Bioquimica Avaliacao. = 2 frequéncias (50% cadod - 2 Exames (100% cada) Fundamentés aq Bioquimica A cerca de 4 bilides de anos atras, surgiu a vida microrganismos simples com capacidade de estrair energia de compostos. quirnicos,e mais tarde, da luz solar, CELULARES As células sdo os unidades estruturais e funcionais de todos os organismos. Existem 3 grupos distintos de vida. - Bacteria - Archaea, ~ Eukarya Os organismnos diferem arnplamente pelas suas fontes de energia e precursores blossintéticos.~ As células eucariéticas tm uma grande variedade de organelos providos de memibranas que podem ser isolados para estudo. = 0 Citoplasma é organizado pelo cito esqueleto e é altamente dinamico. EM SUMA. ~ Todas as células so delimnitadas por urna membrana plasmiética tém um citosol contendo metabolites, coenzimas, \Ses ‘norgdhnicos e enzimas; e tém um conjunto de genes contidas dentro de um nuclebide (bactérias e arqueias) ou de umn niicleo Ceucariotas). = Todos 0s organismas requerem uma fonte de energia para realizar o trabalho celular. Os fototréfices obtém energia da luz Solar, 05 quimiotréficos oxidamn combustivels quimnicas, transferindo eletroes através dos compostos Inorganicos, compostos orgdnicos ou oxigénio molecular. =As células de bactérias e de arquelas contém citosol, nuclebide e plasmideos, todos contidos dentro de um erwelope celular. AS células eucari6ticas térm nicleo e sao multicompartimentalizadas, com determinados processos segregados em organelos espectficos: estes organelos podem ser separados e estudados isoladamente =As proteinas do citoesqueleto organizam-se em longos filamentos que ddo forma e rigidez 4s células e server como trilhos 0 longo dos quats os organelos celulares se deslocam por toda a célula. QUiMicos a-SiEMSUMA. = Devido 4 sua versatilidade de ligagéo, 0 carbono pode produzir amplas colegées de estruturas carbono-carbono com uma grande variedade de grupas funcionals; esses grupos conferem és blomoléculas as suas propriedades quimicas e biolégicas. = AS protefnas e os dcidos nuciecos sdo polimeras lineates fettos de subunidades monméricas simples: suas sequéncias contém as informagées que fornecem a cada molécula sua estrutura tridimensional e as suas fungées biol6gicas. = A configuragdo molecular pode ser alterada somente mediante quebra de ligac8s covalentes. Para um étorno de cartoono com 4 substutuintes diferentes (carbono quiraD. 0s grupos substutuintes podem ser arranjados em duas diferentes, formas, gerando estereoisometas com propriedades distintas. Somente um dos estereoisémeros & biologlcamente ativo. A conformagdo molecular é a dispasigdo dos étomos tno espaco que pode ser mudada por rotagdo em torno de ligacbes. simples , sem quebrar ligagBes covalentes. = Interagées entre moléculas bloldglcas sdo quase invarlavelmente estereoespectficas; elas requerem um qjuste proximo entre as estruturas complementares das moléculas interagentes. Fisicos = Sc. = = = Reagbes catabélicas - libertagdo de energia ReagSes anabélicas + gasto de energia EMSUMA. = AS células vivas Sdo sistemas abertos. que trocam matéria e energa com o melo externa, extraindo e canalizando energia para se manterem no estado estaciondirio dindmico longe do equilforio. Energia é obtida do sol ou de combustivels quimicos pela conversdo da energia do fluxo de elettées em ligagées quimicas de ATP =A tendéncia de uma reagéo quirica em prosseguir em diregdo ao equilforio pode ser expressa como fungdo da energia livre, que tem dois componentes. a variacdo da entalpia e a variacdo da enitopia = Muitas reagbes celulares ocorrem a velocidades apropriadas somente porque as enzimas esto presentes para catalisé-las. As enzimas atuam em parte pela estabilizacdo do estado de transigdo, reduzindo a energia de ativagdo, e aumentando a velocidade de reagio em varias ordens de randeza. A atividade catalttico das enzimas nas células 6 regulada. =O metabolism é a soma de muitas sequéncias de reagbes interconectadas que interconvertemn metabolites celuiares. Cada sequéncia € reguiada para suprir 0 que a célula precisa em um dado momento e para gastar energia somente quando necessério.GENETICOS nip sieoe Aor is Nocona ‘ease = A informacdo genética 6 codficada na sequéncia linear de 4 tipas de desoxorribonucleotideos no DNA. = A dupla-hélice da molécula de DNA contém um molde interno para sua prépria replicagdo e reparagGo. AS moléculas de DNA do extremamente grandes, com massas moleculares de milhdes ou biliSes. = Apesar do tamanho enorme do DNA. a sequéncia de nucledtidos nela é mutto precisa, e a manutencdo dessa precisdo no decorrer de perfodes ber longos de tempo € a base da continuidade genética dos organismos. = A sequéncia linear de aminodcldos de uma proteina, que esté codificada no DNA do gene dessa proteina produz a estrutura ‘tridimensional espectfica da proteina- processo que também depende das condigées ambientais. EVOLUTIVOSA Agua ~ substéincia abundante nos sistemas vis. INTERAGOES FRACAS EM SISTEMAS AQUOSOS = As blomoléculas polares dissolvern-se facilmente em gua porque eles poder substitulr interagdes entre as moléculas de dgua (Agua-tigua) por interagées energeticamente mals favordivels entre a dgua e o soluto (Agua-soluto) = As blomoléculas apolares sdo muito pouco solivels em dgua porque elas interferem nas interacbes do tipo Sgua-égua ‘mas séo incapazes de formar interagées do tipo Agua-soluto = Em solugées aquosas, moléculas apolares tendem a formar agregados, A ligagbes de hidrogénio sdo relativamente fracas (presente no DNA) L Cok oo: DENDD AS UGACHES itt POR PINES DE HiDROKEND ‘cen oon oe me 1 descreve 0 movimento da dgua através de uria membrana sem impermedvel ocasionando por diferencas na pressio osmética. - As memibranas plasmitica sdo mais permedvels 6 dqua que a maioria das / oo =. outras moléculas pequenas ides e macromoléculas, porque 0s canats protelcos Caquaporinas) na mernibrana seletiva mente permitem a passagem de dgua = Em situages hiperténicas (+ soluta, - agua), a célula encolhe assim que a ‘gua transfere para fora ~ Em Solugées hipoténicas (- soluto, + dquo), a célula incha assim que a\égua entraTONIZAGAO DA AGUA E DE ACIDOS E BASES FRACAS caw pH de uma solugdo aquosa reflete, em escala logaritmica, pH = log —~ a concentragio de Ides hidrogénio {H*] A lonizagdo da dgua & descrita pela constante de equiloria, da qual o produto ténico da égua, Kw. & os Wes He = solugées dcidas: obtido QUANTO MAIOR A ACIDEZ DE UMA SOLUCAO, MAIS BAIXO EO SEU pH ‘A extensio desses processos. 6 Caracterstica de cada fcido ou base fraca © & expressa_como uma constanie de issocagso deca tor Koa THA Os aminoécides tém uma caracteristica fundamental-a sua estrutura arson at: Tem 5 grupos: octane ~ carbone central- carbone alfa, e € o primelro carbono de uma proteina a Carmentod ~ grupo amina Cazud Tigodo a0 ~ Grupo carboxilo vermetho) carbone «do Z aioe hidragéti livre ~ grupoR L-aminodcido ‘© que varia de oa para aa é 0 grupo R (cadela lateraD e € 0 que caracteriza de todos 0s outros. Em diferentes pHs, 0s aa podern apresentar diferentes, ‘caracter(sticas, ou seja alteram a sua carga conforme o pH. r ¥ ¥ Quando 0 pH é acid. 0s \6es Hwa se juntar ao grupa WN C—COOH HNC COO- HAN C—CO0 carboxilo (val fcar com carga pasitiva). Quando estamos num R R R ambiente alcalina, temos menos Hs; logo val perder Hee fea plik — i com carga negativa arga positiva carga global nla carga negative Por esta razdo, os aminodcldos sto Substanclas anfotéricas’ Quando os aminodicldas estdo se a juntar uns com os outros formamos umn PEPMIDO, As proteinas podem ser degradadas e hidrolisadas nos seus aa constituintes por varios métodos, 0 carono alfa & o centro quital e é sempre o prime carbono do 0a, Cadeia lateral (R): + Allitica apolar composes por carbono @hidepéne A cadeta lateral mais simples existe & ter um Hidrogénia. + Potarnge ionlzvel- sso pares contendo grupos C=O, OH ou SH + Aromatiea ~ apolarescontando um aelbenzénico * lonizvel~ cont propos carboxy aina que se onizamAté phi 7 temos uma curva de titulagdo e depots, ‘também hé outra curva de titulagdo, ou seja. em plt Nitotem biol agar € ser uma -OSEI HC) hideosito EG) tos Cex sacaose, rues ss glicose) Grupo funcional principal: carbone Todos o outros carbonos tem grupos hidrxilo . SE um OSE uma CETONA (0 grupo erbonilo 0 grup ceto > CETOSE Grupo funcional principal: ceto E aldeido FE aldeido es carbonos sdo enumerados triose-3C ea poem roma (Fea eve unas fasey io baits bidroito que a cadela dupla de oxigénio do aldefdo é na dine ponta enquanto que. numa cetona a cadeia ALDEIDO ‘ALDOSE dupla de oxigénio encontra-se no meio. Uma Aldohexose Jaldose'é diferente de um aldeldo porque ee +t8m um grupo hidroxilo of CLASSIFICAGAO QUIMICA FISIOLOGICA ae Glicémicos _ Eleva a glucose (disponiveis) no sangue Nao Nao elevam a glicémicos glucose no sangueOs hnidrataside'carbono sdo polichidroxialdeldos'ow pol-hidroxicetonas, ou substdncias que geram esses compostos quando hidrolisadas. Muitos carbohidratos:ténniaférmiulalempiricai(CH2O)n, alguns tanibém contém azoto, fosForo ou enxorve. =--o ‘GUUCIDOS GLICEMICOS: digeridos pelo organismo humano, absorvidos e metabolizados (agticares e armidos). GLUCIDOS NAO GLICEMICOS: ndo sdo digeridos pelo organismo humano (Abra). GLUCIDOs = Um dos dots enantiémeras do gliceraldefdo 6, poriconvengao: designado somero D.€ 0 outro é isémero L. cHo = Assim como para as outras blomoléculas com centros quirals. as z configuragées absolutas dos agticares sdo conhecidas a partir de @ 1) cristalagratia de raios X . = Para representar estruturas tridimensionais de agéicares no papel. em geral so utllizadas as Formulas de projecdo de Fischer. + Nas formulas de projocio de Fischer, 2s igardes horizontals 4 projetam par fora do plano do papel, em diesio 20 letor: as lgardes verticals se projetam para ts do plano o papel dstanciando-se do letor Epimeras so mastrados como formulas de project, (ex manase. glicase e galactose) LIGAGAO GLICOSTDICA E CONFORMAGAO 7 = 0s monossacar(deos comumente geram uma estrutura cicica: = Sh. |sso pode ser representado como uma férmula em perspectiva de eos oe whe Kg woo. gt = 0 Gtomno de carbone originalmente localizado no grupo aldefdo ou “— are cetonalpodelassumir uma de duas configuracées alfaleibeta, meee res Interconversiveis por mutarrotagao, we Ne OeAll 1 calfa)forma-se quando a I*oselestéina‘formaratfa A ligagdoiglsosfaia beta forma-se quando a ttoseiestéinaitorma beta POLISSACKRIDOS |. servem de armazenamento:de:combustivelie como componentes estruturais da parede celular e da matriz extracelular. \Atmido%e gicogénio sdo constituidos por D-glicase com ligagdes (alfa +! Acelulosezquitina’eldextrano tém fungées estruturals, GLUCOCONJUGADOS [PROTEDGLICANOS: um ou mais glicanos grandes, chamados de glicasaminoglicanos:sulfats estao covalentemente igadios a ‘uma protefna central. = fomecem pontos de adesao. reconhecimento e transferéncia de informagao entre as células ou entre as células ea matriz. cextracelular: IGLICOPROTEINAS: tem oligossacéridos covalentemente ligados a reduos de Asp ou Ser/Thr. Muitas proteinas extracelulares ou da super‘fcie celular sao glicoprote(nas, assim como a maioria das protefnas secretadas. 0s oigossacarideos covalenterentligados influenciam 0 enovelamento e a estabilidade das proteinas, fornecern \nformagbes crucials sobre 0 destino de protefnas recentemente sintetizadas e permitem o reconhecimento espectfico por outras protetnas, GLICOLIPIDOS glicoesfingolipides em plantas e animais sdo componenites da membrana celular.