Professional Documents
Culture Documents
l
frqłl hro we rnt bodĄ po nu ahr'w prod/łhtf. 14
'q,te_rr'9,f,ów fi.,orqąnt'X,rn
rc,nt'o,, rn
oynocla ,tu W tłń
_
c 6tłl.
Tod"a,ć,aI
,
lłoei"rlro;\e Kt,lrrąórrlłCIt,lp. łi t
owt'ecLnr-lh kom
hom6rek, ^fi,
in vu}w r] nn.'rn €,tl tfuą
ź. t§,>Yt^ąowe nt'n hnĄowtt. hom_t< rlłr wu{qh l
-, \or.ho siłsbe_m m_O,d"g\0wt^ w xq_a(qwe orąpn\zm,!
{e tgWruc zn
JJgKSuc
^ąrnt'g,Ą" fiC(,
Zn o,rcr
ąth now tc twłl\rorłńt_h
:: twrffA§nlg tlĄ&neK _ " *
-" proglvLtk u',9" §i(Ul"ept.OnŁ \ł \'
--, vŁDLi hr&tl'O- i uu KL a r.łr-t tJw
::KUllM§l
;,py Kt{oJ{c,0L -t-"o.'p"ęuĘ*vń:
Bt
l"§.,
5. ?_rx.rłilr2lowr}n(g r' ł|r.rlĄ\.ł]6aul'u *,lq
,.#
.:->
'P"OilsYąwo we SV'rOvCjLnt,K[ -
.l7.,\ł:twte qnie
U,Pm§d}ł:* l
e nO"
Mrn§rxłr,ą
{"
\
-\
+
Ąf,
-:1
a I a\
#7
r/ź=J
.
_Ł_
rcLł(ąt'f,,tix
są oLD te t,t) łohstłt^n MJb Ąlert,4tnp§lrJ
0Wh\'0tĆ
6ręX L' ĄLerqth_g
Fłńtł kUasu; it ł.,t -Vzrnrc,
1
*r"ro_,** _"
ń ou L0
_.___ ___- _
br9"rcrt
ntKt W \^JX,
ńwrłłuł'tt0
:^L*uąPo:l,ruł n t'nł Ęm . NOd^LL
nŁ \ thgmr'uang w!Ąśu'wo{ui vne {yn . PV
ffi
..
ńU sO,JOLK&"
l{tttuer, htŁoLv
Lqd,roLia,c"Ł.q §Ot0
ńąn t'em-q§& (^ En t"D- t
ńq,łł>u\m r:MQ\r,loLn
ąb(\'ą t".li't,UsU ,
\"gt_!t@"
Pltyl(
F9rń, _d $9ęl_toviutm,
o
BB" m&t20"
CWr§f €sLŁntw o,utŁvr rro§tl'l
rxgińowuw$niu Ńo"n tr,ł" i d,Usty 6 vUi( [t'n, tt
Komó rh0w§!h_: ńnłwt'§k'T9g_W_ r,v hł rn
wterą, vów nt]?d" rnórl^vt' n t'Uiln8,
.p \lr§ńLĄJ tlnl'e h rKł' Ą factłvw
W \No"rw\Ąl^,oń tnrŚ
n r"
- i^r' m Ó r |^ŃW_(_:^ O,,QWL& wr e)p-
Yvnw
r''
0"t L'e \^
pul^1
1
fttu
tĄrr l
* t-Ktc" Dx.u§ O"nU.,
{o{ p"l l.Ł t
\, §.
§sx KoLąfrOnO,ile n a" \ł r OSP9
, PtLAc, rpwwir it - lJr|Cfrue
\§§ ,ąLQ, V\,t)rnÓr ą t-rłcn ntŁ
nnt Yn\'
qJ§-
innte \" pyzc
. rn
e ną ppt^,t
Ę_§
Ł t§Ąy
tf/,t
il^ró ttx)nn, wą_ĘfiłĄ}_)
Kplm$rhł n{e .rvtną hO, ?Oble
-J:--_L'V-!_:],-Y! VY t v- \
. _ _= ,^
= =_
\r{ Ąnę/O,LW(Y\, -
3
0 YOd 'v /.{lrń óTl,r,ł-" rot
Ąt.Vt óCVrt
ffi
]
po\)v^tvuhĄ'.
, te oLńĄ
,i,J W,i}.n e
ńt/
,
,ffit"
\ f
e,
t^,o
'rn ł,n]UeirŁ€,Ln
ifffifrffifo,.l,rru_*
Oht'firn U,
,won r]g Lt'n [u
tfr lO
nt'rr Ln6t uJ vlw
lĄorrr ń rTh"\ |.wo,
rd"Łń en {^eą
Yy\ : t^lt' n0§6,
(t-nfę, [Intr"'
-pO
^8, rvt'łzt rn ń
rr 0W
- r\nu tcntrr\,nt'Ur W&n
tŁ nt ,_ ąpLen ou,tktłą
t/\^\),
ttu"r,_ Łkn n n o ulfł!Fz_:_
ń,nx fT;IuomTffin,olnergnbŁ
,rt'op ruĘJc Fu y^lt-a
Ą
J ,L-
o nat^nft@t'
Vrn Xu
kp ąlrruEqp]e]O§I
Trn
{vt l \ł ńtMo rtN \Ą(i?o
wO|nrl no,ff
LLo- , X'U UO- lT
']_§
L'
\,! :UuxnOrtr i,,t'uĄ ne
* rnU W
]v drn t'f, Yntlr"th" na.
nnL,
-& rr"ł t ,{łJr. n
1,] ii, i ił t'Ł
t' q
[>
1,t {,
rónne
n0. 0f,lĄ,ł,,
Y-^gDVĄ?
l'l[O, to ĘQ9:Ą
Tqnt, 1ni nć t,9h t nŁtĄ -
ft (yyl, lltt m§tkĄ
n(i,ł"nit o^ $qĘ
OLov rnL l)
t*/ n(}, Pr-c tt,
i
Dp,
ne tŁM& ĄL' Om Ov
$D
r,"t; \,ttrn t | - Tnte Ą,r§n/
^)U r\prn*ren,
vyó,
UX\^t^'\,t n"n e
\
ł , Ń*i,p,rÓŁsłrl i, noipow:a9^1Ętrr'e!l*q
T9 iug, 't1.^ł^'u"5jb^łbĘ
biÓiŁ[ nryNp.rnbcnroyvrlry4ń ^.lqwooL
uióreU .rnl"p^crrbcnrowrl"+4ń ru' N! ł, ĄurrŁnnł.
olru'"^:l L.{}
*^B$WtłU'T§l f, },b .
abu C;,t
łWń
! )ff
r,crn qJo
b.^'(Y"{rrnE{Ov"oulc\ n
y*?ł\r
,
,
ę'
d- f,p {rro rn ą v^n
u
b io|^|e w
qC
1rć
fy\oJ:lti p nĄrrn{ y oĄ,o\gn l Qry1 '
,
ił
*.
Ę. ?vOoV,uK,,,\0., btmgl1 w "rrnu'\nyq2^rqlłni -&mo"ułr,
, roŃro nJrn,"rv-V.,v.eVl4iOryOryr" 6U,acw& t' rm tYl9.;OO\ńn,
_, rÓ;ńi oń uYtd1"Ąrn,C,nt0" \' łnrarVpvL0,rąlt',
-, bóręę,bUl'(L rnie,d.rrcor(dr a?ffiO,tĘVt'OIW r,
i
-, ha,\łbV,Ą"wr1roł& wv5łPl4p Wlą&ino;u ,
:, fq,Lwe. ńw iĘą-f,e nte ĄlłO,Li Ętod^ł lł ą't ) l .^
-, m,cł*...l n.il'Ó' "di;;ńiq{..,o, tuń rc*uĘ' da rn;7d?l"gy!
. ^
Weh,#..,*
p W., d,r,l (n
il**, &r§firy ",1,i49t,
oq nłr, Ńr ffio§'ÓJ'''
1,
"att 1
e
Dńę
-r fit'f-
-'1\tł&n0,r
Ą\rvO,ńO..r t
xl\d.nrn t-ł
Ki\{thit,Łu'
_; b'1cń
tr5 Ouc e0w \ł PV
lą ^0..{0Ąńk
- l nO.nLprnoU..r"\Uią :
u,' t,l'i -
rno e, |^nć
) Ę
Yę-V|vli rn On
,ht'"ru
'0, lnr-O-f( A'\,łtdkrt' t'('}
ns(,ą-
\'ęę'rĘrnQnCą
noqOn
j
l ółln^' r}"n§t,r n 3*ą9
T' Lłl ,. nn
Ł
4\
ńfch w \"y ^^'W-
fL-
)toe rO. C,^,
)n Cer ŁCLY )\, yan{Ą V\r c {Yitrl3{
ł-]
Y tb{ JOtĄł,
\)'
Uxn^ t^ł' -,
d-
atn(e
j
N, \nowńc;
oty^& fi ll,a-
ne beŁ
,łlt'O o-" ," |)l',
!
auvla
.hód.0-
14.?(OoW\Ątio, bttr!tr" pv-łe x. lro.n>Qtni tn
prod-tlkr,łO" \qutr" bio§t}d nkwąmp" TU\-Ńu}
d^,uł t,l 0.I€ ąi u, t* T"ł,.f|
9,{nct,;1:^!$4.',t,
illnłrr- \rud7'K,0' qrrbą\,colYYilCa rvO" poz.ł
^[1§
-, h,OnĘ0,rrr,r'\nlO, Q'c. l
-?\)C[rĄK,LrWe -?-5-,
-, bttqr q0, yo ryt-oy'fiĄ btrytt k.',
l
l]l
=ąĄ
t
t
H htułwo fl\, - ,c,lłĘr;.1 t.O,Xnnt noq€ful,
' 7tXel<nX"taD 'quJmu: pLnaml'naperw
vCg1^/o-n^ł e tDq-
t^rOl-
hr'3 Cfi r
bonr b nnL'hlL
ć( h
V* hovtrnam t/\,,X. oft t- ę*r
K,O OLrr 4
, .(y&ĄĆe ł.J-KDą.
-r;rrąmł' TT, lPl-
,lnfe r{ęrcnL.{ - bt 71-rĄ
j e, Wi \rU \tnrt
n( t \ \"\\tV
\^)n(0., t\ł
^KP nL
óxyl (
lrnĄU
V"F i
^rn^j\,Y\[
l
tetą"
ŁnOrnu kn -
lw{r Ńru&\
Ll^d \
/YlĄ YnL LeLe }r-
W(elr,
|\-|J
Ą
-,
v\
^Ufiu
H. fn,t'nn nC-
Yn(L
źr,a-^/O
rYL'
l
ŁnO y^yl
L' - opt'e
'}
rd,eJ- 0n
m ttgĄ łl
Eq','
u-
i
ł§M,S ?ł*WoW,!
iv[v\^/d, L' ,nli-
'y^ [e
rcrtndIrru, ,
*
ł_ńLTł*
/y\łO}rMc.l t*'
\
l
tfi tn na, py1 1' [rOb t,CWą v' a-
* 1rie ,,:-0!r(f-(fie
r t' i Y.l-t'c §vvt ĄpŁtŁ
v\§Ł_L_2kvŹBr_9_W_ Ą'tlźd.fiw( t\'Yt.\ (_,,iry,
L L,.! ry"'"d-.'r}ipg&-l4ѧl,
..
,'\,l' ]w Ą{ b"}l'fl,L5 t],y'1,1t.
ŁryWvt"yv3-
Y-UO" r\Ą ń[yt,5uJ ;
: ,r.
",;:.
.; i..
,1''1) N,'1.;,,)
}.'r,,,,i_' , ,. i,,,.,-i_, ) ,"\ |Y,,,,,r1.',1
,^,.,_l. (- .}.,
,v (t W S"d[\1Ł ł.ts,t'Y\łi Lr - \nn*łro ,d.,[ wrO
O$vłl u l.!u4r
u€K t'i,<.f
lĄ,ł}Clfl, cą i"ir J
t,tJ fię p\tĄ\tćt
,li
'[,r,'\"i\ \\
itt"'i.
")
nl p\ŁY]Ąt ruV - {x"ć ł
hrcCI
L_§en&i
rfu P_tQ"B:_ffit
\.Ł - u/ tłt rt] L€/Ke
m0n łT i ,/}\]
ół§t,,
NK:V)U§§ł
\e }-&l,ltilO\\ę W{\-ń>t i'Ą,
& .HapIen-, nlŁlĄ\ó rt t [ęrnŁrr,rt\
ł,llŃ,enłe Ąo,mg wrłl,Pt*ąJ
oiutnu rr/p, Sł-ru'lrcttn,lL
^/0-,
t-\^Ą4/łÓtłr\'v
Cf\Ą
,e,§Ą qeru ą *rd.powt'u1,{
t
b, lrnm'uń,pqeN
,Ł,,lrnm"unp,ąetv - qeru \,[
rń nruuy\,OtłJ Qł' t,r n0,
h,tpt'łO\r- wrrr ,}|Ą4qęnĄ w,r e:wQ NJ 7. 'yeLePtłrlĆĘ
§, Opl0n,l'il10.I,(a, WW- 0-nfu g el^L ^ (ezr a"lruyłćłoynĄl,
\0\,W \utĄ^}ło0}nP h;cĘndlh,L oto tq/q OW?7u4 ; '
tM(.ł H't§nd LaŁSł'
sĄ.|}*Ftę. wwrU o_nfu}gŁr^Iw
La f/iLL' Wu!,ustd O-r\flłJ0 Łr^fw ,W-b,; ?ncu'utł'oĄ
P+b; ?ncu'utł,cłĄ
fK.!ffiruffioncn oaó - \ Łryt ^arur*L' ńn rx,,sC, wnnó\"l^{
yrerc'Ąt,u ; .rn,Oi{e bulu' V,fly^ńrlĄnq{ł u/bfuLrywirg,fnP- ,,
Ł] PatVuXł- lv|,t'
ri.-ffi}
'd"
Y$r,' yofivl
ffi ń rw'{\If*
e\+Ł Y2v'ń,ąą'U",ut'n*,fąrtu' rtL_ ,ttorłt€-
\^cn6^rlxl pc^Ti!yt,t ,r,Ł l-p (t-,4ł-9rtl!/,:ę]
* óOń lr: iice"ru"ńd ; cr;j-,Ją dń-. ń##,}''#'J ;a;ić h -
F9yT,*,o,1FA "r ^
CCLĘO L
t
. .ź\/
_: ;,
!
ri
li+, J 1
il,ą-
;|
§#
\-]--,-
._l
t i
§.
,,\
rrlt} n o 5
/\ń'a rT-I2
0 yY\c a,Ł ą\r&p u fń
d*CxW_ ,&_ t,R
-- F.}.'ir] $-
J,l );
ne wunćLtWLt yp
*rf HiT -
y{,tn f ; ,"trn
fi e uł'Lłt-ł'tJ"i]S ff\Ą'
^
§
-.
.M,t
V
t )]f ,,
]a/
3
'rĄł,i,luł ŁUilł i,t,Y- .- {
\ffi\*ffi,ffi*m'ł,
I {,ĄĄ YC 'vĄ'r,1,1
w{PŃ ytf
rV w{p,/e
(, '-
rltąc, ut't rr e.
f'OL{ WtĄ,
' >,",{f,l}.tl,ęrl t |{/ tf l", LŁ l;:!fi
ń, r \łtPXj il,\, bi' O{O,,;ł- t' l llL
(ltl
l.- t,
/.' Utj{
.Ą.fuO t ŁL' ,[,\_
('- t i/),t,ł
e
r,,,
Y''] ujtr
tr,xr' 7y;P,l,'c,*
iorrl "{,,Owa*fi e
"l
i,[,,o fi.Q
[],ł-(J. .
ł:Ta(" DC.
,,fu
1. Sekwencjonowanie metodą terminacji łańcucha
Metodę tę wynalazł w połowie lat 70 XX. wieku Frederick Sanger. Jest to dośćpracochłonna metoda,
jednak nadal wykorzystywana do np. sekwencjonowania małych cząsteczek DNA np, produktów po
PCR. Dziękitej metodzie poznano 8enom człowieka iHGP) i innych organizmów eukariotycznych.
Metoda ta polega na róznicach rozdziału jednoniciowych cząsteczek DNA różniących się długością
zaledwie o jeden nukleotyd, przez elektroforezę w zelu poliakrylamidowym. przeprowadzenie
elektroforezy w kapilarze o długości50-80 cm i średnicy 0,1 mm pozwala na rozdzielenie populacji
cząsteczek o długoŚci do 1500 nukleotydów, tak że poszczególne co raz większe cząsteczki wychodzą
na końcu kapilary,
Sekwencjonowanie przeprowadza się przy pomocy polimerazy DNA, która kopiuje sekwencjonowanie
cząsteczki. Pierwszym etapem jest przyłączenie krótkich nukieotydów do matrycowego DNA, które
słuŻą jako startery do syntezy nowej komplementarnej nici DNA. Reakcja syntezy wyrnaga 4
trifosforanów deoksyrybonukleotydów (dATP, dGTP, dCTP, dTTP), które w zwykĘch warunkach
mogłYbY utworzyĆ zwykłą cząsteczkę DNA. Jednak w tej metodzie używane są trifosforany
dideoksYnukleotydów(ddATP, ddCTP, ddGTP, ddTTP), które są wyznakowane róźnymiznacznikami
fluorescencyjnymi. Polimeraza nie odróżnia dNTP od ddNTP, ale ddNTp powoduje blokowanie
Powstawanie dalszego łańcucha, bo związki te mają H w 3', Tak więc powstają cząsteczki DNA,
zakończone różnymi ddNTP, Aby uzyskać informacje na temat sekwencji, nalezy zidentyfikować
ddNTP na końcach każdej cząsteczki. W tym celu, przeprowadza się elektroforezę w zelu
PoliakrYlamidowym w kapilarze. Cząsteczki przesuwają się przed detektorem fluorescencji, który
rozróżnia znaczniki dołączone do ddNTP.
- PosiadaĆ duźą Procesywnośćtzn. nie mogą się odłączać w wybranym fragmencie, tylko w takim, w
którym przyłączone są ddNTP,
- nieznaczna aktywnoŚĆ egzonukleaz 5' do 3' lub jej brak, aby nie odejmowaĘ nukleotydów z końca 5',
- nieznaczna aktywnośćegzonukleaz 3' do 5' lub jej brak, aby nie odejmowaĘ ddNTP,
Na Początku stosowano fragment Klenowa, czyli pochodną polimerazy DNA z E.coli z usuniętą
aktYwnoŚcią egzonukleazy 5' do 3'. Jednakźe enzyrn ten odznaczał się małą procesywnością, więc
uzYskiwane fragmenty miały długośćokoło 250 bp. Ponadto nici utworzone są naturalnie, a nie
włączone do nich ddNTP. Tak więc obecnie stosuje się polimerazę Taq, dzięki której uzyskuje się
fragmenty długości750 bp lub więcej,
2. Sekwencjonowanie cykliczne
W tej metodzie, podobnie jak przy terminacji łańcucha, stosuje się oligonukleotydy, które zatrzymują
działanie polimerazy. Jednakże są odwracalne, bo po odczytaniu danych, tworzenie łańcucha
postępuje. Usunięcie grupy chernicznej z węgla 3', najczęściej znacznik fluorescencyjny, Mieszanina
nie zawiera nukleotydów, więc każdy krok syntezy nici związany jest z jej zatrzymaniem. Detektor
wykrywa znacznik, enzym usuwa znacznik i kolejny proces zachodzi. Proces sekwencjonowanła jest
inicjowany przez przyłączenie startera do sekwencji adaptorowych dodawanych do końców
fragmentów DNA w trakcie przygotowania bibliotek, Metoda daje odczyt 300 bp, ale jest masowo
równoległa, tak więc w jednym doświadczeniu można uzyskać sekwencję o długości2000 Mb.
4.2 Pi rosekwencjonowanie
W tej metodzie w mieszaninie reakcyjnej znajdują się tylko deoksynukleotydy, a kopiowanie matrycy
zachodzi bez wymuszania terminacji. Synteza jest śledzonawraz z rozkładem pirofosforanu przez
enzym sulfurylazę, który jest wykrywany za pomocą błysków chemiluminescencji i który jest
uwałniany za każdym razem, gdy nowy nukleotyd jest dodawany do końca 3'. Każdy dinukleotyd jest
dodawany osobno w określonej kolejnościwraz z nukleotydazą. Jeżeli nie jest włączany, to jest
degradowany przeż ten enzym.
W tej rnetodzie sekwencja jest ustalana na podstawie sygnałów hybrydyzacji szeregu nukleotydów
komplementarnych do sekwencji matrycy, Najpierw przyłączany jest starter. Następnie dodaje się
mieszaninę 1024 oligonukleotydów, które reprezentują każdąz 5-nukleotydowych sekwencji.
Sekwencja jednego z nich jest komplementarna do odcinka matrycy bezpośrednio sąsiadującego ze
starterem. Oligonukleotyd wiąże się i ligaza łączy go ze starterem, Każdy oligonukleotyd jest
wyzna kowa ny 4 znaczni ka m i fl uorescencyj nym i.
nITTTTTnnTTnnnnTTTTnnTTnnITnTTTTnTTnTTnnTTnTTnnTTnnTTnnnTTnTTnTTnnTTTTnn
Aby odczytaĆ genom, naIezy wykonać po sekwencjonowaniu proces składania sekwencji. Najprostszą
techniką jest strategia shotgun, czyli ułożeniekrótkich fragmentów w takiej kolejnościi nakładanie
ich na siebie, jako pierwszy genom poznany w wyniku tej strategii był genom H. influenzae:
§ekwencjonowanie hierarchiczną strategią shotgun - genom fragmentuje się na duze odcinki do 300
kb i klonuje się do dużych wektorów np. BAC, Następnie identyfikuje się klony zawierające
zachodzące na siebie sekwencje i to pozwala utworzyć ciągi przylegających do siebie klonów - kontigi
klonów, Sekwencje wstawek składa się metodą shotgun. Sekwencję wyjściowąotrzymuje się łącząc
sekwencje wstawek połozonych po kolei,
r Analiza wzoru restrykcyjnego - klony trawi się odpowiednimi enzymami, rozdziela na żelu i
jeŚli wstawki dwóch klonów zachodzą na siebie to otrzvma się podobne prążki,
Określaniesekwencji aminokwasowej:
Białka można rozdzielać na sekwencje dzieląc na mniejsze łańcuchy ok 50 reszt w celu ułatwienia
sekwencjonowania. Specyficzne rozdzielanie łańcucha mozna przeprowadzić na podstawie np,
bromocyjanu, który rozdziela łańcuch w określonych miejscach(reszty metioninowe po
karboksylowych końcach) lub trypsyny(karboksylowe reszty lizyny i argininy). Peptydy po
rozcięciu poddaje się chromatografił, metodzie Edmana. Dodaje się kolejny enzym, który
rozszczepia polipeptyd w innych miejscach w celu uzyskania nakładających się
peptydów{chymotrypsyna- rozdziela wiązania peptydowe po karboksylowej stronie
aminokwasów aromatycznych i innych mających rozbudowany łańcuch
boczny).Chemotrypsynowe peptydy nakładają się na kilka trypsynowych i można określić
kolejność w białku.
Przeciwciała to białka syntezowane przez organizmy żywe w wyniku odpowiedzi na obcy antygen.
Przeciwciała składają się z łańcuchów lekkich i ciężkich połączonych wiązaniami disulfonowymi.
Znajdują się na nich miejsca wiązania antygenu domeny Fab oraz miejsca domeny Fc,
Przeciwciała rozpoznają określonąsekwencję aminokwasów na cząsteczce i to się nazywa
epitopem lub determinacją antygenową" Przeciwciała są swoiste. Antyserum czyli surowica
zawiera aktywne przeciwciała na wszystkie antygeny. Przeciwciała poliklonalne=heterogenne -
każde jest swoiste wobec innego epitoptl danego antygenu. Przeciwciała rnonoklonalne -
rozpoznają tylko jeden określony epitop danego antygenu,
ł Test poŚredni ELlSA - stosowany do wykrycia przeciwciała(HlV}: białkowy antygen wirusa jest
na podłożustałym w zagłębieniu, dodaje się przeciwciała od pacjenta, jedynie osoba
zarazona wirusem będzie miała przeciwciała przeciwko temu antygenowi, podaje się
przeciwciała związane z enzymem swoistym dla przeciwciał pacjenta, przemywa się i dodaje
się substrat, jeżeli zajdzie reakcja enzymatyczna to znaczy że pacjent jest zarażony bo ma
przeciwciała
Ł Test warstwowy EL|SA - stosowany do wykrycia przeciwciała, nie antygeny, przeciwciało
wiąŻe się do antygenu, podaje się antygen wiąże się z przeciwciałem, podaje się kolejne
przeciwciało z enzymem i-ll-
Technika Western białka poddaje się SDS-PAGE, przenosisię na filtr idodaje przeciwciało, komp|eks
-
antygen przeciwciało poddaje się przemywaniu innym przeciwciałem swoistym dia pierwszego
znakowanego radioaktywnie albo jak w przypadku testu ELISA. Zastosowanie: kłonowanie genów,
test na infekcję WZW C,
Spektrofotometria mas -
pozwala określićmasę cząsteczkową białek; Technika analizy zjonizowanych
cząsteczek w formie gazowej. Pomiaru masy dokonuje się papr?_ez wyznaczenie przyspieszenie jakie
mają jony w polu elektrycznym. Przyspieszenie jonu o mniejszej masie będzie mniejsze zgodnie z
F=ma, F będzie stałe, a pomiar przyspieszenia da nam masę. tsiałka nie są lotne więc powstały dwie
metody:
Masa cząsteczkowa białka i masa cząsteczkowa jego fragmentów uzyskanych metodą specyficznego
trawienia umożliwia jego identyfikacje spośród wielu białek w komórce. Białka po elektroforezie
mozna poddać trawieniu proteazą i uzyskaną mieszaninę ana|izuje się przez MALDI-TOF i masy
peptydów porównuje się z masami białek zdeponowanych w bazach danych,
1". Najpierw otrzymuje się kryształ poprzez działanie na białko siarczanem Vll amonu lub innej
soli co sprzyja tworzeniu się uporządkowanych kryształów, ponieważ atomy w krysztale
białka muszą być skierowane w odpowiednią stronę.
7. Uzyskanie wiązki promieniowania rentgenowskiego o długości0,154 nm poprzez rozpędzenie
elektronów uderzających o miedzianą anodę, Np. synchotrony(uderzają w kryształ białka,
częśćprzechodzi przez kryształ a częśćsię rozprasza. czyii ułega dysfrakcji ico się mierzy na
detektorze lub na kliszy fotograficznej, której zaczerwienienie jest wprost proporcjonalne do
natęzenia wiązki promieni rentgenowskich).
Technika ta opiera się na zasadach: amplituda fal rozproszonych jest wprost proporcjonalna do liczby
elektronów w atomie, rozproszone fale nakładają się czyli ulegają interfencji i ten sposób zależy od
ułozenia atomów.
;7
l
i'.l.r1 Lą l)
§,
{
I
/
^ub
eutq- odłol^ńl
] tlrvr rytLŁy\,obo^' t ll A
V\ń/\
n
łt, owt} n
9
Ły^L^' t? m
J-=-iĄ c/n^l Korn^J
$CIo Ol§t rn nLL
-r \.P ż
*)t k^"'r"a - ffi,O^i
,a Vf,
_-L
l ŁL' ,, rY,,alYJ"YWtn^r,
n rrcl;c' ry\Ę,
il Y0 ,t" the,rnr$ne ,}.\ł
ffi,a)ĄĄlu ył"Jłrułl
Ą 'ru
L,.
W
,"].i1
Ęr
-*
Ę
I- e!"l
&- UJ"' ng ela,bllh" ryn U-a
,J b - u[/, twt !J)€,
trrd,dC tł{ept&.' Ą'yn (ylĄLywuc
YO,
C- (r Li
t,Uttł'KJ, d- ? ł:.ul0
n ŁLĄlwłIalu
.1T d'\P 4Ą' mt
jńĘrłe "ęJk
rCI,\,u{O. &'e Vro,w,lo-Y1&
e^irYLU\, ne H erc vaJ rL
^^^,b Ul^ĄLd"nl'*v
ll\ żi
ńŁ(r m
ffińi-uw,łtnW .dp
r] 7, VrOn \r !+ \.o
ait\,'- nrćo- t-O,},o-
łt
l ll ,
\-
v-{Ł nO^nr
,," -§
a
},J
i
,. .. .Łt
I
'"Atr
tr=
,rĘ*-
,,=Ęł
,
";Ęl
&
\
..łr
'-;-ł
ffi
jil.
i"'ffi:
_Ę i.
6,ł<nYJ)a,kĄv,n e ?fńeą'lruz.ta- -, ą 'ue r*e U'(ą, Lia('
ml"'a,rnł lĄUt&Ą'Ulłn urrruł) t 'Ou{,t ł 1v(I ur
ryDx'rĘ [}L LŁ) ^ro1at L',.YY| rnJLnp '(/L L}w
TA
ell',urw'Q)--O- 'd'0 Wvra-n € l,cL rrh,art
7O Lt fi'lc L.l,fit( DN Ą, R /YnĄ'(,ł,rt'nF
hru (d- eul,tu?^lalwu' rmor1,o k/.4
evt'Ul ly',,Qłał'
^,ov^
O"O:tką.l-, a,b cLc ó ru'a clp
CL (n;yul 'Cd4, +n-Wyat oW er)
T, ,,c,Lhrz I (V1) ffałQ , U)ad'
rlł'€ dO LąlOt t-; tSJ Ł
Łx rafutKłułar/w-euń4ńne ćLlfurtlfirtD ; t'1.14 m_,Lł no_
til Q,ću{wu'ą[ ie^t artt'ląnł'u b lNa
nf arnL' wanntr tfu rTe. X/ą,ł e l }łt
L' rakd,e lnć lŁ '0t"/,Ot-Cpcu€ tl € tt'Lt:lt.t't\'tQ ;
4,
J n e pńett"l,ąl LL'a)a, PoW'n rL4ł : 0 vl c' lĄ.O
fie ,' źL|,OLn€ ob r3rpm,owł*ntL t),t'rni'rlpuv,rya
'l/cxl, roow^ó WCI, fl ć t n a,4lrTT nĄ'Łl .rd, t_ rV e rną b
'uI ne OLlĄ- ą rn' rt ft,
5 I^
tJUu)
_l _
ne 'wln 6u.tóó re
oą
Cłu', X'rva_,
U. rd" &uill t-t'arJa- ?eX, Llo hn rrruru
]" ur tls ( ru 'X'fl 5T
{_tffi, )rfl,rONULrĄ vftrulzvu't .'nJ y,oYffi,'ffi?,fłł*
au,alYru' ,ra,ŁoL
raLl yLlawt'; W!'f xP *ir
i' .r%.rrrt hą'P e
kn mt rfr,t' o lro
L'n n
:'ulą, ftnry,l1rwto,9r,u q', Uerła^ryne Ę ffie'
uĄź
{ń@Ł9 yahO 7rwybeĘ ruX'fte ,dn
-; a|eL'ryry.c'
TqŻu@ry'?,
^ńĄlĆ:
,( ał!s'ąy'Y ryTrrtK y:?t"!!T"uU&,
,
Wiht!#ffi
''' ,'
?* *"óYl p'Ć
-vl YWńĄfu * ż n
p r
ffiy,,,y
i,
l sń c n{Tł' l r-l4u4Ą,p,ft ) #,'pr
Ir r,:,
nr"rnł nr:
7;
t kł*;;"
VÓO ^: ^ cŁ
ł1 ?o?okuńŁ'łń}fi,44ąĄ,ę
4I Kul/h,a. ł/arfi,W"rYĄ,ę Lę(tr)"
t
ąę
LQc,o", UĄ r,0 W ril1 y!,!
om, r!/rl.u_Ju
'
J;,)^t"', b!4 rrń n?llllllllllllll*',^HHł,ff
^łp tru1 w,'o:kl' r
L^rq)Ą/Ę
a' y eP 1'g ph,L .',&, P,W,4Źr9'rył,'^W /&:^ & h,0 rn1f,ńą rnĄ',,
tąĘw,)*;,
^n,| u-ńlfua ąrłrĘ^'ą p&q b 4,@ i Óiń tły'"i, t ) kń
|,hne| (y).{)?vł ( QĄ,LOqŁru u)e). l fu9Ąnyant tż1 ęrn( aĄp t{k,
O,bLł' burr4 ,lT §-Po Xil,ctlrrąn e ,'i'd^n o b L,€ ,
,, 5#r,,#,b nl^,L', a |c +peulł cc
ąLl ą ęnłwe- ź.,ł,2tw'trp.l ę
.
anhĄQery4, 'tfl,Kcw€ ,
:; ąilft^;^?uYra,l'p6 e :nert'OI 9 e, ęry u cUzn Ę w
l, lvińPpi ńlnĄ*' ą. k, ,^, r!,4 żn)' oi e;nł{ rą t tł tut l iTu - lł,łmrrłcr,
J-e tr?,b?^W!' r y^ :! ślFTW:,*, *,'r Fo -y ł!, rll4ł ul ń;
wńolwru-One kŁrkfft,L UrrĄłuDLLłuć ę f@4ruąn€
W,rYWftflf! nlknw7rnł, ,no"rwwrw"e ł_ L,?}<łTl/t
u/"uM/& nł ^'
W: J?,? Z:I2ĘW, :
ć3
d.q
l
t-
ffi
'tłst łL*
t
;pĘc}L
W d.xl
na ltffi,t RturL?D
vĄ) ,ynL'ń, b nrbW ; 'W
,?niłl.,,w
xrwc.ż-&la & t'ann1,1łnuI{ ne
Xnn"nĄ-
{,Ur
ń
,,tŁC r1ŁctaŁ rwe Ynnd&L h,og podzłŁn lrl_,,t'Ł
" lnĄrrfud.an(t t'łv a ,hLŁ
rnmLMw L<pns hnnltrt,łJ-
WWnc_ , rvĄl,)<głłe vv'_ baąłe WinĄĄ n Ł /yn)
'bu'!rt'tL-
?d Ly
,
eu)wa rv(e
w /y)'(}L vTlĄeYL,|e t L-
df^Ovcd WWrJ,,
)w<}rv'e i[łniut}Wu ch-
rrvFovmeyfw
hn qt'r u"
rnOtU,
uthodfu'tv ^,Ue
t'hłź
tĄuyu ;m{ Fea, ,yn"cŁ'e
"y,LLt-D t-o
bt,.ałe/{ TuilWn€ ómł łnaĄ-e 9a!ry )
t
,, rTy1"O&le
buć Ćp np, ,łru'C) ące
akc |iloolnra WL d,Un-Lf5
t€- L' L'nn m e
-bt
"Ł
W
twĘru
-> uJ" oy
ffiŁ *Hł
,l^iq.łolrł
Wr,Tń6
i.-gilu; :młtx,t,Wy{ru?,':
1ćdry*
B,
ff h9pĘ,oxet ern,
fr'ó rup, 6ęćItr sfó{dł ffim,Y:,ft
n tŁt ł'|óĄrv., U,WA
pVft -rH b,
ł, yvrlq3iiy1,.t pott,MthiyT\Ą ,^ PŁ&, PcLrt - PĘq, !
#*l P :łi-Yłi;kó,tr r?, W?,h,tr ffi
lWrum
ą-CCroJ-rp
u€ l
rsfu,
l
urw
;ł+r.^łu.diurępŃ
;$*;,^ł
rnńjlc ęffii
\-c!qunŁ]; ł
w'\,,",uJre
nruryąłórw;: uaiĄ,kru\
rruryąttłrw-
ólł:,
fi,ł*99* ą ffiif rrbJ1'eW
X.!.o"/- , klŃrlctą
u:rh+4,t nlixł.o,/-
;^
kCIŃ{lclą -
(ńnĆ uu8ln,t12ln\'ę .['U{,tt 4 J'tq,c
prp|t)<vt,Q ,ryyow
ó\ił'ii^rl"ńlpót*t \v ĘĄoJ-,./c n e t,r..j Ń:Ońr.,i,u ńłps:,nłko,)u
ń^b t?rłl._oiłrń;t Ł lr) , ń,cqp bqr-' tlarngLo rn€, h'ćJL^Pen0l)f
ffiffihlffi$ffi.m
,t"lii' t
t{;#,
e,,:ffilń"!*
/Y]-\^tl rru^l1)C ił\..,(,Ą!)t l tW? W,?,j, Ł
,'|VIlIl.| ),'\_ y\',rĘt\,/.v\l:1-1
, r,:y
^ru-,§hrydffi
lótQlłpł,"n pilrŃt'In e, Ę\Ą' r}Ql U,1 t t, ĘA'( |'mnrLu rppr Ę ne l
J lnnń,.di"ą- ,(ułl, ,- pdęĘtqffiyryW,
r
n l?rńćr,tllc!1
t ---- F,
\
luL'
'1ta6:
d
mf rlĄL, rvnńą't,
U nc l^V rh)f
v, A
-)
I
n{e (?WLl l l
ł Ihr,
l l
W
t frbbdr.tr't
,ĄO,bM
+
ą"Ęą Ąr.
n)od l l
Jł /
)
7|
cl
)t<
Jn
FR
oĘu
.:.',
.;€?: a.. Ę
a
1
?
tl){Ynb(ut -
Y
l
W
fu'm@&'erYĄsL7Ł1 ],-j_
i
LtXtll,
---+rL-J---
ąr,
7^u
-T- I
-tf6,i Ę
,={ fr
, ,"#
Ęif,ńF
',&.\ **
^-, '=§
ii--l
\a, \,
a
u aj*"'t
lG
§l
tC
'e ąSte-
_
)h'l
46Q l<bńl
tg
i8
'rłcŁt'
brrr-
{,
la Ę
Lll :
a
\
/
TŁvąpto ą"nor^n,
ŁJBro,rua, S enou,,o,- _p_ot u2vu, łuX, leglgnl]Ł*M
unłtlr0rąnuLł^V
::- / OtUł' rL7 L^JOfi^,O
ry
u. . \t,r& Pt W P- t,łraĘ& v\łiŁ ń,
'..}1ne ' Ov\XXJ tł)/ ó.tru.ł(łL.
- wpvQł"łrrCr,r:Clfi_t n t'e w Frl Ą^u'ąĄ-Ul-u
rult! rrnłłtlł/c t oą '\x,tru d_ urvryro:'ll, tł'L
w},lłNdq*W
oł,,o ą p e
ffi-;frlETvI
Qe D ?pi
ti
M
ą
-7 Wprąrud.&e,Yw(L
yy\^,,tnn.ĄoOyLv\
-: V.l {) ,tI ilntnl phovl"W łuł.n,t}.l:
\rrofu[,t'[ę, \\n" Lt re,łąi'a,
2ro1,^n {Id"oYu ul-§lu de rnw L<D (w§yt-lĄ. r,a yń
|,t^ t OvO Lł/v py*t\r e1 \,l. c ł\,a. Lelr<L
r*|e tr1^/|,,)j sarnąbf| dn kl:ry,w
'eM-1Ł i |ua,(
'nlł\
tuc sr'RtVą ob Ę2uil,t
t e^,O Vł-ave Y o Lvę
:e aeftflw- t LCL
(
dn ooLNc U,Ą'eru
[l'L' rź. uŁ uhn rvb ł
)Drc- ((-
fr -łń§ffi
w, p!,;t ci5
frtĘ;'.łił}frifu
,ftt tr'łfoft ffi *.Łr
{
e(l i,\Hł,'# §§ł!b'y.'
§.t\]"ti*{nŁ,
Yn
P!$u"b
ll*l )\, łt
,. 1t4.i ],q
I
;., i
t] \)i:[ t t
I i'lrr
t
\-t, q
lfitvnńs.tJl"Jt
epFńTlJ{"Jt Ft!łĘl,il".r
rUłĘl,tuvtr
V"tr Q!ł,l
Q!"J kc
ŁC tl)i:i
0tł{ KC i ..';-
..QiVC"
tflMfitrvĄi-i- V1,'"!
Y \trtĘłutt^łł*rfutl
lW ,^tn§J]-fnC"U!4!T
ffi-ffi,#ffiffi
musą#ffi',tĘi
n'
:,Ń'ł:J"WŁH"kk,Ł,,'!Ł+ęY
{
:
,]ffi:
T l .6lr,tj.r" }ti'' 3,§r'.j*th'fr iil'''
itli
ł
[[T ćn,llitł{DLDUtJr
ffill*t'l;*tl*;
.lFi-TP,1 (!t.-' u dffiffiŁD+Ł
ffil-\V,l ] ,i l ;
Vl lłłl\ifl-łl
:łti,*'li'tii
\Y, ;
9iĘ1.p\Ęu ćf
1
i 1{N'iFtJ"l,*])!t{ nl'tt
'i'i{l l,J fi\iN
'
}ll;iĘi
}lLn ik i ,-ł {ł nćvf
i;uu, rł
l; fluwtł [tt ć
l',ffi,].,fft 11ffi J,ii'\v. fr- łłJ",rj-
**i,
foiw
, }kĘI)i\i-,, r - ĘlJ,*F IiD,1',;tqt:L',4r,t
H|"J.$.§f
rT"Ń,[ilS ;"tft;r§N D -l,L, u5ę j,li,|r3łu ,,-
i--łl,rę ) ;t- ,{-łV n §tT rii )];"rP *l:"u"+ V,r:,"rP' L,-
t\ł
n^ c.J.,Łr-;", iń,{,-uj-r Dl,iirr,
rr hłrłtifiril
$,*r-''i;c^Ąs" \,_i.,ł_ pseĘąu.
',4.ł l, ' "
,u7.]i..;" e f),". trta r€ł"; ii , N ijI ] \ *
,,
w"L.rry ji ,'
rł. 1ó6
\uttll,ć- L',l*v,(l1t h-a
,,[ł;Ł:,,Ł.ń [ łl.ti.;
Ł.Ęu,jir,ł\1 tiit-, l !
1.1
.\,\i-i*,i.}lL l]]Pn',rlf f
,d],1,,,,
:
l-
t".{
u.l
b-
ź
L
i
I
H l/ \i li
t
, l,_,,t]
H
|
LH
-
1tatnnilOfirŁ
ółbul 6\(fi-
l
\_
Lbl g§ł$łJd"-Jl
]
t ffifrqWĘ
pH
t
L.
t
L
t
b
t
h
h
t
L.
t
ts
r
L_ s$4łl
k :ffi
|- H_\
l-
b
l!
D
E
;l,łi|if.
L -,,,---i .*
-
',
*,' - *
l
I
L l, t'
Ą,%,,
l,ł ,, 1.1
''t:, t \], ,l,,i,,i"
- '',l '*
l l | .' aj
i l '., i
- i, i l:
(J"rU
l
-(l,ł
lr
Li ., ]
,. !
,'ą] ! / ł
J - J_
J
7--
qĘ[ł! -1
]eMp4ł nŁ+lLĄ WĄEął
l
,d
-.{
-l
,J-
ffi
nl l l i
!łI{4
fi trr,ł l
ffi&
(n
0eP- _l
!l
f,sffi
-l
tO'Yłl
,łr0W ,I lt" l vl
&WtslnM ilrutlh \)o,łńĄ-oi] l_ą
$ł fitH:k u
-l
){}tryrnĄL l: 1-1
óMnfiyh^' nnLl :lt }n' ftd f, 1
j\rhh ! - l u tł1h
4J{
-l
nĘirQtĄąP irufl.
1
,J
*: rrqJ
,l W+.ł,{.LY]ln ł([t
ŁtŁnh t'rjcńnld ffi :1
ffi
mmT--F-h,
ri[R$W +, s# Ę
i \ Ft hrloĄ,dpr|d li'rilffi
Pclp|Eflr.n{tl rlq4tni/"4 T ll l -l
_I
-a
!-J
F+ryŁ-'$
_l
l,qĘ,ęi, i I
-a
-I
L-Ą
-, , ,t.
-,, ;-)',
iól[4€rtrĘĄs&
§$++tj+
rDJłu
ł"d€
-l
t ;l
_,l
=
ż--a
-.__l
,
l
l ,. i-'1-, i
jąderkowej, tworzy podjednostki rybosomu), fibrylarynaidojrzewanie prekursorowego rRNA},
rybocharyna(dojrzewanie duzych podjednostek rybosomów). Jąderko ma częśćwłóknistą, gęstego
składnika włóknistego i ziarnistego zawieszone w macierzy jąderkowej, Większość jąderek nie
posiada uporządkowanej struktury, a jezeli już taka zajdzie to to jest proces segregacji jąderkowej.
Białka prekui"sorowe ze względu na budowę dzielimy na; prebiałka-na końcu N mają sekwencję
sygnałową, probiałka - aktywacja proteoiityczna, preprobiałka- w środku łańcucha mają sekwencje
sygnałowe.
Siateczka śródplazmatyczna - zbiór cystern i kanaiików zamkniętych błoną, jest szorstka pokryta
ziarnistościami rybosomów i gładka nie pokryta niczym i rnająca dłuzsze kanaiiki,
Formowanie białek - cząsteczki białek powstające w RER stają się integralnymi błon siateczki
ite są fragmentami cystern siateczki, w formie pęcherzyków, które są odrywane od cystern i
idą do miejsc przeznaczenia-organella komórkowe, błona komórkowa. Białka rozpuszczalne
wchodzą w skład kanalików RER, a białka transbłonowe zostają zatrzymane w błonach