‫وضعية جديدة لوحدة النشاط االنزيمي للبروتينات حول انزيم الكتات ديهيدروجيناز‬

‫تمرين استدالل‪:‬‬

‫االنزيمات جزيئات بروتينية ذات بنيات فراغية محددة‪ ،‬تصنعها العضوية لتحفيز التفاعالت الضرورية‬

‫لمختلف نشاطاتها‪ ،‬غير ان حركية التفاعالت التي تحفزها تتأثر بعديد العوامل مثل انزيم ‪LDH‬‬

‫)‪ (Lactates déshydrogénases‬المحفز ألحدى تفاعالت التخمر اللبني‪.‬‬

‫الجزء‪:I‬‬

‫انزيم ‪ LDH‬هو انزيم يتواجد تقريبا في كل خاليا العضوية‪ ،‬لفهم العالقة بين بنية هذا االنزيم وتخصصه الوظيفي‬

‫اليك أشكال الوثيقة ‪ ,1‬حيث الشكل 'أ' يوضح التفاعل الذي يحفزه هذا االنزيم‪.‬‬

‫أما الشكل 'ب' فهو نمذجة لبنية جزء من هذا االنزيم وعالقته بمادة التفاعل‪.‬‬

‫حمض‬
‫البيروفيك‬

‫انزيم‬

‫‪LDH‬‬

‫حمض‬
‫اللبن‬

‫الشكل 'ب'‬ ‫الشكل 'أ'‬

‫الوثيقة "‪"1‬‬ ‫‪KB‬‬

‫‪ -‬بين عالقة البنية الفراغية لهذا االنزيم بتخصصه الوظيفي‪ ,‬باستغاللك لمعطيات الوثيقة ‪.1‬‬
 ‫الجزء ‪:II‬‬
‫لدراسة حركية التفاعل المدروس بداللة بعض العوامل كدرجة ‪ PH‬وحرارة الوسط وأيضا تركيز مواد التفاعل‪ ،‬نقيس‬
‫سرعة التفاعل عند تراكيز متزايدة من حمض البيروفيك مع ثبات تركيز االنزيم و‪ PH‬والحرارة و‪ NADHH‬وذلك‬
‫اعتمادا على تقنيات التجريب المدعم بالحاسوب ‪ ,EXaO‬النتائج موضحة في الشكل 'أ' من الوثيقة"‪."2‬‬
‫في حين أن الشكل 'ب' يوضح نماذج جزيئية لألنزيم و مواد التفاعل في مرحلتين مختلفتين من التجربة السابقة‪.‬‬

‫الحالة العادية‬ ‫‪KB‬‬

‫الشكل 'ب'‬ ‫الشكل 'أ'‬
‫الوثيقة "‪"2‬‬ ‫‪KB‬‬

‫كما نقيس سرعة هذا التفاعل اعتمادا على تقنيات التجريب المدعم بالحاسوب ‪ ,EXaO‬في درجات مختلفة من‬
‫الحرارة ثم في درجات متغيرة من ‪ PH‬وهذا في حالة ثبات تركيز االنزيم ومواد التفاعل‪ ،‬النتائج موضحة في شكلي‬
‫الوثيقة "‪."3‬‬

‫الشكل 'ب'‬ ‫الشكل 'أ'‬

‫الوثيقة "‪"3‬‬ ‫‪KB‬‬

‫‪ -1‬إشرح تأثير التراكيز العالية لحمض البيروفيك على حركية التفاعل االنزيمي المدروس‪ ،‬باستغاللك للوثيقة "‪."2‬‬
‫‪ -2‬بين الشروط المثلى لعمل هذا االنزيم‪ ،‬اعتمادا على معطيات الوثيقتين "‪ "2‬و "‪."3‬‬
‫ن ‪-‬ج ن‪-‬ك‬ ‫شبكة التقويم لتمرين االستدالل‬
‫الجزء ‪ :I‬العالقة بين بينة ‪ LDH‬ووظيفته‪.‬‬

‫إستغالل معطيات الوثيقة ‪:1‬‬

‫الشكل أ‪ :‬مخطط للتفاعل االنزيمي الذي يحفزه انزيم ‪.LDH‬‬

‫نزع ذرات هيدروجين من‪ NADHH+‬ليتحول الى ‪ NAD+‬واضافتها لحمض البيروفيك ليتحول الى حمض ‪0.25‬‬
‫اللبن وذالك بتحفيز من أنزيم ‪.LDH‬‬
‫*‪3‬‬
‫نتيجة‪ LDH :‬يحول البيروفيك و‪ NADHH+‬الى حمض لبن و ‪(NAD+‬أكسدة – ارجاع)‪.‬‬

‫الشكل ب‪ :‬نموذج جزيئي للعالقة بين بنية ‪ LDH‬ومواد التفاعل حمض البيروفيك و‪.NADHH+‬‬

‫يرتبط حمض البيروفيك بالمجموعة الوظيفية في نهاية جذر االرجنين ‪ 171‬في الموقع الفعال فهي تابعة‬
‫لموقع التثبيت‪.‬‬

‫يرتبط ‪ NADHH+‬بالمجموعة الوظيفية في نهاية جذر الفالين ‪ 138‬في الموقع الفعال فهي تابعة لموقع‬
‫التثبيت‪.‬‬

‫يحدث التأثير على حمض البيروفيك وإضافة الهيدروجين عن طريق المجاميع الوظيفية لنهايات االحماض‬
‫‪3 0.25‬‬ ‫االمينية االرجنين ‪ 109‬والهيستيدين ‪ 195‬فهي تابعة لموقع التحفيز‪.‬‬

‫ترتبط نهاية الهيستيدين مع نهاية حمض االستبارتيك ‪ 168‬فهو حمض اميني يتدخل في الشكل الفراغي *‪5‬‬

‫للموقع الفعال دون ان بتدخل مباشرة مع مادة التفاعل‪.‬‬

‫نتيجة‪ :‬نهايات جذور االحماض االمينية المتعلقة بالموقع الفعال لإلنزيم مسؤولة عن االرتباط والتأثير على‬
‫‪ NADHH+‬وحمض البيروفيك‪.‬‬

‫ربط‪ LDH :‬يحول البيروفيك و‪ NADHH+‬بعد االرتباط بهما بواسطة المجاميع الوظيفية لموقع التثبيت‬
‫‪0.25‬‬
‫(االرجنين ‪ 171‬والفالين ‪ )138‬الى حمض لبن و ‪NAD+‬بتدخل المجاميع الوظيفية لموقع التحفيز‬
‫*‪2‬‬
‫(االرجنين ‪ 109‬والهيستيدين ‪.)195‬‬
‫‪0.25‬‬
‫ومنه‪ :‬يرتكز التخصص الوظيفي ألنزيم ‪ LDH‬على المجاميع الوظيفية وعلى الشكل الفراغي لموقعه‬
‫الفعال الذي يتكون من موقع تثبيت (االرجنين ‪ 171‬والفالين ‪ )138‬يحدد نوعيته اتجاه مادة التفاعل وموقع ‪*2‬‬

‫تحفيز (االرجنين ‪ 109‬والهيستيدين ‪ )195‬يحدد نوعيته اتجاه نوع التفاعل‪.‬‬

 ‫الجزء ‪ :II‬شرح تأثير التراكيز العالية لحمض البيروفيك على حركية التفاعل االنزيمي‪.‬‬
‫استغالل معطيات الوثيقة ‪:2‬‬
‫الشكل أ‪ :‬منحنى بياني لتغيرات سرعة التفاعل االنزيمي بداللة تركيز حمض البيروفيك‪.‬‬
‫‪0.25‬‬ ‫زيادة تركيز حمض البيروفيك (من ‪ 0‬الى ‪ :)Mm 2‬زيادة سرعة التفاعل حتى قيمة أعظمية ‪.0.280‬‬
‫*‪2‬‬ ‫زيادة تركيز حمض البيروفيك (من ‪ 2‬الى ‪ :)Mm 3‬ثبات سرعة التفاعل عند قيمة أعظمية‪.‬‬
‫زيادة تركيز حمض البيروفيك (من ‪ 3‬الى ‪ :)Mm 9‬انخفاض سرعة التفاعل حتى قيمة ‪.0.190‬‬
‫‪0.25‬‬ ‫نتيجة‪ :‬التراكيز العالية لمادة التفاعل عامل مثبط للتفاعل االنزيمي‪.‬‬

‫‪0.25‬‬ ‫الشكل ب‪ :‬نماذج جزيئية لألنزيم ومواد التفاعل‪.‬‬

‫*‪2‬‬ ‫وهي ارتباط كل من حمض البيروفيك و‪ NADHH+‬كل في موقعه للتثبيت‪.‬‬
‫الحالة الثانية وهي ارتباط جزيئات من حمض البيروفيك في كل موقع التثبيت‪.‬‬
‫‪0.25‬‬ ‫نتيجة‪ :‬قدرة جزيئات حمض البيروفيك على التموضع في موقع تثبيت‪. NADHH+‬‬
‫‪4‬‬
‫ربط‪ :‬قدرة جزيئات حمض البيروفيك على التموضع في موقع تثبيت‪ NADHH+‬وبذلك تصبح التراكيز‬
‫‪0.25‬‬
‫العالية منها تثبط التفاعل‪.‬‬
‫حيث‪ :‬ارتفاع تركيز حمض البيروفيك مقارنة بتركيز ‪ NADHH+‬في الوسط مع قدرتها على االرتباط‬
‫‪0.25‬‬
‫بجميع المجاميع الوظيفية لموقع التثبيت‪ ،‬يزيد من احتمالية ارتباطها بمواقع مخصصة في األصل لالرتباط‬
‫بـ ‪ NADHH+‬فال يرتبط هذا األخير باألنزيم مما يعرقل حدوث التفاعل‪.‬‬

‫استغالل معطيات الوثيقة ‪:3‬‬

‫الشكل أ‪ :‬نسبة حركية التفاعل االنزيمي بداللة ح اررة الوسط‪.‬‬
‫‪0.25‬‬
‫درجة ح اررة (‪10‬م‪ °‬الى ‪30‬م‪ :)°‬تزايد نسبة حركية التفاعل االنزيمي حتى قيمة أعظمية ‪.%100‬‬
‫*‪2‬‬
‫درجة ح اررة (‪30‬م‪ °‬الى ‪50‬م‪ :)°‬تناقص نسبة حركية التفاعل االنزيمي حتى قيمة دنيا حوالي ‪.%15‬‬
‫‪0.25‬‬
‫نتيجة‪ :‬تؤثر درجة الح اررة على نشاط ‪ LDH‬ويكون نشاطه أعظمي عند ‪30‬م‪.°‬‬

‫الشكل ب‪ :‬نسبة حركية التفاعل االنزيمي بداللة ‪ PH‬الوسط‪.‬‬

‫‪0.25‬‬
‫درجة حموضة (‪ 4‬الى ‪ :)7.5‬تزايد نسبة حركية التفاعل االنزيمي حتى قيمة أعظمية ‪.%100‬‬
‫*‪2‬‬
‫درجة ح اررة (‪ 7.5‬الى ‪ :)9‬تناقص نسبة حركية التفاعل االنزيمي حتى قيمة دنيا تقارب االنعدام‪.‬‬
‫‪0.25‬‬
‫نتيجة‪ :‬تؤثر درجة الحموضة على نشاط ‪ LDH‬ويكون نشاطه أعظمي عند ‪.7.5‬‬

‫‪0.25‬‬
‫ربط‪ :‬تؤثر درجة الح اررة والحموضة على نشاط ‪ LDH‬ويكون نشاطه أعظمي عند ‪30‬م‪ °‬و‪.PH=7.5‬‬
‫‪0.25‬‬
‫ومنه‪ :‬الشروط المالئمة لعمل انزيم ‪ LDH‬هي تراكيز متناسقة بين كل من تركيز حمض البيروفيك‬
‫و‪ NADHH+‬وعند ‪30‬م‪ °‬و‪.PH=7.5‬‬
 ( ‫) ﺗﺎﺑﻌﻮﻧﺎ ﻋﻠﻰ ﺻﻔﺤﺔ اﻟﻔﺎﯾﺴﺒﻮك او اﻻﻧﺴﺘﻐﺮام‬ ‫ﺗﻌﺪﯾﻞ اﻻﺳﺘﺎذ ﺧﯿﺮاﻟﺪﯾﻦ ﺳﻮدة‬
https://www.facebook.com/khaireddinesouda23
https://www.instagram.com/khaireddine_souda