrieben, wie SyMRI an einem Sectra IDS7 Arbeitsplatz
gestartet werden kann.
2.1.1.1 SyMRI starten

• Starten Sie Sectra IDS7 und melden Sie sich an.
• Gewünschten Bilderstapel in einem Sectra IDS7 Bildfenster öffnen.
• „SyMRI“ im klinischen Anwendungsmenü auswählen.
• SyMRI startet und kann verwendet werden.
Kommt es zu nicht wiederherstellbaren Fehlern während des Ladens, wird SyMRI ge-
schlossen und kehrt zu Sectra PACS IDS7 zurück, nachdem ein Mitteilungsfenster mit
Informationen zu dem Fehler angezeigt wurde.
2.1.1.2 SyMRI schließen

SyMRI wird unter Verwendung des Menüpunkts Datei › Beenden SyMRI in der bewegli-
chen Symbolleiste geschlossen (siehe Abschnitt 3.3).
Schließen Sie das Sectra-Bildfenster nicht, bevor Sie SyMRI verlassen, da damit ein
unsachgemäßer Abbruch von SyMRI herbeigeführt werden kann.

2 Einsatz von SyMRI
2.2 SyMRI StandAlone für Microsoft Windows

In diesem Kapitel wird beschrieben, wie Sie SyMRI starten können.

• Starten Sie das selbstständige Programm SyMRI.
• Klicken Sie auf den Hintergrund des Hauptfensters und wählen Sie den gewünsch-
ten Datensatz aus.
Kommt es zu einem Fehler aufgrund eines Datensatzes während des Ladens, kehrt SyMRI
zum Hauptfenster zurück. Hier können Sie einen anderen Datensatz auswählen, nachdem
ein Mitteilungsfenster mit Informationen zu dem Fehler angezeigt wurde. Kann der Feh-
ler nicht behoben werden, kann SyMRI nach der Anzeige der Fehlermeldung geschlossen
werden.

SyMRI kann über die Menüoption Datei› Beenden SyMRI in der Symbolleiste (siehe Ab-
schnitt 3.3) oder durch Drücken der Schaltfläche „Schließen“ im Hauptfenster geschlossen
werden.

2 Einsatz von SyMRI
2.3 SyMRI StandAlone für macOS

In diesem Kapitel wird beschrieben, wie Sie SyMRI starten können.

• Starten Sie das selbstständige Programm SyMRI.
• Klicken Sie auf den Hintergrund des Hauptfensters und wählen Sie den gewünsch-
ten Datensatz aus.
Kommt es zu einem Fehler aufgrund eines Datensatzes während des Ladens, kehrt SyMRI
zum Hauptfenster zurück. Hier können Sie einen anderen Datensatz auswählen, nachdem
ein Mitteilungsfenster mit Informationen zu dem Fehler angezeigt wurde. Kann der Feh-
ler nicht behoben werden, kann SyMRI nach der Anzeige der Fehlermeldung geschlossen
werden.

SyMRI kann über die Menüoption SyMRI › Beenden SyMRI in der Menüleiste (siehe Ab-
werden.
2.3.2 Tastenkombinationen
Am macOS unterscheiden sich die folgenden Tastenkombinationen von Windows:
• Anstatt Strg.
• F13 anstatt Einfg.

2 Einsatz von SyMRI
2.4 SyMRI für das Netzwerk

In diesem Kapitel wird beschrieben, wie manSyMRI im Netzwerkmodus verwendet.

• SyMRI aus PACS starten.
• Abhängig davon, ob eine einzelne Serie oder eine Studie ausgewählt wurde, er-
scheint eine Liste mit Serien, die geladen werden können.
• Falls Usermasken oder Hirnmasken gespeichert sind, kann nach dem Laden der
Serie vom Netzwerk eine dieser Masken ausgewählt werden.
Kommt es zu nicht wiederherstellbaren Fehlern während des Ladens, wird SyMRI ge-
schlossen, nachdem ein Mitteilungsfenster mit Informationen zu dem Fehler angezeigt
wurde.

SyMRI kann über die Menüoption Datei› Beenden SyMRI in der Symbolleiste (siehe Ab-
werden.

3 Konzepte und Funktionen

In diesem Kapitel werden allgemeine Konzepte, Funktionen, Benutzerbefehle und Funk-
tionen beschrieben, auf die in allen Paketen innerhalb von SyMRI zugegriffen werden
kann. Die spezifischen Funktionen der einzelnen Pakete werden in den folgenden Kapiteln
erklärt.
3.1 Konzepte
3.1.1 Paket
Es gibt zwei Pakete in SyMRI, SyMRI IMAGE (Kapitel 4) und SyMRI NEURO (Kapitel
5). Je nach Ihrer Lizenz können Sie eines oder mehrere nutzen.
Wurde ein Datensatz geladen, kann das aktive Paket (wenn dies Ihre Lizenz zulässt)
über die Menüoption Einstellungen › Paket wechseln geändert werden.
3.1.1.1 SyMRI IMAGE

Das SyMRI IMAGE-Paket ist mit einer IMAGE- oder NEURO-Lizenz erhältlich. Unter
Kapitel 4 finden Sie eine Beschreibung des SyMRI IMAGE-Pakets und seiner Funktionen.
3.1.1.2 SyMRI NEURO

SyMRI NEURO ist nur mit einer NEURO-Lizenz verfügbar und wird automatisch aus-
gewählt, wenn ein Gehirndatensatz geladen und als Gehirn klassifiziert wird (der Text:
„Erkanntes Objekt: Gehirn“ erscheint auf der linken Seite des Bilds).
Wenn der Datensatz als andere Anatomie/ein anderes Objekt klassifiziert wird, wird das
SyMRI IMAGE-Paket ausgewählt. Sie können zum SyMRI NEURO wechseln, indem Sie
den Menüpunkt Einstellungen › Paket wechseln verwenden.
SyMRI NEURO enthält alle Funktionen von SyMRI IMAGE, bietet aber auch auto-
matische Gewebesegmentierung, Volumenberechnungen und BPF-Messungen. Kapitel 5
beschreibt die Einzelheiten der Funktionen des SyMRI NEURO-Pakets.

3.2 Arbeitsbereich
Das ganze Fenster von SyMRI wird Arbeitsbereich genannt. Der Arbeitsbereicha (Ab-
bildung 3.1) umfasst ein oder mehrere Darstellungsfelder mit Bildern oder Tabellen.
Der Arbeitsbereich kann vom Menü oder der Anwendung aus Symbolleiste gesteuert
werden. Sie können auch die Tastatur und die Maus verwenden.
Abbildung 3.1: Der Arbeitsbereich in SyMRI kann in fünf Darstellungsfeldern

konfiguriert werden. Die Inhalte der Symbolleiste und der Menüs hängen vom
verwendeten Paket und Ihrer Lizenz ab.
3.2.1 Darstellungsfeld
Jedes einzelne Bild oder jede einzelne Tabelle im Arbeitsbereich des SyMRI wird Darstel-
lungsfeld genannt. Jedes Darstellungsfeld kann ein Bild mit Bildinformationen anzeigen
(Abbildung 3.2), oder (wenn Ihre Lizenz dies zulässt) eine Tabelle mit Gewebevolumen.
Das Darstellungsfeld, über dem der Mauszeiger schwebt, ist immer aktiv. Der Inhalt des
Darstellungsfelds wird durch das Rechtsklickmenü gesteuert.

Abbildung 3.2: Zwei Darstellungsfelder im SyMRI-Arbeitsbereich. Wenn ein

ROI aktiv ist, werden zusätzliche Informationen auf der rechten Seite des Dar-
stellungsfelds dargestellt.
3.2.1.1 Bildinformationen im Darstellungsfeld

Die Bildinformationen im Darstellungsfeld werden auch als „HUD“ (Heads-Up Display)
bezeichnet. Die im HUD angezeigten Informationen hängen von der Art des im Darstel-
lungsfeld angezeigten Bilds ab.
Patienteninformationen: Die Patienteninformationen werden in der oberen linken Ecke
angezeigt. Sie enthalten den Namen des Patienten, die ID, Alter und Geschlecht.
Untersuchungsinformationen: Die Untersuchungsinformationen werden in der oberen
linken Ecke, unter den Patienteninformationen angezeigt. Es werden Protokollna-
me, Aufnahmedatum und -zeit und – wenn zutreffend – Informationen über das
verabreichte Kontrastmittel angezeigt.
Hinweis: Wenn angezeigte Informationen im Datensatz nicht vorhanden sind, z. B.
aufgrund von Anonymisierung, wird die Zeile, in der die entsprechenden Daten nor-
malerweise angezeigt werden, vollständig vom HUD entfernt und die folgenden Zeilen
werden nach oben verschoben, damit keine leere Zeile sichtbar ist.
WARNUNG: Informationen über das Kontrastmittel/den Bolus werden nur

angezeigt, wenn der Datensatz den DICOM-Tag enthält, der angibt, dass
ein Kontrastmittel oder Bolus für den Scan eingesetzt wurde. Wenn dieser
Tag vorhanden ist, wird eine Zeile angezeigt, die mit „Kontrast“ beginnt.
Wenn dieser Tag vorhanden ist, aber keinen Wert hat, steht in der Zeile
„Kontrast: Ja“. Wenn der Tag einen kundenspezifischen Wert hat, wird der
kundenspezifische Wert anstelle von Ja angezeigt. Wenn dieser DICOM-Tag
nicht vorhanden ist, d. h. wenn kein Kontrastmittel/Bolus verwendet wurde,
wird die Zeile für das Kontrastmittel/den Bolus nicht angezeigt.
Aufnahmegeometrie: Die Aufnahmegeometrie wird in der unteren linken Ecke des Dar-
stellungsfelds angezeigt. Sie enthält FOV, Schnittstärke, Schnittspalt, Anzahl der
Schichten und Position der aktuellen Schicht.

Zoom und Fensterung: Der aktuelle Zoom sowie der Mittelpunkt und die Breite der
Fensterung wird in der oberen rechten Ecke angezeigt.
Informationen zur Kontrastgewichtung ist nur in Darstellungsfeldern sichtbar, in welchen
ein kontrastgewichtetes Bild angezeigt wird.
Informationen zur Kontrastgewichtung: Die Kontrastgewichtung wird in der oberen
linken Ecke unter der Untersuchungsinformationen und oben im Darstellungsfeld
angezeigt. Die Informationen links enthalten Scannerparameter wie z. B. TE, TR
usw. (Abschnitt 4.1). Die aktuelle Kontrastgewichtung ist oben im Darstellungs-
fenster angegeben.
Navigationsfenster: Das Navigationsfenster erscheint unter dem Text in der oberen lin-
ken Ecke. (Abschnitt 4.1.5)
Außerdem werden einige Informationen nur angezeigt, wenn ein ROI in einem Darstel-
lungsfeld aktiv ist (Abschnitt 4.3).
ROI-Info: Statistische Informationen über den ROI erscheinen in der oberen rechten
Ecke, unter den Informationen zu Zoom und Fensterung. Sie enthalten Informa-
tionen über die Gewebeeigenschaften im ROI sowie über die Signalintensität (Ab-
schnitt 4.3.2).
ROI-Plot: Ein Streuungs-Plot erscheint ebenso in der rechten unteren Ecke des Dar-
stellungsfensters (Abschnitt 4.4).
Bei Verwendung einer SyMRI NEURO-Lizenz werden einige weitere Informationen an-
gezeigt (Abschnitt III).

3.3 Symbolleiste
Die in der SyMRI-Symbolleiste verfügbaren Befehle beziehen sich auf die gesamte Ar-
beitsumgebung und nicht nur auf ein bestimmtes Darstellungsfeld. Der Inhalt der Sym-
bolleiste und der Menüs hängt vom verwendeten Paket sowie der vorliegenden Lizenz
ab. In der Symbolleiste können beispielsweise Sprach- und Arbeitsbereicheinstellungen
vorgenommen werden. Die Funktionen, um ganze Datensätze und Screenshots zu expor-
tieren, sind auch in der Symbolleiste zu finden.
Die Verfügbarkeit einiger Funktionen hängt von Ihrer Lizenz ab.
Abbildung 3.3: Die Symbolleiste in SyMRI. Die obere ist die Symbolleiste für
SyMRI NEURO mit AutoROI Tool. Die untere ist die Symbolleiste in SyMRI
IMAGE.
In den folgenden Abschnitten werden die einzelnen Befehle in der Symbolleiste und im
Rechtsklickmenü erklärt.
Hinweis: Obwohl SyMRI in Sectra IDS7 integriert ist, handelt es sich um ein sepa-
rates Programm. Die in der Sectra IDS7-Anwendung verfügbaren Werkzeuge können
NICHT in SyMRI verwendet werden und umgekehrt. Nur die Werkzeuge, die in der
beweglichen Symbolleiste von SyMRI verfügbar sind, gelten für SyMRI.
Plug-In
Verwenden Sie die Schaltfläche „Schließen“ oder schließen Sie das Sectra IDS7
Hauptfenster, ohne SyMRI zu beenden, kann es zu einem fehlerhaften Abbruch
von SyMRI kommen oder das unverankerte Fenster mit der Symbolleiste bleibt zu-
gänglich, bis ein neuer Patient oder eine neue Untersuchung ausgewählt wird.
In macOS befindet sich die Menüleiste oben am Bildschirm, wenn SyMRI im Vor-
macOS
dergrund ist.

3.4 Optionen und Einstellungen

3.4.1 Layout-Optionen
Die Anzahl der Darstellungsfelder kann verändert werden.
Ansicht› 1 Bildfenster «Strg+1» Ein Darstellungsfeld anzeigen
Ansicht› 2 Bildfenster «Strg+2» Zwei Darstellungsfelder anzeigen
Ansicht› 3 Bildfenster «Strg+3» Drei Darstellungsfelder anzeigen
Ansicht› 4 Bildfenster «Strg+4» Vier Darstellungsfelder anzeigen
Ansicht› 5 Bildfenster «Strg+5» Fünf Darstellungsfelder anzeigen
Ansicht› 6 Bildfenster «Strg+6» Sechs Darstellungsfelder anzeigen
Das Layout einzelner Darstellungsfelder einschließlich der Einstellungen für jedes Dar-
stellungsfeld können gespeichert und geladen werden.
Einstellungen › Akt. Layout speichern Das aktuelle Layout mit der Anzahl der Dar-
stellungsfelder, den Zeitparametern, der Overlay-Art, der SyMaps-Art und den Bild-
einstellungen speichern. Beim Speichern des Layouts erscheint ein Dialogfeld mit der
Aufforderung zur Eingabe eines Namens für das Layout.
Wenn gespeicherte Layouts vorhanden sind, wählt SyMRI eins als Start-Layout sobald
SyMRI gestartet wird. Die Auswahl des Layouts hängt von drei Kriterien ab:
1. Aufnahmeausrichtung
2. Erkanntes Objekt
3. Feldstärke
Wenn keine exakte Übereinstimmung gefunden werden kann, wird die nächstmögliche
Übereinstimmung gewählt, indem die Kriterien in der oben angegebenen Reihenfolge
miteinander abgeglichen werden.
Einstellungen › Layout laden Gespeichertes Layout laden. Jedes gespeicherte Layout ist
ein Datenpunkt im Untermenü und trägt den Namen, den Sie beim Speichern des Lay-
outs vergeben haben. Durch Auswahl des gewünschten Datenpunkts wird das entspre-
chende Layout geladen. Dieses Layout wird beim Start von SyMRI als Standardlayout
verwendet.
Einstellungen › Layout löschen Gespeichertes Layout löschen. Jedes gespeicherte Lay-
out ist ein Datenpunkt im Untermenü und trägt den Namen, den Sie beim Speichern
des Layouts vergeben haben. Durch Auswahl des gewünschten Datenpunkts wird das
entsprechende Layout gelöscht.
3.4.2 Ansichtsoptionen
Ansicht› Verkn. Zoomen und Schwenken Alle Darstellungsfelder im Arbeitsbereich
sind verbunden. Die Funktionen Verschieben und Zoom werden gleichzeitig in allen Dar-
stellungsfeldern angepasst. Dadurch wird die Ansicht aller Bilder identisch.
Ansicht› Interpoliert «Ctrl+P» Durch Interpolation kann eine glattere Visualisierung
von kontrastgewichteten Bildern und SyMaps erzielt werden. Die Interpolation von Bil-
dern ist automatisch aktiviert und immer mit allen Darstellungsfeldern verbunden. Diese
Einstellung ist nicht betroffen durch und hat keinen Einfluss auf Ansicht› Verkn. Zoomen
und Schwenken.

Hinweis: Weites Herauszoomen bei ausgeschalteter Interpolation kann zu Aliasing-

Artefakten im Bild führen.
Rechtsklick› Bildeinstellungen › Farbe «C» Wenn die Farboption aktiviert wird, wird der
Bilderstapel farbig anstatt in Graustufen angezeigt. Synthetische kontrastgewichtete Bil-
der können nicht in Farbe angezeigt werden.
3.4.3 Sonstiges
Einstellungen › Sprache (Language) Die gewünschte Sprache aus der Liste der verfügba-
ren Sprachen auswählen. Wenn eine andere Sprache als Englisch verwendet wird, enthält
die Menüoption immer den Text „(Language)“ nach dem Wort für Sprache in der ak-
tuell ausgewählten Sprache. Der Inhalt des Untermenüs sind die Namen der einzelnen
verfügbaren Sprachen in dieser Sprache.
Windows Datei› Info über SyMRI Es werden Informationen über die momentan installierte
Version von SyMRI angezeigt.
macOS SyMRI› Info über SyMRI Es werden Informationen über die momentan installierte
Version von SyMRI angezeigt.

3.5 Bilder ansehen

3.5.1 Zoom
Zoom-Werkzeug «Z» Halten Sie die linke Maustaste gedrückt und bewegen Sie die
Maus, um den Bilderstapel im Darstellungsfeld zu zoomen. Bewegen Sie die Maus nach
vorne, um in das Bild hineinzuzoomen und nach hinten, um aus dem Bild herauszuzoo-
men. Die Zoomfunktion lässt sich nicht für Tabellen und Plots verwenden.
Rechtsklick› Zoom › Vergrößern «Strg+Z» Es wird eine Stufe in das Bild hineingezoomt.
Rechtsklick› Zoom › Verkleinern «Strg+Shift+Z» Es wird eine Stufe aus dem Bild her-
ausgezoomt.
Die Zoomschritte sind vorgegeben.
Rechtsklick› Zoom › Auf Fenstergröße zoomen Die Bildgröße wird an die Größe des
Darstellungsfelds angepasst.
Rechtsklick› Zoom › Pixel zu Pixel Ein Voxel im Original-DICOM-Datensatz wird mit
einem Pixel auf dem Computerbildschirm angezeigt. Bei nicht-quadratischen Voxels wird
die kürzeste Seite des Voxels in der Bildebene mit einem Pixel auf dem Computerbild-
schirm angezeigt.
3.5.2 Navigieren
Durch einen Bilderstapel scrollen: Mit dem Mausrad oder den Tasten «Bild-nach-oben»
und «Bild-nach-unten» können Sie durch einen Bilderstapel scrollen. Die erste
Schicht eines Bilderstapels wird durch die Taste «Pos1» aufgerufen. Die letzte
Schicht kann mit der Taste «Ende» aufgerufen werden.
Die folgenden Werkzeuge sind in der SyMRI-Symbolleiste zu finden.
Seitenw. Anz. «F4» Zum Scrollen durch die Bilder die Maus mit gedrückter linker
Maustaste bewegen.
Schwenken «F5» «P» Halten Sie die linke Maustaste gedrückt und bewegen Sie die
Maus, um den Bilderstapel im Darstellungsfeld zu verschieben. Tabellen und Plots kön-
nen nicht verschoben werden.
3.5.3 Fensterung
Fensterung: Halten Sie die mittlere Maustaste oder das Mausrad gedrückt und bewe-
gen Sie die Maus, um den Kontrast und die Intensität des Bildes anzupassen.
Horizontale Bewegungen verändern das Zentrum des Fensters und vertikale Bewe-
gungen die Breite des Fensters. Das Zentrum und die Breite bestimmen die Grau-
oder Farbstufen des Bildes. Das wiederum hat Einfluss auf die Helligkeit und den
Kontrast.
Rechtsklick› Bildeinstellungen › Autom.skal. «A» Die Bildhelligkeit und der Bildkon-

trastwerden an das Bild im Darstellungsfeld angepasst.

Teil II
SyMRI® IMAGE

4 Funktionen in SyMRI IMAGE

In SyMRI IMAGE können synthetische Magnetresonanztomographien durchgeführt wer-
den. Bei diesem Ansatz werden anhand eines einzelnen quantifizierenden MR-Scans die
Gewebeeigenschaften R1- und R2-Relaxationsraten und die Protonendichte PD gemes-
sen. Basierend auf diesen drei Eigenschaften können kontrastgewichtete Bilder, wie z. b.
T1W, T2W oder FLAIR synthetisiert werden, und zwar bei freier Wahl der Echozeit
TE, Wiederholungszeit TR, bei einem Inversionspuls die Inversionsverzögerung TI und
bei einem doppelten Inversionspuls die zweite Verzögerungszeit TI2.
Die Standardeinstellungen für gewöhnliche kontrastgewichtete Bilder sind vorgegeben,
der Benutzer kann aber TE, TR, TI und TI2 auf jeden beliebigen Wert einstellen.
ACHTUNG: Synthetische Bilder anders gewonnen und berechnet werden
als traditionelle Bilder und der Bildkontrast deshalb sehr ähnlich, aber nicht
unbedingt identisch ist, sogar bei den gleichen Einstellungen für TE, TR
und TI. Nehmen Sie sich die Zeit, um TE, TR und TI so einzustellen, dass
entweder die Bilder ähnlich aussehen, wie Sie es gewohnt sind, oder dass
diese Werte anderweitig optimal für Ihre Bedürfnisse eingestellt sind.
Die Interpretation von synthetischen Bildern sollte sorgfältig durchgeführt
werden und es wird dazu geraten, dass Sie sich zunächst mit dieser Art von
Bildern vertraut machen, um die feinen Unterschiede zwischen synthetischen
und konventionellen Bildern zu lernen.
Abbildung 4.1: Wenn Sie SyMRI IMAGE starten, öffnen sich vier Darstellungs-
felder mit synthetischen kontrastgewichteten Bildern: T2W, T2W FLAIR,
PSIR und T1W

4.1 Synthetische kontrastgewichtete Bilder

Die synthetischen kontrastgewichteten Bilder werden anhand der gemessenen R1, R2
und PD-Werte unter Einbeziehung der gewählten TE-, TR-, TI und TI2-Einstellungen
berechnet.
4.1.1 Anzeige synthetischer kontrastgewichteter Bilder

Eine Reihe von voreingestellten Kontrastgewichtungen können über das Rechtsklickmenü
oder Tastenkürzel ausgewählt werden. Welche Einstellungen verfügbar sind, ist unter
Umständen von Ihrer Lizenz abhängig.
Kontrast Layout «Strg+R» Es werden vier Darstellungsfelder mit Kontrastbildern an-

gezeigt: ein T2W, ein T2W FLAIR, ein T1W und ein PSIR. Die Standardwerte für TE,
TR und TI finden Sie in Tabelle 4.1. Tabelle 4.2 zeigt die Standardwerte für DIR, wenn
eine für DIR freigegebene Lizenz verwendet wird.
Rechtsklick› T1W «1» Ein T1-gewichtetes Bild wird im aktiven Darstellungsfeld an-
gezeigt. In T1-gewichteten Bildern werden Bereiche mit einer geringen Protonendichte
gewichtet, um den Kontrast zwischen grauer und weißer Substanz zu verstärken.
Rechtsklick› T2W «2» Ein T2-gewichtetes Bild wird im aktiven Darstellungsfeld ange-
zeigt.
Rechtsklick› PDW Ein PD-gewichtetes Bild wird im aktiven Darstellungsfeld angezeigt.
Rechtsklick› T1W FLAIR Ein T1-gewichtetes FLAIR-Bild wird im aktiven Darstel-
lungsfeld angezeigt.
Rechtsklick› T2W FLAIR «3» Ein T2-gewichtetes FLAIR-Bild wird im aktiven Dar-
stellungsfeld angezeigt.
Rechtsklick› STIR «4» Ein T2-gewichtetes STIR-Bild wird im aktiven Darstellungsfeld
angezeigt.
Rechtsklick› PSIR «5» Ein Phase Sensitive IR-Bild wird im aktiven Darstellungsfeld
angezeigt.
Rechtsklick› PSIR (Blutgefäß) Ein Phase Sensitive IR-Bild wird im aktiven Darstel-
lungsfeld angezeigt um die Blutgefäße zu markieren.
Rechtsklick› Doppel-IR (WM supp) Ein Doppel IR-Bild wird im aktiven Darstellungs-
feld angezeigt, und unterdrückt sowohl WM als auch CSF.
Rechtsklick› Doppel-IR (GM supp) Ein Doppel IR-Bild wird im aktiven Darstellungs-
feld angezeigt, und unterdrückt sowohl GM als auch CSF.
Hinweis: Die Menüoption DIR ist nur verfügbar, wenn Sie eine Lizenz haben, die die
DIR-Funktion freigibt.

Tabelle 4.1: Standardwerte für TE, TR, TI für die verschiedenen synthetischen
kontrastgewichteten Bilder.
Bildart TE TR TI
T1W 10 ms 500 ms
T2W 100 ms 4 500 ms
PDW 10 ms 8 000 ms
T1W FLAIR 10 ms 2 500 ms 1 050 ms
T2W FLAIR 100 ms 15 000 ms 3 000 ms
STIR 100 ms 15 000 ms 300 ms
PSIR 10 ms 6 000 ms 500 ms
PSIR (Blutgefäß) 10 ms 8 000 ms 10 ms
Tabelle 4.2: Standardwerte für TE, TR, TI und TI2 für DIR für die unterstützten Feldstärken.
Bildart Feldstärke TE TR TI TI2

Doppel-IR (WM supp) 1.5 T 100 ms 15 000 ms 420 ms 3 600 ms
Doppel-IR (WM supp) 3.0 T 100 ms 15 000 ms 470 ms 3 750 ms
Doppel-IR (GM supp) 1.5 T 10 ms 6 000 ms 700 ms 3 200 ms
Doppel-IR (GM supp) 3.0 T 10 ms 6 000 ms 900 ms 3 600 ms
4.1.2 Anpassung des Bildkontrasts

SyMRI ermöglicht im Anschluss an die Untersuchung bei synthetischen kontrastgewich-
teten Bildern eine Kontrolle des Kontrastgewichts. Dies erfolgt durch Anpassung von
TE, TR, TI und TI2. Diese Optionen können im Rechtsklickmenü, über ihr Symbol in
der Symbolleiste oder die unten aufgeführten Tastenkombinationen ausgewählt werden.
Beim Anpassen der Kontrastgewichtung durch Herunterdrücken der linken Maustaste
können Sie die Änderungen zurücknehmen, indem Sie «Esc» drücken, bevor Sie die linke
Maustaste wieder loslassen.
TE einstellen «Q» Sie können TE anpassen, indem Sie die linke Maustaste gedrückt
halten und die Maus bewegen.
TR einstellen «W» Sie können TR anpassen, indem Sie die linke Maustaste gedrückt
halten und die Maus bewegen.
TR/TE einstellen «E» TR und TE werden gleichzeitig angepasst, wenn die Maus bei
heruntergedrückter linker Maustaste bewegt wird.
TI einstellen «R» Sie können TI anpassen, indem Sie die linke Maustaste gedrückt halten
und die Maus bewegen. Die Option ist verfügbar, wenn der Inversions-Präpuls aktiviert
ist.
TI-TI einstellen «T» Sie können TI und TI2 anpassen, indem Sie die linke Maustaste
gedrückt halten und die Maus bewegen. Die Option ist verfügbar, wenn der Double
Inversions-Präpuls aktiviert ist.
Hinweis: Wenn das Werkzeug TI einstellen oder TI-TI einstellen ausgewählt ist, wird
der Mauszeiger zu einem roten Kreis, wenn er über kontrastgewichtete Bilder gezogen
wird, wo der entsprechende Inversionspuls / die entsprechenden Inversionspulse nicht
aktiv sind. Bei dem Versuch, TI oder TI2 für solch ein Bild anzupassen, erscheint ein

Dialogfeld mit der Frage, ob Sie den entsprechenden Inversionspuls / die entsprechenden
Inversionspulse aktivieren möchten.
ROI, Rechtsklick› ROI zum Nullen von Gewebe verwenden Das Kontrastgewicht des
Bildes wird angepasst und Gewebe im ROI erscheint in Folge schwarz im Bild. Das wird
erreicht durch einen Inversions-Präpuls mit einer optimierten TI. Um eine bestimmte
Gewebeart auszublenden: Erstellen Sie einen ROI und passen Sie seine Größe so an,
dass der ROI nur Gewebe der Art beinhaltet, dessen Signal Sie ausblenden möchten.
Das passt die TI im gezeigten Bild an. Bei einem DIR-Bild wird der zum Ausblenden
von CSF verwendete TI angepasst, um CSF weiterhin auszublenden, während der andere
TI optimiert wird, um das Gewebe im ROI auszublenden. Wie Sie einen ROI zeichnen
können, wird im Kapitel 4.3 beschrieben.
Siehe Abschnitt 6.3.1 (ROI zum Nullen von Gewebe verwenden).
ROI, Rechtsklick › Bildeinstellungen ›Inversions-Vorimpuls «Strg+I» Ein Inversions-Prä-
puls wird im Bild aktiviert. Die TI des Inversions-Präpuls wird im linken Bereich des
Darstellungsfelds angezeigt und kann mit TI einstellen angepasst werden.
ROI, Rechtsklick › Bildeinstellungen ›Präpuls mit doppelter Inversion Der Doppelin-
versions-Präpuls wird im Bild aktiviert. Die Inversionszeit wird im linken Bereich der
Ansicht angezeigt und kann mit TI-TI einstellen angepasst werden.
ROI, Rechtsklick › Bildeinstellungen› PSIR aktivieren Wenn PSIR inaktiviert ist, wer-
den negative Werte als der entsprechende Absolutwert angezeigt. Negative Werte kom-
men in Bildern mit einem Inversionspuls vor, beispielsweise PSIR. Bei einem konven-
tionellen MRT kann nur der Absolutwert angezeigt werden. Mit SyMRI können die
negativen Werte durch Aktivierung von PSIR angezeigt werden. Wenn PSIR aktiviert
wird, wird „PSIR (synthetisch)“ angezeigt.
4.1.3 Anpassen von FLAIR-Bildern

Bei einem FLAIR-Bild wird flüssige (CSF) mit einer Kombination aus Inversionspuls und
einer Inversionsverzögerung so unterdrückt, dass kein Flüssigkeitssignal mehr vorhanden
ist. Die verwendete Kombination aus TR und TI kann von Krankenhaus zu Krankenhaus
verschieden sein und es ist wichtig, sich der Unterschiede bewusst zu sein.
Abbildung 4.2: Verschiedene T2W FLAIR-Einstellungen bei einem MS-

Patienten (nach Gd). A: TR/TI = 12 000/2 850 ms, B: TR/TI = 12 000/2600
ms, C: TR/TI = 12 000/2 400 ms, D: TR/TI = 6 000/2 000 ms. Es gilt immer
TE = 100 ms.
In Abbildung 4.2 werden einige Beispiele für eine Optimierung der FLAIR-Bilder aufge-
führt: CSF ist mit der Kombination TR/TI = 12 000/2 600 ms vollständig ausgeblendet,
das Ergebnis ist eine sehr schwarze CSF (Abbildung 4.2 B). Allerdings hat eine längere

TI mit derselben TR immer noch eine angemessen unterdrückte CSF, aber einen hö-
heren GM/WM-Kontrast (Abbildung 4.2 A). Bei einer für Kliniken typischen FLAIR-
Einstellung mit einer kurzen TR, um die Scanzeit zu verkürzen, verschlechtert sich der
Kontrast der GM/WM, aber die Scanzeit für synthetische MRT verändert sich nicht
(Abbildung 4.2 D).
SyMRI kennzeichnet ein Bild als FLAIR , wenn der TI -Wert den Wert, der CSF voll-
ständig unterdrückt, fast erreicht hat. Bei anderen TI-Werten wird das Bild als gekenn-
zeichnet IR.
Siehe Abschnitt 6.3.1 (ROI zum Nullen von Gewebe verwenden).
4.1.4 Double IR-Bilder anpassen

In einem Double IR-Bild können zwei beliebige Gewebe mit einer Kombination aus zwei
Inversionspulsen und Inversionsverzögerungen unterdrückt werden. Beispielsweise kön-
nen weiße Substanz, graue Substanz oder Fett gleichzeitig mit CSF unterdrückt werden.
In Abbildung 4.3 werden einige Beispiele mit den vorgeschlagenen Einstellungen aufge-
führt.
Abbildung 4.3: Einstellungsbeispiele für Double IR bei 3T.

A: Ein DIR wo weiße Substanz und CSF unterdrückt werden unter Verwen-
dung von TE/TR/TI1/TI2 = 100/15 000/470/3 750 ms (weiblich, 35 Jahre),
B: Ein DIR für pädiatrische Anwendungen unter Verwendung von
TE/TR/TI1/TI2 = 10/8 000/900/3 950 ms (männlich, 8 Monate) und
C: Eine DIR mit Fettunterdrückung, um ein T2W FLAIR-ähnliches Bild mit
Fettunterdrückung zu erhalten, unter Verwendung von TE/TR/TI1/TI2 =
100/15 000/250/3 200 ms (männlich, 10 Jahre).
Zwei TIs korrekt einzustellen ist schwierig. Deshalb wird der Einsatz der Funktion
„ROI zum Nullen von Gewebe verwenden“ (Abschnitt 4.1.2) empfohlen.
4.1.5 Navigationsfenster für Kontrastbilder

Die aktuelle Kontrastgewichtung des Bilds ist im Darstellungsfenster auf zwei Arten
angezeigt; als Navigationsfenster auf der linken Seite des Darstellungsfensters und als
Text oben im Darstellungsfenster.
Das Navigationsfenster (Abbildung 4.4) wird zusammen mit kontrastgewichteten Bil-
dern angezeigt. Im Navigationsfenster wird die Kontrastgewichtung des Bildes als gelber
Punkt angezeigt. Verwenden Sie bei der Anpassung von TR oder TE das Navigations-
fenster, um zu sehen, wie sich die Veränderungen auf die Kontrastgewichtung auswirken.
Es ist auch möglich, TE und TR durch Klicken und Ziehen des gelben Punktes anzu-
passen.

Abbildung 4.4: Der Kreis im Navigationsfenster gibt die Kontrastgewichtung

des im Darstellungsfenster angezeigten Bilds an.
Der Text oben im Darstellungsfenster ändert sich abhängig von der aktuellen Kontrastge-
wichtung. Bei Spin-Echo-Bildern kann es das T1W-, T2W-, PDW- oder T1+T2-Gewicht
sein. Wenn ein Inversions-Präpuls aktiv ist, zeigt das Textfeld IR, PSIR, STIR, T1W
FLAIR, T2W FLAIR oder FLAIR an. Wenn zwei Inversions- Präpulse aktiviert sind,
ist die Kontrastgewichtung DIR.

4.2 SyMaps
Die Quantifizierungskarten in SyMRI zeigen die gemessenen Werte für die Gewebeei-
genschaften pro Voxel in einem Datensatz an. Die Quantifizierungskarten für die R1-
Relaxationsrate, R2-Relaxationsrate und die Protonendichte (PD) sind die Grundlage
des synthetischen MRT. Neben diesen Quantifizierungskarten sind die invertierten Re-
laxionszeiten T1 und T2 verfügbar.
4.2.1 Anzeige der SyMaps

Die unten beschriebenen Quantifizierungskarten können mit dem Rechtsklickmenü oder
der angegebenen Tastenkombination ausgewählt werden.
Abbildung 4.5: Das SyMaps-Layout enthält ein synthetisches kontrastgewich-

tetes T2W-Bild, SyMaps für PD, R1 und R2.
Jeder als SyMaps dargestellter Parameter hat einen bestimmten Bereich, in welchem er
gemessen werden kann. Dies wird als dynamischer Bereich von SyMRI bezeichnet. Der
dynamische Bereich jedes Parameters ist in Tabelle 6.2 aufgeführt.
Layout SyMaps «Strg+F» Vier Datenfelder werden mit R1-Karte, R2-Karte, PD-Karte
und T2W synthetischem kontrastgewichtetem Bild angezeigt.
Rechtsklick› SyMaps› T1 Karte Die T1 Relaxionszeiten werden in ms angezeigt.
Rechtsklick› SyMaps› T2 Karte Die T2 Relaxionszeiten werden in ms angezeigt.
1
Rechtsklick› SyMaps› R1 Karte Die R1-Relaxationsrate wird angezeigt in s−1 , 𝑅1 = 𝑇1.
Rechtsklick› SyMaps› R2 Karte Die R2-Relaxationsrate wird angezeigt in s−1 , 𝑅2 = 𝑇12
Rechtsklick› SyMaps› PD Karte Die Protonendichte wird in Prozenteinheiten (pu) im
Verhältnis zu einem Referenzwert von 100 pu angezeigt, was der Protonendichte von
Wasser entspricht. Fett hat eine höhere Protonendichte als Wasser und wird deshalb mit
Werten von über 100 pu angezeigt.

4.3 Untersuchungsbereich (ROI)

Ein ROI kann erstellt werden, um einen Bereich im Bild auszuwählen. Über den ROI
können R1, R2, PD und die Signalintensität innerhalb der gekennzeichneten Region
analysiert werden.
4.3.1 ROI erstellen und anpassen

Sie können einen ROI erstellen, indem Sie den Mauszeiger auf einem ausgewählten Punkt
positionieren, die linke Maustaste drücken und die gewünschte Form und Größe zeichnen
und dann die Maustaste wieder loslassen. Wählen Sie eine der folgenden Möglichkeiten,
um das Werkzeug für das Zeichnen eines ROIs zu aktivieren:
Freihand-ROI «F6» Es kann ein ROI mit einer beliebigen Form gezeichnet werden. Der
ROI wird mit einem linearen Segment geschlossen, wenn die Maustaste losgelassen wird.
Rechtecks-ROI «F7» Es kann ein rechteckiger ROI gezeichnet werden. Sie können den
rechteckigen ROI anpassen, indem Sie eine der Ecken markieren, die linke Maustaste
gedrückt halten und den ROI auf die gewünschte Größe anpassen.
4.3.2 Informationen im ROI

Informationen, die sich auf die ROI beziehen, werden in der oberen rechten Ecke des Dar-
stellungsfelds (Abbildung 4.6) angezeigt, unter Zoom und Fensterung. Dieser Textblock
wird als ROI-Info bezeichnet.
Abbildung 4.6: ROI und verwandte Informationen.
Zwei der Zeilen zeigen standardmäßig den Mittelwert und die Standardabweichung von
R1 und R2. Diese beiden Zeilen können so verändert werden, dass sie T1 und T2 anstatt
Es werden die folgenden Informationen angezeigt:
Position: Die Zentrumskoordinaten des ROI im Verhältnis zum Bild werden spezifiziert
als „ROI [#,#]“. Beim Freihand-ROI ist das Zentrum das seines umschließenden
Rechtecks.
R1 oder T1 anzeigen: Mittelwert und Standardabweichung von R1 oder T1 innerhalb
des ROI. Bei T1-Karten wird T1 angezeigt und bei R1-Karten wird R1 angezeigt.
R2 oder T2: Mittelwert und Standardabweichung von R2 oder T1 innerhalb des ROI.
Bei Bei T2-Karten wird T2 angezeigt und bei R2-Karten wird R2 angezeigt.
PD: Durchschnittswert und Standardabweichung von PD innerhalb des ROI.

Signal: Durchschnittswert und Standardabweichung der Voxelintensität. Bei syntheti-

schen Bildern entspricht dies der Signalstärke des simulierten MRT-Signals.
Siehe auch Abschnitte 5.1, 5.4 und 5.6 für zusätzliche ROI-Befehle in SyMRI NEURO.
4.3.3 ROI-Einstellungen
SyMRI unterstützt unterschiedliche ROI pro Darstellungsfeld und jeder ROI kann spe-
zifisch für eine bestimmte Schicht sein.
Einstellungen › Mehrere ROIs Dadurch kann der Benutzer mehr als einen ROI pro Dar-
stellungsfeld erhalten. Die Standardeinstellung ist aus. Der aktive ROI hat einen durch-
gehenden Rand, andere ROI haben einen gepunkteten Rand. Das Auftreten von aktiven
und inaktiven ROI ist in Abbildung 4.7 erkennbar.
Wenn Mehrere ROIs aus ist, wird ein ROI automatisch gelöscht, wenn ein ROI in demsel-
ben Darstellungsfeld gezeichnet wird. Wenn Mehrere ROIs an ist, bleibt der bestehende
ROI erhalten und erhält einen gepunkteten Rand.
Einstellungen › ROI pro Scheibe Verbindet ROI mit der spezifischen Schicht, wenn der
ROI gezeichnet wurde. Die Standardeinstellung, wenn aus ist.
Wenn ROI pro Scheibe aus ist, bleibt ein ROI beim Scrollen durch die Schichten sichtbar.
ROI-Info wird aktualisiert, um die Statistik für den ROI in der aktuell sichtbaren Schicht
anzuzeigen. Wenn ROI pro Scheibe an ist, ist ein ROI nur in der Schicht sichtbar, in
der er gezeichnet wurde. Beim Scrollen zu einer anderen Schicht ist ROI nicht sichtbar.
ROI-Info ist nur in Schichten mit einem ROI sichtbar.
Abbildung 4.7: Zwei ROI in demselben Darstellungsfeld. Der obere ROI ist aktiv
und deshalb mit einem durchgezogenen Rand dargestellt. Der untere ROI ist
nicht aktiv und deshalb mit einem gepunkteten Rand dargestellt
Hinweis: Die in den Darstellungsfeldern aufgeführten Informationen beziehen sich auf

den als aktiv markierten ROI. Ein ROI wird durch Klicken mit der linken Maustaste
aktiviert. Wenn ein neuer ROI gezeichnet wird, wird er automatisch als aktiv markiert.
Durch Drücken von «Tab» oder «Umschalttaste+Tab» kann ausgewählt werden, welcher
ROI aktiv ist.
4.3.4 Einen ROI entfernen

Durch Rechtsklick auf einen ROI wird das Rechtsklickmenü des ROI angezeigt. Dieses
Menü enthält verschiedene Optionen für den ROI.

ROI, Rechtsklick › ROI schneiden «Strg+X» Der ROI wird in die Zwischenablage kopiert
und dann aus dem Bildfenster entfernt.
ROI, Rechtsklick› ROI kopieren «Strg+C» Der ROI wird in die Zwischenablage kopiert.
ROI, Rechtsklick› ROI einfügen «Strg+V» Befindet sich ein ROI in der Zwischenabla-
ge, wird dieser im aktuell aktiven Bildfenster eingefügt.
Der Tastenbefehl «Strg+V» muss zum Einfügen eines ROI in ein Darstellungsfeld ohne
vorhandenen ROI verwendet werden. Der Tastenbefehl «Strg+V» kann auch zum Ein-
fügen des ROI als Text verwendet werden. Der Text kann dann in SyMRI kopiert und
eingefügt werden, um einen identischen ROI zu erstellen.
ROI, Rechtsklick› ROI deaktivieren «Rücktaste» Der ROI wird aus dem Darstellungs-
feld gelöscht.
ROI, Rechtsklick › Plot anzeigen Der Plot kann angezeigt oder verborgen werden.
ROI, Rechtsklick › ROI zum Nullen von Gewebe verwenden Siehe Abschnitt 4.1.2 (An-
passung des Bildkontrasts). Diese Funktion ist beim Wechsel der Schicht automatisch
ausgeschaltet.

4.4 Plots
Wenn ein ROI im Bild angezeigt wird, erscheint automatisch ein Plot in der unteren
rechten Ecke des Datenfelds. Die Voxelwerte im ROI sind im Diagramm abgebildet
(Abbildung 4.8). Die Farbe zeigt an, wie viele Voxel eine bestimmte Wertekombination
haben. Rot zeigt eine relativ hohe und blau eine niedrige Voxelzahl an (Abbildung 4.9).
Abbildung 4.8: Im Plot sind alle Voxels innerhalb des ROI aufgezeichnet.
Der Plot kann über das Rechtsklickmenü für Plots individuell angepasst werden.
Zusätzlich gibt es drei Arten von Diagrammen, die für den Plot im Kontextmenü ver-
fügbar sind: R1-R2-, R1-PD- und R2-PD-Plots. Die Achse und Beschreibung des Plots
verändern sich je nach gewählter Plotart.
Für die Plot-Skala sind zwei Optionen verfügbar. Eine kleine Skala, die für Werte an-
gepasst ist, die normalerweise im Gehirn vorgefunden werden. Die andere Skala ist eine
größere Skala, die ein größeres Intervall für die R1-R2-, R1-PD- und R2-PD-Achsen
bietet. Die kleine Skala ist die Standard- und empfohlene Skala für die Hirnanatomie.
Andere Anatomien verwenden die große Skala als Standard.
Abbildung 4.9: Das Rechtsklickmenü für Plots

4.5 Speichern und laden

Verschiedene Bildarten und Bilderstapel können von SyMRI in Ihrem Arbeitsplatz oder
PACS. gespeichert werden. Welche Speicher- und Ladeoptionen verfügbar sind, hängt
davon ab, welche Version von SyMRI Sie verwenden.
ACHTUNG: Bitte beachten Sie, dass nur die SyMaps- und MDME -Quellda-
ten von SyMRI erneut geöffnet werden können. Die gespeicherten kontrast-
gewichteten Bilder können mit anderen DICOM-Bildanzeigegeräten geöffnet
werden.
WARNUNG: Beachten Sie, dass falls der Arbeitsplatz abgeschaltet wird oder
ein Fehler auftritt, während die Daten gespeichert werden, die daraus ent-
stehenden Daten nicht verlässlich sind. Löschen Sie alle gespeicherten Daten
und speichern Sie erneut.
Bitte beachten Sie, dass bei einigen Versionen der Speichervorgang nur teil-
weise abgeschlossen ist, wenn er in SyMRI abgeschlossen wurde. Sectra PACS
IDS7 beispielsweise importiert die gespeicherten Daten in einem separaten
Schritt.
Sectra PACS IDS7 beginnt mit dem Import, wenn SyMRI den Speicher-
vorgang einleitet, aber auch nach Verlassen von SyMRI können in Sectra
PACS IDS7 noch Bilder zum Import ausstehen. Bei einem Absturz von
Plug-In
Sectra PACS IDS7 nach dem Verlassen von SyMRI sollten Sie die gespei-
cherten Daten kontrollieren. In Ihrer Sectra PACS IDS7-Dokumentation
finden Sie Informationen zum Import in Sectra PACS IDS7.
4.5.1 SyMaps speichern

Das Dateimenü enthält Optionen für das Speichern von SyMaps.
Hinweis: Diese Funktion ist nur verfügbar, wenn SyMRI mit einem MDME-Datensatz
verwendet wird.
Hinweis: SyMaps sind normalerweise verschlüsselt. In diesem Fall ist eine Datei pro
Schicht vorhanden. Verschlüsselte SyMaps können in einem DICOM-Anzeigegerät geöff-
net und als T2W-Serie angezeigt werden. Die verschlüsselte SyMaps kann nur in SyMRI
korrekt angezeigt werden.
MDME-Daten für SyMRI enthalten normalerweise über 300 Bilder, während quanti-
fizierte SyMaps ein oder drei Bilder pro Schicht und ca. 20 bis 300 Bilder insgesamt
enthalten.
Löschen Sie nie den Originaldatensatz! Beachten Sie, dass der Originaldatensatz mög-
licherweise gebraucht wird, um in zukünftigen Softwareversionen verlässliche Vergleiche
anstellen zu können. Diese Funktion ist nicht verfügbar, wenn SyMRI mit einem quan-
tifizierten Datensatz gestartet wurde.
Datei›SyMaps (T1T2PD) in PACS speichern Ein quantifizierter Bilderstapel wird
Plug-In
in PACS als eine eigene Serie in der aktuellen Untersuchung gespeichert.

Datei›SyMaps (T1T2PD) speichern in lokalem Verzeichnis... Ein quantifizierter

Bilderstapel wird im DICOM-Format in einen ausgewählten Order auf dem lokalen
StandAlone Arbeitsplatz gespeichert. Es wird ein DICOMDIR im Ordner erstellt und die Stapel-
daten werden in einem Unterordner gespeichert. Ist bereits eine DICOMDIR-Datei
vorhanden, wird sie aktualisiert.
Datei›SyMaps (T1T2PD) in PACS speichern Eine spezifizierte Anzahl an Bildern

Network wird über das Netzwerk als eine separate Serie in der aktuellen Untersuchung in der
konfigurierten PACS gespeichert.
4.5.1.1 Zeit einsparen

Bevor Sie SyMRI schließen, ist es empfehlenswert, die quantifizierte SyMaps zu spei-
chern, wenn Sie den Datensatz zu einem späteren Zeitpunkt laden möchten. Das wird
empfohlen, da es schneller ist, eine quantifizierte SyMaps zu laden als mit nicht quanti-
fizierten Rohdaten (MDME) zu beginnen.
4.5.2 Screenshot des Arbeitsbereichs speichern

Das Datei-Menü enthält Optionen zum Speichern eines Screenshots des Arbeitsbereichs.
Hinweis: Der Screenshot kann nicht von SyMRI geöffnet werden, kann aber in anderen
DICOM-Bildbetrachtern angezeigt werden.
Datei › Screenshot im PACS speichern Eine Kopie des Arbeitsbereichs von SyMRI
Plug-In
wird in PACS als eine neue Serie in der aktuellen Untersuchung gespeichert.
Datei › Screenshot speichern in Datei... Eine Kopie des Arbeitsbereichs von SyMRI
wird im DICOM-Format in der angegebenen Datei auf dem Arbeitsplatz gespeichert.
StandAlone
Es wird ein DICOMDIR im Ordner erstellt und die Datei wird in einem Unterordner
gespeichert. Ist bereits eine DICOMDIR-Datei vorhanden, wird sie aktualisiert.
Datei › Screenshot im PACS speichern Ein Screenshot des Arbeitsbereichs SyMRI

wird über das Netzwerk als eine neue Serie in der aktuellen Untersuchung in der Network
konfigurierten PACS gespeichert.
4.5.3 Bildstapel speichern
Hinweis: Die gespeicherten kontrastgewichteten Bildstapel können nicht mit SyMRI

geöffnet werden, aber in anderen DICOM-Bildanzeigegeräten angesehen werden.
Hinweis: Das Format der gespeicherten Bilder unterscheidet sich je nach Farbeinstel-
lung. Wenn Farbe an ist, werden die Bilder als RGB-Bilder gespeichert. Wenn Farbe aus
ist, werden die Bilder in Grautönen gespeichert. Siehe Abschnitt 3.4.2.

4.5.3.1 Diesen Stapel speichern

Das Rechtsklickmenü für jedes Darstellungsfeld enthält die Option zum Speichern des
Stapels, der im aktuellen Darstellungsfeld angezeigt wird, in einer neuen Serie. Der Stapel
behält seine Einstellungen aus dem Datenfeld bei, z. B. Fensterung, Kontrastgewichtung
und Farbeinstellungen.
Rechtsklick › Diesen Stapel im PACS speichern Der Bilderstapel im Datenfeld wird
Plug-In
in PACS als eine neue Serie in der Untersuchung gespeichert.
Rechtsklick› Diesen Stapel speichern im lok. Verz.... Der Bilderstapel im Datenfeld

wird als eine DICOM-Serie in einen Order auf dem lokalen Computer gespeichert.
StandAlone Es wird ein DICOMDIR im Ordner erstellt und die Stapeldaten werden in einem
Unterordner gespeichert. Ist bereits eine DICOMDIR-Datei vorhanden, wird sie ak-
tualisiert.
Rechtsklick› Diesen Stapel im PACS speichern Speichert den Stapel über das Netz-
Network
werk als eine neue Serie in der aktuellen Untersuchung in der konfigurierten PACS.
4.5.3.2 Alle sichtbaren Stapel speichern

Die Symbolleiste und das Menü Datei enthalten die Option, alle momentan sichtbaren
Darstellungsfelder als neue Serie zu speichern. Wenn Rohdaten geöffnet wurden, werden
auch SyMaps gespeichert.
Datei›Alle sichtbaren Stapel im PACS speichern Speichert alle sichtbaren Stapel
Plug-In (zusammen mit SyMaps, wenn aus den Rohdaten geöffnet) als neue Serie in der
aktuellen Untersuchung in PACS.
Datei›Alle sichtbaren Stapel speichern im lok. Verzeichnis... Speichert alle sicht-

baren Stapel (zusammen mit SyMaps, wenn aus den Rohdaten geöffnet) im DICOM-
StandAlone Format im angegebenen Verzeichnis in der Arbeitsstation. Ein DICOMDIR wird in
dem Ordner erstellt und die Stapeldaten werden in einem Unterordner gespeichert.
Wenn bereits eine DICOMDIR-Datei vorhanden ist, wird sie aktualisiert.
Datei›Alle sichtbaren Stapel im PACS speichern Speichert alle sichtbaren Stapel

Network (und SyMaps, wenn sie von Rohdaten geöffnet werden) als eine neue Serie in der
aktuellen Untersuchung über das Netzwerk in das konfigurierte PACS.

Teil III
SyMRI® NEURO

5 Funktionen in SyMRI NEURO

In SyMRI NEURO können eine Charakterisierung von Hirngewebe und Messungen des
Hirnvolumens durchgeführt werden. Anhand der Gewebeeigenschaften R1, R2 und PD
kann das Partialvolumen von Gewebe automatisch gemessen werden. So werden das in-
trakranielle Volumen (ICV) und das Hirnparenchymvolumen (BPV) sowie das Volumen
der weißen Substanz (WM), grauen Substanz (GM), Zerebrospinalflüssigkeit (CSF) und
der Myelin-korrelierten Komponente (MyC) geschätzt. Es ist eine Benutzermaske ver-
fügbar, um das Volumen einer benutzerdefinierten Auswahl des Hirngewebes zu messen.
ACHTUNG: Die Genauigkeit dieser Messungen hängt von verschiedenen Pa-
rametern ab, einschließlich Reihenfolgeeinstellungen, Scannerhersteller und
Feldstärke. Wenn eine Messung mit demselben Patienten mit derselben Se-
quenz und demselben MR-Scanner durchgeführt wird, hat diese eine hohe
Wiederholbarkeit. Wenn jedoch Parameter verändert werden, beispielsweise
die Sequenz oder der verwendete MR-Scanner, kann das die Genauigkeit ver-
ringern. Die Hirnvolumen wurden sowohl bei 1,5 T als auch 3 T verifiziert,
aber die Toleranz zwischen den Scannern kann immer zu Unterschieden füh-
ren. Es ist deshalb ratsam, bei Longitudinalstudien dieselben Einstellungen
zu verwenden.
Abbildung 5.1: Wenn Sie SyMRI NEURO starten, werden fünf Darstellungs-
felder angezeigt. In drei dieser Darstellungsfelder werden synthetische Kon-
trastbilder angezeigt. In einem Darstellungsfeld wird eine Segmentierungskar-
te angezeigt. Die Segmentierungskarte zeigt die CSF an. Im Darstellungs-
feld ganz rechts wird eine Segmentierungstabelle mit Volumenergebnissen an-
gezeigt. Verwenden Sie das Tastaturkürzel «Strg+R», um zu diesem Layout
zurückzukehren.

5.1 Die Hirnmaske
WARNUNG: Vor der Analyse der Gewebevolumen muss der Benutzer veri-
fizieren, dass die Hirnmaske anatomisch korrekt ist. Wenn die automatische
Erstellung fehlschlägt, muss die Maske vom Benutzer mit der ROI-Funktion
korrigiert werden. Probleme treten für gewöhnlich an den Orbita und am
Vertex und der Schädelbasis auf.
Abbildung 5.2: Die Hirnmaske definiert den ICV in SyMRI NEURO. Die rote
Linie markiert das Äußere des ICV.
Die Hirnmaske definiert das intrakranielle Volumen in SyMRI NEURO. Alle Segmentierungs-
und Volumenberechnungen werden auf die Voxel in der Hirnmaske angewendet.
Für die Lage der Hirnmaske werden WM, GM und CSF miteinbezogen, gefolgt von einem
Bereichswachstumsverfahren, um ein zusammenhängendes Volumen sicherzustellen. Der
Rand der Maske wird definiert mit PD = 50. Dabei wird angenommen, dass der Rand
des ICV in der Mitte zwischen CSF (mit PD = 100) und dem Schädelknochen (PD = 0)
liegt. Dann wird das Hirnmaske um 0,5 mm verkleinert, um die Dura mater zu entfernen.
Beachten Sie, dass die rote ICV-Randlinie, wie in Abbildung 5.2 zu sehen, außerhalb des
ICV Volumens aufgezeichnet wird.
5.1.1 Die Hirnmaske anpassen

Die Hirnmaske sollte in folgenden Schritten angepasst werden:
1. Zeigen Sie die Hirnmaske an, indem Sie Intrakranielle Maske im Rechtsklick-
menü verwenden oder «I» drücken.
2. Scrollen Sie durch alle Schichten und überprüfen Sie, dass die Hirnmaske
korrekt ist.
3. Fügen Sie Bereiche zu der Maske hinzu, indem Sie einen ROI um den Bereich
zeichnen. Fügen Sie der Maske den Bereich hinzu, indem Sie Zur intrakranieller
Maske hinzufügen im ROI-Rechtsklickmenü verwenden oder «Einfügen» drücken.
Teile des ROI außerhalb der Bildmatrix werden während der Bearbeitung ignoriert.
4. Entfernen Sie Bereiche aus der Maske, indem Sie einen ROI um den Bereich
zeichnen. Entfernen Sie den Bereich aus der Maske, indem Sie Aus intrakranieller

Maske entfernen im ROI-Rechtsklickmenü verwenden oder «Entfernen» drücken.

Teile des ROI außerhalb der Bildmatrix werden während der Bearbeitung ignoriert.
5. Die Hirnmaske speichern Wenn die Maske korrekt ist, können Sie die Änderun-
gen mit Intrakranielle Maske speichern im Dateimenü speichern. Wenn die Maske
gespeichert wurde, wird die Tabellenansicht mit dem Text: „Letzte Änderung der
Hirnmaske durch ‚Name des Benutzers‘, ‚Datum‘, ‚Zeit‘“ aktualisiert.
Die Hirnmaske wird nicht automatische gespeichert, wenn SyMaps gespeichert wer-
den, wird aber neu berechnet, wenn SyMaps geöffnet werden. Es ist möglich, die
Plug-In Hirnmaske zu speichern, wenn SyMaps geöffnet werden. Sobald die Hirnmaske mit
den SyMaps gespeichert wurde, wird diese Maske automatisch geladen und ange-
zeigt, wenn die SyMaps angezeigt werden.
WARNUNG: Die Hirnmaske (Abbildung 5.2) entspricht der Definition von

SyMRI NEURO des ICV. Die Gewebesegmentierung und Volumenschätzung
werden für alle Voxel in der Hirnmaske durchgeführt. Gewebe außerhalb der
Maske wird bei der Berechnung des Gewebevolumens nicht berücksichtigt.
5.1.2 Zusätzliche Funktionen für die Hirnmaske

Datei› Intrakranielle Maske speichern Die Hirnmaske wird gespeichert und automatisch
geladen, wenn die Untersuchung das nächste Mal verwendet wird. Diese Menüoption ist
nur dann verfügbar, wenn einSyMaps-Datensatz geöffnet wurde.
Die Informationen werden in eine DICOM-Objektdatei mit Präsentationsstatus in

einer neuen Serie in dem Order gespeichert, aus dem der Datensatz geladen wurde.
StandAlone
Beim Speichern von SyMaps wird die Hirnmaske im gespeicherten SyMaps-
Datensatz gespeichert.
Die Informationen werden in einem DICOM-Objekt mit Präsentationsstatus in

Plug-In PACS in einer neuen Serie in derselben Untersuchung wie der geladene Datensatz
gespeichert.

PACS über das Netzwerk in einer neuen Serie in derselben Untersuchung wie der
Network geladene Datensatz gespeichert.
Beim Speichern von SyMaps wird die Hirnmaske im gespeicherten SyMaps-
Datensatz gespeichert.
Datei› Intrakranielle Maske laden Die zuletzt gespeicherte Hirnmaske wird geladen.
Bearbeiten› Neuber. Intrakraniell. Maske Die Hirnmaske wird von dem in SyMRI
NEURO enthaltenen Algorithmus neu erstellt.
Bearbeiten› Intrakranielle Maske löschen Die Hirnmaske wird gelöscht. Alle berechne-
ten Volumen werden auf Null gesetzt. Diese Funktion ist hilfreich, wenn der Benutzer
das Gehirn ganz neu definieren möchte.
Rechtsklick› Intrakranialen Maskenrand zeigen «H» Umschalten zum Anzeigen und
Ausblenden der Hirnmaske.

WARNUNG: Um genaue Segmentierungsergebnisse zu erhalten, muss das

vollständige Schädelvolumen in die Hirnmaske miteinbezogen werden. Die
Hirnmaske darf nicht für die Berechnung des Volumens bestimmter Hirntei-
le, z.B. Ventrikel, verwendet werden. Um kleinere Bereiche des Gehirns zu
segmentieren, kann die Benutzermaske (Kapitel 5.4) verwendet werden.

5.2 Gewebesegmentierung
SyMRI segmentiert verschiedene Gewebearten automatisch. Unter anderem WM, GM,
CSF und MyC. Die automatische Segmentierung wird auf allen Voxels durchgeführt, die
im ICV vorhanden sind, definiert durch die Hirnmaske.
Die Ergebnisse der Gewebesegmentierungen werden auf zwei Arten dargestellt, sowohl als
Gesamtvolumina, die in der Segmentierungstabelle (Abschnitt 5.5) dargestellt werden,
als auch als Segmentierungskarten (Abschnitt 5.3).
5.2.1 Hirnparenchym- und CSF-Segmentierung

SyMRI unterteilt das Gewebe in vier Typen, wobei jede Volumeneinheit in ICV Teilvo-
lumen im Intervall von 0 bis 100 % der Volumeneinheit für jeden Gewebetyp enthält.
Die vier Gewebetypen im Segmentierungsmodell SyMRI:s sind:
• WM (aus dem Englischen White Matter) (markhaltige) weiße Substanz
• GM (aus dem Englischen Gray Matter) grauer Substanz
• CSF (aus dem Englischen Cerebrospinal Fluid) Zerebrospinalflüssigkeit
• NON-WM/GM/CSF, Gewebe/Flüssigkeit mit Eigenschaften, die sich von WM, GM

und CSF unterscheiden.
Hinweis: Als NON-WM/GM/CSF segmentiertes Gewebe sollte nicht als patho-

logisch eingestuft werden; es handelt sich hierbei nur um restliches Voxelvolumen,
das nicht als WM, GM oder CSF segmentiert wurde.
Die Gewebedefinitionen von WM, GM und CSF wurden über die Analyse von R1, R2
und PD, nach Quantifizierung von SyMRI, definiert. Ein Neuroradiologe hat mehrere
ROI zur Kennzeichnung von Bereichen mit reiner WM, GM und CSF in Gehirnda-
tensätzen einer Reihe von gesunden, erwachsenen Freiwilligen platziert. Es wurde eine
statistische Analyse der Gewebeeigenschaften innerhalb dieser ROI verwendet, um die
Gauß-Verteilung von R1-R2-PD für jede Gewebeart zu definieren, auch als Gewebeclus-
ter bezeichnet.
WARNUNG: Bitte beachten Sie, dass die Gewebetypen dem Gewebe gemäß
der histologischen Klassifizierung ähnlich sind, aber nicht identisch damit
sind. Bei sehr jungen Kindern, zum Beispiel, bei denen die weiße Substanz
noch nicht komplett markhaltig ist, kann das Geweben als GM anstatt WM
segmentiert werden. Das geschieht, da WM für markhaltige weiße Substanz
geformt wird und die nicht markhaltige weiße Substanz viel eher mit den
Gewebeeigenschaften von GM übereinstimmt.
WARNUNG: Es wurden keine Vergleiche mit biologischer weißer Substanz,

grauer Substanz oder CSF durchgeführt.

5.2.2 Myelin-korrelierte (MyC) Teilvolumenabbildung

Neben den Segmentierungskarten für WM, GM, CSF und NON-WM/GM/CSF, kann
SyMRI auch eine Segmentierungskarte für die Myelin-korrelierte Komponente MyC an-
zeigen. Diese Karte hat eine hohe Korrelation zum Teilvolumen von Myelin in jedem
Aufnahmevoxel. Typische Werte für MyC sind bei Erwachsenen 0-8 % in der kortikalen
GM und 30-45 % in der WM. MyC wird im Bild als Farbskala von 0 bis 40 % angezeigt,
aber die Werte können höher sein. Verwenden Sie die ROI-Funktion, um MyC-Werte
in bestimmten Bereichen zu bestätigen (siehe Abschnitt 5.6.1). Im menschlichen Gehirn
beträgt MyC normalerweise nicht mehr als 50 %. MyC ist nicht linear proportional zum
WM-Teilvolumen, z. B. kann MyC in Bereichen schwanken, die homogen als 100 % WM
segmentiert wurden.
MyC basiert auf einem anderen Segmentierungsmodell als WM, GM, CSF und NON-
WM/GM/CSF. Die Summe der Volumina von WM, GM, CSF und NON-WM/GM/
CSF ergeben insgesamt ICV, ohne MyC. Echtes Myelin enthält sehr dünne Schichten
Wasser, wo die Relaxation zu schnell geschieht, um direkt in der SyMRI-Aufnahme
erfasst zu werden. Aufgrund des magnetischen Austausches hat das schnell relaxierende
Myelinwasser eine Auswirkung auf das umgebende, langsamer relaxierende Wasser, mit
axonalem, intrazellulärem und extrazellulärem Wasser. Deshalb basieren die MyC-Werte
auf dem magnetischen Austausch zwischen Myelin und dem umgebenden Wasser. Wenn
Myelin vorhanden ist, sind die beobachteten Relaxationsraten des umgebenden Wassers
höher und das beobachtete PD niedriger, als wenn kein Myelin vorhanden ist.
Das MyC-Modell enthält vier Teilvolumina wobei jedes einen eigenen Satz an Relaxati-
onsraten und Protonen-Dichtigkeitsparameter aufweist. Die vier Teilvolumina sind MyC,
zelluläres Teilvolumen, freies Wasser-Teilvolumen und überschüssiges Parenchymwasser-
Teilvolumen. Die Summe dieser vier Teilvolumina beträgt 100 % für jeden Aufnah-
mevoxel. Für die Festlegung der optimalen Verteilung der vier Teilvolumina wird ein
Algorithmus verwendet, um die gemessenen R1-, R2- und PD-Werte für jeden Vox-
el in den Parameterkarten zu erhalten. Das MyC-Teilvolumen hat hohe R1- und R2-
Relaxationsraten und niedriges PD. Der Algorithmus findet einen höheren Beitrag von
MyC in WM als in GM, da die Relaxationsraten in WM höher als in GM sind wäh-
rend PD in WM niedriger ist als in GM. Nur das Kompartiment mit MyC kann in
SyMRI angezeigt werden. Weitere Einzelheiten zur Bestimmung von MyC sind in ei-
nem Open Source Journal aufgeführt, das kostenlos heruntergeladen werden kann unter
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fneur.2016.00016/full.
Hinweis: Es gibt eine hohe Korrelation zwischen MyC-Werten und der optischen Dichte
von Mustern mit histologischen Luxol-Fast-Blue-Flecken. Da MyC für den gesamten
magnetischen Effekt von Myelin auf R1, R2 und PD des umlegenden Gewebes steht, ist
nicht bestätigt, ob die Teilvolumina von MyC und das echte Myelin identisch sind.
ACHTUNG: Pathologische Veränderungen des Hirngewebes, die dazu füh-

ren, dass R1, R2 und PD erheblich von solchen in nicht-pathologischen Hirn-
parenchymen abweichen, können die MyC-Segmentierung beeinflussen. Ein
Beispiel einer solchen Veränderung ist ein starkes Ödem, wo die Relaxati-
onsraten sich denen von reinem CSF annähern.

5.3 Segmentierungskarten
Segmentierungskarten werden verwendet, um den Gewebegehalt in jedem Voxel inner-
halb des ICV zu visualisieren. Standardmäßig werden Segmentierungskarten als Overlays
angezeigt, Farbbilder, die über kontrastgewichteten Bildern angezeigt werden. Das kon-
trastgewichtete Bild dient dann als Referenzrahmen, während das farbliche Overlay den
Gewebegehalt anzeigt. Die Overlays haben jeweils abhängig von der Art des Gewebes,
für das sie stehen, eine andere Farbe. In Abbildung 5.3 sind vier verschiedene Segmen-
tierungskarten dargestellt, die als Overlay über kontrastgewichteten Bildern liegen.
Bei WM/GM/CSF modellieren die Gewebekarten das Teilvolumen gesunden erwachse-
nen Gewebes, d. h. die Karten sind auf 100 % für Gewebe, das reinem WM/GM/CSF
entspricht, gesättigt und (nicht-pathologischen) Veränderungen in z. B. Myelinierung in
reiner weißer Substanz werden nicht angezeigt, da sie alle bis zu 100 % in der WM-Karte
dargestellt sind.
Die Segmentierungskarten (Abbildung 5.3) werden vor einem Hintergrund angezeigt, der
ein kontrastgewichtetes Bild oder schwarz sein kann. Wenn eine Segmentierungskarte vor
einem schwarzen Hintergrund angezeigt wird, wird der Farbbalken in der oberen rechten
Ecke des Darstellungsfelds angezeigt.
Abbildung 5.3: Segmentierungskarten vor einem T2W Hintergrund.
5.3.1 Segmentierungskarten anzeigen

Die Segmentierungskarten werden im Rechtsklick oder mit dem entsprechenden Tasta-
turkürzel aktiviert.
Segmentierungslayout «Strg+S» Anzeige des standardmäßigen Segmentierungslayouts,

das aus 5 Darstellungsfeldern mit WM, GM, CSF, NON-WM/GM/CSF und Segmen-

tierungstabelle besteht.
Rechtsklick› Weiße Substanz «7» Die Segmentierungskarte für WM wird als ein Over-
lay angezeigt.
Rechtsklick› Graue Substanz «8»Die Segmentierungskarte für GM wird als ein Overlay
angezeigt.
Rechtsklick› Hirn-Rückenmarksflüss. «9» Die Segmentierungskarte für CSF wird als ein
Overlay angezeigt.
Rechtsklick› NON-WM/GM/CSF «0» Die Segmentierungskarte für Gewebe, das weder
der Definition von WM, GM noch CSF entspricht, wird als ein Overlay angezeigt.
Wenn eine Segmentierungskarte sichtbar ist, wird das Gesamtvolumen des segmentierten
Gewebes innerhalb der aktuellen Schicht oben im Darstellungsfenster angezeigt.
Ist ein ROI mit einem Overlay einer Segmentierung aktiv, wird das Volumen in ROI in
der oberen rechten Ecke des Darstellungsfeldes angezeigt. Siehe Abschnitt 5.6 für weitere
Informationen.
Außerdem kann man den Hirnmaskenrand über die Menüoption Intrakranialen Masken-
rand zeigen oder Tastenkombination «H» deaktivieren.
5.3.2 Hintergrundbild für die Segmentierung

Um zu sehen, wie die Farbe der Segmentierungskarten mit dem Gewebeinhalt korreliert,
muss der Hintergrund abgeschaltet werden. Daraufhin erscheint eine Farbleiste in der
oberen rechten Ecke des Darstellungsfelds, in welcher die Farbskala angezeigt wird.
Zur Ansicht der Segmentierungskarten auf einer linearen Skala von schwarz nach weiß,
wo weiß für 100 % und schwarz für 0 % Gewebegehalt steht, kann die Farbe abgeschaltet
werden. Die Farbe kann nur abgeschaltet werden, nachdem der Hintergrund deaktiviert
wurde.
Rechtsklick› Hintergrund deaktivieren «Strg+B» Schwarzer Hintergrund wird verwen-

det. Der Farbbalken für die Segmentierungskarte wird in der oberen rechten Ecke ange-
zeigt (Abbildung 5.4).
Rechtsklick› Bildeinstellungen › Farbe «C» Farbe deaktivieren

Abbildung 5.4: Wenn der Hintergrund abgeschaltet ist, wird eine Farbleiste an-
gezeigt. Diese Farbleiste zeigt, wie der Gewebegehalt mit der Farbe verknüpft
ist.

5.4 Benutzermaske für benutzerdefinierte Segmentierung

Die Benutzermaske gibt dem Benutzer die Möglichkeit, ausgewählte Teile des Bildersta-
pels zu markieren und zu einer Benutzermaske hinzuzufügen. Die Benutzermaske kann
Gewebe von sowohl innerhalb als auch außerhalb der Hirnmaske enthalten. Die Maske
kann zur Segmentierung des Volumens bestimmter Gewebe, Verletzungen und Anatomi-
en verwendet werden. Die Benutzermaske wird automatische angezeigt, wenn Sie SyMRI
NEURO mit einem Datensatz mit einer zuvor gespeicherten Benutzermaske starten.
5.4.1 Die Benutzermaske anzeigen

Sie können die Benutzermaske im Rechtsklickmenü aktivieren.
Rechtsklick› Benutzermaske zeigen «U» Die Benutzermaske wird im Darstellungsfeld

als Overlay angezeigt.
5.4.2 Volumen mit der Benutzermaske messen

Die Benutzermaske wird hauptsächlich zum Messen des Volumens einiger Benutzerde-
finierten Regionen verwendet. Das Volumen wird mit dem Voxelvolumen, einschließlich
des zugrunde liegenden Schnittspalts berechnet. Das Volumen der Benutzermaske kann
den ganzen oder einen Teil jedes Voxels umfassen. Das Benutzermaskenvolume in der
aktuellen Schicht wird oben im Darstellungsfenster / in den Darstellungsfenstern, in
welchen die Benutzermaske angezeigt wird/werden, angezeigt.
Das Teilvolumen kann zu der Benutzermaske hinzugefügt werden, indem Teilgewebe-
gehalt aus einer Segmentierungskarte in die Benutzermaske kopiert wird (siehe 5.4.3).
Das Teilvolumen des segmentierten Gewebes wird dann zum Benutzermaskenvolumen
hinzugefügt. Wenn beispielsweise das Teilvolumen des Gewebes in einem Voxel 25 %
beträgt, wird nur 25 % des Voxelvolumens zum Benutzermaskenvolumen hinzugefügt.
Benutzermasken, die nur Teil des Voxelvolumens enthalten, sind teilweise Transparent.
Mehr Transparenz steht für ein niedrigeres Teilvolumen.
Die Optionen für Farben und Hintergründe entsprechen denen für Segmentierungskarten.
Siehe Abschnitt 5.3.2.
5.4.3 Eine Benutzermaske erstellen und anpassen

Die Benutzermaske wird erstellt, indem Sie Bereiche hinzufügen oder entfernen. Dies ist
entweder durch Hinzufügen oder Entfernen von Regionen, die mit einem ROI markiert
sind, durch Hinzufügen von Gewebe, das mit einem ROI markiert ist oder durch Kopieren
von ganzen Schichten aus einer Segmentierungskarte möglich.
5.4.3.1 Die Benutzermaske mit einem ROI bearbeiten

Bei der Verwendung eines ROI zur Bearbeitung der Benutzermaske können Bereiche und
Gewebe über das ROI, Rechtsklick-Menü in die Benutzermaske hinzugefügt oder daraus
entfernt werden. Beginnen Sie damit, einen ROI um den zu ändernden Bereich zu legen.
ROI, Rechtsklick › Zu Benutzermaske hinzufügen Alle Voxel innerhalb dieses ROI wer-
den zur Benutzermaske hinzugefügt. Das Gesamtvolumen jedes Voxels wird zum Volu-
men der Benutzermaske hinzugefügt.

ROI, Rechtsklick› Aus Benutzermaske entfernen Entfernt alle Voxel innerhalb dieses
ROI aus der Benutzermaske. Das Volumen, das von diesen Voxeln beigetragen wurde,
wird von der Benutzermaske entfernt.
Es ist auch möglich, Gewebe aus einer Segmentierungskarte zu kopieren.
ROI, Rechtsklick› Gewebe in ROIin Benutzermaske kopieren - Vergrößern Alle Vo-

xel mit über 1 % des Gewebes in der Segmentierungskarte werden zur Benutzermaske
hinzugefügt. Das Gesamtvolumen jedes Voxels wird zum Volumen der Benutzermaske
hinzugefügt.
ROI, Rechtsklick› Gewebe in ROIin Benutzermaske kopieren - Teilvolumen Teilvolu-
mina werden in die Benutzermaske kopiert.
Abbildung 5.5: Mit einem ROI mit Overlay der Segmentierung mit Partialvolumen kopieren
5.4.3.2 Weitere Möglichkeiten, die Benutzermaske anzupassen

Es ist möglich, das gesamte segmentierte Gewebe in einer oder mehreren Schichten auf
einmal zur Benutzermaske hinzuzufügen. Diese Option erschient im Rechtsklickmenü,
wenn eine Segmentierungskarte sichtbar ist.

Abbildung 5.6: Es können ganze Schichten segmentierten Gewebes in die Be-

nutzermaske kopiert werden.
Rechtsklick› Gewebe in Ben.maske kopieren Kopieren Sie das gesamte Gewebe in der
sichtbaren Karte aus mehreren Schichten in die Benutzermaske. Es erscheint ein Dialog-
feld mit der Aufforderung, den Schichtbereich auszuwählen (Abbildung 5.6). Standard-
mäßig wird das Teilgewebevolumen hinzugefügt. Markieren Sie das Kontrollkästchen
„Teilvolumen auf 100 % vergrößern“, um das Gesamtvoxelvolumen von allen Voxeln mit
über 1 % Teilgewebevolumen einzuschließen.
Bearbeiten› Benutzermaske löschen Die Benutzermaske wird für alle Schichten ge-
löscht.
5.4.4 Die Benutzermaske speichern und laden

Es ist möglich, die Benutzermaske zu speichern und eine vorher gespeicherte Maske zu
laden.
Datei› Benutzermaske speichern Die Benutzermaske wird gespeichert. Es erscheint ein

Dialogfeld mit der Aufforderung, die Benutzermaske zu benennen. Es können verschiede-
ne Benutzermaske unter unterschiedlichen Namen gespeichert werden. Wenn wieder ein
Datensatz in SyMRI NEURO geladen wird, wird eine Liste aller in der DICOMDIR-Datei
gespeicherten Benutzermasken angezeigt. Wenn keine andere Benutzermaske ausgewählt
wird oder es nur eine gespeicherte Benutzermaske gibt, wird die zuletzt gespeicherte Be-
nutzermaske angezeigt.
Die Informationen werden in eine DICOM-Objektdatei mit Präsentationsstatus in

StandAlone
einer neuen Serie in dem Order gespeichert, aus dem der Datensatz geladen wurde.

PACS in einer neuen Serie in derselben Untersuchung wie der geladene Datensatz Plug-In
gespeichert.

PACS über das Netzwerk in einer neuen Serie in derselben Untersuchung wie der Network
geladene Datensatz gespeichert.
Datei› Benutzermaske laden Die zuletzt gespeicherte Benutzermaske wird geladen. Al-
le aktuellen Veränderungen werden durch die letzte gespeicherte Maske ersetzt. Wenn
SyMRI NEURO gestartet wird, wird automatisch die letzte für einen Datensatz gespei-
cherte Benutzermaske geladen.

5.5 Segmentierungstabelle
Die Segmentierungstabelle bietet volumetrische Informationen über alle automatisch seg-
mentierte Gewebearten in SyMRI NEURO und der Benutzermaske. Es werden immer
die Gesamtvolumina für das gesamte Gehirn angezeigt und die Tabelle kann erweitert
werden, um die Gewebevolumina pro Schicht anzuzeigen.
Abbildung 5.7: In der Segmentierungstabelle werden die berechneten Volumen

von WM, GM, CSF, NON-WM/GM/CSF und MyC pro Schicht und gesamt
angezeigt.
Rechtsklick› Segmentierungstabelle «6» Anzeige der Segmentierungstabelle im Dar-

stellungsfeld.
In der Segmentierungstabelle werden die folgenden Volumen angezeigt:
• Summe (ml): Gesamtvolumen von WM, GM, CSF, NON-WM/GM/CSF und

MyC in der Hirnmaske.
• % BPV: Die Volumina von WM, GM, NON-WM/GM/CSF und MyC als Anteil
des gesamten Hirnparenchymvolumens. Bitte beachten Sie, dass die Anteile von
WM, GM und NON insgesamt 100 % ergeben, während der Anteil von MyC ein
von den anderen Gewebearten unabhängiger Anteil von BPV ist.
• % ICV: Die Volumina von WM, GM, CSF, NON-WM/GM/CSF und MyC-
Volumina als Teile des gesamten intrakraniellen Volumens. Bitte beachten Sie,
dass die Anteile von WM, GM, CSF und NON insgesamt 100 % ergeben, während
der Anteil von MyC ein von den anderen Gewebearten unabhängiger Anteil von
ICV ist.
• Hirnparenchymfraktion (BPF). Die Parenchymfraktion ist die Summe aus den Vo-
lumen für WM + GM + NON-WM/GM/CSF dividiert durch das Gesamtvolumen
der Hirnmaske (𝐵𝑃 𝐹 = = = ).
ICV ICV ICV
Hinweis: Der Anteil von MyC wird nicht in die Berechnung von BPF aufge-
nommen, da MyC von anderen Gewebearten, die den Inhalt von ICV vollständig
aufteilen, unabhängig ist.
Der Name des Benutzers, der die Hirnmaske erstellt hat, auf die sich die Segmentie-
rungsvolumen beziehen, wird unter der Tabelle zusammen mit der Zeit und dem Datum
angezeigt.
5.5.1 Anzeige der Volumina pro Schicht

Die Segmentierungstabelle kann erweitert werden, um die Gewebevolumina für jede ein-
zelne Schicht anzuzeigen.

Segmentierungstabelle, Rechtsklick ›Schnitte zeigen erweitert die Segmentierungsta-

belle, um die Gewebevolumina in jeder Schicht anzuzeigen.
• SchichtVolumen von WM, GM, CSF, NON-WM/GM/CSF und MyC pro Schicht.
5.5.2 Benutzermaske in der Segmentierungstabelle

Wenn die Benutzermaske mindestens einen Voxel enthält, erscheint eine neue Spalte mit
dem Namen „UM“ in der Segmentierungstabelle. In dieser Spalte wird das Benutzer-
maskenvolumen genau wie für WM. GM, CSF usw. angezeigt. Es werden Volumen pro
Schicht, Gesamtvolumen und Volumen als Anteil von ICV und BPV angezeigt.
5.5.3 Exportieren der Segmentierungstabelle

Datei› Segmentierungstabelle als Text speichern... Die Tabelle mit den Segmentier-
ungsergebnissen wird lokal auf dem Arbeitsplatz als eine Textdatei gespeichert. In der
Datei werden der Name des Patienten, die Untersuchungs-ID und die verwendeten Ver-
sionen von SyMRI gespeichert.
Datei› Segmentierungstabelle als Structured Report speichern... Der gleiche Befehl

wie oben, aber die Tabelle wird als ein DICOM-Objekt mit dem strukturierten Be-
richtsformat gespeichert. Siehe auch die DICOM-Konformitätserklärung für SyMRI zu
weiteren (technischen) Einzelheiten zu diesem Format.
Segmentierungstabelle, Rechtsklick› Segmentierungstabelle kopieren «Ctrl+C» Da-
mit wird die Segmentierungstabelle als Text kopiert und kann in Dokumente, E-Mails
usw. eingefügt werden.

5.6 ROI in SyMRI NEURO

Zusätzlich zu den Funktionen, die der ROI in SyMRI IMAGE (Abschnitt 4.3) hat, wird
der ROI für drei Funktionen verwendet, die es nur in SyMRI NEURO gibt:
1. Um die Hirnmaske anzupassen (Abschnitt 5.1.1).
2. Um die Benutzermaske anzupassen (Abschnitt 5.4.3).
3. Messen des Volumens von segmentiertem Gewebe.
Abbildung 5.8: ROI und verwandte Informationen
5.6.1 Messen des Volumens von segmentiertem Gewebe

Wenn eine Segmentierungskarte sichtbar ist, erscheinen zwei neue Zeilen im ROI-Info-
Text.
Am Anfang der ersten Zeile steht der Name der sichtbaren Segmentierungskarte, z. B.
WM oder CSF. In dieser Zeile wird das Mittel und die Standardabweichung vom Teilvo-
lumen des segmentierten Gewebegehalts in ROI, als Anteil des gesamten ROI-Volumens
angezeigt.
Die zweite Zeile beginnt mit Vol. und zeigt das Volumen des segmentierten Gewebes
innerhalb des ROI an und dann das Gesamtvolumen des ROI. Die Volumina werden in
Milliliter (ml) angezeigt.
Wenn eine Benutzermaske sichtbar ist, werden die Informationen für die Benutzermaske
innerhalb des ROI auf die gleiche Art und Weise in ROI-Info angezeigt. Falls sowohl
eine Benutzermaske als auch ein Segmentierungs-Overlay sichtbar sind, werden die Vo-
lumeninformationen für die Benutzermaske unter den Volumeninformationen für das
segmentierte Gewebe angezeigt. Siehe Abbildung 5.8.
Beachten Sie bitte auch, dass die Zeile für Signal entfernt wird, wenn die Volumeninfor-
mationen für eine Benutzermaske oder für segmentiertes Gewebe angezeigt werden.

5.7 Plots in SyMRI NEURO
Abbildung 5.9: Der ROI-Plot in SyMRI NEURO.
Die Plots in SyMRI NEURO haben dieselben Funktionen wie in SyMRI IMAGE (Ab-
schnitt 4.4). Zusätzlich zeigen sie den Durchschnittswert der definierten Gewebearten
mit einem Kreuz an.
Plot, Rechtsklick › Gehirn-Cluster Die Referenzcluster für CSF, WM und GM werden

angezeigt.

Teil IV
Wichtige Informationen

6 Warnungen
6 Warnungen
Lesen Sie alle Informationen in diesem Kapitel, da sie wichtige Informationen bezüglich
der sicheren Verwendung von SyMRI enthalten.
6.1 Bildartefakte
Die verschiedenen Arten von Bildartefakten, die in traditionellen MRT-Bildern erschei-
nen, können auch bei einem synthetischen MRT erscheinen. Bildartefakte wie Bewe-
gungsartefakte, Störungen, Faltungen etc. können aus denselben Gründen erscheinen.
Die Auswirkung auf die Bilder kann jedoch anders sein, da die Signale anders erfasst
werden.
6.1.1 Bewegungsartefakte
Abbildung 6.1: Bewegungen des Patienten können zu Faltungen und Geisterbil-

dern führen. A: T2W B: FLAIR C: T2W mit NON-WM/GM/CSF-Karte
Genau wie traditionelle MRT-Bilder werden auch synthetische MRT-Bilder durch Be-
wegung beeinflusst. Bewegungen führen zu Artefakten, die die Bildqualität beeinträchti-
gen. Synthetische Bilder werden aus mehreren aufeinanderfolgenden Aufnahmen erstellt.
Durch Bewegung verursachte Artefakte erscheinen deshalb möglicherweise anders als bei
traditionellen Bildern. Die „Geisterbilder“ ähneln denen, die auch in traditionellen Bil-
dern erscheinen und häufig bearbeitet der Segmentierungsalgorithmus das Bild problem-
los, mit Ausnahme des Bereichs, in dem Geisterbilder auftreten. Bewegungen führen zu
verschwommenen Bildern mit unscharfen Rändern.
WARNUNG: Wenn die Patienten ihre ursprüngliche Position verändern,

führt dies zu Fehlern im Übergang zwischen den Geweben in der R2-Karte
und schweren Messfehlern in der R1-Karte. Das führt zu unbrauchbaren
Kontrastbildern und schlechter Segmentierung. Abbildung 6.1 zeigt einen
Schlaganfallpatienten, der sich während der Untersuchung bewegt hat.

6 Warnungen
6.2 Abweichungen – synthetisches MRT

Die synthetischen kontrastgewichteten Bilder sollen ähnlich aussehen wie die Bilder eines
traditionellen MRT. Es gibt Faktoren, die dazu beitragen, dass die synthetischen Bilder
sich von traditionellen Bildern unterscheiden.
6.2.1 Schwarzes Blut
Abbildung 6.2: In synthetischen Bildern wird das Signal von fließendem Blut
unterdrückt. Beispielsweise werden Arterien in einem synthetischen T1W-Bild
(rechts) nicht betont, nachdem ein Kontrastmittel gegeben wurde, wie das bei
traditionellen T1W-Bildern der Fall wäre (links).
Die Aufnahme für die Quantifizierung unterdrückt das Signal des fließenden Bluts. Das
führt zu synthetisierten Bildern mit „schwarzem Blut“. Arterien werden im Bild nicht
betont, auch wenn ein Kontrastmittel gegeben wurde. Nichtfließendes Blut, verursacht
beispielsweise durch eine Blutung, verstärkt den T1-Wert in synthetischen Bildern. Das
trifft auch zu, wenn sich ein Kontrastmittel im Gewebe angesammelt hat.
WARNUNG: Es wird empfohlen, eine MDME-Aufnahme vor der Gabe des

Kontrastmittels zu erstellen.
6.2.2 Flussempfindlichkeit
Abbildung 6.3: Hyperintensives Signal aufgrund eines CSF-Strahls.
Ähnlich wie bei der traditionellen MRT, können synthetische MRT durch Artefakte
beeinflusst werden, die durch Fluss verursacht wurden. Beispiele sind ein Streifen von
Geisterbildern aufgrund einer großen Arterie oder eines CSF-Strahls (siehe Abbildung
6.3).

6 Warnungen
WARNUNG: Bei dünneren Schichten sind vor allem Flussartefakte ausge-

sprochener. Je dünner die Schicht, desto wahrscheinlicher ist das Auftreten
von Flussartefakten und deren Deutlichkeit. Ein Arterienfluss kann auch ein
anscheinend hyperintensives Gefäßsignal (auch als arterielle Hyperintensitä-
ten bekannt) in FLAIR-Bildern verursachen.
6.2.3 Kleine Elemente verschwinden möglicherweise

Wie bei einem traditionellen MRT verschwinden kleine Elemente, wenn die Auflösung
zu gering für das bestimmte untersuchte Element ist.
WARNUNG: Bei einem synthetischen MRT werden die Berechnungen von

R1, R2 und PD auf einem Modell basiert, das annimmt, dass die Relaxi-
on in jedem Voxel monoexponentiell ist. Deshalb ist es möglich, dass kleine
Strukturen, die in keinem Voxel die dominierende Komponente werden, ver-
schwinden und in den synthetischen Bildern nicht sichtbar sind.

6 Warnungen
6.3 Funktionen spezifisch für synthetisches MRT

6.3.1 ROI zum Nullen von Gewebe verwenden
WARNUNG: Wenn Sie große Bereiche auswählen, in denen sich mehr als
eine Gewebeart befindet, wählt der Ausblende-Algorithmus möglicherweise
eine TI, die keiner dieser Gewebearten entspricht. Wenn Sie beispielsweise
einen großen ROI wählen, der sowohl WM als auch CSF in ungefähr glei-
chen Mengen enthält, führt das zu einer inkorrekten Ausblendung. Siehe
Abbildung 6.4 für eine Illustration der Auswirkungen. Die besten Ergebnis-
se werden erzielt, wenn Sie einen ROI erstellen, der nur das Gewebe enthält,
das untersucht werden soll.
Abbildung 6.4: Auswirkungen der Erstellung eines ROI für die Gewebe-
Ausblend-Funktion. Beachten Sie, dass in 6.4d der Nucleus caudatus (Nucleus
caudatus) sichtbar ist, nachdem die weiße Substanz ausgeschlossen wurde.
6.3.2 Quantitative Messungen

Die quantitativen Messungen von R1 (T1), R2 (T2) und PD wurden in Phantomstudien
überprüft. Ein Satz Phantome mit verschiedenen Kombinationen von R1 und R2 wurden
gescannt und mit SyMRI quantifiziert und die Ergebnisse wurden mit Inversion Recovery
für R1 und Multiecho CPMG (Carr-Purcell-Meiboom-Gill) für R2 verglichen. Für PD
wurde ein anderes Phantom mit verschiedenen Konzentrationen von schwerem Wasser
verwendet. Es zeigte sich eine gute Korrelation für alle Parameter. Die durchschnittli-
chen Unterschiede, Standardabweichungen und Überprüfungsbereiche (intervall) für die
quantitativen Parameter und verschiedenen Hersteller und Feldstärken finden Sie in der
Tabelle 6.1.
Hinweis: Die Verwendung von SyMRI auf MDME-Eingabedaten von Siemens-

Scannern ist durch die US FDA noch nicht nach 510(k) zugelassen und des-
halb in den USA noch nicht zu kaufen, außer für eingeschränkten Forschungs-
und Untersuchungsgebrauch.
Tabelle 6.1: Genauigkeit von SyMRI im Vergleich zum Goldstandard bei Phantomen
Philips GE Siemens
Parameter Intervall
1.5 T 3.0 T 1.5 T 3.0 T 1.5 T 3.0 T
𝑅1 0.5 − 3.33 𝑠−1 4±7 % 9±7 % 5±7 % 7±6 % 0 ± 11 % 1 ± 11 %
𝑅2 2.5 − 25 𝑠−1 7 ± 2 % 16 ± 10 % 12 ± 13 % 16 ± 10 % 11 ± 6 % 17 ± 4 %
𝑃𝐷 20 – 100 pu 7±8 % 5 ± 11 % 2 ± 4 % −1 ± 5 %
Beispiele für die Ergebnisse der Phantomstudien sind in Abbildung 6.5 zu sehen.

6 Warnungen
25 120
3.5
3 100
R2_MDME (s-1) at 3T
20
R1_MDME (s-1) at 3T
PD_MDME (%) at 3T
2.5 80
15
2
60
1.5 10
40
1
5
20
0.5
0
0 0
0 5 10 15 20 25 0 20 40 60 80 100 120
0 0.5 1 1.5 2 2.5 3 3.5
R1_IR (s-1) at 3T
10

0.5 0.5 8
0.4 0.4 6
0.3 0.3 4
0.2 0.2 2
0.1 0.1
0
0.0 0.0
-2
-0.1 -0.1
-0.2 -0.2 -4
-0.3 -0.3 -6
-0.4 -0.4 -8
-0.5 -0.5 -10
0 0.5 1 1.5 2 2.5 3 3.5 0 5 10 15 20 25 0 20 40 60 80 100 120
Abbildung 6.5: SyMRI quantitative Messungen im Vergleich zum quantitativen

Goldstandard bei Phantomen mit einem GE Discovery MR750 3 T.
6.3.2.1 Dynamischer Bereich

Den dynamischen Bereich der Messungen für die quantitativen Gewebeparameter finden
Sie in Tabelle 6.2.
WARNUNG: Werte außerhalb des dynamischen Bereichs fallen weg.
Tabelle 6.2: Dynamischer Bereich für SyMRI.
Wert Einheit Min Max

T1 ms 250 4 300
R1 𝑠−1 0.23 4
T2 ms 10 2 000
R2 𝑠−1 0.5 100
PD pu 0 160
6.3.3 Segmentierung
Die Segmentierung in SyMRI basiert auf vordefinierten Clustern (WM, GM, CSF), die
definiert wurden, um weiße Substanz, graue Substanz und Zerebrospinalflüssigkeit darzu-
stellen. Beachten Sie, dass pathologisches Gewebe Werte aufweisen kann, die den gesun-
den Definitionen entsprechen. Gleichermaßen kann gesundes Gewebe Werte aufweisen,
die von den definierten Gewebedefinitionen abweichen. Das Partialvolumen wird mit
einem Simulationsmodell (Bloch-Simulator) berechnet, das die Werte der beiden Gewe-
becluster an den berechneten Partialgewebetyp anpasst.
ACHTUNG: Ein absoluter Vergleich zwischen verschiedenen Gehirnen oder
einem Gehirn, das zu verschiedenen Zeitpunkten gescannt wurde, muss in
vergleichbaren Versionen von SyMRI durchgeführt werden. Hinweise zur

6 Warnungen
neusten Version enthalten Informationen darüber, ob Veränderungen gegen-

über den älteren Versionen von SyMRI vorgenommen wurden.
WARNUNG: In Voxeln mit einem Partialvolumen von bekanntem Gewebe

und einem Partialvolumen von Knochen, Luft oder anderem Gewebe mit
einer niedrigen PD, klassifiziert die Segmentierung möglicherweise den Vox-
el fälschlicherweise als NON-WM/GM/CSF anstatt als Partialvolumen be-
kannten Gewebes und Partialvolumen von NON-WM/GM/CSF.
WARNUNG: Wenn mehrere pathologische Gewebe innerhalb von einem Vo-

xel zu finden sind, das Gewebe in diesem Voxel aufgrund von Partialvolumen-
effekten teilweise falsch klassifiziert werden könnte. Beispielsweise in einem
Voxel, der zwei pathologische Gewebe enthält und in dem sich die Vermi-
schung mit einem bekannten Gewebe überschneidet, kann dies dazu führen,
dass das bekannte Gewebe fälschlicherweise als Partialvolumen klassifiziert
wird.
WARNUNG: Die Gabe von Sauerstoff während des MRT kann die R2 Rela-
xationsrate im Gehirngewebe erhöhen und somit die Segmentierungsanalyse
beeinflussen.
6.3.4 Faktoren, die die Volumenberechnung beeinflussen

Verifizierungs- und Validierungsprozesse wurden durchgeführt, um die Wiederholbarkeit
der Volumenmessungen zu bewerten. Die Messungen basieren auf vordefinierten Gewe-
bedefinitionen.
WARNUNG: Es wurden keine Vergleiche mit biologischer weißer Substanz,

grauer Substanz oder CSF durchgeführt.
6.3.4.1 Genauigkeit
Für Volumenberechnungen in SyMRI wird das Volumen jedes einzelnen Voxels als Pro-
dukt des voxelbasierten Bereichs im Schnitt und der Abstand des Schnitts berechnet
(dies beinhaltet den Spalt des Schnitts). Die Abstand des Schnitts wird anstatt der Stär-
ke des Schnitts verwendet, um das gesamte Hirnvolumen miteinzubeziehen. Abbildung
6.6 stellt dar, wie Abstand, Stärke und Spalt in Zusammenhang stehen.
ACHTUNG: SyMRI schätzt den Gewebegehalt im Schnittspalt basierend
auf den beiden angrenzenden Schichten. Der Schnittunterschied (Abbildung
6.6) niedrig sein muss, um große Näherungswerte in den Messungen zu ver-
meiden.

6 Warnungen
Schnittabstand =
Schnittspalt +
Schnittstärke
Abbildung 6.6: Darstellung der Beziehungen zwischen Schnittabstand, Schnitt-

spalt, und Schnittstärke.
6.3.4.2 Wiederholbarkeit
Um die Wiederholbarkeit der Segmentierungsmethode zu überprüfen, wurden in-vivo
Messungen an 7 gesunden Testpersonen (Alter 32–48 Jahre) durchgeführt, die mit ei-
nem GE 450W 1.5 T, einem GE 750 3 T, einem Philips Ingenia 1.5 T, einem Philips
Ingenia 3 T, einem Siemens Aera 1.5 T und einem Siemens Prisma 3 T Scanner gescannt
wurden. Die Testpersonen wurden mit jedem Scanner zweimal gescannt. Zwischen den
Aufnahmen wurden sie aus dem Scanner genommen. Nicht alle Probanden wurden mit
den Siemens-Scannern gescannt.
Die Wiederholbarkeit des Volumens des Gehirngewebes als Prozentsatz des intrakrani-
ellen Volumens und die Wiederholbarkeit von BPF werden in Tabelle 6.3 angezeigt. Die
angezeigte Wiederholbarkeit ist eine Standardabweichung innerhalb des Probanden, was
bedeutet, dass der Wiederholbarkeitskoeffizient durch Multiplizieren der Werte mit 2,77
erreicht wird.
Hinweis: Die Verwendung von SyMRI auf MDME-Eingabedaten von Siemens-Scannern
ist durch die US FDA noch nicht nach 510(k) zugelassen und deshalb in den USA noch
nicht zu kaufen, außer für eingeschränkten Forschungs- und Untersuchungsgebrauch.
Tabelle 6.3: Wiederholbarkeit für SyMRI.

GE 450W 1.5 T 0.38 % 0.42 % 0.14 % 0.10 % 0.12 % 0.14 %
GE 750 3 T 0.62 % 0.58 % 0.15 % 0.15 % 0.21 % 0.15 %
Siemens Aera 1.5 T 0.45 % 0.50 % 0.11 % 0.13 % 0.13 % 0.11 %
Siemens Prisma 3 T 0.39 % 0.32 % 0.10 % 0.06 % 0.14 % 0.10 %
ACHTUNG: Um vergleichbare Volumenmessungen zu erhalten, ist es wich-

tig, dass die gleiche Softwareversion von SyMRI für alle Untersuchungen
verwendet wird. Volumetrische Messungen, die mit verschiedenen Versionen

6 Warnungen
von SyMRI durchgeführt werden, können aufgrund von Änderungen in der

Software voneinander abweichen. Es dürfen nur Datensätze miteinander ver-
glichen werden, die von der gleichen Version von SyMRI quantifiziert und
segmentiert wurden.
ACHTUNG: SyMaps aus dem gleichen Datensatz, die jedoch mit verschie-
denen Versionen von SyMRI erstellt wurden, sind nicht identisch. Die Seg-
mentierung wird basierend auf der Kombination von R1, R2 und PD jedes
Voxel durchgeführt. Deshalb können Unterschiede in SyMaps Auswirkungen
auf die Segmentierung und das gemessene Volumen haben. Kurz: die Ver-
wendung von SyMaps, die mit verschiedenen Versionen von SyMRI erzeugt
wurden, kann zu unterschiedlichen Volumina führen, auch wenn beide auf
den gleichen MDME-Aufnahmedaten basieren und in die gleiche Version von
SyMRI geladen werden.

6 Warnungen
6.4 Weitere Warnungen

6.4.1 Systemanforderungen
WARNUNG: SyMRI darf nur entsprechend der Systemanforderungen be-

nutzt werden. Abweichungen von den Systemanforderungen können fast un-
merkliche Veränderungen verursachen, aber auch dazu führen, dass Daten-
sätze von SyMRI nicht mehr geladen werden können. Ein Versuch, Daten zu
laden, die nicht gemäß den Bestimmungen der Systemanforderungen erstellt
wurden, verstößt gegen den vorgesehenen Einsatz von SyMRI.
6.4.1.1 Schnittspalt
Der Schnittspalt betrifft die Quantifizierung von R2 (T2) und die Volumenschätzun-
gen in der Segmentierung. Der empfohlene Schnittspalt beträgt 25 % der Schnittstärke.
Dieser Spalt ist empfohlen, da er einen guten Ausgleich zwischen Übersprechen und
Volumenschätzungsfehlern bietet.
ACHTUNG: Der Schnittspalt sollte mindestens 10 % der Schnittstärke be-
tragen, um ein Übersprechen zwischen den Schichten zu verhindern. Über-
sprechen hat Auswirkungen auf die Quantifizierung von R2 (T2) und führt
dazu, dass R2 überschätzt wird. Das führt zu einer Überschätzung des MyC-
Inhalts.
Wenn der Schnittspalt breit ist, kann der Schätzungsfehler für Gewebevolumina inner-
halb des Schnittspalt steigen. Siehe Abschnitt 6.3.4.1.
6.4.1.2 Schnittstärke
Die Schnittstärke hat Auswirkungen auf die Quantifizierung, Auflösung von kleinen
Merkmalen und das Risiko von Flussartefakten. Die empfohlene Schnittstärke bietet
einen guten Ausgleich zwischen Auflösung und Flussartefakten.
Wenn die Schichten dünn sind, ist ein Auftreten von Flussartefakten wahrscheinlicher.
Weitere Informationen sind in Abschnitt 6.2.2 zu finden.
Wenn die Schichten dick sind, wird die Quantifizierung von Teilvolumeneffekten beein-
flusst. Weitere Informationen sind in Abschnitt 6.2.3 zu finden.

6 Warnungen
6.4.2 Nachuntersuchungen mit anderen Analyseinstrumenten
WARNUNG: Verschiedene Analyseinstrumente verwenden unterschiedliche

Modelle und Methoden zur Volumenschätzung und dabei auch verschie-
dene Gewebedefinitionen. Das führt zu systematischen Unterschieden
zwischen unterschiedlichen Instrumenten. Der Vergleich von Volumina
des SyMRI und anderen Analyseinstrumenten in Nachuntersuchungen
können zu falschen Interpretationen und/oder Schlüssen führen. Wenn
die Segmentierungsvolumina von z. B. NeuroQuant, basierend auf einer
T1W 3D-Aufnahme, mit den Volumina von SyMRI, basierend auf einer
2D MDME-Aufnahme verglichen werden, können sie aus verschiedenen
Gründen voneinander abweichen. Unter anderem unterscheiden sich die
Gewebedefinitionen in NeuroQuant und SyMRI voneinander. SyMRI
verwendet beispielsweise Teilvolumina, während NeuroQuant jedem Voxel
einen Gewebetyp zuweist.
Allgemein sollte der Vergleich von Daten aus verschiedenen Analyse-
instrumenten vermieden werden, außer es liegt eine Rechtfertigung für die
Gültigkeit des Vergleichs der verschiedenen Analyseinstrumente vor.
SyntheticMR AB empfiehlt dringend, immer dasselbe Analyseinstrument

zu verwenden, um sicherzustellen, dass Daten aus Nachuntersuchungen
verglichen werden können und Vergleiche nur nach dem entsprechenden
klinischen Protokoll und der Vorgehensweisen für Nachuntersuchungen
durchgeführt werden.
Hinweis: SyMRI kann nur Gewebevolumina von Daten aus Sequenzen, die für die Ver-
wendung mit SyMRI genehmigt wurden, analysieren. Eine Liste mit den genehmigten
Sequenzen mit den empfohlenen Sequenzparametern ist in FORM 75-10 System Requi-
rement List zu finden.
6.4.3 Zeichenkodierung
WARNUNG: Wenn ein Datensatz mit nicht westeuropäischen Buchstaben

für Textinformationen im HUD in SyMRI geladen wird, werden diese Infor-
mationen nicht ordnungsgemäß angezeigt. Weitere Informationen über die
im HUD angezeigten Textinformationen sind in Abschnitt 3.2.1.1 zu finden.
6.4.4 Anonymisierungssoftware
WARNUNG: SyMRI verwendet bestimmte private DICOM-Tags, um Da-

tensätze laden zu können (siehe DICOM-Konformitätserklärung). Sollte eine
Anonymisierungssoftware verwendet werden, überprüfen Sie, ob diese Tags
erhalten sind.

6 Warnungen
6.5 Scanner-spezifische Warnungen

6.5.1 GE
Die folgenden Warnungen gelten nur für die Verwendung an GE-MRT-Scannern.
6.5.1.1 Anonymization
ACHTUNG: GE verwendet private DICOM-Tags, um ein paar Aufnahme-

parameter zu speichern, die SyMRI benötigt. Um diese Tags bei der Anony-
misierung zu erhalten, sind Anonymisierungstools von GE zu verwenden.
Datensätze mit fehlenden Tags können von SyMRI nicht geöffnet werden.
Die von SyMRI erforderlichen Tags sind in der Konformitätserklärung von DICOM auf-
geführt. Wenn ein Anonymisierungstool von einem anderen Anbieter als GE verwendet
wird, stellen Sie bitte sicher, dass die erforderlichen Tags beibehalten wurden.
6.5.2 Philips
Die folgenden Warnungen gelten nur für die Verwendung an Philips-MRT-Scannern.
6.5.2.1 Mehrere Pakete

Beachten Sie, dass der Scanner aufgrund der FORM 75-10 System Requirement List
nicht mehrere Pakete erstellt.
Bei MRT-Scannern von Philips mit der Philips-Softwareversion 4.x.y (nur für 3T verfüg-
bar) oder 5.1.x (sowohl für 1.5T als auch 3T verfügbar), zeigt die Scanner-Konsole, dass
sie mehrere Pakete erzeugt, diese Informationen jedoch nicht in den DICOM-Objekten
speichert; das bedeutet, dass es für die Software zur Nachbearbeitung, wie z. B. SyMRI,
nach dem Scanvorgang unmöglich ist, zu erkennen, ob der Scanner mehrere Pakete er-
zeugt hat. Deshalb muss der Bediener des Scanners sicherstellen, dass der Scanner mel-
det, dass er nicht mehrere Pakete erstellen wird.
Ab der Philips-Softwareversion 5.2.x erzeugen mehrere Pakete eine Konfliktmeldung auf
der Untersuchungskarte und der Scanvorgang kann nicht gestartet werden.
WARNUNG: Das Laden von mehreren Paketdaten kann zu unvorhersehba-

ren Ergebnissen führen, die möglicherweise nicht als inkorrekte Daten er-
kannt werden.
6.5.2.2 Reihenfolge der Schichten
ACHTUNG: Bei MRT-Scannern von Philips mit der Software-Verson 4.x.y

(nur für 3T verfügbar) oder 5.1.x (sowohl für 1.5T als auch für 3T verfügbar)
müssen Sie darauf achten, dass die Reihenfolge der Schichten in der Unter-
suchungskarte auf Aufsteigend oder Absteigend und nicht auf Standard oder
Überlappend eingestellt ist.
Bei Letzterem oszilliert die Quantifizierung von T1 zwischen den Schichten, was sichtbar
gemacht werden kann, indem Sie ein großes ROI auswählen und durch die Schichten
scrollen. Die Kurve für normales Hirngewebe im R1-R2-Plot verschiebt sich dann bei fast
jeder zweiten Schicht nach rechts/links. Ab der Philips-Softwareversion 5.2.x wurden die
Optionen für die Schichtreihenfolge „Standard“ und „Verschachtelt“ entfernt.

6 Warnungen
6.5.3 Siemens
Die folgenden Warnungen gelten nur für die Verwendung an Siemens-MRT-Scannern.
Hinweis: Die Verwendung von SyMRI auf MDME-Eingabedaten von Siemens-

Scannern ist durch die US FDA noch nicht nach 510(k) zugelassen und des-
halb in den USA noch nicht zu kaufen, außer für eingeschränkten Forschungs-
und Untersuchungsgebrauch.
6.5.3.1 Patientenlage
ACHTUNG: Positionieren Sie den Patienten immer so, dass die abgebilde-
te Anatomie im ISO-Zentrum des Scanners platziert ist. Wenn der Patient
falsch liegt, ist das B1-Feld suboptimal und die Quantifizierung wird unter
Umständen nicht korrekt durchgeführt.
MRT-Scanner haben in der Mitte der Spule, dem ISO-Zentrum des Magnetfeldes, die
besten Abbildebedingungen. Durch die Verwendung eines Laser zur ordnungsgemäßen
Positionierung des Patienten kann eine optimale Quantifizierung und somit eine optimale
Bildqualität der synthetischen Bilder sichergestellt werden.

Teil V
Appendix

7 Tastenkombinationen
Eine Liste aller Tastenkombinationen und deren Funktion finden Sie unter SyMRI.
Am macOS unterscheiden sich die folgenden Tastenkombinationen von Windows:
macOS • Anstatt Strg.
• F13 anstatt Einfg.
Tastenkombination Funktion
1 T1W
2 T2W
3 T2W FLAIR
4 STIR
5 PSIR
Bild-nach-oben Zur vorherigen Schicht gehen

Pfeil nach oben Zur vorherigen Schicht gehen1
Bild-nach-unten Zur nächsten Schicht gehen
Pfeil nach unten Zur nächsten Schicht gehen1
Pos1 Zur ersten Schicht gehen
Ende Zur letzten Schicht gehen
Strg+R Kontrast Layout

Strg+F Layout SyMaps
A Autom.skal.
C Farbe
Strg+Z Vergrößern
Strg+Shift+Z Verkleinern
Strg+P Interpoliert
Strg+X ROI schneiden

Strg+C ROI kopieren
Strg+V ROI einfügen
Rücktaste ROI deaktivieren
Tab Nächste ROI aktivieren2
Shift+Tab Vorherige ROI aktivieren2
Strg+1 1 Bildfenster
1
Diese Tastenkombination steht in SyMRI Plug-In nicht zur Verfügung, da sie im Sectra PACS IDS7-
Hostfenster verwendet wird.
2
Für Mehrere ROIs

F4 Seitenw. Anz.
F5 Schwenken1
P Schwenken
F6 Freihand-ROI
F7 Rechtecks-ROI
Z Zoom-Werkzeug
Q TE einstellen
W TR einstellen
E TR/TE einstellen
R TI einstellen
T TI-TI einstellen3
Strg+I Inversions-Vorimpuls
Strg+O Öffnen...
Strg+Shift+S Alle sichtbaren Stapel speichern im lok. Verzeichnis...
Schwenken ist auch verfügbar, wenn man die «Shift» Taste gedrückt hält. Zoom-
Werkzeug ist auch verfügbar, wenn man die «Strg» Taste gedrückt hält.
«S» und «F» können zusammen mit TR einstellen, TI einstellen oder TI-TI einstellen
verwendet werden, um die Rate, mit der die Zeitparameter beim Bewegen des Cursors
verändert werden, zu reduzieren oder zu erhöhen. Sie können ebenso verwendet werden,
um schneller zwischen den Schnitten zu scrollen und um das Fensterung anzupassen.
Wenn die Funktion Benutzermaske zur Verfügung steht, können die folgenden Tasten-
kombinationen verwendet werden.
U Benutzermaske zeigen
Strg+B Hintergrund deaktivieren
Mit SyMRI NEURO sind die folgenden Tastenkombinationen auch verfügbar.
Strg+S Segmentierungslayout
6 Segmentierungstabelle
7 Weiße Substanz
8 Graue Substanz
9 Hirn-Rückenmarksflüss.
0 NON-WM/GM/CSF
Y Myelin (MyC)
I Intrakranielle Maske
H Intrakranialen Maskenrand zeigen
Strg+B Hintergrund deaktivieren
Einfügen Zur intrakranieller Maske hinzufügen

Löschen Aus intrakranieller Maske entfernen
M Zu Benutzermaske hinzufügen
Komma (,) Gewebe in ROIin Benutzermaske kopieren - Vergrößern
3
sDIR-Lizenz erforderlich.

Punkt (.) Gewebe in ROIin Benutzermaske kopieren - Teilvolumen

Subtraktion (-) Aus Benutzermaske entfernen
Strg+C Segmentierungstabelle kopieren

®
SyMRI® 11
SyMRI
Version 11.0.7
SyntheticMR AB
Storgatan 11
UDI: (01)07340024700030(8012)11.0.7 SE-582 23 Linköping, SWEDEN
®
SyMRI
SyntheticMR AB
2018-08-30
Manual de usuario
Versión 11.0.7
UDI: (01)07340024700030(8012)11.0.7
SyMRI 11
Reglamentos aplicables
Estas secciones contienen información importante sobre la autorización reglamentaria y
el uso de SyMRI. Tenga en cuenta que SyMRI está clasificado como dispositivo médico
(MD) y, por tanto, está sujeto a la reglamentación aplicable al uso clínico y no clínico.
Por ejemplo, en la Unión Europea se aplica la Directiva sobre productos sanitarios
(MDD).
SyMRI solo puede utilizarse en los casos en los que la ley lo permita; consulte a las
autoridades locales y a SyntheticMR AB si no está seguro sobre si es lícito utilizar esta
versión de SyMRI en su ámbito de actividad.
ADVERTENCIA: Si el ámbito reglamentario aplicable en su caso no aparece

enumerado en esta sección, SyMRI no puede utilizarse para ninguna otra
finalidad que no sea la demostración o la investigación en calidad de producto
no sanitario y no debe utilizarse para el diagnóstico ni para cualquier otro
tipo de fines relacionados con la atención al paciente.
La indicación «La legislación médica es de aplicación (Página i)» que aparece al pie en
todas las páginas de este manual es una referencia a esta sección para más información.
Uso certificado
SyMRI cumple los siguientes requisitos reglamentarios. El uso está sujeto a la normativa
local y a las condiciones de la reglamentación. Es posible que sean aplicables otros
reglamentos, condiciones o restricciones adicionales.
• CE (Unión Europea):
SyMRI 11 es un producto sanitario con marcado CE que cumple la Directiva del
Consejo 93/42/CEE (MDD).
0413
• USA/HSS (FDA):
PRECAUCIÓN: Las leyes federales de Estados Unidos solo permiten la

venta de este dispositivo a médicos o por prescripción facultativa.
• Australia (Therapeutic Goods Administration, TGA):

Para el mercado australiano, el responsable de cumplimiento de la normativa es:
65 Epping Road
No para uso clínico (NFCU)

En esta sección se enumeran ámbitos de actividad en los que puede utilizarse SyMRI con
determinadas restricciones en un entorno no clínico (NFCU, del inglés «Not For Clinical
Use»). Para los ámbitos de actividad para los que pueda ser aplicable un uso NFCU,
SyMRI® La legislación médica es de aplicación (Página i) i

preste atención al texto de advertencia oportuno y a cualquier reglamento, restricción o
condición adicional que pueda ser aplicable.
• Canadá y países en los que sea aplicable la reglamentación de Health Canada

(Ministerio de Salud de Canadá):

pétents
SyMRI® La legislación médica es de aplicación (Página i) ii

Índice general
Índice general
Reglamentos aplicables . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . i
Uso certificado . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . i
No para uso clínico (NFCU) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . i
1 Introducción 1
1.1 Descripción del dispositivo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1
1.2 Uso previsto . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2
1.2.1 Indicaciones de uso . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2
1.3 Ventajas de SyMRI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3
1.4 Abreviaturas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4
1.5 Advertencias, precauciones y notas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
1.5.1 Nota . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
1.5.2 PRECAUCIÓN . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
1.5.3 ADVERTENCIA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
I Trabajo con SyMRI® 7
2 Versiones de SyMRI 8
2.1 SyMRI para Sectra PACS IDS7 (Plug-In) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
2.1.1 Inicio y cierre . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
2.1.1.1 Cómo iniciar SyMRI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
2.1.1.2 Cómo cerrar SyMRI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
2.2 SyMRI StandAlone para Microsoft Windows . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
2.2.1 Inicio y cierre . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
2.3 SyMRI StandAlone para macOS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
2.3.1 Inicio y cierre . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
2.3.2 Teclas de método abreviado . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
2.4 SyMRI para red . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12
2.4.1 Inicio y cierre . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12
3 Conceptos y funciones 13
3.1 Conceptos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13
3.1.1 Paquete . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13
3.1.1.1 SyMRI IMAGE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13
3.1.1.2 SyMRI NEURO . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13
3.2 Espacio de trabajo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14
3.2.1 Cuadro de visualización . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14
3.2.1.1 Información de la imagen del cuadro de visualización . . . . . 15
3.3 Barra de herramientas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17
SyMRI® La legislación médica es de aplicación (Página i) iii

Índice general
3.4 Opciones y preferencias . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18

3.4.1 Opciones de diseño . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18
3.4.2 Opciones de vista . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18
3.4.3 Otros . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19
3.5 Visualización de imágenes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
3.5.1 Zoom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
3.5.2 Navegar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
3.5.3 Configuración de la ventana . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
II SyMRI® IMAGE 21
4 Funciones de SyMRI IMAGE 22

4.1 Imágenes sintéticas de contraste ponderado . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23
4.1.1 Visualización de imágenes sintéticas de contraste ponderado . . . . . . 23
4.1.2 Ajuste del contraste de imagen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24
4.1.3 Ajuste de imágenes FLAIR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25
4.1.4 Ajuste de imágenes de IR doble . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26
4.1.5 Ventana de navegación para imágenes de contraste . . . . . . . . . . . 26
4.2 SyMaps . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28
4.2.1 Visualización de SyMaps . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28
4.3 Región de interés (ROI) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30
4.3.1 Creación y ajuste de una ROI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30
4.3.2 Información en la ROI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30
4.3.3 Preferencias de ROI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31
4.3.4 Funciones de una ROI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31
4.4 Gráficas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33
4.5 Guardado y carga . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
4.5.1 Guardado de SyMaps . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
4.5.1.1 Ahorro de tiempo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35
4.5.2 Guardado de una captura de pantalla del espacio de trabajo . . . . . . 35
4.5.3 Guardado de pilas de imágenes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35
4.5.3.1 Guardado de la pila actual . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35
4.5.3.2 Guardado de todas las pilas visibles . . . . . . . . . . . . . . 36
III SyMRI® NEURO 37
5 Funciones de SyMRI NEURO 38

5.1 Máscara intracraneal . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39
5.1.1 Ajuste de la máscara intracraneal . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39
5.1.2 Funciones adicionales para la máscara intracraneal . . . . . . . . . . . 40
5.2 Segmentación tisular . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 42
5.2.1 Segmentación de parénquima cerebral y CSF . . . . . . . . . . . . . . 42
5.2.2 Asignación de volumen parcial correlacionado con la mielina (MyC) . . 42
5.3 Mapas de segmentación . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 44
5.3.1 Visualización de mapas de segmentación . . . . . . . . . . . . . . . . . 44
5.3.2 Imagen de fondo para la segmentación . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45
SyMRI® La legislación médica es de aplicación (Página i) iv

Índice general
5.4 Máscara de usuario para una segmentación definida por el usuario . . . . . . . 47

5.4.1 Visualización de la máscara de usuario . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47
5.4.2 Medición del volumen con la máscara de usuario . . . . . . . . . . . . 47
5.4.3 Creación y ajuste de la máscara de usuario . . . . . . . . . . . . . . . 47
5.4.3.1 Edición de la máscara de usuario mediante una ROI . . . . . 47
5.4.3.2 Formas adicionales de ajustar la máscara de usuario . . . . . 48
5.4.4 Guardado y carga de la máscara de usuario . . . . . . . . . . . . . . . 49
5.5 Tabla de segmentación . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 50
5.5.1 Visualización de volúmenes por corte . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 50
5.5.2 Máscara de usuario en la tabla de segmentación . . . . . . . . . . . . . 51
5.5.3 Exportación de la tabla de segmentación . . . . . . . . . . . . . . . . . 51
5.6 ROI en SyMRI NEURO . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 52
5.6.1 Medición del volumen del tejido segmentado . . . . . . . . . . . . . . 52
5.7 Gráficas en SyMRI NEURO . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53
IV Información importante 54
6 Advertencias 55
6.1 Artefactos de imagen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55
6.1.1 Artefactos de movimiento . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55
6.2 Desviaciones: MRI sintéticas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56
6.2.1 Sangre negra . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56
6.2.2 Sensibilidad al flujo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56
6.2.3 Posible desaparición de pequeñas peculiaridades . . . . . . . . . . . . . 57
6.3 Funciones específicas para MRI sintéticas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58
6.3.1 Usar ROI hasta tejido nulo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58
6.3.2 Mediciones cuantitativas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58
6.3.2.1 Rango dinámico . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59
6.3.3 Segmentación . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59
6.3.4 Factores que afectan a las estimaciones de volumen . . . . . . . . . . . 60
6.3.4.1 Precisión . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 60
6.3.4.2 Repetibilidad . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61
6.4 Advertencias adicionales . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63
6.4.1 Requisitos del sistema . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63
6.4.1.1 Espacio entre cortes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63
6.4.1.2 Grosor de corte . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63
6.4.2 Exploraciones de seguimiento utilizando distintas herramientas de análisis 64
6.4.3 Codificación de caracteres . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
6.4.4 Software de anonimización . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
6.5 Advertencias específicas del escáner . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65
6.5.1 GE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65
6.5.1.1 Anonimización . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65
6.5.2 Philips . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65
6.5.2.1 Paquetes múltiples . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65
6.5.2.2 Orden de cortes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65
6.5.3 Siemens . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66
6.5.3.1 Posición del paciente . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66
SyMRI® La legislación médica es de aplicación (Página i) v

Índice general
V Apéndice 67
7 Teclas de método abreviado 68
SyMRI® La legislación médica es de aplicación (Página i) vi

1 Introducción
1 Introducción
1.1 Descripción del dispositivo
SyMRI permite al usuario generar múltiples contrastes de imagen a partir de un solo
escaneo de adquisición. Esto se logra mediante el posprocesamiento de una adquisición
multi-retardo, multi-eco (MDME) y su conversión en mapas paramétricos. Los mapas
paramétricos son las tasas de relajación R1 y R2 y la densidad protónica (PD). Los
parámetros de relajación inversa, el tiempo de relajación T1 (1/R1) y el tiempo de
relajación T2 (1/R2) también se ofrecen como mapas paramétricos. Los mapas para-
métricos se pueden visualizar en forma de imágenes de RM de contraste ponderado,
por ejemplo T1W, T2W o PDW, y en forma de imágenes de recuperación de inversión
(IR) ponderada (entre ellas, imágenes ponderadas T1W FLAIR, T2W FLAIR, STIR,
IR doble y PSIR). SyMRI calcula la intensidad de la señal de píxeles en función de R1,
R2, PD y los ajustes de escáner de RM deseados, como tiempo de eco (TE), tiempo de
repetición (TR) y tiempo de retardo de inversión (TI). Se ofrece una serie de ajustes
predeterminados para TE, TR y TI, pero el usuario puede cambiar el contraste de las
imágenes. SyMRI genera todos los distintos contrastes de imagen a partir de los mismos
mapas paramétricos, derivados de la misma adquisición. Esto desemboca en un registro
mejorado del corte de imagen gracias a la ausencia de movimientos del paciente entre
las adquisiciones. SyMRI brinda al usuario la posibilidad de cambiar el contraste de las
imágenes tras la adquisición. Esto se realiza ajustando los parámetros TE, TR y/o TI
tras la adquisición para generar el contraste específico deseado.
SyMRI también permite a los usuarios obtener información volumétrica de la cabeza,
por ejemplo, materia blanca (WM), materia gris (GM), líquido cefalorraquídeo (CSF),
volumen parcial correlacionado con la mielina (MyC), parénquima cerebral (BP) y ca-
vidad intracraneal (IC). Esto se logra utilizando definiciones de tejido basadas en los
mapas paramétricos. Las definiciones de tejidos proporcionan el volumen parcial tisular,
o la fracción tisular, por vóxel. SyMRI también ofrece herramientas de procesamiento de
imágenes para extraer los valores de los mapas paramétricos y el volumen parcial tisular
por píxel individual, por región de interés o todo el volumen de imágenes.
SyMRI está concebido para el uso con datos generados por cualquiera de las siguientes
secuencias de adquisición:
• Datos de secuencia MDME de GE MAGiC
• Datos de secuencia MDME de Philips SyntAc
• Datos de secuencia MDME de Siemens MDME (C2P)1
1
Aún sin autorización 510(k) de la FDA de Estados Unidos y, por tanto, no disponible actualmente
para la venta en Estados Unidos salvo de forma limitada a la investigación o el uso con fines de
investigación.
SyMRI® La legislación médica es de aplicación (Página i) 1

1 Introducción
1.2 Uso previsto

1.2.1 Indicaciones de uso
SyMRI es un dispositivo médico de software de posprocesamiento previsto para el uso
en la visualización del cerebro. SyMRI analiza los datos de entrada de los sistemas de
imagen de RM. SyMRI utiliza datos obtenidos a partir de una adquisición multi-retardo,
multi-eco (MDME) para generar mapas paramétricos de las tasas de relajación R1 y R2
y la densidad protónica (PD). SyMRI puede generar múltiples contrastes de imagen a
partir de los mapas paramétricos. SyMRI permite el ajuste del contraste de la imagen
tras la adquisición. SyMRI está indicado para generar imágenes de la cabeza.
SyMRI también está previsto para el etiquetado automático, la visualización y la cuan-
tificación volumétrica de tejidos cerebrales a partir de una serie de imágenes de RM. Los
volúmenes de tejido cerebral se determinan en función del modelado de mapas paramé-
tricos a partir de imágenes MDME.
Si la persona que las interpreta es un médico con la debida formación, las imágenes de
SyMRI pueden proporcionar información útil para determinar el diagnóstico. SyMRI de-
be utilizarse siempre en combinación con al menos otra adquisición de RM convencional
(p. ej., T2W FLAIR).

1 Introducción
1.3 Ventajas de SyMRI

SyMRI solo utiliza una única adquisición para obtener los valores R1, R2 y PD. Es posible
mostrar imágenes sintéticas T1W, T2W y FLAIR con cualquier opción de tiempo de eco
TE, tiempo de repetición TR y tiempo de retardo de inversión TI sin necesidad de volver
a escanear al paciente. Por lo tanto, este método permite ahorrar un valioso tiempo de
escaneo para la exploración por RM.
PRECAUCIÓN: La imagen T2W FLAIR sintética muestra un efecto de real-
ce de bordes en la interfaz de CSF y tejido cerebral. Este efecto es fruto de
los efectos de volumen parcial de los vóxeles de adquisición en la interfaz.
El uso del contraste T2W FLAIR sintético depende de la cuestión clínica. La imagen
T2W FLAIR sintética tiene una excelente sensibilidad para los cambios del tejido cere-
bral.
PRECAUCIÓN: Recomendamos que cualquier cambio visible en T2W FLAIR
se confirme mediante la imagen T2W, PDW, PSIR o IR doble del mismo
conjunto de datos sintético.
Como todas las imágenes sintéticas de contraste ponderado están generadas a partir
de los mismos mapas paramétricos, a partir de la misma adquisición, se registrarán
las imágenes sintéticas. Esto quiere decir que un hallazgo en T2W FLAIR aparecerá
exactamente en el mismo píxel en las demás ponderaciones sintéticas de contraste (T2W,
PDW, PSIR o IR doble) para su confirmación o desestimación como falso positivo.
PRECAUCIÓN: Para el diagnóstico de patologías que tengan como resultado
el realce de bordes en T2W FLAIR, por ejemplo, hemorragias o reacciones
inflamatorias, puede que la secuencia sintética por sí sola no sea suficiente
para el diagnóstico. En caso de duda se recomienda añadir, por ejemplo, una
secuencia 3D-FLAIR convencional.
ADVERTENCIA: No deben tomarse decisiones de atención al paciente úni-

camente sobre la base de imágenes sintéticas de contraste ponderado ob-
tenidas con SyMRI, que debe utilizarse siempre en combinación con MRI
convencionales u otras herramientas de diagnóstico aplicables.
Las funciones de segmentación tisular ofrecen medidas cuantitativas. Esto puede servir
de ayuda para una evaluación objetiva del paciente.
En este manual de usuario se ofrece una vista general de todas las funcionalidades
disponibles y se describen todos los conceptos utilizados en el software.

1 Introducción
1.4 Abreviaturas
En el manual se utilizan las siguientes abreviaturas.
BPV Volumen del parénquima cerebral; volumen de todos los teji-

dos del ICV excluyendo el volumen del CSF
(del inglés Brain Parenchymal Volume)
BPF Fracción del parénquima cerebral, el BPV dividido entre el
ICV
(del inglés Brain Parenchymal Fraction)
CSF Definición de SyMRI del líquido cefalorraquídeo (consulte la
Apartado 5.2)
(del inglés Cerebrospinal Fluid)
DIR IRdoble, imagen de recuperación de inversión con dos momen-
tos de inversión
(del inglés Double Inversion Recovery)
FLAIR Recuperación de inversión por atenuación de fluido; imagen de
resonancia magnética en la que se suprime la señal del CSF
(del inglés FLuid Attenuated Inversion Recovery)
GM Definición de SyMRI de la materia gris (consulte el Apartado
5.2)
(del inglés Gray Matter)
HUD Información que aparece al lado de una imagen en SyMRI,
como información del paciente y de la imagen
(del inglés Heads-up Display)
ICV Volumen intracraneal; volumen total de la máscara intracra-
neal
(del inglés Intra-Cranial Volume)
IR Recuperación de inversión; imágenes en las que se aplica un
preimpulso de inversión.
(del inglés Inversion Recovery)
MRI Imágenes por resonancia magnética
MyC Definición de SyMRI del tejido correlacionado con la mielina
(del inglés Myelin Correlated)
NON-WM/GM/CSF Tejido con características que difieren de WM, GM y CSF
(consulte el Apartado 5.2)
PD Densidad protónica
(del inglés Proton Density)
PDW Imagen de contraste ponderado en densidad protónica, nor-
malmente TE corto y TR largo
(del inglés Proton Density Weighted)
PSIR Recuperación de inversión sensible a la fase; imagen con re-
cuperación de inversión en la que se mantiene el signo de la
señal
(del inglés Phase Sensitive Inversion Recovery)
R1 Tasa de relajación R1 longitudinal (1/T1)
R2 Tasa de relajación R2 transversal (1/T2)
ROI Región de interés; una región definida por el usuario en un
corte en el conjunto de datos, dibujado con una herramienta
ROI
(del inglés Region of Interest)

1 Introducción
STIR Imagen IR en T1 corta, técnica de supresión de grasa

(del inglés Short Tau/TI Inversion Recovery)
SyMaps Mapa que muestra uno de los valores cuantitativos T1, T2,
R1, R2 o PD
T1 Tiempo de relajación T1 longitudinal (1/R1)
T1W Imagen de contraste ponderado en T1, normalmente TE corto
y TR corto
(del inglés T1 Weighted)
T2 Tiempo de relajación T2 transversal (1/R2)
T2W Imagen de contraste ponderado en T2, normalmente TE largo
y TR largo
(del inglés T2 Weighted)
TE Tiempo de eco
TI Tiempo de retardo de inversión tras un impulso de inversión
TR Tiempo de repetición
UM Máscara usuario, consulte el Apartado 5.4
(del inglés User Mask)
WM Definición de SyMRI de la materia blanca (mielinizada) (con-
sulte el Apartado 5.2)
(del inglés White Matter)

1 Introducción
1.5 Advertencias, precauciones y notas

1.5.1 Nota
Las notas contienen información importante sobre las funciones de SyMRI que es nece-
sario resaltar. La información que se presenta en las notas incluye sugerencias útiles y
limitaciones específicas en la disponibilidad de ciertas funciones; también resalta com-
portamientos de SyMRI que pudieran no ser intuitivos para el usuario.
Nota: Ejemplo de nota
1.5.2 PRECAUCIÓN
Las precauciones indican situaciones potencialmente peligrosas para el paciente o el
usuario que podrían provocar una pérdida de tiempo, una reducción de la calidad de la
imagen o la necesidad de repetir la exploración del paciente. Las precauciones también
indican el modo de evitar dichas situaciones.
PRECAUCIÓN: Ejemplo de precaución
1.5.3 ADVERTENCIA
Las advertencias indican situaciones potencialmente peligrosas que podrían provocar
daños en el paciente, principalmente por un error de interpretación o diagnóstico. Las
advertencias también indican el modo de evitar dichas situaciones.
El símbolo de advertencia ISO 15223-1:2016 se utiliza junto a estas advertencias para
resaltar su importancia.
ADVERTENCIA: Ejemplo de advertencia

Parte I
Trabajo con SyMRI®
La legislación médica es de aplicación (Página i)

2 Versiones de SyMRI
SyMRI está disponible en varias versiones. En función del sistema y la licencia que tenga,
habrá disponibles uno o más modos de instalación.
Diríjase al responsable o al administrador del sistema si tiene alguna duda sobre las
versiones que puede utilizar.
En su mayor parte, las funcionalidades, el comportamiento y las interacciones de la

interfaz de usuario son idénticos para todas las versiones, mientras que algunos aspectos
difieren ligeramente. En los apartados siguientes de esta parte del manual de usuario se
describen las diferencias y algunas particularidades de las versiones.
En algunos puntos de las demás partes del manual de usuario hay secciones que solo
son aplicables a una de las versiones. Estas secciones están señalizadas con una nota al
margen y una barra vertical del siguiente modo:
Este párrafo solo es aplicable a SyMRI para Sectra PACS IDS7 (Plug-In). Plug-In
Este párrafo solo es aplicable a SyMRI StandAlone. StandAlone
Este párrafo solo es aplicable a SyMRI para Microsoft Windows. Windows
Este párrafo solo es aplicable a SyMRI para macOS. macOS
Este párrafo solo es aplicable a SyMRI para red. Network

2.1 SyMRI para Sectra PACS IDS7 (Plug-In)

Cuando SyMRI se utiliza como complemento en Sectra PACS IDS7, el menú y la barra
de herramientas de la aplicación aparecen en una ventana de barra de herramientas
flotante en vez de integrados en la ventana principal. La barra de herramientas flotante
se puede mover a discreción con total libertad.
El espacio de trabajo con la barra de herramientas flotante puede verse en la Figura 2.1.
Figura 2.1: Espacio de trabajo de SyMRI con barra de herramientas flotante.
2.1.1 Inicio y cierre

En este apartado se describe cómo iniciar SyMRI en una estación de trabajo Sectra IDS7.
2.1.1.1 Cómo iniciar SyMRI

• Abra Sectra IDS7 e inicie sesión.
• Abra la pila de imágenes deseada en una ventana de imágenes de Sectra IDS7.
• Seleccione la opción «SyMRI» en el menú de aplicación clínica.
• SyMRI arranca y se puede utilizar.
En caso de errores irrecuperables durante la carga, SyMRI se cerrará y regresará a Sectra

PACS IDS7 después de mostrar un cuadro de texto con información sobre el error.
2.1.1.2 Cómo cerrar SyMRI

SyMRI se cierra mediante el elemento de menú Archivo› Salir de SyMRI de la barra de
herramientas flotante (consulte el Apartado 3.3).
No cierre la ventana de imágenes de Sectra antes de salir de SyMRI porque esto puede
provocar un cierre incorrecto de SyMRI.

2.2 SyMRI StandAlone para Microsoft Windows

En este apartado se describe cómo iniciar la versión StandAlone de SyMRI.

• Inicie el programa independiente SyMRI.
• Haga clic en el fondo de la ventana principal y seleccione el conjunto de datos

deseado.
Si se produce un error en relación con el conjunto de datos durante la carga, SyMRI

regresará a la ventana principal, donde podrá hacer clic para comenzar a partir de otro
conjunto de datos distinto después de que aparezca un cuadro de texto con información
sobre el error. Si el error es irrecuperable, es posible que SyMRI se cierre después de
mostrar el mensaje de error.

SyMRI se puede cerrar mediante el elemento de menú Archivo› Salir de SyMRI de la
barra de herramientas (consulte el Apartado 3.3) o pulsando el botón de cierre de la
ventana principal.

2.3 SyMRI StandAlone para macOS

En este apartado se describe cómo iniciar la versión StandAlone de SyMRI.

• Inicie el programa independiente SyMRI.
• Haga clic en el fondo de la ventana principal y seleccione el conjunto de datos

deseado.
Si se produce un error en relación con el conjunto de datos durante la carga, SyMRI

regresará a la ventana principal, donde podrá hacer clic para comenzar a partir de otro
conjunto de datos distinto después de que aparezca un cuadro de texto con información
sobre el error. Si el error es irrecuperable, es posible que SyMRI se cierre después de
mostrar el mensaje de error.

SyMRI se puede cerrar mediante el elemento de menú SyMRI › Salir de SyMRI de la
barra de menús (consulte el Apartado 3.3) o pulsando el botón de cierre de la ventana
principal.
2.3.2 Teclas de método abreviado

En macOS, las siguientes teclas de método abreviado son distintas con respecto a
Windows:
• en lugar de Ctrl.
• F13 en lugar de Insert.

2.4 SyMRI para red

En este apartado se describe cómo se utiliza SyMRI en modo de conexión en red.

• Inicie SyMRI desde PACS.
• Dependiendo de si se ha seleccionado una sola serie o un estudio, aparecerá una

lista de las series que se pueden cargar.
• Si hay máscaras intracraneales o máscaras de usuario guardadas, es posible selec-

cionar una de ellas una vez cargada la serie desde la red.
En caso de errores irrecuperables durante la carga, SyMRI se cerrará después de mostrar

un cuadro de texto con información sobre el error.

SyMRI se puede cerrar mediante el elemento de menú Archivo› Salir de SyMRI de la
barra de herramientas (consulte el Apartado 3.3) o pulsando el botón de cierre de la
ventana principal.

3 Conceptos y funciones
En este capítulo se describen conceptos generales, funciones, comandos de usuario y
funciones accesibles en todos los paquetes de SyMRI. Las funcionalidades específicas
correspondientes a cada paquete individual se tratan en los capítulos siguientes.
3.1 Conceptos
3.1.1 Paquete
Hay dos paquetes disponibles en SyMRI: SyMRI IMAGE (Apartado 4) y SyMRI NEURO
(Apartado 5). En función de la licencia de la que disponga, podrá utilizar uno de ellos o
ambos.
Una vez cargado un conjunto de datos, es posible cambiar el paquete activo (si la licencia
lo permite) mediante el elemento de menú Preferencias › Intercambiar paquete.
3.1.1.1 SyMRI IMAGE

El paquete SyMRI IMAGE está disponible con licencia IMAGE o NEURO. En el Apar-
tado 4 encontrará una descripción del paquete SyMRI IMAGE y sus funcionalidades.
3.1.1.2 SyMRI NEURO

El paquete SyMRI NEURO solo está disponible con la licencia NEURO y se seleccio-
nará automáticamente cuando se cargue un conjunto de datos cerebrales y se clasifique
como cerebro (el texto: «Objeto reconocido: Cerebro» aparece en el lado izquierdo de la
imagen).
Si el conjunto de datos se clasifica como cualquier otro objeto/parte anatómica, en
su lugar se seleccionará el paquete SyMRI IMAGE. Puede cambiar a SyMRI NEURO
mediante el elemento de menú Preferencias ›Intercambiar paquete.
SyMRI NEURO contiene todas las funciones de imagen de SyMRI, pero también pro-
porciona segmentación tisular, cálculos de volumen y medidas BPF automáticas. En el
Apartado 5 encontrará una descripción del paquete SyMRI NEURO y sus funcionalida-
des.

3.2 Espacio de trabajo

La ventana entera que ocupa SyMRI se denomina «espacio de trabajo». El espacio de
trabajo (Figura 3.1) incluye uno o más cuadros de visualización con imágenes o tablas.
El espacio de trabajo se controla mediante el menú SyMRI y la barra de herramientas
(Apartado 3.3). También es posible utilizar el teclado y el ratón.
Figura 3.1: Espacio de trabajo de SyMRI configurado con cinco cuadros de vi-
sualización. El contenido de la barra de herramientas y los menús depende del
paquete que se esté utilizando y la licencia de la que se disponga.
3.2.1 Cuadro de visualización

Cada imagen o tabla independiente que aparece en el espacio de trabajo de SyMRI se
denomina «cuadro de visualización». Cada cuadro de visualización puede contener una
imagen con información (Figura 3.2) o (si la licencia lo permite) una tabla de volúmenes
de tejidos. El cuadro de visualización en el que se encuentra el puntero del ratón es
siempre el cuadro activo. El contenido del cuadro de visualización se controla mediante
el menú contextual.

Figura 3.2: Dos cuadros de visualización en el espacio de trabajo de SyMRI.

Cuando una ROI está activa, se muestra información adicional en el lado de-
recho del cuadro de visualización.
3.2.1.1 Información de la imagen del cuadro de visualización

La información de la imagen del cuadro de visualización también se denomina «HUD»
(del inglés Heads-Up Display). La información visualizada en el HUD depende del tipo
de imagen que aparece en el cuadro de visualización.
Información del paciente: La información del paciente se muestra en la esquina superior
izquierda e incluye el nombre del paciente, la ID, la edad y el sexo.
Información de exploración: La información de exploración aparece en la esquina su-
perior izquierda, debajo de la información del paciente. Se muestra el nombre del
protocolo, la fecha de adquisición y la hora y, si es aplicable, información sobre el
medio de contraste administrado.
Nota: Si alguna de las informaciones que se visualizan no está en el conjunto de datos
(por ejemplo, debido a la anonimización), la línea que generalmente muestra estos datos
se eliminará completamente del HUD y en su lugar aparecerán las líneas subsiguientes
para que no haya ningún espacio vacío.
ADVERTENCIA: La información sobre el medio de contraste/bolo solo se

muestra si el conjunto de datos contiene la etiqueta DICOM que indica
que se ha utilizado un medio de contraste o bolo en el escaneo. Cuando está
presente esta etiqueta, aparece una línea que empieza por «Contraste:». Si la
etiqueta está presente pero no tiene ningún valor, la línea será «Contraste:
Sí». Si la etiqueta tiene un valor personalizado, aparecerá el valor personali-
zado en vez de «Sí». Cuando esta etiqueta de DICOM no está presente (lo
que significa que no se ha utilizado ningún medio de contraste/bolo), la línea
de contraste/bolo no aparece.
Geometría de adquisición: La geometría de adquisición aparece en la esquina inferior

izquierda del cuadro de visualización. Incluye el FOV, el grosor del corte, la sepa-
ración entre cortes, el número de cortes y la posición del corte actual.

Zoom y configuración de la ventana: El zoom actual, así como el centro y la anchura

de la ventana, aparecen en la esquina superior derecha.
La información sobre la magnitud del contraste solo aparece en los cuadros de visuali-
zación que muestran una imagen con contraste ponderado.
Información sobre la magnitud del contraste: La información sobre la magnitud del con-
traste aparece en la esquina superior izquierda, debajo de la Información de ex-
ploración y en la parte superior del cuadro de visualización. La información de la
izquierda contiene los parámetros del escáner, como TE, TR, etc. (Apartado 4.1).
La magnitud del contraste actual se muestra en la parte superior del cuadro de
visualización.
Ventana de navegación: La ventana de navegación aparece en la esquina superior iz-
quierda, debajo del texto. (Apartado 4.1.5)
También hay algunos datos que solo aparecen cuando una ROI está activa en un cuadro
de visualización (Apartado 4.3).
Info ROI: La información estadística sobre la ROI aparece en la esquina superior de-
recha, debajo de la información de Zoom y configuración de la ventana. Muestra
datos sobre las propiedades del tejido dentro de la ROI, así como sobre la intensi-
dad de la señal (Apartado 4.3.2).
Gráfica de ROI: También aparece una gráfica de dispersión en la esquina inferior dere-
cha del cuadro de visualización (Apartado 4.4).
Puede aparecer cierta información adicional al utilizar una licencia de SyMRI NEURO
(Apartado III).

3.3 Barra de herramientas

Los comandos disponibles en la barra de herramientas de SyMRI son para todo el espacio
de trabajo y no solo para un cuadro de visualización específico. El contenido de la barra
de herramientas y los menús depende del paquete que se esté utilizando y de la licencia de
la que se disponga. La barra de herramientas contiene, por ejemplo, ajustes de idioma
y ajustes del espacio de trabajo. En la barra de herramientas también se encuentran
funciones para exportar capturas de pantalla y conjuntos de datos completos.
La disponibilidad de algunas funciones depende de la licencia con la que se cuente.
Figura 3.3: Barra de herramientas de SyMRI. En la parte superior se muestra

la barra de herramientas de SyMRI NEURO con la Herramienta AutoROI. En
la parte inferior se muestra la barra de herramientas de SyMRI IMAGE.
Los comandos específicos de la barra de herramientas y del menú contextual se describen

en los apartados siguientes.
Nota: Incluso aunque SyMRI esté integrado en Sectra IDS7, es un programa in-
dependiente. Las herramientas disponibles en la aplicación Sectra IDS7 NO pueden
utilizarse en SyMRI y viceversa. Solo las herramientas de la barra de herramientas
flotante de SyMRI se aplican a SyMRI.
Plug-In
Si pulsa el botón de cierre o cierra la ventana principal de Sectra IDS7 sin salir de
SyMRI, puede provocar que SyMRI finalice de forma incorrecta o que la ventana de
la barra de herramientas flotante siga estando accesible hasta que se seleccione un
nuevo paciente o una nueva exploración.
En macOS, la barra de menús se encuentra en la parte superior de la pantalla cuando

macOS
SyMRI está en primer plano.

3.4 Opciones y preferencias

3.4.1 Opciones de diseño
Es posible cambiar el número de cuadros de visualización.
Vista › 1 ventana «Ctrl+1» Se muestra un cuadro de visualización.

Vista › 2 ventanas «Ctrl+2» Se muestran dos cuadros de visualización.
Vista › 3 ventanas «Ctrl+3» Se muestran tres cuadros de visualización.
Vista › 4 ventanas «Ctrl+4» Se muestran cuatro cuadros de visualización.
Vista › 5 ventanas «Ctrl+5» Se muestran cinco cuadros de visualización.
Vista › 6 ventanas «Ctrl+6» Se muestran seis cuadros de visualización.
Es posible cargar y guardar los diseños de cuadros de visualización, incluidos los ajustes
de cada uno de ellos.
Preferencias› Guardar formato actual Se guarda el diseño actual con el número de vistas
de visualización, los parámetros temporales, el tipo de superposición, el tipo de SyMaps
y los ajustes de color. Al guardar el diseño, aparece un cuadro de diálogo que solicita un
nombre para el diseño.
Si hay diseños guardados, SyMRI seleccionará uno como diseño inicial siempre que se
inicie SyMRI. La selección del diseño depende de tres criterios:
1. Orientación de adquisición
2. Objeto reconocido
3. Intensidad de campo
Si no se encuentra una coincidencia exacta, se seleccionará la más aproximada a estos
criterios en el orden antes especificado.
Preferencias› Cargar formato Carga un diseño guardado. Cada diseño guardado es un
elemento de un submenú con el nombre asignado al guardar el diseño. Al seleccionar uno
de los elementos, se carga ese diseño. Este diseño se utilizará como diseño predeterminado
al abrir SyMRI.
Preferencias› Borrar disposición Borra un diseño guardado. Cada diseño guardado es
un elemento de un submenú con el nombre asignado al guardar el diseño. Al seleccionar
uno de los elementos, se borra ese diseño.
3.4.2 Opciones de vista

Vista › Enlazar Zoom y panorámica Todos los cuadros de visualización del espacio de
trabajo están vinculados. La panoramización y el zoom se ajustarán de forma simultánea
en todos los cuadros de visualización. De este modo, el zoom y la panoramización serán
idénticos para todas las imágenes.
Vista › Interpolar «Ctrl+P» La interpolación ofrece una visualización más fluida de las
imágenes con contraste ponderado y de SyMaps. La interpolación de imágenes se activa
de forma predeterminada y siempre está vinculada entre todos los cuadros de visualiza-
ción. Este ajuste no se ve afectado por la opción y no tiene efecto, Vista› Enlazar Zoom
y panorámica

Nota: Alejar el zoom mientras la interpolación está apagada puede provocar la aparición
de artefactos de solapamiento en la imagen.
Menú contextual › Config. de imagen › Color «C» Cuando la opción de color está acti-
vada, la pila de imágenes se muestra en color en vez de en escala de grises. Las imágenes
ponderadas sintéticas de contraste no se pueden visualizar en color.
3.4.3 Otros
Preferencias› Idioma (Language) Permite elegir el idioma deseado en la lista de idio-
mas disponibles. Cuando se utiliza cualquier otro idioma distinto del inglés, el elemento
de menú contiene siempre el texto «(Language)» (en inglés) detrás de la palabra que
signifique «idioma» en el idioma seleccionado en ese momento. El contenido del submenú
son los nombres de cada idioma disponible escritos en el idioma correspondiente.
Windows Archivo › Acerca de SyMRI Se muestra información sobre la versión de SyMRI que
se está ejecutando en esos momentos.
macOS SyMRI› Acerca de SyMRI Se muestra información sobre la versión de SyMRI que
se está ejecutando en esos momentos.

3.5 Visualización de imágenes

3.5.1 Zoom
Herram. zoom «Z» Un movimiento con el ratón al mismo tiempo que se mantiene
presionado el botón izquierdo del ratón permite aplicar el zoom a la pila de imágenes
en el cuadro de visualización. Los movimientos hacia delante sirven para acercar, y los
movimientos hacia atrás sirven para alejar. No es posible aplicar el zoom a tablas y
gráficas.
Menú contextual › Zoom › Acercar «Ctrl+Z» La imagen se agranda un incremento.
Menú contextual › Zoom › Alejar «Ctrl+Mayús+Z» La imagen se reduce un incremento.
Los pasos de zoom están predefinidos.
Menú contextual › Zoom › Ajustar a ventana El tamaño de la imagen se ajusta al tamaño

del cuadro de visualización.
Menú contextual › Zoom › Píxel a píxel Un vóxel del conjunto de datos DICOM original
se muestra utilizando un píxel de la pantalla del ordenador. Para los vóxeles no cua-
drados, el lado más corto del vóxel en el plano de la imagen se asigna a un píxel de la
pantalla del ordenador.
3.5.2 Navegar
Desplazamiento por la pila de imágenes: Para desplazarse por la pila de imágenes, des-
lice la rueda del ratón o utilice las teclas «Re Pág» y «Av Pág». Al primer corte
de una pila de imágenes se accede mediante la tecla «Inicio». Al último corte se
accede a través de la tecla «Fin».
En la barra de herramientas de SyMRI se pueden encontrar las siguientes funciones.
Herr paginación «F4» Un movimiento con el ratón al mismo tiempo que se mantiene
presionado el botón izquierdo del ratón permite desplazarse por la pila de imágenes.
Herr panor «F5» «P» Un movimiento con el ratón al mismo tiempo que se mantiene
presionado el botón izquierdo del ratón permite panoramizar la pila de imágenes en el
cuadro de visualización. Las tablas y las gráficas no se pueden panoramizar.
3.5.3 Configuración de la ventana

Configuración de la ventana: Mantenga pulsado el botón central o la rueda del ratón
para ajustar el contraste y la intensidad de la imagen. El movimiento horizontal
cambiará el centro de la ventana y el movimiento vertical cambiará la anchura de
la ventana. El centro y la anchura determinarán la escala de grises o de color de
la imagen, lo que, a su vez, afectará al brillo y al contraste.
Menú contextual› Config. de imagen › Escala auto «A» El brillo y el contraste de la

imagen se ajustan para adecuarse a la imagen del cuadro de visualización.

Parte II
SyMRI® IMAGE

4 Funciones de SyMRI IMAGE

En SyMRI IMAGE está disponible la funcionalidad para captar imágenes sintéticas por
resonancia magnética. Se utiliza un solo escaneo de cuantificación por RM para medir las
siguientes propiedades tisulares: tasas de relajación R1 y R2 y densidad protónica PD.
Tomando como base estas tres propiedades se pueden sintetizar imágenes de contraste
ponderado como T1W, T2W o FLAIR con cualquier opción de tiempo de eco TE, tiempo
de repetición TR, en caso de impulso de inversión, un tiempo de retardo de inversión
TI, y en caso de impulso de inversión doble, un tiempo de retardo de inversión TI2 de
un segundo.
Se proporcionan ajustes predeterminados para las imágenes de contraste ponderado co-
munes, pero el usuario puede modificar TE, TR, TI y TI2 a cualquier valor posible.
PRECAUCIÓN: Las imágenes sintéticas se adquieren y calculan de un modo
distinto que las imágenes convencionales reales y, por tanto, el contraste de
imagen, aunque muy similar, no es necesariamente idéntico, incluso con los
mismos ajustes para TE, TR y TI. Tómese su tiempo para dar con un ajuste
de TE, TR y TI con el que las imágenes tengan un aspecto similar al que
esté acostumbrado o que sea idóneo para satisfacer sus necesidades.
Las imágenes sintéticas deben interpretarse con cuidado, y se recomienda un
periodo de prueba para familiarizarse con las diferencias de matiz entre las
imágenes sintéticas y las convencionales.
Figura 4.1: Cuando se inicia SyMRI IMAGE aparecen cuatro cuadros de visua-
lización con imágenes sintéticas de contraste ponderado: T2W, T2W FLAIR,
PSIR y T1W

4.1 Imágenes sintéticas de contraste ponderado

Las imágenes sintéticas de contraste ponderado se calculan utilizando los valores R1, R2
y PD medidos en combinación con los ajustes TE, TR, TI y TI2 seleccionados.
4.1.1 Visualización de imágenes sintéticas de contraste ponderado

Es posible seleccionar varias ponderaciones de contraste predefinidas usando el menú
contextual o los comandos del teclado. Los ajustes disponibles dependen de la licencia
que se utilice.
Formato de contraste «Ctrl+R» Se muestran cuatro cuadros de visualización con imá-

genes de contraste: una imagen T2W, una imagen T2W FLAIR, una imagen T1W y una
imagen PSIR. Los valores predeterminados de TE, TR y TI se enumeran en la Tabla
4.1. En la Tabla 4.2 se muestran los valores predeterminados de DIR para los casos en
los que se utilice una licencia compatible con DIR.
Menú contextual › T1W «1» En el cuadro de visualización activo se muestra una imagen
ponderada en T1. En las imágenes ponderadas en T1 se ponderan las zonas de baja
densidad protónica para realzar el contraste de imagen entre materia gris y materia
blanca.
Menú contextual › T2W «2» En el cuadro de visualización activo se muestra una imagen
ponderada en T2.
Menú contextual› PDW En el cuadro de visualización activo se muestra una imagen
ponderada en PD.
Menú contextual › T1W FLAIR En el cuadro de visualización activo se muestra una
imagen de recuperación de inversión por atenuación de fluido ponderada en T1.
Menú contextual› T2W FLAIR «3» En el cuadro de visualización activo se muestra
una imagen de recuperación de inversión por atenuación de fluido ponderada en T2.
Menú contextual › STIR «4» En el cuadro de visualización activo se muestra una imagen
de recuperación de inversión de tau corta ponderada en T2.
Menú contextual› PSIR «5» En el cuadro de visualización activo se muestra una imagen
de recuperación de inversión sensible a la fase.
Menú contextual › PSIR (vaso) En el cuadro de visualización activo se muestra una
imagen de recuperación de inversión sensible a la fase para resaltar los vasos sanguíneos.
Menú contextual › IR doble (WM supp) En el cuadro de visualización activo se muestra
una imagen de recuperación de inversión doble que suprime tanto el valor de WM como
el valor de CSF.
Menú contextual › IR doble (GM supp) En el cuadro de visualización activo se muestra
una imagen de recuperación de inversión doble que suprime tanto el valor de GM como
el valor de CSF.
Nota: Los elementos de menú DIR solo aparecen si se dispone de una licencia que
permita la función DIR.

Tabla 4.1: Valores predeterminados de TE, TR y TI para las distintas imágenes

sintéticas de contraste ponderado.
Tipo de imagen TE TR TI
T1W 10 ms 500 ms
T2W 100 ms 4 500 ms
PDW 10 ms 8 000 ms
T1W FLAIR 10 ms 2 500 ms 1 050 ms
T2W FLAIR 100 ms 15 000 ms 3 000 ms
STIR 100 ms 15 000 ms 300 ms
PSIR 10 ms 6 000 ms 500 ms
PSIR (vaso) 10 ms 8 000 ms 10 ms
Tabla 4.2: Valores TE, TR, TI y TI2 predeterminados para DIR para las in-
tensidades de campo admitidas.
Tipo de imagen Intensidad de campo TE TR TI TI2

IR doble (WM supp) 1.5 T 100 ms 15 000 ms 420 ms 3 600 ms
IR doble (WM supp) 3.0 T 100 ms 15 000 ms 470 ms 3 750 ms
IR doble (GM supp) 1.5 T 10 ms 6 000 ms 700 ms 3 200 ms
IR doble (GM supp) 3.0 T 10 ms 6 000 ms 900 ms 3 600 ms
4.1.2 Ajuste del contraste de imagen

SyMRI permite un control posterior a la exploración de la magnitud del contraste en las
imágenes sintéticas de contraste ponderado. Esto se lleva a cabo ajustando TE, TR, TI
y TI2. Estas opciones se pueden seleccionar en el menú contextual, a través del icono
correspondiente de la barra de herramientas o mediante las teclas de método abreviado
que se indican a continuación. Cuando se ajusta la magnitud del contraste manteniendo
presionado el botón izquierdo del ratón, se pueden revertir los cambios pulsando la tecla
«Esc» antes de soltar el botón izquierdo del ratón.
Ajustar TE «Q» El valor de TE se ajusta moviendo el ratón al mismo tiempo que se

mantiene presionado el botón izquierdo del ratón.
Ajustar TR «W» El valor de TR se ajusta moviendo el ratón al mismo tiempo que se
mantiene presionado el botón izquierdo del ratón.
Ajustar TR/TE «E» TR y TE se ajustan simultáneamente moviendo el ratón mientras
se mantiene pulsado el botón izquierdo.
Ajustar TI «R» El valor de TI se ajusta moviendo el ratón al mismo tiempo que se
mantiene presionado el botón izquierdo del ratón. La opción está disponible cuando está
activado el preimpulso de inversión.
Ajustar TI-TI «T» Los valores de TI y TI2 se ajustan moviendo el ratón al mismo tiempo
que se mantiene presionado el botón izquierdo del ratón. La opción está disponible
cuando está activado el preimpulso de inversión doble.
Nota: Cuando se selecciona la herramienta Ajustar TI o Ajustar TI-TI, el puntero del

ratón se convertirá en un círculo rojo cuando pase sobre imágenes de contraste ponderado
donde el pulso o pulsos de inversión correspondientes no están activos. Intentar ajustar

TI o TI2 para tal imagen activará un cuadro de diálogo que pregunta al usuario si desea
activar el pulso o pulsos de inversión correspondientes.
Menú contextual de ROI › Usar ROI hasta tejido nulo La magnitud de contraste de la
imagen se ajustará haciendo que el tejido de la ROI aparezca negro en la imagen. Esto
se lleva a cabo mediante un preimpulso de inversión con un TI optimizado. Para anular
el tejido de un tipo determinado, ubique y ajuste el tamaño de una ROI de tal forma
que la ROI solo incluya tejido del tipo del que desee cancelar la señal. Así se ajustará
el TI en la imagen mostrada. En una imagen de DIR, el TI utilizado para anular CSF
se ajustará para seguir anulando CSF, mientras el otro TI se optimizará para anular el
tejido en el ROI. Las funciones para trazar una ROI se describen en el Apartado 4.3.
Consulte también el Apartado 6.3.1 (Usar ROI hasta tejido nulo).
Menú contextual › Config. de imagen › Prepulso de inversión «Ctrl+I» Se activará un
preimpulso de inversión en la imagen. El valor de TI del preimpulso de inversión se
muestra a la izquierda en la vista y se puede ajustar mediante Ajustar TI.
Menú contextual› Config. de imagen› Double Preimpulso de inversión doble Se activa
un preimpulso de inversión doble en la imagen. Los tiempos de inversión se muestran a
la izquierda en la vista y se pueden ajustar mediante Ajustar TI-TI.
Menú contextual › Config. de imagen › Activar PSIR Si la opción PSIR está desactivada,
los valores negativos se visualizan como el valor absoluto correspondiente. Se dan valores
negativos en imágenes con un impulso de inversión, por ejemplo, PSIR. En las MRI
convencionales solo se puede mostrar el valor absoluto. Cuando se utiliza SyMRI, los
valores negativos se pueden visualizar activando la opción PSIR. Si la opción PSIR está
activada, se mostrará el texto «PSIR (sintética)» en el HUD del cuadro de visualización.
4.1.3 Ajuste de imágenes FLAIR

En una imagen FLAIR, el líquido (CSF) se suprime utilizando una combinación de
un impulso de inversión y un retardo de inversión para anular la señal del líquido. La
combinación empleada de TR y TI puede variar entre hospitales, y es importante ser
consciente de las diferencias.
Figura 4.2: Diversos ajustes de una imagen FLAIR de un paciente con EM (post
Gd). A: TR/TI = 12 000/2 850 ms, B: TR/TI = 12 000/2 600 ms, B: TR/TI
= 12 000/2 400 ms, D: TR/TI = 6 000/2 000 ms. El valor de TE es de 100 ms
en todos los casos.
En la Figura 4.2 puede verse una serie de ejemplos para la optimización de imágenes T2W
FLAIR: el CSF se anula exactamente utilizando la combinación TR/TI = 12 000/2 600
ms, que tiene como resultado un CSF de color muy negro (Figura 4.2 B). Sin embargo,
un TI más largo con el mismo TR sigue teniendo un CSF razonablemente suprimido,

pero un mayor contraste GM/WM (Figura 4.2 A). Un ajuste FLAIR clínico típico, con
un TR corto para la reducción del tiempo de escaneo, desemboca en una degradación del
contraste GM/WM, pero no modifica el tiempo de escaneo para MRI sintéticas (Figura
4.2 D).
SyMRI anota una imagen como imagen FLAIR cuando el valor de TI se aproxima al
valor que suprime por completo el CSF. Para otros valores de TI, la imagen se anota
como imagen IR.
Consulte también el Apartado 6.3.1 (Usar ROI hasta tejido nulo).
4.1.4 Ajuste de imágenes de IR doble

En una imagen de IR doble se suprimen dos tejidos a elección utilizando una combinación
de dos impulsos de inversión y tiempos de retardo de inversión. Por ejemplo, es posible
suprimir la materia blanca, la materia gris o la grasa al mismo tiempo que el CSF. La
Figura 4.3 contiene una serie de ejemplos junto con los ajustes sugeridos.
Figura 4.3: Ejemplos de ajustes para IR doble con 3 T.

A: DIR en el que se han suprimido la materia blanca y el CSF utilizando
TE/TR/TI1/TI2 = 100/15 000/470/3 750 ms (mujer, 35 años),
B: DIR para aplicaciones pediátricas con valores TE/TR/TI1/TI2 =
10/8 000/900/3 950 ms (varón, 8 meses) y
C: DIR de supresión de grasa similar a una imagen T2W FLAIR con supre-
sión de grasa, utilizando TE/TR/TI1/TI2 = 100/15 000/250/3 200 ms (varón,
10 años).
Ajustar dos TI correctamente es complicado y se recomienda la función «Usar ROI hasta

tejido nulo» (Apartado 4.1.2).
4.1.5 Ventana de navegación para imágenes de contraste

La magnitud del contraste de la imagen se muestra en el cuadro de visualización de dos
formas; como una ventana de navegación en el lado izquierdo del cuadro de visualización
y como texto en la parte superior del cuadro de visualización.
La ventana de navegación (Figura 4.4) se muestra junto con imágenes de contraste
ponderado. En la ventana de navegación, la magnitud del contraste de la imagen se
indica mediante un punto amarillo. Cuando ajuste los valores de TR o TE, utilice la
ventana de navegación para ver cómo afectan los cambios a la magnitud del contraste.
También es posible ajustar TE y TR haciendo clic en el punto amarillo y arrastrándolo.

Figura 4.4: El círculo de la navegación indica la magnitud del contraste de la

imagen que se muestra en el cuadro de visualización.
El texto que se muestra en la parte superior del cuadro de visualización cambia en función
de la magnitud de contraste actual. Para imágenes con efecto eco de espín, la magnitud
puede ser T1W, T2W, PDW o T1+T2. Si está activado un preimpulso de inversión, el
texto será IR, PSIR, STIR, T1W FLAIR, T2W FLAIR o FLAIR. Si están activados dos
preimpulsos de inversión, la magnitud del contraste será DIR.

4.2 SyMaps
En los mapas de cuantificación de SyMRI se muestran los valores medidos para las
propiedades tisulares por vóxel del conjunto de datos. Los mapas de cuantificación de
la tasa de relajación R1, la tasa de relajación R2 y la densidad protónica (PD) son la
base de las MRI sintéticas. Aparte de estos mapas de cuantificación, están disponibles
los tiempos de relajación inversa T1 y T2.
4.2.1 Visualización de SyMaps

Los mapas de cuantificación descritos a continuación se pueden seleccionar mediante el
menú contextual o la tecla de método abreviado indicada.
Figura 4.5: El diseño de SyMaps contiene una imagen T2W de contraste pon-
derado, SyMaps para PD, R1 y R2.
Cada parámetro representado como SyMaps tiene un rango concreto dentro del cual se
puede medir. Esto es conocido como el rango dinámico de SyMRI. El rango dinámico de
cada parámetro se enumera en la Tabla 6.2.
Formato de SyMaps «Ctrl+F» Se muestran cuatro cuadros de visualización con mapa

R1, mapa R2, mapa PD e imagen sintética de contraste ponderado T2W.
Menú contextual› SyMaps › Mapa T1 Los tiempos de relajación T1 se muestran en ms.
Menú contextual› SyMaps › Mapa T2 Los tiempos de relajación T2 se muestran en ms.
Menú contextual › SyMaps › Mapa R1 La tasa de relajación R1 se muestra en s−1 , 𝑅1 =
1
.
𝑇1
Menú contextual › SyMaps › Mapa R2 La tasa de relajación R2 se muestra en s−1 , 𝑅2 =
1
.
𝑇2
Menú contextual› SyMaps › Mapa PD La densidad protónica se muestra en unidades
porcentuales (pu) con respecto a un valor de referencia de 100 pu, que es la densidad

protónica del agua. La grasa tiene una mayor densidad protónica que el agua y, por
tanto, se muestra con valores superiores a 100 pu.

4.3 Región de interés (ROI)

Es posible crear una ROI para seleccionar una zona de la imagen. A través de ROI, se
pueden analizar R1, R2, PD y la intensidad de la señal dentro de la región marcada.
4.3.1 Creación y ajuste de una ROI

Para crear una ROI, coloque el puntero del ratón en el punto elegido, pulse y mantenga
presionado el botón izquierdo del ratón y trace la forma y el tamaño deseado. Luego
suelte el botón del ratón. Para activar la herramienta que sirve para trazar ROI utilice
cualquiera de las siguientes alternativas:
ROImano alzada «F6» Permite dibujar una ROI de forma libre. La ROI se cerrará con
un segmento lineal al soltar el botón del ratón.
ROI rectangular «F7» Permite dibujar una ROI rectangular. La ROI rectangular se
puede ajustar marcando una de las esquinas, manteniendo presionado el botón izquierdo
del ratón y ajustando la ROI al tamaño deseado.
4.3.2 Información en la ROI

La información relacionada con la ROI se muestra en la esquina superior derecha del
cuadro de visualización (Figura 4.6), debajo del zoom y la configuración de la ventana.
Se hace referencia a este bloque de texto como Info ROI.
Figura 4.6: ROI e información relacionada.
Dos de las líneas muestran el valor medio y la desviación estándar de R1 y R2 de forma

predeterminada. Estas dos líneas se pueden cambiar para que muestren T1 y T2.
Aparece la siguiente información:
Posición: Las coordenadas centrales de la ROI con respecto a la imagen se especifi-
can como «ROI [#,#]». Para las ROI a mano alzada, el centro es del rectángulo
delimitador.
R1 o T1: Valor medio y desviación estándar de R1 o T1 en la ROI. Para los mapas T1
se muestra T1 y para los mapas R1, se muestra R1.
R2 o T2: Valor medio y desviación estándar de R2 o T1 en la ROI. Para los mapas T2
se muestra T2 y para los mapas R2, se muestra R2.
PD: Valor medio y desviación estándar de PD en la ROI.
Valor: Valor medio y desviación estándar de la intensidad de vóxel. En las imágenes
sintéticas, este valor corresponde a la intensidad de la señal MRI simulada.

Consulte también los apartados 5.1, 5.4 y 5.6 para informarse sobre las operaciones ROI
adicionales disponibles en SyMRI NEURO.
4.3.3 Preferencias de ROI

SyMRI admite varias ROI por cuadro de visualización, y cada ROI puede ser específica
de un corte en concreto.
Preferencias› Múltiples ROI Permite al usuario tener más de una ROI por cuadro de
visualización. El valor predeterminado es off (desactivado). La ROI activa tiene un
contorno sólido mientras que la otra ROI tiene contornos de puntos. El aspecto de una
ROI activa e inactiva se puede ver en la Figura 4.7.
Cuando Múltiples ROI está off (desactivado), una ROI se elimina automáticamente al
trazar una nueva ROI en el mismo cuadro de visualización. Cuando Múltiples ROI está
on (activado), la ROI existente permanece con un contorno de puntos.
Preferencias› ROI por corte Bloquea ROI en el corte específico donde se trazó la ROI.
Valor predeterminado si está off (desactivado).
Cuando ROI por corte está off (desactivado), una ROI permanece visible al desplazarse
por los cortes. Info ROI se actualiza para mostrar las estadísticas de la ROI del corte
actualmente visible. Cuando ROI por corte está on (activado), una ROI solo está visible
en el corte donde se trazó. Al desplazarse a un corte diferente, la ROI no estará visible.
Info ROI solo estará visible en cortes con una ROI.
Figura 4.7: Dos ROI en el mismo cuadro de visualización. La ROI superior está
activada y, por tanto, aparece con un contorno de línea sólida. La ROI inferior
no está activada y, por tanto, aparece con un contorno de puntos
Nota: La información que aparece en el cuadro de visualización está relacionada con

la ROI marcada como activa. Una ROI se activa haciendo clic sobre ella con el botón
izquierdo del ratón. Cuando se dibuja una ROI nueva, se marca automáticamente como
activa. También es posible elegir la ROI activa pulsando «Tab» o «Mayús+Tab».
4.3.4 Funciones de una ROI

Hacer clic en una ROI mostrará el menú contextual de ROI. Este menú contiene varias
operaciones para la ROI.

Menú contextual de ROI › Delinear ROI «Ctrl+X» La ROI se copiará en el portapapeles

y luego desaparecerá del cuadro de visualización.
Menú contextual de ROI › Copiar ROI «Ctrl+C» La ROI se copiará en el portapapeles.
Menú contextual de ROI › Pegar ROI «Ctrl+V» Si hay alguna ROI en el portapapeles,
se pegará en el cuadro de visualización que se encuentre activo en ese momento.
El comando de teclas «Ctrl+V» debe utilizarse para pegar la ROI en el cuadro de
visualización sin una ROI presente. El comando de teclas «Ctrl+V» también se puede
utilizar para pegar la ROI como texto. El texto se puede copiar y pegar en SyMRI para
generar una ROI idéntica.
Menú contextual de ROI › Desactivar ROI «Retroceso» La ROI se borra del cuadro
de visualización.
Menú contextual de ROI › Mostrar gráfico La gráfica se mostrará o se ocultará.
Menú contextual de ROI › Usar ROI hasta tejido nulo Consulte el Apartado 4.1.2
(Ajuste del contraste de imagen). Esta función se desactiva automáticamente al cambiar
el corte.

4.4 Gráficas
Cuando se muestra una ROI en la imagen, aparece automáticamente una gráfica en la
parte inferior derecha del cuadro de visualización. Los valores de los vóxeles de la ROI se
trazan en el gráfico (Figura 4.8). El color indica cuántos vóxeles tienen una determinada
combinación de valores. El color rojo indica un número relativamente alto de vóxeles; y
el color azul, un número bajo (Figura 4.9).
Figura 4.8: En la gráfica se trazan todos los vóxeles de la ROI.
La gráfica se puede personalizar a través del menú contextual.

Hay tres tipos de gráficos disponibles en el menú contextual de la gráfica: gráficas R1-R2,
R1-PD y R2-PD. La descripción y el eje de la gráfica cambian en función del tipo de
gráfica seleccionado.
Hay dos opciones disponibles para la escala de la gráfica. La primera es una escala de
gráfica pequeña, que está adaptada a los valores que suelen darse en el cerebro. La otra
es una escala más grande que proporciona un intervalo más largo para los ejes R1-R2,
R1-PD y R2-PD. La escala pequeña es la escala predeterminada y recomendada para
la anatomía cerebral; las demás anatomías se ajustarán de forma predeterminada a la
escala grande.
Figura 4.9: Menú contextual de gráfica

4.5 Guardado y carga

Es posible guardar varios tipos de imágenes y pilas de imágenes desde SyMRI en la
estación de trabajo o PACS. Las opciones de guardado y carga disponibles dependen de
la versión de SyMRI que se esté utilizando.
PRECAUCIÓN: Tenga en cuenta que solo los SyMaps y los datos de ori-
gen MDME se pueden volver a abrir en SyMRI. Las imágenes de contraste
ponderado se pueden abrir con otros visores de imágenes DICOM.
ADVERTENCIA: Tenga en cuenta que si se apaga la estación de trabajo o

se produce un error mientras se guardan los datos, los datos resultantes no
serán fiables. Elimine cualquier dato guardado y guarde de nuevo.
Tenga en cuenta que, para algunas versiones, es posible que la operación
de guardado solo pueda completarse parcialmente si se ha completado en
SyMRI. Por ejemplo, la versión para Sectra PACS IDS7 importa los datos
guardados en un paso aparte.
Sectra PACS IDS7 inicia la importación cuando SyMRI inicia la opera-
ción de guardado, sin embargo, incluso después de que SyMRI se cierre,
es posible que Sectra PACS IDS7 siga teniendo imágenes en cola para
la importación. Si Sectra PACS IDS7 se bloquea después del cierre de Plug-In
SyMRI, debería inspeccionar los datos guardados. Consulte la documen-
tación de Sectra PACS IDS7 para obtener más información sobre cómo
funciona la importación de Sectra PACS IDS7.
4.5.1 Guardado de SyMaps

El menú Archivo contiene opciones para guardar SyMaps.
Nota: Esta función solo está disponible si se utiliza SyMRI con un conjunto de datos
MDME.
Nota: Normalmente los SyMaps están cifrados. Si este es el caso, habrá un archivo por
corte. Los SyMaps cifrados se pueden abrir en un visor DICOM, donde se mostrarán
como una serie T2W. Los SyMaps cifrados solo se pueden abrir correctamente en SyMRI.
Los datos de MDME para SyMRI generalmente contienen más de 300 imágenes, mientras
que el SyMaps cuantificado contiene una o tres imágenes por corte y aproximadamente
entre 20 y 300 imágenes en total.
No borre nunca el conjunto de datos original. Tenga en cuenta que cabe la posibilidad
de que el conjunto de datos original sea necesario para realizar comparaciones fiables en
futuras versiones del software.
Archivo › Guardar SyMaps (T1T2PD) en PACS Se guardará una pila de imágenes
Plug-In
cuantificada en PACS como serie independiente en la exploración actual.
Archivo › Guardar SyMaps (T1T2PD) en carpeta local... Se guardará una pila de

imágenes cuantificada en formato DICOM en la carpeta seleccionada de la estación
StandAlone
de trabajo local. Se crea un DICOMDIR en la carpeta, y los datos de la pila se
guardan en una subcarpeta. Si ya existe un archivo DICOMDIR, se actualiza.

Archivo › Guardar SyMaps (T1T2PD) en PACS Se guardará una pila de imágenes

cuantificada en el PACS configurado a través de la red como serie independiente en Network
la exploración actual.
4.5.1.1 Ahorro de tiempo

Antes de cerrar SyMRI se recomienda guardar los SyMaps cuantificados si el usuario
desea cargar el conjunto de datos en un momento posterior. Esto se recomienda porque
es más rápido cargar un SyMaps cuantificado que comenzar a partir de datos brutos sin
cuantificar (MDME).
4.5.2 Guardado de una captura de pantalla del espacio de trabajo

El menú Archivo contiene opciones para guardar una captura de pantalla del espacio de
trabajo.
Nota: Tenga en cuenta que la imagen de la captura de pantalla no se puede abrir desde
SyMRI, pero puede visualizarse en otros visores de imágenes DICOM.
Archivo› Guardar captura de pantalla en PACS Se guarda una captura de pantalla

Plug-In
del espacio de trabajo de SyMRI en PACS como serie nueva en la exploración actual.
Archivo› Guardar captura de pantalla en archivo... Se guarda una captura de panta-

lla del espacio de trabajo de SyMRI en formato DICOM en la carpeta especificada de
StandAlone la estación de trabajo con el nombre de archivo especificado. Se crea un DICOMDIR
en la carpeta, y el archivo se guarda en una subcarpeta. Si ya existe un archivo
DICOMDIR, se actualiza.
Archivo› Guardar captura de pantalla en PACS Se guarda una captura de pantalla

Network del espacio de trabajo de SyMRI en el PACS configurado a través de la red como
nueva serie en la exploración actual.
4.5.3 Guardado de pilas de imágenes
Nota: No es posible abrir la pila de imágenes con contraste ponderado guardadas en

SyMRI, pero puede verse en otros visores de imágenes DICOM.
Nota: El formato de las imágenes guardadas es diferente en función del ajuste de color.
Si el color está on (activado), las imágenes se guardarán como imágenes RGB. Si el
color está off (desactivado) las imágenes se guardarán en escala de grises. Consulte el
Apartado 3.4.2.
4.5.3.1 Guardado de la pila actual

El menú contextual de cada cuadro de visualización incluye la opción de guardar la pila
que se muestra en el cuadro de visualización en una nueva serie. La pila conserva los
ajustes del cuadro de visualización, por ejemplo, configuración de la ventana, magnitud
del contraste y ajustes de color.

Menú contextual › Guardar esta pila en PACS La pila se guarda en PACS como
Plug-In
serie nueva en la exploración actual.
Menú contextual› Guardar esta pila en carpeta local... La pila se guarda en formato
DICOM en el directorio especificado de la estación de trabajo. Se crea un DICOMDIR
StandAlone
en la carpeta, y los datos de la pila se guardan en una subcarpeta. Si ya existe un
archivo DICOMDIR, se actualiza.
Menú contextual › Guardar esta pila en PACS La pila se guarda en el PACS confi-
Network
gurado a través de la red como nueva serie en la exploración actual.
4.5.3.2 Guardado de todas las pilas visibles

La barra de herramientas y el menú Archivo incluyen una opción que permite guardar
todos los cuadros de visualización actualmente visibles como series nuevas. Si se han
abierto datos brutos, también se guardan SyMaps.
Archivo › Guardar todas las pilas visibles en PACS Guarda todas las pilas visibles
(junto con SyMaps si se abre desde datos brutos) en PACS como una serie nueva en Plug-In
la exploración actual.
Archivo › Guardar todas las pilas visibles en carpeta local... Guarda todas las pilas
visibles (junto con SyMaps si se abre desde datos brutos) en formato DICOM en
el directorio especificado de la estación de trabajo. Se crea un DICOMDIR en la StandAlone
carpeta, y los datos de la pila se guardan en una subcarpeta. Si ya existe un archivo
DICOMDIR, se actualiza.
Archivo › Guardar todas las pilas visibles en PACS Guarda todas las pilas visibles
(y SyMaps si se abre desde datos brutos) en el PACS configurado a través de la red, Network
como una nueva serie en la exploración actual.

Parte III
SyMRI® NEURO

5 Funciones de SyMRI NEURO

En SyMRI NEURO está disponible la funcionalidad para caracterizar los tejidos cere-
brales y medir el volumen cerebral. Tomando como base las propiedades tisulares R1, R2
y PD se pueden medir automáticamente los volúmenes parciales de los tejidos. De este
modo se calculan el volumen intracraneal (ICV) y el volumen del parénquima cerebral
(BPV), así como los volúmenes de materia blanca (WM), materia gris (GM) líquido
cefalorraquídeo (CSF) y el componente correlacionado con la mielina (MyC). Hay dis-
ponible una máscara de usuario para medir volúmenes de la selección definida por el
usuario de tejido intracraneal.
PRECAUCIÓN: La precisión de estas mediciones depende de varios paráme-
tros, incluidos los ajustes de secuencia, el fabricante del escáner y la intensi-
dad de campo. Al medir de nuevo al mismo paciente con la misma secuencia y
el mismo escáner de RM se da una alta repetibilidad. Sin embargo, cualquier
cambio en los parámetros, por ejemplo, un cambio de secuencia o el uso de
otro escáner de RM, puede reducir la precisión. Los volúmenes cerebrales es-
tán validados tanto con 1.5 T como con 3 T, pero la tolerancia entre escáneres
siempre puede tener como resultado diferencias. Por lo tanto, se recomienda
utilizar ajustes idénticos cuando se realicen estudios longitudinales.
Figura 5.1: Cuando se inicia SyMRI NEURO aparecen cinco cuadros de visuali-
zación. En tres de los cuadros de visualización se muestran imágenes sintéticas
de contraste. Un cuadro de visualización contiene un mapa de segmentación.
En el mapa de segmentación se muestra el CSF. El cuadro de visualización
de la derecha contiene una tabla de segmentación con resultados de volumen.
Utilice el atajo de teclado «Ctrl+R» para regresar a este diseño.

5.1 Máscara intracraneal
ADVERTENCIA: Antes de analizar los volúmenes de los tejidos, el usuario

debe asegurarse de que la máscara intracraneal sea anatómicamente correc-
ta. Si la generación automática es infructuosa, el usuario debe corregir la
máscara mediante la funcionalidad de ROI. Suelen darse problemas en las
órbitas y en el vértice y la base del cráneo.
Figura 5.2: La máscara intracraneal define el ICV en SyMRI NEURO. La línea

roja indica el exterior del ICV.
La máscara intracraneal define el volumen intracraneal en SyMRI NEURO. Todos los

cálculos de volumen y segmentación se aplican a los vóxeles incluidos en la máscara
intracraneal.
La máscara intracraneal se halla con la inclusión de WM, GM y CSF, seguidos de un
algoritmo de crecimiento de región para garantizar un volumen contiguo (Figura 5.2).
El borde de la máscara se define donde PD = 50, tomando como base el supuesto de
que el borde del ICV está a medio camino entre el CSF (con PD = 100) y el hueso
craneal (PD = 0). Por último, el tamaño de la máscara intracraneal se reduce 0,5 mm
para eliminar la duramadre. Tenga en cuenta que la línea roja de contorno del ICV, tal
como se muestra en las imágenes de segmentación, está trazada fuera del volumen ICV.
5.1.1 Ajuste de la máscara intracraneal

La máscara intracraneal debe ajustarse utilizando los siguientes pasos:
1. Muestre la máscara intracraneal mediante la opción correspondiente Máscara
intracraneal del menú contextual o pulsando «I».
2. Desplácese por todos los cortes y asegúrese de que la máscara intracraneal sea
correcta.
3. Agregue áreas a la máscara dibujando una ROI alrededor de la zona. Agregue el
área a la máscara mediante Añadir a máscara intracraneal en el menú contextual
de ROI o pulsando «Insert» en el teclado. Durante la edición no se tienen en
cuenta las partes de la ROI que se encuentran fuera de la imagen.
4. Quite áreas de la máscara dibujando una ROI alrededor de la zona. Quite el
área de la máscara mediante la opción Eliminar de máscara intracraneal del menú

contextual ROI o pulsando «Supr» en el teclado. Durante la edición no se tienen

en cuenta las partes de la ROI que se encuentran fuera de la imagen.
5. Guarde la máscara intracraneal. Cuando la máscara sea correcta, guarde los

cambios con la opción Guardar máscara intracraneal del menú Archivo. Una vez
guardada la máscara, la vista de tabla se actualizará con este texto: «Máscara
intracraneal modifica por última vez por “nombre del usuario”, “fecha”, “hora”».
La máscara intracraneal no se guarda automáticamente cuando se guarda el SyMaps,

pero se vuelve a calcular cuando se abre el SyMaps. Es posible guardar la máscara
intracraneal cuando se abre el SyMaps. Una vez que se haya guardado la máscara Plug-In
intracraneal con el SyMaps, esta máscara se cargará y se mostrará automáticamente
siempre que se abra el SyMaps.
ADVERTENCIA: La máscara intracraneal (Figura 5.2) se corresponde a la

definición de SyMRI NEURO de ICV. La segmentación de tejidos y el cálculo
de volumen se efectúan para todos los vóxeles de la máscara intracraneal. El
tejido que se encuentre fuera de la máscara no se incluirá en el cálculo de
volúmenes de tejidos.
5.1.2 Funciones adicionales para la máscara intracraneal

Archivo› Guardar máscara intracraneal La máscara intracraneal se guardará y se car-
gará automáticamente la próxima vez que se utilice la exploración. Esta opción de menú
solo está disponible si se ha abierto un conjunto de datos SyMaps.
La información se guarda en un archivo de objeto DICOM de estado de presentación

en una serie nueva en la misma carpeta desde la que se haya cargado el conjunto de
datos. StandAlone
Al guardar SyMaps, la máscara intracraneal se guarda en el conjunto de datos
SyMaps guardado.
La información se guarda en un objeto DICOM de estado de presentación en PACS

Plug-In
en una serie nueva en la misma exploración que el conjunto de datos cargado.
La información se guarda en un objeto DICOM de estado de presentación en el

PACS configurado a través de la red en una serie nueva en la misma exploración que
el conjunto de datos cargado. Network
Al guardar SyMaps, la máscara intracraneal se guarda en el conjunto de datos
SyMaps guardado.
Archivo› Cargar máscara intracraneal Se carga la última máscara intracraneal guarda-

da.
Editar› Recalcular máscara intracraneal La máscara intracraneal se regenera a través
del algoritmo incluido en SyMRI NEURO.
Editar› Borrar máscara intracraneal La máscara intracraneal se borra. Todos los volú-
menes calculados se ajustan a cero. Esta función resulta útil cuando el usuario desea
definir el cerebro partiendo de cero.

Menú contextual › Mostrar borde de máscara intracraneal «H» El botón de alternancia

muestra u oculta el borde de la máscara intracraneal.
ADVERTENCIA: Para generar resultados de segmentación precisos, debe

incluirse el volumen craneal completo en la máscara intracraneal. La máscara
intracraneal no debe utilizarse para calcular el volumen de partes específicas
del cerebro, p. ej., los ventrículos. Para segmentar regiones cerebrales más
pequeñas puede utilizarse la máscara de usuario (Apartado 5.4).

5.2 Segmentación tisular

SyMRI segmenta automáticamente varios tipos de tejido. Estos incluyen WM, GM, CSF
y MyC. La segmentación automática se realiza en todos los vóxeles contenidos dentro
del ICV y se define mediante la máscara intracraneal.
Los resultados de estas segmentaciones tisulares se presentan de dos formas, como vo-
lúmenes totales presentados en la tabla de segmentación (Apartado 5.5) y como mapas
de segmentación (Apartado 5.3).
5.2.1 Segmentación de parénquima cerebral y CSF

SyMRI segmenta el tejido en cuatro tipos; y cada vóxel del ICV contiene volúmenes
parciales que oscilan entre el 0 y el 100 % del volumen de vóxeles para cada tipo de
tejido. Los cuatro tipos de tejido del modelo de segmentación de SyMRI son:
• WM (del inglés White Matter), materia blanca (mielinizada)
• GM (del inglés Gray Matter), materia gris
• CSF (del inglés Cerebrospinal Fluid), líquido cefalorraquídeo
• NON-WM/GM/CSF, tejido/líquido con características que difieren de WM, GM y

CSF
Nota: No debe presuponerse que el tejido segmentado como NON-WM/GM/CSF

es patológico; es meramente el resto del volumen de vóxeles que no se ha segmen-
tado como WM, GM o CSF.
Las definiciones de tejidos de WM, GM y CSF se definieron utilizando el análisis de R1,

R2 y PD, de acuerdo con la cuantificación de SyMRI. Un neurorradiólogo colocó varias
ROI para marcar áreas de WM, GM y CSF puras en conjuntos de datos cerebrales de un
número de voluntarios adultos sanos. Se utilizaron análisis estadísticos de las propiedades
de los tejidos dentro de estas ROI para definir las distribuciones de Gauss de R1-R2-PD
para cada tipo de tejido, también denominados grupos de tejidos.
ADVERTENCIA: Los tipos de tejido son similares, aunque no idénticos, al

tejido según la clasificación histológica. Por ejemplo, para niños muy peque-
ños, cuya materia blanca aún no está totalmente mielinizada, cabe la posi-
bilidad de que el tejido se segmente como GM en vez de como WM. Esto
ocurre porque la WM está modelada para la materia blanca mielinizada, y
la materia blanca no mielinizada se aproxima más a las propiedades tisulares
de la GM.
ADVERTENCIA: No se ha efectuado ninguna comparación con el CSF, la

materia gris o la materia blanca biológica.
5.2.2 Asignación de volumen parcial correlacionado con la mielina (MyC)

Independientemente de los mapas de segmentación para WM, GM, CSF y NON-WM/
GM/CSF, SyMRI también puede mostrar un mapa de segmentación para el componente
correlacionado con la mielina, MyC. Este mapa tiene una alta correlación con el volumen

parcial de mielina en cada vóxel de adquisición. Los valores típicos de MyC son 0–8 % en
GM cortical y 30–45 % en WM en adultos. MyC se muestra en la imagen en una escala
de colores de 0 a 40 %, pero los valores pueden ser superiores. Utilice la función ROI
para verificar los valores de MyC en áreas específicas (consulte el Apartado 5.6.1). En el
cerebro humano, MyC normalmente no supera el 50 %. MyC no es linealmente propor-
cional al volumen parcial de WM, por ejemplo, MyC puede variar en áreas segmentadas
de forma homogénea como 100 % WM.
MyC se basa en otro modelo de segmentación diferente a WM, GM, CSF y NON-
WM/GM/CSF. La suma de los volúmenes de WM, GM, CSF y NON-WM/GM/CSF
suman el ICV total, sin incluir MyC. La mielina real contiene capas de agua muy finas
donde la relajación se produce con demasiada rapidez para poder observarla directamente
mediante la adquisición de SyMRI. Sin embargo, debido al intercambio de magnetización,
el agua de mielina de rápida relajación tiene un efecto en el agua de relajación circundante
más lenta, que compone el agua extracelular, intracelular y axonal. Por tanto, los valores
de MyC se basan en el intercambio magnético entre la mielina y el agua circundante.
Cuando la mielina está presente, las tasas de relajación observadas en el agua circundante
son más altas y la PD es más baja que en una situación en la que no hay mielina presente.
El modelo de MyC contiene cuatro volúmenes parciales, cada uno con su propio conjunto
de tasas de relajación y parámetros de densidad protónica. Los cuatro volúmenes parcia-
les son MyC, volumen parcial celular, volumen parcial de agua libre y volumen parcial de
agua de parénquima excesivo. La suma de estos cuatro volúmenes parciales es 100 % para
cada vóxel de adquisición. Se utiliza un algoritmo para determinar la distribución óptima
de los cuatro volúmenes parciales para obtener los valores de R1, R2 y PD medidos para
cada vóxel en los mapas paramétricos. El volumen parcial de MyC tiene tasas de relaja-
ción de R1 y R2 y PD baja. El algoritmo buscará una contribución más alta de MyC en
WM que GM, ya que las tasas de relajación en WM son más altas que en GM, mientras
que la PD es más baja en WM que en GM. Solo el compartimento que contiene MyC se
puede mostrar en SyMRI. Puede obtener más información sobre el modelo para determi-
nar MyC en un publicación de acceso abierto que se puede descargar libremente a través
de https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fneur.2016.00016/full.
Nota: Existe una alta correlación entre los valores de MyC y la densidad óptica del
espécimen histológicamente teñido con Luxol Fast Blue. Sin embargo, dado que el MyC
representa el efecto magnético total de la mielina en R1, R2 y PD del tejido circundante,
no se valida si los volúmenes parciales de MyC y la mielina real son idénticas.
PRECAUCIÓN: Los cambios patológicos en el tejido cerebral que hacen que

R1, R2 y PD se desvíen significativamente de los encontrados en parénquima
cerebral no patológico pueden afectar a la segmentación de MyC. Un ejemplo
de un cambio de este tipo es el edema severo, donde las tasas de relajación
se aproximan a las del CSF puro.

5.3 Mapas de segmentación

Los mapas de segmentación se utilizan para visualizar el contenido de cada vóxel en
el ICV. De forma predeterminada, los mapas de segmentación se muestran como su-
perposiciones, imágenes en color que aparecen sobre imágenes de contraste ponderado.
La imagen de contraste ponderado actúa, a continuación, como un marco de referencia,
mientras que la superposición en color muestra el contenido de tejido. Las superposi-
ciones tienen un color diferente en función del tejido que representen. La Figura 5.3
muestra cuatro mapas de segmentación diferentes, que aparecen como superposiciones
sobre imágenes con contraste ponderado.
Para WM/GM/CSF, los mapas de tejidos modelan el volumen parcial de tejido adulto
sano, lo que significa que los mapas que se saturan al 100 % para el tejido que corresponde
a WM/GM/CSF puros y a cambios (no patológicos), por ejemplo, en la mielinización
dentro de materia blanca pura, no se muestran ya que se representan al 100 % en el
mapa de WM.
Los mapas de segmentación (Figura 5.3) se muestran sobre un fondo que puede ser una
imagen de contraste ponderado o un fondo negro sólido. Cuando se muestra un mapa de
segmentación sobre un fondo negro, la barra de la escala de colores aparece en la esquina
superior derecha del cuadro de visualización.
Figura 5.3: Mapas de segmentación sobre un fondo T2W.
5.3.1 Visualización de mapas de segmentación

Los mapas de segmentación se activan en el Menú contextual o mediante la tecla de
método abreviado asociada.
Formato de segmentación «Ctrl+S» Muestra el diseño de segmentación predetermina-

do, que consta de cinco cuadros de visualización con WM, GM, CSF, NON-WM/GM/
CSF y la Tabla de segmentación.
Menú contextual› Materia blanca «7» El mapa de segmentación de la WM se muestra
superpuesto.
Menú contextual › Materia gris «8» El mapa de segmentación de la GM se muestra
superpuesto.
Menú contextual › Líquido cefalorraquídeo «9» El mapa de segmentación del CSF se
muestra superpuesto.
Menú contextual › NON-WM/GM/CSF «0» El mapa de segmentación del tejido que
no se corresponde con la definición de WM, GM o CSF se muestra superpuesto.
Menú contextual› Mielina (MyC) «Y» El mapa de segmentación del MyC se muestra
superpuesto.
Cuando un mapa de segmentación está visible, el volumen total del tejido segmentado
dentro del corte actual aparece en la parte superior del cuadro de visualización.
Si hay una ROI activa con una superposición de segmentación, el volumen de la ROI se
muestra en la esquina superior derecha del cuadro de visualización. Consulte el Apartado
5.6 para obtener más información.
También es posible desactivar la visualización del borde de la máscara intracraneal me-
diante la opción de menú Mostrar borde de máscara intracraneal o la tecla de método
abreviado «H».
5.3.2 Imagen de fondo para la segmentación

Para ver cómo el color de la segmentación representa las correlaciones con el contenido
de tejido, debe desactivarse el fondo. Una vez hecho esto, aparece una barra de colores en
la esquina superior derecha del cuadro de visualización, donde se ve la escala de colores.
Para ver los mapas de segmentación en una escala lineal de negro a blanco, donde el
blanco es el 100 % de contenido de tejido y el negro es el 0 %, el color se puede desactivar.
El color se puede desactivar después de desactivar el fondo.
Menú contextual › Desactivar fondo «Ctrl+B» Se utiliza un fondo negro. La barra de

color para el mapa de segmentación aparece en la esquina superior derecha (Figura 5.4).
Cuando se desactiva el fondo es posible desactivar el color de la superposición.
Menú contextual › Config. de imagen › Color «C» Desactivación de color

Figura 5.4: Cuando se desactiva el fondo aparece una barra de colores. Esta
barra muestra cómo se representa el contenido de tejido en color.

5.4 Máscara de usuario para una segmentación definida por el

usuario
La máscara de usuario ofrece la posibilidad de marcar partes seleccionadas de la pila de
imágenes y agregarlas a una máscara de usuario. La máscara de usuario puede incluir
tejido tanto dentro como fuera de la máscara intracraneal. La máscara se puede utilizar
para segmentar el volumen de tejidos, lesiones y anatomías específicos. La máscara de
usuario se muestra automáticamente si SyMRI NEURO se inicia con un conjunto de
datos que tenga una máscara de usuario guardada previamente.
5.4.1 Visualización de la máscara de usuario

La máscara de usuario se activa en el menú contextual.
Menú contextual › Mostrar máscara de usuario «U» La máscara de usuario se muestra

superpuesta en el cuadro de visualización.
5.4.2 Medición del volumen con la máscara de usuario

La función principal de la máscara de usuario es medir el volumen de algunas regiones
definidas por el usuario. Este volumen se calcula utilizando el volumen de vóxel, incluida
la separación entre cortes subyacente. El volumen de la máscara de usuario puede incluir
parte o la totalidad de cada vóxel. El volumen de la máscara de usuario en el corte
actual aparece en la parte superior de los puertos de vista donde se muestra la máscara
de usuario.
El volumen parcial se puede añadir a la máscara de usuario copiando contenido de tejido
parcial de un mapa de segmentación en la máscara de usuario (consulte el Apartado
5.4.3). El volumen parcial del tejido segmentado se añade a continuación al volumen de
la máscara de usuario. Por ejemplo, si el volumen parcial del tejido de un vóxel es 25 %,
solo el 25 % del volumen del vóxel se añade al volumen de máscara de usuario.
La máscara de usuario que solo incluye parte del volumen de vóxel es parcialmente
transparente. Más transparencia significa menor volumen parcial.
Las opciones de color y fondo son idénticas a las de los mapas de segmentación. Consulte
el Apartado 5.3.2.
5.4.3 Creación y ajuste de la máscara de usuario

La máscara de usuario se crea agregando o eliminando regiones. Esto se puede hacer
añadiendo o eliminando regiones marcadas por una ROI, añadiendo tejido segmentado
marcado por una ROI o copiando cortes completos de un mapa de segmentación.
5.4.3.1 Edición de la máscara de usuario mediante una ROI

Al utilizar una ROI para editar la máscara de usuario, se pueden añadir o eliminar
áreas y tejidos de la máscara de usuario a través del Menú contextual de ROI. Comience
colocando una ROI alrededor del área que desea cambiar.
Menú contextual de ROI › Añadir a másc usuar Todos los vóxeles dentro de la ROI se
añade a la máscara de usuario. El volumen total de cada vóxel se incluye en el volumen
de la máscara de usuario.

Menú contextual de ROI › Eliminar de máscara de usuario Elimina todos los vóxeles
dentro de la ROI de la máscara de usuario. El volumen aportado por estos vóxeles se
eliminan de la máscara de usuario.
También es posible copiar tejido de un mapa de segmentación.
Menú contextual de ROI › Copiar tejido de ROI en Máscara usuario - Subir escala
Todos los vóxeles que contienen más de un 1 % del tejido en el mapa de segmentación se
añaden a la máscara de usuario. El volumen total de cada vóxel se incluye en el volumen
de la máscara de usuario.
Menú contextual de ROI › Copiar tejido de ROI en Máscara de usuario - Volumen
parcial Los volúmenes parciales se copian en la máscara de usuario.
Figura 5.5: Copiado con volumen parcial mediante una ROI con superposición de segmentación
5.4.3.2 Formas adicionales de ajustar la máscara de usuario

Es posible añadir todo el tejido segmentado, en uno o más cortes, a la máscara de
usuario simultáneamente. Esta opción aparece en el menú contextual cuando está visible
un mapa de segmentación.

Figura 5.6: Es posible copiar cortes completos del tejido segmentado en la máscara de usuario.
Menú contextual › Copiar tejido en máscara usuar Copie todo el tejido en el mapa
visible, dentro de un rango de cortes concreto, en la máscara de usuario. Aparece un
cuadro de diálogo, pidiéndole que seleccione el rango de cortes (Figura 5.6). De forma
predeterminada, se añade el volumen de tejido parcial. Marque la casilla «Subir escala
volumen parcial al 100%» para incluir el volumen total de todos los vóxeles con más de
un 1 % de volumen de tejido parcial.
Editar› Borrar máscara usuar Todos los vóxeles se eliminan de la máscara de usuario y
el volumen de la máscara de usuario se ajusta a cero.
5.4.4 Guardado y carga de la máscara de usuario

Es posible guardar la máscara de usuario y cargar una máscara guardada previamente.
Archivo› Guardar másc. usuar. La máscara de usuario se guarda. Aparece un cuadro

de diálogo, pidiéndole un nombre para la máscara de usuario. Es posible guardar varias
máscaras de usuario con diferentes nombres. La próxima vez que se cargue el conjunto de
datos en SyMRI NEURO, se mostrará una lista de las máscaras de usuario no guardadas
en el archivo de DICOMDIR. Si no se selecciona ninguna otra máscara de usuario o solo
hay una máscara usada guardada, se mostrará la última máscara de usuario guardada.
La información se guarda en un archivo de objeto DICOM de estado de presentación

StandAlone en una serie nueva en la misma carpeta desde la que se haya cargado el conjunto de
datos.
La información se guarda en un objeto DICOM de estado de presentación en PACS

Plug-In
en una serie nueva en la misma exploración que el conjunto de datos cargado.
La información se guarda en un objeto DICOM de estado de presentación en el

Network PACS configurado a través de la red en una serie nueva en la misma exploración que
el conjunto de datos cargado.
Archivo› Cargar máscara usuar Se carga la última máscara de usuario guardada. Todos
los cambios actuales serán reemplazados por la última máscara guardada. La última
máscara de usuario guardada para un conjunto de datos se cargará automáticamente
cuando se inicie SyMRI NEURO.

5.5 Tabla de segmentación

La tabla de segmentación proporciona información volumétrica de los tipos de tejido
segmentados automáticamente en SyMRI NEURO, así como la máscara de usuario. Los
volúmenes totales del cerebro completo siempre se muestran, y la tabla se puede expandir
para mostrar volúmenes de tejido por corte.
Figura 5.7: En la tabla de segmentación se muestran valores calculados de WM,

GM, CSF, NON-WM/GM/CSF y MyC. Se añaden los volúmenes relativos,
como porcentaje del volumen cerebral y como porcentaje del volumen intracra-
neal. Es posible obtener información detallada sobre todos los cortes mediante
la opción «Mostrar cortes» del menú contextual.
Visualización de resultados de segmentación La opción

Menú contextual › Tabla de segmentación «6» Muestre la tabla de segmentación en el
cuadro de visualización.
• Suma ml Volumen de WM, GM, CSF, NON-WM/GM/CSF y MyC por corte.

Esta información está oculta de forma predeterminada, pero se puede activar a
través de la opción Mostrar cortes del menú contextual.
• % BPV: Volúmenes de WM, GM, NON-WM/GM/CSF y MyC como porcentajes
del volumen de parénquima cerebral total. Tenga en cuenta que los porcentajes de
WM, GM y NON suman hasta el 100 % mientras que el porcentaje de MyC es un
porcentaje de BPV independiente de los otros tipos de tejido.
• % ICV: Volúmenes de WM, GM, CSF, NON-WM/GM/CSF y MyC como por-
centajes del volumen intracraneal total. Tenga en cuenta que los porcentajes de
WM, GM, CSF y NON suman hasta el 100 % mientras que el porcentaje de MyC
es un porcentaje de ICV independiente de los otros tipos de tejido.
• Fracción del parénquima cerebral (BPF). La fracción del parénquima cerebral es
la suma de los volúmenes de WM + GM + NON-WM/GM/CSF dividida entre el
volumen total de la máscara intracraneal
(𝐵𝑃 𝐹 = = = ).
ICV ICV ICV
Nota: El porcentaje de MyC no se incluye en el cálculo de BPF ya que es inde-
pendiente de los otros tipos de tejido que divide completamente el contenido del
ICV.
El nombre del usuario que ha creado la máscara intracraneal en la que se basan los
volúmenes de segmentación aparece debajo de la tabla junto con la hora y la fecha.
5.5.1 Visualización de volúmenes por corte

La tabla de segmentación se puede expandir para mostrar los volúmenes de tejido de
cada corte individual.

Menú contextual de la tabla de segmentación › Mostrar cortes expande la tabla de

segmentación para mostrar los volúmenes de tejido de cada corte.
• Corte Volumen de WM, GM, CSF, NON-WM/GM/CSF y MyC por corte.
5.5.2 Máscara de usuario en la tabla de segmentación

Si la máscara de usuario contiene al menos un vóxel, aparece una nueva columna en
la tabla de segmentación denominada «UM». Esta columna presenta el volumen de la
máscara de usuario de la misma forma que WM, GM, CSF, etc. Se muestra el volumen
por corte, el volumen total y el volumen como porcentaje de ICV y BPV.
5.5.3 Exportación de la tabla de segmentación

Archivo› Guardar tabla de segmentación como texto... La tabla con los resultados de
segmentación se guardan localmente en la estación de trabajo como archivo de texto. En
el archivo se guardan el nombre del paciente, la ID de la exploración y las versiones de
SyMRI utilizadas.
Archivo› Guardar tabla de segmentación como informe estructurado... Igual que el

comando de arriba, pero la tabla se guarda como objeto DICOM con el formato de
informe estructurado. Consulte la Declaración de conformidad con DICOM de SyMRI
para obtener más información (técnica) sobre este formato.
Menú contextual de la tabla de segmentación ›Copiar tabla de segmentación «Ctrl+C»
Copie la tabla de segmentación como texto y péguela en documentos, mensajes de correo
electrónico, etc.

5.6 ROI en SyMRI NEURO

Aparte de la funcionalidad que la ROI tiene en SyMRI IMAGE (Apartado 4.3), la ROI
se utiliza para tres funciones específicas de SyMRI NEURO:
1. Para ajustar la máscara intracraneal (Apartado 5.1.1).
2. Para ajustar la máscara de usuario (Apartado 5.4.3).
3. Para medir el volumen del tejido segmentado.
Figura 5.8: ROI e información relacionada
5.6.1 Medición del volumen del tejido segmentado

Cuando un mapa de segmentación está visible, aparecen dos nuevas líneas en el texto de
Info ROI.
La primera línea empieza con el nombre del mapa de segmentación, por ejemplo WM
o CSF. Esta línea proporciona la desviación media y estándar de contenido de tejido
segmentado de volumen parcial dentro de la ROI, como un porcentaje del volumen total
de la ROI.
La segunda línea empieza con Vol. y muestra el volumen del tejido segmentado dentro
de la ROI, seguido del volumen total de la ROI. Los volúmenes se facilitan en milímetros
(ml).
Si una máscara de usuario está visible, la información de volumen de la Máscara usuario
dentro de la ROI se mostrará de la misma forma en la Info ROI. En caso de que estén
visibles una máscara de usuario y una superposición de segmentación, la información
de volumen de la máscara de usuario aparece debajo de la información de volumen del
tejido segmentado. Consulte la Figura 5.8.
Tenga en cuenta también que la línea que muestra Señal se elimina cuando aparece la
información de volumen de una máscara de usuario o tejido segmentado.

5.7 Gráficas en SyMRI NEURO
Figura 5.9: Gráfica ROI en SyMRI NEURO.
Las gráficas en SyMRI NEURO tienen la misma funcionalidad que en SyMRI IMAGE
(Apartado 4.4) y, además, muestran el valor medio de los tipos de tejido definidos con
una cruz.
Menú contextual de gráfica › Conjunto del cerebro Se muestran las agrupaciones de

referencia para CSF, WM y GM.

Parte IV
Información importante

6 Advertencias
6 Advertencias
Lea toda la información de este capítulo; contiene indicaciones importantes sobre el uso
seguro de SyMRI.
6.1 Artefactos de imagen

Los tipos de artefactos de imagen que aparecen en MRI convencionales también pueden
aparecer en MRI sintéticas. Pueden darse artefactos de imagen tales como artefactos de
movimiento, ruido, plegamientos, etc. por idénticos motivos. No obstante, el efecto sobre
las imágenes podría ser distinto ya que el muestreo de señales es diferente.
6.1.1 Artefactos de movimiento
Figura 6.1: El movimiento del paciente puede provocar plegamientos y efectos

fantasma. A: T2W B: FLAIR C: T2W con mapa NON-WM/GM/CSF
Al igual que las MRI convencionales, las MRI sintéticas también se ven afectadas por el
movimiento. El movimiento tiene como resultado artefactos que merman la calidad de las
imágenes. Las imágenes sintéticas se generan a partir de varias lecturas consecutivas. Por
lo tanto, los artefactos de movimiento pueden tener un aspecto distinto en comparación
con las imágenes convencionales. Los artefactos de «efecto fantasma» son similares a
los que pueden verse en las imágenes convencionales y, en muchos casos, el algoritmo
de segmentación gestiona bien la imagen al margen de la zona afectada por el efecto
fantasma. Los movimientos provocan imágenes borrosas con bordes difusos.
ADVERTENCIA: Si el paciente se mueve de su posición original, se produ-

cirán errores en las transiciones entre tejidos en el mapa R2 y errores de
medición graves en el mapa R1. Esto tendrá como resultado unas imáge-
nes de contraste inservibles y una segmentación deficiente. En la Figura 6.1
se muestra un paciente con derrame cerebral que se ha movido durante la
exploración.

6 Advertencias
6.2 Desviaciones: MRI sintéticas

Las imágenes sintéticas de contraste ponderado están concebidas para que tengan un
aspecto similar al de las imágenes MRI convencionales. Hay factores que contribuyen a
que las imágenes sintéticas sean distintas de las convencionales.
6.2.1 Sangre negra
Figura 6.2: La señal de la sangre en movimiento se suprime en las imágenes

sintéticas. Por ejemplo, las arterias no se realzarán en una imagen T1W sintética
(a la derecha) tras la administración del medio de contraste, al contrario de lo
que ocurre en una imagen T1W convencional (izquierda).
La adquisición de imagen para cuantificación suprime la señal de la sangre en movimien-

to. Esto resulta en imágenes sintetizadas con efectos de «sangre negra». Las arterias no
se realzarán en la imagen incluso aunque se haya administrado un medio de contraste.
La sangre que no se encuentre en movimiento, a consecuencia, por ejemplo, de una fuga,
realzará el valor T1 en las imágenes sintéticas. Esto también es aplicable cuando se ha
acumulado medio de contraste en el tejido.
ADVERTENCIA: Se recomienda realizar una adquisición MDME antes de

administrar el medio de contraste.
6.2.2 Sensibilidad al flujo
Figura 6.3: Señal hiperintensa debido a un chorro de flujo de CSF.
Al igual que ocurre con las MRI convencionales, las MRI sintéticas pueden verse afectadas
por artefactos provocados por el flujo. Por ejemplo, puede producirse una banda de
artefactos fantasma debido a una arteria grande o a un chorro de flujo de CSF (consulte
la Figura 6.3).

6 Advertencias
ADVERTENCIA: Los artefactos de flujo, en concreto, son más pronunciados

para cortes más finos. Cuanto más fino es el corte, más probables y pronun-
ciados serán los artefactos. El flujo en las arterias también puede provocar
una señal de vaso aparentemente hiperintenso (también conocido como «hi-
perintensidades arteriales») en imágenes FLAIR.
6.2.3 Posible desaparición de pequeñas peculiaridades

Al igual que en las MRI convencionales, las pequeñas peculiaridades desaparecerán si la
resolución es demasiado baja para la peculiaridad de interés en cuestión.
ADVERTENCIA: En las MRI sintéticas, el cálculo de R1, R2 y PD se basa en

un modelo que asume que la relajación en cada vóxel es monoexponencial.
Por lo tanto, las pequeñas estructuras que no resulten ser el componente
dominante en cualquier vóxel podrían desaparecer y no ser visibles en la
imagen sintética.

6 Advertencias
6.3 Funciones específicas para MRI sintéticas

6.3.1 Usar ROI hasta tejido nulo
ADVERTENCIA: Si se seleccionan zonas grandes en las que haya más de un

tipo de tejido, cabe la posibilidad de que el algoritmo de anulación seleccione
un TI que no corresponda a ningún tipo de tejido. Por ejemplo, si se selec-
ciona una ROI grande que contenga tanto WM como CSF en proporciones
aproximadamente iguales, se originará una anulación incorrecta. Consulte la
Figura 6.4, en la que se ilustran los efectos. Los mejores resultados se logran
creando una ROI que contenga solo el tejido de interés.
Figura 6.4: Efectos de la ubicación de la ROI para la función de anulación de

tejidos. Observe que en 6.4D puede verse el núcleo caudado (nucleus caudatus)
una vez cancelada la materia blanca.
6.3.2 Mediciones cuantitativas

Las mediciones cuantitativas de R1 (T1), R2 (T2) and PD se han verificado en estudios
con maniquís. Un conjunto de maniquís con diferentes combinaciones de R1 y R2 se
escanearon y cuantificaron con SyMRI, y los resultados se compararon con la recupera-
ción de inversión para R1 y la secuencia CPMG (Carr-Purcell-Meiboom-Gill) multi-eco
para R2. Para PD, se utilizó un maniquí diferente, con diversas concentraciones de agua
pesada. Se constató una buena correlación para todos los parámetros. La diferencia me-
dia, la desviación estándar y el rango de verificación (intervalo) para los parámetros
cuantitativos y los distintos fabricantes e intensidades de campo se indica en la Tabla
6.1.
Nota: El uso de SyMRI con datos de entrada MDME procedentes de escáne-

res Siemens no cuenta aún con la autorización 510(k) de la FDA de Estados
Unidos y, por tanto, estos equipos no están disponibles actualmente para la
venta en Estados Unidos salvo de forma limitada a la investigación o el uso
con fines de investigación.
Tabla 6.1: Precisión de SyMRI en comparación con el patrón oro en estudios fantasma
Philips GE Siemens
Parámetro Intervalo
1.5 T 3.0 T 1.5 T 3.0 T 1.5 T 3.0 T
𝑅1 0.5 − 3.33 𝑠−1 4±7 % 9±7 % 5±7 % 7±6 % 0 ± 11 % 1 ± 11 %
𝑅2 2.5 − 25 𝑠−1 7 ± 2 % 16 ± 10 % 12 ± 13 % 16 ± 10 % 11 ± 6 % 17 ± 4 %
𝑃𝐷 20 – 100 pu 7±8 % 5 ± 11 % 2 ± 4 % −1 ± 5 %
Los resultados obtenidos en los estudios fantasma se ilustran en la Figura 6.5.

6 Advertencias
25 120
3.5
3 100
R2_MDME (s-1) at 3T
20
R1_MDME (s-1) at 3T
PD_MDME (%) at 3T
2.5 80
15
2
60
1.5 10
40
1
5
20
0.5
0
0 0
0 5 10 15 20 25 0 20 40 60 80 100 120
0 0.5 1 1.5 2 2.5 3 3.5
R1_IR (s-1) at 3T
10

0.5 0.5 8
0.4 0.4 6
0.3 0.3 4
0.2 0.2 2
0.1 0.1
0
0.0 0.0
-2
-0.1 -0.1
-0.2 -0.2 -4
-0.3 -0.3 -6
-0.4 -0.4 -8
-0.5 -0.5 -10
0 0.5 1 1.5 2 2.5 3 3.5 0 5 10 15 20 25 0 20 40 60 80 100 120
Figura 6.5: Mediciones cuantitativas de SyMRI en comparación con las medi-

ciones cuantitativas patrón oro en estudios fantasma de GE Discovery MR750
3 T.
6.3.2.1 Rango dinámico

El rango dinámico de las mediciones para los parámetros tisulares cuantitativos se indica
en la Tabla 6.2.
ADVERTENCIA: Los valores que estén fuera del rango dinámico se trunca-
rán.
Tabla 6.2: Rango dinámico para SyMRI.
Valor Unidad Mín. Máx.

T1 ms 250 4 300
R1 𝑠−1 0.23 4
T2 ms 10 2 000
R2 𝑠−1 0.5 100
PD pu 0 160
6.3.3 Segmentación
La segmentación en SyMRI está basada en agrupaciones predefinidas (WM, GM, CSF)
definidas para representar la materia blanca, la materia gris y el líquido cefalorraquídeo.
Tenga en cuenta que puede haber tejido patológico con valores equivalentes a los de
cualquiera de los tejidos definidos como sanos. Asimismo, puede haber tejidos sanos que
no se correspondan con las definiciones de tejido definidas. El volumen parcial se calcula
a través de un modelo de simulación (simulador Bloch) que equipara los valores entre
dos agrupaciones de tejido al tipo de tejido parcial estimado.
PRECAUCIÓN: Cualquier comparación absoluta entre cerebros distintos o
un cerebro escaneado en distintos momentos debe realizarse en versiones

6 Advertencias
comparables de SyMRI. En las presentes notas de la versión se indicará si se

han efectuado cambios en comparación con versiones anteriores de SyMRI.
ADVERTENCIA: En los vóxeles con volumen parcial de tejido conocido y

volumen parcial de hueso, aire u otro tejido con PD baja, la segmentación
puede clasificar erróneamente el vóxel como NON-WM/GM/CSF en vez de
clasificarlo como volumen parcial de tejido conocido y volumen parcial de
NON-WM/GM/CSF.
ADVERTENCIA: Si hay mezclas de tejidos patológicos en un vóxel, el tejido

del vóxel podría clasificarse parcialmente de forma incorrecta como resultado
de los efectos de volumen parcial. Por ejemplo, un vóxel que contenga dos
tejidos patológicos en el que la mezcla se entrelace con un tejido conocido
podría provocar una clasificación incorrecta como volumen parcial del tejido
conocido.
ADVERTENCIA: La administración de oxígeno durante la adquisición de

MRI puede incrementar la tasa de relajación R2 en el tejido cerebral y, por
tanto, afectar al análisis de segmentación.
6.3.4 Factores que afectan a las estimaciones de volumen

Se han llevado a cabo verificaciones y validaciones para evaluar la repetibilidad de las
mediciones de volumen. Las mediciones están basadas en definiciones de tejidos predefi-
nidas.
ADVERTENCIA: No se ha efectuado ninguna comparación con el CSF, la

materia gris o la materia blanca biológica.
6.3.4.1 Precisión
Para las estimaciones de volúmenes efectuadas en SyMRI, el volumen de cada vóxel
individual se calcula como producto del área base del vóxel en el corte y el intervalo del
corte (slice spacing), que incluye el espacio entre cortes (slice gap). Se utiliza el intervalo
del corte en lugar del grosor del corte (slice thickness) para incluir el volumen cerebral
completo. En la Figura 6.6 se ilustra cómo están interrelacionados el intervalo, del corte
el grosor del corte y el espacio entre cortes.
PRECAUCIÓN: SyMRI calcula el contenido de tejido en un espacio entre
cortes basándose en los dos cortes adyacentes. El espacio entre cortes (Figura
6.6) debe ser pequeño para evitar grandes aproximaciones en las mediciones.

6 Advertencias
Intervalo del corte =

Espacio entre cortes +
Grosor del corte
Figura 6.6: Ilustración de las relaciones entre Intervalo del corte, Espacio entre
cortes y Grosor del corte.
6.3.4.2 Repetibilidad
Para validar la repetibilidad del método de segmentación, se realizaron mediciones IN
VIVO en siete sujetos sanos (de entre 32 y 48 años de edad) que fueron escaneados con
un escáner GE 450W 1.5 T, un GE 750 3 T, un Philips Ingenia 1.5 T, un Philips Ingenia
3 T, un Siemens Aera 1.5 T y un Siemens Prisma 3 T. Los sujetos fueron escaneados dos
veces en cada escáner, y se les sacó del escáner entre las adquisiciones. No se escaneó a
todos los sujetos con los escáneres de Siemens.
La repetibilidad de los volúmenes de los tejidos cerebrales como porcentaje del volumen
intracraneal y la repetibilidad de la BPF se indican en la Tabla 6.3. La repetibilidad
indicada es la desviación estándar intrasujetos; esto quiere decir que el coeficiente de
repetibilidad se puede obtener multiplicando los valores por 2,77.
Nota: El uso de SyMRI con datos de entrada MDME procedentes de escáneres Siemens
no cuenta aún con la autorización 510(k) de la FDA de Estados Unidos y, por tanto,
estos equipos no están disponibles actualmente para la venta en Estados Unidos salvo
de forma limitada a la investigación o el uso con fines de investigación.
Tabla 6.3: Repetibilidad de SyMRI.

GE 450W 1.5 T 0.38 % 0.42 % 0.14 % 0.10 % 0.12 % 0.14 %
GE 750 3 T 0.62 % 0.58 % 0.15 % 0.15 % 0.21 % 0.15 %
Siemens Aera 1.5 T 0.45 % 0.50 % 0.11 % 0.13 % 0.13 % 0.11 %
Siemens Prisma 3 T 0.39 % 0.32 % 0.10 % 0.06 % 0.14 % 0.10 %
PRECAUCIÓN: Para adquirir mediciones de volumen comparables, es im-

portante utilizar la misma versión de software de SyMRI en todas las explo-
raciones. Las mediciones volumétricas realizadas con diferentes versiones de
SyMRI pueden diferir debido a cambios en el software. Compare únicamen-

6 Advertencias
te conjuntos de datos que se hayan cuantificado y segmentado con la misma

versión de SyMRI.
PRECAUCIÓN: SyMaps del mismo conjunto de datos pero generados uti-

lizando diferentes versiones de SyMRI no son idénticos. La segmentación se
realiza basándose en la combinación de R1, R2 y PD en cada vóxel. Por tan-
to, cualquier diferencia en los SyMaps puede afectar a la segmentación y a la
medición de volumen. En resumen, utilizar SyMaps generados por diferentes
versiones de SyMRI puede dar volúmenes diferentes incluso aunque ambos
se basen en los mismos datos de adquisición de MDME e incluso aunque
ambos se carguen en la misma versión de SyMRI.

6 Advertencias
6.4 Advertencias adicionales

6.4.1 Requisitos del sistema
ADVERTENCIA: SyMRI solo debe utilizarse de acuerdo con los requisitos

del sistema. Cualquier divergencia con respecto a los requisitos del sistema
puede provocar cualquier resultado, desde cambios muy sutiles hasta la gene-
ración de conjuntos de datos que no se puedan cargar en SyMRI. Cualquier
intento de cargar datos no generados tal como se especifica en los requisitos
del sistema infringe el uso previsto de SyMRI.
6.4.1.1 Espacio entre cortes

El espacio entre cortes afecta a la cuantificación de R2 (T2) y a las estimaciones de
volúmenes en la segmentación. El espacio entre cortes recomendado es el 25 % del grosor
del corte. Se recomienda esta separación porque proporciona una buena compensación
entre el error de estimación de volumen y la intercomunicación.
PRECAUCIÓN: El espacio entre cortes debe ser de al menos el 10 % del
grosor del corte para evitar intercomunicación entre cortes. La intercomu-
nicación afecta a la cuantificación de R2 (T2) y causa la sobrevaloración de
R2. Esto llevará a una sobrevaloración del contenido de MyC.
Si la separación entre cortes es amplia, puede aumentar el error de estimación para
volúmenes de tejido dentro del espacio entre cortes. Consulte el Apartado 6.3.4.1.
6.4.1.2 Grosor de corte

El grosor de corte afecta a la cuantificación, la resolución de pequeñas peculiaridades y
el riesgo de artefactos de flujo. El grosor de corte recomendado proporciona una buena
compensación entre la resolución y los artefactos de flujo.
Si los cortes son finos, es más probable que aparezcan artefactos de flujo. Para más
información, consulte el Apartado 6.2.2.
Si los cortes son gruesos, la cuantificación se verá afectada por efectos de volumen parcial.
Para más información, consulte el Apartado 6.2.3.

6 Advertencias
6.4.2 Exploraciones de seguimiento utilizando distintas herramientas de

análisis
ADVERTENCIA: Herramientas de análisis diferentes utilizan diferentes

modelos y métodos de estimación de volumen, incluidas diferentes defi-
niciones de tejidos. Esto tendrá como resultado diferencias sistemáticas
entre diferentes herramientas. Comparar los volúmenes proporcionados
por SyMRI con otras herramientas de análisis en exploraciones de segui-
miento puede dar lugar a interpretaciones o conclusiones incorrectas. Si se
comparan los volúmenes de segmentación proporcionados, por ejemplo por
NeuroQuant, basándose en una adquisición 3D T1W, con los volúmenes
proporcionados por SyMRI basándose en una adquisición MDME 2D, los
volúmenes pueden diferir por diversas razones. Entre otras, las definiciones
de tejido en NeuroQuant y SyMRI son diferentes. Por ejemplo, SyMRI
utiliza volúmenes parciales, mientras que NeuroQuant asigna un tipo de
tejido a cada vóxel.
En general, hay que evitar comparar datos entre herramientas de análisis
distintas a menos que pueda justificarse la validez de la comparación entre
las distintas herramientas de análisis.
SyntheticMR AB recomienda encarecidamente utilizar siempre la mis-

ma herramienta de análisis para garantizar que sea posible comparar datos
de exploraciones de seguimiento y realizar las comparaciones de acuerdo
con las prácticas y los protocolos clínicos para seguimientos aplicables.
Nota: SyMRI solo puede analizar volúmenes de tejidos tomando como base datos de
secuencias aprobadas para el uso con SyMRI. Consulte la lista de secuencias aprobadas
y los parámetros de secuencia recomendados en la Lista de requisitos del sistema FORM
75-10.
6.4.3 Codificación de caracteres
ADVERTENCIA: Si se carga un conjunto de datos con caracteres no occi-

dentales para la información textual mostrada en el HUD en SyMRI, esta
información no se mostrará correctamente. Si desea obtener más información
sobre la información textual que se muestra en el HUD, consulte el Apartado
3.2.1.1.
6.4.4 Software de anonimización
ADVERTENCIA: SyMRI utiliza determinadas etiquetas DICOM privadas

para poder cargar conjuntos de datos (consulte la Declaración de conformi-
dad con DICOM). Si se utiliza software de anonimización, hay que asegurarse
de que estas etiquetas se mantengan.

6 Advertencias
6.5 Advertencias específicas del escáner

6.5.1 GE
Las siguientes advertencias solo son aplicables al uso en escáneres MRI de la marca GE.
6.5.1.1 Anonimización
PRECAUCIÓN: GE utiliza etiquetas de DICOM privadas para almacenar

unos cuantos parámetros de adquisición requeridos por SyMRI. Utilice las
herramientas de anonimización proporcionadas por GE para mantener el
anonimato de estas etiquetas. Los conjuntos de datos en los que falten las
etiquetas no pueden ser abiertos por SyMRI.
Las etiquetas requeridas por SyMRI se enumeran en la declaración de conformidad de
DICOM. Si utiliza una herramienta de anonimización no proporcionada por GE, confirme
que se mantienen las etiquetas requeridas.
6.5.2 Philips
Las siguientes advertencias solo son aplicables al uso en escáneres MRI de la marca
Philips.
6.5.2.1 Paquetes múltiples

Tenga en cuenta que la FORM 75-10 System Requirement List requiere que el escáner
no genere paquetes múltiples.
En escáneres de MRI Philips con software Philips, versión 4.x.y (solo disponible para
3T) o 5.1.x (disponible para 1.5T y 3T), la consola del escáner mostrará que va a generar
varios paquetes, pero no almacena esta información en los objetos DICOM; esto significa
que no es posible para el software de posprocesamiento, como SyMRI, para detectar si
el escáner ha generado varios paquetes tras el escaneo. Por tanto, es responsabilidad
del operador del escáner asegurarse de que el escáner notifique que no generará varios
paquetes.
A partir de la versión 5.2.x del software Philips, la existencia de varios paquetes generará
un conflicto en la tarjeta de exploración y el escaneo no se podrá iniciar.
ADVERTENCIA: La carga de datos de paquetes múltiples podría desembo-

car en resultados impredecibles que tal vez no parezcan incorrectos.
6.5.2.2 Orden de cortes
PRECAUCIÓN: En escáneres de MRI Philips con la versión de software

Philips 4.x.y (solo disponible para 3T) o 5.1.x (disponible tanto para 1.5T
como para 3T), asegúrese de que el orden de los cortes en la tarjeta de ex-
ploración esté ajustado a Ascendente o Descendente, y no a Predeterminado
o Intercalado.
Estos últimos ajustes hacen que la cuantificación de T1 oscile entre cortes, lo que puede
verse seleccionando una ROI grande y desplazándose por los cortes. En tal caso, la
curva de tejido cerebral normal en la gráfica R1-R2 se desviará a la derecha/izquierda

6 Advertencias
prácticamente en uno de cada dos cortes. A partir de la versión 5.2.x del software Philips,
las opciones de orden de cortes Predeterminado e Intercalado se han eliminado.
6.5.3 Siemens
Las siguientes advertencias solo son aplicables al uso en escáneres MRI de la marca
Siemens.
Nota: El uso de SyMRI con datos de entrada de MDME procedentes de

escáneres Siemens no cuenta aún con la autorización 510(k) de la FDA de
Estados Unidos, por lo que estos equipos no están disponibles actualmente
para su venta en Estados Unidos salvo de forma limitada para la investigación
o para su uso con fines de investigación.
6.5.3.1 Posición del paciente
PRECAUCIÓN: Coloque siempre al paciente de forma que la anatomía que

se quiere visualizar se encuentre en el centro ISO del escáner. Si el paciente
está mal colocado, el campo B1 no será óptimo y es posible que la cuantifi-
cación no se realice correctamente.
Los escáneres MRI tienen condiciones de imágenes óptimas en el centro de la bobina, el
centro ISO del campo magnético. Utilizar el láser para colocar correctamente al paciente
garantizará una cuantificación óptima y, por tanto, una calidad óptima de las imágenes
sintéticas.

Parte V
Apéndice

7 Teclas de método abreviado

A continuación se incluye una lista de todas las teclas de método abreviado disponibles
en SyMRI y su función correspondiente.
En macOS, las siguientes teclas de método abreviado son distintas con respecto a
Windows:
macOS
• en lugar de Ctrl.
• F13 en lugar de Insert.
Tecla de método abreviado Función

1 T1W
2 T2W
3 T2W FLAIR
4 STIR
5 PSIR
Re Pág Ir al corte anterior

Flecha arriba Ir al corte anterior1
Av Pág Ir al corte siguiente
Flecha abajo Ir al corte siguiente1
Inicio Ir al primer corte
Fin Ir al último corte
Ctrl+R Formato de contraste

Ctrl+F Formato de SyMaps
A Escala auto
C Color
Ctrl+Z Acercar
Ctrl+Mayús+Z Alejar
Ctrl+P Interpolar
Ctrl+X Delinear ROI

Ctrl+C Copiar ROI
Ctrl+V Pegar ROI
Retroceso Desactivar ROI
Tabulador Activar ROI siguiente2
Mayús+Tabulador Activar ROI anterior2
Ctrl+1 1 ventana
Ctrl+2 2 ventanas
Ctrl+3 3 ventanas
Ctrl+4 4 ventanas
Ctrl+5 5 ventanas
1
No disponible en SyMRI Plug-In ya que lo utiliza la ventana del host Sectra PACS IDS7.
2
Para Múltiples ROI

Ctrl+6 6 ventanas
F4 Herr paginación
F5 Herr panor1
P Herr panor
F6 ROImano alzada
F7 ROI rectangular
Z Herram. zoom
Q Ajustar TE
W Ajustar TR
R Ajustar TI
T Ajustar TI-TI3
Ctrl+I Prepulso de inversión
Ctrl+O Abrir...
Ctrl+Mayús+S Guardar todas las pilas visibles en carpeta local...
A la Herr panor también se accede manteniendo la tecla «Mayús» presionada. A la

Herram. zoom también se accede manteniendo la tecla «Ctrl» presionada.
Las teclas «S» y «F» se pueden utilizar junto con Ajustar TR, Ajustar TI o Ajustar
TI-TI para aumentar o reducir el ritmo al que se modifican los parámetros de tiempo
cuando se mueve el cursor. También se pueden utilizar para desplazarse con más rapidez
por los cortes y al ajustar la configuración de las ventanas.
Cuando la función Máscara usuario está disponible, se pueden utilizar las siguientes
teclas de método abreviado:
U Mostrar máscara de usuario
Ctrl+B Desactivar fondo
Con SyMRI NEURO también están disponibles las siguientes teclas de método abreviado.

Ctrl+S Formato de segmentación
6 Tabla de segmentación
7 Materia blanca
8 Materia gris
9 Líquido cefalorraquídeo
0 NON-WM/GM/CSF
Y Mielina (MyC)
I Máscara intracraneal
H Mostrar borde de máscara intracraneal
Ctrl+B Desactivar fondo
Insert Añadir a máscara intracraneal

Supr Eliminar de máscara intracraneal
M Añadir a másc usuar
3
Se requiere licencia para sDIR.

Coma (,) Copiar tejido de ROI en Máscara usuario - Subir

escala
Punto (.) Copiar tejido de ROI en Máscara de usuario - Volu-
men parcial
Resta (-) Eliminar de máscara de usuario
Ctrl+C Copiar tabla de segmentación

®
SyMRI® 11
SyMRI
Versión 11.0.7
SyntheticMR AB
Storgatan 11
UDI: (01)07340024700030(8012)11.0.7 SE-582 23 Linköping, SWEDEN

User Manual SYMRI

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SyMRI ®

Not For Clinical Use (NFCU)

• Canada and the countries where Health Canada regulations is applicable:

Investigational Device – To Be Used by Qualified Investigators Only

PART I – WORK WITH SYMRI®....................................5

3 CONCEPTS AND FUNCTIONS...................................... 9

SyMRI® | MEDICAL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) CONTENTS II

PART III – SYMRI® NEURO....................................... 27

SyMRI® | MEDICAL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) CONTENTS III

SyMRI® | MEDICAL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) CONTENTS IV

1.2 Intended Use

SyMRI® | MEDICAL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) 1 INTRODUCTION 1

CAUTION: The synthetic T2W FLAIR shows an edge-enhancement effect

CAUTION: We recommend that any changes visible in T2W FLAIR are

CAUTION: For diagnosis of illnesses resulting in edge-enhancements in the

WARNING: Patient management decisions should not be made based solely

SyMRI® | MEDICAL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) 1 INTRODUCTION 2

BPV The Brain Parenchymal Volume; the volume of all tissues in

CSF SyMRI’s definition of Cerebrospinal Fluid (see Section 5.2)

FLAIR FLuid Attenuated Inversion Recovery, an MR image where the

IR Inversion Recovery; imaging where an inversion prepulse is applied.

SyMRI® | MEDICAL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) 1 INTRODUCTION 3

NOTE: Example of Note

CAUTION: Example of Caution

WARNING: Example of Warning

SyMRI® | MEDICAL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) 1 INTRODUCTION 4

This paragraph only applies to SyMRI StandAlone. StandAlone

This paragraph only applies to SyMRI for Microsoft Windows. Windows

This paragraph only applies to SyMRI for macOS. macOS

This paragraph only applies to SyMRI for Network. Network

2.1 SyMRI for Sectra PACS IDS7 (Plug-In)

Figure 2.1: The workspace in SyMRI with a floating toolbar.

2.1.1 Starting and Exiting

2.1.1.1 START SYMRI

SyMRI® | MEDICAL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) 2 DEPLOYMENTS OF SYMRI 6

2.2 SyMRI StandAlone for Microsoft

2.2.1.1 START SYMRI

2.2.1.2 CLOSE SYMRI

2.3 SyMRI StandAlone for macOS

2.3.1.1 START SYMRI

2.3.1.2 CLOSE SYMRI

2.3.2 Keyboard Shortcuts

SyMRI® | MEDICAL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) 2 DEPLOYMENTS OF SYMRI 7

2.4.1.1 START SYMRI

2.4.1.2 CLOSE SYMRI

SyMRI® | MEDICAL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) 2 DEPLOYMENTS OF SYMRI 8

3.1.1.1 SYMRI IMAGE

3.1.1.2 SYMRI NEURO

Figure 3.1: The

SyMRI® | MEDICAL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) 3 CONCEPTS AND FUNCTIONS 9

3.2.1.1 VIEWPORT IMAGE INFORMATION

WARNING: Information about the contrast agent/bolus is shown only if

SyMRI® | MEDICAL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) 3 CONCEPTS AND FUNCTIONS 10

Information on contrast weighting is only visible in viewports where a contrast weighted

Contrast weighting information: The contrast weighting information is displayed in the

NOTE: Even though SyMRI is integrated in Sectra IDS7, it is a separate program.

SyMRI® | MEDICAL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) 3 CONCEPTS AND FUNCTIONS 11

Preferences › Delete Layout Delete a saved layout. Each saved layout is an item in a

3.4.2 View Options

View › Interpolate «Ctrl+P» Interpolation gives a smoother visualization of contrast

SyMRI® | MEDICAL REGUL ATIONS APPLY (PAGE I) 3 CONCEPTS AND FUNCTIONS 12

3.5 Viewing Images

The zoom steps are predefined.

The following tools can be found in the SyMRI toolbar.