STRUKTUR VISUALISASI

Krispinus Terano Mingge, 23921, STIPP B

ABSTRAK
Pada praktikum ini dilakukan percobaan pada senyawa metana, D-
Gliserida, L-Gliserida, glukosa terbuka, glukosa tertutup, gliserol, asam butirat,
asam oleat (cis dan trans), dan laktosa. Gliserida adalah lemak sederhana dalam
bentuk senyawa ester. Ia terbentuk dari reaksi kimia antara gliserol dan asam
lemak. Pada pembentukan struktur molekul ini, dilakukan pembentukan D-
gliserida dan L-gliserida. Dengan dilakukannya percobaan pembuatan senyawa,
kita menjadi tau bagaimana bentuk senyawa-senyawa penyusun biomolekul.
Tujuan dari praktikum ini yaitu untuk mempelajari molekul senyawa penyusun
biomolekul. Biomolekul adalah senyawa-senyawa organik sederhana pembentuk
organisme hidup dan bersifat khas sebagai produk aktivitas biologis. Struktur atau
kerangka yang secara kristalografis molekular tersusun atas atom-atom atau unsur
yang dalam biokimia adalah C, H, O, N, S, dan P. Unsur-unsur tersebut ikat
mengikat melalui sepasang elektron. Pasangan tersebut dalam cara
penggambarannya diwujudkan dalam bentuk garis. Salah satu cara untuk me-
visualisasikan struktur adalah dengan menggunakan model kristalografik (ball-
stick, space-filling). Alat yang digunakan pada percobaan ini adalah molymod dan
spidol.
Kata kunci : biomolekul, molekul, senyawa, struktur, unsur.

PENDAHULUAN
Makromolekul-makromolekul pada sel hidup dapat bergabung dengan
makromolekul lain membentuk kompleks supramolekul seperti membran, dinding
sel, kromosom, dan virus. Deretan reaksi pada pembentukan atau degradasi
molekul komponen sel hidup tersebut dikenal dengan metabolisme. Setiap reaksi
pada sederetan reaksi metabolisme dikatalisis oleh enzim. Dengan demikian,
deretan reaksi pada metabolisme berlangsung cepat. Walaupun reaksi berlangsung
cepat, deretan reaksi tersebut diregulasi agar kadar metabolit di dalam sel tetap
(Azhar, 2016 ).
Atom karbon membentuk empat ikatan kovalen Atom karbon (C)
merupakan pemeran utama dalam mempelajari hidrokarbon. Atom C ini memiliki
karakteristik yang khas dibanding atom lainnya. Karakteristik itu adalah
kemampuannya membentuk rantai C yang Panjang. Atom karbon membentuk
ikatan jenuh maupun tak jenuh Atom karbon dapat berikatan dengan atom karbon
lain membentuk rantai karbon dengan iktan tunggal, ikatan rangkap dua atau
ikatan rangkap tiga Atom karbon membentuk rantai terbuka maupun tertutup
Atom C dapat berikatan dengan atom C lain (sejenis), bahkan dapat membentuk
rantai atom atom C baik alifatik (terbuka: lurus dan bercabang) maupun siklik
(tertutup) (Mandera, 2020).
Ikatan hidrogen adalah ikatan yang terjadi antara atom hidrogen (H)
pada molekul yang satu dengan salah satu unsur atom (F, O, N) pada
molekul lainnya,yang merupakan gaya dipol-dipol paling kuat. (Faqiha, 2022).
Asam lemak tidak jenuh pada lemak atau minyak berada dalam dua bentuk isomer
yakni isomer cis dan trans. Asam lemak tidak jenuh biasanya berada dalam bentuk
cis, hanya sedikit yang berada dalam bentuk trans. Asam lemak trans dihasilkan
dari proses hidrogenasi parsial dari minyak tumbuhan dan minyak ikan. Jumlah
yang sedikit juga ditemukan juga pada lemak hewan ruminansia, sebagai hasil
biohidrogenasi asam lemak tidak jenuh ganda dari enzim mikroba pada lambung
ruminansia. Pada minyak goreng asam lemak tidak jenuh yang berkonfigurasi cis
dapat berisomer menjadi bentuk trans akibat proses ekstraksi, oksidasi, proses
pemanasan dan proses hidrogenasi parsial (Kapitan, 2013).

Glukosa merupakan senyawa yang dapat menjadi sumber ATP secara

aerobik maupun anaerobik. Secara Anaerobik glukosa dipecah tanpa
menggunakan oksigen yang disebut glikolisis anaerobik sistem asam laktat.
Secara Aerobik glukosa melalui serangkain reaksi kimia untuk menghasilkan ATP
yang disebut dengan glikolisis arobik. Glikolisis aerobik merupakan pembentukan
energi dengan menggunakan glukosa dan oksigen sebagai bahan penghasil energi.
Glikolisis aerobik menyediakan energi jauh lebih besar bila dibandingkan dengan
sistem gliklolisi anerobik. Glukosa merupakan hasil konversi dari semua jenis
karbohidrat yang dikonsumsi ( Lesmana, 2018).

Terdapat dua jenis isomer, yaitu isomer struktural dan stereoisomer.

Isomer structural adalah isomer dengan perbedaan terletak pada urutan
penggabungan atom-atom yang menyusun molekul, Jika senyawa-senyawa
dengan rumus molekul yang sama itu memiliki urutan atom yang berlainan, maka
mereka mempunyai stuktur (bangun) yang berlainan dan disebut isomer struktural
satu terhadap yang lain. Isomer struktural terjadi ketika dua atau lebih senyawa
organik memiliki rumus molekul sama, tetapi struktur yang berbeda. Perbedaan-
perbedaan ini cenderung memberikan molekul kimia dan sifat fisik yang berbeda.
Sedangkan stereoisomer adalah isomer dengan perbedaan terletak pada cara
penataan atom-atom dalam ruang, tetapi urutan penggabungan atom-atomnya
tidak berbeda (Suryelita, 2015).

Karbohidrat yang penting dalam ilmu gizi dibagi menjadi dua golongan
yaitu karbohidrat sederhana dan karbohidrat kompleks. Karbohidrat sederhana
terdiri atas monosakarida yang merupakan molekul dasar dari karbohidrat,
disakarida yang terbentuk dari dua monosa yang dapat saling terikat, dan
oligosakarida yaitu gula rantai pendek yang dibentuk olh galaktosa, glukosa dan
fruktosa. Karbohidrat kompleks terdiri atas polisakarida yang terdiri atas lebih
dari dua ikatan monosakarida dan serat yang dinamakan juga polisakarida nonpati
(Siregar, 2019). Karbohidrat dalam makanan dapat dikelompokkan menjadi
dua golongan, yaitu karbohidrat sederhana dan kompleks. Karbohidrat kompleks
terdiri dari atas dua ikatan monosakarida yang disebut polisakarida.
Karbohidrat sederhana hanya terdiri dari satu atau dua ikatan molekul sakarida
yaitu monosakarida dan disakarida, contohnya adalah sukrosa (gula tebu) dan
laktosa (gula susu) ( Firdiansyah, 2020 ).

Monosakarida (gula sederhana) Monosakarida adalah karbohidrat paling

sederhana yang merupakan molekul terkecil karbohidrat. Dalam tubuh
monosakarida langsung diserap oleh dinding-dinding usus halus dan masuk ke
dalam peredaran darah. Monosakarida dikelompokkan menjadi 3 golongan :
Glukosa, disebut juga dekstrosa yang terdapat dalam buahbuahan dan sayur-
sayuran. Semua jenis karbohidrat akhirnya akan diubah menjadi glukosa. b)
Fruktosa disebut juga levulosa, zat ini bersama-sama glukosa terdapat dalam
buah-buahan dan sayuran, terutama dalam madu, yang menyebabkan rasa manis.
c) Galaktosa, berasal dari pemecahan disakarida (Nurul, 2019).

Suatu disakarida adalah suatu karbohidrat yang tersusun dari dua

satuan mnosakarida yang dipersatukan oleh suatu hubungan glikosida dari
karbon 1 dari satu satuan ke suatu OH satuan lain. Suatu cara ikatan yang
lazim ialah suatu hubungan glikosida α atau β dari satuan pertama ke gugus 4-
hidroksil dari satuan kedua. Hubungan ini disebut suatu ikatan 1,4’α atau 1,4’-β,
tergantung pada stereokimia pada karbon glikosida.Seperti halnya monosakarida,
senyawa ni larut dalam air, sedikit larut dalam alcohol, dan praktis tidak
larut dalam eter dan pelarut oerganik non-olar. Contoh dari disakarida adalah
maltose, sukrosa, dan laktosa (Fitri, 2020).
BAHAN DAN METODE
ALAT DAN BAHAN
Menyiapkan satu set alat peraga unsur unsur senyawa seperti ball stick
dengan atom carbon berwarna hitam, atom hidrogen berwarna orange dan atom
oksigen berwarna biru muda. Space filling dengan atom carbon brwarna hitam,
atom hidrogen berwarna putih dan atom oksigen berwarna merah serta spidol.

METODE
Langkah kerja pada praktikum kali ini bisa dikatakan tidak begitu sulit.
Karena pada dasar nya kita hanya seperti menyusun puzzle namun juga harus
teliti. Berikut langkah kerja: Menyiapkan alat dan bahan yang sudah
disediakan. Membuat senyawa yang sudah ditentukan dengan menggunakan
alat peraga unsur-unsur senyawa berbentuk bola, pipih, batang silinder, dan
spidol. Adapun senyawa tersebut yaitu, Metana (CH4), D-Gliserida (C3H6O3 ),
L-Gliserida (C3H6O3), Glukosa terbuka (C6H12O6 ), Glukosa tertutup (C6H12O6),
Gliserol (C3H5(0H)3), Asam Butirat (C3H7COOH), Asam Oleat
(CH3(CH2)7CH=CH(CH2)7COOH) (DIBUAT CIS DAN TRANS), Laktosa
(C12H22O11) dan Mendokumentasikan hasil praktikum tersebut setelah itu
masukkan pada pembahasan dan dalam bentuk tabel.

HASIL DAN PEMBAHASAN

Tabel 1. Hasil Pengamatan
No Nama Gambar

1 Metana (CH4)
2 D-gliserida (C3H6O3)

3 L-gliserida (C3H6O3)

4 Glukosa terbuka (C6H12O6)

5 Glukosa tertutup (C6H12O6)

6 Gliserol (C3H5(OH)3)
 7 Asam Butirat (C3H7COOH)

8 Asam Oleat Cis

(CH3(CH2)7CH=CH(CH2)7COOH)

9 Asam Oleat Trans

(CH3(CH2)7CH=CH(CH2)7COOH)

10 Laktosa (C12H22O11)

Pada acara satu ini yaitu struktur visualisasi yang bertujuan untuk
mempelajari struktur molekul senyawa penyusun biomolekul, yang mana alat dan
bahan yang digunakan adalah alat peraga ball stick, space filling dan spidol.
Praktikum kali ini kita ditunjuk untuk membuat senyawa yang sudah ditentukan
menggunakan ball stick dan space filing, yang mana space filing adalah model
molekul tiga dimensi atom berbentuk bola dan dihubungkan dengan batang yang
mewakili ikatannya sedangkan space filling adalah molekul tiga dimensi dimana
atom diwakili oleh bola yang jari jarinya sebanding dengan jari jari atom dan jarak
pusat kepusatnya. Keterangan atom karbon adalah berwarna hitam, atom hidrogen
adalah berwarna orange dan atom oksigen adalah berwarna biru muda.
Pada soal pertama kita mengerjakan senyawa metana CH4, yang mana kita
membutuhkan satu atom carbon berwarna hitam yang mengikat atom hidogen
sebanyak empat atom dengan warna orange. Kedua kita mengerjakan senyawa D-
Gliserida C3H6O3 yang mana kita membutuhkan atom carbon sebanyak tiga
dengan warna hitam, hidrokarbon sebanyak enam atom dengan warna orange dan
oksigen sebanyak tiga atom dengan warna birumuda dengan atom oksigen sebeleh
kanan rangkap dua. Ketiga kita mengerjakan senyawa L-Gliserida C 3H6O3 sama
halnya dengan D-Gliserida tetapi rangkap dua oksigen disebelah kiri. Jadi
perbedaan diantara kedua senyawa tersebut adalah terletak pada letak rangkap
duanya. Keempat kita mengerjakan Glukosa terbuka C3H12O6 yang mana kita
membutuhkan 3 atom karbon dengan warna hitam, 12 atom hidrogen dengan
warna orange dan 6 atom oksigen dengan warna birumuda. Kelima kita
mengerjakan Glukosa tertutup C3H12O6 sama halnya dengan glukosa terbuka kita
membutuhkan atom karbon sebanyak tiga atom karbon dengan warna hitam, 12
atom hidrogen dengan warna orange dan 6 atom oksigen dengan warna birumuda
namun bedanya adalah glukosa berbentuk siklik atau cincin. Jadi perbedaan antara
glukosa terbuka dan tertutup adalah glukosa terbuka sama halnya dengan senyawa
biasnya sedangkan senyawa glukosa tertutup berbentuk siklik atau cincin sehingga
tidak ada atom yang tidak terikat, semuanya terikat satu sama lain hingga
membentuk cincin atau mendekati bulat.
Pada soal keenam kita mengerjakan gliserol (C3H5(OH)3) yang mana kita
membutuhkan tiga atom karbon dengan warna hitam, atom hidrogen sebanyak
lima dan atom hidrogen mengikat oksigen sebanyak tiga atom dengan warna
orange dengan birumuda. Ketujuh kita mengerjakan soal asam butirat
C3H7COOH yang mana kita membutuhkan atom karbon sebanyak tiga atom
dengan warna hitam, atom hidrogen sebanyak enam dengan warna orange dan
atom carbon mengikat rangkap dua atom oksigen dengan warna hitam birimuda
dan oksigen mengikat atom hidrogen dengan warna birumuda dan orange.
Kedelapan kita mengerjakan asam Oleat (CH3(CH2)7CH)= (CH3(CH2)7COOH)
yang mana kita membutuhkan sembilan atom karbon dengan warna hitam,
enambelas atom hidrogen dengan warna putihdan dua atom oksigen dengan warna
birumuda diikatkan dengan dua rangkap yang membutuhkan sembilan atom
karbon dengan warna hitam, enambelas atom hidrogen dengan warna putih dan
paling akhir mengikat atom oksigen dan hidrogen dengan warna merah putih
mengikat atom carbon dengen oksigen dengan warna hitam dan merah ini
merupakan senyawa asam oleat CIS yang mana antara atom carbon mengikat
atom hidrogen dihubungkan dengan rangkap dua dan atom oksigen mengikat
hidrogen yang kedua atom tersebut saling bersebelahan. Kesembilan kita
mengerjakan asam oleat (CH3(CH2)7CH)= (CH3(CH2)7COOH) yang mana kita
membutuhkan sembilan atom carbon dengan warna hitam, enambelas atom
hidrogen dengan warna putihdan dua atom oksigen dengan warna birumuda
diikatkan dengan dua rangkap yang membutuhkan sembilan atom karbon dengan
warna hitam, enambelas atom hidrogen dengan warna putih dan paling akhir
mengikat atom oksigen dan hidrogen dengan warna merah putih mengikat atom
carbon dengen oksigen dengan warna hitam dan merah ini merupakan senyawa
asam oleat TRANS yang mana antara atom carbon mengikat atom hidrogen
dihubungkan dengan rangkap dua dan atom oksigen mengikat hidrogen yang
kedua atom tersebut saling berseberangan. Jadi bedanya cis dan trans terletak pada
posisi bersebalan dan bersebrangan. Kesepuluh kita mengerjakan senyawa laktosa
C12H22O11 yang mana kita membutuhkan duabelas atom carbon dengan warna
hitam, duapuluhdua atom hidrogen dengan warna putih dan sebelas atom oksigen
dengan warna merah.
KESIMPULAN
Dari hasil percobaan yang telah dilakukan dapat disimpulkan bahwa
biokimia merupakan ilmu yang mempelajari struktur dan fungsi komponen
selular, seperti protein, karbohidrat, lipid, asam nukleat, dan biomolekul lainnya.
Pada saat melakukan percobaan, atom-atom adalah bola bola kecil dimana atom
C, dilambangkan pada bola bewarna Hitam, atom O dengan bola berwarna biru
muda dan merah , atom H dengan bola bewarna putih dan orange serta
penyambung panjang menandakan ikatan rangkap 2 dan untuk penyambung yang
pendek menandakan ikatan rangkap 1. Pada praktikum ini dilakukan percobaan
pembuatan pada senyawa metana, D-Gliserida, L-Gliserida, glukosa terbuka,
glukosa tertutup, gliserol, asam butirat, asam oleat (cis dan trans), dan laktosa.
Dengan dilakukannya percobaan pembuatan senyawa, kita menjadi tau bagaimana
bentuk senyawa-senyawa penyusun biomolekul dengan bantuan molymod dengan
jenis ball stick dan space filling dan spidol.
 DAFTAR PUSTAKA

Azhar, M. (2016). Biomolekul sel: karbohidrat, Protein, dan Enzim. Buku

Panduan
belajar Biokimia SMA
Faqiha, A. F., Indrawijaya, Y. Y. A., Suryadinata, A., Amiruddin, M., & Mutiah,
R. (2022). Potensi Senyawa Nitazoxanide dan Arbidol sebagai Antivirus
SARS-CoV-2 terhadap Reseptor NSP5 (7BQY dan2GZ7) dan ACE2 (3D0G
dan 1R4L). Journal of Food and Pharmaceutical Sciences, 10(1), 570-583.
Firdiansyah, R. D., Habibah, S. S., & Utami, N. K. (2020). Literatur Review :
Pengaruh Mengkomsumsi Karbohidrat Sederhana ( Biskuit Kelapa) dan
Karbohidrat Kompleks (Pisang Ayam) terhadap pH Saliva. Jurnal Terapis
Gigi dan Mulut, 1(2), 57-61.
Fitri, A. S., & Fitriana, Y. A. N. (2020). Analisis Senyawa Kimia pada
Karbohidrat.
Sainteks, 17(1), 45-52.
Kapitan, O. B. (2013). Analisis Kandungan Asam Lemak Trans (Trans Fat)
Dalam
Minyak Bekas Penggorengan Jajanan Di Pinggir Jalan Kota Kupang. Jurnal
Kimiaterapan, 1(1), 17-31.
Lesmana, H. S., & Broto, E. P. (2018). Profil Glukosa Darah Sebelum, Setelah
Latihan Fisik Submaksimal dan Selelah Fase Pemulihan Pada Mahasiswa
FIK UNP. Jurnal Media Ilmu Keolahragaan Indonesia, 8(2), 44-48.
Mendera, I. G. (2020). Pembelajaran Kimia SMA Kelas XI : Senyawa
Hidrokarbon. Buku Panduan Belajar Kimia XI
Nurul, I. A. L., Weni, K., & Nur, H. (2019). Asupan Karbohidrat, Asupan Lemak,
Aktivitas Fisik dan Kejadian Obesitas pada Remaja di Kota
Yogyakarta (Doctoral dissertation) Jurnal Poltekkes Kemenkes
Yogyakarta).
Siregar, N. S. (2014). Karbohidrat. Jurnal Ilmu Keolahragaan, 13(02), 38-44.
Suryelita, S. (2015). Bahan Ajar Kimia Organik 3. Buku panduan belajar Kimia
 Yogyakarta, 25 Mei 2023.
Mengetahui,
Co. Ass Praktikan

(Muhamad Pahmi Pradana) (Krispinus Terano Mingge)

LAMPIRAN
DIAGRAM ALIR

Disiapkan alatnya yaitu molymod jenis ball stick dan space filling

Dimulai dengan senyawa metana (CH4) 1 molekul berwarna hitam dan 4

molekul berwarna putih. Gabungkan 4 molekul berwarna putih ke molekul
berwarna hitam dengan menggunakan batang penyambung atau ikatan
tunggal

Dilakukan pengerjaan D-Gliserida (C3H6O3) siapkan 3 molekul berwarna

hitam, 6 molekul berwarna putih, 3 molekul berwarna merah, dan 12 batang
penyambung

Dilakukan pengerjaan Glukosa Terbuka (C6H12O6) Siapkan 6 molekul

berwarna hitam, 12 molekul berwarna putih, 6 molekul berwarna merah, dan
24 batang penyambung

Dilakukan pengerjaan Glukosa Terbuka (C6H12O6) Siapkan 6 molekul

berwarna hitam, 12 molekul berwarna putih, 6 molekul berwarna merah, dan
24 batang penyambung namun bedanya adalah glukosa tertutup berbentuk
siklik.
 Dilakukan pengerjaan Gliserol (C3H5(OH)3) siapkan 3 molekul
berwarna hitam, 8 molekul berwarna putih, 3 molekul berwarna merah, dan
13 batang penyambung

Dilakukan pengerjaan Asam Butirat (C3H7COOH) Siapkan molekul 4

berwarna hitam, 8 molekul berwarna putih, 2 molekul berwarna merah, dan 11
Dokumentasi Kegiatan
batang penyambung.
Gambar Keterangan
Metana adalah hidrokarbon paling sederhana yang
berbentuk gas dengan rumus kimia CH4 dengan atom
carbon berjumblah 1 dan memiliki 4 tangan hidrokarbon
berjumblah 4

D-Gliserida (C3H6O3 ) adalah gliserolyang dua gugus

hidroksilnya telah terasilasi sementara satu gugus sisanya
tetap mempunyai hidroksil atau gugus alkil. Dengan
senyawa 3 atom c dan mengikat 6 hidrokarbon dan
3oksigen
L-Gliserida (C3H6O3) adalah lemak sederhana dalam
bentuk senyawa ester. Ia terbentuk dari reaksi kimia antara
gliserol dan asam lemak. Dengan senyawa 3 atom c dan
mengikat 6 hidrokarbon dan 3 oksigen

Glukosa terbuka (C6H12O6) adalah rantai Carbon yang

terbuka memiliki 6 atom Carbon dan 12 atom Hidrogen
ditambah 6 senyawa Oksigen

Glukosa tertutup (C6H12O6) adalah rantai Carbon yang

tertutup (siklik) memiliki 6 atom Carbon dan 12 atom
Hidrogen ditambah 6 senyawa Oksigen
 Gliserol (C3H5(0H)3) Adalah senyawa dengan 3 atom
Carbon, 8 atom Hidrogen dan 3 atom Oksigen

Asam Butirat (C3H7COOH) adalah senyawa dengan 4

atom carbon,atom Hidrogen dan mengikat COOH(asam
Asam Alkanoat)

Asam Oleat (CH3(CH2)7CH = CH(CH2) 7COOH)

(DIBUAT CIS) dengan rantai atom Carbon sejumblah 18
diikat oleh atom Carbon Hidrogen sebanyak 33, dan
senyawa COOH( Asam Alkanoat) dan salah satu atom
carbon Hidrogen dibawah yang menandakan bahwa
senyawa tersebut adalah cis

Asam Oleat (CH3(CH2)7CH = CH(CH2) 7COOH)

(DIBUAT TRANS) dengan rantai atom Carbon sejumblah
18 diikat oleh atom Carbon Hidrogen sebanyak 33, dan
senyawa COOH(Asam Alkanoat) dan salah satu atom
carbon Hidrogen diatas yang menandakan bahwa senyawa
tersebut adalah Trans

Laktosa (C12H22011) adalah bentuk disakarida dari

karbohidrat yang dapat dipecah menjadi bentuk lebih
sederhana yaitu galaktosa dan glukosa. Laktosa ada di
dalam kandungan susu, dan merupakan 2-8 persen bobot
susu keseluruhan. Mempunyai rumus kimia 12 Atom
Carbon, 22 atom Hidrogen dan 11 atom oksigen yang
saling berikatan