ASAM AMINO DAN PROTEIN

TIM BIOKIMIA JURUSAN BIOLOGI UNESA 2008

CIRI-CIRI ASAM AMINO

1. Gugus karboksil dan gugus amino diikat pd atom C yg sama 2. Merupakan atom C asimetrik kecuali GLISIN 3. Struktur semua asam amino sama kecuali rantai samping

KLASIFIKASI ASAM AMINO BERDASARKAN GUGUS R

REAKSI KIMIA SPESIFIK AA

Reaksi kimia AA bercirikan pd gugus fungsionalnya: - Ggs Amino reaksi asetil - Ggs Karboksil reaksi esterifikasi Dua reaksi penting untuk mendeteksi, mengukur dan mengidentifikasi AA - Reaksi Ninhidrin - Reaksi dg pereaksi FDNB (1-Fluoro-2,4-dinitrobenzen)

ASAM AMINO ESENSIAL

FAT HILL MET VALIN

PEPTIDA
Rantai pendek dr 2/lebih AA yg dihubungkan oleh ikatan kovalen

 Ikatan peptida ikatan yg terjadi antara ggs karboksil AA pertama dg ggs amino dari AA yg lain dipeptida + H20
Polipeptida tdr atas beberapa AA (>100) yg berikatan peptida

Protein tdr atas 1 atau lebih polipeptida

SATUAN MONOMER PENYUSUN

PROTEIN SEDERHANA Hanya mengandung AA, contoh enzim RIBONUKLEASE PROTEIN GABUNGAN (KONYUGASI) Mengandung senyawa lain selain AA Digolongkan berdasar ggs prostetik, contoh: nukleoprotein, glikoprotein, lipoprotein, metaloprotein

STRUKTUR PROTEIN
Primer Sekunder Tersier Kuartener

Struktur Primer: Ikatan peptida bentuk rantai panjang

A diagram showing a generic amino acid structure. All amino acids have an alpha carbon, an amino group, and a carboxyl group, but each of the 20 amino acids has a different side chain or R group. Amino acids are linked together to form a polypeptide chain, like beads on a string, the primary level of protein structure.

Struktur Primer

Struktur Sekunder

Globular

Beberapa protein tersier mjd satu

DENATURASI
Bila susunan ruang/rantai polipeptida suatu molekul protein berubah. Penyebab: panas, pH, mekanik, bahan kimia

A figure showing the process of denaturation. The polypeptide chain has lost its higher order structure and is now a random coil.

PEMBAGIAN PROTEIN BERDASARKAN FUNGSI

ENZIM Protein yg memiliki aktivitas katalisator. Contoh: ribonuklease, tripsin PROTEIN NUTRIEN DAN PENYIMPAN Contoh: ovalbumin, kasein, ferritin PROTEIN TRANSPORT Contoh: hemoglobin PROTEIN KONTRAKTIL Utk berkontraksi mengubah bentuk bergerak. Contoh: aktin, miosin

 PROTEIN STRUKTURAL Contoh: kolagen, elastin, keratin PROTEIN PERTAHANAN Contoh: antibodi (imunoglobulin) PROTEIN PENGATUR Contoh: hormon insulin
PROTEIN GENETIK Contih: nukleoprotein, histon

PEMBAGIAN PROTEIN BERDASAR BENTUK/KONFORMASI

PROTEIN SERABUT - Molekul serabut dg rantai polipeptida yg memanjang pd 1 sumbu tdk berlipat - Sifat tdk larut dlm pelarut2 encer - Hampir semua berperan sbg struktural dan pelindung - Contoh: -Keratin, Kolagen

 PROTEIN GLOBULAR - Rantai polipeptida berlipat rapat bentuk globular - Sifat: larut dlm sistem larutan - Hampir semua mempunyai fungsi gerak - Mudah terdenaturasi - Contoh: antibodi, protein penyimpan, protein transpor, susu atau telur (dlm bhn makanan)

PEMBAGIAN PROTEIN BERDASAR KELARUTAN

ALBUMIN - Larut dlm air, terkoagulasi olh panas - Penambahan (NH4)2SO4 jenuh mengendap - Contoh: laktabumin, serum albumin, albumin telur dll GLOBULIN - Tdk larut dlm air, larut dlm lrt garam encer - Terkoagulasi olh panas - Contoh: globulin GLUTELIN - Tdk larut dlm pelarut netral, larut dlm asam/basa encer - Contoh: glutemin (gandum), Oryzenin (beras) PROLAMIN/GLIADIN - Larut dlm alkohol 70% - 80%. - Contoh: gliadin (gandum) HISTON - Larut dlm air, tdk larut dlm amonia encer - Contoh: Globin dlm hemoglobin PROTAMIN - Larut dlm air - Tdk terkoagulasi olh panas - Dgn asam pekat membentuk garam

MOLEKUL HIBRID
GLIKOPROTEIN - Molekul gabungan antr KH (1-30%) dgn protein (70%) - Mempy 1-beberapa gol KH, mempy sejumlah rantai samping oligosakarida linier/bercabang - Protein pd permukaan sebelah luar hewan plasma darah PROTEOGLIKAN - Molekul gabungan/hibrida antara polisakarida/KH (95%) dgn protein (5%) - Tdr atas unit2 disakarida berulang PEPTIDOGLIKAN - Molekul hibrid antara peptida dgn polisakarida

METABOLISME ASAM AMINO

BIOSINTESIS ASAM AMINO

A A NON ESENSIAL: Senyawa antara: piruvat, glutamat, oksaloasetat, -ketoglutarat, aspartat Dari asam amino non essensial Dari asam amino esensial

 Sintesis AA non essensial dr AA non essensial lain. Contoh: Prolin pd mammalia dan beberapa organisme lain, prolin dpt disintesa dr glutamat melalui jalur sebaliknya dr katabolik

 Sintesis AA non essensial dr AA essensial Contoh: Tirosin dr fenilalanin oleh hidroksilase. Fenilalanin yg berfungsi sbg monooksidase (irreversible). Reaksi ini membutuhkan tetrahidrobiopterin sbg reduktor yg berasal dr reduksi dihidrobiopterin oleh NADPH.

AA ESSENSIAL
Arginin Lisin, metionin, treonin, isoleusin dr asam aspartat

amino acid alanine arginine asparagine aspartate cysteine glutamate glutamine glycine histidine isoleucine leucine lysine methionine

made from pyruvate glutamate aspartate oxaloacetate (methionine)* oxoglutarate glutamate serine essential essential essential essential essential

degraded to pyruvate glutamate aspartate oxaloacetate pyruvate oxoglutarate glutamate one-carbon pool*** glutamate acetyl-CoA + propionylCoA acetyl-CoA not known propionyl-CoA

glyco / keto glycogenic glycogenic glycogenic glycogenic glycogenic glycogenic glycogenic glycogenic glycogenic mixed ketogenic mixed glycogenic

comments large amount in cells strongly basic, urea cycle glycoproteins acidic, large amount in cells -SH group acidic, very large amount in cells large amount in cells no side chain, collagen weak base branched side-chain branched side-chain long side chain, basic contains sulphur, methyl donor

phenylalanine
proline serine threonine tryptophan tyrosine valine

essential
glutamate phosphoglycerate essential essential (phenylalanine)** essential

tyrosine
glutamate pyruvate disputed**** not known fumarate + acetoacetate propionyl-CoA

mixed
glycogenic glycogenic glycogenic mixed mixed glycogenic

aromatic, phenylketonuria
imino acid -OH group -OH group aromatic aromatic, phenolic branched side-chain

KATABOLISME ASAM AMINO

Katabolisme gugus amino Ureolitik: ekskresi urea (mammalia) Urikotelik: ekskresi asam urat (Reptil dan Aves) Ammonotelik: ekskresi ammonia (ikan bertulang belakang)

TAHAPAN KATABOLISME GUGUS AMINO

TRANSAMINASI DEAMINASI OKSIDATIF TRANSPORT AMMONIA SIKLUS UREA (hanya pd mammalia/manusia)

REAKSI TRANSAMINASI
Kebanyakan asam amino dpt diubah mjd asam keto dgn reaksi transaminasi Reaksi ini mjdkan gugus amino dr asam amino satu berpindah menuju asam koto yg lain. Melalui reaksi ini tdk ada kehilangan atau tambahan N dr sistem.

REAKSI UMUM REAKSI TRANSAMINASI

DUA MACAM TRANSAMINASE (semua jaringan mammalia)

Alanin transaminase Mengkatalisa pemindahan gugus amino dr hampir semua AA ke piruvat alanin
Glutamat transaminase (Glu--ketoglutarat transaminase) Memindah gugus amino dr hampir semua asam amino ke -ketoglutarat asam glutamat.

BIOSINTESIS RANTAI SAMPING ASAM AMINO

Asam amino asam aspartat dan alanin dpt disintesis oleh reaksi transaminasi dr oksaloasetat dan piruvat. a-Keto Acid a + a-Amino Donor b ---> a-Amino Acid a + aKeto Acid b Pyruvate + Glutamate ---> Alanine + a-Ketoglutarate alanine transaminase (ALT), or Glutamate-pyruvate transaminase GPT Oxaloacetate + Glutamate ---> Aspartate + aKetoglutarate aspartate transaminase (AST), or Glutamate-oxaloacetate transaminase GOT Oksaloasetat dan piruvat menyumbang sintesis rantai samping asam amino spt isoleucine, leucine and valine.

TRANS-DEAMINASI

Kebanyakan transaminase menyumbang substrat dan produk yang umum yaitu glutamat dan oksoglutarat dgn glutamat dehydrogenase. Hal ini memungkinkan jalur pengeluaran N untuk asam amino. Proses ini disebut trans-deaminasi.

DEAMINASI OKSIDATIF
Perubahan AA menjadi bentuk -keto secara oksidasi Oksidase asam amino, enzim yg tdp di hati dan ginjal mammalia adalah: Oksidase L-asam amino FMN Oksidase D-asam amino FAD

SINTESIS UREA
Diperlukan: 1 molekul ammonia, 2 molekul CO2, 1 molekul aspartat. Ggs amino pertama yg masuk siklus adl NH3 bebas (dr deaminasi oksidatif glutamat di motokondria hati) Ggs amino kedua berasal dr aspartat (dr transaminasi glutamat o/ transaminase aspartat sitosol). Ggs amino berkondensasi dg atom C karbamil dr sitrulin membentuk arginosuksinat.

KATABOLISME KERANGKA KARBON AA

Kerangka karbon AA dpt diubah mjd 7 mcm senyawa amfibolik piruvat, asetil-KoA, aetoasetil KoA, ketoglutarat, suksinil Ko-A, fumarat, oksaloasetat AA glikogenik Ala, Arg, Asp, Sis, Glu, Gli, His, Met, Pro, Ser, Tre, Val, Hidroksiprolin
AA ketogenik murni leusin AA glikogenik & ketogenik Ileu, Lis, Tir, Trip, Fenilalanin

AA PEMBENTUK SENYAWA AMFIBOLIK

AA pembentuk oksaloasetat aspartat, asparagin AA pembentuk -ketoglutarat glutamat, glutamin, prolin, Arginin, Histidin AA pembentuk piruvat Alanin, Serin, Glisin, Sistein, Treonin, Hidroksiprolin AA pembentuk Asetil-KoA Fenilalanin, Tir, Tryp, Lis, Leu AA pembentuk suksinil-KoA Met, Isoleu, Val