Ali Kuşçu 1403’te Timur İmparatorluğu’nun Semerkant şehrinde doğdu. Babası Muhammed, Timur İmparatorluğu hükümdarı ve astronomu olan ve aynı zamanda Timur'un torunu olan Uluğ Bey'in kuşçusu olduğu için, ailesi "Kuşçu" lakabıyla meşhur olmuştur. Küçük yaşından beri matematiğe ve astronomiye ilgi duyan Ali Kuşçu o zamanın en iyi öğretmenlerinden ders aldı. Bilgisini arttırmak için Kirman’a gitti ve orada Şerh-i Tecrid adlı eserini yazdı. Eğitimini tamamladıktan sonra Uluğ Bey’e yardımcı oldu.
Uluğ Bey tarafından Çin’e yollanır ve Dünya’nın yüz
ölçümü ile 24 derece eksen eğikliğini bulur.
1449’da Hacca gitmek istedi. Tebriz'de Akkoyunlu
Devleti hükümdarı Uzun Hasan kendisine büyük saygı gösterdi ve Osmanlı Devleti ile barış görüşmelerinde yardımını istedi. Bunun üzerine Ali Kuşçu, bir süre Uzun Hasan'ın sözcülüğünü yaptı. Ardından, Osmanlı padişahı II. Mehmed'in davetiyle İstanbul'a gitti. Osmanlı - Akkoyunlu sınırında Fatih Sultan Mehmed'in emriyle büyük bir törenle karşılanan Ali Kuşçu, Fatih tarafından Sahn-ı Seman Medresesi'ne müderris olarak göreve başladı. Osmanlı’da bir yandan talebe yetiştirip bir yandan bilimsel araştırmalarına devam etti. İstanbul'un enlem ve boylamını ölçtü, gezegenler arası uzaklıkları ölçüp ayın haritasını çıkardı. Çıkardığı yıldız haritaları Cristof Coloumb’un Amerika kıtasını bulmasına yardımcı oldu.
Ali Kuşçu 1474 tarihinde 71 yaşınada vefat etti. 15.
Yüzyıla özgü mezarı ile Eyüp Sultan Türbesi etrafındaki hazirededir.