Professional Documents
Culture Documents
Biologia Cel Lular: Introducció
Biologia Cel Lular: Introducció
INTRODUCCIÓ
La biologia és la ciència que
estudia els éssers vius.
La biologia cel·lular és la ciència
que estudia la cèl·lula.
El coneixement i la tecnologia
depenen un de l’altre. El
coneixement de la biologia
cel·lular depèn de l’observació (microscopi).
L’any 1665, Robert Hooke va observar un suro a través d’un microscopi. D’aquesta manera
va poder descobrir que l’escorça del suro estava formada per unes cel·les, que les va
anomenar “cèl·lules”.
Gràcies a l’estudi de les cèl·lules, a l’actualitat s’ha pogut arribar a fabricar diferents
fàrmacs que ens han ajudat a millorar la qualitat de la nostra vida, així com la salut.
Aquests, incideixen en la cèl·lula i arriben a modificar la seva activitat.
Cronologia d’esdeveniments:
A partir d’aquesta sopa de cultiu, va sorgir la primera cèl·lula ancestral, comú de totes
les cèl·lules. Es coneix com LUCA (l’últim avantpassat comú universal) és l’últim
organisme del qual descendeixen tots els existents. És una cèl·lula heterotròfica i
anaeròbica. S’alimenta de la sopa.
Era necessari que es formés nova matèria orgànica, ja que l’altre s’estava esgotant.
TOTES les cèl·lules tenen membrana plasmàtica, però NO TOTES paret cel·lular
Procariotes:
Eucariotes:
Hi ha de 2 tipus:
- Sistemes oberts:
Tots els éssers vius són sistemes oberts, és a dir, intercanvien energia i informació
mantenint un equilibri dinàmic. S’encarreguen de transformar la matèria l’energia i
utilitzar-la per fabricar-se una altra que pugui ser utilitzada.
Tal i com podem observar al diagrama, es capta matèria i energia del medi per tal de
mantenir una estructura organitzada.
Sistema: Entenem sistema com una part de l’univers Hi ha diferents tipus de sistemes:
Totes les cèl·lules (exceptuant el virus, que no són considerats éssers vius) produeixen
en el seu interior les molècules necessàries per tal de poder fer totes les funcions vitals.
És per aquest motiu que diem que tenen un alt nivell d’organització, perquè són capaces
de polimeritzar.
- Reproduir-se:
Únic regne que està format per cèl·lules procariotes unicel·lulars. En podem trobar de
diverses formes; esfèrics, allargats, petits, en forma d’espiral... A més, presenten una
estructura no gaire complexa, més aviat és senzilla: presenten una mebrana plasmàtica,
la càpsula que recobreix la membrana, els ribosomes al citosol, l’ADN circular i el flagel,
que els permet el moviment.
Dins del regne Moneres podem trobar Bacteris (procariotes amb DNA circular
(nucleoide)).
També podem trobar micoplasmes (no tenen paret cel·lular, el que els hi confereix
protecció són les cèl·lules eucariotes, que hi viuen parasitant-les).
Altres protists, com els cinetoplàstids i els apicomplexos, són la causa d’una varietat
de malalties humanes greus, com la malària i la malaltia del son.
Els organismes eucariotes unicel·lulars poden tenir moltes formacions, tanmateix sempre
serà una única cèl·lula. Moltes d’aquestes estructures poden provenir de processos de
simbiosi, de mutacions, de canvis en l’ARN, etc.
- Són organismes que tenen cèl·lules amb nucli i requereixen d’altres éssers vius
per obtenir el seu aliment (heteròtrofs).
- Tots tenen paret cel·lular gruixuda, rica en quitina, els hi confereix rigidesa i
resistència.
- La majoria són pluricel·lulars
- Els seus cossos estan constituïts per filaments tubulars microscòpics, anomenats
hifes, que es ramifiquen i entrecreuen.
- Conjunt d’hifes: miceli.
- Els que veiem a la superfície (bolets) són els òrgans reproductius d’un dels grups.
- Per alimentar-se primer descomponen el seu aliment en petites molècules que
després absorbeixen a través de les membranes de les seves cèl·lules.
- La majoria s’alimenten de matèria orgànica morta, altres són paràsits i alguns són
depredadors.
- Durant la reproducció sexual o asexual, produeixen espores que permeten la seva
dispersió cap a nous llocs o els ajuden a sobreviure en condicions adverses, com
la deshidratació o la congelació. També poden desenvolupar-se a partir d’un
fragment de miceli.
- Són essencials en el reciclatge de nutrients en tots els hàbitats terrestres.
Els fongs provenen dels organismes amb paret cel·lular, rica en quitina.
QUART REGNE: VEGETALS
Dins d’una cèl·lula hi ha moviment continu, per això diem que hi ha compartiments o
orgànuls cel·lulars que ocupen un volum dins del citoplasma i que realitzen diferents
funcions. S’encarreguen del metabolisme cel·lular, síntesi de proteïnes, del moviment,
etc.
Depenent del tipus de funció de cada cèl·lula, la proporció dels compartiments seran
diferents.
MECANISMES DE TRANSPORT CEL·LULAR
Totes les substàncies (incloent proteïnes) secretades per la cèl·lula han de ser
transportades, per tal d’arribar al seu destí. Aquest transport es pot dur a terme ja sigui
a l’interior de la cèl·lula com extraient les substàncies cap al medi extracel·lular.
Totes les proteïnes comencen a ser sintetitzades als ribosomes en el citosol. El seu destí
següent depèn de la seva seqüència d’aminoàcids, que pot presentar senyals de
classificació que proporcionen diferents destins específics per a les proteïnes, fora del
citosol. Moltes proteïnes no tenen aquests senyals, així que han de restar al citosol. Altres
tenen senyals de “sorting” que les dirigeixen en el seu repartiment al nucli, al RE, al
mitocondri, als cloroplasts o als peroxisomes.
- Transport vesicular
És el sistema intracel·lular de membranes. Les vesícules de transport
carreguen proteïnes des d’un compartiment a l’altre. A mesura que la
membrana d’un compartiment produeix vesícules per gemmació,
aquestes vesícules capten molècules del lumen del compartiment.
Després del transport i la fusió amb la membrana de l’altre
compartiment, aquestes vesícules descarreguen el seu carregament en
l’interior d’aquest altre compartiment.
- Transport a través de porus
- Transport transmembrana
Les proteïnes que estan al citosol per entrar als compartiments hauran de traspassar les
seves membranes, per això necessiten mecanismes específics (translocadors proteics
units a la membrana) que dirigeixen el transport específic de proteïnes.
Per entrar als orgànuls, les vesícules necessiten ser molt hidrofòbiques. Aquesta és la
raó per què la majoria de seqüències senyal són molt hidrofòbiques (ex. Leucina i lisina
són aminoàcids molt comuns i molt hidrofòbics).
UNITAT 2: ESTRUCTURA DE LES MEMBRANES CEL·LULARS
MEMBRANA PLASMÀTICA
El model cel·lular idoni per estudiar aquesta morfologia són els glòbuls vermells
(eritròcits) que es troben a la sang. Són fàcils d’obtenir en gran quantitat i no presenten
altres membranes intracel·lulars.
Dos físics, en Gorder i en Grendel en 1925 treballant amb aquestes cèl·lules van mesurar
la massa de lípids d’aquestes i van calcular que es tractava del doble de l’àrea de la
superfície de l’eritròcit. Això és perquè la seva membrana està composta per una bicapa
lipídica, que té un gruix de 5 a 10 nm.
Aquesta bicapa lipídica, no es va descobrir fins a mitjans del segle passat al ser
observada a través d’un microscopi electrònic de transmissió que existien a la superfície
de les cèl·lules dues línies més electrodenses (les dues monocapes de fosfolípids)
separades per al voltant d’uns 5 nm.
Composició de les membranes
Avui dia sabem que la membrana està formada per 3 macromolècules orgàniques: lípids,
proteïnes i carbohidats (aquests carbohidrats sempre es troben associats de manera
covalent a lípids o a proteïnes, forformant respectivament glucolípids i glucoproteïnes).
Lípids
A la membrana, els més majoritaris són els fosfolípids (lípids associats a 1 àcid fosfòric o
grup fosfat):
- Colesterol.
- Glucolípids
o Gliceroglucolípids
o Esfingoglucolípids:
Cerebròsids: 1 ceramida + 1 sucre neutre
Gangliòsids: 1 ceramida + sucre carregat.
Proteïnes
Glucoproteïnes
N-glucosilades: els sucres s'afegeixen al grup -NH de certes asparagines
O-glucosilades: els sucres s’uneixen als grups -OH de certes serines o treonines.
LÍPIDS
Grup de biomolècules orgàniques molt heterogeni bàsicament
constituïts per: C i H. La majoria, també presenten O, però en
proporcions molt baixes. Alguns lípids contenen P, N, S, que són
molècules amfipàtiques (tenen un extrem hidrofílic i un
hidrofòbic). Formen bicapes lipídiques i són insolubles en aigua
però es dissolen fàcilment en dissolvents orgànics.
- Fosfolípids:
Els fosfolípids majoritaris a la membrana són els fosfoglicèrids. Són molècules amb una
regió polar (soluble en aigua) i una apolar (insoluble en aigua).
Quan les molècules amfipàtiques es troben rodejades per totes parts per un ambient
aquós, tendeixen a agregar-se de tal manera que les seves cues hidrofòbiques
s’amaguen a l’interior i els seus caps hidrofilics queden exposats a l’aigua (per la seva
capacitat de solubilitzar-se en aigua). Depenent de la forma, poen aconseguir aquesta
disposició, d’una entre dues maneres: poden formar micel·les esfèriques (amb les dues
cap a l’interior) o bicapes, amb les cues hidrofòbiques amagades entre dues capes de
caps hidrofíliques.
Les diferències entre aquestes estructures és que dues d’elles ( liposoma i micel·la) es
troben en forma d’esfera, mentre que la bicapa lipídica és una estructura lineal. Per
diferenciar el liposoma de la micel·la, s’observa que el liposoma està compost per dues
capes fosfolipídiques, mentre que la micel·la només en té una.
Aquests liposomes que es formen, tenen un moviment. S’han observat quatre tipus de
moviment dels fosfolípids:
- Flip-flop: canvi de posició del fosfolípid d'una monocapa cap a l'altra monocapa.
Es tracta d'un moviment molt lent que gairebé no es dona de forma espontània.
Les membranes cel·lulars no es sintetitzen de nou, les cèl·lules filles creixen
gràcies a la obtenció de molècules noves, a través de la cèl·lula mare. Els
fosfolípids es sintetitzen a la cara citosòlica de la cèl·lula (RE). Quan aquests
arriben a la membrana plasmàtica, s'integren dintre de la monocapa citosòlica.
Les flipases són molt important en aquest sentit, ja que són les encarregades
d'equilibrar la composició i estructura lipídica de totes les membranes cel·lulars.
- Moviment de rotació en el seu propi eix: Moviment molt ràpid sobre el seu
eix.
- Moviment de difusió lateral: En una mateixa monocapa, els fosfolípids es poden
moure de forma lliure. Es tracta d’un moviment molt ràpid i comú, poden recórrer
distàncies de 1µm/s. Canvien de posició constantment, això és el que crea un gran
dinamisme en la cèl·lula, pot variar la posició 107 vegades/s. Hi hauran obstacles
que impediran un moviment complet dels fosfolípids, com ara el citoesquelet..
- Moviment de difusió de flexió: les cues hidrocarbonades dels fosfolípids es
poden flexionar permetent una major plasticitat de la membrana.
Els fosfolípids poden dividir-se en glicerofosfolípids i esfingolípids:
GLICEROFOSFOLÍPIDS:
S’originen en esterificar-se dos dels grups alcohols de la glicerina o glicerol amb dos
àcids grassos, saturats (A) o insaturats (B) ( enllaç tipus èster entre C i D).
El tercer grup –OH de la glicerina (D) es troba esterificat (enllaç fosfodièster entre D i E)
amb una molècula d’àcid fosfòric, formant l’anomenat àcid fosfatídic (E). Acostuma a
estar constituït per un àcid gras saturat (A) i un altre insaturat (B), i els seus derivats
s’anomenen afegint el prefix fosfatidil - al nom dels substituent esterificat amb el grup
fosfat (el que nosaltres hem anomenat X i que normalment és un aminoalcohol):
àcid fosfatídic + X → fosfatidil - seguit del nom del grup polar (X)
Trobem quatre grups bàsics de fosfolípids presents a la membrana (en funció de quin
grup s’uneixi al fosfat):
Totes les molècules lipídiques deriven del glicerol, excepte l’esfingomielina que deriva de
la serina.
Les els fosfolípids es sintetitzen a la membrana del RE. Per tal d'aconseguir la asimetria,
les escramblases bescanvien els fosfolípids entre les monocapes, independentment de
l'espècie de fosfolípid. Aquests fragments de membrana viatgen per transport vesicular
fins a la membrana plasmàtica i s'integren. En aquest moment les escramblases es troben
inactives, les que actuen en aquest moment son les flipases, que bescanvien els fosfolípids
d'ambdues monocapes de la membrana plasmàtica.
La fosfatidilserina només es troba a la cara citosòlica de les cèl·lules (en cèl·lules vives).
Això és molt relevant, ja que degut a la seva càrrega negativa, té un gran paper com a
molècula senyal per a les proteïnes hidrosolubles del citosol. De fet, una fosfatidilserina a
la cara extracel·lular indica apoptosi.
Quan una cèl·lula mor per apoptosi, s’ha de recanviar. El que succeeix és que les
escramblasses s’activen i perd la asimetria de la membrana, perquè la fosfatidilserina
canvia la seva posició. Així, es forma una senyal que permet reconèixer quines seran les
cèl·lules que s’han d’eliminar que, posteriorment seran fagocitades per glòbuls blancs o
neutròfils).
Són fosfolípids que al grup fosfat tenen associat de forma covalent una molècula d'inositol.
L'estructura en forma d'anell dels inositols permet que puguin ser fosforilades en diferents
posicions, segons la quinasa específica que s'activi.
La fosforilació d'un PIP2 a PIP3 activa la PDK que, al seu torn fosforila una AKT que
s'associa a un altre PIP3, activant-la per a fosforilar altres proteïnes diverses... Aquesta
cadena metabòlica intervé en diverses reaccions antiapoptòtiques per tal d'assegurar la
supervivència cel·lular.
L'enzim encarregat de modular aquest tipus de reaccions antiapoptòtiques es la PTEN.
Es tracta d'una fosfatasa encarregada de treure un grup fosfat del PIP3 corresponent a
l'activació de la PDK i així aturar la reacció.
*PTEN: gen supressor de tumors, ja que és el motiu de que les cèl·lules no creixin
descontroladament. És una fosfatasa, elimina el PI3K.
ESFINGOLIPIDS
No porten glicerol. Són un tipus de lípids menys abundants a les cèl·lules. Es construeixen
entorn un esquelet d'esfingosina, la qual es caracteritza per la seva cadena
hidrocarbonada llarga i sense dobles enllaços (té un grup amino i un grup alcohol). Al
ser cadenes llargues i saturades, provoquen unions fortes entre molècules, i poden
formar microdominis de membrana més gruixuts, compactes i rígids.
- Ceramida: Esfingosina + àcid gras (saturat, àcid palmític (16 carbonis)). Són molt
importants en senyalització.
- Esfingomielina: 1 esfingosina + 1 àcid gras + 1 grup fosfat + 1 alcohol (colina
ó etanolamina). Importants a les cèl·lules animals.
- Glucoesfingolípids: 1 esfingosina + 1 àc. gras + 1 sucre.
Els sucres de membrana són, a més, els que determinen el grup sanguini.
COLESTEROL
El colesterol s'insereix entre els fosfolípids. El grup alcohol interacciona amb les regions
polars dels fosfolípids, els anells immobilitzen les cues hidrofòbiques, i les cadenes
hidrocarbonades també interactuen entre elles.
facilitat.
Les bicapes lipídiques en tenir cert un important hidrofòbic, seran una barrera selectiva
per a certes molècules. Hi preval el caràcter hidrofòbic respecte de l'hidrofílic, ja que la
regió polar dels fosfolípids és petita respecte de la regió apolar.
No obstant això, qualsevol molècula acabarà penetrant la bicapa lipídica, d’una
manera o una altra. La velocitat amb què es
produeix la difusió depèn de
la mida de la molècula i de la solubilitat en lípids. Com
més petita i més hidrofòbica o apolar, millor i més
ràpidament es difon en la bicapa.
- Integrals
Són proteïnes que tenen regions hidrofòbiques que li permeten integrar-se a dintre de
la bicapa. Estan associades a la membrana de forma molt forta.
si una proteina té una regió
1. Simple pas (alfa hèlix hidrofòbica) hidrofobica, voldrà dir que deixa
2. Multipas (diverses alfa hèlix hidrofòbiques) que s’uneixi fortament
- Perifèriques
Són fàcils de purificar i dissociar mitjançant solucions tampó i diferents formes iòniques.
Solubilització de les proteïnes integrals amb detergents
Per solubilitzar proteïnes associades de forma tan forta com les proteïnes integrals cal
fer servir detergents (petites molècules amfipàtiques que en solució aquosa formen
micel·les).
Tanmateix, cal tenir en compte que no totes les proteïnes integrals s’associen igual:
algunes s’associen més i d’altres menys, motiu pel qual hi hauran proteïnes que es
podran extreure més fàcilment que altres. Haurem d’utilitzar un detergent o un altre.
Per exemple, les proteïnes RAS són més fàcils d’extreure perquè la seva associació és
més dèbil.
La proteïna de la imatge:
Per tal d’unir-se les proteïnes amb els lípids, cal que es produeixi una reacció química.
Els carbohidrats
- Membrana 2 – 5% carbohidrats
- Les proteïnes es troben cobertes de carbohidrats (interaccionen amb
l’entorn), també coneguts com a sucres a l’exterior de la cèl·lula
- Aquests carbohidrats es troben en forma d’oligosacàrids, units mitjançant un
enllaç covalent a les proteïnes de membrana (glucoproteïnes) i als lípids
(glucolípids)
- Sucre sintetitzat a l’aparell de Golgi o al reticle endoplasmàtic, unint-se al
lumen. El sucre es localitzarà a l’interior de la vesícula, formada en aquests
compartiment. Serà transportat a través del citoplasma fins la membrana
plasmàtica. Es fusionarà ambella i sortirà cap a l’exterior.
D’altra banda, quan la proteïna Ras ha fet les seves funcions, aquesta proteïna s’ha d’inactivar i hidrolitzen
el GDP mitjançant el GAPs.
Poden estar ciclant entre un estat actiu i inactiu depenet dels estímuls que activen certes proteïnes. Són
interruptors moleculars.
Les proteïnes RAS són susceptibles a patir mutacions. Més d'un 30% dels càncers es deuen a mutacions
de les RAS, ja que tenen gran rellevància en processos de proliferació i supervivència cel·lular.
Glucoproteïnes
- Serines
- Treonines
- Asparagines
Glucocàlix
Un bon exemple d'estudi del conjunt de proteïnes de membrana és el cas dels eritròcits.
L'espectrina és la proteïna que li confereix als eritròcits la seva morfologia i elasticitat,
de fet, malformacions en questa proteïna dona lloc a anèmia. L'espectrina és un
heterodímer que s'associa a la part citosòlica de la membrana de l'eritròcit a través
d'altres proteïnes perifèriques tals com l'anquirina i la banda 4.1. L'anquirina permet la
unió de l'espectrina a la membrana ja que fa d epont entre l'espectrina i la banda 3
(proteïna multipas). La banda 4.1 fa de pont entre l'espectrina i la glucoforina.
Proteïnes com l'espectrina restringeixen el moviment. Als epitelis les proteïnes del
citoesquelet són responsables de la polarització de la cèl·lula, de la rigidesa d'aquest
tipus de cèl·lules i de la fermesa dels microvilli.
SEMINARI 1
Organisme adequat per a cada tipus d’estudi
-Bacteris:
Procariota Simple
Fàcil propagació
Genoma petit (4300 gens) Estudis
genètics
-Llevats:
-Invertebrats:
Caenorhabditis elegants:
Eucariota pluricel·lular Simple
Fàcil propagació
Genoma petit (1400 gens)
Estudis genètics i desenvolupament
Drosophila melanogaster:
Arabidopsis thaliana:
Eucariota pluricel·lular
Simple
Fàcil propagació
Genoma petit (1500 gens)
Estudis genètics i desenvolupament
- Vertebrats:
Peix cebra:
Eucariota pluricel·lular
Complexes
Difícils de propagar
Genomes grans (humà i ratolí 25000 gens)
Estudis genètics i de desenvolupament difícils
Xenopus:
A l’hora d’estudiar les cèl·lules, cal tenir en compte quin és l’organisme adequat per a
cada tipus d’estudi. Depenent de les característiques, haurem de prendre un organisme
o un altre i, també haurem d’utilitzar unes tècniques o unes altres. Per exemple, si volem
estudiar una característica específica de les plantes, haurem de prendre un model de
planta.
És per això que cal saber quines són les “propietats” de cada ésser viu (les podem
observar a la fotografia). Per exemple, si volem estudiar la mosca Drosophila
Melanogaster, haurem de saber que es tracta d’un organisme eucariota pluricel·lular i,
que per tant, està format per moltes cèl·lules. A més a més, té un genoma petit, fet que
permet fer estudis genètics i de desenvolupament.
Els tipus de mostres més utilitzades per a
l’observació i experimentació són els òrgans i
teixits humans. És per això que a nivell de
cèl·lula podrem estudiar el comportament, ja
que ens interessa observar els diferents tipus de
compartiments, així com els teixits. Aquestes
mostres de teixits es disgreguen per poder
obtenir les cèl·lules (sempre intentant que no es
modifiquin durant el procés d’extracció).
Si el que estem observant són cèl·lules tumorals, cal saber que no tenen inhibició per
contacte (a diferència de les immortalitzades).
En el nostre cos podem trobar des de cèl·lules grans com un òvul fins a cèl·lules mitjanes
com la de la pell, o tan petites com el glòbul vermell de la sang. És per això que hem de
tenir en compte les mides i les seves equivalències (mirar imatge).
Nucli: 3-10 µm
Nuclèol: 0’5-5 µm
Mitocondris: 0’5 µm
Lisosomes/Peroxisomes: 0’2-0’5 µm
Vesícules golgi: 50 nm
Membrana plasmàtica: 4-5 nm gruix
En l'observació de les cèl·lules s’ha de saber que aquestes són dinàmiques, per exemple,
un mitocondri pot adoptar una posició o una altra en mil·lisegons. Per això, els diferents
tipus de microscopis, ens serveixen per a l'estudi de l'estructura i funcionament dels seus
orgànuls, a la vegada que permet conèixer la mida de les diferents estructures cel·lulars.
Les cèl·lules eucariotes, per tant, són mesurables realitzant uns càlculs a través d’una
fórmula.
Conceptes microscòpia
Normalment el revòlver d'un microscopi presenta els objectius següents: 4x, 10, 40x i
100x (objectiu d'immersió). Els objectius són responsables del poder de resolució o la
capacitat de diferenciar dos punts molt propers. Les seves parts són:
El poder de resolució sempre dependrà del límit de resolució, és a dir, que si el límit és
baix, ens permet un poder de resolució alt. Per tant: com més petit sigui el LR més gran
serà el PR.
Paràmetres a tenir en compte
Abans de realitzar la observació microscòpica, cal tenir en compte una sèrie de càlculs
que ens ajudaran a millorar els resultats obtinguts:
N: índex de refracció del medi entre les lents i la mostra (1.0 per l'aire i 1.56 per l'oli
d'immersió).
θ : angle format per l'eix òptic i els raigs de llum més externs que són captats per
l'objectiu.
En la següent imatge podem observar dos medis diferents pels quals el raig travessa i
es desvia. En el cas de l’aire, es desvia més que no pas per l’oli, ja que aquest es tracta
d’un oli especial (anomenat oli d’immersió) que té el mateix índex de refracció que el
vidre, per tant, el raig no es desvia. Això fa que l’apertura numèrica sigui millor.
Tipus de microscopis
1. Microscòpia òptica
o Camp clar
o Fluorescència
2. Microscòpia electrònica
o Transmissió (1931)
o Rastreig (1965)
En aquest diagrama podem observar dues imatges: la primera imatge es tracta d’un
microscopi òptic, en el qual es mostra com es refracta la llum. En la segona imatge
podem observar un microscopi electrònic de transmissió. Depenent de quina mostra
vulguem observar, utilitzarem un microscopi o un altre, ja que cadascun té unes
característiques que el defineixen i que faran d’ell útil per a l’observació de mostres de
mida reduïda.
Característiques del microscopi òptic
Les lents d’enfoc magnètic dirigeixen un feix d’electrons i són les responsables de
la mida del feix d’electrons que incideix sobre la mostra (els electrons es desplacen
de dalt a baix).
Les mostres són il·luminades mitjançant electrons que incidiran i travessaran la
mostra (refracció).
Els electrons que travessen la mostra són recollits en una pantalla d’ordinador (en
blanc i negre o escala de grisos).
Les imatges obtingudes són bidimensionals, però té un poder de resolució major
(podem estudiar l’interior dels orgànuls cel·lulars).
Poden augmentar la imatge d’un objecte fins un milió de vegades.
El poder de resolució arriba fins a 10 Å.
Cal que la mostra s’hagi deshidratat i és bombardejada amb un feix d’electrons que
fan inviable l’observació de cèl·lules vives.
El límit de resolució d’un microscopi electrònic és més petit que el límit de resolució d’un
microscopi òptic, per tant, el primer tindrà més poder de resolució.
Observacions microscòpiques
Per tal d’observar les cèl·lules a través del microscopi, cal tenir en compte si aquestes
estan vives o mortes (en el cas del microscopi òptic, la cèl·lula observada pot estar viva,
en canvi, en el cas de microscopi electrònic la cèl·lula no necessàriament ha d’estar viva).
Les cèl·lules animals són incolores i translúcides, i per estudiar-les hem de ressaltar
(contrastar) els components que volem observar. Com podem ressaltar el que volem
estudiar?
- EXAMEN POSVITAL:
En aquest cas, sí que cal un procés per preparar la mostra, que és el següent:
En el cas que la mostra sigui un teixit (es tracta d’un bloc, caracteritzat per ser gruixut):
- FIXACIÓ:
Pel que fa als processos físics, es duu a terme una congelació (amb nitrogen líquid o neu
carbònica, mitjançant microscopi òptic i microscopi electrònic respectivament). Aquests
processos es realitzen quan es vol observar una activitat enzimàtica o lipídica (perquè
en aquest cas no es produeix la desnaturalització).
- INCLUSIÓ I TALLAT
-TINCIÓ
En el cas que la mostra sigui un cultiu cel·lular, com que el gruix de les cèl·lules és molt
petit, amb dos passos és suficient: es durà a terme la FIXACIÓ i la TINCIÓ, explicades
anteriorment.
Els anticossos: eines de treball per localitzar molècules cel·lulars
Una de les eines que ens servirà per observar proteïnes d’una mostra són els anticossos
(fonamentals per avançar en el coneixement biològic). Però abans de tot, anem a
conèixer què són els anticossos:
Immunohistoquímica o immunocitoquímica
La immuno (“anticòs”) histo (“teixit”) química és una tècnica que permet reconèixer o
diferenciar diferents cèl·lules, mitjançant la unió antigen-anticòs.
Es fa servir sobretot en el diagnòstic de cèl·lules anormals, com ara les dels tumors
cancerosos.
Durant aquest procés, un anticòs primari reconeix un antigen determinat. Per exemple,
podem generar anticossos per una proteïna en concret, purificant-la i injectant-la a un
ésser viu, com seria un conill. Els anticossos reconeixeran aquesta proteïna com una
substància aliena a l’organisme, per tant, la podem identificar com l’antigen específic,
d’aquesta manera voldran immunitzar-la. Un cop reconeguda aquesta proteïna pels
anticossos, podrem observar a través d’un MO o d’un ME els anticossos (s’observarà una
espècie d’acumulació).
Funciona gairebé de la mateixa manera que el microscopi òptic normal, però el que el
difereix és un sistema que permet detectar la fluorescència. Aquest sistema ha de
permetre poder excitar la molècula i, per tant, necessitem una font d’il·luminació més
potent (es fa servir la làmpada de mercuri o de xenó).
Per exemple, volem detectar la fluoresceïna. La excitarem amb la seva longitud d’ona i
necessitarem un filtre d’excitació, que només deixarà passar les longituds d’ona que
permetran excitar. També tenim un mirall dicroic que reflecteix les longituds d’ona menor
de 510 nm. La seva emissió travessarà el dicroic i es trobarà amb un altre filtre que
impedirà que passin les longituds d’ona superiors a la longitud d’ona de la fluoresceïna.
Per tant, restringirà al màxim la observació.
Fins ara hem estudiat el microscopi d’epifluorescència. Aquest l’emprem quan només
volem detectar les longituds d’ona que provenen de la molècula. Quan estem mirant la
mostra, la mirem des de dalt, si localitzem més d’un tipus de proteïna i aquestes estan
posades en paral·lel, ens pot donar problemes de visió, ja que una pot estar localitzada
al nucli i l’altra no, i això fa que en la nostra visió se superposi. A més a més, tenim
plans a sota i a sobre del pla que nosaltres volem observar. Per aquest motiu, per
realitzar experiments de colocalització, necessitem un "programa" que ens permeti
separar els plans. Tractant la imatge amb aquest programa, ens permetrà mostrar el
pla d’imatge que desitgem. Això és el que anomenem deconvolusionar la imatge.
Aquest microscopi és el que ens permet observar mostres més gruixudes. A més, permet
obtenir imatges tridimensionals amb l’ordinador. Per tant, no requereix tot el procés
explicat anteriorment (no cal deconvolusionar la imatge).
Té dos diafragmes: el primer deixa passar el làser per un lloc determinat, de manera
que aquest incidirà en el pla focal de la cèl·lula (justament en el lloc que volem observar),
i el segon diafragma només captarà les imatges que provenen del pla focal.
Per tant, un dels avantatges que té aquest microscopi és que defineix molt bé el pla
focal, és a dir, la zona de la cèl·lula que estem il·luminant.
El microscopi electrònic ens permet tenir una resolució molt important (podem observar
diversos orgànuls: mitocondris, nuclèol, nucli, etc.), ja que el límit de resolució és
més baix que no pas el microscopi òptic.
S’ha emprat des dels anys 80-85. Ha permès obtenir informació que mai no es podria
haver captat mitjançant mètodes tradicionals.
1. Prenem anticossos d’un conill i els injectem en una altra espècie, per exemple, en
una cabra.
2. L’espècie de la cabra generarà anticossos contra els del conill, ja que els detectarà
com si fossin un antigen.
3. En aquesta imatge tenim dos casos:
o En el primer cas, els microtúbuls estan marcats pels anticossos primaris
anti-tubulina que, a la seva vegada són detectats pels anticossos
secundaris, marcats amb la fluoresceïna.
o En el segon cas, els filaments d’actina estan marcats pels anticossos
primaris anti-actina, que a la seva vegada són detectats pels anticossos
secundaris marcats amb Rodamina.
Bàsicament excitar una molècula fluorescent dins la cèl·lula amb llum uv.
Si hi ha cèl·lules que tenen estructures fluorescents, dins de la seva estructura les podem
excitar amb llum UV. Si la cèl·lula no té molècules fluorescents, n’hem d’induir. És per
aquest motiu que utilitzem anticossos: els marquem fluorescentment i els introduïm a la
cèl·lula. Per exemple: els anticossos d’antiactina marcaran les molècules d’actina.
Com ja hem vist anteriorment, perquè una mostra pugui ser observada a través del ME,
ha de realitzar-se un examen postvital (és a dir, la cèl·lula que s’observa està morta) i,
a més, necessita ser processada:
Aquest microscopi conté unes espirals que mouen els feixos d’electrons que incidiran en la
mostra, d’aquesta manera, es genera un moviment d’escombratge o rastreig. Els electrons
incideixen sobre la mostra, la qual emet electrons secundaris que són detectats per la
mostra no tallada i recoberta de metalls pesats (per tant, està tota electrodensa).
Això és el que ens permet obtenir imatges en 3D. A continuació es mostren algunes de les
imatges que es poden obtenir mitjançant el SEM. Ens dona una imatge només de la
superfície de la mostra (xex: una cèl·lula sencera, un insecte, un teixit, etc.).
També es poden observar altres estructures com ara les invaginacions de la membrana (petites cavitats),
ja que fan 60nm de diàmetre i no es poden observar en el MO.
Santiago Ramón y Cajal
Microscopis de superresolució
De fet, els investigadors que han desenvolupat aquest sistema (Eric Betzig, Stefan W.
Hell i William E. Moerner), han estat guardonats amb el Premi Nobel de Química l’any
2014.
En el centre de la imatge s’observa una membrana del lisosoma, capturada pel propi
Betzig. A l’esquerra hi ha la mateixa imatge però capturada amb un microscopi
convencional i, a la dreta, la imatge de la membrana has estat ampliada a 0,2µm.
La teoria més acceptada postula que les procariotes van desenvolupar aquestes
invaginacions fins a un nivell tan avançat que van a assolir una independència funcional
i morfològica, formant el RE. Té sentit, ja que el reticle endoplasmàtic de les eucariotes
té proteïnes translocadores semblants a les translocadores de la membrana de les
procariotes.
Morfologia
Cal tenir en compte que quan s'estudia la cèl·lula mitjançant microscòpia electrònica,
obtenim imatges en 2D. És informació valuosa, però parcial al cap i a la fi. Per tenir
informació real caldria fer una reconstrucció tridimensional de la cèl·lula.
En tal cas, observaríem que les cisternes(entapissades per ribosomes) del RE connecten
amb altres cisternes i formacions tubulars, compartint sempre un espai comú, el lumen.
Per a cada fracció, s'obté una altra fracció anomenada microsomal. Aquesta fracció
apareix durant la homogeneïtzació mecànica, no és més que les membranes del RE.
Dites membranes tendeixen a vesicularitzar-se pels seus extrems hidrofòbics a dintre
del tampó d'homogeneïtzació. 3
Artificialment es poden separar els microsomes llisos dels rugosos. De fet, foren els
microsomes rugosos que portaren als biòlegs de l'època a concloure la funció
proteosintètica dels ribosomes, gràcies a l'addició d'aminoàcids radiactius a dintre
d'aquestes solucions microsomals rugoses que amb el temps, presentaven proteïnes
noves amb caràcter radiactiu.
Una de les tècniques utilitzades per purificar un compartiment cel·lular és l’anomenada
fraccionament cel·lular. Prenem unes cèl·lules concretes, per exemple, les del fetge:
1. Agafem un tros de fetge i el col·loquem en una solució que ens mantingui les
proteïnes de forma correcta (evitant autòlisis i alteracions del pH, mantenir una
temperatura adequada de 4ºC per minimitzar l’activitat de les proteases, en unes
condicions químiques i ambientals apropiades)
2. Cal separar les cèl·lules del teixit del fetge mitjançant homogeneïtzació mecànica,
procés que consisteix en col·locar un homogeneïtzador anomenat èmbol, de
manera que es disgreguen les unions entre les cèl·lules (unions de la matriu
extracel·lular). Trenca la membrana
3. Un cop aquestes cèl·lules s’han separat, cal alliberar el contingut de les mateixes
per poder estudiar els compartiments que realment ens interessen.
4. Per tal de separar els diferents continguts, haurem de sedimentar les molècules
que no ens interessen. Per fer-ho, ens basarem en el seu coeficient de
sedimentació determinada: es realitzen centrifugacions diferencials a partir
d’aquest coeficient, de manera que cada molècules sedimentarà en un lloc o altre.
5. D’aquesta manera, podrem treballar amb els compartiments necessaris.
En practicar la homogeneïtzació
mecànica, es trenquen els microtúbuls
de les membranes, que tendeixen a
tancar-se de nou, perquè les regions
hidrofòbiques han d’evitar el contacte
amb l’aigua. Quan això passa, es
formen unes vesícules anomenades
microsomes. Aquests, en un principi,
eren inexistents en la cèl·lula, perquè
els haurem “creat” nosaltres a partir de
la tècnica explicada. Com a resultat,
obtindrem microsomes rugosos (del RE
rugós) i microsomes llisos (del RE llis).
Com que aquests microsomes són de
diferents densitats, els haurem de
separar utilitzant un “gradell de
sucrosa”. Les vesícules arribaran al seu
punt isopícnic (punt en què la densitat
de les mateixes vesícules és la mateixa)
i, per tant, flotaran en diferents
posicions depenent de quina sigui la
seva densitat.
Redman C.M., Siekevitz i George Palade: van agafar microsomes rugosos i van poder
observar que quan els incubaven es formaven al seu interior proteïnes. Per tant, van
demostrar que a l’interior del RE es pot produir la síntesi de proteïnes.
Aquests lipid droplets es formen neutralitzant els àcids grassos lliures (esterificant-los).
Els àcids grassos esterificats s'emmagatzemen entre les dues monocapes de la bicapa
del reticle.
Un cop les proteïnes són sintetitzades al citosol, aquestes són reconegudes per
xaperones de la família HSP70 i per proteïnes d'interacció amb el reticle. Aquestes
molècules permeten que aquestes proteïnes es puguin incorporar al RE. Les proteïnes
BiP (binding proteins) s’associen a les proteïnes en maduració, i provoquen l'entrada
completa d'aquestes dins el lumen del RE.
Les proteïnes SNARE són proteïnes amb un paper important en el transport vesicular.
Són un tipus de proteïnes que un cop sintetitzades completament, expressen una alfa-
hèlix a l'extrem C-terminal. Aquesta seqüència hidrofòbica és reconeguda per una
maquinària concreta que s'encarrega de que aquesta proteïna sigui inserida a la
membrana del RE i d'altres compartiments.
SS (seqüència senyal)
Són les seqüències específiques d'entre 5 i 10 aminoàcids hidrofòbics que sovint es situen
a l'extrem N-terminal de les proteïnes.
Mapa de hidrofobicitat
La hidrofobicitat es pot descriure com la tendència a presentar una exclusió per part de
l’aigua per a les molècules que són no polars. És una característica molt important pel
que fa al plegament de la proteïna.
D’aquesta manera, tal com podem observar al diagrama, es formaran uns pics
característics en aquelles zones que s’han detectat regions hidrofòbiques de les
proteïnes, de la mateixa manera que ens indica també les zones hidrofiliques.
En els mRNA, la traducció comença quan es troba el codó d’iniciació AUG, però dintre del
mRNA hi ha varis AUG. Generalment el primer que es troba és el que es fa servir per
iniciar la síntesi, però hi ha mRNA que tenen varis AUG que poden servir de punt d’inici
de la traducció i la síntesi proteica comença la traducció quan es troba AUG i continua
fins al codó de STOP.
Modificacions post-traduccionals
Mitjançant tots aquest processos, el RE rugós intervé en la síntesi d'un gran percentatge
de proteïnes cel·lulars. Per tal que aquesta síntesi es porti a terme correctament, en el
mateix RE aquestes proteïnes pateixen modificacions post-traduccionals.
Al RE també hi tenen lloc diversos processos de proteòlisi per tal que les proteïnes acabin
de madurar correctament. Les peptidasa senyal s'encarreguen d'hidrolitzar la seqüència
senyal de les proteïnes en síntesi (sempre que aquest segment no formi part de la proteïna
madura).
Un altre procés important de proteòlisi del RE és el de les proteïnes que s'ancoren als GPI.
Les proteïnes transmembrana són hidrolitzades i posteriorment incorporades a un GPI
mitjançant una glycosiltransferasa. Aleshores, aquestes proteïnes s'ancoren al GPI i
posteriorment, viatjarien a la membrana corresponent (plasmàtica per exemple)
mitjançant transport vesicular.
N-glicosilació
Aquest procés té lloc a la cara citosòlica de la membrana del RE. En aquesta membrana
existeix una molècula lipídica anomenada dolichol, a la qual s'associen els 7 primers
sucres de forma covalent.
Aleshores, quan això ha tingut lloc, la membrana fa un "flip", i els 7 sucres restants són
insertats des del lumen del RE.
Un cop els 14 sucres estan associats de forma covalent entre ells i al dolichol, són
transferits a l'asparagina específica, una oligosacarid transferasa transfereix
l'oligosacàrid a l'asparagina corresponent.
Plegament
Existeixen els enzims glucosidasa-1 i glucosidasa-2 que el que fan és hidrolitzar les dues
darreres glucoses del bloc de 14 sucres de les proteïnes N-glicosilades.
Quan les proteïnes només només una glucosa terminal, és quan són reconegudes per la
calnexina o per la calreticulina. Quan aquestes xaperones reconeixen aquestes proteïnes,
les retenen per tal que altres enzims hi puguin actuar per a produir les modificacions
adients, per tal d'aconseguir el seu plegament correcte.
El RE s'ha d'entendre com una factoria de proteïnes per la cèl·lula. Si les proteïnes no
són sintetitzades correctament, han de ser eliminades per tal que la cèl·lula funcioni bé,
i el RE no col·lapsi.
Mitjançant aquesta resposta, la cèl·lula activarà processos per tal de pal·liar l’estrès que
està patint el RE.
Quan comença l'estrès, les xaperones BiP que mantenien aquestes 3 proteïnes en la seva
forma inactiva (monomèrica) les abandonen, i comencen a associar-se a les proteïnes mal
plegades per tal d'aturar l'estrès.
L'abandonament d'aquestes proteïnes per part de les xaperones, comporta uns efectes a
nivell molecular que activen les respostes UPR.
IRE1
Aquest mRNA codifica específicament una proteïna del tipus factor de transcripció que rep
el nom de XBP1. Aquesta proteïna viatja fins al nucli i estimula l'expressió gènica de
xaperones. Aquesta proliferació de xaperones intentarà paliar l'estrès de RE.
PERK
ATF6
Es tracta d'una malaltia severa, provocada per la mutació de la proteïna CFTR. Aquesta
proteïna és un canal de membrana de clor situat a la secció apical dels epitelis. La sortida
de clor de la cèl·lula implica sortida d'aigua.
Avui dia es sap que aquesta mutació es deu a la posició errònia d'una fenilalanina en un
anticodó implicat en l'expressió d'aquesta proteïna. Degut a això, la CFTR no és
correctament plegada, i per tant és eliminada al proteosoma abans que arribi a la
membrana plasmàtica.
Aquest canal és crucial a les cèl·lules del pulmó per a hidratar els cilis i prevenir
infeccions, la gent amb aquesta patologia és molt sensible a infeccions per pseudomonas
eruginosa. La sortida de clor, i conseqüent hidratació també té gran importància al
pàncrees per al correcte funcionament de determinats enzims.
Aleshores, la proteïna CFTR, tot i que mal plegada, podria funcionar perfectament. Però,
a conseqüència d'un control de qualitat massa restrictiu, aquesta és eliminada, i provoca
simptomatologia clínica greu.
Estratègies farmacològiques
El RE sintetitza gairebé 1/3 de la totalitat de proteïnes cel·lulars, entre les quals figuren
gairebé totes les que són de secreció i de membrana.
Aquestes proteïnes són sintetitzades a la membrana del RE, i són concentrades en unes
regions específiques anomenades ERES (Endoplasmic Reticulum Exit Sites). En aquestes
seccions són seleccionades per a ser empaquetades en vesícules, o bé elements de
transport per tal de ser transportades cap a la cara cis del Golgi.
Aquests elements de transport són sintetitzats per tota la membrana del RE, i són
desplaçades cap al centre de la cèl·lula, ja que la cara cis del Golgi (cara d'entrada) té
una orientació perinuclear, està al voltant del nucli.
- La sortida de les vesícules de la cara trans del Golgi fins a la membrana plasmàtica
rep el nom d'exocitosi constitutiva (constitutiva ja que totes les cèl·lules
presenten aquest fenòmen).
- Quan aquestes vesícules arriben a la membrana per resposta a un estímul, rep el
nom d'exocitosi regulada (es dona en les rutes de secreció, per exemple).
El transport vesicular que va des del Golgi fins la membrana rep el nom de ruta
anterògrada ó biosintèticasecretora (anterògrada per què es considera que va cap
endavant, biosintètica ja que d'aquesta forma es sintetitza membrana plasmàtica, i
secretora ja que les cèl·lules secretores funcionen d'aquesta manera).
- Quan les proteïnes sintetitzades no són de membrana però han seguit la mateixa
derecció de transport, també es consideren de la ruta anterògrada o biosintètica.
Per exemple, el transport d'enzims digestius des de la cara trans del Golgi fins als
endosomes primerencs.
Sempre intervenen els microtúbuls del citoesquelet, són imprescindibles en el transport
vesicular.
Si les vesícules viatgen des de la membrana plasmàtica fins al Golgi, es diu que prenen
la via retrògrada. Poden fer tot el recorregut, o bé desviar-se també als endosomes
primerencs. També pot ocorrer com a resposta a un estímul (estimulada), i pot arribar fins
el RE.
Proteïnes de coberta
Les proteïnes SNARE exerceixen força mecànica per tal que les bicapes lipídiques es
barregin. Quan el procés acaba, hi intervenen unes altres proteïnes per tal de treure les
SNARE i que puguin ser reutilitzades.
Regulació de la interacció: Rabs
Unes altres proteïnes importants que regulen els processos d'interacció entre vesícules i
compartiments dianes són les proteïnes Rab. Són proteïnes monomèriques amb activitat
GTPasa. Quan uneixen GTP adopten la conformació activa (Rab-GTP), que es quan poden
interaccionar amb els seus efectors.
Es formen en els ERES. Intervenen diverses molècules, entre elles el PI(4)P, que permet
la reclutació de proteïnes Sec12, que són tipus GEF (bescanviadores de nucleòtids) a la
membrana del RE. Les Sec12 bescanvien nucleòtids de les GTPases Sar1 (responsable
de la formació d'aquestes vesícules als ERES). Les Sar1 tenen una regió hidrofòbica (alfa
hèlix) a l que en forma inactiva, es troba amagada. En activar-se, aquesta hèlix
hidrofòbica queda exposada i s'insereix a la membrana del RE.
Al seu torn, les Sar1 actives recluten altres proteïnes del complex COPII.
Sar1 en la seva forma activa i insertat a la membrana del RE, recluta Sec23 i Sec24. Són
dues proteïnes diferents, però es troben en forma d'heterodímer. Sec24 entra en
contacte amb el cargo a través de la membrana del RE i el recluta per tal d'emmagatzemar-
ho correctament. Quan el cargo es troba unit al complexe, es forma la segona coberta de
la vesícula, formada per Sec13 i Sec31, que juntes formen un heterotetràmer. Tot plegat
forma el complex COPII, i la vesícula es despren de la membrana.
Quan la vesícula s'ha format i la membrana del RE s'ha gemmat cap al citosol, és la pròpia
Sar1 la responsable del desensamblatge. Ho fa hidrolitzant el GTP a GDP, i d'aquesta
manera desmunta tot el complexe COPII.
El pH a dintre del RE és bastant neutre, als ERGI augmenta cada cop més, i al Golgi el
pH és àcid. És per això què els receptors de KDEL tenen major afinitat pels KDEL quant
més baix és el pH.
El gradient de pH que es crea es deu a que a mesura que les vesícules avancen en la
ruta anterògrada, la bicapa lipídica corresponent presenta més nombre de bombes de
protons. D'aquesta manera el RE té un alt pH, i el Golgi un pH baix.
Està format per diferents sacs anomenats dictiosomes. Va ser descobert a finals del segle
XIX per tinció de cèl·lules nervioses. Els sacs del Golgi estan interconnectats entre si.
Modificació de glúcids
- Sucres complexos: són aquelles glicoproteïnes que han patit modificacií, i se'ls hi
ha afegit diversos sucres més, entre els quals pot figurar el NANA (aporta càrrega
negativa)
- Sucres rics en manose: són aquelles glicoproteïnes que no han patit cap
modificació prèvia.
La composició proteica i lipídica del Golgi varia segons l'àrea d'aquest, segons la funció
que s'hi porti a terme.
Afirma que les cisternes són estàtics i conserven el seu conjunt característic de proteïnes
residents. El pas de les molècules d’una cisterna a l’altra es produeix mitjanç ant el
transport de vesícules que es desplacen cap endavant. D’aquesta manera està variant la
proporció de proteïnes contínuament.
Afirma que les cisternes de l’AG són estructures dinà miques que van adquirint un major
grau de maduració a traves de l’adquisició. Cada cisterna de l’AG madura a medida que
migra cap endavant a través de l’apilament. En cada capa les proteïnes residents de l’AG
que s’han transportat cap endavant en una cisterna en maduració són retornades
mitjançant vesícules de COP I.
Vesícules del RE es fusionen entre elles per formar una cisterna a la cara cis. Quan es
forma una altra de nova, aquesta é s desplaçada cap al compartiment intermig i després al
de trans. El compartiment trans es destrueix donant lloc a vesícules.
L’aparell de Golgi està polaritzat. Té cinc compartiments que realitzen diferents funcions:
TOT AQUESTS ESTUDIS TENEN UNA RELLEVÀNCIA PER A L’ESTUDI DE LES PROTEÏNES.
UNITAT 5: LA EXOCITOSI
A la xarxa transgolgi, les proteïnes s’accionen i es classifiquen per tal de ser dirigides a
diferents destinacions de la cèl·lula. Hi haurà proteïnes que gràcies a una senyal
anomenada manosa-6-fosfat són reconegudes i empaquetades en vesícules recobertes
d’una proteïna anomenada clatrina i enviades cap als lisosomes. Son proteïnes, enzims
hidrolases àcides que la seva funció la realitzen al lisosomes. Hi ha altres molècules que
viatjaran a altres destinacions com per ex la membrana plasmàtica.
Cèl·lules polaritzades
Hi ha cèl·lules que formen part dels teixits epitelials i es troben polaritzades, ja que
presenten dues membranes que tenen una composició proteica-lipídica diferent i, per
tant, tenen funcions diferents.
- Membrana apical
- Membrana basolateral
Les proteïnes són enviades des del aparell de golgi de dues maneres:
- Directe: les proteïnes glicosilades o unides a gtp són reconegudes per l’aparell de
golgi i enviades cap a la membrana apical.
- Indirecte: porcions de membrana per endocitosi formen vesícules que arriben als
endosomes primerencs o early endosomes, on son classificades i enviades a
Les proteïnes que arriben a la membrana plasmàtica poden seguir dues rutes de secreció
(dos tipus d’exocitosi):
Aquests grànuls de secreció al principi són immadurs, i ho seran fins que la clatrina marxi
de la vesícula. La clatrina ha de deixar la vesícula i emportar-se part de la membrana
del grànul de secreció.
Utilitzant un anticòs marcat amb boles d’or (me) podem saber si el grànul és madur o
no, perquè l’anticòs reconeix la clatrina aleshores sabem que la clatrina no ha marxat i,
per tant, és un grànul de secreció immadur que és menys electrodens que el madur.
- Va injectar leucina (aà) marcada radioactivament amb triti radioactiu (d’H) a uns
animals.
- Durant un temps determinat, aquesta leucina radioactiva s’incorporava a una
proteïna (la proteïna quedava marcada).
- Posteriorment elimina la resta de leucina radioactiva. Queden les proteïnes
marcades radioactivament.
- A través una autoradiografia podia observar on es localitza la radiació
o Les primeres marques de radiació
o De 3-5 minuts les trobem al reticle endoplasmàtic
o Als 7 minuts les trobem l’aparell de golgi
o 30 minuts trobem les clatrines als grànuls de secreció (molt laxes), per tant,
en vesícules immadures.
o 2 hores es troben als grànuls madurs, a punt d’alliberar-se.
El mastòcit forma part del sistema immunitari de teixits conjuntius i estan associats
a ladefensa contra patògens i en reaccions al·lèrgiques.
Per tant, els grànuls de secreció que arriben al mastòcit estan plens d’histamina.
Es donarà a terme la fusió de les vesícules amb la membrana del mastòcit on hi
hagui un estimul. Si aquesta estimulació és molt forta, implicarà que les pròpies
vesícules de secreció es fusionaran entre elles per aconseguir una major
concentració d’histamina enun punt i alliberar el material del mastòcit.
Si el mastòcit el tenim fixat en una membrana adherosa podem que fer que
l’estímul només incideixi en una part de la membrana plasmàtica que en aquella
part es doni la fusió. Aquest fet és molt important, com per exemple en els enzims
digestius <els qualshan d’alliberar-se a l’epiteli intestinal, però no en la membrana
basolateral, la qual estàen contacte amb el torrent sanguini.
Processament proteolític
A vegades, els passos finals de maduració de proteïnes tenen lloc als grànuls de
secreció,un exemple son els grànuls de secreció que transporten enzims digestius,
els fem funcionar al final del transport. Algunes proteïnes es sintetitzen com a pro-
enzims i pro-proteïnes, aquesta forma no és activa, i per a ser actius i funcionals,
s’ha d’hidrolitzar el grup pro.
Aquest processament proteolític o hidròlisi comença a la xarxa trans golgi (tgn)i
finalitzaals grànuls de secreció. L’enzim o proteïna nomes serà actiu a partir dels
grànuls de secreció.
- Avantatges
Transport de proteïnes petites, com son les encefalines (5 aminoàcids) que no són
prou grans per ser empaquetades ni per a contenir senyals per a poder ser
sintetitzades pel RE, empaquetada al Golgi i enviada a la membrana plasmàtica. Es
formen poliencefalines (moltes encefalines), les quals poden ser reconegudes i
empaquetar-se i als grànuls de
secreció tornaran a obtenir les proteïnes encefalines per hidròlisi. Aquesta és la
proteïna activa la qual serà alliberada quan sigui necessària..
L’avantatge de la síntesi de proteïnes actives és la síntesi d’enzims digestius o
hidrolítics, ja que com més tard s’activin aquestes proteïnes menys riscos tindrà la
cèl·lula, és a dir, més protegida estarà la cèl·lula.
El processament proteolític permet la possibilitat d’alliberar diferents proteïnes al
mateix temps i diferents tipus depenent del tipus cel·lular i la dotació d’enzims que
aquest tipus cel·lular presenti. Un tipus determinat podrà alliberar unes hormones
determinades o unes altres, depèn dels enzims i la dotació enzimàtica.
FAGOCITOSI:
PINOCITOSI:
Macropinocitosi: (50-100nm)
Es creia, al principi, que la clatrina era la única proteïna de coberta i per tant,
era la única que participava al procés de la endocitosi. Però posteriorment, van
poder observar que quan la clatrina estava inhibida, es seguia fent la
endocitosi. Per tant, van poden dir que hi ha altres proteïnes de coberta
Així doncs, s’ha pogut classificar les vies segons si són depenents o no de
clatrina.
La ruta endocítica s'inicia en els sots recoberts de clatrina (poden ocupar fins
al 2% del total de la membrana plasmàtica en cultius de fibroblasts). Els sots
tenen una vida curta, en qüestió de segons s'invaginen i les crestes es
fisionen i es separen de la membrana i es formen les vesícules recobertes de
clatrina, on participen diferents proteïnes. Es produeixen en cultiu de
fibroblast 2.500 proteïnes per minut.
Aquests sots seleccionen certs receptors que tenen seqüències a la seva cua
citosòlica d’interacció amb la proteïna AP₂.
Membrana: AP2
Rutes endocítiques:
Internalització
Reciclatge
Pot ser directe i ràpid a través del Rab4 o més lent a través de Rab11
Els endosomes poden anar madurant fins a formar els endosomes tardans.
Tenen a la seva membrana bombes de protons que permetran que els protons
entrin a l’interior. És important recalcar que en aquests endosomes tardans
trobarem més bombes de protons i, per tant, més protons a l’interior.
Gradient de protons
Membrana: pH 7
Endosomes primerencs: pH 6,5
Endosomes tardans: pH 6
Lisosomes: pH 5
El colesterol circula per la sang gràcies a les partícules LDL que contenen
colesterol i tenen densitat baixa. Aquestes partícules contenen una monocapa
de fosfolípids i en el seu interior tenen èsters de colesterol esterificat. També
tenen lipoproteïna B que permetrà que aquesta partícula pugui ser reconeguda
per un receptor que es troba a la membrana de la cèl·lula. Aquests receptor
s’anomena receptor de LDL i conté unes senyals a la seva cua citosòlica
d’interacció amb la proteïna adaptadora AP₂.
Així, un cop lliure, aquest receptor pot capturar noves partícules d’LDL o
portar-les cap a l’interior dels endosomes primerencs.
Aquesta partícula de LDL viatjarà cap als lisosomes passant pels endosomes
tardans. Quan arriba als lisosomes serà hidrolitzada i la cèl·lula podrà obtenir
el colesterol lliure que necessiten.
Les cèl·lules tenen uns receptors en el RE que li permet detectar quan els
nivells de colesterol lliure citosòlic son elevats. Quan n’hi ha prou,
disminueixen la síntesi de nous receptors de LDL.
La cèl·lula necessita captar ferro per tal de créixer i sintetitzar nous enzims o
proteïnes que contenen ferro.
Aquest trànsit permet que sigui reconegut pel sistema SCRT (per la ubiqüitina)
i farà que el receptor sigui intravesicularitzat a l'interior dels endosomes
tardans, de tal manera que trobarem el receptor als cossos multivesiculars a
l’interior.
Exemple:
Existeix una altre via que aporta molècules als lisosomes anomenada
autofagia “self eating “ en el qual els orgànuls que s´han fet vells han de
ser eliminats. Aquests orgànuls s´envolten d´una doble membrana que prové
del reticle i es forma
l´autofagosoma que es fusiona
amb el lisosoma per tal de
destruir aquests orgànuls i
substituir-los per uns nous.
Els lisosomes son els principals llocs de digestió intracel·lular gràcies a que
conté en el seu interior un conjunt d'enzims hidrolítics (contenen més de 40
enzims diferents: nucleases, proteases... ). Aquests enzims, al hidrolitzar les
molècules que els arriben produiran aminoàcids, sucres, nucleòtids i
colesterol que necessita la cèl·lula.
El conjunt d'enzims que conté els
lisosomes s'anomenen hidrolases
àcides perquè la seva activitat es a un
pH molt baix (pH = 5).
Els enzims lisosomals son reconeguts a la cara cis del Golgi, s'incorpora a ells
la senyal manosa-6-fosfat amb GIgNAc-P i aquesta, posteriorment és
eliminada en la cisterna i quan arriba a la xarxa transgolgi, la manosa
fosforilada en posició 6 serà reconeguda pel receptor de manosa-6-fosfat i en
la seva cua citosòlica interaccionarà amb la proteïna adaptadora AP1 que
permet el reclutament de clatrina i per tant, els receptors podran ser
seleccionats i empaquetats en vesícules que seran transportats pel receptor
cap als endosomes primerencs. Degut al pH àcid dels endosomes primerencs,
la manosa-6-fosfat s’allibera del receptor i el fosfat s’hidrolitza de la manosa
i ja tenim l’enzim lisosomal en els lisosomes.
o Ex: Melanosomes
Funcions:
Divisió i fusió
Aquesta mida també ens permet observar-los a través d’un microscopi òptic
(MO) en el qual s’observa que canvien contínuament de forma i de localització
a l’interior de la cèl·lula.
Plasticitat:
Membrana externa:
Molt porosa (des del citosol a l’espai intermembrana) on els dos espais estan
equilibrats perquè les molècules la poden travessar en qualsevol sentit.
Membrana interna:
Matriu:
Conté el DNA mitocondrial circular; pot haver més d’una copia, gairebé tot
codificat i petit. Cada mitocondria pot contenir entre 1 a 2 còpies d’aquest.
Espai intermembranós:
Conté enzims que utilitzen l’ATP que passa per la matriu per fosforilar els
nucleòtids.
Fosforilació oxidativa (síntesi ATP)
116
La síntesi d’ATP s’anomena fosforilació oxidativa
perquè l’ADP es fosforila donant lloc a ATP.
Tanmateix, és important recordar que perquè es
pugui fer, s’ha de dur a terme també l’oxidació
del piruvat i l’àcid gras per produir NADH, que
serà oxidat gracies a l’oxigen per produir NAD+ i
H2O
Síntesi d’ATP:
El DNA circular que tenen les mitocòndries només codifica per 13 proteïnes:
2 RNA específics
22 gens de transferència
13 proteïnes (entre elles algunes subunitats de l’ATPsintasa)
El receptor TOM20 porta la senyal prop del TOM40, que és el canal que
facilitarà l’entrada de la proteïna a la mitocondria.
TOM
TIM 23
Participa en l’incorporació de
proteïna a la matriu i
incorporació de proteïnes
transmembrana a la
membrana interna. També
proteïnes que es troben a
l’espai intermembranós un cop
la seqüència senyal es
hidrolitzada.
TIM 22
OXA
Complex que es troba a la membrana interna
i permet la incorporació de proteïnes
transmembrana a la membrana interna,
proteïnes provinents del seu transport a
través del Tim23 o proteïnes que es
sintetitzen mitjançant gens mitocondrials.
SAM
Característiques:
Funcions:
Observació de peroxisomes
En la de microscòpia òptica els punts negres son els peroxisomes. Els trobem
per tota la cèl·lula i tenen una morfologia de ser arrodonida.
Els peroxisomes estan envoltat per una única membrana, bicapa lipídica. En
canvi, els mitocondris els trobem envoltats per una doble membrana.
Funcions principals dels peroxisomes
Detoxificació: els components tòxics els oxiden i els fan solubles per
finalment excretar-los. Molt important en el fetge i el ronyó.
Participen en la beta-oxidació dels àcids grassos de cadenes llargues: els
primers passos de beta oxidació d’aquests àcids grassos succeeix als
peroxisomes. L’oxidació complerta dels àcids grassos finalitza en els
mitocondris, per tal que siguin oxidats completament (cicle de Krebs) i
donar energia.
En fongs poden participar en la síntesi de toxines i antibiòtics, com per
exemple la penicil·lina.
Participen en la gluceogènesi a partir de lípids gracies al cicle del glicoxilat
(glioxisomes). Es dona a les llavors de les cèl·lules vegetals.
Participen en les primeres reaccions de la síntesi dels plasmalògens,
constitueixen molt important de les veïnes de mielina.
Els glioxisomes
Els plasmalògens
Es creia que els peroxisomes van venir de la endosimbiosi, però ara es pensa
que els peroxisomes provenen de membranes del reticle que formen
vesícules, per tant es formen de novo. Aquestes vesícules contenen
transportadors i receptors que permetran la incorporació de noves proteines
peroxisomiques (PTS1 i PTS2) a la membrana de les vesícules i a l’interior
dels peroxisomes (parlem dels enzims oxidatius). Quan aquests peroxisomes
creixen, poden fisionar-se i també fusionar-se. Alhesores, el nombre podrà
variar depenent de la situació fisiològica que es trobi la cèl·lula.
Cal tenir en compte que, quan els peroxisomes s’han d’eliminar (es redueix
el numero de peroxisomes), aquests són envoltats per una doble membrana
que prové del reticle endoplasmàtic, formant un autofagosoma, que els
eliminarà (PEXOFAGIA). En el mas dels mitocondris s’anomena mitofagia
Les proteïnes que s’ha d’importar o que han de formar part dels peroxisomes,
un cop s’han sintetitzat en el citosol contenen seqüencies de
direccionament cap als peroxisomes. Normalment, aquestes seqüencies es
troben a l’extrem C-terminal de la proteïna. En el cas de la catalasa, son tres
aminoàcid (serina, lisina i leucina) que es troben a l’extrem C-terminal de la
proteïna.
Aquest complex permet que aquesta senyal pugui ser dirigida cap a un canal
proteic multimèric que es troba a la membrana del peroxisoma, a través
d’aquest canal la proteïna es incorporada finalment a la matriu del
peroxisoma.
ANIMALS: microtúbuls
Microtúbuls
Filaments d’actina (microfilaments)
Filaments intermedis
Polimeritzar: formació de
filaments en un polímer
mitjanç ant diversos monòmers.
Despolimeritzar: fisió dels
filaments. (trencar el polímer per
formar monòmers)
Això es degut a que les seves unions de les subunitats solubles no són
covalents. Un exemple de la dinàmica és el moviment cel·lular.
Per tant, s’han de poder repolimeritzar en el lloc correcte (on arribi la senyal)
perquè la cèl·lula pugui moure’s en el sentit determinat i aconseguir avançar
cap al lloc on es troba el nutrient. Li permet un gran dinamisme i una gran
plasticitat.
Microtúbuls
Moviment cel·lular
Mantenir la forma cel·lular determinada
Filaments intermedis
El seu diàmetre és de mida mitjana (10nm). És més petit que els microtúbuls
i més grans que els filaments d’actina.
Residència mecànica
Mantenir unions de les cèl·lules en el teixit epiteli
Proteïnes accesò ries del citoesquelet: (proteïnes específiques que
s’activen i es desactiven depenent del que es vulgui moure, depenent de la
dinàmica)
Existeixen:
Tot i ser dinàmics, son dels més estables i forts. Això fa que li proporcioni a
la cèl·lula suport i resistència mecànica. S’enacrreguen d’evitar que la cèl·lula
s’aixafi o es trenqui i, a més a més, s’encarrega de la unió cèl·lula – cèl·lula i
cèl·lula – matriu estracel·lular. Formen una xarxa al voltant del nucli i
s’estenen cap a la perifèria de la cèl·lula, on arriben a interactuar amb la
membrana plasmàtica.
Filaments de queratina
Un dels derivats formats per queratina els cabells i les ungles. Aquests teixits
resisteixen i perduren quan la persona mor. Per això comprovem que els
filaments intermedis són molt resistents.
Els filaments de queratina s’uneixen entre ells gràcies als ponts disulfur.
Filaments de vimentina
Són típics de les cèl·lules mesenquimals, aquelles que formen part del teixit
connectiu.
Neurofilaments
Es localitzen a l’axó de les neurones. Existeixen neurones que van des del
cerebel fins a la punta dels dits, això fa que aquest axó està rebent moltes
tensions, de manera que la funció dels filaments es mantenir la seva
estructura tan llarga i donar resistència.
Filaments de làmines
A l’inici de la mitosi, s’ha de produir una fosforilació de les lamines que fa que
es despolimeritzen. Això pot ser gracies a la quinasa CC2. Quan acaba el procés
de la mitosi, es produeix la desfosforilació mitjançant fosfatases, fent que es
tornin a polimeritzar i tornar a formar les lamines.
Totes les cèl·lules eucariotes animals (excepte els eritròcits) tenen dos tipus
de filaments intermedis (els del nucli i els de fora).
Recordem que si l’extrem beta dels protofilaments dels microtubuls estan units
a GTP, seguirà polimeritzant formant extrems rectes. Per tant, amb GTP seguirà
creixent el polímer. Quan aquesta incorporació a l’extrem positiu disminueix
perquè la concetració d’heterodimers alfa beta tubulina lliure al citosol
disminueix, aleshores, la velocitat de polimerització es més l enta i el
GTP canviarà a GDP. Ara trobarem que aquests polímers estaran formats per
GDP, i això produirà una curvatura de les subunitats que afavoreix la seva
despolimertizació. Això es produïrà de manera ràpida i sobtada. El fenòmen
s’anomena catàstrofe. Això fa que el protofilament s’escursi. Quan tenim
protofilaments més petits, totalment en heterodimers alfa beta, canviaran de
GDP a GTP, les concentracions lliures al citosol d’aquests heterodímers serà
elevada i tornarà a polimeritzar-se, formant un casquet i permetrà fer-se un
creixement molt ràpidament.
Els microtubuls despolimeritzen 100 vegades més rapid quan estan unides a
GDP que a GTP. Per tant, quan hi ha un casquet de GTP afavoreix al
creixament incroporant eterodimers de manera ràpida.
Al llarg del temps, si observem els microtubuls, veiem que varien rapidament
la seva mida. Creixen i s’escurçen de manera molt ràpida (polimeritzen i
depolimeritzen rapidament).
ESTAMINA = ONCOPROTEÏNA D8
Les MAPs poden presentar llocs d’unió a microtubuls i altres molècules. Poden
determinar la distància d’empaquetament dels microtubuls o la distància
d’empaquetament entre microtubuls i altres molècules.
Quan la quinesina es fosforila i s’inactiva, deixa de fer la funció. Per tant, ara
només funcionaran les dineïnes i per això els melanòsits faran el moviment
cap el nucli. Així varien la coloració del seu cos.
Filaments d’actina (microfilaments)
El que veiem en verd són els feixos d’actina, formant una estructura
anomenada FIBRES D’ESTRÉS. contacten amb unes proteïnes que formen part
de les adhesions focals com la Vinculina. Son adhesions que permeten a la
cèl·lula unir-se a un substrat determinat. Les fibres d’estrès contacten en
aquests llocs on es trobem la vinculina en les adhesions (vermell).
Poden formar feixos contràctils que son les fibres d’estrès perquè la
cèl·lula pugui unir-se a certs substrats.
Pot presentar gels tridimensionals
Poden formar la melipodis que permetrà a la cèl·lula avançar en una
direcció determinada en el moviment cel·lular
Formar fil·lopodis que permeten a la cèl·lula explorar l’exterior
En canvi, aquesta concentració que és troba en el citosol encara pot ser més
alta que la concertació critica de l’extrem positiu, això vol dir que en aquest
extrem es poden estar incorporant nous monòmers d’actina.
Quan arriba un estímul, es pot transformar en una senyal que permet que es
doni la polimerització d’actina en un lloc determinat.
Els complexos Arp 2 i 3, no només poden polimeritzar actina, sinó que també
s’hi podran unir als filaments d’actina de forma lateral amb un angle de 70
graus. Per tant, formaran una xarxa que permetrà el moviment cel·lular
Profilina
Timosina
Els caps polars (units a ADP) es mouen quan estan units a ADP. Quan es
fosforila i es transforma a ATP, es desenganxa el domini globular apical. Així
successivament, anant sempre cap al extrem +. Per tant, podem dir que el
domini globular desplaça el filament d’actina cap enrere.
Això farà que totes les proteïnes motores es moguin cap al pol + d’actina,
fent que el filament d’actina es desplaçi cap enrere, i d’aquesta manera, els
filaments es mouran cap el centre de la fibra produint la contracció muscular.
Microvil·li
La seva principal funció és donar més superfície a la cèl·lula, fet que permet
donar-li molta capacitat de treball (absorció de la cèl·lula). Això sí, no s’han
de conforndre amb els cilis. Aquets tenen al seu interior tubulina, doncs són
diferents en mida i en el microvil·li no hi ha tubulina. Són estructures més o
menys fixes.
Fibres d’estrès
Feixos d’actina contràctils perquè estan formats per feixos d’actina i també per
miosina que permet que es puguin contraure les fibres de filaments d’actina
entre elles.
Còrtex cel·lular
Hem vist que l’actina pot estar en diferents parts de la cèl·lula (còrtex,
fil·lopodis i lamelipodis). L’actina del còrtex que es troba a tot el voltant de la
membrana plasmàtica s’estén per tota la cèl·lula, cosa que permet la formació
dels lamelipodis que ajudaran al transport de la cèl·lula. Per fer-ho, la cèl·lula
té llocs d’unió a la matriu extracel·lular, de manera que formarà unaprotrusió,
enganxant-se a la matriu en la part del davant i desenganxant-seen la part
del darrere (enganxa i desenganxa → avanç a, doncs es va arrossegant per la
matriu extracel·lular).
Rho A: regula les fibres d’estrès i els contactes focals; regula la tensió
i ancoratge de les cèl·lules en un lloc determinat.
Cdc42: regula la formació de fil·lopodis i protrusions cel·lulars;
permeten a les cèl·lules explorar l’exterior.
Rac1: participa en la formació de la lamel·lipodis pel moviment
cel·lular i també per la formació del plec de membrana (ruffles), perquè
produeixen unes ondulacions a la cèl·lula i permeten que aquesta dugui
a terme processos de Macropinocitosis
Moviment cel·lular
Tenim una cèl·lula que esta adherida amb un substrat gràcies a les adhesions
focals i a les proteïnes transmembrana alfa i beta integrines que contacten
amb el substrat i comuniquen a l’exterior cap a l’interior cel·lular a través del
citoesquelet.
Mobilitat cel·lular
Aquestes toxines han estat bones eines per estudiar la possible participació
de l’actina i els microtúbuls en molts processos cel·lulars.
Els tres tipus de filaments poden unir-se per dur a terme diversos processos
com és la divisió cel·lular.
Molècules d'adhesió
Les cèl·lules interaccionen entre elles i amb la matriu extracel·lular per formar
els teixits. Les unions intercel·lulars són llocs especialitzats de la superfície
cel·lular pels quals les cèl·lules es connecten les unes amb les altres o amb
l'ECM (matriu extracel·lular).
Unions d'oclusió: separen una part del teixit d'una altra. D'aquesta
forma s'evita l'entrada de patògens o substàncies no desitjades.
Unions d’ancoratge
Es donen entre una cèl·lula i cèl·lula veïna o entre una cèl·lula i ECM.
Transmeten l'estrès depenent del citoesquelet, ja que formen una xarxa
transcel·lular de filaments que dona resistència a l'epiteli i impedeix el seu
trencament.
Dues famílies de molècules d'adhesió (proteïnes):
Tanquen els espais entre cèl·lules d'un epiteli per evitar la difusió de molècules
d'un domini a l'altre (apical i basolateral). Impedeixen la difusió de lípids entre
el domini apical i basolateral de la cèl·lula. Les molècules que s'encarreguen
de les unions són la claudina i l’ocludina.
Aquestes, són molt importants als epitelis. Quan una substància vol travessar
un epiteli pot fer-ho:
Als organismes no els interessa que en els seus epitelis puguin atravesar
substàncies sense control. Per això, els epitelis de l’intestí tenen unions
d’oclusió que eviten aquesta via paracel·lular.
Són unions cèl·lula-cèl·lula. Creen canals entre dues cèl·lules adjacents el que
permet només el bescanvi de petites molècules (ions i molècules hidrosolubles).
Poden haver de diversos tipus. S'han d'unir formant un hexàmer que pot ser
homomeric (totes les molècules són iguals) o heteromeric (no totes les
molècules són iguals). 6 connexines formen un connexor.
S'han d'unir dos connexons (un d’una cèl·lula i un altre d’una altra) per formar
un canal per on passin les molècules.
Els canals intercel·lulars poden ser homotípics (totes les molècules són iguals) o
heterotípics (no totes les molècules són iguals).
Tipus de citoesquelet
Filaments Filaments
intermedis d'actina
Cadherines Cadherines
Unions
d'ancoratge
Hemidesmosomes Contactes focals
Integrines Integrines
Unions de
Molècules de comunicació: connexines
comunicació
UNITAT 13: LA MATRIU EXTRACELUL·LUAR
Teixits epitelials:
Compost per cèl·lules molt properes i adherides entre elles que formen llençol
(pot ser d'una capa o de més). Tenen una ECM (matriu extracel·lular) molt
senzilla (làmina basal). El citoesquelet de les cèl·lules genera la resistència a
l'estrès mecànic del teixit.
Múscul
Epitelis
Vasos sanguinis
Conté molta matriu extracel·lular. Les cèl·lules estan disperses dins l'ECM, i
molt adherides a ella. L'ECM genera la resistència a l'estrès mecànic del teixit.
La matriu extracel·lular (ECM):
Funcions:
Funció de turgència:
Com es formen?
És important que el tall es faci fora de la cèl·lula, ja que un cop tallat els
col·làgens es poden agregar entre ells gràcies a la lisil oxidasa (proteïna que
uneix les serines dels col·làgens) i es formen les fibril·les de col·lagen. Si no
es dona fora, la cèl·lula rebentaria.
Malalties:
Síndrome d'Ehlers-Danlos:
Participa en:
Organització de l'ECM
Malalties:
Quan juntem cèl·lules de col·lagen tipus IV fent una xarxa amb molècules
multiadhesives de laminina que s'uneixen unes a les altres amb el glicogen i
s'afegeixen polipèptids de perlecan tenim una xarxa que forma una làmina on
s'adhereixen les cèl·lules epitelials.
Funció de turgència:
La mida del nucli depèn del tipus de cèl·lula de la que parlem. En la majoria
de cèl·lules, el nucli és l’orgànul cel·lular més gran. Normalment té entre 3 i
10 µm de diàmetre tot i que trobem excepcions.
El nuclis, per la seva mida, es troben dins el límit de resolució del microscopi
òptic.
Dreta: incubació amb DAPI (fluorocrom que emet llum blava, actua com si fos
un colorant perquè té afinitat per les estructures acides de la cèl·lula i per
tant, els nuclis)
Esquerra: incubació amb un anticòs que reconeix una proteïna nuclear marcat
amb un fluorocrom que emet llum verda (GFP)
Nombre de nuclis:
Cromatina
Els cromosomes són una molècula lineal de DNA més proteïnes associades
empaquetats en una estructura compacte. És el nivell màxim de condensació
al qual arriba el DNA.
Tenim una molècula lineal de DNA que es comença a condensar (1), s’associa
a proteïnes (2), es va recargolant (condensant) (3) fins assolir el seu màxim
de condensació i podem observar amb el microscopi òptic el cromosoma, això
succeeix durant la mitosi (4).
El genoma és el conjunt total de molècules de DNA d’un organisme. El
genoma humà està format per un total de 46 cromosomes, cadascun d’aquest
conté una molècula lineal de DNA més proteïnes associades.
o Cromosoma X
o Cromosoma Y
Els gens són segments de DNA que contenen les instruccions per sintetitzar
les proteïnes i RNAs que conformen un organisme, així com quan, en quin
tipus de cèl·lula, en quina quantitat i quan s’han de sintetitzar aquestes
molècules.
Només el 20% del nostre DNA conté gens, és a dir, només el 20%
codifica per algun tipus de molècula.
El 80% restant, no són gens, gens coneguts.
Van sorgir diverses teories: es va contemplar que podia ser DNA escombraria
(“junk DNA”) la funció del qual seria protegir el 20% de DNA que li porta la
informació per la síntesi de molècules. També es va considerar que podria ser
que aquest 80% regulés els gens.
Arrel d’aquest descobriment, es va generar un nou projecte, l’anomenat
projecte encode (2003 - 2012) l’objectiu del qual era trobar elements
funcionals en el genoma a partir de la seqüenciació que haviem obtingut en
el projecte anterior.
Estructures nuclears:
Coberta nuclear
Hi trobem:
Anell central
Anell nuclear
Anell citoplasmàtic de proteïnes situades a la part en contacte amb el
citoplasma.
Fibres del por: per la cara interna del nucli adpten una estructura que
recorda a una cistella, en canvi, per la zona citosòlica aquesta
estructura no s’observa.
Columnes
La coberta nuclear és selectiva, només deixa passar molècules petites apolars.
Els altres tipus de molècules han de travessar la coberta nuclear a través dels
pors nuclears.
En canvi, les proteïnes grans i RNAs travessen els porus però necessiten energia
per fer-ho, per això aquest tipus de transport s’anomena transport actiu.
Matriu nuclear
A partir de cèl·lules s’han aïllat els nuclis que s’han tractat amb DNAasses i
RNAasses per trencar el DNA i el RNA, s’ha centrifugat i s’ha obtingut un pelet
el qual s’ha tractat amb sals amb concentració elevada de clorur sòdic 2M. S’ha
tornat a centrifugar, llençat el sobrenedant i el pelet obtingut s’ha processat
per la seva observació amb el MET.
En la fotografia observem uns filament però després d’un tractament tan llarg,
aquests podrien ser artefactes.
Orgànuls nuclears
La cromatina en blau
Els nucleols en vermell
Els cossos de cajal en rosa
Els speckles en verd
La part negra és tot el citoplasma
UNITAT 15: EL NUCLÈOL I LA SÍNTESI DE RIBOSOMES
Els nuclèols es van descriure per primera vegada l’any 1781. Com era un
orgànul tan gran es va observar amb el microscopi òptic. No va ser fins el
S.XX quan es va començar a saber de les seves funcions ja que el nuclèol es
troba dins del nucli i és difícil de purificar-lo sense malmetre l'estructura i la
funcionalitat.
Característiques
Gènesi de ribosomes:
Els ribosomes son les màquines moleculars per a la síntesi de proteïnes, son
els orgànuls del citoplasma que tradueixen en la informació que van llegint
del RNA missatger que surt del nucli.
Estan formats per 2 subunitats, una gran i una petita, cadascuna d’aquestes
està formada per RNA i proteïnes. Aquestes subunitats es generen al nuclèol
i surten separades del nucli i s’ensamblen en el citoplasma.
Cèl·lules amb tassa molt elevada de síntesi proteica:
Els nuclèols també estan molt relacionats amb les malalties, hi ha moltes
malalties que tenen com a causa mancances en alguna de les funcionalitats
del nuclèol. Un exemple és el càncer.
Les cèl·lules cancerígenes tenen els nuclèols més grans perquè proliferen molt
activament i necessiten sintetitzar molta proteïna. Això vol dir que necessiten
molts ribosomes i per tant, uns nuclèols molt grans capaços de generar les
subunitats ribosòmiques. Per això, la mida dels nuclèols s’utilitza com a medi
de diagnòstic pel càncer a les unitats de patologia.
Procés:
A continuació, té lloc la maduració dels preRNA ribosòmics per donar lloc als
RNA ribosòmics madurs que formaran els ribosomes. Aquestes molècules
donen lloc a les 2 subunitats ribosòmiques (la gran i la petita), que surten del
nuclèol i del nucli per separat via porus nuclears i s’ensamplen en el
citoplasma per formar un ribosoma madur.