国家烟气脱硫中心大气污染计算组计算模拟培训

第一行原理分子动力学
计算模拟方法

岑望来
2020 年 3 月 7 日

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 大气计算组组会报告

Metadynamics

 Collective variables(CV)

 Error estimation

 Data post-treatment

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 大气计算组组会报告

CVs choice

 The should clearly distinguish between the initial state, the final
state and the intermediates.
 They should describe all the slow events that are relevant to the
process of interest.
 Their number should not be too large, otherwise it will take a
very long time to fill the free energy surface.

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 大气计算组组会报告

CVs in VASP

 输入文件： ICONST, PENALTYPOT, INCAR

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 大气计算组组会报告

CVs in VASP
 ICONST, PENALTYPOT, INCAR

ICONST

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 大气计算组组会报告

CVs in VASP
 ICONST, PENALTYPOT, INCAR

PENALTYPOT

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CVs in VASP
 ICONST, PENALTYPOT, INCAR

INCAR

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CVs in VASP
 输入文件： ICONST, PENALTYPOT, INCAR
 输出文件： HILLSPOT ， REPORT ， XDATCAR

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 大气计算组组会报告

CVs in VASP
 输入文件： ICONST, PENALTYPOT, INCAR
 输出文件： HILLSPOT ， REPORT ， XDATCAR REPORT

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 大气计算组组会报告

CVs in VASP
 输入文件： ICONST, PENALTYPOT, INCAR
 输出文件： HILLSPOT ， REPORT ， XDATCAR

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 大气计算组组会报告

CVs in VASP
 输入文件： ICONST, PENALTYPOT, INCAR
 输出文件： HILLSPOT ， REPORT ， XDATCAR

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 大气计算组组会报告

Data post-treatment

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 大气计算组组会报告

Data post-treatment

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 大气计算组组会报告

CVs in VASP
 输入文件： ICONST, PENALTYPOT, INCAR
 输出文件： HILLSPOT ， REPORT ， XDATCAR
 继续计算： cp CONTCAR POSCAR
cp HILLSPOT PENALTYPOT
cp REPORT REPORT.i
cp XDATCAR XDATCAR.i

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 基于 CP2K 的第一性原理分子动力学

FeSO4+HCl+40H2O+NGP 体系

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大气计算组组会报告

谢谢大家！

岑望来
2019 年 4 月 17 日