UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE BUCARAMANGA

TALLER BIOINFORMÁTICA II

INTEGRANTES

ANGIE PEÑARANDA
JAHIR CASTRO

LAB. BIOQUIMICA
PARTE I

Dada la secuencia codificante de nucleótidos:

ATGGTGGTCATGGCGCCCCGAACCCTCTTCCTGCTGCTCTCGGGGGCCCTG
ACCCTGACCGAGACCTGGGCGGGCTCCCACTCCATGAGGTATTTCAGCGCC
GCCGTGTCCCGGCCCGGCCGCGGGGAGCCCCGCTTCATCGCCATGGGCTA
CGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGCGACTCGGCGTGTCCGAG
GATGGAGCCGCGGGCGCCGTGGGTGGAGCAGGAGGGGCCGGAGTATTGGG
AAGAGGAGACACGGAACACCAAGGCCCACGCACAGACTGACAGAATGAACCT
GCAGACCCTGCGCGGCTACTACAACCAGAGCGAGGCCAGTTCTCACACCCTC
CAGTGGATGATTGGCTGCGACCTGGGGTCCGACGGACGCCTCCTCCGCGGG
TATGAACAGTATGCCTACGATGGCAAGGATTACCTCGCCCTGAACGAGGACC
TGCGCTCCTGGACCGCAGCGGACACTGCGGCTCAGATCTCCAAGCGCAAGT
GTGAGGCGGCCAATGTGGCTGAACAAAGGAGAGCCTACCTGGAGGGCACGT
GCGTGGAGTGGCTCCACAGATACCTGGAGAACGGGAAGGAGATGCTGCAGC
GCGCGGACCCCCCCAAGACACACGTGACCCACCACCCTGTCTTTGACTATGA
GGCCACCCTGAGGTGCTGGGCCCTGGGCTTCTACCCTGCGGAGATCATACT
GACCTGGCAGCGGGATGGGGAGGACCAGACCCAGGACGTGGAGCTCGTGG
AGACCAGGCCTGCAGGGGATGGAACCTTCCAGAAGTGGGCAGCTGTGGTGG
TGCCTTCTGGAGAGGAGCAGAGATACACGTGCCATGTGCAGCATGAGGGGC
TGCCGGAGCCCCTCATGCTGAGATGGAAGCAGTCTTCCCTGCCCACCATCCC
CATCATGGGTATCGTTGCTGGCCTGGTTGTCCTTGCAGCTGTAGTCACTGGA
GCTGCGGTCGCTGCTGTGCTGTGGAGAAAGAAGAGCTCAGATTGAAAAGGAG
GGAGCTACTCTCAGGCTGCAATGTGAAACAGCTGCCCTGTGTGGGACTGAGT
GGCAAGTATTTGTTCATGCCTTCCCTTTGTGACTTCAAGAACCCTGACTTCTCT
TTGTGCAGAGACCAGCC

Su posterior transcripción:
AUGGUGGUCAUGGCGCCCCGAACCCUCUUCCUGCUGCUCUCGGGGGCCCU
GACCCUGACCGAGACCUGGGCGGGCUCCCACUCCAUGAGGUAUUUCAGCG
CCGCCGUGUCCCGGCCCGGCCGCGGGGAGCCCCGCUUCAUCGCCAUGGG
CUACGUGGACGACACGCAGUUCGUGCGGUUCGACAGCGACUCGGCGUGUC
CGAGGAUGGAGCCGCGGGCGCCGUGGGUGGAGCAGGAGGGGCCGGAGUA
UUGGGAAGAGGAGACACGGAACACCAAGGCCCACGCACAGACUGACAGAAU
GAACCUGCAGACCCUGCGCGGCUACUACAACCAGAGCGAGGCCAGUUCUC
ACACCCUCCAGUGGAUGAUUGGCUGCGACCUGGGGUCCGACGGACGCCUC
CUCCGCGGGUAUGAACAGUAUGCCUACGAUGGCAAGGAUUACCUCGCCCU
GAACGAGGACCUGCGCUCCUGGACCGCAGCGGACACUGCGGCUCAGAUCU
CCAAGCGCAAGUGUGAGGCGGCCAAUGUGGCUGAACAAAGGAGAGCCUAC
CUGGAGGGCACGUGCGUGGAGUGGCUCCACAGAUACCUGGAGAACGGGAA
GGAGAUGCUGCAGCGCGCGGACCCCCCCAAGACACACGUGACCCACCACC
CUGUCUUUGACUAUGAGGCCACCCUGAGGUGCUGGGCCCUGGGCUUCUAC
CCUGCGGAGAUCAUACUGACCUGGCAGCGGGAUGGGGAGGACCAGACCCA
GGACGUGGAGCUCGUGGAGACCAGGCCUGCAGGGGAUGGAACCUUCCAGA
AGUGGGCAGCUGUGGUGGUGCCUUCUGGAGAGGAGCAGAGAUACACGUGC
CAUGUGCAGCAUGAGGGGCUGCCGGAGCCCCUCAUGCUGAGAUGGAAGCA
GUCUUCCCUGCCCACCAUCCCCAUCAUGGGUAUCGUUGCUGGCCUGGUUG
UCCUUGCAGCUGUAGUCACUGGAGCUGCGGUCGCUGCUGUGCUGUGGAGA
AAGAAGAGCUCAGAUUGAAAAGGAGGGAGCUACUCUCAGGCUGCAAUGUGA
AACAGCUGCCCUGUGUGGGACUGAGUGGCAAGUAUUUGUUCAUGCCUUCC
CUUUGUGACUUCAAGAACCCUGACUUCUCUUUGUGCAGAGACCAGCC

Y finalmente la traducción obtenida:

MVVMAPRTLFLLLSGALTLTETWAGSHSMRYFSAAVSRPGRGEPRFIAMGYVDD
TQFVRFDSDSACPRMEPRAPWVEQEGPEYWEEETRNTKAHAQTDRMNLQTLR
GYYNQSEASSHTLQWMIGCDLGSDGRLLRGYEQYAYDGKDYLALNEDLRSWTA
ADTAAQISKRKCEAANVAEQRRAYLEGTCVEWLHRYLENGKEMLQRADPPKTHV
THHPVFDYEATLRCWALGFYPAEIILTWQRDGEDQTQDVELVETRPAGDGTFQK
WAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPEPLMLRWKQSSLPTIPIMGIVAGLVVLAAVV
TGAAVAAVLWRKKSSD.KGGSYSQAAM.NSCPVWD.VASICSCLPFVTSRTLTSLC
AETS (1)

Se obtuvieron los siguientes resultados en la plataforma de Blastp:

 Ilustración 1 Resultados obtenidos de la secuencia proteica.
National Library of Medicine. Blast.ncbi. [Online]. [cited 2020 septiembre 20. Available from:
https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi#alnHdr_NP_001350496 (2)

En la anterior imagen se puede observar siete resultados con 100% de similitud con
la secuencia consultada. Seis de ellos son isoformas de la proteína “HLA class I
histocompatibility antigen, alpha chain G” también llamada “HLA G antigen” o “MHC
class I antigen G” presente en el organismo Homo sapiens (Human).

Ilustración 2 Representación esquemática del CMH de clase I.

Ishaq HM, Mohammad IS, Shahzad MW, Xu J. Molecular Alteration Analysis of Human Gut Microbial Composition in
Graves' disease Patients. International journal of biological sciences. 2018 septiembre. (3)
La HLA G antigen se encuentra en prácticamente en todas las células nucleadas
del organismo, su función consiste en la presentación de antígenos extraños al
sistema inmunológico, es decir, presentar fragmentos de proteínas producidas en el
interior de las células, a los linfocitos T citotóxicos, las células sanas son toleradas,
pero las células que presentan fragmentos de proteínas que resultan extrañas para
el organismo son atacadas por el sistema inmune. (4)
Es de gran importancia en la tolerancia materna del feto al mediar la protección
contra los efectos nocivos de las células asesinas naturales, los linfocitos T
citotóxicos, los macrófagos y las células mononucleares. (5)

Ilustración 3 Vía por la cual los antígenos intracelulares son procesados y presentados por moléculas
de HLA clase I. Cruz-Tapias P, Castiblanco J, Anaya. JM. Autoimmunity: From Bench to Bedside
[Internet]. Digital ed. Bogotá: El Rosario University Press; 2013.

Las proteínas del citosol son degradadas por la proteasoma para producir pequeños
péptidos que son transportados por la proteína TAP al lumen del RE. Las moléculas
de HLA de clase I se sintetizan en los ribosomas y se trasladan al lumen del RE
donde se ensamblan y se unen al péptido. Los complejos de HLA de clase I y los
péptidos abandonan el ER y se mueven a través del aparato de Golgi hasta la
membrana plasmática, donde son reconocidos por las células T CD8. (6)
PARTE II

Dada la secuencia codificante de nucleótidos:

ATGTTCTCTCCCTGGAAGATATCAATGTTTCTGTCTGTTCGTGAGGACTCCGT
GCCCACCACGGCCTCTTTCAGCGCCGACATGCTCAATGTCACCTTGCAAGGG
CCCACTCTTAACGGGACCTTTGCCCAGAGCAAATGCCCCCAAGTGGAGTGGC
TGGGCTGGCTCAACACCATCCAGCCCCCCTTCCTCTGGGTGCTGTTCGTGCT
GGCCACCCTAGAGAACATCTTTGTCCTCAGCGTCTTCTGCCTGCACAAGAGC
AGCTGCACGGTGGCAGAGATCTACCTGGGGAACCTGGCCGCAGCAGACCTG
ATCCTGGCCTGCGGGCTGCCCTTCTGGGCCATCACCATCTCCAACAACTTCG
ACTGGCTCTTTGGGGAGACGCTCTGCCGCGTGGTGAATGCCATTATCTCCAT
GAACCTGTACAGCAGCATCTGTTTCCTGATGCTGGTGAGCATCGACCGCTAC
CTGGCCCTGGTGAAAACCATGTCCATGGGCCGGATGCGCGGCGTGCGCTGG
GCCAAGCTCTACAGCTTGGTGATCTGGGGGTGTACGCTGCTCCTGAGCTCAC
CCATGCTGGTGTTCCGGACCATGAAGGAGTACAGCGATGAGGGCCACAACGT
CACCGCTTGTGTCATCAGCTACCCATCCCTCATCTGGGAAGTGTTCACCAACA
TGCTCCTGAATGTCGTGGGCTTCCTGCTGCCCCTGAGTGTCATCACCTTCTG
CACGATGCAGATCATGCAGGTGCTGCGGAACAACGAGATGCAGAAGTTCAAG
GAGATCCAGACAGAGAGGAGGGCCACGGTGCTAGTCCTGGTTGTGCTGCTG
CTATTCATCATCTGCTGGCTGCCCTTCCAGATCAGCACCTTCCTGGATACGCT
GCATCGCCTCGGCATCCTCTCCAGCTGCCAGGACGAGCGCATCATCGATGTA
ATCACACAGATCGCCTCCTTCATGGCCTACAGCAACAGCTGCCTCAACCCACT
GGTGTACGTGATCGTGGGCAAGCGCTTCCGAAAGAAGTCTTGGGAGGTGTAC
CAGGGAGTGTGCCAGAAAGGGGGCTGCAGGTCAGAACCCATTCAGATGGAG
AACTCCATGGGCACACTGCGGACCTCCATCTCCGTGGAACGCCAGATTCACA
AACTGCAGGACTGGGCAGGGAGCAGACAGTGA

Su posterior transcripción:
AUGUUCUCUCCCUGGAAGAUAUCAAUGUUUCUGUCUGUUCGUGAGGACUC
CGUGCCCACCACGGCCUCUUUCAGCGCCGACAUGCUCAAUGUCACCUUGC
AAGGGCCCACUCUUAACGGGACCUUUGCCCAGAGCAAAUGCCCCCAAGUG
GAGUGGCUGGGCUGGCUCAACACCAUCCAGCCCCCCUUCCUCUGGGUGCU
GUUCGUGCUGGCCACCCUAGAGAACAUCUUUGUCCUCAGCGUCUUCUGCC
UGCACAAGAGCAGCUGCACGGUGGCAGAGAUCUACCUGGGGAACCUGGCC
GCAGCAGACCUGAUCCUGGCCUGCGGGCUGCCCUUCUGGGCCAUCACCAU
CUCCAACAACUUCGACUGGCUCUUUGGGGAGACGCUCUGCCGCGUGGUGA
AUGCCAUUAUCUCCAUGAACCUGUACAGCAGCAUCUGUUUCCUGAUGCUGG
UGAGCAUCGACCGCUACCUGGCCCUGGUGAAAACCAUGUCCAUGGGCCGG
AUGCGCGGCGUGCGCUGGGCCAAGCUCUACAGCUUGGUGAUCUGGGGGU
GUACGCUGCUCCUGAGCUCACCCAUGCUGGUGUUCCGGACCAUGAAGGAG
UACAGCGAUGAGGGCCACAACGUCACCGCUUGUGUCAUCAGCUACCCAUCC
CUCAUCUGGGAAGUGUUCACCAACAUGCUCCUGAAUGUCGUGGGCUUCCU
GCUGCCCCUGAGUGUCAUCACCUUCUGCACGAUGCAGAUCAUGCAGGUGC
UGCGGAACAACGAGAUGCAGAAGUUCAAGGAGAUCCAGACAGAGAGGAGG
GCCACGGUGCUAGUCCUGGUUGUGCUGCUGCUAUUCAUCAUCUGCUGGCU
GCCCUUCCAGAUCAGCACCUUCCUGGAUACGCUGCAUCGCCUCGGCAUCC
UCUCCAGCUGCCAGGACGAGCGCAUCAUCGAUGUAAUCACACAGAUCGCCU
CCUUCAUGGCCUACAGCAACAGCUGCCUCAACCCACUGGUGUACGUGAUC
GUGGGCAAGCGCUUCCGAAAGAAGUCUUGGGAGGUGUACCAGGGAGUGUG
CCAGAAAGGGGGCUGCAGGUCAGAACCCAUUCAGAUGGAGAACUCCAUGG
GCACACUGCGGACCUCCAUCUCCGUGGAACGCCAGAUUCACAAACUGCAGG
ACUGGGCAGGGAGCAGACAGUGA

Y finalmente la traducción obtenida:

MFSPWKISMFLSVREDSVPTTASFSADMLNVTLQGPTLNGTFAQSKCPQVEWLG
WLNTIQPPFLWVLFVLATLENIFVLSVFCLHKSSCTVAEIYLGNLAAADLILACGLPF
WAITISNNFDWLFGETLCRVVNAIISMNLYSSICFLMLVSIDRYLALVKTMSMGRM
RGVRWAKLYSLVIWGCTLLLSSPMLVFRTMKEYSDEGHNVTACVISYPSLIWEVF
TNMLLNVVGFLLPLSVITFCTMQIMQVLRNNEMQKFKEIQTERRATVLVLVVLLLFII
CWLPFQISTFLDTLHRLGILSSCQDERIIDVITQIASFMAYSNSCLNPLVYVIVGKRF
RKKSWEVYQGVCQKGGCRSEPIQMENSMGTLRTSISVERQIHKLQDWAGSRQ.
(1)

Se obtuvieron los siguientes resultados en la plataforma de Blastp:

Ilustración 4 Resultados obtenidos de la secuencia proteica.

National Library of Medicine. Blast.ncbi. [Online]. [cited 2020 septiembre 20. Available from:
https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi#XP_011939268. (7)
En la anterior imagen se puede observar dos resultados con 100% de similitud con
la secuencia consultada. Uno de ellos es la isoforma del otro, ya que, se trata de la
misma proteína receptora B2 de bradicinina, pero en el organismo Pan troglodytes
(Chimpanzee).
El receptor B2 de bradicinina es un receptor acoplado a la proteína G para
bradicinina, codificado por el gen BDKRB2 en humanos.

Ilustración 5 Ubicación del gen en el cromosoma 14 del ser humano.

Ilustración 6 Ubicación en la banda 14q32.2.

Este receptor, activado por su ligando endógeno bradicinina participa en varios

procesos fisiológicos que incluyen neurogénesis, diferenciación neuronal y control
de la inflamación y la presión arterial. Además de estos efectos, se ha demostrado
que B2R protege a las neuronas de la lesión por isquemia / reperfusión (I / R).
En un reciente artículo se evidenció que el receptor de bradicinina B2 contribuye a
las respuestas inflamatorias en las células endoteliales humanas mediante la
transactivación del receptor del factor de crecimiento de fibroblastos FGFR-1. En la
angiogénesis, ambos estímulos inducen una firma proinflamatoria en las células
endoteliales, activando un bucle de amplificación autocrino / paracrino que sostiene
el proceso de neovascularización. (8)
 Ilustración 7 Modelo esquemático de la interacción BK B2R-FGF-2 FGFR-1 en células endoteliales.
Terzuoli E, Corti F, Nannelli G, Giachetti A, Donnini S, Ziche M. Bradykinin B2 Receptor Contributes to
Inflammatory Responses in Human Endothelial Cells by the Transactivation of the Fibroblast Growth
Factor Receptor FGFR-1. International Journal of Molecular Sciences. 2018 septiembre; XIX(9).
BIBLIOGRAFÍA
1. Herráez A. Biomodel. [Online].; 2013 [cited 2020 Septiembre 20. Available
from: http://biomodel.uah.es/lab/cibertorio/analysis/trans.htm.

2. Medicine NLO. Blast.ncbi. [Online]. [cited 2020 Septiembre 20. Available from:
https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi#alnHdr_NP_001350496.

3. Ishaq HM, Mohammad IS, Shahzad MW, Xu J. Molecular Alteration Analysis of

Human Gut Microbial Composition in Graves' disease Patients. International
journal of biological sciences. 2018 Septiembre.

4. Corporation GB. Genscript. [Online].; 2020 [cited 2020 Septiembre 20.

Available from: https://www.genscript.com/protein-database/hlag_human.

5. UniProt. UniProt. [Online].; 2018 [cited 2020 Septiembre 20. Available from:
https://www.uniprot.org/uniprot/P17693.

6. Cruz-Tapias P, Castiblanco J, Anaya. JM. Autoimmunity: From Bench to

Bedside [Internet]. Digital ed. Bogota: El Rosario University Press; 2013.

7. Medicine NLo. Blast.ncbi. [Online]. [cited 2020 Septiembre 20. Available from:
https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi#XP_011939268.

8. Terzuoli E, Corti F, Nannelli G, Giachetti A, Donnini S, Ziche M. Bradykinin B2

Receptor Contributes to Inflammatory Responses in Human Endothelial Cells
by the Transactivation of the Fibroblast Growth Factor Receptor FGFR-1.
International Journal of Molecular Sciences. 2018 Septiembre; XIX(9).