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CH 10 Bacterial

Genetics

Ted

1
REF 細菌與人類的染色體比較

數量 鹼基對 染色體 質體

E. coli 1條 5 X 106 對 單套 有

人類 23 對 2.9 X 109 對 雙套 無

2
REF 複習 DNA 的構造 -
核甘酸鏈 1

3
REF 複習 DNA 的構造 -
核甘酸鏈 2

4
REF 複習 DNA 的構造 -
DNA 模型

5
REF 轉錄與轉譯

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Ch 10. Bacterial Genetics
I. Over view
II. The Bacterial genome 細菌的基因體
III. Bacteriophage 噬菌體
IV. DNA replication DNA 的複製
V. Gene Transfer 基因轉移
VI. Genetic variation 基因變異
VII. Gene regulation 基因調節

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I. Over view
• 研究材料 :E. coli

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II. The Bacterial genome
( 細菌的基因體 )
Genome 是什麼 ?
生物體所有的遺傳物質
細菌的 Genome 有兩類
1. The Chromosome ( 染色體 )
2. The Plasmid ( 質體 )

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10.01 The bacterial genome

1. 細菌染色體有必要基因與非必要基因
2. 不同基因群負責參與不同生理作用 :
蛋白質合成、 DNA 合成、能量代謝與
控制物質進出
3. 質體 (Plasmid)
可以自行複製,可能 1 個或多個
可製造毒素或促進質體轉移的蛋白質

10
III. Bacteriophage 噬菌體

1. 毒性噬菌體
2. 溫和噬菌體
3. 潛溶性細菌

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10.02 Bacteriophage
replication
•( 噬菌體的複製 )

1. 附著
2. 穿入
3. 合成 DNA 與蛋
白質
4. 組合
5. 釋出

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10.03 A . Visual detection of bacteriophage
by the Plaque Method
噬菌體的計數
斑點法

10.03 A . Visual
detection of
bacteriophage by the
Plaque Method

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Structures of
10.3B

Representative
Bacteriophage

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噬菌體與宿主的關係
• 毒性噬菌體 (Virulent Phages)
• 溫和性噬菌體 (Temperate Phages)

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10.4溫和的
噬菌體 - 形
成 Prophage

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10.4 溫和的噬菌體
10.5 潛溶性細菌的活化

1. 以 UV 阻斷 DNA 合成,
誘發破壞噬菌體抑制蛋白
的系列反應。
2.Phage genes 開始表現,原
噬菌體與染色體剪開、分
離。
3. Phage DNA 開始複製並主
導新噬菌體顆粒之合成。
4. 釋出

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IV. DNA replication

1. 複製單位與複製起始點
(Replicons and replication origins)
2. 環狀與線狀複製
(Circular versus Linear replication)

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10.06-A Bacterial chromosome- Replication bubble
( 複製泡泡 )( 環狀複製 )

• 環狀複製
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DNA 合成
05-02 REF

的啟動

• 由染色體上的
OriC 序列開始
以 helicase ( 解
鏈酶 ) 解開 DNA
依 5‘ 向 3’ 方向進

• 2 個複製叉 .. 嵌套
式泡泡 (nested
bubbles)
FIG 5-2 P34 20
10.06-B Bacterial chromosome-Rolling circle replication
( 滾動環狀複製 )( 線狀複製 )

線狀複製是一些細菌病毒、質體以及染色體轉移
(Chromosome transfer) 時所使用的機轉 21
DNA Replication
• Ted

22
DNA 模型

23
由 5’ 向 3’ 複製

24
新核苷酸接在 3’ 碳上

25
模板股走向為 3’ 向 5’

26
新核苷酸的鹼基與模板配對

27
新核苷酸 5’ 碳之磷酸基
• 新核苷酸的 5’ 碳上
之磷酸基接在已定
位的糖的 3’ 碳上

28
新核苷酸走向為 5’ 向 3’

29
終結者

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V. Gene Translation
基因轉移

1. Conjugation ( 接合作用 )
2. Transduction ( 轉導作用,形質導入 )
3. Transformation ( 轉形作用,形質轉換
)

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V-1. 接合作用 (Conjugation)

• 基因藉由細菌與細菌的接觸而轉移
• Donor( 給與者 )( 捐贈者 )----F+
具有 F 質體,是接合性質體,
具有 Sex Pili
• F+ + F- → F+ + F+

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V-1. 接合作用 (Conjugation)
Cell-to cell transfer of
10.07

Conjugative plasmid

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10.08-A Hfr 的形成
• F plasmid 嵌入環狀染色體
形成 Hfr
• Hfr + F- → Hfr + F-

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10.08-B 細菌染色體的
基因順序
• 細菌染色體的基因順
序可由基因進入接受
者細胞 (Recipient cell,
F-) 的時間得知

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10.08-C 染色體進入 F- 所需的時間

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V-2 形質導入 (Transduction)( 轉導作用 )

• 細菌的基因藉由 Phage 進入另一細菌


• 通常為溫和性噬菌體 (Temperate Phage)

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V-2 形質導入 (Transduction)( 轉導作用 )
10.09 Transduction
可轉導的
基因
A. 任何細菌
的基因
B. 原噬菌體
附近的基因

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10.10 Genetic Transform( 形質轉換 )( 轉形作
用)
• 基因以裸露的方式直接進入另一細菌
• 可自然接受外來 DNA 的稱為 Competent( 適任者
)
Haemophilus influenzae
Streptococcus pneumoniae
Bacillus spp

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10.10 Genetic Transform(
形質轉換 )

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VI. Genetic variation 基因變異
A. Mutation ( 突變 )
B. Mutants ( 突變株 )
C. Mutagenic agents ( 致突變劑 )
D. The Ames test for Mutagenic/Carcinogenic
agents
( 分析致突變劑 / 致癌劑之 Ames test )

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A. Mutation ( 突變 )
1. 鹼基取代作用
2. 添加與刪除

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鹼基取代作用 刪除或揷入
10.11 Mutation ( 突變 )

反向倒置作用
(Inversion)

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B. 突變株
1. 野生型
2. 營養突變型
3. 溫度敏感突變型
4. 誤譯與無意義突變
5. 讀序 (Frame-shift) 突

6. 回復突變與抑制突變
7. 調節突變
8. 分離突變之選擇方法

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10.12 無意義突變

1. 野生型
2. 無意義
突變
TAG 是終止
密碼,所
以突變使
蛋白質的
合成提前
終止。

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10.13 讀序改變突變
• 因刪除或插入一段核甘

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10.14 抑制者 (Suppressors)
• 無意義突變
造成蛋白質
合成提前終
止。
• tRNA 的反密
碼發生突變
,正好抑制
無意義突變
,使轉譯作
用繼續進行

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C. 致突變劑

1. 鹼基結構類似物
2. 化學修飾物
3. 讀序改變突變劑
4. 輻射線
5. 可移動之基因片段
(Transposon)

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UV 使鄰近的嘧啶
產生連結

X光
使 DNA 斷裂
ㄚ啶橙的插入使鹼
10.15 突
基排列發生扭曲導
致小幅度的插入或
變劑引發的
刪除 突變劑
10.15

DNA 變化 引發的 DNA


變化

亞硝酸使 C 與 A 發 溴尿嘧啶結構類似
生去胺作用,造成 鹼基,可取代 G=C
錯誤配對, 中的 C ,造成下一
次 DNA 複製錯誤
羊巠胺可以修飾
C ,使 C 的配對方
式類似 T
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轉位子 (Transposon) 是內在的致突變劑

• Transposon 是一種 DNA 片段,可在染色體與質體


之間來去自如。
• Transposon 會影響基因功能,算是內在的致突變
劑。

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10.16 轉位子 ( 轉座子 )(Transposon) 變換位置

51
D. The Ames test for Mutagenic/Carcinogenic agents
( 分析致突變劑 / 致癌劑之 Ames test )

• 利用營養需求變異株遇到突變劑會
回復為野生種之特性,來偵測致突
變劑。
例如 : 需組織胺的沙門氏菌遇突變
劑會突變成野生種
• 此試驗也可以用在鑑定致癌劑

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E. 後天性抗生素抗藥性之機制

1. 抗生素攝取量減少
2. 抗生素之標的物改變
3. 獲得摧毀或修飾抗生素之能力

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通透性減少

10.17 抗生素抗藥性

標的物改變

抗生素去活化

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VII. Gene Regulation

1. 負向控制 ( Negative control)


( 抑制 (Repression))
2. 正向控制 (Positive control)
( 代謝物活化 (Catabolic activation))
3.RNA 合成酶專一性修飾作用
(Modification of RNA polymerase specificity)

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VII-A. 抑制蛋白與活化蛋白 - 負向控制

1. 利用抑制蛋白控制
2. 培養基有乳糖才會有 β- 半乳
糖酶

56
10.18A 抑制蛋白與活化蛋白 - 負向控制

57
VII-B. 代謝物活化活化 - 正向控制

培養基中若有多種糖類則選擇葡萄
糖為優先的能量來源

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10.18B 抑制蛋白與活化蛋白 - 正向控制

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VII-C. Modification of RNA polymerase
specificity
• RNA 合成酶專一性修飾作用可發生於下
列情況 :
1. 微生物會因環境變化而啟動或關
閉某些基因;例如形成孢子。
2. 熱休克時,因突來的高溫 ,使細
菌產生許多新蛋白質。

60
The End

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