Professional Documents
Culture Documents
Advances in Biochemistry
TOM 42, NR 3,1996
http://rcin.org.pl
K w a rta ln ik „ P o stęp y B io c h e m ii
"
w y d a w a n y z p o m o cą fin a n s o w ą
K o m ite tu B adań N a u k o w y c h
http://rcin.org.pl
SPIS TREŚCI
CONTENTS
W YDAW CA
Listy gratulacyjne z okazji 90-lecia C złonków Honoro
E ditor w ych Tow arzystw a:
P O L SK IE TOW ARZYSTW O
B IO C H E M IC Z N E profesor Stelli Niem ierko i profesora Tadeusza Korzybs-
Polish Biochemical Society kiego
ul. Pasteura 3 Congratulation on the 90th birthday of Professors Stella Niemier
02-093 W arszawa
Poland ko and Tadeusz K orzybski.................................................................223
Poland
http://rcin.org.pl
Izoenzymy fosfolipazy C specyficznie hydrolizującej fos-
fatydyloin ozytole i regulacja ich aktyw ności
Phosphatidylinisitol-specific phospholipase C isozymes and re
gulation of their activity
TADEUSZ PAW ELCZYK............................................... 290
Errata
W zeszycie nr 2 b.r. Postępów Biochemii (str. 219) zostały
zniekształcone nazwiska:
Kol. Jacka Kuźnickiego z Warszawy,
Kol. Jerzego Meduskiego z Kaliforni.
Za niedopatrzenie błędów w korekcie Redakcja uprzejmie Kolegów
przeprasza.
http://rcin.org.pl
ARTYKUŁY
A rtykuł ten dedykujemy Pani Profesor Dr hab. Zofii Zielińskiej
w dowód naszego szacunku i przyjaźni
J A N I N A K A C Z A N O W S K A 1,
D O R O T A W Ł O G A 2,
A N D R Z E J K A C Z A N O W S K I3
Wykaz stosowanych skrótów: EGF — (ang. epidermal growth aktywatory cyklino-zależnej kinazy białkowej Saccharomy
factor) epidermalny czynnik wzrostu; PD G F — (ang. platelet ces cerevisiae: Myo 2 — produkt genu myo 2 będący
derived growth factor) płytkowy czynnik wzrostu; LPA homologiem miozyny w Saccharomyces cerevisiae; septyny
— (ang. lysophosphatidylic acid) kwas lizofosfatydylowy; Ras — (ang. septins) kompleks białek szkieletowych z domeną
— produkt protoonkogenu genu ras pośredniczący w szlaku wiążącą nukleotyd wyznaczających położenie bruzdy po
przekazu bodźca do jądra; Rho — (ang. Ras homologues) działowej; bud — zespół genów kontrolujących powstawanie
grupa białek o podobnej strukturze i funkcji do białka Ras; miejsca pączkowania u Saccharomyces cerevisiae; cdc24,
Rac — (ang. Reorganization o f actin cytoskeleton) białka cdc43, bem 1, bem 3, rsr 1, spa2, gtpb — geny Saccharomyces
zbliżone do Ras bezpośrednio związane z reorganizacją cerevisiae kontrolujące tworzenie kompleksu białek biegu
cytoszkieletu aktynowego; CDC42 — produkt genu cdc42 nowych; GDI — (ang. guanine nucleotide dissociation in
Saccharomyces cerevisiae o strukturze i funkcji podobnej do hibitor) białko negatywnej kontroli funkcji Ras; ERM
białka Ras; GEF — (ang. guanine nucleotide exchange factor) — (ang. ezrin, radixin, moesin family) białka cytoszkieletu
czynnik regulujący GTPazową funkcję białka Ras; GAP występujące albo w cytoszkielecie miejsc przylegania komó
— (ang. GTPase activating protein) aktywator funkcji GTPa- rki do podłoża, albo w* bruździe cytokinetycznej; cdcl5,
zowej białek Ras; CLbl, Clb 2 — (ang. cyclin binding proteins) peanut — geny kodujące białka charakterystyczne dla bruz
dy podziałowej; MAP kinaza — (ang. Mitogen activated
1,3 Prof. dr hab., 2 mgr Zakład Cytofizjologii, Uniwer protein kinase) kinaza serynowo-treoninowa uczestnicząca
sytet Warszawski, Warszawa 00-927, ul. Krakowskie Przed w szlaku kaskady kinaz przenoszących mitogenny sygnał
mieście 26/28 zewnętrzny z cytoplazmy do jądra; c-jun, c-fos — geny
? czyn n ik i
transkrypcyjne
'ekspresja
i • ' \ genów
k in a z a # \ 1
aktyw ująca \ f
c -J U N , ^regulacja
h yd roliza zm ian y m itozy
fo sfa ty d y lo in o zito lu w cytoszkielecie
aktyny
i ERM
Ryc. 1 Uproszczony i hipotetyczny schemat zależności stymulacji białek G, Ras, Rho, Rac i CDC42 z aktywacją reorganizacji cytoszkieletu
(grube strzałki) i pobudzaniem aktywności niektórych kinaz białkowych (kompilacja schematów wielu autorów głównie [3,16,44, i 45]).
FAK — kinaza specyficzna dla miejsc przylegania kom órek do podłoża (ang. foci adhesion kinase), ERM — (ang. ezrin, radixin, moesin)
białka cytoszkieletu związane z wytwarzaniem miejsc przylegania do podłoża i występujące w bruździe cytokinetycznej, G s — białko
G stymulowane horm onalnie (wzrost stężenia cAMP) i Gj — białko G stymulowane kwasem lizofosfatydylowym (LPA) (obniżenie
poziom u cAMP) powoduje aktywację fosfolipazy a następnie aktywację kinazy białkowej C (PKC), aktywację kinazy fos-
fatydylonoizytolu (PI3K) i Rac (RAC), oraz aktywację Rho (być może z udziałem niereceptorowych kinaz tyrozynowych (src i JAK); Przy
działaniu LPA i czynników wzrostowych (IG F i EG F) obserwuje się aktywację szlaku Ras. Stymulacja szlaku Ras jest sprzężona
z aktywacją CDC42 być może przez wspólny czynnik aktywujący GAP.
R O Z P A D LU B T R A N S L O K A C JA
SK Ł A D N IK Ó W K OM PLETU ► ’’ 9 RI C
B IE G U N O W E G O S W l iL t i tri
PO W ST A N IE N IE A K T Y W N E G O
K O M PLETU „SZ Y JK I” C Y T O K IN E Z A
NA M IE JSC U C Y T O K IN E Z Y
Ryc. 4 Schemat zmian w komplecie białek biegunowych w trakcie pączkow ania S. cerevisiae. Opis w tekście. Wg [3, 44].
zbędne dla u trzy m ania w zrostu polarnego. Z p rzy to zy typu R ho prow adzi do w ytw orzenia kabli a k
czonych tu taj danych w ynika schem at przem ian tynow ych cytoszkieletu i do w ytw orzenia miejsc p rzy
w b iałkach biegunow ych niezbędnych dla realizacji legania do p o dłoża (adhesionfoci), a aktyw acja C D C 42
kolejnych stadiów pączkow ania [3] (Ryc. 4). Schem at do w ytw orzenia wiodącej cienkiej nibynóżki zwanej
ten jest uproszczony i nie uw zględnia k o n tro li przez filopodium . M ikroinjekcja białek R ho, R ac i C D C 42
działanie inh ib ito ró w aktyw acji R as lub R ho typu do k o m ó rek spoczynkow ych stym ulow ała wyjście k o
G D I (ang. guanine nucleotide dissociation inhibitors) m órek ze stadium G1 i rozpoczęcie sD N A . W trakcie
w ygaszających m echanizm sygnalizacji [16]. P raw cytokinezy tych kom órek, białko — R ho jest przem ie
d o p o d o b n ie w trakcie m orfogenezy drożdży istnieje szczane z cytosolu do bruzdy podziałow ej, a to w arzy
pew na hierarchiczna kolejność aktyw acji G T P az szą tem u przem ieszczanie się aktyny i białek cyto-
B U D 1, C D C 42 i R ho 1-4 uczestniczących w selekcji szkieletow ych z grupy E R M (ezryny, radiksyny i m oe-
m iejsca pączkow ania, a więc w tw orzeniu pierścienia zyny). B iałka grupy E R M w ystępują, albo w cyto-
szyjki [9, 13, 19, 20]. szkielecie przylg (regionów przylegania kom ó rek do
R ola C D C 42 w raz z kom pleksem białek nie ograni podłoża) w okresie interfazy, albo są w bruzdzie
cza się do k o n tro li reorganizacji cytoszkieletu i wy w trakcie cytokinezy [3].
znaczenia m iejsca pączkow ania we wczesnej fazie Istnieją rów nież pośrednie przesłanki, aby sądzić, że
cyklu. Rów nocześnie ze stym ulacją cyklu kom órkow e niektóre białka kom pleksu białek biegunow ych o c h a
go i pow staw aniem pączka, odbyw a się aktyw acja rakterze septyn są przem ieszczane do bruzdy p o
kinazy threoninow o-serynow ej należącej do grupy działowej w trakcie cytokinezy i m ogą pełnić funkcję
M A P kinaz (uczestniczących w ścieżce aktyw acji zarów no przekaźnika w transdukcji sygnału ja k i oś
transkrypcji wczesnych genów w cyklu kom órkow ym ) ro d k a polim eryzacji innych białek cytoszkieletu.
[21]. W b ad an iach in vitro w ykazano, że C D C 42 jest W b ad an iach n ad podziałem drożdża Schizosac-
źródłem aktyw acji pew nych charakterystycznych dla charomyces pombe w obrębie sekwencji nukleotydów
koniugacji kinaz białkow ych [15]. W ynik ten oznacza, genu cdcl5 o charakterze septyny, znaleziono fragm ent
że CDC42 jako przekaźnik sygnałów feromonowych hom ologiczny wobec dom eny kodującej SH3, a także
spełnia jednocześnie potrójną rolę; wyznacznika miejsca dom eny charakterystycznej dla białek n a któ ry ch
inicjacji reorganizacji cytoszkieletu, utrzymania polar- m oże odbyw ać się polim eryzacja innych białek. B iałko
ności wzrostu pączka i aktywatora ekspresji genów [22]. C D C 15 jest silnie ufosforylow aną fosfoproteiną w tr a
kcie całego cyklu, za w yjątkiem m itozy i tylko w tedy
IV. Funkcje białek biegunowych w komór staje się ośrodkiem kondensacji F -ak ty n y i p o śred
kach różnych typów nikiem w podczepieniu cytoszkieletu do błony k o m ó r
kowej. B iałko C D C 15 m oże być uniw ersalnym p o śred
W p rzy p ad k u fibroblastów myszy aktyw acja G T P a- nikiem w w yznaczaniu m iejsca bruzdy cytokinetycznej
T O M A S Z T. C A L I K O W S K I *
I. Wprowadzenie I. Introduction
II. Drosophila melanogaster — organizm modelowy do II. Drosophila melanogaster — a model for studying develop
badań nad rozwojem ment
III. Grupa genów Polycomb (Pc-G) — represory ekspresji III. The Polycomb gene group (Pc-G) — the repressors of
genów gene expression
III-I. Modele działania Pc-G III-l. The models of Pc-G’s action
IV. Grupa genów trithorax (trx-G) i mechanizmy ich działa IV. The trithorax gene group (trx-G) and its mode of action
nia V. Conclusions
V. Podsumowanie
Wykaz stosowanych skrótów: ANT-C — kompleks genów [33, 34]), ale rów nież z tw orzenia kom pleksów c h ro
homeotycznych Antennapedia; BX-C — kompleks genów m atynow ych wyższego rzędu. C hodzi tu w szczególno
homeotycznych Bithorax; Ubx — gen homeotyczny Ultra-
bithorax; hb — gen segmentacji hunchback; Pc-G — grupa ści o kondensację chrom atyny prow adzącą do utw orze
genów Polycomb z Drosophila; trx-G — grupa genów trit- nia nieaktywnej transkrypcyjnie heterochrom atyny.
horax z Drosophila. P odczas rozw oju, w sterow aniu aktyw nością za
p o m ocą stru k tu r chrom atynow ych b io rą udział dw a
I. Wstęp złożone system y regulatorow e — represyjnie d ziałają
ca g ru p a genów Polycomb {Pc-G) i ak tyw ato ro w a
Rozwój organizm u w ielokom órkow ego możliwy g ru p a genów trithorax (trx-G ). G eny Pc-G b io rą udział
jest dzięki istnieniu system u regulacyjnego, kierujące w tw orzeniu stru k tu r silnie skondensow anej nieaktyw
go ekspresją genów w poszczególnych polach m orfo- nej transkrypcyjnie heterochrom atyny w rejonach
genetycznych zaro dka. E kspresja genów u Eukariota D N A zaw ierającego geny, k tó re m ają ulec trw ałem u
zależy od dostępności m atrycy D N A dla polim erazy wyłączeniu. G eny trx-G przeciw działają tej represji
R N A i czynników transkrypcyjnych. D N A w kom órce rozluźniając chrom atynę i czyniąc ją bardziej d o stęp n ą
eukariotycznej up akow any jest w złożone kom pleksy dla czynników aktyw atorow ych [3-5]. P ro d u k ty obu
n u kleoproteinow e — chrom atynę. P odstaw ow ą je d grup genów zaangażow ane są rów nież w wiele p o z o r
n o stk ą ch ro m aty n y są nukleosom y zbudow ane z b ia nie nie zw iązanych ze sobą zjaw isk takich ja k w ygasza
łek histonow ych i ow iniętego w okół nich D N A [32]. nie ekspresji genów (silencing) u drożdży [52], k o n tro la
S tru k tu ra chro m atyny wpływ a w istotny sposób na genów rozwojowych u Drosophila i myszy a także po
dostępność D N A d la czynników regulacyjnych. N ie wstawanie niektórych białaczek u człowieka [36, 39, 40].
k tó re geny (tak zw ane geny milczące, ang. silent genes),
p o zo stają nieaktyw ne m im o obecności w kom órce II. Drosophila melanogaster — organizm mo
białek p o trzebnych do ich transkrypcji. G eny te po zo delowy do badań nad rozwojem
stają w stanie zablokow anym rów nież po przejściu
k o m ó rk i przez m itozę. Tego rodzaju efekty przypisuje W iele czynników zidentyfikow anych u Drosophila
się często tw orzeniu specyficznych stru k tu r ch ro m aty bierze udział w kształtow aniu podstaw ow ego p lan u
nowych. B lokow anie ekspresji genów m oże w ynikać ciała ju ż w b ardzo wczesnych etapach rozw oju [2].
nie tylko z w ystępow ania kom pleksów nukleosom ów G eny zw iązane z rozw ojem u Drosophila podzielić
w określonej pozycji (zwykle po p ro m o to rac h genów m ożna n a trzy klasy: geny m ateczne, geny segm entacji
i geny hom eotyczne. R óżnią się one organizacją m ole
k u larn ą, sposobem działania i funkcją. I tak geny
* Mgr, Pracownia Biologii Molekularnej Roślin, Instytut
Biochemii i Biofizyki PAN, ul. Pawińskiego 5a, 02-106 m ateczne (około 30) działają ja k o pierwsze podczas
Warszawa oogenezy określając główne osie jaja. G eny te o d
Tabela 1.
Sklonowane geny z grupy Polycomb i ich produkty [3].
Znane motywy
Gen M asa cząsteczkowa Homologi
białkowe
C hrom odom ena Pc jest niezbędna do działania białka [27], natom iast domeny typu palców cynkowych w białkach ph
i E(z) i palców R IN G (Psc, Su(z)2) nie są nieodzowne do funkcjonowania tych białek [26, 28].
Z ap ro p o n o w an o dw a m ożliwe m echanizm y inak- przeciw działanie represji wywołanej przez kom pleksy
tyw acji ekspresji genów przez białka Pc-G. Pierwszy Pc-G, nukleosom y i inne czynniki działające w trans na
polega n a organizacji nici chrom atynow ej przez b iałka poziom ie chrom atyny. M utacje w genach trx-G o b
Pc-G w stru k tu ry wyższego rzędu (Ryc. la) [21]. D N A niżają ekspresję genów hom eotycznych podczas póź
zaw ierałby m iejsca reagujące n a białka Pc-G (elem enty niejszych etapów rozw oju. N iek tó re z tych genów są
odpow iedzi — ang. Pc-G response elements, P R E s), od supresoram i m utacji w genach Pc-G, lecz w przeciw ień
któreg o rozpoczynałoby się pakow anie chrom atyny stwie do tych ostatnich nie tw orzą w spółdziałających
w stru k tu ry wyższego rzędu. W ew nątrz takiego k o m kom pleksów , zaś ich oczyszczone p ro d u k ty m ogą
pleksu m ogłyby zostać u k ryte enhancery, niedostępne (przynajm niej w niektórych przypadkach) wiązać się
w ten sposób dla aktyw ujących czynników transkryp- do D N A in vitro [46]. B iałka tej grupy są heterogenne
cyjnych. D rugi m echanizm to tw orzenie przez k o m pod względem sekwencji, stru k tu ry oraz m iejsca i zape
pleksy Pc-G przedziałów w ew nątrzjądrow ych (Ryc. wne m echanizm u działania. S pośród poznanych do tej
Ib), w k tó ry ch elem enty odpow iedzi (PR E) służą ja k o pory przeszło 18 przedstaw icieli grupy [44,47] d o k ład
p u n k ty zaczepienia ch ro m atyny do białek Pc-G. Im niej p oznano trzy geny i ich produkty. Są to: trithorax
więcej D N A zaw iera tak i kom pleks, tym m ocniejsza (trx) [40, 48], brahma [49, 50] i trithorax-like (tri),
jest represja D N A [30, 31]. W zw iązku z tym m ogła to którego p ro d u k t zw any jest też czynnikiem G A G A
być je d n a z przyczyn skupienia genów hom eotycznych [51] (Tab. 2).
w dużych b lokach (kom pleksach) podczas ewolucji. brahma jest niezbędnym genem Drosophila — m u
S tabiln a represja tych genów jest najłatw iejsza do tan ty hom ozygotyczne brahma giną pod koniec
osiągnięcia wtedy, gdy ich organizacja ch ro m o so m o em briogenezy [53]. M utacje w brahma są supresoram i
w a pozw ala n a zbudow anie dużych kom pleksów re transform acji spow odow anych przez m utacje w ge
presyjnych [21]. nach P oly comb. Białko brahma w ykazuje uderzające
podobieństw o do drożdżow ego ak ty w ato ra trans-
IV. Grupa genów trithorax (trx-G) — krypcyjnego S n f2 /S m 2 , znanego rów nież ja k o G AM 1
aktywatorów ekspresji genów i TYE3 [54]. U drożdży Snf2/Sw i2 jest czynnikiem
koniecznym do transkrypcji wielu regulow anych ge
D ru g ą grupę genów biorących udział w regulacji nów. Snf2/Sw i2 nie wiąże się bezpośrednio do D N A ,
genów hom eotycznych jest gru p a trithorax (trx-G ) lecz łączy się z białkam i S w il, Swi3, Snf5, Snfó
[44]. P ro d u k ty genow e przedstaw icieli tej grupy są i pięciom a innym i, tw orząc ogrom ny kom pleks biał
zdolne do aktyw acji genów rozw ojow ych poprzez kow y o m asie 2 M D a zaangażow any w aktyw ację
tran sk ry p cy jn ą [50]. P odobieństw o białek brahma som ów politenicznych w 16 rożnych m iejscach. M iejs
i Swi2 jest najw iększe w dw u regionach; pierw szym ca te w dużym stopniu pokryw ają się z m iejscam i
z nich jest do m en a A T P azy zależnej od D N A (500 w iązania białka Pc-G (na przykład E(z) [48]). W sk azu
am inokw asów ), zaś drugim m otyw tak zwanej brom o- je to n a podobieństw a w m echanizm ie działania białek
dom eny (77 am inokw asów ), w ystępujący często w eu o bu tych grup. U Drosophila zarodki i dorosłe ow ady
kariotycznych białkach regulatorow ych [4,'50]. P rzy z m utacją trx w ykazują transform acje hom eotyczne
puszcza się, że elem enty te m ogą brać udział w ro z p o d o b n e do obserw ow anych w m u tan tach Sex combs
bijaniu stru k tu r nukleosom ow ych i w spom agać reduced (Ser), U bx, Antennapedia (Antp), Abdom inal-A
czynniki i ak ty w atory transkrypcyjne w w iązaniu do i Abdominal-B. Świadczy to, że trx jest konieczny do
odpow iednich elem entów D N A (na przykład w ią norm alnej ekspresji tych genów, należących do k o m
zanie ak ty w ato ró w transkrypcyjnych G A L4-V P16 pleksów A N T -C i BX-C [60]. Niezwykle ciekawe jest
i G A L4-A H ) [55, 56]. Ludzki hom olog genu brahma, działanie ludzkiego hom ologu trx, A L L 1 (M L L ,
B RG 1, bierze rów nież udział w k o n tro li cyklu k o m ó r H R X ). G en M L L -1 (z ang. mixed-lineage leukaemia)
kow ego poprzez tw orzenie kom pleksów z białkiem położony jest n a chrom osom ie 11, zaś jego rearanżacje
retinoblastoma; odgryw a także rolę w integracji prow i- (głównie typu translokacji) p row adzą do onkogenezy
rusów [57], i pow staw ania białaczek u dzieci [61]. G en H R X
C zynnik GAG A jest aktyw atorem transkrypcji w ią (M L L ) jest niezwykle długi (około 100 kb), zaw iera
żącym się do miejsc w D N A bogatych w pow tórzenia przynajm niej 21 eksonów , zaś jego p ro d u k t, białko
(GA)n [46]. C zynnik ten kodow any jest przez gen 0 długości 3910 am inokw asów , m a trzy regiony hom o-
z grupy trx-G , trithorax-like (tri), i m a 519 am in o logii z trithorax Drosophila. O cenia się, że 75% ostrych
kw asów [51]. M utacje w genie tri prow adzą do białaczek niem owlęcych zw iązanych jest z rearan żacją
transform acji hom eotycznych przypom inających m u genu H R X (lokus llq 2 3 ) [61, 62]. H eterozygotyczne
tacje w genach hom eotycznych A bd-B i U bx (na m utacje w genie M L L u myszy prow adzą n ato m iast do
przykład pow iększenie przedzm ianek i przekształcenie zaham ow ania w zrostu, transform acji hom eotycznych
segm entów odw łoka), czyli p row adzą do obniżenia szkieletu osiowego i deform acji m o stk a [63]. B rak
ekspresji tych genów hom eotycznych. Stw ierdzono, że M L L (-/-) jest em brionalnie letalny. D ysrupcja jednej
in vitro czynnik G AG A wiąże się do D N A w pobliżu kopii genu (M L L + /-) pow odow ała przesunięcie g ra
p ro m o to ro w eg o bloku TATA, a następnie w ykorzy nic ekspresji genów hom eotycznych H oxa-7 i H oxa-9
stując energię w postaci A TP, usuw a nukleosom y ku tyłowi ciała, ale aktyw ność tych genów hom eotycz
um ożliw iając w ten sposób w iązanie się polim erazy II nych była zniesiona w zaro d k ach M L L (-/-). T ak więc
R NA i czynnika transkrypcyjnego T F IID [58, 59]. hom olog genu trithorax jest konieczny do określenia
P onadto czynnik GAG A przeciwdziała represji trans- tożsam ości segm entów ciała i do k o n tro li ekspresji
krypcyjnej będącej rezultatem działania histonu H I [59]. genów H ox.
G en trithorax (trx) koduje co najm niej dwie izofor- M echanizm y działania przedstaw icieli grupy trx-G
my białkow e — tr x l o m asie 368 k D a i t r x l l o masie są zróżnicow ane. P ostuluje się [21], że białka trx-G
404 kD a, z k tó ry ch obie przechodzą złożony proces tw orzą kaskadę regulacyjną — czynniki brahma
o b ró b k i proteolitycznej [44, 48]. B iałka trx zaw ierają 1 Tri/GAG A m ogłyby rozluźniać stru k tu rę chro m atyny
region bogaty w cysteiny, położony w centralnej części z nakładem energii, a trx byłby czynnikiem „ k o t
białka i zdolny do tw orzenia palców cynkow ych [21, w iczącym ” n a poziom ie D N A , koniecznym do p rze
44]. M im o to nie u dow o d n io n o bezpośredniego w iąza ciw działania represyjnym białkom Pc-G. W ażnym
nia trx do D N A . W trx w ystępuje rów nież drugi m otyw m echanizm em działania trx-G m oże być p o n ad to
białkow y, położony blisko jego C -końca i w spólny dla w ypętlanie D N A , dzięki czem u odległe enhancery
wielu białek Drosophila, w tym dla Enhancer o f zeste, lo k u ją się blisko miejsc prom otorow ych [44] i w zm ac
przedstaw iciela grupy Pc-G. trx wiąże się do ch ro m o niają transkrypcję.
I R E N E U S Z W. B I E D E R M A N N *
I. Wstęp I. Introduction
II. Ogólny schemat kaskady MAPK II. General scheme of the MAPK cascade
III. Kaskady MAPK występujące u kręgowców III. MAPK cascades of vertebrate cells
IV. Różnicowy wpływ czynników zewnątrzkomórkowych IV. Differential effect of extracellular stimuli on activity of
na aktywność poszczególnych kaskad MAPK particular MAPK cascades
V. Mechanizmy aktywujące kaskady MAPK V. MAPK cascades — mechanisms of activation
VI. Czynniki transkrypcyjne jako substraty kinaz MAP VI. Transcription factors as the substrates of MAPKs
VII. Regulacja aktywności czynnika transkrypcyjnego AP-1 VII. Transcription factor AP-1 regulation as an effect of
jako efekt współdziałania różnych kaskad MAPK cooperation of different MAPKs
VIII. Uwagi końcowe VIII. Concluding remarks
S kładnikam i w ystępującym i we w szystkich znanych Ryc. 1 Aktywacja kaskady M A PK jako podstawowy mechanizm
obecnie w arian tach k ask ady M A P K , zarów no u k rę umożliwiający modulację aktywności czynników transkryp-
gowców ja k i u drożdży, są: (i) kinaza M A P (M A PK , cyjnych w odpowiedzi na pobudzenie receptorów błono
wych.
ang. M itogen-A ctivated Protein K inase), (ii) kinaza Poza przedstawioną tutaj aktywacją MAP3K poprzez fos
aktyw ująca kinazę M A P, określana ja k o M A P K K forylację obecnie znane są inne, praw dopodobnie niezależne
(ang. M A P K inase K inase), oraz (iii) kinaza kinazy od fosforylacji, mechanizmy aktywacji tej kinazy. Ufos-
forylowana kinaza M AP może fosforylować substraty cyto-
aktyw ującej kinazę M A P, określana ja k o M A P K K K plazmatyczne, lub — po przemieszczeniu się do jądra
lub M A P 3 K (ang. M A P K inase K inase K inase). T a komórkowego — substraty jądrowe, głównie czynniki trans
o statn ia kinaza, p o d o b n ie ja k dwie poprzednie, m oże krypcyjne. Kinazy poziomu M A P4K i M A PK A PK nie
występują (lub też nie zostały dotychczas zidentyfikowane)
być ak tyw ow ana przez fosforylację, z tym , że funkcję w części obecnie znanych kaskad M APK. Stosowane skróty
odpow iedzialnej za ten proces kinazy, określanej cza uwzględniono w wykazie pod spisem treści.
T abela 1.
Obecnie znane kaskady M A PK występujące u kręgowców
RECEPTORY BŁONOWE
Białko G RhoA
M AP4K PAK(?)
M AP3K M EKK
i
MAPK ERK FRK JNK
Ryc. 3 Rola niskocząsteczkowych białek G w aktywacji znanych kaskad M A PK występujących u kręgowców. Obecnie uważa się, że
niskocząsteczkowe białka G pośredniczą w aktywacji kaskad M A PK w odpowiedzi na stymulację większości receptorów błonowych,
aktywując odpowiednie M A P3K bezpośrednio lub za pośrednictwem MAP4K. Ze względu na stosowaną metodykę badań (patrz
rozdział V) powiązania między różnymi receptoram i a poszczególnymi białkami G nie są dokładnie poznane i zostały tutaj
przedstawione schematycznie jak o przerywane pogrubione linie. Ciągłymi i przerywanymi liniami normalnej grubości przedstawiono
(odp. główne i alternatywne) drogi prowadzące do aktywacji poszczególnych kinaz MAP. Hipotetycznej kinazie M AP aktywowanej
przez szlak zależny od białka RhoA przypisuje się pewną rolę w regulacji ekspresji genu c-fos (Ryc. 4). Stosowane skróty uwzględniono
w wykazie pod spisem treści.
H A N N A JA Ń SK A 1
M AGDALENA W OŁOSZYŃSKA2
I. Wstęp I. Introduction
II. Organizacja genomu mitochondrialnego II. Organization of mitochondrial genome
III. Charakterystyka zmian towarzyszących CMS III. Characterization of changes associated with CMS
III-l. Zmiany w organizacji genomu mitochondrialnego III-l. Changes in mitochondrial genome organization
III-2. Zmiany w ekspresji III-2. Changes in expression
IV. Geny przywracające płodność IV. Fertility restorer genes
V. Funkcja i lokalizacja URF13 V. Function and localization URF13
VI. Zastosowanie w hodowli VI. Application in breeding
VII. Podsumowanie VII. Concluding remarks
Wykaz stosowanych skrótów: CMS — cytoplazmatyczna sterylnego tytoniu (N icotiana) pręciki nie pow stają lub
męskosterylność; kp — tysiąc par zasad; mtDNA — mito-
są przekształcane w stru k tu ry pod o b n e do płatków
chondrialny DNA; urf, orf — otwarta ramka odczytu; cox I,
cox I I — geny kodujące odpowiednio podjednostkę I, II albo słupka [7]. W rzadkich przypadkach w ytw orzony
mitochondrialnego kompleksu oksydazy cytochromowej; pyłek nie jest zdolny do zapylania [3]. C ytoplaz-
rrn26 — gen kodujący 26S rybosomalny RNA; trnR m atyczną m ęskosterylność zaobserw ow ano u po n ad
(tRNAArg) — gen kodujący RNA transportujący argininę; 140 roślin kw iatow ych. Sterylne osobniki pojaw iają się
kDa — kilodalton; R f — gen przywracający płodność; atpó
niekiedy spontanicznie w populacji roślin, ale więk
— gen kodujący podjednostkę 6 mitochondrialnej syntazy
ATP; URF 13 — białko kodowane przez gen u rf 13 wy szość otrzym ano w rezultacie krzyżow ań w ew nątrz-
stępujący w linii CMS-T kukurydzy; HmT — Helmintho- gatunkow ych, m iędzygatunkow ych oraz m iędzyro-
sporium may dis szczep T; Pm — Phyllosticta may dis. dzajow ych. K rzyżow anie m iędzygatunkow e p ro w a
dzące do alloplazm ii, czyli um ieszczenia ją d ra k o m ó r
I. Wstęp kow ego jednego gatu n k u w środow isku cytoplazm y
innego gatunku, jest źródłem 3/4 znanych fenotypów
Inform acja genetyczna kom órek roślinnych jest p o CM S.
dzielona m iędzy ją d ro , m ito ch o n d ria i chloroplasty, N azw a cytoplazm atyczna m ęskosterylność naw ią
a praw idłow e funkcjonow anie rośliny w ym aga w spół zuje do pozajądrow ego, m atecznego dziedziczenia
działania p ro d u k tó w genów pochodzących z tych w odróżnieniu od m ęskosterylności w arunkow anej
organelli. Z aburzenie interakcji ją d ra i m itochondriów przez genom jąd ro w y nazywanej jąd ro w ą lub M end-
jest przyczyną cytoplazm atycznej m ęskosterylności low ską m ęskosterylnością (M ST) [3], U w aża się, że
(CM S) u roślin wyższych. N ajogólniej cechę tę m ożna m utacje w genom ie m itochondrialnym , a nie c h lo ro
określić ja k o niezdolność rośliny do w ytw arzania plastow ym , są przyczyną cytoplazm atycznej m ęsko
funkcjonalnego pyłku, a więc do zapylania [1-3]. sterylności [1]. F enotypow e zm iany będące rezultatem
Rozwój pyłku m oże być zaburzony n a różnych e ta tych m utacji są jed n ak obserw ow ane tylko w obecno
pach. W większości przypadków m orfologia roślin ści odpow iedniego genom u jądrow ego. Jeśli genom
sterylnych jest norm aln a, a jedynie m ikrosporogeneza jądrow y zaw iera specyficzne restorery (geny przyw ra
jest niepraw idłow a [1, 4]. Często zw iązane jest to cające płodność) to roślina m im o m utacji w genom ie
z niewłaściwym funkcjonow aniem tap etu m [1, 5] m itochondrialnym jest płodna. O becność restorerów
— tk an k i pełniącej odżyw czą funkcję w rozw oju pyłku nie jest w arunkiem koniecznym do tego, aby rośliny
[6]. Rzadziej rośliny sterylne nie w ytw arzają pyłku z niezm utow anym genom em m itochondrialnym stały
z pow o d u zm ienionej m orfologii kw iatu. W kw iatach się płodne. O kazało się, że różne typy C M S (pow odo
w ane przez inny rodzaj m utacji w genom ie m ito ch o n
1 Dr, 2 mgr, Instytut Biochemii, UW, ul. Tamka 2, drialnym ) w ym agają różnych genów przyw racających
50-137 Wrocław płodność [8]. W niektórych przypadkach niezbędna
nego D N A roślin sterylnych i płodnych. B adania dioaktyw nych am inokw asów w m itochondriach izo
porów naw cze prow adzi się rów nież n ad ekspresją low anych ze sterylnych i płodnych roślin. D ru g a
genom u m itochondrialnego. T ranskrypty pojedyncze m eto d a w ykorzystuje przeciw ciała skierow ane przeciw
go genu m ito chondrialnego roślin często różnią się syntetycznem u peptydow i skonstruow anem u n a p o d
p o d względem wielkości [32, 52]. Jest to konsekw encją stawie sekwencji genu skorelow anego z m ęskosteryl
wielu miejsc inicjacji i term inacji w procesie tran sk ry p nością. Stosując te m etody, najwcześniej w ykryto
cji oraz zjaw isk posttranskrypcyjnych. T ranskrypty białko U R F 13 o m asie 13 kD a, w ystępujące tylko
genów chim eralnych czy zm utow anych genów m ito- w C M S typu T kukurydzy [1, 63]. P o d o b n e b ad an ia
chondrialnych skorelow anych z cytoplazm atyczną um ożliwiły rozpoznanie p ro d u k tó w genów chim eral
m ęskosterylnością w ykazują rów nież ta k ą heterogen- nych u petunii (gen p c f białko o m asie 25 kD a) [1, 64],
ność. G eny chim eralne są często kotranskrybow ane u rzodkiew ki (orf 138, białko o m asie 20 kD a) [65],
z jednym [46, 53-56] lub wielu norm alnym i genam i u pszenicy (orf256, białko o m asie 7 kD a) [66]
m ito chondrialnym i [1, 57]. O pisane różnice w zorów i u słonecznika (orfC, białko o m asie 15 kD a) [67, 68].
transkrypcyjnych roślin sterylnych i płodnych dotyczą C echą w spólną tych białek jest ich lokalizacja w błonie
pojaw ienia się u roślin sterylnych specyficznych trans- m itochondrialnej. Jed n ak sposób ich połączenia z b ło
k ryptów [9, 35, 36, 38, 39, 53, 58, 59]. Dalsze bad an ia n ą jest najpraw dopodobniej różny [1].
niekiedy ujaw niają, że niektóre zaobserw ow ane specy
ficzne tran sk ry p ty nie m ają zw iązku z cytoplazm atycz IV. Geny przywracające płodność
n ą m ęskosterylnością [58, 60]. Bliższych inform acji
o tran sk ry p ta ch odpow iedzialnych za sterylność d o Jak już w spom inano, fenotypow e ujaw nienie się
starczają p o ró w n an ia m ap transkrypcyjnych roślin m itochondrialnej m utacji odpow iedzialnej za C M S
sterylnych z roślinam i o takim sam ym genom ie m ito jest uzależnione od jądrow ej inform acji genetycznej.
chondrialnym , ale płodnych dzięki obecności restore- Z b ad a ń wynika, że większość genów jąd ro w y ch
rów w genom ie jąd row ym (rozdział IV). przyw racających płodność działa posttranskrypcyjnie
O statn io opu b likow ano kilka prac sugerujących, że i/lub posttranslacyjnie [1-3]. P o w o d u ją one zm iany
zaburzenia procesu redagow ania (ang. editing) [50, 61, lokalizacji końców tran sk ry p tó w regionów skorelow a
62] lub sk ład an ia R N A (ang. splicing) [53] m ogą być nych z cechą C M S [69, 70] i/łub inne stosunki
przyczyną CM S. Jeden z takich przypadków przed ilościowe m iędzy tran sk ry p tam i [57]. W konsekw encji
stawim y w rozdziale IV. Z m iany n a poziom ie tra n s obserw uje się obniżenie ilości [6 4 ,6 5 ,7 1 ] lub brak [66]
krypcji zostały opisane u wielu gatunków roślin, ale białek charakterystycznych dla cytoplazm m ęsko-
tylko w kilku p rzypadkach zidentyfikow ano białka sterylnych. Stw ierdzono, że redukcja poziom u tych
unikalne dla roślin sterylnych. Dwie m etody badaw cze białek m oże zachodzić tylko w pew nych częściach
um ożliw iają ta k ą identyfikację. Jed n a z nich opiera się rośliny, n a przykład w tkance rozrodczej fasoli zwykłej
n a p o ró w n an iu białek pow stających w obecności ra [71], w kw iatach i liściach rzodkiew ki [65]. Ciągle
M AGDALENA BOGUTA*
I. Wstęp I. Introduction
II. Mitochondrialny genom Saccharomyces cerevisiae II. Mitochondrial genome in yeast
III. Mutacje mitochondrialne III. Mitochondrial mutations
IY. Dziedziczenie mitochondriów i mechanizm utrzymywa IV. Mitochondrial inheritance and maitenance of mtDNA
nia mtDNA V. Replication and transcription of mtDNA
V. Replikacja i transkrypcja mtDNA VI. RNA stability and splicing
VI. Stabilność i obróbka transkryptów mitochondrialnych VII. Mitochondrial translation
VII. Translacja mitochondrialna VIII. Modification, assembly and degradation of mitochond
VIII. Modyfikacja, degradacja i włączanie białek mitochon- rial protein
drialnych w kompleksy IX. Mitochondrial control of nuclear functions
IX. Mitochondria regulują funkcję jądra komórkowego X. Conclusions
X. Podsumowanie
in tro n ó w m itochondrialnych. G en SU V 3 koduje heli- kodującego je intronu. N ależą one do rodziny białek
kazę RNA, a p ro d u k t genu N A M I nie w ykazuje zaw ierających charakterystyczne m otyw y sekwencji
istotnego po d o b ień stw a do innych białek [40, 44, 45]. am inokw asow ej L A G L I-D A D G . In tro n y grupy II
Trzy geny m ito ch o ndrialne S. cerevisiae, C O X I, k o d u ją m aturazy, k tó re w ykazują znaczące pod o b ień
COB i L S U zaw ierają intro n y (Ryc. 1). Ilość in tro n ó w stwo sekwencji do odw rotnych tran sk ry p taz retro-
jest zależna od szczepu; gen C O X I zaw iera m aksym al w irusów [3].
nie 7 intronów , gen COB — m aksym alnie 5 intronów , Sekwencje intronow e kodujące m atu razy są zgodne
zaś gen L S U p o siad a 1 in tro n lub występuje w formie w fazie i ciągłe z sekwencjam i poprzedzających ek-
bezintronow ej. S k o n struow ano szczep laboratoryjny, sonów, co um ożliw ia kaskadow y proces w ycinania
k tó ry nie posiad ał w ogóle in tro n ó w m ito ch o n d rial kolejnych intronów przedstaw iony schem atycznie na
nych. B rak in tro n ó w nie wywołuje zauw ażalnych rycinie 3. Wycięcie pierw szego in tro n u genu COB,
zm ian fenotypow ych i nie zab u rza funkcji m ito ch o n niezależne od m aturazy, pow oduje połączenie się
drialnych [46]. dw óch pierw szych eksonów , B I i B2. T ranslacja obu
In tro n y m ito ch o n d rialne dzieli się n a dwie grupy (I tych eksonów w raz z sekwencją k odującą stanow iącą
i II) w zależności od przew idyw anej stru k tu ry drugo- 5' koniec drugiego in tro n u prow adzi do pow stania
rzędowej. W ykazano, że w w aru n k ach in vitro introny m aturazy. K atalityczna ilość m aturazy w ystarcza do
m ito ch o n d rialn e są zdolne do sam ow ycinania, a m e wycięcia drugiego intronu, co prow adzi do połączenia
chanizm tej reakcji różni się nieznacznie dla intronów B I, B2 i B3. Teraz sekwencja k odująca in tro n u trzecie
o b u grup [47]. W iększość in tro n ó w m ito ch o n d rial go leży bezpośrednio za sekwencją trzech połączonych
nych grupy I zaw iera o tw a rtą ram kę odczytu (O R F) eksonów i tak m oże ulegać translacji n astęp n a m atu ra-
k od u jącą bąd ź białko uczestniczące w w ycinaniu (ma- za, k tó ra bierze udział w w ycinaniu trzeciego intronu.
turazę), bądź w ro zprzestrzenianiu (endonukleazę) Ilość m aturazy w kom órce jest tak niska, że jej
MOD5-M2 + +
MOD5-M1 u------------------- P U * . + +
Ryc. 2 Lokalizacja subkom órkow a powstających izoenzymów M O D 5 [37]. Dwa kodony inicjacyjne A UG są zgodne w fazie i odległe o 12
aminokwasów. Sekwencje odpowiedzialne za transport do mitochondriów przedstawiono jako czarny blok, sekwencje kierujące do
jąd ra kom órkowego zakreskowano.
I T ir' «
indentyfikacja jest m ożliw a jedynie w m u tan tach , posiadającego in tro n u i nacina obie nici. D w uniciow a
w któ ry ch w ystępują specyficzne defekty w w ycinaniu przerw a jest n ap raw ian a n a bazie istniejącej m atrycy,
in tro n ó w [48]. k tó rą stanow i gen w raz z intronem . T akże i sekwencje
Część in tro n ó w m itochondrialnych grupy I koduje sąsiadujące z intronem ulegają powieleniu. W b u d o w a
endonukleazy, k tó re um ożliw iają m obilność intronu, ny in tro n m oże ulegać ekspresji p ro d u k u jąc endonu-
co w ykazano m etodam i klasycznej genetyki [11]. kleazę.
M echanizm procesów zw iązanych z m obilnością in O statn io opisano także m echanizm addycji dla
tro n ó w grupy I przedstaw iono schem atycznie n a ryci in tro n ó w grupy II na przykładzie in tro n u ai2 genu
nie 4 [49]. Delecje i addycje intronów m ito ch o n d rial C O X I. Proces ten nazw ano “retro h o m in g ”, gdyż p rze
nych znajdują potw ierdzenie dośw iadczalne. Z arów no niesienie in tro n u do allelu bezintronow ego zachodzi
pow ielanie in tro n ó w ja k ich delecje nie w pływ ają na poprzez o d w ro tn ą transkrypcję m R N A allelu zaw iera
funkcję oddechow ą m itochondriów . Stw ierdzono ist jącego intron. B iałko kodow ane przez in tro n ai2
nienie spontanicznych m itochondrialnych rew ertan- spełnia rów nocześnie 3 funkcje: m aturazy, en d o n u
tów, w któ ry ch następuje delecja jednego lub większej kleazy i odw rotnej transkryptazy, przy czym za k ażdą
ilości intronów . D elecja in tro n u następuje dokładnie z funkcji odpow iada określona dom ena białka [50].
n a granicy intron-ekson. Addycję in tro n u grupy O pisano ciekaw ą m utację w sekwencji e n d o n u
I w hom ologiczne miejsce genu bezintronow ego n az kleazy in tro n u czw artego genu C O X I, k tó ra k o m p en
w ano “in tro n ho m in g ”. E ndonukleaza pow stała w wy suje defekt m aturazy genu COB [51]. Z atem pojedyn
niku translacji sekwencji intronow ej rozpoznaje specy cza substytucja am inokw asu w ystarczy aby e n d o n u
ficzne miejsce w D N A hom ologicznego genu nie kleaza była zdolna do funkcjonow ania ja k o m atu raza.
DELECJA INTRONU
Gen X
A N N A M. RYCHTER*
I. Wstęp I. Introduction
II. Dehydrogenazy NAD(P)H roślinnego łańcucha oddecho II. Plant respiratory chain NAD(P)H dehydrogenases
wego II-l. External NAD(P)H dehydrogenases
II-I. Zewnętrzne dehydrogenazy NAD(P)H II-l.l. Characteristics of external NAD(P)H dehydroge
II-l.l. Charakterystyka zewnętrznych dehydrogenaz nases
NAD(P)H II-1.2. Physiological role of external NAD(P)H dehy
11.1.2. Rola fizjologiczna zewnętrznych dehydrogenaz drogenases
NAD(P)H II-2. Internal NADH dehydrogenases
II-2. Wewnętrzne dehydrogenazy NADH II-2.1. Internal NADH dehydrogenase (inhibited by rote
II-2.1. Kompleks I, dehydrogenaza NADH (hamowana non), Complex I
przez rotenon) II-2.2. Internal NADH dehydrogenase, rotenon insen
11.2.2. Dehydrogenaza NADH niewrażliwa na rotenon sitive
III. Oksydaza alternatywna III. Alternative oxidase
III-l. Charakterystyka oksydazy alternatywnej III-l. Characteristics of alternative oxidase
III-2. Regulacja przepływu elektronów przez drogę cyto- III-2. Regulation of electron flux between cytochrome
chromową i alternatywną and alternative pathways
III-3. Oznaczanie aktywności drogi alternatywnej III-3. Determination of the activity of alternative path
III-4. Rola fizjologiczna drogi alternatywnej way
IV. Uwagi końcowe III-4. Physiological role of alternative pathway
IV. Concluding remarks
H+ N AD (P)H
f Przestrzeń międzybłonowa
KCN
Matriks
Ryc. 1 Schemat roślinnego łańcucha oddechowego, zmodyfikowano wg [6 i 10], B.w. — wewnętrzna błona m itochondrialna, w której
umieszczony jest łańcuch oddechowy; I, II, III i IV — oznaczono kolejno kompleksy łańcucha oddechowego, strzałkami oznaczono
miejsca i kierunek translokacji protonów; podwójnymi strzałkami oznaczono fragmenty łańcucha, z których przeniesienie elektronów
nie jest związane z translokacją protonów; grubą kreską oznaczono miejsce ham ow ania przez rotenon, K C N i SHAM; Q — ubichinon;
deh.z. i deh.w. — odpowiednio zewnętrzne i wewnętrzne dehydrogenazy NAD(P)H, niewrażliwe na rotenon; Alt. — oksydaza
alternatywna; b, c1# c, a 3, a — cytochromy tworzące tzw. łańcuch cytochromowy.
R ola fizjologiczna drogi alternatyw nej ja k o procesu W ciągu ostatnich pięciu lat techniki biologii m ole
generującego ciepło wydaje się być bezsporna jedynie kularnej niew ątpliw ie b ardzo posunęły n ap rzó d b a d a
u Araceae [47], U innych roślin poziom w ytw arzania nia n ad stru k tu rą i ro lą fizjologiczną oksydazy a lter
ciepła przez drogę alternatyw ną jest zbyt mały, aby natyw nej. D ostępność przeciw ciał oksydazy altern aty
m iał jakiekolw iek znaczenie fizjologiczne. H ipoteza wnej oraz klonów cD N A pozw ala śledzić ekspresję
„przelew u” (overflow) w ysunięta przez L a m b e r s a o ddychania niew rażliw ego n a cyjanek n a poziom ie
opisyw ała stany fizjologiczne w jak ich m oże funkc R N A i białka z jednoczesnym i pom iaram i gazom et-
jo n o w ać d ro g a alternatyw na, przy wy syconej drodze rycznym i (pobieranie tlenu). O trzym anie roślin tran s-
cytochrom ow ej [94-96]. W pew nych w arunkach (np. genicznych ze zw iększoną lub zm niejszoną ekspresją
w zrost zaw artości cukrów w kom órce i w ynikający oksydazy alternatyw nej um ożliwi określenie jej roli
z tego intensyw niejszy ich przepływ przez szlak glikoli- w procesach w zrostu i rozw oju roślin.
tyczny) m oże w ystąpić b rak rów now agi pom iędzy O znaczenie udziału w oddychaniu niefosforylującej
oksydacyjnym m etabolizm em węgla a m ożliw ością drogi alternatyw nej oraz m echanizm ów zw iązanych
przepływ u elektronów przez łańcuch cytochrom ow y. z regulacją tego udziału m a ogrom ne znaczenie dla
D ro g a cy tochrom ow a m oże być w ysycona przy sp ad określenia w ydajności energetycznej odd ychania
k u A D P , ograniczeniu aktyw ności jednego ze skład [102]. U pew nych roślin (Lolium perenne) obserw uje
ników łań cu ch a oddechow ego [66, 73, 79], lub przy się negatyw ną korelację m iędzy w ysokością p lo n o w a
deficycie P i [97, 98]. W tedy, przy zw iększonym m eta nia a intensyw nością oddychania. M oże to być m.in.
bolizm ie oksydacyjnym , następuje uruchom ienie drogi w ynikiem różnej intensyw ności oksydacyjnej fosfory
alternatyw nej. W ydaje się jednak, że hipoteza ta m usi lacji [95]. W ydaje się więc, że określenie udziału
ulec pewnej m odyfikacji i uwzględnić udział drogi w oddychaniu drogi alternatyw nej jest o wiele bardziej
alternatyw nej przy nie całkow icie wysyconej drodze istotne niż to się do tej pory w ydaw ało, a d o ty ch
cytochrom ow ej, a także uwzględnić regulację aktyw czasowe wyliczenia w ydajności energetycznej o d d y
ności drogi alternatyw nej tn vivo przez p irogronian chania roślin in vivo m ogą być n a znacznie zaniżonym
i potencjał redukcyjny w ew nątrz m itochondriów . Jak poziom ie. D o tych zad ań niezbędny jest rozwój n o
w ykazały o statnie badania, w izolow anych m ito ch o n wych m etod pozw alających n a precyzyjne określenie
driach tytoniu, w arunkiem uruchom ienia drogi alter udziału obu dróg, drogi alternatyw nej i cy to ch ro m o
natyw nej jest spadek poziom u A D P , w zrost siły red u k wej w oddychaniu roślin.
cyjnej w ew nątrz m itochondriów , (niezbędnej do re
dukcji w iązania disiarczkow ego) oraz obecność piro- Napisanie tego artykułu było możliwe dzięki sfinansowaniu
gro n ian u (p o trzeb n a do stym ulacji zredukow anej for przez Grant KBN 6P2043705 uczestnictwa autorki w Kon
m y oksydazy alternatyw nej) [73]. ferencji „Plant Mitochondria from Gene to Function”.
In n ą interesującą hipotezą opisującą rolę fizjologicz A rtyku ł otrzym ano 6 lutego 1996 r.
n ą oksydazy alternatyw nej jest jej udział w regulacji Zaakceptow ano do druku 20 marca 1996 r.
poziom u p o n ad tlen k ó w i nadtlenków w odoru w tk a n
ce [87, 101]. N ad tlen k i w odoru m ogą odgryw ać rolę
Piśmiennictwo
w indukcji ekspresji genu oksydazy alternatyw nej [87].
W w aru n k ach stresu spow odow anego chłodem [99-
1. H r y n i e w i e c k a L (1993) Post Biol Komórki 20: 181-199
101], inw azją pasożytów , zranieniem [96], czy też 2. Do u c e R, B r o u q u i s s e R, J o u r n e t E- P (1987) W:
o gran iczo n ą d o stępnością fosforanu [97,98] następuje Davies D.D (red) The Biochemistry of Plants: A Comprehensive
uruchom ienie odd y chania niewrażliwego n a cyjanek. Treatise, t 11 Academic Press, San Diego, Ca, str. 177-221
3. D o u c e R (1985) W: Mitochondria in Higher Plants: Structure,
W tedy, przy ograniczonej aktyw ności drogi cy to ch ro Function, and Biogenesis. Academic Press, Orlando, Florida
mowej i zwiększonej redukcji ubichinonu, n a terenie 4. Do u c e R, N e u b u r g e r M (1989) Annu Rev Plant Physiol
m ito ch o n d rió w m oże dochodzić do w ytw arzania po- Plant M ol Biol 40: 371-414
5. Mo o r e A L , S i e d o w J N (1991)Biochim BiophysActa 1059:
n ad tlen k u lub n ad tlen k u w odoru [101]. Sugeruje się, 121-140
że udział w o d d ychaniu drogi alternatyw nej m oże 6. S i e d o w JN, U m b a c h AL (1995) Plant Cell 7: 821-831
ograniczać ich w ytw arzanie [87, 101]. Z ap ro p o n o w a 7. P a l m e r JM, Mö l l e r I M (1982) TYends Biochem Sci 7:
258-261
n a ostatn io hip o teza regulacji aktyw ności i indukcji 8. P a l m e r JM, Wa r d JA (1985) Encycl Plant Physiol 18:
oksydazy alternatyw nej uw zględnia zarów no stym ula 173-201
cję aktyw ności oksydazy alternatyw nej przez kw asy 9. Mö l l e r IM, Li n W (1986) Annu Rev Plant Physiol 37:
309-334
organiczne zapobiegającą zwiększonej redukcji ubichi 10. Mö l l e r IM, R a s m u s s o n AG, F r e d l u n d KM (1993)
n o n u ja k i udział nadtlenków w indukcji ekspresji genu J Bioenerg Biomembranes 25: 377-384
K A T A R Z Y N A K U C Z E K 1,
M A G D A L E N A K O T O W S K A 2,
M A R IA N M O R D A R S K I3
I. Wstęp I. Introduction
II. Syntazy poliketydowe II. Polyketide synthases
III. Geny syntaz poliketydowych III. Genes of polyketide synthases
IY. Próby sterowania biosyntezą IV. Attempts of programming of biosynthesis
IV-1. Badanie mutantów zablokowanych na poszcze IV-1. Investigation of mutants blocked on different
gólnych etapach biosyntezy stages of biosynthesis
IV-2. Heterologiczna ekspresja genów IV-2. Heterologous gene expression
IV-3. Badanie funkcji natywnego kompleksu syntazy IV-3. Investigation of synthase complex expressed in
podlegającego ekspresji w komórkach Escheri Escherichia coli
chia coli IV-4. Investigation of enzyme complex in cell free
IY-4. Badanie funkcji wyselekcjonowanego zespołu en systems
zymów PKS w układzie pozakomórkowym IV-5. Gene sequence analysis
IV-5. Analiza sekwencji genów V. Concluding remarks
V. Podsumowanie
Wykaz stosowanych skrótów: PKS — syntaza poliketydowa; zw iązków, do której zalicza się roślinne flaw onoidy,
minPKS — minimalny zestaw genów' syntazy; DEBS — syn toksyny grzybow e oraz liczne związki pochodzenia
taza 6- dezoksyerytronolidu B; SU — jednostka syntazy; AT
bakteryjnego [1-3] (Ryc. 1). Wiele z nich wykazuje
— acylotransferaza; ACP — białkowy czynnik przenoszący
grupy acylowe; KS — syntaza P-ketoacylowa; KR — ketore- właściwości przeciw bakterjne, przeciwgrzybicze, prze-
duktaza; DH — dehydrogenaza; ER — enoiloreduktaza; TE ciw now otw orow e, a naw et toksyczne w obec p asoży
— tioesteraza; CLF — czynnik determinujący długość tów przew odu pokarm ow ego kręgow ców [3-7]. N ie
łańcucha; ARO — aromataza; CYC — cyklaza; MT k tó re połiketydy pochodzenia grzybow ego i b ak tery j
— 0-metylotransferaza.
nego odgryw ają rolę regulatorów w zrostu i różnicow a
nia kom ó rk i [8]. F u n k cja biologiczna większości
I. Wstęp z nich nie jest jed n ak znana. B ogatym źródłem poli-
ketydów są prom ieniow ce — G ram -d o d atn ie bakterie
N azw a „połiketydy” oznacza klasę zw iązków wy
glebowe. C h arak tery zu ją się złożonym cyklem ro z
tw arzanych w w yniku szeregu reakcji kondensacji
wojowym , podczas którego w ytw arzają wiele m etab o
reszt acylow ych k ró tk ich kw asów karboksylow ych
litów w tórnych, m.in. zw iązków poliketydow ych. N a j
oraz reakcji ich redukcji w sposób p o d o b n y do syntezy
bardziej znanym i z tej grupy są antybiotyki m ak ro -
kw asów tłuszczowych. Jest to heterogenna grupa
lidow e oraz tetracykliny. N ależą do nich po n ad to :
antracykliny, polieny, polietery oraz pochodne chino-
3Dr, 2mgr inż.,3prof., Instytut Immunologii i Terapii nowe [9]. B adania dotyczące m echanizm u biosyntezy
Doświadczalnej PAN ul. Czerska 12, 53-114 Wrocław. poliketydów zm ierzają do utw orzenia kontrolo w an e-
CO,H
AKTYNORODYNA
STILBEN
<, OH OH N(CH3)2
,OH
CONH,
Oh II
OH O OH O
COOCH,
[10]. W ielofunkcyjny polipeptyd składa się z p o w tó rzają do ich w yjaśnienia i w ykorzystania w p ro g ram o
rzonych regionów , zw anych jed n o stk am i syntazy (syn- w aniu syntez now ych zw iązków in vivo.
thase units - SU), katalizujących kolejne cykle re d u k
cyjne. K a żd a je d n o stk a skupia centra katalityczne III. Geny syntaz poliketydowych
poszczególnych reakcji doprow adzających do k o n d en
sacji i całkow itej lub częściowej redukcji pow stającego W yodrębniono i sklonow ano geny kilkunastu syn
łańcucha. W szystkie SU zaw ierają syntazę P-ketoacy- taz poliketydow ych prom ieniow ców . G eny każdego
low ą (KS), acylotransferazę (AT) i białkow y czynnik z dotychczas scharakteryzow anych zespołów syntaz są
przenoszący grupy acylowe (ACP), różnią się liczbą zgrupow ane w jednym regionie genom u. Tow arzyszą
dom en k eto red u k tazy (KR), dehydrogenazy (DH) im geny oporności (jeśli poliketyd jest antybiotykiem )
i en oiloreduktazy (ER). D om eną kończącą syntezę oraz geny enzym ów w prow adzających postpolikety-
szkieletu poliketydow ego jest tioesteraza (TE). K ażde dow e m odyfikacje w szkielecie związku.
centrum aktyw ne jest w ykorzystyw ane tylko raz p o d W przy p ad k u wszystkich zbadanych syntaz typu
czas syntezy jednej cząsteczki pro d u k tu . I geny są długim i jed n o stk am i transkrypcyjnym i (ok.
D o typu I zaliczana jest m.in. syntaza aglikonow ej 10 tysięcy p ar zasad). K ażd a z nich koduje wszystkie
części m ak ro lid u — erytrom ycyny Saccharopolyspora enzym y uczestniczące kolejno w cyklach w ydłużania
erythraea oraz inne m akrolidow e syntazy prom ieniow i redukcji łańcucha węglowego. P ełną sekwencję nuk-
ców i aw erm ektyny Streptom yces avermitilis, tylozyny leotydow ą pozn an o jedynie w przy p ad k u genów syn
Streptom yces fradiae, spiram ycyny Streptom yces am- tazy dezoksyerytronolidu B (6-deoxyerythronolide
bofaciens oraz karbom ycyny Streptom yces thermotole- B synthase - D E B S) czyli aglikonow ej części eryt-
rans [11-13]. rom ycym y A. Sekwencja ta obejm uje około 56 tys. p ar
Syntaza ty p u II stanow i kom pleks kilku zasoc- zasad tw orzących trzy jed n o stk i transkrypcyjne (ot
jow anych enzym ów , z których każdy jest w ielokrotnie w arte ram ki odczytu): ery A l, e ry A II i e r y A III (Ryc. 3).
aktyw ny w ciągu syntezy jednego zw iązku [9]. Te K ażd a ra m k a odczytu zaw iera po dw a m oduły, z k tó
enzym y to KS, AT, A C P, czynnik determ inujący rych każdy koduje ciąg dom en enzym atycznych skła
długość łań cucha (chain length determining fa ctor dających się n a jed n o stk ę syntazy. Liczba m odułów
- CLF), K R , cyklaza (CYC) i aro m a taza (ARO). D o w zespole genów syntazy odpow iada liczbie cykli
typu II należy syntaza kw asów tłuszczow ych Escheri- kondensacji i redukcji. T ak więc w zespole genów
chia coli oraz wszystkie znane syntazy arom atycznych D EB S w ystępują trzy jed n o stk i transkrypcyjne sk u
p oliketydów u prom ieniow ców rodzaju Streptomyces. piające po dw a m oduły. O dpow iada to łącznie sześciu
Ze względów funkcjonalnych został w yróżniony reakcjom kondensacji i tow arzyszących im redukcji
trzeci typ syntazy, w ystępujący wyłącznie u roślin podczas syntezy erytrom ycyny. P o n ad to , ciąg dom en
wyższych. C h arak teryzuje się on brakiem A C P. Jego enzym atycznych kodow anych przez dany m oduł o d
funkcje przejm uje koenzym A zestryfikow any kw asam i pow iada dokładnie kolejności reakcji, k tó re zachodzą
karboksylow ym i [14, 15]. w określonym cyklu. T ak więc stru k tu ra i długość
G enetyczne pod staw y p ro g ram o w an ia stru k tu ry łańcucha poliketydu jest zap ro g ram o w an a przez linio
poliketydu były do niedaw na całkow icie nieznane. wą sekwencję genów [16].
P ro w ad zo n e obecnie w kilku o środkach b ad a n ia zmie- A naliza D N A izolow anego z różnych szczepów
(1)
(2)
(3)
(4)
Ryc. 3 O rganizacja genetyczna syntazy 6 -dezoksyerytronolidu B (DEBS) i jej modyfikacje (wg [28], zmodyfikowano, reprodukcja za zgodą Am
Assoc Adv Sei).
(1) -— naturalny produkt DEBS, 6 -dezoksyerytronolid B;
(2), (3), (4) produkty DEBS zmodyfikowanej przez, odpowiednio, delecję domeny KR z m odułu 5, inaktywację domeny ER z modułu 4,
przeniesienie domeny TE z m odułu 6 na koniec modułu 2.
AT — acylotransferaza, A CP — białkowy czynnik przenoszący grupy acylowe, KS — syntaza ß-ketoacylowa, K R — ketoreduktaza, DH
— dehydrogenaza, ER — enoiloreduktaza, TE — tioesteraza.
Streptom yces, kodującego enzym y biosyntezy innych jest bardzo p o d obne we w szystkich syntazach (Ryc. 4).
m akrolidów takich jak: tylozyna, spiram ycyna, aw er- G eny różnych syntaz kodujące KS, AT, C L F i A C P
m ektyna, k arb o m y cy n a czy kandycydyna sugeruje m ają niem al identyczną wielkość i w zajem ne położenie
p o d o b n ą organizację m olekularną. Zespoły genów [17-24]. W przypadku tego typu organizacji ułożenie
biosyntezy tych m ak ro lidów obejm ują znacznie więk genów nie pozw ala w nioskow ać o kolejności reakcji,
szy region genom u w p o ró w n an iu z zespołem ery t a co za tym idzie — o strukturze p ro d u k tu .
rom ycyny: aw erm ektyny — 95 tys. p a r zasad, tylozyny
— 80 tys. pz i kandycydyny — 105 tys. pz. IV. Próby sterowania biosyntezą
W kom pleksie syntazy typu II poszczególne enzym y
są kodow ane przez osobne geny. U łożenie tych genów D ośw iadczenia prow adzące do otrzym ania polike-
SE K 15 (tem m inPK S)
Do członków
Polskiego Towarzystwa Biochemicznego
A G N I E S Z K A Ł U G O W S K A 1,
A N N A T Y L K I-S Z Y M A Ń S K A 2
I. Wstęp I. Introduction
II. Árylosulfataza A i substrat jej działania II. Arylsulfatase A and substrate of its action
III. Defekt biochemiczny przyczyną leukodystrofii meta III. Biochemical defect in metachromatic leukodystrophy
chromatycznej IV. SAP-B activator
IV. Aktywator SAP-B V. Arylsulfatase A pseudodeficiency
V. Pseudodeficyt arylosulfatazy A VI. Defect of posttranslational modification of sulfatases
VI. Defekt posttranslacyjnej modyfikacji sulfataz VII. Molecular bases of arylsulfatase A defects
VII. Molekularne podstawy defektów arylosulfatazy A
Wykaz stosowanych skrótów: LDM — leukodystrofia meta- U pacjentów z leukodystrofią m etachrom aty czn ą
chromatyczna; ASA — arylosulfataza A; Tf-a ASA — prze obserw uje się postępującą demielinizację, k tó ra jest
ciwciała przeciw ASA, połączone z transferyną; SAP-B
przyczyną objaw ów neurologicznych, takich jak: z a b u
— ang. sphingolipid activator protein-B; GABA — kwas
y-aminomasłowy; ASA-PD — pseudodeficyt arylosulfatazy rzenia chodu, ataksja, niedow ład kończyn, zanik n er
A; MSD — ang. multiple sulfatase deficiency, brak wielu wów w zrokow ych, n ap ad y drgaw ek, dem encja.
sulfataz; pz — pary zasad; nt — nukleotyd. W yróżnia się trzy typy leukodystrofii m etac h ro m a
tycznej n a podstaw ie w ieku w ystąpienia pierw szych
objaw ów oraz przebiegu choroby [1]: późnoniem o-
I. Wstęp wlęcy (pierwsze objaw y w wieku 1-2 lat), m łodzieńczy
(3-16 lat), dorosłych (powyżej 16 lat). P o stęp choroby
L eukodystrofia m etachrom atyczna (L D M ) jest ge
u dorosłych jest pow olny i charakteryzuje się obecnoś
netycznie uw aru n k o w anym schorzeniem m etabolicz
cią objaw ów psychotycznych.
nym , spow odow anym deficytem aktyw ności arylosul
fatazy A (ASA) (EC 3.1.6.1.) prow adzącym do spich-
rzan ia galaktozylosulfatydu (siarczanu cerebrozydu)
II. Arylosulfataza A i substrat jej działania
w lizosom ach kom órki. M im o, że spichrzanie galak
A rylosulfataza A (ASA) jest sp o ty k an a we w szyst
tozylosulfatydu dotyczy wszystkich kom órek organiz
kich tk an k ac h i płynach ustrojow ych. Białko enzym u
m u, to jed n ak zm iany patologiczne przebiegają głów
zostało w yizolow ane z różnych źródeł, m.in. ludzkiej
nie w m ielinie ośrodkow ego u k ład u nerw ow ego oraz
w ątroby, łożyska i m oczu, tkanek jeżow ca, szczura,
mielinie nerw ów obw odow ych. G alaktozylosulfatyd
świni [2-4].
oraz laktozylosulfatyd (w m niejszym stopniu) spich-
ASA jest kw aśną glikoproteiną o niskim pi, co wiąże
rzają się rów nież w nerkach, pęcherzyku żółciowym
się z dużą zaw artością kw asu glutam inow ego i a sp a ra
oraz innych n arząd ach w ew nętrznych. Sulfatydy są
ginowego. Zaw iera rów nież duże ilości proliny. P o w y
w ydalane w dużych ilościach z m oczem i żółcią.
żej p H 6.5 enzym istnieje ja k o m onom er o m asie
W p re p ara ta ch histologicznych sulfatydy tw orzą
cząsteczkowej ok. 100 kD a. ASA m oże polim eryzow ać
stru k tu ry kuliste, barw iące się m etachrom atycznie pod
w zależności od p H środow iska tw orząc dim er przy p H
wpływem fioletu krezylu (m etachrom azja) [1].
4.5. Enzym pochodzący z ludzkiego m oczu składa się
z dw óch podjednostek o m asach 54 i 63 kD a, n a to
1 Mgr, Instytut Pomnik Centrum Zdrowia Dziecka, Za m iast pochodzący z ludzkiej w ątroby, łożyska i fibro-
kład diagnostyki Laboratoryjnej, Al. Dzieci Polskich 20, blastów składa się z dw óch podjednostek o m asach 55
04-736 Warszawa, i 64 k D a [5, 6].
2 doc. dr hab n. med., Instytut Pomnik Centrum Zdrowia
Dziecka, Zespół Chorób Metabolicznych, Al. Dzieci Pol W kom órce ASA jest um iejscow iona w lizosom ach,
skich 20; 04-736 Warszawa gdzie praw d o p o d o b n ie tw orzy dimery.
H H
CHaOH
c - c - c H r o ,a
T
4 -H są ,
OH
H ydroliza niek tó ry ch sfingolipidów w ym aga działa N iską aktyw ność ASA obserw uje się rów nież w o k o
nia m ałych glikoprotein zw anych SAP (ang. sphin- ło 5-15% ogólnej populacji. W grupie tej znajdują się
golipid activator proteins) lub sapozynam i. B iałka te osoby klinicznie zdrow e [36], ja k rów nież „nietypow i”
działają ja k detergenty rozpuszczając hydrofobow e pacjenci z innym i niż L D M schorzeniam i neurologicz
su b straty lipidow e lub bezpośrednio aktyw ują nie nym i lub psychiatrycznym i [37]. Zjaw isko obniżenia
k tó re enzym y lizosom alne. ASA m oże hydrolizow ać aktyw ności ASA do 10-30% średnich w artości n o r
O 3.1kb
zygotycznym p ro w ad zą do późnoniem ow lęcej form y nych określonych rejonach genu nie jest niczym nie
L D M . M utacje ty p u R (lub A) cechują się niską zwykłym.
aktyw nością resztkow ą enzymu. W stanie hom ozygo- L eukodystrofia m etachrom atyczna jest ch o ro b ą
tycznym m utacje typu R prow adzą do postaci d o ro dziedziczoną autosom alnie, recesywnie. O gólną czę
słych L D M . H eterozygotyczność m utacji typu stość w ystępow ania L D M m ożna oszacow ać tylko
0 i R w ystępuje najczęściej u pacjentów z typem w przybliżeniu, gdyż jest ona różna w zależności od
m łodzieńczym L D M . badanej populacji i w ykryw alności klinicznej choroby
D w a spośród zm utow anych alleli — 459 + I G > A (rozpoznaw alności). W północnej Szwecji częstość w y
oraz P426L — stanow ią razem ok. 50% w ykryw anych stępow ania późnoniem ow lęcego typu L D M ustalo n o
m utacji u pacjentów z L D M [48, 49, 51]. M utacja n a 1:40000 [53], we F rancji — 1:130000 [54], w śród
459 + IG > A (typ 0) polega n a zam ianie G -> A w pozy Ż ydów habanickich w Izraelu — 1:75 [55], w USA
cji n t 609 genu, czego skutkiem jest u tra ta donorow ego — 1:100000 urodzeń [1], w stanie W ashington
m iejsca cięcia dla posttranskrypcyjnej o b róbki m R N A — 1:40000 [46]. C zęstość w ystępow ania allelu pseu-
— sk ład an ia (splicing). U pacjentów będących hom o- dodeficytu arylosulfatazy A (ASA-PD) w ogólnej p o
zygotam i tego allelu praw ie nie w ykryw a się ASA pulacji ustalono n a 7.3-15% [1, 57-59], n ato m iast
m R N A . M u tacja P 426L (typ R) polega n a tranzycji hom ozygot P D /P D n a 0.5-2% [1].
C -> T w pozycji n t 2381 genu, co pow oduje zam ianę
Pro426 w Leu. P ro d u k t zm utow anego genu wykazuje A rtyku ł otrzym ano 6 listopada 1995 r.
pew ną aktyw ność enzym atyczną, ale jest bardzo nie Z aakceptow ano do druku 30 kwietnia 1996 r.
stabilny.
H o n k e zauw ażył, że m utacje L D M g rupują się Piśmiennictwo
w regionie 5' genu, szczególnie w eksonach 2 i 3 [52].
O koło połow y w szystkich m utacji um iejscow iono w ła 1. K o l o d n y E H , F l u h a r t y A L (1995) W: Scriver CR,
śnie w tych dw óch eksonach [46]. G dy p o rów nano Beaudet AL, Sly WS, Valle D (red) The M etabolie and M olecu
lar Bases of Inherited Disease, wyd. 7, Me Graw-Hill, New York,
sekwencje am inokw asow e sulfataz izolow anych od str 2693-2739
różnych ssaków stw ierdzono, że stopień hom ologii 2. S a s a k i H, Y a m a d a K, A k a s a k a K, K a w a s a k i H,
maleje od regionu N -końcow ego w kierunku regionu S u z u k i K, S a i t o A, S a t o M, S h i m a d a H (1988) Eur
J Biochem 177: 9
C -końcow ego. N ajw iększy stopień hom ologii w ykaza 3. V a n d e r P a l R H , K l e i n W, V a n G o l d e L M, L o -
no po ró w n u jąc sekwencje kodow ane przez ekson 2. p e s - C a r d o z o M (1990) Biochim Biophys Acta 1043: 91
Jeśli stopień hom ologii sekwencji am inokw asów o d 4. S e l m i S, M a i r e J, R o u s e t t B (1989) Arch Biochem
Biophys 273: 170
zw ierciedla funkcjonalne znaczenie danego regionu 5. D r a p e r R K , F i s k u m G M , E d m o n d J (1976) Arch
cząsteczki enzym u, to grupow anie się m utacji w pew Biochem Biophys 177: 525
TA D EU SZ PAW ELCZYK*
I. Wstęp I. Introduction
II. Izoenzymy fosfolipazy C II. Isoenzymes of phospholipase C
III. Właściwości katalityczne fosfolipazy C III. Catalytic properties of phospholipase C
IV. Regulacja aktywności izoenzymów fosfolipazy C IV. Regulation of phospholipase C isoforms
IV-1. Regulacja aktywności izoenzymów fosfolipazy IV-1. Regulation of phospholipase C p isoforms
C typu p IV-2. Regulation of phospholipase C y isoforms
IV-2. Regulacja aktywności izoenzymów fosfolipazy IV-3. Regulationof phospholipase C 8 isoforms
C typu y IV-4. Regulationof phospholipase C activity by protein
IV-3. Regulacja aktywności izoenzymów fosfolipazy kinase C and protein kinase A
C typu 8 V. Subcellular distribution of phospholipase C isoenzymes
IV-4. Regulacja aktywności fosfolipazy C przez kinazę VI. Role of phospholipase C in pathophysiology
białkową C i kinazę białkową A
V. Wewnątrzkomórkowe rozmieszczenie izoenzymów fos
folipazy C
VI. Rola fosfolipazy C w patofizjologii
C DP
B iałk o
Ryc. 1 Schemat głównych przem ian fosfatydyloinozytoli zachodzących w komórce z udziałem fosfolipazy C (PLC). D la przejrzystości rysunku
zaznaczono tylko główne przemiany istotne dla sygnałowania komórkowego opartego o przemiany P IP 2 pomijając szereg istotnych
czynników biorących udział w przemianach fosfatydyloinozytoli. Stosowane oznaczenia: R, receptor; H, horm on; DAG, diacyłoglicerol
P IP 2, fosfatydyloinozytolo 4,5-bisfosforan; PIP, fosfatydyloinozytolo 4-fosforan; PI, fosfatydyloinozytol; Ins, inozytol; PK C, kinaza
białkowa C; PS, fosfatydyloseryna; RE, retikułum endoplazmatyczne.
O p ublikow ane dotychczas dane w skazują, że h y d ro W izoenzym ach typu y, pom iędzy dom enam i X i Y wy
liza P I P 2 przez fosfolipazę C inicjuje kaskadę przem ian stępuje region około 400 am inokw asów , w którym
m ających isto tn e znaczenie dla szeregu podstaw ow ych zaw arta jest stru k tu ra hom ologiczna do stru k tu ry src.
funkcji kom órki. W ym ienić tutaj m ożna aktyw ność M ożna w niej w yodrębnić dom eny SH2 i SH3, wy
m etaboliczną, wydzielniczą, nerw ow ą i skurczow ą stępujące rów nież w kinazach tyrozynow ych rodziny
oraz podział kom órkow y. src [18]. W izoenzym ach P L C (3 znajduje się około 450
am inokw asów m iędzy dom eną Y a C końcem . Region
II. Izoenzymy fosfolipazy C ten jest znacznie krótszy w izoenzym ach fosfolipazy
C y oraz fosfolipazy C 8 [19]. W szystkie ssacze
W iele fosfolipaz C w yizolow ano i oczyszczono z ro z izoenzym y fosfolipazy C zaw ierają rów nież jed n ą lub
m aitych tk an ek zwierzęcych [11-14]. N a podstaw ie dwie dom eny P H (dom ena po raz pierwszy opisana
cD N A u stalo n o sekwencje am inokw asow e 14 enzy w białku plekstrynie) składające się z około 100
m ów z tk an ek ssaczych i 2 sekwencje enzym ów z m u am inokw asów . D om eny te obecne są u wielu białek
szki owocowej Drosophila [15, 16]. P o śró d fosfolipaz sygnałow ych [20, 21]. W izoenzym ach P L C dom ena
C m o żn a w yróżnić trzy głów ne typy, nazw ane: P L C P H położona jest n a N końcu łańcucha białkowego.
(3 (155 kD a), P L C y (145 kD a) i P L C 5 (85 kDa). Izoenzym y y p osiadają d o d atk o w ą dom enę P H p o ło
C ząsteczka każdej fosfolipazy C zb udow ana jest z p o żoną m iędzy dom enam i X i Y, k tó ra jest rozdzielona
jedynczego łań cucha białkow ego. W obrębie każdego dom enam i SH (Rys. 2) [22]. W iększość białek po siad a
typu fosfolipazy C m o żn a w yróżnić kilka izoenzymów. jących dom enę P H jest białkam i k tó re do aktyw acji
I tak zidentyfikow ano w śród fosfolipaz C typu (3 izoen
P L C ty p |3
zymy: (31, (32, (33, (34 i n orpA (enzym z Drosophila).
W p rzy p ad k u fosfolipazy C typu y znaleziono izoen N -ffiS — IZZ]— MMM c
PH X Y
zymy y l i y2. N a to m iast fosfolipaza C typ 6 w ystępuje P L C typ Y
w postaci izoenzym ów 61, 82, 83, 84 [13]. Fosfolipazy
C poszczególnych typów są w m ałym stopniu h o m o
"-iiffl— 1 [BMWWWHlM ilł c
PH X PH SH2 SH2 SH3 PH Y
logiczne. W obrębie stru k tu ry każdego z izoenzym ów PL C ty p 8
Ryc. 5 Mechanizm stymulacji fosfolipazy C y przez receptor zawie A ktyw ność fosfolipazy C typu 5 stym ulow ana jest
rający w swojej strukturze kinazę tyrozynową. W niektórych
typach kom órek w procesie tym uczestniczy również białko przez C a 2+, poliam iny oraz białka zasadow e [34,105].
Gia. Y, tyrozyna; Y-P, fosfotyrozyna. P rzypuszcza się, że rolę fizjologicznego regu lato ra
Z uwagi n a to, że fosfolipaza C odgryw a znaczącą Już po wysłaniu tego artykułu do druku, w Naturę* ukazał
rolę w aktyw acji szeregu funkcji w kom órce m ożna się artykuł poświęcony strukturze fosfolipazy C 81. Dane
otrzymane w wyniku badań krystalograficznych wykazały,
przypuszczać, że w wielu stanach patologicznych d o że enzym ten posiada w swojej N końcowej części cztery
chodzi do zaburzeń w funkcjonow aniu tego enzymu. domeny EF, które są umieszczone parami w dwóch pętlach.
Stw ierdzono, że w nadciśnieniu sam oistnym aktyw Domena EF1 i EF2 uczestniczy w wiązaniu wapnia, podczas
ność fosfolipazy C w k o m ó rk ach kan alik a proksym al- gdy domena EF3 i EF4 tworząca pętlę drugą nie posiadała
nego nerki szczura jest podw yższona [140]. D ośw iad związanego wapnia. Autorzy pracy na podstawie analizy
struktury kryształu PLC 81 proponują mechanizm od
czenia z użyciem skraw ków kory nerki szczura w yka działywania enzymu z błoną plazmatyczną, w którym to
zały, że odpow iedź nerki n a dopam inę, m ierzona procesie brałyby udział domeny PH oraz domena C2.
w zrostem aktyw ności fosfolipazy C jest niższa u szczu W zaproponowanym modelu domena PH zlokalizowana na
rów z nadciśnieniem sam oistnym [140] . U szczurów N końcu cząsteczki miałaby odpowiadać za wiązanie en
z nadciśnieniem w yw ołanym przez podaw anie octanu zymu do błony lipidowej, natomiast domena C2 (626-756 aa)
odpowiadałaby za właściwą orientację enzymu w stosunku
d eo k sy k o rtik o stero n u jednocześnie z hypertonicznym do substratu. W podsumowaniu autorzy stwierdzają, że
roztw orem soli aktyw ność fosfolipazy C jest podw yż architektura domen białkowych PLC 81 wskazuje na typ
szona w k o m ó rk ach rdzenia nerki, n ato m iast o b cząsteczki zdolnej do odwracalnej asocjacji z błoną plaz
niżona w korze nerki oraz w k o m ó rk ach ścian tęt matyczną, co jest cechą charakterystyczną szeregu białek
niczych [141]. P o m iary ilości P I 3 i diacyloglicerolu sygnałowych takich jak kinaza białkowa C, cytoplazmatycz-
na fosfolipaza A2 czy fosfatydyloinizytolo 3-kinaza.
w k o m ó rk ach ao rty u szczurów z nadciśnieniem
sam oistnym w ykazały, że ilość I P 3 i D A G u tych
zw ierząt jest znam iennie wyższa niż u szczurów n o r Piśmiennictwo
m alnych. A ktyw ność fosfolipazy C 81 w k o m órkach
ao rty zw ierząt z nadciśnieniem sam oistnym jest wyż 1. M a j e r u s P W (1992) Annu Rev Biochem 61: 225-250
sza, a poziom P I P 2 obniżony [142]. P o n a d to enzym 2. R a n a RS, H o k i n L E (1990) Physiol Rev 70: 115-164
3. I r v i n e R F (1990) FEBS L ett 263: 5-9
ten jest bardziej w rażliwy n a stym ulujące działanie 4. I r v i n e R F (1991) Bioassays 13: 419-427
niskich stężeń C a 2+ [142]. Z a podw yższoną w raż 5. N i s h i z u k a Y (1988) Nature (London) 334: 661-665
liwość fosfolipazy C 81 n a stym ulujące działanie 6. N i s h i z u k a Y (1995) F A SE B J 9: 489-496
7. K i k k a k a w a U, N i s h i z u k a Y (1986) Ann Rev Cell Biol 2:
w apnia odpow iedzialna jest ja k wydaje się, m utacja 149-178
p u n k to w a w cząsteczce enzym u [142,143]. A ktyw ność 8 . M e e k D W, S t r e e t A J (1992) Biochem J 287: 1-15
fosfolipazy C y stym ulow ana jest przez szereg czyn 9. D o w n e s C P , M a c p h e e C H (1990) Eur J Biochem 193:
1-18
ników w zrostu co w skazyw ać m oże n a jej udział 10. M a t o J M (1990) W: Phospholipid metabolism in cellular
w przekazyw aniu kom órce sygnału do podziału. M i- signaling. C. R. S. Press, Boca Raton, Ann Arbor, Boston, str
krow strzyknięcie fosfolipazy C y lub |3 do fibroblastów 9-17
indukuje syntezę D N A [144], k tó ra jest zaham ow ana
p o m ikrow strzyknięciu przeciw ciał przeciw tym en *E s s e n L-O, P e r i s i c O, C h e u n g R, K a t a n M,
zym om [145]. W ykazano, że szereg kom órek now o W i l l i a m s R L (1996) Nature ( London) 380, 595-602
JOLANTA M. DZIK1,
ELŻBIETA WAŁAJTYS-RODE2
Spis treści: C ontents:
I. Wstęp I. Introduction
II. Wpływ metabolitów sfingomieliny na różnicowanie i pro II. Regulation of proliferation and differentiation by sphin
liferację komórek gomyelin metabolites
II-l. Wpływ pochodnych sfingozyny na poziom kwasu II-l. Influence of sphingosine derivatives on the level of
fosfatydowego phosphatidic acid
III. Rola metabolitów sfingomieliny w apoptozie III. Sphingomyelin metabolites in apoptosis
IV. Wpływ sfingozyno-l-P na ruchliwość komórek nowo IV. Sphingosine-l-P involvement in cancer cell motility
tworowych V. Regulation of cellular calcium homeostasis by sphin
V. Regulacja homeostazy wapniowej w komórce przez gomyelin metabolites
metabolity sfingomieliny VI. Sphingomyelin metabolites and cytokine and growth
VI. Rola metabolitów sfingomieliny w przenoszeniu syg factor signal transduction
nałów cytokin i czynników wzrostu w komórkach VI-1. TNF receptors
VI-1. Receptory dla TNF VI-2. Fas/APO-1
VI-2. Receptor Fas/APO-1 VI-3. Diversity of nSM-ase and aSM-ase induced signal
VI-3. Różne drogi przenoszenia sygnału pochodzącego pathways
od nSM-azy i aSM-azy VI-4. PDGF receptor
VI-4. Receptor PDGF VII. Concluding remarks
VII. Uwagi końcowe
DE NOVO
PALMITOILO-Co A + SERYNA
Ryc. 1 Drogi metabolizm u sfingolipidów. N a podstawie prac przeglądowych [ 6 - 8 ], z uwzględnieniem następujących modyfikacji, odzwiercie
dlających obecne poglądy: (i) wprowadzenie podwójnego wiązania 4-trans odbywa się już po reakcji acylacji, zatem wolna sfingozyna nie
jest pośrednikiem w syntezie sfingolipidów de novo; (ii) biosynteza sfingomieliny polega na przeniesieniu fosfocholiny z fosf-
atydylocholiny na ceramid i uwolnieniu diacyloglicerolu; (iii) sfingozyna, k tóra powstaje w wyniku hydrolizy ceramidu, może być
przem ieniana z pow rotem do ceramidu lub degradowana, co obejmuje fosforylację do sfingozyno-l-P oraz lityczny rozpad do fosforanu
etanoloam iny i trans-2-heksadekanalu. Zaznaczono wpływ czynników regulatorowych. D la uproszczenia pominięto niektóre substraty,
produkty, a także nazwy enzymów.
Ryc. 2 U dział metabolitów sfingomieliny w postulowanym mechaniźmie przenoszenia sygnału receptorów T N F i Fas/APO -1. Receptor T N F
(TNF-R55), aktywując w błonie komórkowej sfingomielinazę (nSM-azę), powoduje uwolnienie ceramidu, który z kolei aktywuje
specyficzną kinazę białkową (CAPK) inicjującą kaskadę przenoszenia sygnałów od kinazy Raf, przez kinazę M A PK (MEK) lub kinazy
aktywowane strestem (SAPK), do kinazy M A P (MAPK). M A PK stymuluje aktywność fosfolipazy A 2 (PLA 2) oraz czynników
transkrypcji AP-1 i NFkB, stymulujących proliferację i apoptozę. Ceramid indukuje również aktywność specyficznej fosfatazy białkowej
(CAPP), uczestniczącej w procesie apoptozy. Białko TRADD, homologiczne do domeny śmierci TNF-R55, pośredniczy w apoptozie
oraz aktywacji i translokacji NFkB. Jednocześnie TNF-R55 stymuluje aktywność lizosomalnej aSM-azy przez D AG uwolniony po
aktywacji PC-PLC. Ceramid powstający w tym przedziale komórkowym jest odpowiedzialny za przenoszenie sygnału wyłącznie do
apoptozy. Fas/APO -1 aktywuje również obie sfingomielinazy, ale potwierdzono tylko przenoszenie sygnału do apoptozy (generowanego
analogicznie jak po aktywacji TNF-R55), natom iast nie stwierdzono indukcji ekspresji genów.
[62] sfingozyna in d u k o w ała apoptozę. C eram id i S P P vitro ich w zrost zależy od estrogenu, zaś kom órki
nie działały w tych ko m órkach. D im etylosfingozyna M D A -M B-231 nie m ają takich receptorów i są oporne
i H -7 (inhibitor P K C ) także indukow ały ap optozę co n a działanie antyestrogenów [64]. S P P w stężeniu
sugeruje, że zjaw isko to m oże być zw iązane z h am o w a 1-10 pM ham ow ał w zrost kom órek obu linii. P o d
niem P K C przez sfinogozynę. W niestym ulow anych wpływem S P P kom órki M D A -M B-231 zm ieniały fe
ludzkich neutrofilach stężenie ceram idu jest bardzo notyp n a bardziej praw idłow y i charakteryzow ały się
wysokie (ok. 200 pM ) co poddaje w w ątpliw ość zm niejszoną znacznie inw azyjnością [63]. Sfingozyna
znaczenie egzogennie dodaw anego ceram idu. W ynika nie m iała wpływu n a te cechy. W yniki b ad a ń nad
z tego, że w tych k o m ó rk ach endogennym m o d u la to wpływem S P P n a ruchliw ość chem otaktyczną i in-
rem pośredniczącym w yw oływ aniu ap o p to zy przez wazyjność kilku linii kom órkow ych, mysiego i ludz
T N F m oże być sfingozyna. kiego czerniaka oraz ludzkiego kostniakom ięsaka d o
w odzą ham ującego wpływu S P P n a inw azyjność k o
IY. Wpływ sfingozyno-l-P na ruchliwość m órek now otw orow ych. Z drugiej strony, S P P nie
komórek nowotworowych w pływał n a ruchliw ość ludzkich kom órek śródbłon k a
i w łókniakom ięsaka [65]. Zreferow ane wyżej wyniki
Ze w zględu n a fakt, że S P P pod o b n ie ja k czynniki b ad a ń n ad pozytyw nym oddziaływ aniem S P P z k o
w zrostu, zw iększa poziom w apnia i kw asu fosfatydo- m órkam i niektórych linii now otw orow ych sugerują, że
wego w ko m ó rk ach , zb ad an o wpływ S P P n a w zrost ta nietoksyczna ufosforylow ana p o ch o d n a sfinogozy-
i różnicow anie dw óch linii kom órkow ych ra k a piersi: ny m oże zm niejszać inw azyjność now otw orów . Takie
M C F -7 i M D A -M B -231 [63]. K o m ó rk i M C F -7 działanie p ośrednika sfingom ielinow ego szlaku prze
m ają funkcjonujące receptory estrogenow e i in syłania sygnału m oże otw ierać now e m ożliwości tera-
Laureaci konkursu na najlepszy wykład akademicki w roku 1996: dr Hanna Czeczot, prof. dr hab. Zygmunt Pojda.
Redakcja
SPRAWOZDANIA I KOMUNIKATY
W dniach 26-27 kwietnia 1996 r. odbyło się w Szczecinie siódme sympozjum z cyklu Metabolizm Fluoru
zorganizowane przez Katedrę i Zakład Biochemii i Chemii Pomorskiej Akademii Medycznej w Szczecinie oraz
szczeciński oddział Polskiego Towarzystwa Biochemicznego. W obradach uczestniczyły 64 osoby. Tematem
wiodącym sympozjum była analityka związków fluoru. Po raz pierwszy oprócz części teoretycznej zor
ganizowano warsztaty będące częścią praktyczną sympozjum.
Tadeusz Ogoński
K ierow nik Katedry
W grudniu 1995 r. Zarząd Główny Polskiego Towarzystwa Biochemicznego, na mój wniosek, powołał do
życia Sekcję Kwasów Nukleinowych. Celem tej inicjatywy jest integracja środowiska badaczy podejmujących
tematykę kwasów nukleinowych, ich funkcji, struktury i właściwości. Powinna to być również płaszczyzna
rzeczowych dyskusji nie tylko teoretycznych ale również szczegółowych problemów warsztatowych. Formą
działalności sekcji będą spotkania i konferencje naukowe organizowane w różnych ośrodkach naukowych.
Będą one dotyczyły różnych aspektów biologii molekularnej kwasów nukleinowych. Będzie to również
platforma prezentacji i promocji młodych biochemików oraz laureatów konkursów organizowanych przez
Polskie Towarzystwo Biochemiczne.
W celu przyspieszenia obiegu informacji otwarta została w sieci Internet strona WWW (Word Wide Web), na
której umieszczane będą wszelkie wiadomości i komunikaty dotyczące aktualnych zamierzeń i działalności
sekcji. Jest możliwość nadsyłania i umieszczania na tej stronie własnych wypowiedzi, uwag i komentarzy na
temat aktualnych zadań badawczych, udoskonaleń technicznych, ciekawych wyników. Jest możliwość
zamieszczania wszelkich sugestii, notatek, informacji o konferencjach, nowych książkach, metodach,
wizytach gości zagranicznych, własnych pracach opublikowanych, seminariach lokalnych oraz wszelkich
innych sprawach, które mogą być interesujące dla biochemików kwasów nukleinowych i nie tylko. Można
podzielić się swoimi przemyśleniami dotyczącymi ogólnych problemów nauki. Materiały te mogą stanowić
podstawę do publikacji na WWW biuletynu informacyjnego naszej sekcji. Strona WWW i jej adres widoczne
są na ryc. 1.
......
0
¡ \ Location: jhttp: //rose. man. poznan. pl/~rnszyman/skn_ptbio. html
___ ■■■■ i u
mm
tel: (061) 52-85-03
fax: (061) 52-05-32
i
Si
«J
Informuję jednocześnie, że pierwsze spotkanie naukowe już się odbyło. Konferencja miała na celu
podkreślenie ważności i uczczenie 30 rocznicy odkrycia kodu genetycznego. Oprócz referatów dotyczących
problemów rozpoznawania kwasów nukleinowych i białek, które wygłosili: Dr hab. G. Węgrzyn, Prof. dr hab.
R. Adamiak, Dr hab. J. Zakrzewska-Czerwińska, Prof. dr hab. T. Twardowski, Dr hab. Z. Szweykowska-
Kulińska, Doc. dr hab. K. Szyfteri Dr A. Przykorska, odbyła się sesja otwarta, w której każdy z uczestników mógł
w ciągu 5 minut przedstawić własne wyniki badawcze. W sesji tej wystąpili: Doc. dr hab. W. Baer-Dubowska,
Prof. dr hab. R. Oliński, Prof. dr hab. A. Małkiewicz, Dr M. Figlerowicz, Mgr M. Oczkowski, Mgr K. Lesniewicz
i Mgr W. Kaczmarek.
Zapraszam do czytania stron WWW.
organizują Sympozjum Mikroskopii Elektronowej. Odbędzie się ono 6 grudnia 1996 r. w Katedrze i Zakładzie
Patomorfologii Klinicznej A.M. w Poznaniu, ul. Przybyszewskiego 49. Planujemy sympozjum jednodniowe
w godzinach od 9.00 do 17.00.
Tematem przewodnim będą; ultrastruktura płuca w fizjologii i patologii oraz diagnostyka ultra-
strukturalna. Przewidujemy także tematy wolne. Termin nadsyłania zgłoszeń uczestnictwa czynnego
i biernego upływa z dniem 30 października.
Streszczenia należy nadesłać także do dnia 30 października. Streszczenia będą drukowane jako w ydaw ni
ctwo Patologii Polskiej w języku angielskim. Akceptujemy także streszczenia polskie (czasopismo posiada
własnego tłumacza).
Koszt uczestnictwa wyniesie 15 zł. Noclegi w cenie ok. 80 zł możemy zabezpieczyć w Hotelu „O lim pia”
w pobliżu miejsca obrad.
Serdecznie zapraszamy do wzięcia udziału.
W . M ejbaum -K atzenellenbogerTs
Seminars on M olecular Biology
4. Nuclear O rganization and
Intracellular Transport
(ARF and Protein 14-3-3)
W roclaw /Szklarska Poręba, June 23— 25
Info: Prof. Jan Szopa
Uniwersytet Wrocławski, Inst. Biochemii
ul. Przybyszewskiego 63/77
51-148 Wrocław, Poland
Fax (48) +71 252-930
dla a u to ró w
Strona 1 (ty tu ło w a ) zawiera imiona i nazwiska autorów, tytuł
pracy w języku polskim i angielskim, rzeczowy spis treści też
w obu językach, tytuł naukowy każdego z autorów i ich miejsce
pracy z adresem pocztowym oraz wykaz stosowanych skrótów.
Kolejno num erow ane dalsze strony obejmują tekst pracy,
piśmiennictwo, tabele, podpisy i objaśnienia rycin, wzorów
i fotografii.
Wydawany przez Polskie Towarzystwo Biochemiczne kwar
talnik „Postępy Biochemii" publikuje prace przeglądowe oma
wiające bieżące osiągnięcia, koncepcje i kierunki badawcze
w dziedzinie biochemii i nauk pokrewnych; publikuje też noty P IŚ M IE N N IC T W O : Wykaz piśmiennictwa obejmuje prace
z historii biochemii, zasady polskiego słownictwa biochemi w kolejności ich cytowania w tekście, zaznacza się je liczbami
cznego, recenzje nadesłanych książek oraz sprawozdania ze porządkowymi ujętymi w nawiasy kwadratowe, np. [3 ,7 ,9 — 26].
zjazdów, konferencji i szkół, w których biorą udział członkowie Odnośniki bibliograficzne winny mieć nową uproszczoną formę.
Towarzystwa. Sposób cytowania czasopism (1), monografii (2), rozdziałów
Prace przeznaczone do publikacji w „Postępach Biochemii" z książek jednotomowych (3), rozdziałów z tom ów serii opraco
mogą mieć charakter artykułów monograficznych (do 20 stron wanej przez tych samych redaktorów (4), rozdziałów z tom ów
tekstu licząc piśmiennictwo i tabele), minireviews (do 10 stron serii opracowanych przez różnych redaktorów (5) wskazują
tekstu), oraz krótkich not o najnowszych osiągnięciach i po poniżej podane przykłady:
glądach (do 5 stron tekstu).
1. Hildenbrandt GR, Aronson NN (1980) Biochim Biophys
Acta 631: 499-502
Autorzy artykułu odpowiadają za prawidłowość i ścisłość poda 2. Bostock CJ, Sumner AT (1978) The Eukaryotic Chromo
wanych informacji oraz poprawność cytowania piśmiennictwa. some, Elsevier, N orth-Holand, Amsterdam
Ujęcie prac w inno być syntetyczne, a przedstawione zagadnienie 3. Norberth T, Piscator M (1979) W: Friberg L, Nordberg GF,
zilustrowane za pomocą tabel, rycin, (wykresy, schematy, reak Von VB (red) Handbook on the Toxicology of Metals.
cje), wzorów i fotografii. Elsevier, North-Holland, Amsterdam, str. 541-553
Wskazany jest podział artykułów monograficznych na rozdziały 4. Delej J, Kesters K (1975) W: Florkin M, Stotz EH (red)
i podrozdziały, których rzeczowe tytuły tworzą spis treści. Zgod Comprehensive Biochemistry t 29B. Elsevier, N orth-H ol
nie z przyjętą konwencją rozdziały noszą cyfry rzymskie, podroz land Amsterdam, str. 1 -77
działy odpowiednio rzymskie i arabskie np. 1-1, I-2. Poprawność 5. Franks NP, Lieb WR (1981) W: Knight CG (red) Research
logiczna i stylistyczna tekstu warunkuje jego jednoznaczność Monographs in Cell and Tissue Physiology, t 7. Elsevier,
i czytelność. Autorzy przeto winni unikać składni obcojęzycznej, North-Holland, Amsterdam, str. 243-272
gwary laboratoryjnej, a także ograniczać stosowanie doraźnie
tworzonych skrótów, nawet jeżeli bywają używane w pracach
specjalistycznych. Każda z nadesłanych do Redakcji prac podlega ILUSTRACJE: Ryciny w inny być gotowe do reprodukcji. Foto
ocenie specjalistów i opracowaniu redakcyjnemu. Redakcja grafie czarno-białe (kontrastowe), powinny być wykonane na
zastrzega sobie możliwość skrócenia tekstu i wprowadzenie papierze matowym. Po porozumieniu z Redakcją można propo
zmian nie wpływających na treść pracy, deklaruje też gotowość nować reprodukcję fotografii barwnych. Pozostałe ryciny należy
konsultowania tekstu z Autorami. wykonać tuszem na białym papierze lub kalce technicznej.
Wskazane jest, aby ryciny były dwukrotnie większe od przyszłej
reprodukcji, tj. w skali 2 :1 . Cyfry i litery służące do opisu rysunku
Przekazanie artykułu do redakcji jest równoznaczne z oświad powinny mieć wysokość nie mniejszą niż 5 mm. Na rysunkach nie
czeniem, że nadesłana praca nie była i nie będzie publikowana należy umieszczać opisów słownych, lecz posługiwać się skróta
w innym czasopiśmie, jeżeli zostanie ogłoszona w „Postępach mi. Osie wykresów winny być opatrzone napisem łatwo zro
Biochemii". W przypadku, gdy Autor(zy) zamierza(ją) włączyć zumiałym. Decyzję o stopniu zmniejszenia ryciny podejmuje
do swego artykułu ilustracje publikowane przez autorów prac wydawca. Ilustracji nie należy włączać w tekst maszynopisu, lecz
cytowanych, należy uzyskać i przekazać nam odpowiednią zgodę odpowiednio ponumerować: tabele i ryciny noszą cyfry arabskie,
na przedruk. wzory zaś rzymskie. Na marginesie tekstu należy zaznaczyć
ołówkiem preferowane miejsce umieszczenia tabeli, ryciny czy
wzoru. Tabele odpowiednio porubrykowane, winny być opat
rzone jednoznacznym tytułem i ewentualnie także niezbędnymi
objaśnieniami. Słowne objaśnienia znaków graficznych można
Redakcja prosi A u to ró w o przestrzeganie następujących umieścić w podpisie pod ryciną, rysunkowe zaś jedynie na
w skazów ek szczegółowych:
planszy ryciny. Tytuły i objaśnienia rycin sporządza się w postaci
oddzielnego wykazu. Ilustracje należy podpisać nazwiskiem
pierwszego z autorów i pierwszym słowem tytułu pracy oraz
TEKST: Maszynopis powinien być napisany jednostronnie oznaczyć „g ó ra -d ó ł" (ołówkiem, na odwrocie). Ze względu na
czcionką wielkości standartowej, z podwójną interlinią, z lewym wewnętrzną spoistość artykułu wskazane jest konstruowanie
marginesem ok. 4 cm. oryginalnych rycin i zbiorczych tabel na podstawie danych
W tekście nie należy stosować żadnych podkreśleń, ani roz z piśmiennictwa.
strzelonego druku. Ewentualne sugestie co do charakteru czcion
ki drukarskiej mogą Autorzy zaznaczyć ołówkiem na marginesach
maszynopisu. W przypadku stosowania w tekście liter alfabetu Maszynopis i załączniki (w dwu egzemplarzach), właściwie
greckiego trzeba na marginesie wpisać ołówkiem ich fonetyczne zabezpieczone przed uszkodzeniem w czasie transportu, należy
brzmienie. przesłać na adres:
Strona inform acyjna maszynopisu jest nienumerowana, za Redakcja kwartalnika „Postępy Biochemii"
wiera imiona i nazwisko (a) autora (ów ), nazwy, adresy wraz Polskie Towarzystwo Biochemiczne
z numerem telefonu zakładów (w języku polskim i angielskim), ul. Pasteura 3,
w których pracują autorzy, adres do korespondencji, nr telefonu 02-093 Warszawa
im ię, nazw isko, dokładny adres z kodem pocztow ym im ię, nazw isko, dokładny adres z kodem pocztowym im ię, nazw isko, dokładny adres z kodem pocztow ym